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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2025-10-06 |
IGCLAPS: an interpretable graph contrastive learning method with adaptive positive sampling for scRNA-seq data analysis
2025-Jul-21, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf411
PMID:40689508
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研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据分析的可解释图对比学习方法 | 开发了自适应正采样模块,基于表达相似性和软聚类标签动态识别真实正样本对 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中的细胞聚类性能 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图对比学习, 图变换器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 422 | 2025-07-22 |
Cellular-resolution spatial transcriptomics of skin remodelling after fractional CO2 laser treatment
2025-Jul-21, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.20870
PMID:40689597
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 423 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing in tuberculosis: Application and future perspectives
2025-Jul-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003095
PMID:39111829
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在结核病研究中的应用现状与未来展望 | 系统总结了scRNA-seq在结核病领域的应用潜力,并首次探讨其在临床生物标志物发现、宿主导向治疗和精准治疗研究中的具体价值 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于文献综述和理论分析 | 探讨单细胞RNA测序技术在结核病研究中的应用前景和发展方向 | 结核病免疫机制和细胞异质性 | 单细胞组学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 424 | 2025-10-06 |
The Icarian flight of antibody-drug conjugates: target selection amidst complexity and tackling adverse impacts
2025-Jul-19, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwaf002
PMID:39813112
|
综述 | 本文综述抗体药物偶联物(ADCs)在靶点选择和应对毒性挑战方面的研究进展 | 重点探讨多靶点策略、pH依赖性抗体和掩蔽肽技术等创新方法,并强调单细胞测序和人工智能在优化靶点选择中的作用 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据验证 | 分析ADC开发面临的挑战并探讨提高其疗效和安全性的策略 | 抗体药物偶联物(ADCs)及其靶向治疗应用 | NA | 癌症 | 单细胞测序,人工智能 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 425 | 2025-10-06 |
Identification of biomarkers for Laryngeal squamous cell carcinoma through Mendelian randomization and integrated bioinformatics analysis
2025-Jul-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03114-w
PMID:40679719
|
研究论文 | 通过整合多组学数据和孟德尔随机化方法,识别喉鳞状细胞癌的生物标志物并构建预后模型 | 首次系统分析泛凋亡相关基因在LSCC中的作用,结合单细胞RNA测序数据构建预后模型并验证其临床价值 | 样本量相对有限,需要更大规模的前瞻性研究验证模型的临床应用价值 | 识别喉鳞状细胞癌的生物标志物并构建预后预测模型 | 喉鳞状细胞癌患者样本和正常对照样本 | 生物信息学 | 喉癌 | RNA-seq, scRNA-seq, CNV分析, qRT-PCR | Lasso-Cox回归模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 拷贝数变异数据 | 训练集:114例LSCC和12例正常样本;验证集:270例LSCC样本;scRNA-seq:2例LSCC样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 426 | 2025-10-06 |
Architecture mechanics mediated osteogenic progression in bone regeneration of artificial scaffolds
2025-Jul-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv8804
PMID:40680128
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人工骨支架结构通过应力刺激调控骨再生的生物力学机制 | 首次阐明了支架结构诱导应力刺激(SASS)对细胞的生物力学机制,发现了SASS通过调控间充质干细胞粘着斑和成骨分化通路平衡骨重塑过程 | 研究仅针对石墨、富勒烯和金刚石三种支架材料,未涵盖其他生物材料体系 | 探究支架结构通过力学刺激调控骨再生的生物力学机制 | 骨间充质干细胞、破骨细胞、成骨细胞及临界尺寸骨缺损动物模型 | 骨组织工程 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 427 | 2025-10-06 |
Nicotinamide boosts oocyte quantity and quality by promoting N4-acetylation modification in lupus mice
2025-Jul-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adu0955
PMID:40680131
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示烟酰胺通过促进N4-乙酰化修饰改善狼疮小鼠卵母细胞数量和质量的作用机制 | 首次绘制狼疮小鼠卵母细胞acC修饰图谱,揭示NAT10介导的acC修饰在卵母细胞发育异常中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类患者中验证 | 探究系统性红斑狼疮影响卵母细胞发育的分子机制及烟酰胺的治疗潜力 | 系统性红斑狼疮小鼠模型的卵母细胞 | 生殖医学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞转录组测序, 翻译组测序, acC-RNA免疫沉淀测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, 翻译组数据, 表观遗传修饰数据 | 狼疮小鼠卵母细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 翻译组测序, 表观遗传学测序 | NA | NA |
| 428 | 2025-10-06 |
NPLOC4 constructs tumor immunosuppressive microenvironment in pan-cancer and hepatocellular carcinoma
2025-Jul-17, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究探讨NPLOC4在泛癌和肝细胞癌肿瘤免疫微环境中的作用及其作为免疫治疗靶点的潜力 | 首次系统揭示NPLOC4在肿瘤免疫微环境中的免疫抑制作用及其作为免疫治疗新靶点的潜力 | 研究主要基于公共数据库数据,部分发现需进一步实验验证 | 探究NPLOC4在肿瘤免疫微环境中的作用机制和治疗价值 | 多种肿瘤类型和肝细胞癌患者组织样本及肿瘤细胞系 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | qRT-PCR, 免疫组织化学, 单细胞测序分析 | NA | mRNA表达数据, 蛋白质表达数据, 单细胞测序数据 | 多个公共数据库数据及肝细胞癌患者癌组织和癌旁组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 429 | 2025-10-06 |
Mechanism of Initial Favorable Response to Decitabine in TP53-Mutated MDS/AML and Potential Mechanisms of Subsequent Relapse
2025-Jul-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3192
PMID:40397797
|
研究论文 | 本研究探讨了TP53突变MDS/AML患者对地西他滨初始治疗产生良好反应及后续复发的潜在机制 | 首次通过整合靶向测序、纳米孔DNA甲基化测序和单细胞转录组学,系统分析TP53突变患者在地西他滨治疗过程中白血病细胞与免疫群体的动态变化 | 样本量有限,属于II期临床研究,需要更大规模研究验证 | 阐明TP53突变MDS/AML患者对地西他滨治疗反应及复发的分子机制 | 骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病患者 | 血液肿瘤学 | 骨髓增生异常综合征,急性髓系白血病 | 靶向髓系panel测序,纳米孔DNA胞嘧啶甲基化测序,单细胞转录组学 | NA | 基因组测序数据,甲基化数据,单细胞转录组数据 | 未明确样本数量,但为系列样本(治疗前、治疗完成时、形态学缓解期和复发期) | NA | 单细胞RNA-seq,DNA甲基化测序 | NA | NA |
| 430 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing in Hirschsprung's disease tissues reveals lack of neuronal differentiation in the aganglionic colon segment
2025-Jul-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.01.662516
PMID:40631286
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析先天性巨结肠症组织,揭示无神经节结肠段中神经元分化缺失的机制 | 首次结合单细胞RNA测序和全基因组测序系统比较先天性巨结肠患者健康与无神经节结肠段的细胞组成差异 | 样本量有限,未明确说明具体患者数量 | 探究先天性巨结肠症无神经节结肠段神经元分化障碍的分子机制 | 先天性巨结肠患者的健康与无神经节结肠组织 | 单细胞组学 | 先天性巨结肠症 | 单细胞RNA测序, 全基因组测序 | NA | 单细胞转录组数据, 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 431 | 2025-10-06 |
Examination of an iPSC model of human eye development reveals progressive emergence of critical embryonic cell types
2025-Jul-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-06602-9
PMID:40596144
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研究论文 | 通过多时间点形态学和转录组分析研究人类iPSC衍生的眼发育模型(SEAM)中关键胚胎细胞类型的渐进出现过程 | 开发了模拟人类全眼发育早期阶段的2D模型,首次实现了多种胚胎细胞类型的同步发育研究 | 模型仅覆盖28天的分化过程,可能无法完全模拟更长期的发育事件 | 建立人类眼发育的体外模型并解析关键细胞类型的发育轨迹 | 人类iPSC衍生的SEAM眼细胞模型 | 发育生物学 | 眼发育疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | SEAM模型 | 转录组数据, 形态学数据 | 多时间点(第0、14、28天)的批量RNA-seq和单细胞RNA-seq分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 432 | 2025-10-06 |
cDC1s Promote Atherosclerosis via Local Immunity and Are Targetable for Therapy
2025-Jul-18, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325792
PMID:40444360
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研究论文 | 本研究揭示传统1型树突状细胞通过促进T细胞免疫加剧动脉粥样硬化,并开发靶向cDC1的纳米颗粒疗法 | 首次证实cDC1通过STING通路促进动脉粥样硬化,并开发了靶向CLEC9A的免疫抑制纳米颗粒疗法 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体验证 | 阐明传统树突状细胞在动脉粥样硬化发病机制中的作用并开发靶向治疗策略 | Ldlr-/-基因敲除小鼠和不同cDC1缺陷小鼠模型 | 免疫学 | 心血管疾病 | 流式细胞术,单细胞RNA测序,纳米颗粒靶向治疗 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 多种基因修饰小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 433 | 2025-10-06 |
Integrating bulk and single cell sequencing data to identify prognostic biomarkers and drug candidates in HBV associated hepatocellular carcinoma
2025-Jul-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-10876-4
PMID:40676059
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研究论文 | 整合bulk和单细胞测序数据识别HBV相关肝细胞癌的预后生物标志物和候选药物 | 结合101种机器学习模型开发最优免疫风险指数模型,首次发现SPP1在血管型TAMs中高表达并通过多途径促进肿瘤进展 | 样本量相对有限,机制研究需要进一步实验验证 | 识别HBV相关肝细胞癌的预后生物标志物和潜在治疗靶点 | HBV相关肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,分子对接,PPI分析 | 逐步Cox回归,RSF(随机生存森林),机器学习集成模型 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 434 | 2025-10-06 |
Identification of CTSK as a TLR-related critical biomarker in liver cirrhosis via integrative bioinformatics and pathological characterization
2025-Jul-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-11606-6
PMID:40670571
|
研究论文 | 通过整合生物信息学和病理学方法鉴定CTSK作为肝硬化中TLR相关关键生物标志物 | 首次系统识别TLR相关基因在肝硬化中的作用,发现四个枢纽基因并验证其诊断和治疗价值,揭示CTSK可能通过TLR4-MyD88-NF-κB轴促进肝硬化进展 | 基于公共数据库数据的回顾性分析,需要进一步实验验证机制 | 探索肝硬化中Toll样受体相关基因的诊断和治疗价值 | 肝硬化相关基因和生物标志物 | 生物信息学 | 肝硬化 | 生物信息学分析,qRT-PCR,免疫组化,单细胞RNA测序,分子对接 | 机器学习,风险模型 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 435 | 2025-10-06 |
Modeling tumor relapse using proliferation tracing and ablation transgenic mouse
2025-Jul-17, NPJ breast cancer
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s41523-025-00792-1
PMID:40675988
|
研究论文 | 通过增殖追踪和消融转基因小鼠模型研究肿瘤复发机制 | 开发了双重组酶介导的遗传系统,能够在特定时间窗内追踪并消融增殖细胞 | 基于小鼠模型的研究,与人类肿瘤存在物种差异 | 建立模拟肿瘤复发的临床前动物模型并研究复发机制 | PyMT诱导的自发性小鼠乳腺癌模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 436 | 2025-10-06 |
The role of UBR2 in triple-negative breast cancer and its implications for immune checkpoint blockade therapy
2025-Jul-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03153-3
PMID:40676335
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研究论文 | 本研究探讨UBR2在三阴性乳腺癌中的作用及其对免疫检查点阻断治疗的影响 | 首次揭示UBR2在TNBC免疫抑制微环境中的非泛素化功能,并发现其可作为PD-L1治疗的预测指标 | 研究主要基于数据库分析和体外实验,需要更多临床样本验证 | 阐明UBR2在三阴性乳腺癌免疫治疗中的作用机制 | 三阴性乳腺癌细胞系和患者样本 | 癌症免疫学 | 三阴性乳腺癌 | RNA测序, Western blotting, 流式细胞术, 免疫浸润分析 | NA | RNA测序数据, 蛋白质印迹数据, 流式细胞数据 | 来自GEO和TCGA数据库的三阴性乳腺癌患者队列 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 437 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the effects of mental stress on mouse mammary tumors and the tumor microenvironment
2025-Jul-16, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02619-1
PMID:40670350
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究精神压力对小鼠乳腺肿瘤及肿瘤微环境的影响 | 首次在体内系统阐明精神压力通过诱导肿瘤细胞去分化为癌症干细胞样细胞、改变免疫细胞组成(如增加TANs和TIDCs,抑制CTLs等)促进肿瘤生长的机制 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究精神压力对乳腺肿瘤及其微环境的影响机制 | MMTV-PyMT转基因小鼠的乳腺肿瘤组织 | 单细胞测序分析 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、通路富集分析 | NA | 单细胞转录组数据、组织切片图像 | MMTV-PyMT转基因小鼠肿瘤组织(压力暴露与未暴露组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 438 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing combined with spatial transcriptomics reveals the characteristics of follicle-targeted inflammation patterns in primary cicatricial alopecia
2025-Jul-16, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01447-1
PMID:40671126
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学揭示了原发性瘢痕性秃发中毛囊靶向炎症模式的特征 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术系统分析LPP毛囊靶向炎症的细胞组成、空间定位和细胞间相互作用 | 样本量相对有限,仅分析了LPP、LS和对照组的头皮样本 | 研究原发性瘢痕性秃发中毛囊靶向炎症的特征并识别治疗靶点 | 扁平苔藓样秃发、局限性硬皮病和对照组的头皮样本 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | LPP、LS和对照组头皮样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 439 | 2025-10-06 |
Utilizing genomics to identify novel immunotherapeutic targets in multiple myeloma high-risk subgroups
2025-Jul-15, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01503-y
PMID:40665393
|
研究论文 | 本研究开发了一种利用多组学数据识别多发性骨髓瘤新型免疫治疗靶点的方法 | 建立了整合细胞表面潜力、健康器官表达和MM细胞表达水平的框架来定义新型免疫治疗靶点,并识别了亚型特异性靶点 | NA | 识别多发性骨髓瘤高危亚群的新型免疫治疗靶点 | 多发性骨髓瘤患者样本和细胞系 | 基因组学 | 多发性骨髓瘤 | 多组学分析,流式细胞术,免疫印迹,CRISPR-Cas9敲除模型,单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据,转录组数据,蛋白质数据 | 两个大型数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 440 | 2025-10-06 |
Paneth cells inhibit intestinal stem cell proliferation through the bone morphogenic protein 7 pathway under rotavirus-mediated intestinal injury
2025-Jul-14, World journal of gastroenterology
IF:4.3Q1
DOI:10.3748/wjg.v31.i26.107044
PMID:40678707
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研究论文 | 本研究揭示了潘氏细胞通过骨形态发生蛋白7通路抑制肠道干细胞增殖的机制,以应对轮状病毒介导的肠道损伤 | 首次发现轮状病毒直接感染潘氏细胞,并阐明潘氏细胞通过BMP7信号通路调控肠道干细胞增殖的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和类器官,在人体中的验证仍需进一步研究 | 探究轮状病毒感染对潘氏细胞的影响及潘氏细胞在肠道损伤修复中对肠道干细胞的调控作用 | 潘氏细胞、肠道干细胞、轮状病毒感染的肠道组织 | 单细胞生物学 | 肠道感染性疾病 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、流式细胞术、逆转录定量聚合酶链反应 | CellChat、伪时序分析 | 单细胞RNA测序数据、免疫组织化学数据 | Lgr5-EGFP-IRES-CreERT2小鼠和肠道类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |