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当前共找到 820 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-01-17 |
Foxn3 is required to suppress aberrant ciliogenesis in nonphotoreceptor retinal neurons
2025-Jul-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2500871122
PMID:40663603
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子Foxn3在抑制视网膜非感光神经元中异常纤毛发生中的作用 | 首次揭示了Foxn3作为关键转录抑制因子，通过直接结合并抑制纤毛基因及其反式激活因子的启动子，来防止非感光神经元形成类似感光细胞的纤毛结构 | 研究主要基于小鼠模型，其在人类视网膜中的具体作用机制尚需进一步验证 | 探究视网膜细胞类型间纤毛结构差异的建立与维持机制 | 视网膜特异性条件性敲除（Foxn3CKO）小鼠的视网膜神经元，特别是双极细胞和无长突细胞 | 发育生物学 | 纤毛病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、染色质分析、转录测定 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、电生理数据、染色质结合数据 | Foxn3CKO小鼠及其对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2026-01-17 |
Genomic and Single-Cell Analyses Characterize Patient-Derived Tumor Organoids to Enable Personalized Therapy for Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2025-Jul-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-2850
PMID:40261963
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研究论文 | 本研究通过建立头颈部鳞状细胞癌患者来源的肿瘤类器官，结合基因组和单细胞分析，揭示了肿瘤异质性、顺铂耐药机制，并识别了潜在治疗靶点 | 利用患者来源的肿瘤类器官模型，结合bulk和单细胞RNA测序，首次在类器官中表征了分子亚型和瘤内转录异质性，并发现了一种与顺铂耐药和不良预后相关的混合上皮-间质转化样程序，识别了amphiregulin作为关键调节因子 | 研究样本量相对较小（31例患者），且主要基于体外类器官模型，其体内生理环境模拟和长期临床验证仍需进一步研究 | 改善头颈部鳞状细胞癌的生物学理解并开发个性化疗法 | 头颈部鳞状细胞癌患者及其来源的肿瘤类器官 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | 患者来源的肿瘤类器官模型 | 基因组数据, 转录组数据, 组织病理学数据 | 31例头颈部鳞状细胞癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2026-01-15 |
CD36 promotes iron accumulation and dysfunction in CD8+ T cells via the p38-CEBPB-TfR1 axis in early-stage hepatocellular carcinoma
2025-07, Clinical and molecular hepatology
IF:14.0Q1
DOI:10.3350/cmh.2024.0948
PMID:40037690
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研究论文 | 本研究揭示了CD36通过p38-CEBPB-TfR1轴促进早期肝细胞癌中CD8+ T细胞铁积累和功能障碍的新机制 | 首次发现CD36通过介导oxLDL-p38-CEBPB轴上调TfR1，导致CD8+ T细胞铁积累和功能障碍 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究早期肝细胞癌肿瘤微环境中CD8+ T细胞功能障碍的机制 | 早期肝细胞癌肿瘤微环境中的CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | RNA测序数据，流式细胞数据 | 小鼠肝细胞癌模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2026-01-10 |
EDNRB2 regulates fate, migration, and maturation of hair cell precursors in regenerating avian auditory epithelium explants
2025-Jul-15, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2502713122
PMID:40627393
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研究论文 | 本研究揭示了EDNRB2在鸟类听觉上皮毛细胞再生过程中对前体细胞命运、迁移和成熟的关键调控作用 | 首次发现EDNRB2在鸟类听觉上皮毛细胞再生过程中特异性高表达，并系统阐明了其信号通路在毛细胞前体细胞命运决定、迁移和成熟中的调控机制 | 研究基于鸟类模型，其发现向哺乳动物（如人类）耳蜗的转化应用仍需进一步验证 | 揭示EDNRB2在鸟类听觉上皮毛细胞再生中的具体作用机制 | 鸟类听觉上皮（基底乳头）的毛细胞前体细胞 | 发育生物学与再生医学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序，RNA测序，组织学评估 | NA | 基因表达数据，组织学图像 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2026-01-08 |
Systematic analysis of cellular cross-talk reveals a role for SEMA6D-TREM2 regulating microglial function in Alzheimer's disease
2025-07-30, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adx0027
PMID:40737431
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研究论文 | 通过单细胞转录组和空间转录组分析，揭示了SEMA6D-TREM2介导的神经元-小胶质细胞通讯在阿尔茨海默病中的作用机制 | 首次系统重建了AD中的细胞间通讯网络，发现了SEMA6D-TREM2这一新的神经元-小胶质细胞信号通路，并证实其调控小胶质细胞活化和Aβ清除功能 | 样本量相对有限（67例），主要基于转录组数据推断功能，体内功能验证仍需进一步深入 | 探究阿尔茨海默病中细胞间通讯网络的失调机制及其对疾病进展的影响 | 人脑组织样本（来自Knight ADRC和DIAN队列）、人诱导多能干细胞衍生的小胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序、空间转录组学、组织免疫染色、基因敲除技术 | 细胞通讯网络分析 | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、图像数据 | 67例临床和神经病理学特征明确的对照和AD脑组织捐赠者 | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 26 | 2026-01-07 |
Single-cell transcriptomics reveal alveolar macrophages-specific responses in single-hit ozone exposure model in mice
2025-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.11.664370
PMID:40791434
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了小鼠在单次臭氧暴露模型中肺泡巨噬细胞的特异性转录组响应及其功能调控 | 首次在单细胞分辨率下系统分析了不同浓度臭氧暴露对肺泡巨噬细胞转录组的影响，并识别出浓度依赖性的通路富集和亚群特异性变化 | 研究仅使用雄性C57BL/6J小鼠，未考虑性别或品系差异；暴露时间固定为3小时，未探索不同时间点的动态变化 | 探究肺泡巨噬细胞对臭氧暴露的响应机制，特别是不同浓度下的转录组变化和功能调控 | C57BL/6J雄性成年小鼠的肺泡巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | C57BL/6J雄性成年小鼠，分为过滤空气暴露组、1 ppm臭氧暴露组和1.5 ppm臭氧暴露组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2026-01-04 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveal a Tumor-Associated Macrophage Subpopulation that Mediates Prostate Cancer Progression and Metastasis
2025-Jul-02, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-24-0791
PMID:40105746
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和多重免疫荧光数据，揭示了前列腺癌中肿瘤相关巨噬细胞（TAM）的异质性，并识别出一个与转移相关的SPP1+/TREM2+ TAM亚群 | 首次整合单细胞和空间转录组学数据，识别出SPP1+/TREM2+ TAM亚群在前列腺癌转移中的关键作用，并验证其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，需要更大规模临床验证；SPP1阻断策略的长期疗效和安全性未充分评估 | 探究前列腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其在肿瘤进展和转移中的作用机制 | 人类前列腺癌患者样本、小鼠前列腺癌模型（RM1模型） | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、免疫荧光图像 | 人类患者样本和小鼠模型样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 28 | 2026-01-03 |
Cannabidiol exerts anti-inflammatory effects but maintains T effector memory cell differentiation: A Single-Cell Study in Humans
2025-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.30.667742
PMID:40766582
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等方法，评估了口服大麻二酚对人类外周免疫细胞分布的影响，发现其具有抗炎作用但维持T效应记忆细胞分化 | 首次在人类中结合单细胞RNA测序、细胞因子检测和流式细胞术，系统评估大麻二酚对免疫细胞的混合免疫调节效应，特别是在肾病患者或肾移植受者中的影响 | 样本量较小（23名参与者），且研究为短期暴露（11天），未评估长期效应或临床结局 | 评估大麻二酚在稳态下对人类外周免疫细胞分布的免疫调节作用，特别是对疼痛管理受限的肾病患者或肾移植受者的影响 | 人类外周免疫细胞，包括T细胞和B细胞 | 单细胞研究 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、细胞因子检测、质谱分析 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质水平数据、流式细胞数据 | 23名参与者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2026-01-03 |
Putting AML Differentiation States on the BoneMarrowMap
2025-Jul-01, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-25-0083
PMID:40294281
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研究论文 | 本文介绍了一种名为'BoneMarrowMap'的新型计算工具，用于将白血病单细胞RNA测序数据集映射到造血分化状态 | 开发了BoneMarrowMap工具，通过大规模单细胞RNA测序再分析，发现了12种与预后和治疗相关的复发性急性髓系白血病分化模式，并解析了患者个体内的白血病克隆结构 | NA | 开发计算工具以映射白血病单细胞RNA测序数据至造血分化状态，并探索急性髓系白血病的分化模式与临床关联 | 白血病单细胞RNA测序数据集，特别是急性髓系白血病样本 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2026-01-03 |
Multipotent lineage potential in B cell acute lymphoblastic leukemia is associated with distinct cellular origins and clinical features
2025-Jul, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-025-00987-2
PMID:40579588
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研究论文 | 本研究通过整合89个B-ALL样本的单细胞转录组测序数据与正常B细胞发育图谱，揭示了B-ALL的发育起源与谱系可塑性及临床特征之间的关联 | 首次系统性地将B-ALL单细胞数据与正常B细胞发育图谱整合，揭示了亚型特异性发育阶段关联，并开发了与不良生存相关的'多能性评分' | 研究样本量相对有限（89例），且主要基于转录组数据，可能需要更多功能验证和更大队列验证 | 探索B细胞急性淋巴细胞白血病的发育起源及其与谱系可塑性、治疗反应的关系 | B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）患者样本（89例）及正常人类B细胞发育过程 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 89个B-ALL样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2026-01-02 |
Epidermal Resident Memory T Cell Fitness Requires Antigen Encounter in the Skin
2025-Jul-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.31.646438
PMID:40236062
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研究论文 | 本研究揭示了表皮驻留记忆T细胞（T）的适应性依赖于其在皮肤发育过程中与抗原的接触，这种接触通过降低TGFβ需求并增强增殖能力来提高其持久性 | 首次证明表皮T细胞在发育过程中接触抗原会增强其分化特征、降低TGFβ依赖性持久性需求，并提高抗原特异性增殖能力，且TGFβRIII在这一过程中起关键作用 | 研究主要聚焦于表皮CD8 T细胞，其他组织或T细胞亚群的情况尚不明确；TGFβRIII的具体调控机制仍需进一步探索 | 探究表皮驻留记忆T细胞持久性与功能适应性的调控机制 | 小鼠表皮CD8组织驻留记忆T细胞（T） | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2025-12-29 |
Pulmonary fibrosis and exosomes: pathways to treatment
2025-Jul-23, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-10855-y
PMID:40699390
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综述 | 本文综述了特发性肺纤维化（IPF）的分子机制，重点关注外泌体在纤维化微环境中的作用及其治疗潜力 | 整合了外泌体作为纤维化关键调节因子的最新研究，并探讨了工程化纳米颗粒-外泌体杂合体的治疗前景，同时融入了单细胞RNA测序对成纤维细胞异质性的新见解 | 当前动物模型在模拟慢性IPF方面存在局限性，且外泌体治疗的临床转化仍需进一步验证 | 探讨肺纤维化的分子机制及外泌体在其中的作用，以开发精准医疗方法 | 特发性肺纤维化（IPF）及相关信号通路、外泌体、成纤维细胞、上皮细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 33 | 2025-12-29 |
A systematic review of single-cell RNA sequencing applications and insights in Oryza sativa response to environmental stresses
2025-Jul-19, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-10836-1
PMID:40682700
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综述 | 本文系统综述了2017年至2024年间单细胞RNA测序（scRNA-seq）在水稻（Oryza sativa）研究中的应用，重点关注其在解析水稻对不同环境胁迫响应中的转录异质性方面的进展 | 首次针对水稻（而非拟南芥）的scRNA-seq应用进行系统性综述，整合了多种新兴转录组技术（如ATCT-seq、snRNA-seq、Stereo-seq）在水稻胁迫响应研究中的最新成果 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据；且主要基于2017-2024年间已发表研究，可能未涵盖最新技术突破 | 系统总结scRNA-seq技术在水稻环境胁迫响应研究中的应用与见解，为作物改良策略提供参考 | 水稻（Oryza sativa）的根、叶、花、种子等组织，及其对低氮、高盐、缺铁和褐飞虱胁迫的响应 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、ATCT-seq、snRNA-seq、Stereo-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 34 | 2025-12-27 |
Unraveling the role of gut microbiota on the formation of nephrolithiasis: insights from integrated analysis of GWAS, single-cell transcriptomics, bulk RNA sequencing and network Pharmacology
2025-Jul-15, Urolithiasis
IF:2.0Q2
DOI:10.1007/s00240-025-01809-x
PMID:40664942
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研究论文 | 本研究通过整合GWAS、单细胞转录组学、bulk RNA测序和网络药理学分析，探讨了肠道微生物群在肾结石形成中的分子机制 | 首次结合孟德尔随机化、单细胞分析和网络药理学，系统揭示了肠道微生物群与肾结石之间的因果关系及关键基因PALLD和R3HDM1的作用 | 研究依赖于公共数据库数据，未进行实验验证，且样本来源和人群特征可能有限 | 探索肠道微生物群相关关键基因在肾结石形成中的分子机制 | 肾结石患者相关基因组、肠道微生物群数据及基因表达数据 | 生物信息学 | 肾结石 | GWAS, 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 网络药理学, 分子对接 | 孟德尔随机化模型, 差异表达分析, 富集分析 | 基因组数据, 转录组数据, 微生物组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2025-12-27 |
CD8a + GZMK + T Cells Inhibit Osteoclastogenesis in Postmenopausal Osteoporosis via the p38-MAPK Pathway
2025-Jul-07, Calcified tissue international
IF:3.3Q2
DOI:10.1007/s00223-025-01402-9
PMID:40622431
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和功能实验，鉴定并表征了绝经后骨质疏松症（PMOP）中CD8a+GZMK+T细胞亚群，揭示其通过分泌GzmK抑制破骨细胞生成的新机制 | 首次在PMOP中鉴定出CD8a+GZMK+T细胞亚群，并阐明其通过GzmK-p38-MAPK通路抑制破骨细胞生成的新功能机制 | 研究主要基于小鼠模型，人体样本验证不足；体内功能验证和临床转化潜力需进一步探索 | 探究绝经后骨质疏松症（PMOP）中骨髓T细胞的异质性及其在破骨细胞生成中的调控作用 | 小鼠股骨骨髓T细胞、原代骨髓巨噬细胞（BMMs） | 单细胞组学 | 骨质疏松症 | 单细胞转录组测序、流式细胞术、TRAP染色、免疫荧光染色、qPCR、RNA测序、Western blot | NA | 单细胞转录组数据、基因表达数据、蛋白质印迹数据 | 小鼠股骨骨髓样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2025-12-26 |
Setdb1 ablation in macrophages attenuates fibrosis in heart allografts
2025-Jul, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2424534122
PMID:40553495
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了巨噬细胞中Setdb1介导的组蛋白甲基化在心脏同种异体移植物和肿瘤组织纤维化中的关键作用，并提出了靶向FN1与受体相互作用的抗纤维化治疗策略 | 首次在单细胞水平上阐明巨噬细胞中Setdb1通过CCR2-Creb/Setdb1轴调控Fn1表达，进而通过ITGA5和PIRA受体促进纤维化的新机制，并发现该通路在移植排斥和肿瘤免疫排斥中的双重作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；纤维化抑制对肿瘤发展的长期影响尚未明确；具体受体信号通路细节需进一步解析 | 探究巨噬细胞中Setdb1介导的组蛋白甲基化在组织纤维化中的作用机制，并开发针对纤维化相关疾病的治疗靶点 | 人类和小鼠的心脏同种异体移植物、肿瘤组织、巨噬细胞、成纤维细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未明确样本数量，包含人类和小鼠心脏移植物及肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2025-12-25 |
Multiplexed single-cell transcriptomics reveals diverse phenotypic outcomes for pathogenic SHP2 variants
2025-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.30.662374
PMID:40631144
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研究论文 | 本研究结合单细胞转录组学、蛋白质生物化学、结构分析和细胞生物学，揭示了致病性SHP2变异如何失调信号传导，并阐明了不同突变类型对细胞状态的多样化影响 | 首次在单细胞水平系统比较了临床多样性SHP2变异对基因表达的影响，发现催化活性丧失并不等同于基因敲除的表型，揭示了不同突变机制可能产生趋同表型效应，而同一热点残基的不同突变可导致截然不同的细胞状态 | 研究主要基于体外细胞模型，尚未在动物模型或临床样本中全面验证；单细胞转录组分析可能未完全捕捉蛋白质水平和功能层面的变化 | 阐明致病性SHP2变异如何通过结构扰动影响细胞信号传导和基因表达，从而理解其与人类疾病的关联 | 表达临床多样性SHP2变异（包括增强催化活性、失活型和影响蛋白质相互作用的突变）的细胞 | 单细胞组学 | 发育障碍（如努南综合征）和多种癌症 | 单细胞转录组测序、蛋白质生物化学、结构分析、细胞生物学 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质结构数据、细胞表型数据 | 未明确说明具体细胞数量，但涉及表达多种临床SHP2变异的细胞群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2025-12-23 |
Cmpk2 Protects Against Acute Lung Injury in Mice
2025-Jul-05, Lung
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s00408-025-00829-z
PMID:40616692
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研究论文 | 本研究探讨了线粒体代谢酶Cmpk2在铜绿假单胞菌诱导的急性肺损伤中的作用及其保护机制 | 首次揭示了Cmpk2通过STING依赖的机制增强中性粒细胞吞噬功能并减轻肺部炎症，从而在急性肺损伤中发挥保护作用 | 研究主要基于小鼠和斑马鱼模型，在人体中的直接验证尚不充分，且STING通路的具体调控机制有待进一步阐明 | 探究Cmpk2在急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征中的功能与分子机制 | Cmpk2基因敲除小鼠、斑马鱼胚胎、ARDS患者样本 | 数字病理学 | 急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、ELISA、GO/KEGG分析、苏木精-伊红染色 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据、病理图像、细胞计数数据 | 未明确样本数量，但使用了小鼠模型、斑马鱼胚胎及公共数据库（GEO）中ARDS患者数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2025-12-22 |
Single-cell and spatial transcriptomics of stricturing Crohn's disease highlights a fibrosis-associated network
2025-Jul, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02225-y
PMID:40562913
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研究论文 | 本研究结合单细胞和空间转录组学技术，分析了克罗恩病（CD）狭窄病变中的纤维化相关网络 | 首次在CD狭窄病变中配对应用单细胞和空间转录组学，揭示了免疫细胞、炎症成纤维细胞等关键亚群的空间共定位，并将基因表达与肠道生物地理学及遗传风险位点关联 | 样本量相对有限（61个样本来自31名患者），且未涉及长期随访或治疗干预效果评估 | 探究克罗恩病狭窄病变的纤维化机制和细胞网络 | 克罗恩病患者和非炎症性肠病患者的肠道组织样本 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间数据 | 61个样本来自21名CD患者和10名非IBD患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 40 | 2025-12-19 |
scPlantLLM: A Foundation Model for Exploring Single-cell Expression Atlases in Plants
2025-07-11, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf024
PMID:40094454
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研究论文 | 本文开发了一个名为scPlantLLM的Transformer基础模型，用于处理和分析植物单细胞RNA测序数据，以解决批次整合、细胞类型注释和基因调控网络推断等挑战 | 开发了首个针对植物单细胞数据的Transformer基础模型，采用包含掩码语言建模和细胞类型注释任务的顺序预训练策略，在零样本学习场景下实现了高达0.91的准确率 | 模型主要基于拟南芥数据集进行验证，在其他植物系统中的泛化能力有待进一步评估 | 开发一个先进的计算模型，以解决植物单细胞RNA测序数据分析中的关键挑战，包括批次整合、细胞类型注释和基因调控网络推断 | 植物单细胞RNA测序数据，特别是拟南芥的单细胞表达图谱 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer | 单细胞基因表达数据 | 数百万个植物单细胞数据点 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |