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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2025-10-06 |
Identification of Crosstalk Genes Between Primary Sjögren's Syndrome and Primary Biliary Cirrhosis by Transcriptome Analysis
2025-Jul, Digestive diseases and sciences
IF:2.5Q2
DOI:10.1007/s10620-025-08917-z
PMID:40199818
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研究论文 | 通过转录组分析识别原发性干燥综合征与原发性胆汁性胆管炎之间的串扰基因 | 首次通过整合差异表达分析、WGCNA和LASSO回归识别出pSS和PBC之间的7个关键串扰基因 | 研究基于公共数据库的转录组数据,需要进一步实验验证 | 探索原发性干燥综合征与原发性胆汁性胆管炎之间的分子关联机制 | 原发性干燥综合征和原发性胆汁性胆管炎患者的转录组数据 | 生物信息学 | 自身免疫性疾病 | 转录组分析, 差异表达分析, WGCNA, LASSO回归, ssGSEA, 单细胞转录组分析 | LASSO回归模型, 多元逻辑回归模型 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的两个数据集(GSE66795和GSE119600) | NA | 转录组测序, 单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 322 | 2025-10-06 |
Mobilizing antigen-presenting mast cells in anti-PD-1-refractory triple-negative breast cancer: a phase 2 trial
2025-Jul, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-025-03776-7
PMID:40563015
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析发现抗原呈递肥大细胞(apMCs)与PD-1抑制剂疗效的关联,并开展二期临床试验验证色甘酸钠联合抗PD-1治疗对难治性三阴性乳腺癌的疗效 | 首次揭示肥大细胞在肿瘤免疫调控中的关键作用,发现色甘酸钠可动员apMCs增强T细胞免疫,为克服抗PD-1耐药提供新策略 | 样本量有限(44例单细胞分析,484例验证),研究聚焦三阴性乳腺癌,结果可能不适用于其他癌症类型 | 探索克服三阴性乳腺癌抗PD-1治疗耐药的新机制和临床策略 | 三阴性乳腺癌患者(初治44例,验证队列484例,临床试验为难治性转移性三阴性乳腺癌女性患者) | 数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 44例初治患者单细胞分析,484例独立验证,二期临床试验患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 323 | 2025-10-06 |
A novel subset of inflammation-related liver NK cells modulates immune responses in a murine model of primary biliary cholangitis
2025-Jul, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2025.103454
PMID:40609234
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研究论文 | 本研究在原发性胆汁性胆管炎中发现并鉴定了一类新型炎症相关自然杀伤细胞亚群 | 首次鉴定出具有CD49aCXCR6特征的新型炎症相关NK细胞亚群,并阐明其从常规NK细胞分化及通过TNF-α调控免疫反应的机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证尚不充分 | 探究原发性胆汁性胆管炎中新型免疫细胞亚群的功能机制 | 小鼠PBC模型(ARE-Del小鼠)和PBC患者肝脏样本 | 免疫学 | 自身免疫性肝病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | 基因表达数据 | PBC小鼠模型和患者肝脏样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 324 | 2025-10-06 |
Guard cells on the adaxial and abaxial leaf surfaces use different compositions of potassium ion channels to drive light-induced stomatal opening
2025-Jul, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-02026-5
PMID:40634560
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研究论文 | 本研究揭示了植物叶片上下表皮保卫细胞通过不同钾离子通道组成驱动光诱导气孔开放的分子机制 | 首次发现植物上下表皮保卫细胞利用不同钾离子通道控制气孔光响应 | 研究主要基于拟南芥和烟草模型植物,在其他植物中的普适性需进一步验证 | 探究植物叶片上下表皮气孔对光响应差异的分子机制 | 拟南芥和烟草的保卫细胞 | 植物分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序,计算机模拟 | OnGuard模拟 | 基因表达数据 | 拟南芥和烟草的保卫细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 325 | 2025-10-06 |
OM-85, a Bacterial Lysate, Reduces Pulmonary Nodule Malignant Probability: A Retrospective Study
2025-Jul, The clinical respiratory journal
DOI:10.1111/crj.70109
PMID:40692186
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研究论文 | 回顾性研究评估细菌裂解物OM-85对慢性支气管炎患者高危肺结节的干预效果 | 首次发现OM-85可通过提升NK细胞比例降低肺结节恶性概率 | 回顾性研究设计,样本量有限(72例治疗组/90例对照组) | 评估OM-85对高危肺结节的干预效果 | 慢性支气管炎伴高危肺结节患者 | 临床医学 | 肺癌 | 流式细胞术, 多重免疫荧光, 单细胞RNA测序 | NA | 医学影像, 分子生物学数据 | 162例患者(204个肺结节) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 326 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals Shen-Bai-Jie-Du decoction retards colorectal tumorigenesis by regulating the TMEM131-TNF signaling pathway-mediated differentiation of immunosuppressive dendritic cells
2025-Jul, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2025.05.013
PMID:40698132
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示参白解毒汤通过调控TMEM131-TNF信号通路介导的免疫抑制性树突细胞分化延缓结直肠肿瘤发生 | 首次构建小鼠和临床患者相互验证的单细胞转录组图谱,发现CCL22树突细胞的积累及其免疫抑制功能,并揭示参白解毒汤和黄连素通过TMEM131-TNF信号通路逆转这一过程 | 机制研究仍需进一步验证,特别是TMEM131作为黄连素潜在靶点的具体作用机制 | 探究参白解毒汤延缓结直肠肿瘤发生的分子机制 | 结直肠肿瘤微环境中的树突细胞 | 单细胞测序分析 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组化, 流式细胞术, 批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据, 蛋白质表达数据 | 小鼠模型和临床患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 327 | 2025-10-06 |
Generation of Porcine Blastoids from Embryonic Stem Cells
2025-Jul-25, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2025_651
PMID:40705202
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研究论文 | 本研究开发了一种从猪胚胎干细胞生成类囊胚结构的方法 | 建立了首个猪胚胎干细胞来源的类囊胚三维两步分化策略 | NA | 开发大动物胚胎发育研究模型以加速育种进程 | 猪胚胎干细胞和类囊胚结构 | 发育生物学 | NA | 三维分化策略、单细胞转录组分析 | NA | 形态学数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 328 | 2025-10-06 |
Enhancing and accelerating cell type deconvolution of large-scale spatial transcriptomics slices with dual network model
2025-Jul-24, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf419
PMID:40704686
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研究论文 | 提出一种基于双网络模型的快速细胞类型反卷积算法jMF2D,用于增强大规模空间转录组切片的细胞类型解析 | 通过联合学习细胞类型相似性网络来桥接scRNA-seq和空间转录组数据,提高细胞类型特征的准确性,同时节省约90%的运行时间 | NA | 开发快速准确的细胞类型反卷积算法以分析空间转录组数据 | 空间转录组切片中的细胞类型分布 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 非负矩阵分解,网络模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 329 | 2025-10-06 |
Decellularized small intestinal hydrogel-encapsulated BMSCs attenuate dextran sulfate sodium-induced colitis in mice via immunomodulation and tissue repair
2025-Jul-23, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d5tb00706b
PMID:40566954
|
研究论文 | 本研究开发了一种脱细胞小肠水凝胶递送系统,用于包裹大鼠骨髓间充质干细胞,通过免疫调节和组织修复缓解小鼠结肠炎 | 首次将脱细胞小肠水凝胶与骨髓间充质干细胞结合,通过直肠靶向给药治疗结肠炎,展现出优于传统PLGA-PEG-PLGA水凝胶的生物活性和治疗效果 | 需要进一步研究水凝胶与干细胞的相互作用机制,优化给药方案,并通过单细胞RNA测序阐明免疫调节机制 | 开发有效的炎症性肠病治疗策略 | 小鼠结肠炎模型和大鼠骨髓间充质干细胞 | 组织工程与再生医学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 330 | 2025-10-06 |
Down-regulation of IGFBP2 mediates endometrial epithelial cells senescence in thin endometrium
2025-Jul-23, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf032
PMID:40700608
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现IGFBP2下调介导子宫内膜上皮细胞衰老是薄型子宫内膜的关键致病机制 | 首次在单细胞水平揭示IGFBP2通过PI3K/AKT信号通路调控PTEN活性影响P21积累介导细胞衰老的新机制 | 研究样本量有限,动物模型通过刮宫联合H2O2灌注建立可能与人类自然发病机制存在差异 | 探究薄型子宫内膜的发病机制并寻找潜在治疗靶点 | 薄型子宫内膜患者样本、人原代子宫内膜上皮细胞、Ishikawa细胞系、TE小鼠模型 | 单细胞生物学 | 妇科生殖疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 331 | 2025-10-06 |
Molecular mechanism of potently neutralizing human monoclonal antibodies against severe fever with thrombocytopenia virus infection
2025-Jul-22, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00533-25
PMID:40539781
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序从SFTS幸存者中分离出高效中和单克隆抗体,并验证其对SFTS病毒感染的防护效果 | 首次报道针对SFTS病毒Gn糖蛋白的超高中和活性人源单克隆抗体,并解析了抗体-抗原复合物的晶体结构 | 动物实验仅在鼠模型中进行,尚未开展人体临床试验 | 开发针对SFTS病毒的特异性抗病毒治疗方法 | SFTS病毒及其Gn糖蛋白 | 传染病学 | 发热伴血小板减少综合征 | 单细胞RNA-seq, X射线晶体学, 中和实验 | NA | 基因序列数据, 结构生物学数据 | 从SFTS幸存者中分离多个单克隆抗体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 332 | 2025-10-06 |
Integrative causal and single-cell analyses reveal genes responsive to endocrine disruptors driving human male infertility
2025-Jul-22, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118709
PMID:40700968
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研究论文 | 通过整合因果分析和单细胞测序技术,揭示内分泌干扰物响应基因在男性不育症中的作用机制 | 首次结合孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序,系统鉴定与内分泌干扰物相关的男性不育致病基因 | 研究主要基于遗传变异和基因表达数据,需要进一步实验验证具体的分子机制 | 探索内分泌干扰物通过调控基因表达导致男性不育的分子机制 | 人类睾丸组织及与男性不育相关的基因 | 单细胞组学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 共定位分析 | NA | 基因表达数据, 遗传变异数据, 单细胞转录组数据 | 大规模cis-eQTL和GWAS数据集,包含人类睾丸组织单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 333 | 2025-10-06 |
Sceptic: pseudotime analysis for time-series single-cell sequencing and imaging data
2025-Jul-17, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03679-3
PMID:40676652
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研究论文 | 提出一种用于时间序列单细胞数据的监督式伪时间分析方法Sceptic | 开发基于支持向量机的监督式伪时间分析方法,显著提高预测准确性并适用于多种单细胞数据类型 | NA | 解决现有单细胞伪时间分析方法预测准确性低且难以泛化到不同数据类型的问题 | 时间序列单细胞RNA测序数据、单细胞ATAC测序数据和显微镜图像数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、显微镜成像 | 支持向量机(SVM) | 单细胞测序数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞成像 | NA | NA |
| 334 | 2025-10-06 |
Phenotypic heterogeneity and plasticity in colorectal cancer metastasis
2025-Jul-09, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100881
PMID:40393458
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研究论文 | 通过单细胞多组学和空间转录组学技术揭示结直肠癌转移过程中的表型异质性与可塑性调控机制 | 首次发现具有再生和炎症表型的中间态癌细胞群体,并鉴定AP-1和NF-κB作为关键转录调控因子 | 未明确说明样本量具体数值,调控机制验证需进一步实验证实 | 探究结直肠癌转移过程中表型异质性的调控因素和外在信号 | 原发性和转移性结直肠癌患者样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞多组学,空间转录组学 | NA | 单细胞多组学数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞多组学,空间转录组学 | NA | NA |
| 335 | 2025-10-06 |
SpaLinker identifies phenotype-associated spatial tumor microenvironment features by integrating bulk and spatial sequencing data
2025-Jul-09, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100893
PMID:40480216
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研究论文 | 开发SpaLinker集成框架,通过整合空间转录组和bulk RNA-seq数据识别与表型相关的肿瘤微环境空间特征 | 首创表型驱动的计算框架,整合空间和bulk测序数据,在分子、细胞和组织结构三个层面解析空间分辨的肿瘤微环境 | 空间测序样本的临床注释数据稀缺 | 建立空间特征与临床表型的定量关联 | 肿瘤微环境空间特征 | 空间转录组学 | 泛癌种 | 空间转录组测序,bulk RNA-seq | 计算框架 | 空间转录组数据,bulk RNA-seq数据 | 多种肿瘤空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 336 | 2025-10-06 |
Integrin β1 activity controls colony morphology during human pluripotent stem cell state transitions
2025-Jul-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102538
PMID:40541174
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研究论文 | 本研究揭示了整合素β1在调控人类多能干细胞状态转换过程中对集落形态的关键作用 | 首次发现整合素β1活性通过调节细胞骨架和ERK信号通路控制多能干细胞状态转换过程中的集落形态重组 | 研究仅限于体外细胞模型,未涉及体内验证 | 探究整合素β1在调控人类诱导多能干细胞naive样和primed状态转换中的作用机制 | 人类诱导多能干细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞转录组分析, 功能分析 | NA | 基因表达数据, 形态学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 337 | 2025-10-06 |
PROFET Predicts Continuous Gene Expression Dynamics from scRNA-seq Data to Elucidate Heterogeneity of Cancer Treatment Responses
2025-Jul-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.27.662030
PMID:40631077
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研究论文 | 开发PROFET计算框架从稀疏采样的单细胞RNA测序数据重建连续基因表达动态轨迹 | 提出基于Lipschitz正则化梯度流和神经力匹配的粒子流方法,首次实现从静态单细胞数据推断连续非线性基因表达动态 | 方法依赖于时间戳样本的可用性,在极稀疏采样情况下性能可能受限 | 研究癌症治疗响应异质性,特别是激素受体阳性乳腺癌对帕博西尼的治疗反应 | 小鼠和人类单细胞RNA测序数据,包括帕博西尼耐药乳腺癌细胞系和患者来源数据集 | 计算生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 神经网络,梯度流模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 338 | 2025-10-06 |
HMBOX1 reverses autophagy mediated 5-fluorouracil resistance through promoting HACE1-induced ubiquitination and degradation of ATG5 in colorectal cancer
2025-07, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2025.2477443
PMID:40126194
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研究论文 | 本研究揭示了HMBOX1通过促进HACE1介导的ATG5泛素化降解逆转结直肠癌中自噬介导的5-氟尿嘧啶耐药机制 | 首次发现HMBOX1-HACE1-ATG5轴在调控结直肠癌化疗耐药中的关键作用,阐明了转录因子通过调控E3泛素连接酶影响自噬的新机制 | 研究主要基于细胞和临床组织验证,缺乏动物模型在体验证;临床样本量有限 | 探究HMBOX1在结直肠癌5-氟尿嘧啶耐药中的作用机制 | 结直肠癌细胞系和临床组织样本 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 质谱蛋白质组学, 免疫染色, 染色质免疫沉淀 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 临床病理数据 | 结直肠癌患者组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 质谱蛋白质组学 | NA | NA |
| 339 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial transcriptome analysis revealed cellular heterogeneity of glycosyltransferases in cervical cancer, and identified GALNT3-negative epithelial cells as a protective factor: a retrospective cohort study based on public database
2025-07-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002520
PMID:40387729
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组分析揭示宫颈癌中糖基转移酶的细胞异质性,发现GALNT3阴性上皮细胞是保护性因素 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学分析宫颈癌中糖基转移酶的细胞异质性,鉴定出GALNT3阴性上皮细胞作为保护因子 | 基于公共数据库的回顾性队列研究,需要进一步实验验证 | 探索糖基转移酶在宫颈癌中的作用机制 | 宫颈癌患者样本和细胞系 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 基于公共数据库的回顾性队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 340 | 2025-10-06 |
Evaluation of tumor pseudocapsule using computed tomography-based radiomics in pancreatic neuroendocrine tumors to predict prognosis and guide surgical strategy: a cohort study
2025-07-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002511
PMID:40395025
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研究论文 | 本研究通过CT影像组学评估胰腺神经内分泌肿瘤假包膜状态,以预测预后并指导手术策略 | 首次结合CT影像组学和机器学习术前识别假包膜状态,为小胰腺神经内分泌肿瘤的手术方式选择提供依据 | 单中心回顾性研究,样本量有限,需要外部验证 | 评估胰腺神经内分泌肿瘤假包膜状态对预后的影响并指导手术决策 | 胰腺神经内分泌肿瘤患者 | 医学影像分析 | 胰腺神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序,CT影像组学分析 | 机器学习模型 | 医学影像,临床病理数据,单细胞测序数据 | 475例胰腺神经内分泌肿瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |