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当前共找到 797 篇文献,本页显示第 221 - 240 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
221 2025-10-06
Deciphering antigen-specific T cell navigation tactics and cancer immune evasion in co-cultures
2025-Jul-31, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过共培养系统揭示了抗原特异性T细胞的导航策略和癌细胞免疫逃逸机制 首次系统研究了共培养后T细胞运动行为的演变,揭示了T细胞方向持久性增强和与癌细胞形成持久相互作用的新机制 研究基于2.5D共培养系统,可能与体内真实微环境存在差异 阐明T细胞在肿瘤微环境中的导航策略和癌细胞免疫逃逸机制 抗原特异性T细胞和癌细胞 癌症免疫学 癌症 定量细胞轨迹分析,计算建模,RNA测序 计算模型 细胞轨迹数据,基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
222 2025-10-06
Single-cell map of the healthy human immune system across the lifespan reveals unique infant immune signatures
2025-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过单细胞技术绘制健康人类免疫系统在整个生命周期中的变化图谱,揭示婴儿期独特的免疫特征 首次在生命周期尺度上结合单细胞转录组和染色质可及性分析,系统揭示婴儿免疫系统的独特组成和SOX4+ naïve T细胞群的特征 样本量相对有限(95人),仅分析外周血单个核细胞,未涉及组织驻留免疫细胞 阐明人类免疫系统从婴儿期到老年期的连续重塑过程 95名健康个体(2个月至88岁)的外周血单个核细胞,包括婴儿、儿童、成人和老年人 单细胞生物学 NA 单细胞RNA测序, 单细胞核ATAC测序 NA 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 95名健康个体(婴儿27人, 儿童23人, 成人18人, 老年人27人) NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
223 2025-10-06
Maternal opioid use with and without hepatitis C infection disrupts the structure and immune landscape of the maternal-fetal interface
2025-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过多组学方法揭示母体阿片类药物使用障碍对胎盘结构和免疫环境的破坏作用 首次结合空间转录组学和单细胞转录组学系统分析OUD对母胎界面的影响,并考虑HCV感染的协同作用 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 探究母体阿片类药物使用障碍对胎盘组织结构和免疫功能的影响 胎盘组织及母胎界面细胞 空间生物学 成瘾性疾病与肝炎 流式细胞术,组织学,空间转录组学,单细胞转录组学,CellChat分析 NA 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,流式细胞数据,组织学图像 未明确具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
224 2025-10-06
A Novel 14-Gene Panel Associated With Efferocytosis for Predicting Pancreatic Cancer Prognosis Through Bulk and Single-Cell Databases
2025-Jul-30, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据,识别了一个与胞葬作用相关的14基因预后特征面板,用于预测胰腺癌预后 首次构建了基于胞葬作用的14基因预后特征面板,并通过深度学习建立了ER风险评分系统 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限,需要进一步的功能研究确认机制 探索胞葬作用在胰腺导管腺癌进展中的作用,并建立预后预测模型 胰腺导管腺癌(PDAC)患者样本和肿瘤微环境中的细胞 生物信息学 胰腺癌 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 免疫组织化学, 细胞周期分析, 多重免疫荧光染色 LASSO回归, 随机生存森林, 深度学习 基因表达数据, 临床生存数据 来自TCGA和GEO数据库的多个数据集,包含167个ER特征 NA 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 NA NA
225 2025-10-06
Targeting FGFR4 abrogates HNF1A-driven metastasis in pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-Jul-29, Molecular cancer IF:27.7Q1
研究论文 本研究揭示了HNF1A通过上调FGFR4驱动胰腺导管腺癌转移的机制,并证明FGFR4抑制剂可有效阻断该转移过程 首次发现HNF1A通过调控FGFR4促进PDAC转移,并验证了FGFR4抑制剂在阻断转移中的治疗潜力 研究主要基于细胞系和动物模型,临床转化效果需进一步验证 探究HNF1A在胰腺导管腺癌转移中的作用机制并寻找靶向治疗策略 胰腺导管腺癌细胞系、患者来源的PDAC细胞、小鼠移植瘤模型 癌症生物学 胰腺癌 单细胞RNA测序, 组织芯片分析, UMAP空间分析, RNA干扰, 药物抑制实验 NA 基因表达数据, 空间转录组数据, 免疫组化数据 ATCC细胞系、患者来源细胞及小鼠模型 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
226 2025-10-06
Evaluating Integrative Strategies for Incorporating Phenotypic Features in Spatial Transcriptomics
2025-Jul-29, ArXiv
PMID:40766882
研究论文 本研究评估了在空间转录组学中整合表型特征的策略,特别关注在现实实验约束条件下的多模态数据整合方法 使用最小调参的变分自编码器从细胞图像中提取信息丰富的低维表示,并与转录计数进行整合,展示了在受限条件下学习表示优于手工特征的优势 研究基于公开的小鼠回肠MERFISH数据集,数据集规模有限且存在类别不平衡问题,使用基于边界框的分割方法 评估在空间转录组学中整合表型特征和成像模态的最佳策略 小鼠回肠组织细胞 空间转录组学 NA 空间转录组学,成像分析 变分自编码器(VAE),岭回归模型 空间转录组数据,细胞图像数据(核染色,膜染色) 公开可用的MERFISH小鼠回肠数据集 NA 空间转录组学,MERFISH NA NA
227 2025-10-06
Single-cell antigen receptor sequencing in pigs with influenza
2025-Jul-26, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究开发了猪特异性T细胞和B细胞受体富集引物,利用单细胞测序技术分析流感感染猪的免疫受体库 开发了与10x Genomics VDJ测序协议兼容的猪特异性TCR和BCR富集引物,首次在猪模型中实现高通量单细胞免疫受体测序 研究样本量有限,仅针对特定基因型猪和流感感染模型 研究自然杀伤T细胞对肺T细胞和B细胞受体库的影响,追踪流感感染后克隆扩增 CD1D表达和CD1D缺陷猪的肺细胞及肺液T细胞 免疫学 流感 单细胞RNA测序, VDJ测序 NA 单细胞测序数据 CD1D表达和CD1D缺陷猪的肺细胞样本 10x Genomics 单细胞RNA测序, VDJ测序 10x Chromium 10x Genomics VDJ测序协议
228 2025-10-06
Identification and Mechanistic Studies of Key Genes in Thalamic Hemorrhage Pain by Multi-omics
2025-Jul-25, Journal of integrative neuroscience IF:2.5Q3
研究论文 通过多组学方法识别丘脑出血疼痛的关键基因并研究其机制 首次采用整合多组学方法(转录组学、蛋白质组学、代谢组学、核糖体分析和单细胞RNA测序)系统研究丘脑出血疼痛的分子机制 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类患者中验证 阐明丘脑出血疼痛发病机制中的关键基因 丘脑出血疼痛小鼠模型 多组学分析 丘脑出血疼痛 转录组学, 蛋白质组学, 代谢组学, 核糖体分析, 单细胞RNA测序 小鼠疾病模型 多组学数据 THP组和对照组小鼠 NA 单细胞RNA测序, 多组学分析 NA NA
229 2025-10-06
A lipid metabolism-related gene signature predicts prognosis after tamoxifen treatment in ER + breast cancer and reflects tumor microenvironment heterogeneity through single-cell analysis
2025-Jul-31, BMC medical genomics IF:2.1Q3
研究论文 本研究开发了一个基于脂质代谢相关基因的特征模型,用于预测ER阳性乳腺癌患者他莫昔芬治疗后的预后 整合脂质代谢基因表达和机器学习数据构建预后模型,并通过单细胞分析揭示肿瘤微环境异质性 研究样本量相对有限,需要更多独立队列验证 开发ER阳性乳腺癌患者他莫昔芬治疗后预后预测模型 ER阳性乳腺癌患者 机器学习 乳腺癌 单细胞测序,机器学习 预后预测模型 基因表达数据 TCGA-ER+BRCA数据集183例,验证数据集GSE17705(298例)、GSE22219(134例)、GSE42568(70例)、GSE58644(147例) NA 单细胞RNA-seq NA NA
230 2025-10-06
Dual lineage origins contribute to neocortical astrocyte diversity
2025-Jul-30, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序和谱系追踪技术揭示了小鼠新皮质中星形胶质细胞的五种亚型及其双重谱系起源机制 首次发现新皮质星形胶质细胞存在两种不同的发育谱系,并鉴定出Olig2作为关键调控因子控制特定谱系的分化 研究仅聚焦于小鼠新皮质区域,尚未验证其他脑区或物种的普适性 探究星形胶质细胞多样性形成的发育机制 小鼠新皮质中的星形胶质细胞 神经科学 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 谱系追踪技术 NA 基因表达数据, 空间分布数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
231 2025-10-06
Time-coexpress: temporal trajectory modeling of dynamic gene co-expression patterns using single-cell transcriptomics data
2025-Jul-29, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 提出基于copula的TIME-CoExpress框架,用于建模单细胞转录组数据中基因共表达随细胞时间轨迹的非线性动态变化 首次将copula模型与数据驱动平滑函数结合,能够捕捉基因共表达的非线性动态变化,同时建模零膨胀率和平均表达水平的动态变化 方法性能仅在模拟分析和单个scRNAseq数据集上验证,需要更多真实数据验证其普适性 开发能够识别单细胞转录组数据中基因共表达动态变化的计算方法 基因共表达模式、零膨胀率、平均表达水平沿细胞时间轨迹的动态变化 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 copula模型、数据驱动平滑函数 单细胞转录组数据 垂体胚胎发育过程中的scRNAseq数据集,比较[公式:见正文]和野生型小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
232 2025-10-06
"Small extracellular vesicles: messengers at the service of breast cancer agenda in the primary and distant microenvironments"
2025-Jul-21, Journal of experimental & clinical cancer research : CR IF:11.4Q1
综述 本文综述了小细胞外囊泡在乳腺癌原发和远处微环境中的关键作用及其临床转化潜力 系统整合小细胞外囊泡在乳腺癌微环境通讯中的多功能角色,并探讨人工智能与多组学技术结合的解决方案 存在小细胞外囊泡异质性问题和追踪技术限制,临床转化仍面临靶向效率、体内稳定性等挑战 阐明小细胞外囊泡在乳腺癌进展和治疗抵抗中的分子机制及临床应用前景 乳腺癌相关的小细胞外囊泡及其携带的生物分子(蛋白质、脂质、非编码RNA等) 肿瘤生物学 乳腺癌 超速离心、免疫亲和、微流控系统、单细胞转录组学、多组学分析 NA 分子生物学数据、临床数据 NA NA 单细胞转录组学、多组学分析 NA NA
233 2025-10-06
Image-based inference of tumor cell trajectories enables large-scale cancer progression analysis
2025-Jul-18, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 开发基于人工智能的模型,利用H&E染色全切片图像推断肿瘤细胞轨迹并进行大规模癌症进展分析 首次利用常规病理切片中的细胞形态特征和组织学空间组织来推断肿瘤细胞分化状态和动态轨迹 方法依赖于图像质量,且在三组独立肺腺癌队列中验证但需进一步扩大验证范围 开发成本效益高的方法来分析肿瘤进展动态和肿瘤微环境细胞群体多样性 肺腺癌患者的H&E染色全切片图像和肿瘤细胞 数字病理 肺癌 人工智能模型,空间转录组学分析,批量转录组学分析 AI模型 图像 三个独立肺腺癌队列 NA 空间转录组学,批量转录组学 NA NA
234 2025-10-06
PoweREST: Statistical power estimation for spatial transcriptomics experiments to detect differentially expressed genes between two conditions
2025-Jul, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 开发了用于空间转录组学实验统计功效估计的工具PoweREST,支持10X Genomics Visium数据的差异表达基因检测功效计算 首个专门针对空间转录组学实验的统计功效估计工具,支持实验前和初步数据收集后的功效分析 目前仅支持10X Genomics Visium平台数据,未涵盖其他空间转录组学技术 解决空间转录组学实验中差异表达基因检测的统计功效计算问题 空间转录组学数据中的差异表达基因 空间转录组学 NA 空间转录组学 统计功效分析模型 空间转录组学数据 NA 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10X Genomics Visium空间转录组学平台
235 2025-10-06
Traditional medicine Kuanxiong Aerosol alleviates atherosclerotic plaque inflammation by mitigating CX3CR1+ macrophage apoptosis via the cGAS-STING pathway
2025-Jul-30, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 本研究探讨宽胸气雾剂通过cGAS-STING通路减轻CX3CR1+巨噬细胞凋亡,从而缓解动脉粥样硬化斑块炎症的作用机制 首次揭示宽胸气雾剂对巨噬细胞亚群的调控作用及其抗凋亡功能 NA 探索宽胸气雾剂治疗动脉粥样硬化的潜力及其作用机制 ApoE-/-小鼠模型 生物医学 心血管疾病 单细胞RNA测序,超高效液相色谱-高分辨质谱,生物信息学分析,分子对接 NA 基因表达数据,质谱数据,组织学图像 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
236 2025-10-06
Analyses of Nogo-Family Genes in Mouse and Human Microglia Omics Datasets Identify LINGO1 as a Candidate Drug Target in Alzheimer's Disease
2025-Jul-30, Current neuropharmacology IF:4.8Q1
研究论文 通过分析小鼠和人类小胶质细胞组学数据,探索Nogo家族基因表达模式并鉴定LINGO1作为阿尔茨海默病的潜在药物靶点 首次发现LINGO1在人类AD小胶质细胞中高度富集,并系统分析了Nogo信号系统在小胶质细胞中的表达特征 研究主要基于公开数据集,需要进一步实验验证功能机制 探索Nogo家族基因在小胶质细胞中的表达模式及其在阿尔茨海默病中的作用 小鼠和人类小胶质细胞 生物信息学 阿尔茨海默病 单细胞测序,RNA-seq,RiboTag翻译谱分析 NA 基因表达数据,单细胞测序数据 整合21个人类脑细胞单细胞测序数据集 NA 单细胞RNA-seq CZ CellxGene Discover 用于整合分析21个单细胞测序数据集的工具平台
237 2025-10-06
Single-Cell Transcriptomics: Technical Advances, Applications and Challenges in Cancer Drug Discovery
2025-Jul-30, Current cancer drug targets IF:2.3Q3
综述 本文全面概述单细胞RNA测序技术在癌症药物发现中的技术进展、应用与挑战 重点强调单细胞转录组学在解析肿瘤异质性和识别药物靶点方面的创新应用 讨论了单细胞RNA测序技术当前面临的技术挑战 促进读者对单细胞测序的理解,启发肿瘤药物开发新思路 癌症药物发现过程 单细胞组学 癌症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
238 2025-10-06
Renin Cells Drive Kidney Neurovascular Development and Arterial Remodeling when Renin Activity is Deficient
2025-Jul-11, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过新型超亮肾素细胞特异性报告小鼠模型,揭示了肾素细胞在肾脏神经血管发育和动脉重塑中的关键作用 开发了超亮肾素细胞特异性tdTomato报告小鼠模型,首次实现了对稀有肾素细胞(仅占肾脏细胞0.01%)与神经纤维相互作用的3D可视化 研究主要基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 探索肾素细胞在肾脏神经血管发育和动脉重塑中的功能机制 肾素细胞、肾脏神经纤维、动脉血管 发育生物学 肾脏疾病 单细胞RNA测序, 高分辨率3D成像 转基因小鼠模型 基因表达数据, 影像数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
239 2025-10-06
Metabolic Analysis of Tumor Cells Within Ameloblastoma at the Single-Cell Level
2025-Jul, Oral diseases IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术分析成釉细胞瘤肿瘤细胞的代谢异质性 首次在单细胞水平揭示成釉细胞瘤肿瘤细胞的代谢异质性,发现线粒体编程和糖酵解的变异是肿瘤细胞代谢特征的主要贡献者 仅分析了3例患者样本,样本量较小;研究主要基于计算分析框架 表征成釉细胞瘤在单细胞分辨率下的代谢异质性 成釉细胞瘤肿瘤细胞 单细胞组学 成釉细胞瘤 单细胞RNA测序 生物信息学分析 单细胞转录组数据 3例AB供体的17,284个细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
240 2025-10-06
CCL19+ Fibroblasts Promote Tertiary Lymphoid Structure in Oral Lichen Planus: A Retrospective Study
2025-Jul, Oral diseases IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和多重免疫荧光染色揭示了口腔扁平苔藓中CCL19+成纤维细胞通过促进三级淋巴结构形成加剧疾病严重性的机制 首次在口腔扁平苔藓中发现CCL19+成纤维细胞在三级淋巴结构形成中的关键作用,并阐明其通过淋巴毒素激活促进T细胞趋化的机制 回顾性研究设计,样本量有限 阐明口腔扁平苔藓中适应性免疫的启动机制,特别关注诱导性三级淋巴结构和基质-免疫微环境的作用 口腔扁平苔藓患者 数字病理学 口腔扁平苔藓 单细胞RNA测序,多重免疫荧光染色 NA 基因表达数据,图像数据 口腔扁平苔藓患者回顾性临床数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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