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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2025-10-06 |
Potential of SPHK1 as a prognostic marker and therapeutic target in colorectal cancer: insights from bioinformatics and experimental analysis
2025-07-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002506
PMID:40434736
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研究论文 | 本研究通过生物信息学和实验分析探讨SPHK1在结直肠癌中的预后标志物和治疗靶点潜力 | 首次通过孟德尔随机化方法证实鞘磷脂水平与结直肠癌风险的因果关系,并结合单细胞RNA测序分析SPHK1与免疫浸润的关联 | 样本量相对有限,需要更大规模临床验证 | 研究SPHK1在结直肠癌进展中的作用机制及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 结直肠癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 多组学分析,单细胞RNA测序,孟德尔随机化,多重荧光免疫组化,细胞迁移/侵袭/凋亡实验 | NA | 基因表达数据,甲基化数据,蛋白质表达数据,细胞功能数据 | 90例结直肠癌组织和对应正常组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 342 | 2025-10-06 |
Microbiome Single Cell Atlases Generated with a Commercial Instrument
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202409338
PMID:40462354
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研究论文 | 本文介绍了EASi-seq方法,通过改造商业单细胞测序平台实现对微生物的高通量单细胞基因组测序 | 首次将商业单细胞测序仪器成功应用于微生物单细胞基因组测序,开发了配套生物信息学流程 | 未明确说明方法在特定微生物类型或复杂环境样本中的适用性限制 | 开发适用于微生物的单细胞基因组测序方法 | 人类和环境微生物组中的单个微生物细胞 | 微生物组学 | NA | 单细胞基因组测序 | NA | 基因组序列数据 | 每次运行可测序数万个微生物 | Mission Bio | 单细胞基因组测序 | Tapestri | Mission Bio Tapestri单细胞分析平台 |
| 343 | 2025-10-06 |
Identification of an immunomodulatory lncRNA signature associated with immune cell reprogramming in high-grade glioma
2025-Jul, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-025-00919-3
PMID:40527978
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研究论文 | 本研究通过识别与高级别胶质瘤免疫细胞重编程相关的免疫调节性长链非编码RNA特征,揭示了其在肿瘤免疫微环境形成中的作用 | 首次在高级别胶质瘤中系统鉴定与免疫抑制和促炎性肿瘤微环境相关的lncRNA特征,并通过单细胞和空间转录组学揭示其细胞类型特异性和空间分布特征 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;机制研究尚不深入 | 探索lncRNAs在高级别胶质瘤免疫微环境形成中的作用机制 | 高级别胶质瘤肿瘤浸润免疫细胞 | 生物信息学 | 脑肿瘤/胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 转录组分析 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | 两种小鼠模型(RCAS-PDGFb和RCAS-BRAF V600E)及GBM患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 344 | 2025-10-06 |
Bidirectional mendelian randomization and single-cell sequencing reveal T cell-mediated causal links between COPD and lung adenocarcinoma
2025-Jul-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002448
PMID:40676822
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研究论文 | 通过双向孟德尔随机化和单细胞测序技术揭示T细胞介导的慢性阻塞性肺疾病与肺腺癌之间的因果关系 | 首次结合双向孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序技术探索COPD与肺腺癌之间的因果机制 | 研究样本量有限,仅关注了CD4+T细胞亚群,未涵盖其他免疫细胞类型 | 探索慢性阻塞性肺疾病与肺腺癌之间的潜在关系和作用机制 | COPD和肺腺癌患者的CD4+T细胞亚群 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 表达数量性状位点分析, 全基因组关联研究 | 孟德尔随机化模型 | 单细胞RNA测序数据, GWAS数据, eQTL数据 | 来自COPD和肺腺癌患者外周血样本的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 345 | 2025-10-06 |
Mapping Genetic Associations With Functional Brain Area Alterations in Schizophrenia and Implications for Cortical Development
2025-Jul, Brain and behavior
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/brb3.70688
PMID:40685676
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研究论文 | 本研究通过脑功能区域灰质体积变化与遗传因素关联分析,探索精神分裂症患者大脑皮层发育异常的潜在机制 | 首次系统性地将精神分裂症患者灰质体积变化定位到特定Brodmann脑功能区域,并结合GWAS和单细胞RNA测序技术揭示相关基因在皮层发育中的动态表达模式 | 样本量相对有限(194名患者和330名对照),且主要基于台湾人群,结果在其他人群中的普适性需要进一步验证 | 识别精神分裂症患者特定脑功能区域的灰质体积变化及其遗传基础,探索相关基因在皮层发育中的作用 | 精神分裂症患者和健康对照者的大脑灰质体积变化及遗传变异 | 神经影像遗传学 | 精神分裂症 | T1加权MRI、全基因组关联分析(GWAS)、单细胞RNA测序、原位杂交 | GWAS分析、单细胞转录组分析 | 脑影像数据、遗传数据、基因表达数据 | 194名精神分裂症患者和330名健康对照 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 346 | 2025-10-06 |
Dissecting Sex-Specific Pathology in K18-hACE2 Transgenic Mice Infected With Different SARS-CoV-2 Variants
2025-Jul, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70506
PMID:40686017
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研究论文 | 本研究通过分析感染不同SARS-CoV-2变异株的K18-hACE2转基因小鼠,揭示性别特异性病理差异 | 首次系统比较不同SARS-CoV-2变异株(614G、Delta、Omicron)在转基因小鼠模型中引发的性别特异性病理差异 | 研究局限于K18-hACE2转基因小鼠模型,结果需在人类中进一步验证 | 解析COVID-19病理中性别差异与SARS-CoV-2变异株特异性关系 | K18-hACE2转基因小鼠的肺组织和鼻腔组织 | 空间转录组学 | COVID-19 | 空间转录组学,免疫组织化学,细胞因子检测 | NA | 基因表达数据,细胞浸润数据,细胞因子数据 | 年龄匹配的雌性和雄性K18-hACE2转基因小鼠 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 347 | 2025-10-06 |
Cerulenin partially corrects the disrupted developmental transcriptomic signature in Huntington's disease striatal medium spiny neurons
2025-Jul-21, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf029
PMID:40336225
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析亨廷顿病纹状体中型多棘神经元的发育轨迹,并发现药物Cerulenin可部分纠正其发育转录组异常 | 首次在人类iPSC分化的MSN发育模型中系统揭示HD相关转录组异常,并通过L1000数据库筛选发现Cerulenin具有部分纠正作用 | 研究仅验证了Cerulenin的部分纠正效果,尚未进行完整的机制解析和体内验证 | 探究突变HTT蛋白对中型多棘神经元发育的影响及潜在治疗策略 | 亨廷顿病诱导多能干细胞分化的纹状体中型多棘神经元 | 神经科学 | 亨廷顿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | HD iPSC和同基因对照分化的神经元群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 348 | 2025-10-06 |
Biomimetic phosphorus dendrimer multi-epitope nanovaccine enhances humoral and cellular immune response against African swine fever virus
2025-Jul-21, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03593-7
PMID:40685337
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研究论文 | 本研究开发了一种靶向树突状细胞的非洲猪瘟病毒仿生纳米疫苗,通过增强体液和细胞免疫反应提供保护 | 首次将DC靶向纳米抗体与ASFV多表位抗原结合,并利用磷树枝状大分子和病毒感染的巨噬细胞膜构建仿生纳米疫苗 | 研究仅在鼠模型中进行验证,尚未在猪体中进行临床试验 | 开发有效的非洲猪瘟病毒疫苗 | 非洲猪瘟病毒(ASFV)抗原和鼠免疫系统 | 免疫学 | 非洲猪瘟 | 单细胞RNA测序, 纳米疫苗构建技术 | NA | 基因表达数据, 免疫反应数据 | 鼠脾脏细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 349 | 2025-10-06 |
An adeno-associated virus gene therapy strategy for anti-obesity treatment by nanocarrier-based delivery systems
2025-Jul-21, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03595-5
PMID:40685368
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研究论文 | 本研究通过纳米载体递送AAV基因疗法增强肠道内分泌细胞中Scg2表达,探索抗肥胖治疗新策略 | 开发了能够长期粘附肠道上皮的交联纳米颗粒载体系统,首次证明Scg2在调节代谢激素GLP-1和PYY分泌中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 探索通过基因疗法治疗代谢紊乱和肥胖的新方法 | 无菌小鼠、常规饲养小鼠、高脂饮食小鼠和ob/ob基因型小鼠 | 基因治疗 | 肥胖症 | 单细胞转录组分析、多组学分析、AAV基因递送 | NA | 转录组数据、代谢组数据 | 多种基因型小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 350 | 2025-10-06 |
Differential expression pattern of CC chemokine receptor 7 guides precision treatment of hepatocellular carcinoma
2025-Jul-21, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02308-6
PMID:40685403
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研究论文 | 本研究通过分析CC趋化因子受体7在肝细胞癌中的差异表达模式,指导肝癌精准治疗 | 首次揭示肿瘤细胞来源与基质细胞来源的CCR7表达具有相反效应,并发现VEGF-C通过激活淋巴管生成和CCL21/CCR7轴促进三级淋巴结构形成 | 临床前研究结果需要进一步临床试验验证 | 探索肝细胞癌微环境中CCR7的差异表达模式及其对精准治疗的指导意义 | 肝细胞癌患者组织和细胞系 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 组织芯片、空间转录组、单细胞测序、CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 图像、转录组数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 351 | 2025-10-06 |
Exploring Immunogenetic Mechanisms in Parkinson's Disease Using Single-Cell Transcriptomics and Mendelian Randomization
2025-Jul-21, Current pharmaceutical biotechnology
IF:2.2Q3
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和孟德尔随机化方法探索帕金森病的免疫遗传机制 | 首次结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析揭示帕金森病中免疫细胞浸润和转录调控的新机制 | 受限于人群异质性和因果关系推断的挑战 | 探究帕金森病的免疫遗传机制 | 帕金森病患者和对照组的免疫细胞 | 生物信息学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 表达数量性状位点分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 352 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing uncovers abnormal Sertoli-cell elevation and testicular niche impairment in the transfemales's testis
2025-Jul-20, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01445-3
PMID:40685388
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示跨性别女性睾丸中支持细胞异常增多和睾丸微环境损伤的机制 | 首次在跨性别女性睾丸中发现支持细胞数量异常增加及β-连环蛋白核转位现象 | 样本量有限,未涵盖所有年龄段的跨性别女性 | 研究性别肯定激素治疗对睾丸细胞组成和分子通路的影响 | 跨性别女性睾丸组织细胞 | 单细胞转录组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 实时定量PCR, 免疫染色 | NA | 单细胞转录组数据 | 约49,385个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 353 | 2025-10-06 |
CXCL12/CXCR4 modulates macrophage efferocytosis to induce glomerular crescent formation and fibrosis via ELMO1/DOCK180/RAC1 signaling in ANCA-associated glomerulonephritis
2025-Jul-19, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05750-5
PMID:40682610
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研究论文 | 本研究揭示CXCL12/CXCR4信号轴通过调控巨噬细胞胞葬作用促进ANCA相关性肾小球肾炎新月体形成和纤维化的机制 | 首次阐明内皮细胞与单核/巨噬细胞间通过CXCL12/CXCR4信号轴建立特异性分子对话机制,发现ELMO1/DOCK180/RAC1信号通路介导的胞葬作用在疾病进展中的关键作用 | 未明确说明样本规模和具体实验模型的局限性 | 探究ANCA相关性肾小球肾炎中单核细胞募集和巨噬细胞极化的调控机制 | ANCA相关性肾小球肾炎患者样本、单核细胞、巨噬细胞、肾小球内皮细胞 | 分子病理学 | ANCA相关性肾小球肾炎 | 单细胞测序、蛋白相互作用分析、体外实验、体内实验 | EAV模型 | 单细胞测序数据、蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 354 | 2025-10-06 |
Cardiomyocyte OTUD1 drives diabetic cardiomyopathy via directly deubiquitinating AMPKα2 and inducing mitochondrial dysfunction
2025-Jul-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61901-z
PMID:40683882
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研究论文 | 本研究揭示了去泛素化酶OTUD1通过直接去泛素化AMPKα2诱导线粒体功能障碍,从而驱动糖尿病心肌病的分子机制 | 首次发现OTUD1是AMPK的直接调控去泛素化酶,并揭示了OTUD1-AMPK信号轴在糖尿病心肌病中的关键作用 | 研究主要聚焦于雄性小鼠模型,缺乏雌性动物验证;临床转化价值需进一步验证 | 探究去泛素化酶OTUD1在糖尿病心肌病发病中的作用及调控机制 | 1型和2型糖尿病雄性小鼠模型及心肌细胞 | 分子生物学 | 糖尿病心肌病 | 单细胞RNA测序,基因敲除,蛋白相互作用分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,蛋白互作数据,生理功能数据 | 糖尿病小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 355 | 2025-10-06 |
Multi-cohort analysis identifies a blood-based immune transcriptomic signature for early lung cancer detection
2025-Jul-19, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01043-z
PMID:40684032
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研究论文 | 通过多队列分析识别出基于血液的免疫转录组特征用于肺癌早期检测 | 首次通过大规模多队列血液转录组meta分析识别出6个基因组成的肺癌特征,该特征主要来源于髓系细胞,在肿瘤相关巨噬细胞和成纤维细胞中表达更高 | 需要进一步临床验证和开发 | 开发基于血液的肺癌早期检测方法 | 肺癌患者、健康对照和其他疾病患者的血液样本 | 生物信息学 | 肺癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | 诊断分类器 | 转录组数据 | 发现阶段:432例肺癌,8154例健康对照,14187例其他疾病;验证阶段:371名受试者(172例肺癌),454名Framingham研究受试者(42例肺癌);单细胞数据:1,022,063个细胞 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 356 | 2025-10-06 |
From preneoplastic lesion to heterogenous tumor: recent insights into hepatoblastoma biology and therapeutic opportunities
2025-Jul-19, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02405-8
PMID:40684183
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综述 | 本文综述了肝母细胞瘤生物学特征的最新发现及治疗机会 | 整合单细胞RNA测序、多组学、空间转录组学和功能基因组学筛选揭示肿瘤异质性机制 | NA | 总结肝母细胞瘤生物学特征以推进治疗策略 | 小儿肝母细胞瘤细胞、肿瘤相关细胞类型及遗传依赖性 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 多组学, 空间转录组学, 功能基因组学筛选 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 357 | 2025-10-06 |
GeneSurfer enables transcriptome-wide exploration and annotation of gene co-expression modules in 3D spatial transcriptomics data
2025-Jul-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112713
PMID:40678514
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研究论文 | 开发了GeneSurfer交互式界面,用于探索3D空间转录组数据中局部基因共表达模式 | 首个设计用于在大规模数据集中探索局部基因共表达模式的交互式分析工具 | NA | 开发空间转录组数据中基因共表达模式的探索和注释工具 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 358 | 2025-10-06 |
Bering: joint cell segmentation and annotation for spatial transcriptomics with transferred graph embeddings
2025-Jul-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60898-9
PMID:40681510
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研究论文 | 提出Bering图深度学习模型,利用转录本共定位关系进行空间转录组学的联合细胞分割和分子注释 | 首次提出利用转录本共定位关系进行联合噪声感知细胞分割和分子注释的图深度学习模型,构建预训练模型并通过迁移学习和自蒸馏实现高精度分割 | 未明确说明模型在特定组织类型或技术平台上的局限性 | 解决空间转录组学中细胞分割和注释的准确性问题 | 2D和3D空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 图深度学习模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 359 | 2025-10-06 |
The pro-cancer and immunosuppressive activity of macrophage-transformed cancer-associated fibroblasts in oral squamous cell carcinoma
2025-Jul-18, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.07.027
PMID:40684939
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研究论文 | 本研究揭示了口腔鳞状细胞癌中巨噬细胞-肌成纤维细胞转化(MMT)的存在及其通过CXCL10途径促进肿瘤进展和免疫抑制的机制 | 首次在口腔鳞状细胞癌中证实巨噬细胞-肌成纤维细胞转化的存在,并阐明其通过CXCL10促进髓源性抑制细胞归巢和功能的免疫抑制机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需进一步深入 | 探究巨噬细胞-肌成纤维细胞转化的起源、功能特征及其在口腔鳞状细胞癌中的作用机制 | 口腔鳞状细胞癌肿瘤微环境中的巨噬细胞-肌成纤维细胞转化细胞 | 肿瘤免疫学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 流式细胞术, 假时序分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 图像数据, 流式细胞数据 | 口腔鳞状细胞癌病理切片、同种异体移植肿瘤和皮下肿瘤模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 360 | 2025-10-06 |
Machine learning assisted immune profiling of COPD identifies a unique emphysema subtype independent of GOLD stage
2025-Jul-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112966
PMID:40687815
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研究论文 | 通过机器学习辅助的免疫分析识别出独立于GOLD分期的独特肺气肿亚型 | 首次结合多组学技术和机器学习算法识别出与肺气肿严重程度相关的独特免疫亚型 | 样本量未明确说明,需要进一步验证研究 | 探索COPD免疫特征与疾病异质性的关系 | 慢性阻塞性肺疾病患者 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | 流式细胞术,细胞因子分析,单细胞转录组学,空间转录组学,机器学习算法 | 机器学习算法 | 细胞数据,分子数据,临床数据 | NA | NA | 单细胞转录组学,空间转录组学 | NA | NA |