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当前共找到 801 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-10-06 |
Single-cell antigen receptor sequencing in pigs with influenza
2025-Jul-26, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08507-9
PMID:40715353
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研究论文 | 本研究开发了猪特异性T细胞和B细胞受体富集引物，利用单细胞测序技术分析流感感染猪的免疫受体库 | 开发了与10x Genomics VDJ测序协议兼容的猪特异性TCR和BCR富集引物，首次在猪模型中实现高通量单细胞免疫受体测序 | 研究样本量有限，仅针对特定基因型猪和流感感染模型 | 研究自然杀伤T细胞对肺T细胞和B细胞受体库的影响，追踪流感感染后克隆扩增 | CD1D表达和CD1D缺陷猪的肺细胞及肺液T细胞 | 免疫学 | 流感 | 单细胞RNA测序, VDJ测序 | NA | 单细胞测序数据 | CD1D表达和CD1D缺陷猪的肺细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, VDJ测序 | 10x Chromium | 10x Genomics VDJ测序协议 |
| 202 | 2025-10-06 |
Identification and Mechanistic Studies of Key Genes in Thalamic Hemorrhage Pain by Multi-omics
2025-Jul-25, Journal of integrative neuroscience
IF:2.5Q3
DOI:10.31083/JIN38130
PMID:40767016
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研究论文 | 通过多组学方法识别丘脑出血疼痛的关键基因并研究其机制 | 首次采用整合多组学方法（转录组学、蛋白质组学、代谢组学、核糖体分析和单细胞RNA测序）系统研究丘脑出血疼痛的分子机制 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类患者中验证 | 阐明丘脑出血疼痛发病机制中的关键基因 | 丘脑出血疼痛小鼠模型 | 多组学分析 | 丘脑出血疼痛 | 转录组学, 蛋白质组学, 代谢组学, 核糖体分析, 单细胞RNA测序 | 小鼠疾病模型 | 多组学数据 | THP组和对照组小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | NA | NA |
| 203 | 2025-10-06 |
A lipid metabolism-related gene signature predicts prognosis after tamoxifen treatment in ER + breast cancer and reflects tumor microenvironment heterogeneity through single-cell analysis
2025-Jul-31, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-025-02194-5
PMID:40745642
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研究论文 | 本研究开发了一个基于脂质代谢相关基因的特征模型，用于预测ER阳性乳腺癌患者他莫昔芬治疗后的预后 | 整合脂质代谢基因表达和机器学习数据构建预后模型，并通过单细胞分析揭示肿瘤微环境异质性 | 研究样本量相对有限，需要更多独立队列验证 | 开发ER阳性乳腺癌患者他莫昔芬治疗后预后预测模型 | ER阳性乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞测序，机器学习 | 预后预测模型 | 基因表达数据 | TCGA-ER+BRCA数据集183例，验证数据集GSE17705(298例)、GSE22219(134例)、GSE42568(70例)、GSE58644(147例) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 204 | 2025-10-06 |
Dual lineage origins contribute to neocortical astrocyte diversity
2025-Jul-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61829-4
PMID:40738880
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和谱系追踪技术揭示了小鼠新皮质中星形胶质细胞的五种亚型及其双重谱系起源机制 | 首次发现新皮质星形胶质细胞存在两种不同的发育谱系，并鉴定出Olig2作为关键调控因子控制特定谱系的分化 | 研究仅聚焦于小鼠新皮质区域，尚未验证其他脑区或物种的普适性 | 探究星形胶质细胞多样性形成的发育机制 | 小鼠新皮质中的星形胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 谱系追踪技术 | NA | 基因表达数据, 空间分布数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 205 | 2025-10-06 |
Time-coexpress: temporal trajectory modeling of dynamic gene co-expression patterns using single-cell transcriptomics data
2025-Jul-29, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06218-w
PMID:40731381
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研究论文 | 提出基于copula的TIME-CoExpress框架，用于建模单细胞转录组数据中基因共表达随细胞时间轨迹的非线性动态变化 | 首次将copula模型与数据驱动平滑函数结合，能够捕捉基因共表达的非线性动态变化，同时建模零膨胀率和平均表达水平的动态变化 | 方法性能仅在模拟分析和单个scRNAseq数据集上验证，需要更多真实数据验证其普适性 | 开发能够识别单细胞转录组数据中基因共表达动态变化的计算方法 | 基因共表达模式、零膨胀率、平均表达水平沿细胞时间轨迹的动态变化 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | copula模型、数据驱动平滑函数 | 单细胞转录组数据 | 垂体胚胎发育过程中的scRNAseq数据集，比较[公式：见正文]和野生型小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 206 | 2025-10-06 |
"Small extracellular vesicles: messengers at the service of breast cancer agenda in the primary and distant microenvironments"
2025-Jul-21, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03471-y
PMID:40691627
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综述 | 本文综述了小细胞外囊泡在乳腺癌原发和远处微环境中的关键作用及其临床转化潜力 | 系统整合小细胞外囊泡在乳腺癌微环境通讯中的多功能角色，并探讨人工智能与多组学技术结合的解决方案 | 存在小细胞外囊泡异质性问题和追踪技术限制，临床转化仍面临靶向效率、体内稳定性等挑战 | 阐明小细胞外囊泡在乳腺癌进展和治疗抵抗中的分子机制及临床应用前景 | 乳腺癌相关的小细胞外囊泡及其携带的生物分子（蛋白质、脂质、非编码RNA等） | 肿瘤生物学 | 乳腺癌 | 超速离心、免疫亲和、微流控系统、单细胞转录组学、多组学分析 | NA | 分子生物学数据、临床数据 | NA | NA | 单细胞转录组学、多组学分析 | NA | NA |
| 207 | 2025-10-06 |
Image-based inference of tumor cell trajectories enables large-scale cancer progression analysis
2025-Jul-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv9466
PMID:40680117
|
研究论文 | 开发基于人工智能的模型，利用H&E染色全切片图像推断肿瘤细胞轨迹并进行大规模癌症进展分析 | 首次利用常规病理切片中的细胞形态特征和组织学空间组织来推断肿瘤细胞分化状态和动态轨迹 | 方法依赖于图像质量，且在三组独立肺腺癌队列中验证但需进一步扩大验证范围 | 开发成本效益高的方法来分析肿瘤进展动态和肿瘤微环境细胞群体多样性 | 肺腺癌患者的H&E染色全切片图像和肿瘤细胞 | 数字病理 | 肺癌 | 人工智能模型，空间转录组学分析，批量转录组学分析 | AI模型 | 图像 | 三个独立肺腺癌队列 | NA | 空间转录组学，批量转录组学 | NA | NA |
| 208 | 2025-10-06 |
PoweREST: Statistical power estimation for spatial transcriptomics experiments to detect differentially expressed genes between two conditions
2025-Jul, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013293
PMID:40729405
|
研究论文 | 开发了用于空间转录组学实验统计功效估计的工具PoweREST，支持10X Genomics Visium数据的差异表达基因检测功效计算 | 首个专门针对空间转录组学实验的统计功效估计工具，支持实验前和初步数据收集后的功效分析 | 目前仅支持10X Genomics Visium平台数据，未涵盖其他空间转录组学技术 | 解决空间转录组学实验中差异表达基因检测的统计功效计算问题 | 空间转录组学数据中的差异表达基因 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 统计功效分析模型 | 空间转录组学数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10X Genomics Visium空间转录组学平台 |
| 209 | 2025-10-06 |
Traditional medicine Kuanxiong Aerosol alleviates atherosclerotic plaque inflammation by mitigating CX3CR1+ macrophage apoptosis via the cGAS-STING pathway
2025-Jul-30, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157120
PMID:40753933
|
研究论文 | 本研究探讨宽胸气雾剂通过cGAS-STING通路减轻CX3CR1+巨噬细胞凋亡，从而缓解动脉粥样硬化斑块炎症的作用机制 | 首次揭示宽胸气雾剂对巨噬细胞亚群的调控作用及其抗凋亡功能 | NA | 探索宽胸气雾剂治疗动脉粥样硬化的潜力及其作用机制 | ApoE-/-小鼠模型 | 生物医学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,超高效液相色谱-高分辨质谱,生物信息学分析,分子对接 | NA | 基因表达数据,质谱数据,组织学图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 210 | 2025-10-06 |
Analyses of Nogo-Family Genes in Mouse and Human Microglia Omics Datasets Identify LINGO1 as a Candidate Drug Target in Alzheimer's Disease
2025-Jul-30, Current neuropharmacology
IF:4.8Q1
|
研究论文 | 通过分析小鼠和人类小胶质细胞组学数据，探索Nogo家族基因表达模式并鉴定LINGO1作为阿尔茨海默病的潜在药物靶点 | 首次发现LINGO1在人类AD小胶质细胞中高度富集，并系统分析了Nogo信号系统在小胶质细胞中的表达特征 | 研究主要基于公开数据集，需要进一步实验验证功能机制 | 探索Nogo家族基因在小胶质细胞中的表达模式及其在阿尔茨海默病中的作用 | 小鼠和人类小胶质细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序，RNA-seq，RiboTag翻译谱分析 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 整合21个人类脑细胞单细胞测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | CZ CellxGene Discover | 用于整合分析21个单细胞测序数据集的工具平台 |
| 211 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomics: Technical Advances, Applications and Challenges in Cancer Drug Discovery
2025-Jul-30, Current cancer drug targets
IF:2.3Q3
|
综述 | 本文全面概述单细胞RNA测序技术在癌症药物发现中的技术进展、应用与挑战 | 重点强调单细胞转录组学在解析肿瘤异质性和识别药物靶点方面的创新应用 | 讨论了单细胞RNA测序技术当前面临的技术挑战 | 促进读者对单细胞测序的理解，启发肿瘤药物开发新思路 | 癌症药物发现过程 | 单细胞组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 212 | 2025-10-06 |
Renin Cells Drive Kidney Neurovascular Development and Arterial Remodeling when Renin Activity is Deficient
2025-Jul-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.08.663706
PMID:40672316
|
研究论文 | 本研究通过新型超亮肾素细胞特异性报告小鼠模型，揭示了肾素细胞在肾脏神经血管发育和动脉重塑中的关键作用 | 开发了超亮肾素细胞特异性tdTomato报告小鼠模型，首次实现了对稀有肾素细胞（仅占肾脏细胞0.01%）与神经纤维相互作用的3D可视化 | 研究主要基于小鼠模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 探索肾素细胞在肾脏神经血管发育和动脉重塑中的功能机制 | 肾素细胞、肾脏神经纤维、动脉血管 | 发育生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 高分辨率3D成像 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据, 影像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 213 | 2025-10-06 |
Metabolic Analysis of Tumor Cells Within Ameloblastoma at the Single-Cell Level
2025-Jul, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.15239
PMID:39737843
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析成釉细胞瘤肿瘤细胞的代谢异质性 | 首次在单细胞水平揭示成釉细胞瘤肿瘤细胞的代谢异质性，发现线粒体编程和糖酵解的变异是肿瘤细胞代谢特征的主要贡献者 | 仅分析了3例患者样本，样本量较小；研究主要基于计算分析框架 | 表征成釉细胞瘤在单细胞分辨率下的代谢异质性 | 成釉细胞瘤肿瘤细胞 | 单细胞组学 | 成釉细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 生物信息学分析 | 单细胞转录组数据 | 3例AB供体的17,284个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 214 | 2025-10-06 |
CCL19+ Fibroblasts Promote Tertiary Lymphoid Structure in Oral Lichen Planus: A Retrospective Study
2025-Jul, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.15266
PMID:39962879
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重免疫荧光染色揭示了口腔扁平苔藓中CCL19+成纤维细胞通过促进三级淋巴结构形成加剧疾病严重性的机制 | 首次在口腔扁平苔藓中发现CCL19+成纤维细胞在三级淋巴结构形成中的关键作用，并阐明其通过淋巴毒素激活促进T细胞趋化的机制 | 回顾性研究设计，样本量有限 | 阐明口腔扁平苔藓中适应性免疫的启动机制，特别关注诱导性三级淋巴结构和基质-免疫微环境的作用 | 口腔扁平苔藓患者 | 数字病理学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞RNA测序，多重免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据，图像数据 | 口腔扁平苔藓患者回顾性临床数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 215 | 2025-10-06 |
Integrated system for screening tumor-specific TCRs, epitopes, and HLA subtypes using single-cell sequencing data
2025-Jul-31, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012029
PMID:40744664
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研究论文 | 开发了一种集成系统，用于从单细胞测序数据中筛选肿瘤特异性TCR、表位和HLA亚型 | 开发了快速TCR组装方法，可在2天内构建TCR文库，并建立了HLA敲除的抗原呈递系统和Jurkat NFAT-GFP报告细胞系 | 仅通过小规模筛选验证了HPV16特异性TCR，需要更大规模的验证 | 开发高效可扩展的方法识别肿瘤特异性TCR以推进TCR-T免疫治疗 | 宫颈癌患者的HPV16特异性T细胞 | 免疫治疗 | 宫颈癌 | 单细胞测序，TCR组装，抗原呈递系统，报告细胞系筛选 | NA | 单细胞测序数据 | HPV16阳性宫颈癌患者数据集 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 216 | 2025-10-06 |
Integrative network pharmacology and multi-omics reveal anisodamine hydrobromide's multi-target mechanisms in sepsis
2025-Jul-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-13187-w
PMID:40744980
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研究论文 | 通过整合网络药理学和多组学方法揭示氢溴酸山莨菪碱在脓毒症中的多靶点作用机制 | 首次整合网络药理学、机器学习、免疫学分析、分子模拟和单细胞转录组学，系统阐明氢溴酸山莨菪碱在脓毒症中的多靶点作用机制 | NA | 阐明氢溴酸山莨菪碱在脓毒症治疗中的作用机制 | 脓毒症患者和动物模型 | 生物信息学 | 脓毒症 | 网络药理学, 机器学习, 免疫学分析, 分子模拟, 单细胞转录组学 | 生存模型, 分子对接模型, 分子动力学模拟 | 转录组数据, 蛋白质相互作用数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 217 | 2025-10-06 |
Multi-omics analysis unveiled fibroblast-mediated pathogenesis in male genital lichen sclerosus
2025-Jul-31, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01453-3
PMID:40745572
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示成纤维细胞在男性生殖器硬化性苔藓发病机制中的关键作用 | 首次构建男性生殖器硬化性苔藓的细胞图谱，发现成纤维细胞通过胶原-CD44轴和APP-CD74信号通路分别与T细胞和角质形成细胞的相互作用机制 | NA | 阐明男性生殖器硬化性苔藓的发病机制和关键生物标志物 | 男性生殖器硬化性苔藓组织样本 | 生物信息学 | 皮肤疾病 | 多组学分析,单细胞RNA测序,全基因组关联分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,基因组关联数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 218 | 2025-08-04 |
Single-cell sequencing-based study of ferroptosis mechanisms in heat stroke: identification of key biomarkers and dynamic analysis of the immune microenvironment
2025-Jul-31, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-025-02188-3
PMID:40745616
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 219 | 2025-10-06 |
Comprehensive single-cell transcriptomic analysis reveals fibroblast subpopulations and the prognostic association of COMT in prostate cancer progression， COMT ， COMT
2025-Jul-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-10624-8
PMID:40721434
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示前列腺癌中成纤维细胞亚群及其与预后的关联 | 首次在前列腺癌中通过单细胞RNA测序鉴定出三个不同的成纤维细胞亚群，并发现COMT基因在肿瘤来源成纤维细胞中的关键作用 | 需要进一步研究验证结果并探索COMT在前列腺癌进展和治疗抵抗中的机制作用 | 探索前列腺癌中成纤维细胞的分子景观并评估COMT表达的预后意义 | 前列腺癌样本中的成纤维细胞亚群 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光检测 | Cox回归风险评分模型 | 单细胞转录组数据, 临床数据 | 来自GEO数据库和TCGA数据库的前列腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 220 | 2025-10-06 |
DNFE: Directed network flow entropy for detecting tipping points during biological processes
2025-Jul, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013336
PMID:40729372
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研究论文 | 开发了一种基于有向网络流熵的方法，用于检测生物过程中的临界状态和驱动网络 | 提出了有向网络流熵方法，能够将组学数据转换为有向网络，相比传统无向网络方法具有更好的鲁棒性和有效性 | NA | 识别生物过程中的临界状态和驱动网络，预测活跃转录因子和暗基因 | 基因调控网络、转录因子、暗基因 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、批量测序 | 有向网络流熵算法 | 组学数据、单细胞数据、批量数据 | 六个真实数据集（三个单细胞数据集、两个批量肿瘤数据集、一个血液数据集） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |