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当前共找到 801 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2025-10-06 |
ARTEMIS integrates autoencoders and Schrödinger Bridges to predict continuous dynamics of gene expression, cell population, and perturbation from time-series single-cell data
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf218
PMID:40662824
|
研究论文 | 提出ARTEMIS生成模型，整合变分自编码器和薛定谔桥来预测基因表达、细胞群体和扰动的连续动态 | 将变分自编码器与不平衡扩散薛定谔桥结合，首次在连续潜空间中重建细胞轨迹并估计时间依赖性细胞死亡率 | 基于单时间点快照数据推断连续动态，可能受限于数据稀疏性和技术噪声 | 从时间序列单细胞数据重建细胞轨迹、揭示基因表达动态和恢复细胞群体变化 | 胰腺β细胞分化、斑马鱼胚胎发生、癌细胞上皮间质转化过程 | 单细胞数据分析 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器(VAE), 薛定谔桥, 随机微分方程(SDEs) | 单细胞基因表达数据 | 三个scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 402 | 2025-10-06 |
Transcriptome assembly at single-cell resolution with Beaver
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf236
PMID:40662838
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研究论文 | 开发了一种名为Beaver的单细胞特异性转录本组装工具，用于短读长单细胞RNA测序数据 | 设计了转录本片段图组织个体组装，采用动态规划算法搜索全长转录本，并整合两个随机森林模型准确估计候选转录本在单个细胞中的表达可能性 | 仅针对短读长scRNA-seq数据设计，未验证在其他单细胞测序技术上的表现 | 解决单细胞分辨率下全长转录本重建的挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | Smart-seq3 | Smart-seq3单细胞RNA测序技术 |
| 403 | 2025-10-06 |
Biallelic Mutations in the Otogelin-Like Gene (OTOGL) Associated With Congenital Non-Syndromic Sensorineural Hearing Loss in a Chinese Family
2025-Jul, Molecular genetics & genomic medicine
IF:1.5Q4
DOI:10.1002/mgg3.70122
PMID:40682330
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研究论文 | 通过全外显子测序在中国家庭中发现OTOGL基因双等位基因突变与非综合征性先天性听力损失相关 | 首次在中国家庭中鉴定出OTOGL基因复合杂合突变(p.Ile34Val和p.Phe319del)与先天性听力损失的关联 | 研究仅针对单个中国家庭，OTOGL基因突变谱和功能相关性仍需进一步研究 | 探索OTOGL基因突变与非综合征性感觉神经性听力损失的遗传机制 | 患有不明原因听力损失的中国家庭成员 | 遗传学 | 听力损失 | 全外显子测序,Sanger测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,转录组数据 | 1个中国家庭(先证者为6岁男孩) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 404 | 2025-10-06 |
T Cells Enhance Tissue Complexity and Function to Study Fibrosis in 3D Skin-Like Tissue Models
2025-Jul, Tissue engineering. Part C, Methods
DOI:10.1177/19373341251360742
PMID:40690724
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研究论文 | 本研究开发了含有T细胞的3D皮肤样组织模型，用于研究纤维化疾病中T细胞的作用机制 | 首次在3D皮肤样组织中整合自体T细胞、成纤维细胞、巨噬细胞和角质形成细胞，并通过单细胞RNA测序鉴定T细胞亚群 | 模型仍需进一步验证其在其他器官纤维化研究中的适用性 | 研究T细胞在组织纤维化发病机制中的作用 | 硬皮病患者的血液来源T细胞、成纤维细胞、巨噬细胞和角质形成细胞 | 组织工程 | 硬皮病、特发性肺纤维化、肝纤维化、肾纤维化 | 单细胞RNA测序、酶联免疫吸附试验、组织分析 | 3D组织工程模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、组织形态数据 | 硬皮病患者来源的细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 405 | 2025-10-06 |
A Deep Learning Approach to Assessing Cell Identity in Stem Cell-Based Embryo Models
2025-Jul-22, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2025_654
PMID:40690128
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研究论文 | 开发了一种基于深度学习的集成模型，用于评估干细胞胚胎模型中细胞身份与发育保真度 | 首次将深度学习与单细胞RNA测序数据整合，创建了能够评估体外细胞类型身份并提供分类可靠性熵分数的工具 | NA | 评估干细胞胚胎模型中细胞类型与真实胚胎发育的相似程度 | 胚胎干细胞、胚胎体、体外分化细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 406 | 2025-10-06 |
IGCLAPS: an interpretable graph contrastive learning method with adaptive positive sampling for scRNA-seq data analysis
2025-Jul-21, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf411
PMID:40689508
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研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据分析的可解释图对比学习方法 | 开发了自适应正采样模块，基于表达相似性和软聚类标签动态识别真实正样本对 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中的细胞聚类性能 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图对比学习, 图变换器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 407 | 2025-07-22 |
Cellular-resolution spatial transcriptomics of skin remodelling after fractional CO2 laser treatment
2025-Jul-21, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.20870
PMID:40689597
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 408 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing in tuberculosis: Application and future perspectives
2025-Jul-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003095
PMID:39111829
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在结核病研究中的应用现状与未来展望 | 系统总结了scRNA-seq在结核病领域的应用潜力，并首次探讨其在临床生物标志物发现、宿主导向治疗和精准治疗研究中的具体价值 | 未涉及具体实验数据验证，主要基于文献综述和理论分析 | 探讨单细胞RNA测序技术在结核病研究中的应用前景和发展方向 | 结核病免疫机制和细胞异质性 | 单细胞组学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 409 | 2025-10-06 |
The Icarian flight of antibody-drug conjugates: target selection amidst complexity and tackling adverse impacts
2025-Jul-19, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwaf002
PMID:39813112
|
综述 | 本文综述抗体药物偶联物（ADCs）在靶点选择和应对毒性挑战方面的研究进展 | 重点探讨多靶点策略、pH依赖性抗体和掩蔽肽技术等创新方法，并强调单细胞测序和人工智能在优化靶点选择中的作用 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据验证 | 分析ADC开发面临的挑战并探讨提高其疗效和安全性的策略 | 抗体药物偶联物（ADCs）及其靶向治疗应用 | NA | 癌症 | 单细胞测序，人工智能 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 410 | 2025-10-06 |
Identification of biomarkers for Laryngeal squamous cell carcinoma through Mendelian randomization and integrated bioinformatics analysis
2025-Jul-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03114-w
PMID:40679719
|
研究论文 | 通过整合多组学数据和孟德尔随机化方法，识别喉鳞状细胞癌的生物标志物并构建预后模型 | 首次系统分析泛凋亡相关基因在LSCC中的作用，结合单细胞RNA测序数据构建预后模型并验证其临床价值 | 样本量相对有限，需要更大规模的前瞻性研究验证模型的临床应用价值 | 识别喉鳞状细胞癌的生物标志物并构建预后预测模型 | 喉鳞状细胞癌患者样本和正常对照样本 | 生物信息学 | 喉癌 | RNA-seq, scRNA-seq, CNV分析, qRT-PCR | Lasso-Cox回归模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 拷贝数变异数据 | 训练集：114例LSCC和12例正常样本；验证集：270例LSCC样本；scRNA-seq：2例LSCC样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 411 | 2025-10-06 |
Architecture mechanics mediated osteogenic progression in bone regeneration of artificial scaffolds
2025-Jul-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv8804
PMID:40680128
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人工骨支架结构通过应力刺激调控骨再生的生物力学机制 | 首次阐明了支架结构诱导应力刺激(SASS)对细胞的生物力学机制，发现了SASS通过调控间充质干细胞粘着斑和成骨分化通路平衡骨重塑过程 | 研究仅针对石墨、富勒烯和金刚石三种支架材料，未涵盖其他生物材料体系 | 探究支架结构通过力学刺激调控骨再生的生物力学机制 | 骨间充质干细胞、破骨细胞、成骨细胞及临界尺寸骨缺损动物模型 | 骨组织工程 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 412 | 2025-10-06 |
Nicotinamide boosts oocyte quantity and quality by promoting N4-acetylation modification in lupus mice
2025-Jul-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adu0955
PMID:40680131
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示烟酰胺通过促进N4-乙酰化修饰改善狼疮小鼠卵母细胞数量和质量的作用机制 | 首次绘制狼疮小鼠卵母细胞acC修饰图谱，揭示NAT10介导的acC修饰在卵母细胞发育异常中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类患者中验证 | 探究系统性红斑狼疮影响卵母细胞发育的分子机制及烟酰胺的治疗潜力 | 系统性红斑狼疮小鼠模型的卵母细胞 | 生殖医学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞转录组测序, 翻译组测序, acC-RNA免疫沉淀测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, 翻译组数据, 表观遗传修饰数据 | 狼疮小鼠卵母细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 翻译组测序, 表观遗传学测序 | NA | NA |
| 413 | 2025-10-06 |
NPLOC4 constructs tumor immunosuppressive microenvironment in pan-cancer and hepatocellular carcinoma
2025-Jul-17, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究探讨NPLOC4在泛癌和肝细胞癌肿瘤免疫微环境中的作用及其作为免疫治疗靶点的潜力 | 首次系统揭示NPLOC4在肿瘤免疫微环境中的免疫抑制作用及其作为免疫治疗新靶点的潜力 | 研究主要基于公共数据库数据，部分发现需进一步实验验证 | 探究NPLOC4在肿瘤免疫微环境中的作用机制和治疗价值 | 多种肿瘤类型和肝细胞癌患者组织样本及肿瘤细胞系 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | qRT-PCR, 免疫组织化学, 单细胞测序分析 | NA | mRNA表达数据, 蛋白质表达数据, 单细胞测序数据 | 多个公共数据库数据及肝细胞癌患者癌组织和癌旁组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 414 | 2025-10-06 |
Mechanism of Initial Favorable Response to Decitabine in TP53-Mutated MDS/AML and Potential Mechanisms of Subsequent Relapse
2025-Jul-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3192
PMID:40397797
|
研究论文 | 本研究探讨了TP53突变MDS/AML患者对地西他滨初始治疗产生良好反应及后续复发的潜在机制 | 首次通过整合靶向测序、纳米孔DNA甲基化测序和单细胞转录组学，系统分析TP53突变患者在地西他滨治疗过程中白血病细胞与免疫群体的动态变化 | 样本量有限，属于II期临床研究，需要更大规模研究验证 | 阐明TP53突变MDS/AML患者对地西他滨治疗反应及复发的分子机制 | 骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病患者 | 血液肿瘤学 | 骨髓增生异常综合征,急性髓系白血病 | 靶向髓系panel测序,纳米孔DNA胞嘧啶甲基化测序,单细胞转录组学 | NA | 基因组测序数据,甲基化数据,单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，但为系列样本（治疗前、治疗完成时、形态学缓解期和复发期） | NA | 单细胞RNA-seq,DNA甲基化测序 | NA | NA |
| 415 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing in Hirschsprung's disease tissues reveals lack of neuronal differentiation in the aganglionic colon segment
2025-Jul-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.01.662516
PMID:40631286
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析先天性巨结肠症组织，揭示无神经节结肠段中神经元分化缺失的机制 | 首次结合单细胞RNA测序和全基因组测序系统比较先天性巨结肠患者健康与无神经节结肠段的细胞组成差异 | 样本量有限，未明确说明具体患者数量 | 探究先天性巨结肠症无神经节结肠段神经元分化障碍的分子机制 | 先天性巨结肠患者的健康与无神经节结肠组织 | 单细胞组学 | 先天性巨结肠症 | 单细胞RNA测序, 全基因组测序 | NA | 单细胞转录组数据, 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 416 | 2025-10-06 |
Examination of an iPSC model of human eye development reveals progressive emergence of critical embryonic cell types
2025-Jul-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-06602-9
PMID:40596144
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研究论文 | 通过多时间点形态学和转录组分析研究人类iPSC衍生的眼发育模型（SEAM）中关键胚胎细胞类型的渐进出现过程 | 开发了模拟人类全眼发育早期阶段的2D模型，首次实现了多种胚胎细胞类型的同步发育研究 | 模型仅覆盖28天的分化过程，可能无法完全模拟更长期的发育事件 | 建立人类眼发育的体外模型并解析关键细胞类型的发育轨迹 | 人类iPSC衍生的SEAM眼细胞模型 | 发育生物学 | 眼发育疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | SEAM模型 | 转录组数据, 形态学数据 | 多时间点（第0、14、28天）的批量RNA-seq和单细胞RNA-seq分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 417 | 2025-10-06 |
Genetic Loci Associated With Periodontitis: The FinnGen Study Based on National Health Registers
2025-Jul-19, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.14193
PMID:40682483
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研究论文 | 基于芬兰基因组队列进行牙周炎的全基因组关联研究，识别了11个与牙周炎相关的独立遗传位点 | 发现了6个常见且新颖的牙周炎相关遗传位点，并首次在HLA区域识别了与牙周炎的独立关联 | 研究仅基于芬兰人群，可能限制了结果的普适性 | 探索牙周炎的遗传基础 | 近25万芬兰个体 | 基因组学 | 牙周炎 | GWAS, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 健康登记数据 | 约250,000名芬兰个体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 418 | 2025-10-06 |
scIMGCN: an Automatic Single-Cell Type Annotation Method Based on Interpretable Graph Convolutional Network
2025-Jul-19, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00738-y
PMID:40682757
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研究论文 | 提出一种基于可解释图卷积网络的自动单细胞类型注释方法scIMGCN | 通过图结构增强、改进Transformer模块和基于KAN的GCN变体提升注释精度，并引入可解释性掩蔽机制增强模型决策透明度 | NA | 开发自动单细胞类型注释方法以解决大规模单细胞数据集中细胞类型准确识别和分类的挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图卷积网络(GCN), Transformer, 科尔莫戈罗夫-阿诺德网络(KAN) | 基因表达数据 | 十个真实数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 419 | 2025-10-06 |
cDC1s Promote Atherosclerosis via Local Immunity and Are Targetable for Therapy
2025-Jul-18, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325792
PMID:40444360
|
研究论文 | 本研究揭示传统1型树突状细胞通过促进T细胞免疫加剧动脉粥样硬化，并开发靶向cDC1的纳米颗粒疗法 | 首次证实cDC1通过STING通路促进动脉粥样硬化，并开发了靶向CLEC9A的免疫抑制纳米颗粒疗法 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体验证 | 阐明传统树突状细胞在动脉粥样硬化发病机制中的作用并开发靶向治疗策略 | Ldlr-/-基因敲除小鼠和不同cDC1缺陷小鼠模型 | 免疫学 | 心血管疾病 | 流式细胞术，单细胞RNA测序，纳米颗粒靶向治疗 | NA | 基因表达数据，细胞表型数据 | 多种基因修饰小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 420 | 2025-10-06 |
Integrating bulk and single cell sequencing data to identify prognostic biomarkers and drug candidates in HBV associated hepatocellular carcinoma
2025-Jul-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-10876-4
PMID:40676059
|
研究论文 | 整合bulk和单细胞测序数据识别HBV相关肝细胞癌的预后生物标志物和候选药物 | 结合101种机器学习模型开发最优免疫风险指数模型，首次发现SPP1在血管型TAMs中高表达并通过多途径促进肿瘤进展 | 样本量相对有限，机制研究需要进一步实验验证 | 识别HBV相关肝细胞癌的预后生物标志物和潜在治疗靶点 | HBV相关肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，分子对接，PPI分析 | 逐步Cox回归，RSF（随机生存森林），机器学习集成模型 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |