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当前共找到 799 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-12-16 |
Developmental Origins and Oncogenesis in Medulloblastoma
2025-07, Annual review of neuroscience
IF:12.1Q1
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综述 | 本文综述了髓母细胞瘤的发育起源和致癌机制，重点讨论了其分子亚群的细胞起源、可塑性、异质性以及相关的遗传和表观遗传改变 | 整合了最新的单细胞转录组学研究，提出了各分子亚群特异性遗传-表观遗传改变导致神经发育程序停滞并引发肿瘤的新观点，并强调了靶向特定致癌脆弱性的治疗进展 | NA | 探讨髓母细胞瘤的细胞起源、肿瘤发生机制以及相关治疗策略 | 髓母细胞瘤及其分子亚群 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 202 | 2025-12-13 |
Evolution of SARS-CoV-2 T cell responses as a function of multiple COVID-19 boosters
2025-Jul-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115907
PMID:40580476
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研究论文 | 本研究通过一项为期3年的队列研究，探讨了重复接种COVID-19疫苗对适应性免疫的长期影响 | 首次通过长达3年的纵向研究，结合单细胞RNA测序技术，系统揭示了重复疫苗接种后T细胞反应的动态变化与表型特征，并发现了无症状感染对免疫应答的独特影响 | 样本量相对较小（78人），且依赖于自我报告的无症状感染证据，可能存在漏报或误报 | 评估重复COVID-19疫苗接种对适应性免疫（特别是T细胞反应）的长期影响 | 78名未报告有症状感染的个体 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 78名个体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 203 | 2025-12-13 |
Molecular Mechanisms of Perivascular Macrophages in Alzheimer's Disease: Insights from Single-Cell Sequencing and Mendelian Randomization
2025-Jul-07, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-025-01590-w
PMID:40622473
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研究论文 | 本研究结合单细胞测序和孟德尔随机化分析，探讨了阿尔茨海默病中血管周围巨噬细胞的分子机制 | 首次将单细胞测序与孟德尔随机化分析结合，系统研究血管周围巨噬细胞在阿尔茨海默病中的分子机制，并识别出四个关键基因 | 研究主要基于公共数据集分析，缺乏实验验证；样本来源和数量可能限制结果的普适性 | 揭示血管周围巨噬细胞在阿尔茨海默病发病和进展中的具体分子机制 | 阿尔茨海默病患者中的血管周围巨噬细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序, 孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 表达数量性状位点数据 | 基于GSE264648和eQTLGen数据集，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 204 | 2025-12-06 |
Combined bulk and single-cell transcriptomic analysis reveals cell-type-specific inflammatory crosstalk in pancreatic cancer
2025-Jul-25, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01815-8
PMID:40711603
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研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞转录组数据，揭示了胰腺导管腺癌中细胞类型特异性的炎症信号串扰，识别了关键调控非编码RNA、枢纽蛋白编码基因及细胞间通讯通路 | 结合bulk和单细胞转录组学分析，首次在PDAC中构建了ceRNA网络并利用单细胞数据解析了枢纽基因的细胞来源，发现了巨噬细胞-内皮细胞CXCL8-ACKR1信号轴 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证；数据来源于公共数据库，可能存在批次效应；单细胞数据样本量有限 | 阐明胰腺导管腺癌的复杂分子和细胞景观，识别可作为预后生物标志物和治疗靶点的关键调控元件 | 胰腺导管腺癌组织及癌旁正常组织 | 生物信息学 | 胰腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | ceRNA网络, PPI网络 | 转录组数据 | 多个GEO数据集中的PDAC和正常组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 205 | 2025-12-06 |
Identification of a fibroblast-derived gene signature reveals prognostic and therapeutic insights in pancreatic cancer
2025-Jul-18, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01801-0
PMID:40676405
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研究论文 | 本研究基于胰腺导管腺癌（PDAC）中成纤维细胞特异性基因特征，构建了一个预后模型，并识别了潜在的治疗靶点基因 | 利用单细胞RNA测序数据，通过高维加权基因共表达网络分析识别PDAC中富集的成纤维细胞亚群，并构建了一个包含14个关键基因的成纤维细胞相关预后特征 | NA | 开发基于成纤维细胞特异性基因特征的预后模型，并识别可作为治疗靶点的关键基因 | 胰腺导管腺癌（PDAC）及癌旁正常组织 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 206 | 2025-12-06 |
Single-cell RNA sequencing in human atherosclerotic plaques reveals a novel smooth muscle cell subtype that possesses multi differentiation potential and shapes the microenvironment
2025-Jul-16, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01735-7
PMID:40668312
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据，在人类冠状动脉粥样硬化斑块中发现了一种新型平滑肌细胞亚型SMC_C5，该亚型具有多向分化潜能并能重塑微环境 | 首次在人类冠状动脉粥样硬化斑块中鉴定出SMC_C5这一新型平滑肌细胞亚型，并揭示其与转录因子GABP1的关联及通过ALDOA基因调控代谢、缺氧反应和免疫微环境的新功能 | 研究主要基于生物信息学分析，虽使用ApoE小鼠模型进行验证，但人类样本的验证和机制研究仍需进一步深入 | 探究动脉粥样硬化斑块中平滑肌细胞亚型的异质性及其在疾病发生中的作用 | 人类冠状动脉粥样硬化斑块和平滑肌细胞，以及ApoE小鼠的主动脉斑块 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | pySCENIC | RNA测序数据 | 整合了三个单细胞RNA测序数据集，并使用ApoE小鼠模型进行验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 207 | 2025-12-06 |
Exploring SERTAD4 as a prognostic biomarker and therapeutic target in breast cancer: insights from multidatabase analyses and in vitro studies
2025-Jul-14, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01792-y
PMID:40658117
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研究论文 | 本文通过多数据库分析和体外实验，探讨了SERTAD4作为乳腺癌预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 首次系统性地研究了SERTAD4在乳腺癌中的表达、临床相关性及其作为预后因子和治疗靶点的作用，并揭示了其与PI3K/AKT信号通路的关联 | 研究主要基于数据库分析和体外实验，缺乏体内实验验证，且临床样本量可能有限 | 探索SERTAD4在乳腺癌中的生物学功能、临床意义及其作为治疗靶点的潜力 | 乳腺癌细胞、临床乳腺癌样本、单细胞测序数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、siRNA敲低、分子对接、免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据、临床数据、单细胞测序数据 | 临床乳腺癌样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 208 | 2025-12-05 |
Linear structure unfolding : application to mouse brain in spatial transcriptomics
2025-Jul, Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual International Conference
DOI:10.1109/EMBC58623.2025.11251850
PMID:41335925
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研究论文 | 本文提出了一种用于空间转录组学中分析细长弯曲形状或点云的方法，通过展开线性结构来研究细胞或转录本类型沿主轴的分布 | 结合k-means聚类和旅行商问题优化自动计算形状的中心线，实现沿中心线或垂直方向的细胞或转录本空间分布分析 | NA | 解决空间转录组学中特定形状区域（如细长弯曲结构）的计算分析问题 | 小鼠大脑组织中的细胞或RNA分子点云 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | k-means聚类，旅行商问题优化 | 图像，点云数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 209 | 2025-12-01 |
Deciphering the tumor immune microenvironment: single-cell and spatial transcriptomic insights into cervical cancer fibroblasts
2025-Jul-05, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03432-5
PMID:40616092
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学技术解析宫颈癌肿瘤免疫微环境中成纤维细胞的异质性及其功能 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和反卷积分析系统鉴定宫颈癌中6种成纤维细胞亚型，发现C0 MYH11+成纤维细胞通过MDK-SDC1信号轴在肿瘤进展中的关键作用 | 研究结果仅部分揭示了CAFs在宫颈癌免疫微环境中的可能作用，需要进一步验证 | 探索宫颈癌肿瘤免疫微环境中成纤维细胞的异质性及其在肿瘤进展和治疗抵抗中的作用 | 宫颈癌组织样本和细胞系 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,反卷积分析,伪时间轨迹映射,荧光激活细胞分选,多重免疫荧光,免疫组织化学 | 预后模型 | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,批量RNA测序数据,图像数据 | 人类宫颈癌组织样本和培养细胞 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 210 | 2025-11-27 |
Heterochronic parabiosis uncovers AdipoR1 as a critical player in retinal rejuvenation
2025-Jul-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv6642
PMID:40668916
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研究论文 | 本研究通过异时共生模型结合单细胞RNA测序技术，揭示AdipoR1在视网膜年轻化过程中的关键作用 | 首次通过异时共生模型系统分析视网膜衰老的转录组变化，并鉴定AdipoR1-AMPK信号通路作为视网膜年轻化的核心机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类视网膜中验证 | 探索视网膜衰老的分子驱动因素并鉴定抗衰老靶点 | 年轻、年老及异时共生配对小鼠的视网膜组织 | 单细胞转录组学 | 视网膜衰老 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻、年老及异时共生配对小鼠视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 211 | 2025-11-24 |
Spatial transcriptomics defines the cell-specific RNA landscape of equine dorsal root ganglia
2025-Jul, Veterinary pathology
IF:2.3Q1
DOI:10.1177/03009858241312623
PMID:39916473
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术绘制了马背根神经节细胞特异性RNA图谱 | 首次将人类细胞标记物成功应用于马背根神经节的空间转录组分析，并验证了其在马组织中的适用性 | 研究仅针对健康成年马匹，尚未应用于疾病状态 | 定义健康成年马背根神经节的空间转录组景观 | 马背根神经节组织 | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | 数字空间分析 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiling | GeoMx数字空间分析平台 |
| 212 | 2025-11-07 |
PLIN2 promotes colorectal cancer progression through CD36-mediated epithelial-mesenchymal transition
2025-Jul-10, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07836-1
PMID:40640171
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研究论文 | 本研究揭示了PLIN2通过稳定CD36蛋白表达促进结直肠癌上皮-间质转化和肿瘤进展的分子机制 | 首次发现PLIN2通过抑制CD36蛋白的蛋白酶体降解途径稳定其表达，进而促进EMT过程和结直肠癌进展 | NA | 构建可靠的预后预测模型并阐明结直肠癌进展的关键分子机制 | 结直肠癌细胞、临床标本、组织芯片 | 生物信息学 | 结直肠癌 | WGCNA、单细胞RNA测序、空间转录组、免疫沉淀、免疫荧光 | LASSO回归、Cox回归、Kaplan-Meier生存分析 | 基因表达谱、临床数据 | 120个免疫细胞表达谱及临床标本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
| 213 | 2025-07-17 |
Unveiling new therapeutic targets for esophageal cancer treatment through single-cell transcriptomics: pH-responsive nanobubbles enhance the efficacy of 125I radiotherapy
2025-Jul-15, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03552-2
PMID:40665303
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 214 | 2025-10-16 |
Joint representation and visualization of derailed cell states with Decipher
2025-Jul-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03682-8
PMID:40702544
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研究论文 | 提出一种名为Decipher的深度生成模型，用于整合单细胞基因组学数据并可视化正常与异常细胞状态间的转变 | 开发首个能联合建模和可视化正常与扰动单细胞RNA-seq数据中基因表达和细胞状态的深度生成模型 | NA | 开发计算工具以整合跨条件的单细胞基因组学数据并表征正常到异常细胞状态的转变 | 单细胞RNA测序数据中的细胞状态 | 机器学习 | 胰腺炎、急性髓系白血病、胃癌 | 单细胞RNA测序 | 深度生成模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 215 | 2025-10-05 |
Snail1 as a key prognostic biomarker of cancer-associated fibroblasts in breast tumors
2025-07, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189316
PMID:40222423
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综述 | 本文总结了Snail1作为癌症相关成纤维细胞关键预后生物标志物在乳腺肿瘤中的作用 | 揭示了Snail1相关基因特征在CAFs中的预后潜力，并强调了表达Snail1的成纤维细胞的纤维化和免疫抑制作用 | 基于现有研究的综述性分析，缺乏原始实验数据验证 | 探讨CAF生物标志物在癌症预后中的价值，特别关注Snail1的作用 | 乳腺癌患者样本和小鼠模型中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 216 | 2025-10-05 |
CXCL13 as a Prognostic Biomarker and Modulator of the Tumor Microenvironment in Colorectal Cancer
2025 Jul-Aug, Journal of digestive diseases
IF:2.3Q3
DOI:10.1111/1751-2980.70001
PMID:40804009
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研究论文 | 本研究探讨CXCL13作为预后生物标志物在结直肠癌肿瘤微环境中的作用 | 首次系统评估CXCL13在结直肠癌中的预后价值及其与CD8+T细胞的相互作用机制 | 研究基于多个独立队列但需要进一步实验验证CXCL13调控CD8+T细胞功能的具体机制 | 探究CXCL13对结直肠癌患者预后和肿瘤免疫微环境的影响 | 结直肠癌患者和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 免疫组织化学,多重免疫组织化学,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,组织切片图像,单细胞测序数据 | 四个独立队列(包括TCGA队列和Renji医院队列) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 217 | 2025-10-06 |
Single-cell profiling of bone metastasis ecosystems from multiple cancer types reveals convergent and divergent mechanisms of bone colonization
2025-Jul-09, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100888
PMID:40412393
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析多种癌症类型骨转移生态系统的异质性 | 首次在多种癌症类型的骨转移中识别出三种不同的生态系统原型，并发现骨转移原型与组织来源相关性较弱 | 样本量相对有限(42例骨转移样本)，需要更大规模研究验证 | 研究不同癌症类型骨转移生态系统的异质性和趋同机制 | 8种癌症类型的42例骨转移样本 | 单细胞组学 | 骨转移癌 | 单细胞RNA测序,免疫组化,生物信息学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,组织切片图像,批量RNA测序数据 | 42例骨转移样本(单细胞测序),158例骨转移样本(验证分析) | NA | 单细胞RNA测序,空间转录omics | NA | NA |
| 218 | 2025-10-05 |
An Intrinsic-hoc Framework for Heterogeneous Cellular Senescence Elucidation Using Deep Graph Representation Learning and Experimental Validation
2025-Jul-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.01.662364
PMID:40631080
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研究论文 | 提出一种基于深度图表示学习的框架DeepSAS，用于从单细胞RNA-seq数据中解析衰老细胞的异质性 | 开发了首个结合深度图表示学习和实验验证的本征框架，能够稳健地识别衰老细胞类型及其相关基因 | NA | 解析衰老细胞的异质性及其相关基因，增进对衰老和年龄相关疾病的理解 | 健康眼部细胞图谱和特发性肺纤维化数据集中的衰老细胞 | 机器学习 | 年龄相关疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 深度图表示学习 | 单细胞RNA-seq数据，空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | Xenium | Xenium空间转录组学验证平台 |
| 219 | 2025-10-05 |
cp_measure: API-first feature extraction for image-based profiling workflows
2025-Jul-01, ArXiv
PMID:41019218
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研究论文 | 开发了一个名为cp_measure的Python库，用于从生物图像中提取特征以支持基于图像的细胞分析工作流 | 将CellProfiler的核心测量功能提取为模块化、API优先的工具，实现程序化特征提取 | NA | 开发适用于机器学习工作流的自动化、可重复图像分析工具 | 生物图像中的细胞和其他实体 | 计算机视觉 | NA | 图像分析，特征提取 | NA | 图像 | NA | NA | 空间转录组学，3D成像 | NA | NA |
| 220 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA-seq provides insight into the underdeveloped immune system of germ-free mice
2025-Jul-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示无菌小鼠免疫系统发育不全的分子机制 | 首次使用液滴单细胞RNA测序系统比较无菌小鼠与特定病原体自由小鼠的免疫细胞差异，发现微生物缺失导致中性粒细胞凋亡增加和干扰素反应受损的新机制 | 研究主要聚焦于骨髓和外周血细胞，未涉及其他免疫器官；机制验证仍需进一步功能实验 | 探究微生物群缺失导致免疫系统发育不全的分子机制 | 无菌小鼠和特定病原体自由小鼠的骨髓及外周血免疫细胞 | 单细胞组学 | 免疫缺陷 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 无菌小鼠和特定病原体自由小鼠的骨髓及外周血样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 液滴单细胞RNA测序平台 |