单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 845 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2025-10-06 |
Mature megakaryocytes acquire immune characteristics in a mouse model of aplastic anemia
2025-Jul-08, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024015621
PMID:40086077
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了成熟巨核细胞在再生障碍性贫血中获得免疫特征的新功能 | 首次发现成熟巨核细胞在骨髓衰竭状态下获得抗原呈递细胞功能并抑制造血干细胞 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究巨核细胞在免疫性骨髓衰竭中的非传统功能 | 小鼠巨核细胞和再生障碍性贫血患者样本 | 单细胞生物学 | 再生障碍性贫血 | 单细胞RNA测序，电子显微镜，共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据，显微镜图像 | 小鼠模型和人类患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 422 | 2025-10-06 |
Lars2 Deficiency-Induced Mitochondrial Dysfunction Drives the Emergence of a Pro-Inflammatory Stroke-Specific Microglial Subpopulation
2025-Jul-04, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2025.0387
PMID:40681356
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现Lars2缺陷导致的线粒体功能障碍驱动了中风特异性促炎小胶质细胞亚群的出现 | 首次识别出具有低Lars2表达和促炎特征的中风特异性小胶质细胞亚群(Mc)，并揭示了Lars2作为连接中风诱导的小胶质细胞重编程与神经炎症的线粒体检查点 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性尚需验证 | 探究中风后小胶质细胞免疫状态改变的分子机制 | 出血性、缺血性中风和对照小鼠的纹状体小胶质细胞 | 单细胞转录组学 | 中风 | 单细胞RNA测序，基因本体功能富集分析，细胞间通讯分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 出血性、缺血性和对照小鼠纹状体组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 423 | 2025-10-06 |
scRDAN: a robust domain adaptation network for cell type annotation across single-cell RNA sequencing data
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf344
PMID:40671175
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研究论文 | 提出一种用于跨单细胞RNA测序数据的细胞类型注释的鲁棒域自适应网络scRDAN | 结合去噪域自适应模块、细粒度判别模块和鲁棒性增强模块，通过特征重构和对抗学习解决噪声和批次效应问题 | NA | 开发能够有效处理单细胞RNA测序数据中噪声和批次效应的细胞类型注释方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 域自适应网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 424 | 2025-10-06 |
scRECL: representative ensembles with contrastive learning for scRNA-seq data clustering analysis
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf346
PMID:40671174
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研究论文 | 提出一种名为scRECL的对比集成学习方法用于单细胞RNA测序数据聚类分析 | 结合对比学习和集成学习方法，通过Siamese神经网络和多重图代表性元素选择来提高聚类鲁棒性 | NA | 开发鲁棒的单细胞RNA测序数据聚类方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Siamese神经网络, 对比学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 425 | 2025-10-06 |
Anomaly detection in spatial transcriptomics via spatially localized density comparison
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf242
PMID:40662796
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研究论文 | 提出了一种名为Sardine的空间转录组学异常检测方法，用于识别不同条件下组织切片中空间局部化的表达变化 | 通过空间局部化密度估计来比较不同条件下细胞状态在相同空间位置的概率，能够更准确地识别空间局部化改变 | 论文未明确说明方法的计算复杂度或在大规模数据集上的性能限制 | 开发空间转录组数据分析方法，检测不同条件下组织中的空间局部化表达变化 | 小鼠大脑皮层损伤响应前后的组织样本和接受电疗的小鼠脊髓组织样本 | 空间转录组学 | 神经系统损伤 | 空间转录组测序 | 密度估计算法 | 空间基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间基因表达平台 |
| 426 | 2025-10-06 |
Inactivation of Histone Chaperone HIRA Unmasks a Link Between Normal Embryonic Development of Melanoblasts and Maintenance of Adult Melanocyte Stem Cells
2025-Jul, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70070
PMID:40669469
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示组蛋白伴侣HIRA在胚胎期黑色素细胞发育与成年期黑色素干细胞维持之间的关键联系 | 首次证实HIRA在胚胎期的功能缺陷会通过表观遗传机制影响成年组织干细胞的长期维持 | 研究仅限于小鼠色素系统模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 探索组蛋白伴侣HIRA在胚胎发育与成年组织干细胞维持之间的分子联系 | 小鼠黑色素细胞谱系（黑色素母细胞和黑色素干细胞） | 发育生物学 | 色素相关疾病 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, 条件性基因敲除 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 未明确样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | NA |
| 427 | 2025-10-06 |
Itaconate suppresses neonatal intestinal inflammation via metabolic reprogramming of M1 macrophage
2025-Jul, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70419
PMID:40673634
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研究论文 | 本研究揭示了衣康酸通过代谢重编程调节巨噬细胞分化在新生儿坏死性小肠结肠炎中的保护作用 | 首次发现衣康酸通过挽救线粒体功能和上调氧化磷酸化来抑制M1巨噬细胞极化的机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床样本验证有限 | 探究衣康酸在坏死性小肠结肠炎中对巨噬细胞代谢重编程的调节作用 | 坏死性小肠结肠炎新生儿临床样本和ACOD1基因敲除小鼠模型 | 免疫代谢 | 坏死性小肠结肠炎 | 免疫荧光染色,液相色谱-质谱联用,单细胞测序 | NA | 图像,代谢组数据,单细胞测序数据 | 临床NEC样本和ACOD1-/-、ACOD1fl/flLysMcre小鼠模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 428 | 2025-10-06 |
PPARγ controls ESCRT-dependent fibroblast-like synoviocyte exosome biogenesis and alleviates chondrocyte osteoarthritis mediated by exosomal ANXA1
2025-Jul, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2025.06.008
PMID:40678612
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研究论文 | 本研究揭示运动通过上调PPARγ调控ESCRT依赖性成纤维样滑膜细胞外泌体生成，并通过外泌体ANXA1蛋白缓解骨关节炎 | 首次发现PPARγ通过ESCRT通路调控成纤维样滑膜细胞外泌体生成，并鉴定ANXA1为关键治疗性外泌体货物蛋白 | NA | 探索运动疗法缓解骨关节炎的分子机制及外泌体介导的细胞间通讯 | 成纤维样滑膜细胞和软骨细胞 | 细胞生物学 | 骨关节炎 | 单细胞转录组测序, 定量蛋白质组学, 数据非依赖性采集 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 429 | 2025-10-06 |
Rod-shaped microglia represent a morphologically distinct subpopulation of disease-associated microglia
2025-Jul-16, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03504-5
PMID:40671004
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研究论文 | 本研究在小鼠模型中鉴定了一种形态独特的杆状小胶质细胞亚群，并探讨其形成机制 | 首次发现杆状小胶质细胞是神经退行性疾病早期出现的独特活化亚群，其形成不依赖C1q介导的突触修剪机制 | 研究仅基于GCLC缺陷小鼠模型，尚未在其他神经退行性疾病模型中验证 | 探究小胶质细胞形态变化与基因表达谱的关联机制 | 谷胱甘肽缺陷诱导氧化应激的GCLC缺陷小鼠模型中的小胶质细胞 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单核RNA测序, 通路富集分析, 分子分析 | NA | 基因表达数据, 形态学数据 | GCLC缺陷小鼠皮质组织 | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 430 | 2025-10-06 |
Campylobacter jejuni regulates cell cycle progression to potentiate host cell invasion
2025-Jul-16, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02348-z
PMID:40671100
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研究论文 | 本研究揭示了空肠弯曲菌通过调节宿主细胞周期进程来增强细胞入侵能力 | 首次发现空肠弯曲菌通过调控宿主细胞G1期来促进细菌入侵和炎症反应 | 研究主要使用INT 407细胞系，未在体内模型或原代细胞中验证 | 探究空肠弯曲菌如何通过调控宿主细胞周期来增强其致病性 | 空肠弯曲菌感染的INT 407人上皮细胞 | 细胞生物学 | 肠道感染 | 流式细胞术,单细胞RNA测序,RT-qPCR,共聚焦显微镜,ELISA | NA | 基因表达数据,细胞图像,细胞周期数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 431 | 2025-10-06 |
Vagal Stimulation Rescues HFpEF by Altering Cardiac Resident Macrophage Function
2025-Jul-15, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326236
PMID:40662221
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了经皮迷走神经刺激通过调节心脏驻留巨噬细胞功能改善射血分数保留型心衰的机制 | 首次发现tVNS通过改变心脏驻留巨噬细胞亚群的功能（减少CCR2+巨噬细胞及其Spp1表达，同时诱导TLF+/MHC2+巨噬细胞表达Igf1）来改善HFpEF | 研究基于小鼠模型，需要在人类患者中进一步验证 | 探究迷走神经刺激改善HFpEF的心脏驻留巨噬细胞机制 | HFpEF小鼠模型 | 心血管研究 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，超声心动图 | NA | 基因表达数据，心脏功能数据 | 对照组、HFpEF+假刺激组、HFpEF+tVNS组小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 432 | 2025-10-06 |
Tumor-intrinsic ENO1 inhibition promotes antitumor immune response and facilitates the efficacy of anti-PD-L1 immunotherapy in bladder cancer
2025-Jul-15, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03464-x
PMID:40665335
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研究论文 | 本研究通过CRISPR筛选和RNA测序发现ENO1是膀胱癌抗PD-L1免疫治疗疗效的关键调控因子 | 首次发现ENO1通过SPPO-ITGA4/ITGB1通路调控CD8 T细胞功能和肿瘤相关巨噬细胞极化，揭示了肿瘤内在ENO1在免疫逃避中的新机制 | 研究主要聚焦于膀胱癌，其他癌症类型中的适用性需要进一步验证 | 探索膀胱癌免疫治疗耐药机制并寻找新的治疗靶点 | 膀胱癌样本和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 癌症免疫学 | 膀胱癌 | CRISPR-Cas9筛选, RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 临床膀胱癌样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 433 | 2025-10-06 |
Integration of scRNA-seq and ST-seq identifies hyperproliferative RRM2+ cells features and therapeutic targets in gastric cancer
2025-Jul-15, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06847-y
PMID:40665360
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组测序技术，识别胃癌中过度增殖的RRM2+细胞特征并发现治疗靶点 | 首次结合scRNA-seq和ST-seq技术系统解析胃癌中过度增殖细胞的表型可塑性，发现RRM2过表达的关键作用并验证其抑制剂奥沙利胺的抗肿瘤效果 | 样本量相对有限（40个scRNA-seq样本和6个ST样本），需要更大规模研究验证 | 探究胃癌中过度增殖细胞的特征及其在肿瘤进展中的作用机制 | 人类胃组织样本，涵盖肿瘤进展不同阶段 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 40个scRNA-seq样本和6个ST样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 434 | 2025-10-06 |
SIRT7 facilitates ferroptosis resistance of melanocytes via activating the SMAD3-ATF3-GPX4 signaling pathway in vitiligo
2025-Jul-12, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.07.020
PMID:40659088
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研究论文 | 本研究揭示了SIRT7通过激活SMAD3-ATF3-GPX4信号通路抵抗黑色素细胞铁死亡的新机制 | 首次发现SIRT7在白癜风中通过SMAD3-ATF3-GPX4信号通路调控黑色素细胞铁死亡的新机制 | 机制研究主要基于体外实验，临床转化潜力仍需进一步验证 | 探究SIRT7在白癜风黑色素细胞铁死亡中的调控机制 | 白癜风患者皮损组织、黑色素细胞、Sirt7基因敲除小鼠模型 | 分子生物学 | 白癜风 | 单细胞RNA测序、基因敲除、生化分析 | NA | 蛋白质表达数据、基因表达数据、scRNA-seq数据 | 白癜风患者皮损组织与健康供体组织对比 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 435 | 2025-10-06 |
Hair Bundle Degeneration is a Key Contributor to Age-Related Vestibular Dysfunction
2025-Jul-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.02.636113
PMID:39975332
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了年龄相关前庭功能障碍中毛细胞分子特征变化及毛束退化机制 | 首次在单细胞水平揭示前庭毛细胞衰老的分子特征，发现毛束退化是前庭功能衰退的关键因素且早于毛细胞丢失 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究年龄相关前庭功能障碍的病因和分子机制 | 年轻和年老小鼠的前庭毛细胞 | 单细胞转录组学 | 前庭功能障碍 | 单细胞RNA测序，成像技术，电生理记录 | NA | 转录组数据，图像数据，电生理数据 | 年轻和年老小鼠的前庭毛细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 436 | 2025-10-06 |
Paradigms, innovations, and biological applications of RNA velocity: a comprehensive review
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf339
PMID:40668554
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综述 | 本文对RNA速度的计算方法、创新应用和生物学意义进行了系统性综述 | 首次将RNA速度模型系统分类为稳态方法、轨迹方法和状态外推方法，并全面比较了各类方法的假设前提和计算策略 | 模型假设存在局限性，预处理流程和可视化方法仍需优化 | 梳理RNA速度领域的发展现状，为动态转录组研究提供实施指南 | RNA速度计算方法及其在生物学研究中的应用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Velocyto, scVelo等RNA速度模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 437 | 2025-10-06 |
Cardiac fibroblasts regulate myocardium and coronary vasculature development in the murine heart via the collagen signaling pathway
2025-Jul-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.102305
PMID:40591485
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和细胞消融技术揭示了心脏成纤维细胞通过胶原信号通路调控心肌和冠状动脉血管发育的机制 | 首次系统阐明心脏成纤维细胞通过胶原信号通路直接调控心肌细胞和血管内皮细胞发育的时空动态关系 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类心脏发育中验证；长期消融后的代偿机制仍需进一步研究 | 探究心脏发育过程中成纤维细胞对心肌和血管发育的调控作用 | 小鼠心脏发育过程中的成纤维细胞、心肌细胞和血管内皮细胞 | 发育生物学 | 心脏发育缺陷 | 单细胞mRNA测序、RNA染色、白喉毒素A消融系统 | NA | 单细胞RNA测序数据、组织染色图像 | 不同发育阶段的小鼠心脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 438 | 2025-10-06 |
Multi-Omics Analysis and Real-World Data Validation of Serine Metabolism-Related Genes in Colorectal Cancer
2025-Jul, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70721
PMID:40660426
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研究论文 | 通过多组学分析和真实世界数据验证，研究丝氨酸代谢相关基因在结直肠癌中的作用 | 首次对丝氨酸代谢相关基因进行泛癌分析，并在结直肠癌中深入探索其表达模式、预后意义及与肿瘤微环境的关联 | 研究主要基于公共数据库和回顾性队列，需要进一步前瞻性研究验证 | 阐明丝氨酸代谢相关基因在结直肠癌中的表达模式、遗传改变和临床意义 | 结直肠癌患者组织和细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 转录组学、基因组学、表观遗传学、单细胞RNA测序、免疫组化 | NA | 基因表达数据、临床数据、单细胞测序数据 | TCGA和GTEx数据库中的泛癌数据，两个独立的结直肠癌真实世界队列 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 439 | 2025-10-06 |
Bayesian inference of fitness landscapes via tree-structured branching processes
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf193
PMID:40662787
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研究论文 | 提出了一种基于树结构分支过程的贝叶斯推理方法FiTree，用于从单细胞肿瘤突变树中学习适应性景观 | 将表型适应性参数化与贝叶斯推理方案结合，统一了癌症进展的概率图模型与群体遗传学 | 未明确说明模型的计算复杂度或在大规模数据集上的可扩展性限制 | 推断肿瘤进化中的适应性景观，理解突变间的表型相互作用 | 单细胞肿瘤突变树和急性髓系白血病数据集 | 计算生物学 | 急性髓系白血病 | 单细胞测序 | 树结构多类型分支过程模型，贝叶斯推理 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 440 | 2025-10-06 |
Fast and scalable Wasserstein-1 neural optimal transport solver for single-cell perturbation prediction
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf253
PMID:40662778
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研究论文 | 提出一种基于Wasserstein-1的快速可扩展神经最优传输求解器，用于单细胞扰动预测 | 采用Wasserstein-1对偶公式简化优化过程，避免了复杂的极小极大优化问题，并通过对抗训练恢复传输映射 | W1对偶仅揭示传输方向，不直接提供唯一最优传输映射，需要额外步骤确定传输步长 | 开发快速可扩展的最优传输求解器用于单细胞扰动响应预测 | 单细胞扰动数据分布映射 | 机器学习 | NA | 最优传输理论，对抗训练 | 神经网络 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |