单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 799 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2025-10-06 |
Recreating pathophysiology of CLN2 disease and demonstrating reversion by TPP1 gene therapy in hiPSC-derived retinal organoids and retina-on-chip
2025-Jul-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102244
PMID:40706588
|
研究论文 | 本研究利用hiPSC来源的视网膜类器官和视网膜芯片系统重建CLN2疾病病理生理学，并证明TPP1基因治疗的逆转效果 | 首次建立人类相关的微生理视网膜疾病模型，揭示CLN2病理生理学新机制，并证明AAV介导的TPP1基因治疗的潜力 | 研究主要基于体外模型，需要进一步体内验证 | 重建CLN2疾病病理生理学并评估基因治疗效果 | hiPSC来源的视网膜类器官、视网膜色素上皮细胞和视网膜芯片系统 | 数字病理学 | 神经元蜡样脂褐质沉积症2型 | 单细胞RNA测序，基因治疗 | 视网膜类器官模型，视网膜芯片系统 | 基因表达数据，组织学图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 402 | 2025-10-06 |
Interferon-responsive HEVs drive tumor tertiary lymphoid structure formation and predict immunotherapy response in nasopharyngeal carcinoma
2025-Jul-15, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102200
PMID:40543508
|
研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和泛癌单细胞图谱，揭示了鼻咽癌中三级淋巴结构的特征，并发现干扰素应答性高内皮微静脉通过分泌CXCL9驱动TLS形成并预测免疫治疗反应 | 首次发现干扰素应答性高内皮微静脉(IFN-HEVs)亚群在肿瘤TLS形成中的关键作用，并开发了CXCL9-TLS反应预测评分系统(CTRscore) | 研究主要聚焦于鼻咽癌，在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 探究肿瘤三级淋巴结构形成的驱动因素及其在免疫检查点阻断治疗反应预测中的作用 | 鼻咽癌患者样本 | 空间转录组学 | 鼻咽癌 | 空间转录组学, 单细胞测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞数据 | 三个独立的鼻咽癌队列 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 403 | 2025-10-06 |
Cardiolipin-mimic lipid nanoparticles without antibody modification delivered senolytic in vivo CAR-T therapy for inflamm-aging
2025-Jul-15, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102209
PMID:40602406
|
研究论文 | 开发了一种基于心磷脂模拟脂质纳米颗粒的体内CAR-T细胞疗法，用于治疗衰老相关炎症疾病 | 首次使用无需抗体修饰的心磷脂类似二磷酰胺脂质实现T细胞靶向递送，并利用环状RNA延长mRNA表达时间 | NA | 开发新型体内CAR-T细胞疗法治疗衰老相关炎症疾病 | T细胞、肝脏纤维化、类风湿性关节炎 | 免疫治疗 | 肝脏纤维化、类风湿性关节炎 | mRNA递送、单细胞测序、scFv人源化筛选 | CAR-T细胞疗法 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 404 | 2025-10-06 |
Exploring the role of neutrophil extracellular traps in colorectal cancer: Insights from single-cell sequencing
2025-Jul-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v17.i7.107589
PMID:40697221
|
综述 | 探讨中性粒细胞胞外诱捕网在结直肠癌中的生物学功能、分子机制及单细胞测序技术在该领域的应用 | 整合单细胞测序技术研究NETs在结直肠癌中的作用机制，为开发新型诊断标志物和靶向治疗策略提供新视角 | 未涉及具体实验数据验证，主要基于现有研究的理论分析 | 阐明NETs在结直肠癌肿瘤微环境中的作用机制及治疗潜力 | 结直肠癌肿瘤微环境中的中性粒细胞胞外诱捕网 | 单细胞生物学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 405 | 2025-10-06 |
Metabolic reprogramming in astrocytes prevents neuronal death through a UCHL1/PFKFB3/H4K8la positive feedback loop
2025-Jul, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-025-01467-x
PMID:40016338
|
研究论文 | 本研究揭示了星形胶质细胞通过UCHL1/PFKFB3/H4K8la正反馈环路进行代谢重编程以保护神经元免于死亡的机制 | 首次发现UCHL1/PFKFB3/H4K8la正反馈环路在星形胶质细胞代谢重编程中的关键作用 | 研究主要聚焦于脊髓损伤模型，其他神经系统疾病中的适用性需进一步验证 | 探究星形胶质细胞代谢重编程在脊髓损伤后神经元保护中的作用机制 | 星形胶质细胞、神经元、脊髓损伤模型 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 406 | 2025-10-06 |
De novo TANC2 variants caused developmental and epileptic encephalopathy and epilepsy
2025-Jul, Epilepsia
IF:6.6Q1
DOI:10.1111/epi.18358
PMID:40110879
|
研究论文 | 本研究通过外显子测序和功能实验证实TANC2基因是癫痫和发育性癫痫性脑病的致病基因 | 首次系统揭示TANC2基因变异与癫痫表型的关联，并建立基因型-表型相关性 | 样本量较小（仅6个病例），需要更大队列验证 | 探索TANC2基因与癫痫的关联及其表型变异机制 | 癫痫患者和果蝇模型 | 神经遗传学 | 癫痫 | 外显子测序,单细胞RNA测序 | 果蝇模型,脑类器官 | 基因组数据,转录组数据 | 6个无关病例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 407 | 2025-10-06 |
Identification of Crosstalk Genes Between Primary Sjögren's Syndrome and Primary Biliary Cirrhosis by Transcriptome Analysis
2025-Jul, Digestive diseases and sciences
IF:2.5Q2
DOI:10.1007/s10620-025-08917-z
PMID:40199818
|
研究论文 | 通过转录组分析识别原发性干燥综合征与原发性胆汁性胆管炎之间的串扰基因 | 首次通过整合差异表达分析、WGCNA和LASSO回归识别出pSS和PBC之间的7个关键串扰基因 | 研究基于公共数据库的转录组数据，需要进一步实验验证 | 探索原发性干燥综合征与原发性胆汁性胆管炎之间的分子关联机制 | 原发性干燥综合征和原发性胆汁性胆管炎患者的转录组数据 | 生物信息学 | 自身免疫性疾病 | 转录组分析, 差异表达分析, WGCNA, LASSO回归, ssGSEA, 单细胞转录组分析 | LASSO回归模型, 多元逻辑回归模型 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的两个数据集(GSE66795和GSE119600) | NA | 转录组测序, 单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 408 | 2025-10-06 |
A novel subset of inflammation-related liver NK cells modulates immune responses in a murine model of primary biliary cholangitis
2025-Jul, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2025.103454
PMID:40609234
|
研究论文 | 本研究在原发性胆汁性胆管炎中发现并鉴定了一类新型炎症相关自然杀伤细胞亚群 | 首次鉴定出具有CD49aCXCR6特征的新型炎症相关NK细胞亚群，并阐明其从常规NK细胞分化及通过TNF-α调控免疫反应的机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证尚不充分 | 探究原发性胆汁性胆管炎中新型免疫细胞亚群的功能机制 | 小鼠PBC模型（ARE-Del小鼠）和PBC患者肝脏样本 | 免疫学 | 自身免疫性肝病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | 基因表达数据 | PBC小鼠模型和患者肝脏样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 409 | 2025-10-06 |
Guard cells on the adaxial and abaxial leaf surfaces use different compositions of potassium ion channels to drive light-induced stomatal opening
2025-Jul, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-02026-5
PMID:40634560
|
研究论文 | 本研究揭示了植物叶片上下表皮保卫细胞通过不同钾离子通道组成驱动光诱导气孔开放的分子机制 | 首次发现植物上下表皮保卫细胞利用不同钾离子通道控制气孔光响应 | 研究主要基于拟南芥和烟草模型植物，在其他植物中的普适性需进一步验证 | 探究植物叶片上下表皮气孔对光响应差异的分子机制 | 拟南芥和烟草的保卫细胞 | 植物分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序,计算机模拟 | OnGuard模拟 | 基因表达数据 | 拟南芥和烟草的保卫细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 410 | 2025-10-06 |
OM-85, a Bacterial Lysate, Reduces Pulmonary Nodule Malignant Probability: A Retrospective Study
2025-Jul, The clinical respiratory journal
DOI:10.1111/crj.70109
PMID:40692186
|
研究论文 | 回顾性研究评估细菌裂解物OM-85对慢性支气管炎患者高危肺结节的干预效果 | 首次发现OM-85可通过提升NK细胞比例降低肺结节恶性概率 | 回顾性研究设计，样本量有限（72例治疗组/90例对照组） | 评估OM-85对高危肺结节的干预效果 | 慢性支气管炎伴高危肺结节患者 | 临床医学 | 肺癌 | 流式细胞术, 多重免疫荧光, 单细胞RNA测序 | NA | 医学影像, 分子生物学数据 | 162例患者（204个肺结节） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 411 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals Shen-Bai-Jie-Du decoction retards colorectal tumorigenesis by regulating the TMEM131-TNF signaling pathway-mediated differentiation of immunosuppressive dendritic cells
2025-Jul, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2025.05.013
PMID:40698132
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示参白解毒汤通过调控TMEM131-TNF信号通路介导的免疫抑制性树突细胞分化延缓结直肠肿瘤发生 | 首次构建小鼠和临床患者相互验证的单细胞转录组图谱，发现CCL22树突细胞的积累及其免疫抑制功能，并揭示参白解毒汤和黄连素通过TMEM131-TNF信号通路逆转这一过程 | 机制研究仍需进一步验证，特别是TMEM131作为黄连素潜在靶点的具体作用机制 | 探究参白解毒汤延缓结直肠肿瘤发生的分子机制 | 结直肠肿瘤微环境中的树突细胞 | 单细胞测序分析 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组化, 流式细胞术, 批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据, 蛋白质表达数据 | 小鼠模型和临床患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 412 | 2025-10-06 |
Enhancing and accelerating cell type deconvolution of large-scale spatial transcriptomics slices with dual network model
2025-Jul-24, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf419
PMID:40704686
|
研究论文 | 提出一种基于双网络模型的快速细胞类型反卷积算法jMF2D，用于增强大规模空间转录组切片的细胞类型解析 | 通过联合学习细胞类型相似性网络来桥接scRNA-seq和空间转录组数据，提高细胞类型特征的准确性，同时节省约90%的运行时间 | NA | 开发快速准确的细胞类型反卷积算法以分析空间转录组数据 | 空间转录组切片中的细胞类型分布 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 非负矩阵分解，网络模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 413 | 2025-10-06 |
Integrative causal and single-cell analyses reveal genes responsive to endocrine disruptors driving human male infertility
2025-Jul-22, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118709
PMID:40700968
|
研究论文 | 通过整合因果分析和单细胞测序技术，揭示内分泌干扰物响应基因在男性不育症中的作用机制 | 首次结合孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序，系统鉴定与内分泌干扰物相关的男性不育致病基因 | 研究主要基于遗传变异和基因表达数据，需要进一步实验验证具体的分子机制 | 探索内分泌干扰物通过调控基因表达导致男性不育的分子机制 | 人类睾丸组织及与男性不育相关的基因 | 单细胞组学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 共定位分析 | NA | 基因表达数据, 遗传变异数据, 单细胞转录组数据 | 大规模cis-eQTL和GWAS数据集，包含人类睾丸组织单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 414 | 2025-10-06 |
Sceptic: pseudotime analysis for time-series single-cell sequencing and imaging data
2025-Jul-17, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03679-3
PMID:40676652
|
研究论文 | 提出一种用于时间序列单细胞数据的监督式伪时间分析方法Sceptic | 开发基于支持向量机的监督式伪时间分析方法，显著提高预测准确性并适用于多种单细胞数据类型 | NA | 解决现有单细胞伪时间分析方法预测准确性低且难以泛化到不同数据类型的问题 | 时间序列单细胞RNA测序数据、单细胞ATAC测序数据和显微镜图像数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、显微镜成像 | 支持向量机(SVM) | 单细胞测序数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞成像 | NA | NA |
| 415 | 2025-10-06 |
Phenotypic heterogeneity and plasticity in colorectal cancer metastasis
2025-Jul-09, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100881
PMID:40393458
|
研究论文 | 通过单细胞多组学和空间转录组学技术揭示结直肠癌转移过程中的表型异质性与可塑性调控机制 | 首次发现具有再生和炎症表型的中间态癌细胞群体，并鉴定AP-1和NF-κB作为关键转录调控因子 | 未明确说明样本量具体数值，调控机制验证需进一步实验证实 | 探究结直肠癌转移过程中表型异质性的调控因素和外在信号 | 原发性和转移性结直肠癌患者样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞多组学，空间转录组学 | NA | 单细胞多组学数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞多组学，空间转录组学 | NA | NA |
| 416 | 2025-10-06 |
SpaLinker identifies phenotype-associated spatial tumor microenvironment features by integrating bulk and spatial sequencing data
2025-Jul-09, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100893
PMID:40480216
|
研究论文 | 开发SpaLinker集成框架，通过整合空间转录组和bulk RNA-seq数据识别与表型相关的肿瘤微环境空间特征 | 首创表型驱动的计算框架，整合空间和bulk测序数据，在分子、细胞和组织结构三个层面解析空间分辨的肿瘤微环境 | 空间测序样本的临床注释数据稀缺 | 建立空间特征与临床表型的定量关联 | 肿瘤微环境空间特征 | 空间转录组学 | 泛癌种 | 空间转录组测序，bulk RNA-seq | 计算框架 | 空间转录组数据，bulk RNA-seq数据 | 多种肿瘤空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 417 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial transcriptome analysis revealed cellular heterogeneity of glycosyltransferases in cervical cancer, and identified GALNT3-negative epithelial cells as a protective factor: a retrospective cohort study based on public database
2025-07-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002520
PMID:40387729
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组分析揭示宫颈癌中糖基转移酶的细胞异质性，发现GALNT3阴性上皮细胞是保护性因素 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学分析宫颈癌中糖基转移酶的细胞异质性，鉴定出GALNT3阴性上皮细胞作为保护因子 | 基于公共数据库的回顾性队列研究，需要进一步实验验证 | 探索糖基转移酶在宫颈癌中的作用机制 | 宫颈癌患者样本和细胞系 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 基于公共数据库的回顾性队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 418 | 2025-10-06 |
Evaluation of tumor pseudocapsule using computed tomography-based radiomics in pancreatic neuroendocrine tumors to predict prognosis and guide surgical strategy: a cohort study
2025-07-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002511
PMID:40395025
|
研究论文 | 本研究通过CT影像组学评估胰腺神经内分泌肿瘤假包膜状态，以预测预后并指导手术策略 | 首次结合CT影像组学和机器学习术前识别假包膜状态，为小胰腺神经内分泌肿瘤的手术方式选择提供依据 | 单中心回顾性研究，样本量有限，需要外部验证 | 评估胰腺神经内分泌肿瘤假包膜状态对预后的影响并指导手术决策 | 胰腺神经内分泌肿瘤患者 | 医学影像分析 | 胰腺神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序，CT影像组学分析 | 机器学习模型 | 医学影像，临床病理数据，单细胞测序数据 | 475例胰腺神经内分泌肿瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 419 | 2025-10-06 |
Potential of SPHK1 as a prognostic marker and therapeutic target in colorectal cancer: insights from bioinformatics and experimental analysis
2025-07-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002506
PMID:40434736
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学和实验分析探讨SPHK1在结直肠癌中的预后标志物和治疗靶点潜力 | 首次通过孟德尔随机化方法证实鞘磷脂水平与结直肠癌风险的因果关系，并结合单细胞RNA测序分析SPHK1与免疫浸润的关联 | 样本量相对有限，需要更大规模临床验证 | 研究SPHK1在结直肠癌进展中的作用机制及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 结直肠癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 多组学分析,单细胞RNA测序,孟德尔随机化,多重荧光免疫组化,细胞迁移/侵袭/凋亡实验 | NA | 基因表达数据,甲基化数据,蛋白质表达数据,细胞功能数据 | 90例结直肠癌组织和对应正常组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 420 | 2025-10-06 |
Microbiome Single Cell Atlases Generated with a Commercial Instrument
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202409338
PMID:40462354
|
研究论文 | 本文介绍了EASi-seq方法，通过改造商业单细胞测序平台实现对微生物的高通量单细胞基因组测序 | 首次将商业单细胞测序仪器成功应用于微生物单细胞基因组测序，开发了配套生物信息学流程 | 未明确说明方法在特定微生物类型或复杂环境样本中的适用性限制 | 开发适用于微生物的单细胞基因组测序方法 | 人类和环境微生物组中的单个微生物细胞 | 微生物组学 | NA | 单细胞基因组测序 | NA | 基因组序列数据 | 每次运行可测序数万个微生物 | Mission Bio | 单细胞基因组测序 | Tapestri | Mission Bio Tapestri单细胞分析平台 |