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当前共找到 806 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-10-06 |
Comprehensive analysis of cholesterol metabolism-related genes in prostate cancer: integrated analysis of single-cell and bulk RNA sequencing
2025-Jul-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03294-5
PMID:40736630
|
研究论文 | 本研究构建并验证了基于胆固醇代谢基因的前列腺癌预后特征模型 | 整合单细胞和bulk RNA测序数据构建胆固醇代谢基因预后特征，并探索其与生物学通路、免疫景观和药物敏感性的关联 | 研究基于公共数据库的回顾性数据，需要进一步实验验证 | 构建胆固醇代谢基因相关的预后特征以预测前列腺癌患者预后 | 前列腺腺癌患者 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | TCGA前列腺癌数据集和三个外部验证队列 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 202 | 2025-10-06 |
Comprehensive insight on immune landscape in intracerebral hemorrhage patients with single-cell RNA sequencing: from blood to hematoma
2025-Jul-30, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03518-z
PMID:40739271
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术全面解析脑出血患者血肿和血液样本中的免疫细胞景观 | 首次从脑出血患者血肿样本中获取免疫细胞进行单细胞转录组分析，揭示了Toll样受体4在免疫炎症和代谢中的作用 | 样本量较小（4名患者和3名健康对照），需要更大规模研究验证发现 | 研究脑出血患者免疫细胞的转录特征和动态炎症过程 | 脑出血患者的血肿和血液样本，以及健康志愿者的血液样本 | 单细胞组学 | 脑出血 | 单细胞RNA测序 | 细胞轨迹推断，细胞间通讯分析 | 单细胞转录组数据 | 4名脑出血患者和3名健康志愿者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 203 | 2025-10-06 |
CanCellCap: robust cancer cell capture across tissue types on single-cell RNA-seq data by multi-domain learning
2025-Jul-30, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02337-1
PMID:40739511
|
研究论文 | 提出一种基于多领域学习的CanCellCap框架，用于在单细胞RNA测序数据中跨组织类型识别癌细胞 | 整合领域对抗学习和专家混合模型，能够同时提取不同组织中癌细胞和正常细胞的通用和特异性基因表达模式，并通过掩码重建策略适应不同测序平台 | NA | 开发一个能够在不同组织、癌症类型和测序平台上稳健识别癌细胞的通用框架 | 单细胞RNA测序数据中的癌细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 多领域学习框架，包含领域对抗学习和专家混合模型 | 单细胞RNA测序数据，空间转录组数据 | 在13种组织类型、23种癌症类型和7种测序平台的基准数据集上进行评估 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 204 | 2025-10-06 |
Nitidine chloride may mediate its antitumor effects by targeting kinesin family member 20A in colorectal cancer cells
2025-Jul-24, World journal of clinical oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.5306/wjco.v16.i7.108666
PMID:40741189
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研究论文 | 本研究探讨氯化硝基苯胺通过靶向KIF20A抑制结直肠癌细胞的抗肿瘤机制 | 首次揭示氯化硝基苯胺与KIF20A的高亲和力结合及其在结直肠癌治疗中的潜在作用机制 | 需要进一步通过KIF20A敲除实验验证NC的结合特异性和机制作用 | 研究KIF20A在结直肠癌细胞中的表达特征及其作为NC潜在靶基因的作用 | 结直肠癌细胞系（HCT116等）和416例临床组织样本（208例癌组织+208例对照组织） | 癌症研究 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,mRNA表达谱分析,免疫组织化学染色,CRISPR基因编辑,分子对接,RNA测序 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据,临床样本数据 | 416例临床组织样本（208对癌与癌旁组织）和多种结直肠癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,RNA测序 | NA | NA |
| 205 | 2025-10-06 |
Integration of Untargeted Metabolomics, Network Pharmacology, Single-Cell RNA Sequencing, and Molecular Dynamics Simulation Reveals GOT1, CYP1A2, and CA2 as Potential Targets of Huang Qin Decoction Preventing Colorectal Cancer Liver Metastasis
2025-Jul-17, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph18071052
PMID:40732339
|
研究论文 | 本研究通过整合非靶向代谢组学、网络药理学、单细胞RNA测序和分子动力学模拟，揭示了黄芩汤预防结直肠癌肝转移的潜在作用靶点GOT1、CYP1A2和CA2 | 首次整合多种组学技术和计算方法系统阐明黄芩汤治疗结直肠癌肝转移的多靶点作用机制 | 研究主要基于计算预测和体外实验，需要进一步的体内实验验证 | 探究黄芩汤预防结直肠癌肝转移的活性成分、作用靶点和分子机制 | 结直肠癌肝转移小鼠模型和结直肠癌细胞 | 计算生物学 | 结直肠癌 | 非靶向代谢组学, 网络药理学, 单细胞RNA测序, 分子动力学模拟, 原子力显微镜 | 分子对接, 分子动力学模拟 | 代谢组数据, 单细胞转录组数据, 分子结构数据 | 小鼠模型和细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 206 | 2025-10-06 |
A Novel Hypoxia-Immune Signature for Gastric Cancer Prognosis and Immunotherapy: Insights from Bulk and Single-Cell RNA-Seq
2025-Jul-16, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47070552
PMID:40729021
|
研究论文 | 开发了一个基于缺氧和免疫相关基因的胃癌预后特征，并探索其与免疫治疗反应的关系 | 首次结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据构建胃癌缺氧-免疫特征，识别了5个关键基因并在单细胞水平验证了其表达模式 | 研究基于公共数据库的回顾性数据，需要前瞻性临床研究进一步验证 | 开发胃癌预后评估和免疫治疗指导的基因特征 | 胃癌患者 | 生物信息学 | 胃癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Cox回归分析 | 转录组数据 | TCGA-STAD队列和独立验证队列GSE84437 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 207 | 2025-10-06 |
DGAT: A Dual-Graph Attention Network for Inferring Spatial Protein Landscapes from Transcriptomics
2025-Jul-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.05.662121
PMID:40672156
|
研究论文 | 提出一种双图注意力网络DGAT，用于从空间转录组数据推断空间蛋白质表达景观 | 首次构建整合转录组、蛋白质组和空间信息的异质图，通过图注意力网络学习RNA-蛋白质关系 | 依赖空间CITE-seq数据集进行训练，在缺乏此类数据的组织中应用受限 | 从仅含转录组的空间数据推断蛋白质表达水平 | 扁桃体、乳腺癌、胶质母细胞瘤和恶性间皮瘤组织样本 | 计算生物学 | 多种癌症 | 深度学习，图注意力网络 | DGAT（双图注意力网络） | 空间转录组数据，蛋白质表达数据 | 公共和内部数据集，包含多种组织类型 | NA | 空间转录组，CITE-seq | NA | NA |
| 208 | 2025-10-06 |
A New Tool to Decrease Interobserver Variability in Biomarker Annotation in Solid Tumor Tissue for Spatial Transcriptomic Analysis
2025-Jul-09, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47070531
PMID:40728999
|
研究论文 | 开发了一种基于MATLAB的新工具，用于减少空间转录组分析中生物标志物注释的观察者间变异性 | 开发了首个能够对多细胞斑点进行自动图像分析的工具，通过研究者定义的参数标准减少人工注释的变异性 | 研究仅针对γH2AX标志物在胶质母细胞瘤组织中的应用，未验证其他生物标志物或肿瘤类型 | 解决空间转录组与免疫荧光数据整合中的观察者间变异性问题 | 辐照处理的胶质母细胞瘤组织 | 空间转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 免疫荧光, 空间转录组学, 图像分析 | 基于MATLAB的图像分析工具 | 图像, 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 空间转录组学, 免疫荧光 | NA | NA |
| 209 | 2025-10-06 |
Spatial Transcriptome Analysis Reveals Diverse Human Burn Wound Microenvironment
2025 Jul-Aug, Wound repair and regeneration : official publication of the Wound Healing Society [and] the European Tissue Repair Society
IF:3.8Q1
DOI:10.1111/wrr.70061
PMID:40579885
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组技术分析人类烧伤创面微环境，揭示不同烧伤深度区域的基因表达差异 | 首次将空间转录组技术应用于烧伤组织分析，能够在保留空间位置信息的同时识别不同烧伤深度区域的独特基因表达模式 | 提供了该技术在烧伤组织应用中存在的局限性，为未来研究提供指导 | 探索人类烧伤创面微环境的分子特征和空间异质性 | 人类烧伤组织样本 | 空间转录组学 | 烧伤 | 空间转录组学，RNA测序 | NA | 空间基因表达数据，组织图像 | NA | NA | 空间转录组学，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 210 | 2025-10-06 |
Cross-tissue gene expression interactions from bulk, single cell and spatial transcriptomics with crossWGCNA
2025-Jul-01, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11747-y
PMID:40597567
|
研究论文 | 提出了一种基于共表达的跨组织基因表达相互作用分析方法crossWGCNA | 开发了无偏识别高相互作用基因的方法，可应用于多种转录组数据，克服现有方法基于强基线假设的局限性 | NA | 研究生物系统中细胞、组织或器官间的分子相互作用 | 乳腺癌中的基质-上皮细胞通讯 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 共表达分析 | WGCNA | bulk转录组、单细胞转录组、空间转录组 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 211 | 2025-10-06 |
cytoKernel: robust kernel embeddings for assessing differential expression of single-cell data
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf399
PMID:40658464
|
研究论文 | 提出一种基于核嵌入的稳健方法cytoKernel，用于评估单细胞数据的差异表达 | 使用基于核的评分检验，利用单细胞数据的完整概率分布模式检测差异表达，能够识别传统方法忽略的多模态特征变化 | NA | 开发稳健的差异表达分析方法，检测单细胞数据中更细微的表达变化 | 单细胞RNA测序数据和高维流式或质谱流式细胞术数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | 基于核的评分检验 | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 212 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of gene regulatory networks in the mammary glands of P4HA1-knockout mice
2025-Jul, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011505
PMID:40694594
|
研究论文 | 通过单细胞分析研究P4HA1基因敲除小鼠乳腺中基底上皮细胞的基因调控网络 | 首次在P4HA1敲除小鼠乳腺中应用单细胞网络推断方法结合SCENIC流程构建基因调控网络 | 单细胞数据固有的技术挑战 | 研究P4HA1在小鼠乳腺中的作用及其与乳腺癌的关联 | 对照组和P4HA1敲除小鼠的乳腺基底上皮细胞 | 单细胞生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | SCENIC | 单细胞转录组数据 | 两组小鼠（对照组5Ht和P4HA1敲除组6Ho） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 213 | 2025-10-06 |
A primer on single-cell RNA-seq analysis using dendritic cells as a case study
2025-Jul, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.15009
PMID:39245787
|
综述 | 本文以树突状细胞为例，为免疫学家提供单细胞RNA测序分析的全面入门指南 | 通过树突状细胞这一典型免疫细胞案例，系统整合单细胞转录组学分析工具与方法，填补了该领域实践指导的空白 | 作为入门指南未涉及高级分析方法，且主要聚焦于树突状细胞这一特定细胞类型 | 为免疫学家提供单细胞转录组学分析的实践指导，促进该技术在免疫学研究中的应用 | 树突状细胞及其亚群 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 214 | 2025-10-06 |
Comprehensive Insights into APOBEC Mutations in Thyroid Cancer: Prognostic and Therapeutic Discoveries
2025-Jul-26, Biological procedures online
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s12575-025-00288-z
PMID:40713522
|
研究论文 | 本研究系统分析了APOBEC家族突变在甲状腺癌中的分布特征、临床意义及治疗潜力 | 首次在多癌种中系统表征APOBEC突变特征，建立了基于机器学习的预后预测模型，并通过体内外实验验证APOBEC2抑制的治疗价值 | 研究主要聚焦于甲状腺癌，其他癌种的分析相对有限 | 探究APOBEC家族成员在癌症中的生物学特征和临床意义 | 甲状腺癌患者样本和动物模型 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 全外显子测序,靶向二代测序,RNA测序,单细胞RNA测序,Western blot,药物敏感性分析 | 机器学习模型 | 基因组数据,转录组数据,蛋白质数据 | 多个甲状腺癌队列 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 215 | 2025-10-06 |
Extracellular vesicles from ovarian cancer cells induce senescent lipid-laden macrophages to facilitate omental metastasis
2025-Jul-26, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03612-7
PMID:40713812
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研究论文 | 本研究揭示了卵巢癌细胞通过细胞外囊泡诱导巨噬细胞脂质积累和衰老，从而促进大网膜转移的机制 | 首次发现卵巢癌细胞来源的细胞外囊泡通过CD36介导的脂质摄取驱动巨噬细胞衰老，形成促转移微环境 | 机制研究主要基于体外实验和动物模型，需要更多临床验证 | 探索卵巢癌细胞外囊泡如何调控巨噬细胞和脂肪细胞促进大网膜转移 | 卵巢癌细胞、巨噬细胞、脂肪细胞、大网膜转移灶 | 癌症生物学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组学、蛋白质组学、脂质组学、免疫组织化学、共培养系统 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、脂质组数据、图像数据 | 临床标本和细胞系模型 | NA | 单细胞RNA-seq、蛋白质组学、脂质组学 | NA | NA |
| 216 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics of ventral forebrain progenitors identifies Evf2 enhancer lncRNA-enhancer gene guidance through direct RNA binding and RNP recruitment domains
2025-Jul-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62205-y
PMID:40715144
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示Evf2增强子lncRNA在小鼠胚胎大脑发育中通过直接RNA结合和RNP招募结构域调控基因表达的机制 | 发现Evf2将chr6划分为短距离激活基因和长距离抑制基因区域，并识别出预测成年表型的癫痫调控基因 | 研究仅限于小鼠胚胎大脑发育阶段，未验证其他发育阶段或物种 | 探究Evf2增强子lncRNA在胚胎大脑发育中的基因调控机制 | 小鼠胚胎腹侧前脑祖细胞 | 单细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 217 | 2025-10-06 |
In vivo efficacy of NRL knockdown with cell-penetrating siRNA in retinal degeneration
2025-Jul-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-07299-6
PMID:40715177
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研究论文 | 本研究评估了细胞穿透性不对称小干扰RNA靶向NRL在视网膜退行性疾病中的治疗效果 | 首次使用细胞穿透性不对称小干扰RNA靶向NRL诱导杆状细胞向锥状细胞转分化，为视网膜退行性疾病提供新型治疗策略 | 在视网膜色素变性小鼠模型中功能改善相对有限，可能反映疾病晚期阶段 | 研究NRL基因敲低在视网膜退行性疾病中的治疗潜力 | C57BL/6J野生型小鼠、新生血管性年龄相关性黄斑变性小鼠模型和视网膜色素变性小鼠模型 | 基因治疗 | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序，电生理评估 | NA | 基因表达数据，电生理数据 | 多种小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 218 | 2025-10-06 |
Targeting tumor-associated CCR2+ macrophages to inhibit pancreatic cancer recurrence following irreversible electroporation
2025-Jul-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adw2937
PMID:40700478
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胰腺癌不完全不可逆电穿孔后的肿瘤免疫微环境，开发了靶向CCR2+巨噬细胞的联合疗法抑制肿瘤复发 | 首次揭示不完全不可逆电穿孔诱导CCR2+肿瘤相关巨噬细胞介导的免疫抑制微环境，并开发了巨噬细胞来源的蛋白脂质囊泡联合给药系统 | 研究基于临床前胰腺癌模型，尚未进行人体临床试验验证 | 探索胰腺癌不完全不可逆电穿孔后肿瘤复发的免疫机制并开发新型治疗策略 | 胰腺导管腺癌(PDAC)小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 219 | 2025-10-06 |
Metabolic stress and early cell death in photoreceptor precursor cells following retinal transplantation
2025-Jul-25, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04509-w
PMID:40708039
|
研究论文 | 本研究探讨了视网膜移植后光感受器前体细胞早期死亡机制，发现代谢应激是主要驱动因素 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出代谢应激是移植后光感受器前体细胞早期死亡的关键驱动因素 | 研究使用异种移植模型，可能与人类同种移植存在差异；样本量有限 | 阐明光感受器前体细胞移植后早期死亡的机制并评估宿主视网膜反应 | 人胚胎干细胞来源的光感受器前体细胞和犬视网膜 | 数字病理学 | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学分析，多模态视网膜成像 | NA | 基因表达数据，图像数据 | 正常和退化的犬视网膜模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 220 | 2025-10-06 |
Neurons derived from NeuroD1-expressing astrocytes transition through transit-amplifying intermediates but lack functional maturity
2025-Jul-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adw9296
PMID:40712017
|
研究论文 | 本研究通过谱系追踪和单细胞转录组学揭示了NeuroD1驱动星形胶质细胞向神经元转化的时空限制和功能不成熟性 | 发现NeuroD1诱导的星形胶质细胞向神经元转化需经过过渡扩增中间阶段，且生成的神经元样细胞缺乏成熟神经电生理特性 | NeuroD1转化的神经元缺乏功能性成熟，限制了其在神经回路中的功能整合 | 探究NeuroD1介导的胶质细胞向神经元转化的机制和功能特性 | 转基因小鼠的星形胶质细胞和脊髓及脑部损伤核心区域的细胞 | 神经科学 | 中枢神经系统损伤 | 单细胞转录组学、谱系追踪、转基因技术 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据、电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |