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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2025-10-06 |
The Dichotomy of Tumor Control by Recruited and Resident Tumor-Associated Macrophages
2025-Jul-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6977440/v1
PMID:40630529
|
研究论文 | 本研究揭示了肿瘤相关巨噬细胞中不同亚群在肿瘤控制中的双重作用 | 首次明确区分了组织驻留间质巨噬细胞不同亚群的促瘤和抑瘤功能,并发现CCR5阻断可改善肿瘤控制 | 研究主要聚焦于黑色素瘤和肺腺癌模型,在其他癌症类型中的普适性需进一步验证 | 阐明肿瘤相关巨噬细胞不同亚群在肿瘤进展中的功能异质性 | 肿瘤相关巨噬细胞(包括recMacs和IMs) | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤,肺腺癌 | 空间转录组学,基因敲除模型 | Pf4 Cx3cr1小鼠模型 | 基因表达数据,空间定位数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 402 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing in Hirschsprung's disease tissues reveals lack of neuronal differentiation in the aganglionic colon segment
2025-Jul-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.01.662516
PMID:40631286
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析先天性巨结肠症组织,揭示无神经节结肠段中神经元分化缺失的机制 | 首次结合单细胞RNA测序和全基因组测序系统比较先天性巨结肠患者健康与无神经节结肠段的细胞组成差异 | 样本量有限,未明确说明具体患者数量 | 探究先天性巨结肠症无神经节结肠段神经元分化障碍的分子机制 | 先天性巨结肠患者的健康与无神经节结肠组织 | 单细胞组学 | 先天性巨结肠症 | 单细胞RNA测序, 全基因组测序 | NA | 单细胞转录组数据, 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 403 | 2025-10-06 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveal a Tumor-Associated Macrophage Subpopulation that Mediates Prostate Cancer Progression and Metastasis
2025-Jul-02, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-24-0791
PMID:40105746
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学发现介导前列腺癌进展和转移的肿瘤相关巨噬细胞亚群 | 首次识别并验证了SPP1+/TREM2+肿瘤相关巨噬细胞亚群在前列腺癌转移中的关键作用及其治疗潜力 | 研究样本量有限,需要更大规模临床验证 | 揭示肿瘤相关巨噬细胞在前列腺癌进展和转移中的作用机制 | 前列腺癌患者样本和鼠模型中的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重免疫荧光 | 鼠模型 | 基因表达数据,空间定位数据,免疫染色数据 | 人类患者样本和鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 404 | 2025-10-06 |
Examination of an iPSC model of human eye development reveals progressive emergence of critical embryonic cell types
2025-Jul-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-06602-9
PMID:40596144
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研究论文 | 通过多时间点形态学和转录组分析研究人类iPSC衍生的眼发育模型(SEAM)中关键胚胎细胞类型的渐进出现过程 | 开发了模拟人类全眼发育早期阶段的2D模型,首次实现了多种胚胎细胞类型的同步发育研究 | 模型仅覆盖28天的分化过程,可能无法完全模拟更长期的发育事件 | 建立人类眼发育的体外模型并解析关键细胞类型的发育轨迹 | 人类iPSC衍生的SEAM眼细胞模型 | 发育生物学 | 眼发育疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | SEAM模型 | 转录组数据, 形态学数据 | 多时间点(第0、14、28天)的批量RNA-seq和单细胞RNA-seq分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 405 | 2025-10-06 |
Cadmium exposure following early-life respiratory syncytial virus infection promotes lung fibrosis through autophagy inhibition
2025-Jul-01, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/toxsci/kfaf054
PMID:40268749
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研究论文 | 本研究探讨了早期呼吸道合胞病毒感染后镉暴露通过抑制自噬促进肺纤维化的机制 | 揭示了mTORC1激活-自噬抑制通路在镉暴露加重病毒感染后肺纤维化中的关键作用 | 使用小鼠模型,结果向人类临床应用的转化需要进一步验证 | 研究慢性低剂量镉暴露在早期RSV感染后促进肺纤维化的分子机制 | 小鼠模型 | 病理生理学 | 肺纤维化 | 代谢组学分析,单细胞RNA测序 | 动物模型 | 基因表达数据,代谢物数据,组织病理数据 | 未明确说明具体样本数量的小鼠实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 406 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic and chromatin dynamics of the human brain in PTSD
2025-Jul, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09083-y
PMID:40533550
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研究论文 | 通过单细胞转录组和染色质分析揭示创伤后应激障碍患者前额叶皮层的细胞特异性分子调控机制 | 首次在超过200万个细胞核中系统分析PTSD的细胞类型特异性表观基因组调控机制,整合遗传、转录组和表观遗传数据 | 使用死后脑组织样本,可能无法完全反映活体状态;样本量相对有限 | 解析创伤后应激障碍的细胞特异性分子调控机制 | 111例人类大脑背外侧前额叶皮层组织(含PTSD、重度抑郁症患者和对照组) | 单细胞组学 | 创伤后应激障碍 | 单细胞转录组测序, 染色质可及性分析, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据, 表观遗传数据, 空间转录组数据 | 111例人脑样本,超过200万个细胞核 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 407 | 2025-10-06 |
Technologies for Decoding Cancer Metabolism with Spatial Resolution
2025-Jul-01, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041553
PMID:39284668
|
综述 | 本文讨论了三种新兴的代谢组学技术在解码癌症代谢中的应用 | 聚焦空间代谢组学、单细胞代谢组学和细胞器代谢组学三种新兴技术 | NA | 研究癌症代谢及其技术发展 | 癌细胞代谢途径 | 代谢组学 | 癌症 | 代谢组学、质谱分析 | NA | 代谢物数据 | NA | NA | 空间代谢组学, 单细胞代谢组学, 细胞器代谢组学, 单细胞转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 408 | 2025-10-06 |
Noncanonical Differentiation of Memory B Cells Drives Latent Tuberculosis Infection Reactivation Upon Tumor Necrosis Factor-Alpha Inhibitor Therapy: An Integrative Transcriptomic Study
2025-Jul, International journal of rheumatic diseases
IF:2.4Q2
DOI:10.1111/1756-185X.70311
PMID:40686471
|
研究论文 | 通过整合转录组分析揭示记忆B细胞在肿瘤坏死因子抑制剂治疗期间驱动潜伏结核感染复活的非经典分化机制 | 首次发现ROR1+记忆B细胞在结核病进展中的非经典分化轨迹及其代谢重编程作用 | 基于六项现有转录组数据集的二次分析,缺乏实验验证 | 探索TNFi治疗导致潜伏结核感染复活的分子机制 | 记忆B细胞在结核病进展和TNFi治疗过程中的变化 | 生物信息学 | 结核病 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | 伪时间分析,转录因子分析 | 转录组数据 | 六个转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 409 | 2025-10-06 |
Identification of potential biomarkers and therapeutic targets for cerebral venous thrombosis
2025-Jul-20, Neurological research
IF:1.7Q4
DOI:10.1080/01616412.2025.2532039
PMID:40684330
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化方法系统识别与脑静脉血栓形成相关的可药物化基因 | 首次整合外周血和脑组织eQTL数据集,结合多变量分析和药物重定位策略发现CVT新靶点 | 基于遗传推断的结果需要进一步的机制和临床验证 | 识别脑静脉血栓形成的潜在生物标志物和治疗靶点 | 脑静脉血栓形成患者 | 生物信息学 | 脑静脉血栓形成 | 孟德尔随机化, eQTL分析, 单细胞RNA测序, 分子对接 | 两样本孟德尔随机化, 基于汇总数据的MR, 贝叶斯共定位 | 基因组数据, 表达数据 | 两个大规模eQTL数据集和FinnGen GWAS汇总统计数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 全基因组关联分析 | NA | NA |
| 410 | 2025-10-06 |
Genetic Loci Associated With Periodontitis: The FinnGen Study Based on National Health Registers
2025-Jul-19, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.14193
PMID:40682483
|
研究论文 | 基于芬兰基因组队列进行牙周炎的全基因组关联研究,识别了11个与牙周炎相关的独立遗传位点 | 发现了6个常见且新颖的牙周炎相关遗传位点,并首次在HLA区域识别了与牙周炎的独立关联 | 研究仅基于芬兰人群,可能限制了结果的普适性 | 探索牙周炎的遗传基础 | 近25万芬兰个体 | 基因组学 | 牙周炎 | GWAS, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 健康登记数据 | 约250,000名芬兰个体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 411 | 2025-10-06 |
scIMGCN: an Automatic Single-Cell Type Annotation Method Based on Interpretable Graph Convolutional Network
2025-Jul-19, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00738-y
PMID:40682757
|
研究论文 | 提出一种基于可解释图卷积网络的自动单细胞类型注释方法scIMGCN | 通过图结构增强、改进Transformer模块和基于KAN的GCN变体提升注释精度,并引入可解释性掩蔽机制增强模型决策透明度 | NA | 开发自动单细胞类型注释方法以解决大规模单细胞数据集中细胞类型准确识别和分类的挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图卷积网络(GCN), Transformer, 科尔莫戈罗夫-阿诺德网络(KAN) | 基因表达数据 | 十个真实数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 412 | 2025-10-06 |
cDC1s Promote Atherosclerosis via Local Immunity and Are Targetable for Therapy
2025-Jul-18, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325792
PMID:40444360
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研究论文 | 本研究揭示传统1型树突状细胞通过促进T细胞免疫加剧动脉粥样硬化,并开发靶向cDC1的纳米颗粒疗法 | 首次证实cDC1通过STING通路促进动脉粥样硬化,并开发了靶向CLEC9A的免疫抑制纳米颗粒疗法 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体验证 | 阐明传统树突状细胞在动脉粥样硬化发病机制中的作用并开发靶向治疗策略 | Ldlr-/-基因敲除小鼠和不同cDC1缺陷小鼠模型 | 免疫学 | 心血管疾病 | 流式细胞术,单细胞RNA测序,纳米颗粒靶向治疗 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 多种基因修饰小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 413 | 2025-10-06 |
Integrating bulk and single cell sequencing data to identify prognostic biomarkers and drug candidates in HBV associated hepatocellular carcinoma
2025-Jul-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-10876-4
PMID:40676059
|
研究论文 | 整合bulk和单细胞测序数据识别HBV相关肝细胞癌的预后生物标志物和候选药物 | 结合101种机器学习模型开发最优免疫风险指数模型,首次发现SPP1在血管型TAMs中高表达并通过多途径促进肿瘤进展 | 样本量相对有限,机制研究需要进一步实验验证 | 识别HBV相关肝细胞癌的预后生物标志物和潜在治疗靶点 | HBV相关肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,分子对接,PPI分析 | 逐步Cox回归,RSF(随机生存森林),机器学习集成模型 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 414 | 2025-10-06 |
Identification of CTSK as a TLR-related critical biomarker in liver cirrhosis via integrative bioinformatics and pathological characterization
2025-Jul-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-11606-6
PMID:40670571
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研究论文 | 通过整合生物信息学和病理学方法鉴定CTSK作为肝硬化中TLR相关关键生物标志物 | 首次系统识别TLR相关基因在肝硬化中的作用,发现四个枢纽基因并验证其诊断和治疗价值,揭示CTSK可能通过TLR4-MyD88-NF-κB轴促进肝硬化进展 | 基于公共数据库数据的回顾性分析,需要进一步实验验证机制 | 探索肝硬化中Toll样受体相关基因的诊断和治疗价值 | 肝硬化相关基因和生物标志物 | 生物信息学 | 肝硬化 | 生物信息学分析,qRT-PCR,免疫组化,单细胞RNA测序,分子对接 | 机器学习,风险模型 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 415 | 2025-10-06 |
Modeling tumor relapse using proliferation tracing and ablation transgenic mouse
2025-Jul-17, NPJ breast cancer
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s41523-025-00792-1
PMID:40675988
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研究论文 | 通过增殖追踪和消融转基因小鼠模型研究肿瘤复发机制 | 开发了双重组酶介导的遗传系统,能够在特定时间窗内追踪并消融增殖细胞 | 基于小鼠模型的研究,与人类肿瘤存在物种差异 | 建立模拟肿瘤复发的临床前动物模型并研究复发机制 | PyMT诱导的自发性小鼠乳腺癌模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 416 | 2025-10-06 |
The role of UBR2 in triple-negative breast cancer and its implications for immune checkpoint blockade therapy
2025-Jul-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03153-3
PMID:40676335
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研究论文 | 本研究探讨UBR2在三阴性乳腺癌中的作用及其对免疫检查点阻断治疗的影响 | 首次揭示UBR2在TNBC免疫抑制微环境中的非泛素化功能,并发现其可作为PD-L1治疗的预测指标 | 研究主要基于数据库分析和体外实验,需要更多临床样本验证 | 阐明UBR2在三阴性乳腺癌免疫治疗中的作用机制 | 三阴性乳腺癌细胞系和患者样本 | 癌症免疫学 | 三阴性乳腺癌 | RNA测序, Western blotting, 流式细胞术, 免疫浸润分析 | NA | RNA测序数据, 蛋白质印迹数据, 流式细胞数据 | 来自GEO和TCGA数据库的三阴性乳腺癌患者队列 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 417 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the effects of mental stress on mouse mammary tumors and the tumor microenvironment
2025-Jul-16, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02619-1
PMID:40670350
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究精神压力对小鼠乳腺肿瘤及肿瘤微环境的影响 | 首次在体内系统阐明精神压力通过诱导肿瘤细胞去分化为癌症干细胞样细胞、改变免疫细胞组成(如增加TANs和TIDCs,抑制CTLs等)促进肿瘤生长的机制 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究精神压力对乳腺肿瘤及其微环境的影响机制 | MMTV-PyMT转基因小鼠的乳腺肿瘤组织 | 单细胞测序分析 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、通路富集分析 | NA | 单细胞转录组数据、组织切片图像 | MMTV-PyMT转基因小鼠肿瘤组织(压力暴露与未暴露组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 418 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing combined with spatial transcriptomics reveals the characteristics of follicle-targeted inflammation patterns in primary cicatricial alopecia
2025-Jul-16, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01447-1
PMID:40671126
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学揭示了原发性瘢痕性秃发中毛囊靶向炎症模式的特征 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术系统分析LPP毛囊靶向炎症的细胞组成、空间定位和细胞间相互作用 | 样本量相对有限,仅分析了LPP、LS和对照组的头皮样本 | 研究原发性瘢痕性秃发中毛囊靶向炎症的特征并识别治疗靶点 | 扁平苔藓样秃发、局限性硬皮病和对照组的头皮样本 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | LPP、LS和对照组头皮样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 419 | 2025-10-06 |
Utilizing genomics to identify novel immunotherapeutic targets in multiple myeloma high-risk subgroups
2025-Jul-15, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01503-y
PMID:40665393
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研究论文 | 本研究开发了一种利用多组学数据识别多发性骨髓瘤新型免疫治疗靶点的方法 | 建立了整合细胞表面潜力、健康器官表达和MM细胞表达水平的框架来定义新型免疫治疗靶点,并识别了亚型特异性靶点 | NA | 识别多发性骨髓瘤高危亚群的新型免疫治疗靶点 | 多发性骨髓瘤患者样本和细胞系 | 基因组学 | 多发性骨髓瘤 | 多组学分析,流式细胞术,免疫印迹,CRISPR-Cas9敲除模型,单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据,转录组数据,蛋白质数据 | 两个大型数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 420 | 2025-10-06 |
Paneth cells inhibit intestinal stem cell proliferation through the bone morphogenic protein 7 pathway under rotavirus-mediated intestinal injury
2025-Jul-14, World journal of gastroenterology
IF:4.3Q1
DOI:10.3748/wjg.v31.i26.107044
PMID:40678707
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研究论文 | 本研究揭示了潘氏细胞通过骨形态发生蛋白7通路抑制肠道干细胞增殖的机制,以应对轮状病毒介导的肠道损伤 | 首次发现轮状病毒直接感染潘氏细胞,并阐明潘氏细胞通过BMP7信号通路调控肠道干细胞增殖的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和类器官,在人体中的验证仍需进一步研究 | 探究轮状病毒感染对潘氏细胞的影响及潘氏细胞在肠道损伤修复中对肠道干细胞的调控作用 | 潘氏细胞、肠道干细胞、轮状病毒感染的肠道组织 | 单细胞生物学 | 肠道感染性疾病 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、流式细胞术、逆转录定量聚合酶链反应 | CellChat、伪时序分析 | 单细胞RNA测序数据、免疫组织化学数据 | Lgr5-EGFP-IRES-CreERT2小鼠和肠道类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |