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当前共找到 801 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 21 | 2026-04-29 |
Role of Dual Specificity Phosphatase 1 (DUSP1) in influencing inflammatory pathways in macrophages modulated by Borrelia burgdorferi lipoproteins
2025-Jul-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.20.624562
PMID:39605372
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研究论文 | 本文研究双特异性磷酸酶1在疏螺旋体脂蛋白调节巨噬细胞炎症通路中的作用 | 通过多组学方法（单细胞RNA测序和蛋白质组学）发现DUSP1在疏螺旋体脂蛋白诱导的巨噬细胞反应中起关键调控作用 | 仅在小鼠骨髓来源巨噬细胞中进行，未在体内或人类细胞中验证 | 探索DUSP1在疏螺旋体脂蛋白调节巨噬细胞免疫反应中的功能和机制 | 小鼠骨髓来源巨噬细胞 | 机器学习 | 莱姆病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 小鼠骨髓来源巨噬细胞，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2026-04-29 |
Targeted single cell expression profiling identifies integrators of sleep and metabolic state
2025-07-09, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkaf079
PMID:40509864
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研究论文 | 通过靶向单细胞表达谱分析，鉴定调控睡眠与代谢状态整合的神经元和基因 | 首次利用靶向单细胞测序技术对单个LHLK神经元进行转录组分析，鉴定出睡眠-代谢相互作用的新调控因子 | 仅限于果蝇模型，且仅关注单个神经元类型，可能遗漏其他相关神经元或全身性调控机制 | 研究单个神经元在睡眠与代谢交互中的转录变化及功能基因 | 果蝇（Drosophila melanogaster）的侧角亮氨酸激酶（LHLK）神经元 | 自然语言处理 | NA | 单细胞测序（single-cell sequencing） | NA | 基因表达数据 | 果蝇LHLK神经元（喂食状态与24小时饥饿状态对比，具体样本未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | 单细胞CEL-Seq | 靶向单细胞CEL-Seq对单个LHLK神经元进行RNA分离和测序 |
| 23 | 2026-04-25 |
Comprehensive insight on immune landscape in intracerebral hemorrhage patients with single-cell RNA sequencing: from blood to hematoma
2025-Jul-30, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03518-z
PMID:40739271
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序对脑出血患者从血液到血肿的免疫景观进行全面解析 | 首次对脑出血患者血肿样本进行单细胞转录组分析，揭示免疫细胞特征及动态炎症过程 | 样本量较小（4名患者、3名健康对照），未提及外部验证队列 | 探究脑出血患者血肿中免疫细胞的转录谱，阐明组织损伤机制 | 脑出血患者的血肿样本和外周血样本，健康志愿者外周血样本 | 单细胞转录组学 | 脑出血 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 4名脑出血患者（血肿+血液样本），3名健康志愿者（血液样本） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2026-04-25 |
Prenatally derived macrophages support choroidal health and decline in age-related macular degeneration
2025-Jul-07, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20242007
PMID:40261298
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研究论文 | 该研究利用三维多重免疫荧光、单细胞RNA测序和流式细胞术，揭示了人脉络膜中FOLR2+巨噬细胞在年龄相关性黄斑变性（AMD）中数量减少和脂质代谢障碍，并证明其产前来源对维持脉络膜健康至关重要 | 首次在单细胞水平描述人类脉络膜免疫景观，发现两种FOLR2表达不同的巨噬细胞亚群，并揭示产前来源的FOLR2+巨噬细胞在AMD中的减少是疾病标志特征之一 | 研究主要基于小鼠模型和部分人眼样本，可能无法完全反映人类AMD的长期病程；巨噬细胞亚群功能验证尚需更直接的人类实验证据 | 阐明脉络膜免疫环境在年龄相关性黄斑变性（AMD）病理过程中的变化及其作用 | 人类及小鼠的脉络膜组织，特别是FOLR2+巨噬细胞 | 机器学习 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、三维多重免疫荧光 | NA | 图像、文本 | NA | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 单细胞RNA测序使用10x Chromium进行文库构建，在Illumina NovaSeq上测序 |
| 25 | 2026-04-25 |
Diminished SUV3 expression and its functional implications in the IFN-enriched monocyte subset of childhood Sjögren's disease
2025-Jul-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keaf193
PMID:40268748
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析儿童干燥综合征中IFN富集单核细胞亚群的SUV3表达降低及其功能影响 | 首次揭示SUV3表达降低通过mt-dsRNA介导的PKR激活驱动先天免疫缺陷的新机制 | 文章标题和摘要中未明确提及局限性 | 研究儿童干燥综合征中IFN富集单核细胞亚群的SUV3表达降低的分子和功能意义 | 儿童干燥综合征患者的IFN富集CD14+单核细胞 | 单细胞组学 | 儿童干燥综合征 | 单细胞RNA测序、甲醛交联免疫沉淀-qPCR、透射电镜 | NA | 单细胞转录组数据 | 儿童干燥综合征患者及对照组的单核细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2026-04-25 |
Optical phenotyping using label-free microscopy and deep learning
2025-Jul, Biophotonics discovery
DOI:10.1117/1.BIOS.2.3.035001
PMID:42028248
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研究论文 | 利用无标记显微镜和深度学习对胰腺癌样本进行光学表型分析 | 结合无标记多光子显微镜、空间转录组学和深度学习，提出一种非破坏性的光学表型分析方法 | 研究仅基于胰腺癌样本，未评估其他组织类型；准确性仍有提升空间，可能需要整合更多基因表达数据或互补成像模态 | 开发光学表型分析新方法以区分胰腺癌样本的结构和功能特征 | 胰腺癌标本 | 计算机视觉 | 胰腺癌 | 空间转录组学、无标记多光子显微镜 | 深度学习分类模型（具体类型未提及） | 图像、基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 27 | 2026-04-24 |
Single-cell transcriptomics of ventral forebrain progenitors identifies Evf2 enhancer lncRNA-enhancer gene guidance through direct RNA binding and RNP recruitment domains
2025-Jul-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62205-y
PMID:40715144
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研究论文 | 通过单细胞转录组学研究Evf2增强子lncRNA在小鼠胚胎腹侧前脑祖细胞中通过直接RNA结合和RNP招募域引导增强子与基因互作的机制 | 首次利用单细胞转录组学揭示Evf2-Dlx5/6UCE与基因引导和转录调控之间比先前报道更显著的一致性，并发现Evf2将染色体6划分为短程激活基因和长程/超长程抑制基因，以及RNP招募的组合调控机制 | 未明确提及 | 阐明Evf2超保守增强子lncRNA在脑发育过程中通过直接RNA结合和RNP招募域引导增强子与基因互作的分子机制 | 小鼠胚胎腹侧前脑祖细胞中的Evf2 lncRNA、Dlx5/6UCE及其调控的基因 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎腹侧前脑的单个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-04-24 |
Artifacts in spatial transcriptomics data: their detection, importance, prevalence, and prevention
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf306
PMID:40748322
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研究论文 | 开发了一种名为BLADE的自动化跨平台统计方法，用于检测和去除空间转录组学数据中的三种人工制品 | 首次提出了一套跨平台的自动化统计方法，专门检测和纠正空间转录组数据中的边界、组织边缘和位置批次故障三类人工制品 | 人工制品检测方法对于空间转录组学质量控制至关重要，但未具体说明局限性 | 检测和去除空间转录组数据中的人工制品，提高数据分析准确性 | 人类和小鼠的肝脏及脂肪组织样本 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 37个10x Visium样本（来自人类和小鼠的肝脏及脂肪组织） | 10x Genomics, Nanostring | 空间转录组学, 空间转录组学 | 10x Visium, CosMx | 10x Visium空间转录组平台, CosMx空间分子成像平台 |
| 29 | 2026-04-24 |
Technologies for Decoding Cancer Metabolism with Spatial Resolution
2025-Jul-01, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041553
PMID:39284668
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综述 | 本文讨论了三种新兴的代谢组学技术：空间代谢组学、单细胞代谢组学和细胞器代谢组学，及其在解码癌症代谢空间分辨率中的应用 | 系统性地阐述了空间代谢组学、单细胞代谢组学和细胞器代谢组学这三种新兴技术，并探讨了它们与单细胞转录组学和蛋白质组学等传统方法结合使用将如何推动癌症研究的新发现和新问题 | 未具体说明各技术的局限性，仅作为概述性综述 | 讨论新兴代谢组学技术在解码癌症代谢空间分辨率方面的进展和应用前景 | 癌症细胞代谢途径、代谢物谱、空间代谢组学、单细胞代谢组学、细胞器代谢组学 | 数字病理学 | 癌症 | 质谱法 | NA | 代谢物数据 | NA | NA | 空间代谢组学, 单细胞代谢组学, 单细胞转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 30 | 2026-04-23 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Identified Fatty Acid-Binding Proteins Controlling Endothelial Glycolytic and Arterial Programming in Pulmonary Hypertension
2025-Jul, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321173
PMID:40401371
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术，揭示了脂肪酸结合蛋白FABP4和FABP5在肺动脉高压中调控内皮细胞糖酵解和动脉编程的作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学分析，系统阐明了内皮细胞FABP4/5在肺动脉高压发病中的关键角色，特别是其通过调控糖酵解和动脉编程促进血管重塑的机制 | 研究主要基于动物模型和有限的患者样本，需要更大规模的人群研究验证；机制研究尚未完全揭示FABP4/5下游的具体信号通路 | 探究内皮细胞FABP4和FABP5在肺动脉高压发病机制中的作用 | 肺动脉内皮细胞、肺组织、患者血浆样本、Egln1Tie2Cre基因敲除小鼠模型 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 血浆蛋白质组分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量RNA测序数据, 蛋白质组数据 | 包括特发性肺动脉高压患者样本、肺动脉高压大鼠模型、Egln1Tie2Cre小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2026-04-21 |
Single-cell transcriptomic and chromatin dynamics of the human brain in PTSD
2025-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09083-y
PMID:40533550
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和染色质动态分析，揭示了创伤后应激障碍（PTSD）在人脑前额叶皮层中的细胞特异性分子调控机制 | 首次在超过两百万个细胞核中，以细胞类型特异性方式整合遗传、转录组和表观遗传数据，系统解析PTSD的调控机制，并利用空间转录组学验证关键基因 | 研究基于死后脑组织样本，可能无法完全反映活体状态下的动态变化；样本量虽大，但疾病异质性可能影响结果普适性 | 探究PTSD在人脑前额叶皮层中的细胞特异性分子基础与调控网络 | 111个人类死后大脑的背外侧前额叶皮层细胞核 | 单细胞组学 | 创伤后应激障碍 | 单细胞转录组测序、染色质可及性分析、空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据、表观遗传数据、空间转录组数据 | 超过两百万个细胞核，来自111个人类大脑样本 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 32 | 2026-04-17 |
Enhancer-driven gene regulatory networks reveal transcription factors governing T cell adaptation and differentiation in the tumor microenvironment
2025-Jul-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.04.030
PMID:40425012
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研究论文 | 本研究通过配对单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序，揭示了肿瘤微环境中具有组织驻留记忆表型的CD8 T细胞分化的增强子驱动调控网络和关键转录因子。 | 首次通过配对单细胞多组学（RNA-seq和ATAC-seq）分析T细胞受体匹配的CD8 T细胞，构建增强子驱动的调控网络，并明确了KLF2和BATF转录因子在调控肿瘤浸润淋巴细胞中组织驻留记忆表型形成中的相反作用。 | 研究主要基于感染和癌症模型，其结果在人类患者肿瘤微环境中的普适性有待进一步验证。 | 阐明肿瘤微环境中CD8 T细胞向组织驻留记忆表型分化的表观遗传和转录调控机制。 | 感染和癌症模型中的T细胞受体匹配的CD8 T细胞，特别是具有组织驻留记忆表型的肿瘤浸润淋巴细胞。 | 单细胞多组学 | 癌症 | 配对单细胞RNA测序，配对单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据，单细胞染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 33 | 2026-04-17 |
Opposite regulation of intestinal and intrahepatic CD8+ T cells controls alcohol-associated liver disease progression
2025-Jul-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-334412
PMID:40199574
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研究论文 | 本研究揭示了酒精相关性肝病中肠道与肝内CD8+ T细胞的反向调控机制及其在疾病进展中的关键作用 | 首次发现酒精暴露导致十二指肠CD8+ T细胞特异性减少而肝内CD8+ T细胞增加的反向调控现象，并证明BCL2在其中的关键调控作用 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本的关联分析，需要进一步验证BCL2调控机制在人体中的直接作用 | 探究肠道与肝内CD8+ T细胞在酒精相关性肝病中的调控机制及其对疾病进展的影响 | ALD患者样本、野生型小鼠、CD8特异性Bcl2转基因小鼠和Cd8基因敲除小鼠 | 单细胞组学 | 酒精相关性肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | ALD患者样本及多种基因修饰小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2026-04-12 |
Heterogeneous pericoerulear neurons tune arousal and exploratory behaviours
2025-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08952-w
PMID:40335695
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研究论文 | 本研究通过识别并表征蓝斑核周围异质性的GABA能神经元群，揭示了它们如何调控蓝斑核功能，进而控制全局觉醒水平和相关行为 | 首次在蓝斑核树突场中识别出一群在转录组、空间分布和功能上均具有多样性的GABA能神经元，并阐明了它们通过接收远程输入、调节蓝斑核放电模式来控制觉醒和探索行为的新机制 | NA | 探究局部神经调制输入如何控制蓝斑核功能，以及蓝斑核及其周围神经元在调控觉醒、回避状态和相关行为中的具体作用 | 小鼠的蓝斑核及蓝斑核周围区域的神经元 | 神经科学 | 神经精神疾病 | 病毒示踪，单细胞RNA测序，空间转录组学，神经环路研究方法 | NA | 转录组数据，空间定位数据，行为数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 35 | 2026-04-11 |
Patient phenotyping for molecular profiling of neck and low back pain - Study protocol
2025 Jul-Dec, Neurobiology of pain (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1016/j.ynpai.2025.100186
PMID:40501484
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研究论文 | 本文介绍了针对慢性颈痛和腰痛患者进行分子特征分析的研究方案，旨在通过表型分型促进转录组学发现 | 结合全面的患者表型分型与多组学技术（包括单细胞和空间转录组学），在人类疼痛背景下研究分子神经生物学机制 | 研究依赖于手术获取的组织样本，可能无法完全代表所有慢性疼痛患者群体，且控制组织来自器官捐献者，可能存在匹配偏差 | 通过分子特征分析，揭示慢性颈痛和腰痛的分子神经生物学和神经免疫学机制，以发现治疗靶点 | 接受C1-2和腰椎融合手术的慢性颈痛和腰痛患者，以及器官捐献者的对照组织 | 数字病理学 | 慢性疼痛 | 转录组学 | NA | 组织样本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2026-04-09 |
Axon targeting of transcriptionally distinct pioneer neurons is regulated by retinoic acid signaling
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61044-1
PMID:40593691
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了斑马鱼后侧线感觉神经元中先驱神经元与跟随神经元在转录水平上的异质性，并发现视黄酸信号下调对先驱神经元轴突正确靶向至关重要 | 首次通过单细胞RNA测序证明先驱神经元与跟随神经元是转录上不同的群体，并揭示视黄酸信号在调节先驱神经元轴突靶向中的关键作用 | 研究仅基于斑马鱼后侧线感觉神经元模型，结果在其他神经系统或物种中的普适性有待验证 | 探究神经系统发育过程中先驱神经元与跟随神经元在转录水平上的差异及其调控机制 | 斑马鱼后侧线感觉神经元，包括先驱神经元和跟随神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2026-04-01 |
The Dichotomy of Tumor Control by Recruited and Resident Tumor-Associated Macrophages
2025-Jul-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6977440/v1
PMID:40630529
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤相关巨噬细胞中招募型和驻留型亚群在肿瘤控制中的双重作用，并探索了靶向特定巨噬细胞亚群的治疗策略 | 首次明确区分了驻留性间质巨噬细胞亚群在肿瘤中的促瘤或抑瘤功能，并利用空间转录组学证实了其定位和趋化因子谱的差异，同时提出CCR5阻断作为增强肿瘤控制的新方法 | 研究主要基于小鼠模型，人类肿瘤中的巨噬细胞亚群功能可能有所不同，且CCR5阻断疗法的长期安全性和有效性需进一步验证 | 探究肿瘤相关巨噬细胞不同亚群在肿瘤进展和控制中的作用机制，并开发靶向巨噬细胞的治疗策略 | 肿瘤相关巨噬细胞，包括招募型巨噬细胞和驻留型间质巨噬细胞亚群 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤，肺腺癌 | 空间转录组学，基因敲除小鼠模型，CCR5阻断 | Pf4 Cx3cr1小鼠模型 | 空间转录组数据，免疫组织化学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 38 | 2026-03-31 |
Spatial Transcriptomics Decodes Breast Cancer Microenvironment Heterogeneity: From Multidimensional Dynamic Profiling to Precision Therapy Blueprint Construction
2025-07-24, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15081067
PMID:40867511
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术在乳腺癌研究中的应用，重点探讨其在解析肿瘤异质性、表征肿瘤微环境、阐明疾病进展与转移机制以及预测治疗反应方面的作用 | 系统性地将空间转录组学定位为整合多组学数据的枢纽技术，并提出了其在构建乳腺癌精准治疗蓝图中的路线图 | 作为一篇综述文章，其局限性在于主要总结现有研究，而非提出新的原始数据或实验验证 | 旨在综合空间转录组学在乳腺癌研究中的应用，并探索其如何连接分子图谱与临床转化以推动精准治疗 | 乳腺癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 39 | 2026-03-31 |
Targeting Sodium Transport Reveals CHP1 Downregulation as a Novel Molecular Feature of Malignant Progression in Clear Cell Renal Cell Carcinoma: Insights from Integrated Multi-Omics Analyses
2025-07-15, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15071019
PMID:40723891
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析，揭示了钠离子转运相关基因CHP1下调是透明细胞肾细胞癌恶性进展的新分子特征 | 首次通过整合单细胞RNA测序、蛋白质组学等多组学数据，系统揭示了CHP1在ccRCC恶性进展中的下调模式及其作为预后生物标志物的潜力，并筛选出靶向CHP1的候选化合物 | 研究主要基于回顾性数据分析，需要进一步的体内外实验验证CHP1的功能机制和候选化合物的治疗效果 | 构建ccRCC的细胞和转录组全景图，揭示恶性进展过程中的基因表达动态 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC） | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序，蛋白质组学，免疫组化，分子对接，虚拟筛选 | 伪时间轨迹分析，Mfuzz聚类，细胞间通讯建模 | 单细胞转录组数据，蛋白质组数据，免疫组化图像，细胞系数据 | 90个scRNA-seq样本，包含534,227个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 40 | 2026-03-29 |
Gene-regulatory programs that specify age-related differences during thymocyte development
2025-Jul-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115903
PMID:40570375
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研究论文 | 本研究构建了新生和成年小鼠T细胞发育的转录和染色质可及性图谱，揭示了年龄相关差异的基因调控程序 | 通过整合转录组和染色质可及性数据，结合CRISPR扰动与单细胞RNA测序，鉴定了调控T细胞发育年龄差异的保守转录因子Zbtb20 | 研究仅基于小鼠模型，未在人类样本中验证，且单细胞测序技术可能受限于细胞捕获效率和测序深度 | 探究T细胞发育过程中年龄相关差异的基因调控机制 | 新生和成年小鼠的胸腺细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 染色质可及性分析, CRISPR扰动 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 新生和成年小鼠的胸腺细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |