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当前共找到 797 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-05-29 |
Study on the prediction model of liver cancer based on chronic liver disease and the related molecular mechanism
2025 Jul-Dec, Annals of hepatology
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.aohep.2024.101572
PMID:39278407
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研究论文 | 基于慢性肝病数据构建肝癌预测模型并探索相关分子机制 | 整合肝炎、肝硬化和肝细胞癌数据集，识别10个与疾病进展相关的基因并建立预后模型，通过单细胞测序揭示MIF信号通路的作用 | 模型验证仅依赖ROC分析，未提及外部独立验证队列 | 开发一种新的预测模型以准确分类肝细胞癌，提高患者生存率 | 肝炎、肝硬化和肝细胞癌患者的数据及单细胞测序样本 | 机器学习教育 | 肝癌 | 单细胞测序, 多变量Cox回归分析, 药物敏感性分析 | Cox比例风险模型 | 基因表达数据, 临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2026-05-29 |
Extracellular Origins of Cognition: Lessons from Primate Neocortical ECM
2025-07, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.13979
PMID:40696865
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评论 | 评论一篇关于灵长类新皮层细胞外基质在发育过程中的分子组成和空间组织的研究 | 通过多模态方法整合单细胞转录组学、蛋白质组学和免疫组织荧光技术，构建了人类和非人灵长类发育中新皮层的细胞外基质图谱 | 作为评论文章，未提供具体实验数据或验证研究结果 | 强调细胞外基质在早期大脑发育中的作用及其在神经发育障碍疾病中的潜在参与 | 人类和非人灵长类的新皮层细胞外基质 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 单细胞转录组学，蛋白质组学，免疫组织荧光 | NA | 基因表达数据，蛋白质数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2026-05-28 |
Enhancer-driven gene regulatory networks reveal transcription factors governing T cell adaptation and differentiation in the tumor microenvironment
2025-Jul-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.04.030
PMID:40425012
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研究论文 | 通过对感染和癌症模型中T细胞受体匹配的CD8 T细胞进行配对单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序，揭示了增强子驱动的基因调控网络，阐明了在肿瘤微环境中调节T细胞适应和分化的转录因子 | 首次通过多组学分析构建增强子驱动的调控子，揭示了KLF2和BATF在终末分化的组织驻留记忆样肿瘤浸润淋巴细胞形成中的拮抗作用 | 主要基于小鼠模型，未在人类肿瘤样本中验证；TGF-β信号和CD103表达对Trm样TIL形成的必要性结论可能受限于体外实验条件 | 阐明肿瘤微环境中组织驻留记忆样CD8 T细胞分化的表观遗传和转录调控机制 | 感染和癌症模型中的CD8 T细胞（特别是肿瘤浸润淋巴细胞） | 机器学习, 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 多组学分析 | 调控子模型 | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 感染和癌症模型中T细胞受体匹配的CD8 T细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序平台 |
| 24 | 2026-05-27 |
ETS1 Orchestrates a Hybrid EMT Program Driving in vivo Metastasis and Immune Evasion
2025-Jul-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.17.665404
PMID:40777467
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示了ETS1转录因子在头颈鳞癌中驱动混合上皮-间充质转化程序，促进体内转移和免疫逃逸 | 首次发现ETS1作为双重驱动因子，同时调控肿瘤远端转移和免疫逃逸，并确定HSP90抑制剂可作为针对性治疗策略 | 未明确说明局限性 | 研究转录组瘤内异质性如何驱动上气道消化道鳞状细胞癌的转移和免疫逃逸 | 上气道消化道鳞状细胞癌细胞系和患者肿瘤样本 | 机器学习和单细胞转录组学 | 头颈鳞癌 | 单细胞RNA测序 | 转录因子调控网络模型 | 单细胞基因表达数据 | 多个患者队列的肿瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 25 | 2026-05-27 |
DGAT: A Dual-Graph Attention Network for Inferring Spatial Protein Landscapes from Transcriptomics
2025-Jul-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.05.662121
PMID:40672156
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研究论文 | 提出双图注意力网络DGAT，从转录组数据推断空间蛋白景观，弥合空间组学中转录组与蛋白质组之间的鸿沟 | 首次利用双图注意力网络从纯转录组空间数据中学习RNA-蛋白质关系，实现空间蛋白质表达推断，无需直接测量蛋白质 | 未提及明确的局限性 | 通过空间转录组数据推断空间蛋白质表达，增强对组织功能环境和细胞状态的理解 | 扁桃体、乳腺癌、胶质母细胞瘤和恶性间皮瘤的空间转录组数据集 | 机器学习 | 乳腺癌, 胶质母细胞瘤, 恶性间皮瘤 | 空间转录组学, 空间CITE-seq | 双图注意力网络（DGAT） | 空间转录组数据 | 包含扁桃体、乳腺癌、胶质母细胞瘤和恶性间皮瘤的多个数据集 | NA | 空间转录组学, 空间CITE-seq | NA | NA |
| 26 | 2026-05-27 |
Single-cell omics in inflammatory bowel disease: recent insights and future clinical applications
2025-07-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-334165
PMID:39904604
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综述 | 本综述总结了单细胞组学技术在炎症性肠病研究中的应用，涵盖溃疡性结肠炎和克罗恩病，并探讨了其在治疗靶点识别、药物反应机制及临床诊断中的潜在价值 | 全面梳理了单细胞组学（尤其是单细胞RNA测序）在揭示IBD相关新细胞类型、细胞功能及并发症机制中的最新进展，并前瞻性地讨论了其向临床实践转化的可能性 | 单细胞组学在临床实施中仍处于早期阶段，存在技术成本高、数据分析复杂及样本量限制等挑战 | 系统综述单细胞组学在IBD研究中的应用成果，并展望其在临床诊断、监测和预后预测中的未来发展 | 炎症性肠病（IBD患者） | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2026-05-27 |
Multiplexed single-cell transcriptomics reveals diverse phenotypic outcomes for pathogenic SHP2 variants
2025-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.30.662374
PMID:40631144
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研究论文 | 结合单细胞转录组分析、蛋白质生物化学、结构分析和细胞生物学，研究致病性SHP2突变如何失调信号通路，揭示不同突变表型结果的多样性 | 首次通过单细胞转录组分析揭示催化活性丧失与基因敲除在表达水平上表型不同，发现机制不同的突变可能产生趋同的表型效应，且同一热点残基的不同突变可产生不同的细胞状态 | 信息不足，无法提取具体局限性 | 解释致病性SHP2突变如何失调Ras/MAPK信号通路，并阐明突变类型与细胞表型之间的关联 | 表达临床不同SHP2变异的细胞 | 机器学习和转录组学 | 努南综合征及相关发育障碍、癌症 | 单细胞转录组分析、蛋白质生物化学、结构分析、细胞生物学 | NA | 单细胞转录组数据 | 表达不同SHP2变异体的细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 28 | 2026-05-27 |
Diminished SUV3 expression and its functional implications in the IFN-enriched monocyte subset of childhood Sjögren's disease
2025-07-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keaf193
PMID:40268748
|
研究论文 | 研究了儿童干燥综合征中IFN富集单核细胞亚群中SUV3表达降低的功能意义 | 首次揭示SUV3通过线粒体dsRNA介导的PKR激活驱动先天免疫功能障碍的新机制 | 样本量有限（儿童患者），且机制验证主要依赖体外细胞模型 | 探究儿童干燥综合征发病机制中SUV3表达降低的分子和功能影响 | 儿童干燥综合征患者的IFN富集CD14+单核细胞 | 分子生物学 | 儿童干燥综合征 | 单细胞RNA测序、甲醛交联免疫沉淀-qPCR、透射电子显微镜 | NA | 单细胞转录组数据、免疫沉淀定量数据、电子显微镜图像 | cSjD患者和对照组（具体数量未明确提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2026-05-25 |
Down-regulation of IGFBP2 mediates endometrial epithelial cells senescence in thin endometrium
2025-07-03, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf032
PMID:40700608
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析发现，薄型子宫内膜中IGFBP2表达下调导致子宫内膜上皮细胞衰老，并揭示了其通过PI3K/AKT信号通路调控PTEN活性的机制 | 首次阐明IGFBP2下调通过PTEN/PI3K/AKT通路介导子宫内膜上皮细胞衰老，并在体内外模型中验证重组IGFBP2蛋白抗衰老效果优于传统药物达沙替尼 | 未明确IGFBP2上游调控机制；小鼠模型与人类TE病理差异需进一步验证 | 阐明薄型子宫内膜中IGFBP2调控上皮细胞衰老的分子机制及治疗潜力 | 人类原代子宫内膜上皮细胞、Ishikawa细胞系、薄型子宫内膜小鼠模型 | 数字病理学 | 子宫内膜相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 薄型子宫内膜和正常对照组织的单细胞RNA测序数据；小鼠模型数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2026-05-23 |
Disruption of cell-intrinsic PCSK9 enhances the antitumor efficacy of CD8+ T cells
2025-Jul-15, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011657
PMID:40664445
|
研究论文 | 研究发现破坏CD8+ T细胞内源性PCSK9可增强其抗肿瘤功效 | 首次揭示免疫细胞内源性PCSK9在肿瘤控制中的抑制作用，并证明PCSK9缺失可增强CD8+ T细胞的抗肿瘤能力 | 未提及具体局限性 | 探究免疫细胞内源性PCSK9在CD8+ T细胞抗肿瘤免疫中的作用 | 小鼠CD8+ T细胞和人类嵌合抗原受体（CAR）-T细胞 | 机器学习和免疫学交叉 | 胰腺癌和黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | Pcsk9缺陷小鼠和肿瘤模型小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 31 | 2026-05-23 |
Malevolent alliance of MYBL2hi cancer stem cell and SPP1+ macrophage confers resistance to neoadjuvant immunotherapy in bladder cancer
2025-Jul-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-011319
PMID:40639849
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学揭示MYBL2高表达癌症干细胞与SPP1阳性巨噬细胞的协同作用导致膀胱癌对免疫检查点阻断新辅助治疗耐药 | 首次从单细胞和空间转录组角度阐明MYBL2高表达癌症干细胞与SPP1阳性巨噬细胞通过CCL15-CCR1和SPP1-ITGα9β1轴的双向通讯驱动膀胱癌免疫治疗耐药，并发现老年CCL3阳性中性粒细胞参与其中 | 研究样本量较小（2例初治和10例治疗患者），需要更大队列验证；主要基于转录组分析，功能验证仅在小鼠模型中进行 | 探究膀胱癌对新辅助免疫检查点阻断治疗的耐药机制 | 膀胱癌患者的外周血单核细胞、肿瘤组织、癌旁正常组织和转移淋巴结 | 机器学习和数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、空间RNA测序、多重免疫组化、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、空间基因表达数据 | 12例膀胱癌患者（2例初治、5例应答者、5例非应答者） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序，10x Visium用于空间RNA测序 |
| 32 | 2026-05-23 |
Overexpression of high affinity Type I adenosine receptors promotes the growth of uterine leiomyomas
2025-07-03, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf025
PMID:40489662
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研究论文 | 本研究探讨了高亲和力I型腺苷受体（ADORA1）过表达促进子宫平滑肌瘤生长的机制 | 首次揭示ADORA1在子宫平滑肌瘤中过表达通过调节AKT1信号通路促进肿瘤生长，并利用单细胞转录组数据分析多种细胞亚型的ADORA1表达 | 未明确阐述体外结果与体内机制的完全对应性，且样本量可能有限 | 阐明细胞外腺苷水平改变对子宫平滑肌瘤生长的作用机制 | 子宫平滑肌瘤组织和匹配的肌层组织标本及其原代培养细胞 | 数字病理学 | 子宫平滑肌瘤 | RT-qPCR, Western blot, 免疫组化, 单细胞转录组学, siRNA干扰 | NA | 组织标本和原代培养细胞 | 匹配的子宫肌层和肌瘤标本及其原代培养物（具体数量未提及） | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 33 | 2026-05-23 |
scRNA-Seq and Bulk-Seq Identify Novel Markers Associated With Calcium Regulation and Immunomodulation in Acute Pancreatitis
2025-07-01, Pancreas
IF:1.7Q3
DOI:10.1097/MPA.0000000000002421
PMID:40536508
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research paper | 通过单细胞RNA测序和批量RNA测序识别与急性胰腺炎中钙调控和免疫调节相关的新型标志物 | 结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据构建ceRNA网络，首次发现与钙信号和免疫调节相关的新候选基因 | 未说明具体局限性，试验注册不适用 | 阐明急性胰腺炎的发病机制并识别新的潜在生物标志物 | 急性胰腺炎小鼠模型 | machine learning | acute pancreatitis | RNA-seq, scRNA-seq, qRT-PCR | ceRNA network | RNA-seq data, scRNA-seq data | 小鼠样本（具体数量未明确） | Illumina | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 34 | 2026-05-23 |
Fibroblasts-The emerging therapeutic target of the cardiovascular system?
2025-07, Pharmacological reviews
IF:19.3Q1
DOI:10.1016/j.pharmr.2025.100072
PMID:40609323
|
综述 | 综述了单细胞RNA测序揭示的成纤维细胞在心血管系统中的异质性和可塑性，及其在健康和疾病状态下的多样角色 | 强调缺乏成纤维细胞亚型共识命名法，提出跨心脏和血管组织的共享标志物及其治疗潜力与安全性问题 | 心脏成纤维细胞靶向治疗的临床前研究虽有前景，但血管干预手段有限，且亚型表型重叠和功能多样性构成挑战 | 探索成纤维细胞在心血管系统中的治疗靶点潜力，并倡导完善其分类和命名 | 心血管系统中健康和疾病状态下的成纤维细胞 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2026-05-22 |
Spatial transcriptomic profiling uncovers the molecular effects of the neurotoxicant polychlorinated biphenyls (PCBs) in the brains of adult mice
2025-Jul-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.24.665575
PMID:40777386
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研究论文 | 利用空间转录组学技术揭示多氯联苯对成年小鼠大脑的分子效应 | 首次通过空间转录组学技术系统分析PCB暴露对小鼠五个脑区基因表达的分子特征，并揭示其与血脑屏障完整性的关联 | 未说明具体局限性 | 评估人类相关PCB混合物对大脑功能与认知的影响机制 | 成年雄性C57BL/6J小鼠 | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 成年雄性C57BL/6J小鼠（具体数量未说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 36 | 2026-05-21 |
Scalable and unsupervised discovery from raw sequencing reads using SPLASH2
2025-Jul, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-024-02381-2
PMID:39313645
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研究论文 | 介绍SPLASH2，一种基于高效k-mer计数方法的快速可扩展实现，用于从多种测序技术的大规模数据集中检测调控序列变异 | 提出SPLASH2算法，实现了从原始测序reads中无监督、可扩展的发现，无需参考基因组或注释，并能有效处理大规模单细胞和批量RNA-seq数据 | NA | 开发一种快速、可扩展的算法，用于从原始测序数据中无监督发现调控序列变异 | 单细胞RNA-seq数据和癌症细胞系百科全书（CCLE）的批量RNA-seq数据 | 机器学习 | 癌症 | RNA-seq，k-mer计数 | NA | 测序数据 | 包含单细胞RNA-seq和CCLE批量RNA-seq数据 | Illumina | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 37 | 2026-05-20 |
Molecular characterization of benign intracranial glioependymal and arachnoid cysts suggest heterogeneous mechanisms of action
2025-Jul-01, Journal of neuropathology and experimental neurology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jnen/nlaf029
PMID:40197611
|
研究论文 | 该研究对良性颅内胶质室管膜囊肿和蛛网膜囊肿进行分子表征，提出异质性作用机制 | 首次通过单细胞测序和RNA表达分析揭示两种囊肿的细胞组成差异，发现胶质室管膜囊肿中钠转运蛋白和水通道蛋白表达上调，提示主动液体分泌机制 | 样本量较小（仅16例患者），且未进一步验证囊肿形成的分子机制 | 阐明良性颅内囊肿形成和生长的异质性机制 | 16例接受手术治疗的良性颅内囊肿患者的囊壁病理样本（8例）和囊液（4例） | 数字病理学 | 颅内囊肿 | H&E染色、免疫荧光染色、单细胞测序、RNA表达谱分析 | NA | 图像、文本 | 16例患者，其中8例囊壁样本，4例囊液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2026-05-18 |
Biomarkers and therapeutic strategies targeting microglia in neurodegenerative diseases: current status and future directions
2025-07-10, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-025-00867-4
PMID:40640892
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综述 | 本文综述了靶向小胶质细胞的生物标志物和治疗策略在神经退行性疾病中的现状与未来方向 | 系统总结了从成熟靶点（如TREM2、PGRN、SORT1）到新兴候选标志物（如LILRB4、P2Y6R、TAM受体）的全景，并引入肿瘤学伴随诊断（CDx）模型，提出整合多模态生物标志物策略以指导个性化干预 | 多数生物标志物仍局限于临床前研究，面临物种差异、缺乏标准化及临床异质性等转化挑战 | 探讨小胶质细胞功能障碍在神经退行性疾病（如阿尔茨海默病、肌萎缩侧索硬化症、帕金森病、额颞叶痴呆）中的核心作用，并评估相关治疗靶点及生物标志物 | 小胶质细胞及相关生物标志物与治疗靶点 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 单细胞组学、空间转录组学 | NA | 多模态数据（含血液、脑脊液、影像数据） | NA | NA | 单细胞组学，空间转录组学 | NA | NA |
| 39 | 2026-05-17 |
TCF7 functions as a prognostic biomarker in bladder cancer by strengthening EMT and stemness associated with TGF-β/SMAD3 signaling
2025-Jul, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-025-05241-y
PMID:40025258
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research paper | 本研究探究TCF7在膀胱癌中通过调控TGF-β/SMAD3信号通路促进上皮间质转化和干性，作为预后生物标志物的作用机制 | 首次揭示TCF7通过转录调控TGFBR1影响TGF-β/SMAD3通路，驱动膀胱癌上皮间质转化和干性的新机制 | NA | 阐明TCF7在膀胱癌进展中的生物学功能和转录调控机制 | 膀胱癌患者样本及TCF7相关分子机制 | machine learning | bladder cancer | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2026-05-17 |
Circulating monocytes upregulate CD52 and sustain innate immune function in cirrhosis unless acute decompensation emerges
2025-07, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.12.031
PMID:39818234
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析不同阶段肝硬化患者循环单核细胞的异质性，发现CD52在先天免疫功能中的关键作用 | 首次在单细胞水平上描述CD52在肝硬化不同阶段循环单核细胞中的表达变化，并揭示CD52稳定化可增强单核细胞抗感染功能 | 未在急性失代偿患者中深入验证CD52的机制，且缺乏体内功能验证 | 阐明肝硬化不同阶段循环单核细胞状态的异质性，以及CD52在先天免疫麻痹中的功能和潜在治疗意义 | 健康个体和不同阶段肝硬化患者的循环单核细胞 | 数字病理学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 体外功能实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康个体和各阶段肝硬化患者的血液样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 测序平台 |