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当前共找到 820 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-02-11
spRefine Denoises and Imputes Spatial Transcriptomics with a Reference-Free Framework Powered by Genomic Language Model
2025-Jul-07, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种名为spRefine的深度学习框架,利用基因组语言模型对空间转录组数据进行联合去噪和插补 开发了首个基于基因组语言模型的无参考框架,能够同时处理空间转录组数据的噪声和缺失值问题,并提高了空间衰老时钟估计的准确性 未明确说明框架的计算复杂度或对特定数据类型的适用性限制 解决空间转录组数据分析中的高噪声和基因测量缺失问题 空间转录组数据 空间转录组学 衰老相关疾病 空间转录组学 深度学习框架、基因组语言模型 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
2 2026-02-11
Targeting IGF1-Induced Cellular Senescence to Rejuvenate Hair Follicle Aging
2025-Jul, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本研究探讨了IGF-1信号通路通过诱导毛囊干细胞衰老来调控毛囊老化的机制,并提出了针对性的干预策略 首次在转基因小鼠模型中揭示了表皮过度表达IGF-1会直接导致毛囊干细胞衰老和毛囊早衰,并验证了通过调控下游通路或清除衰老细胞来逆转这一过程的可行性 研究主要基于小鼠模型,人类皮肤中的机制验证尚需进一步临床研究 探究IGF-1信号通路在器官老化特别是毛囊衰老中的作用机制 小鼠皮肤组织、人类皮肤样本、转基因小鼠模型 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3 2026-02-11
Pyrroloquinoline Quinone Reprograms the Single-Cell Landscape of Immune Aging in Hematopoietic Immune System
2025-Jul, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了衰老对小鼠造血免疫系统的影响,并证明了抗氧化剂吡咯喹啉醌(PQQ)能够通过减轻氧化应激、逆转免疫衰老表型、恢复免疫稳态来改善免疫衰老 首次在单细胞分辨率下系统描绘了PQQ对衰老造血免疫系统的重编程作用,并鉴定了ASPP1、Yy1和CD62L等关键分子靶点,同时结合机器学习程序验证了PQQ的衰老细胞清除(senolytic)和衰老表型调节(senomorphic)效应 研究基于小鼠模型,其在人体中的效果和机制仍需进一步验证;单细胞测序仅聚焦于脾脏和骨髓细胞,未涵盖其他免疫器官或组织 探究衰老对造血免疫系统的影响,并评估抗氧化剂PQQ在改善免疫衰老、恢复免疫稳态方面的潜力 小鼠的脾脏和骨髓细胞 单细胞组学 免疫衰老 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 机器学习程序 单细胞转录组数据 小鼠模型(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
4 2026-02-11
Deciphering Immunosenescence From Child to Frailty: Transcriptional Changes, Inflammation Dynamics, and Adaptive Immune Alterations
2025-Jul, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本研究通过整合分析从儿童到衰弱老年人的PBMCs的bulk-cell和single-cell RNA-seq数据,揭示了免疫衰老的转录组变化、炎症动态和适应性免疫改变 首次结合bulk-cell和single-cell RNA-seq数据,全面描绘了从儿童到衰弱老年人PBMCs的免疫衰老动态变化,并识别了衰弱老年人特有的免疫细胞表型异常 研究仅基于PBMCs样本,可能无法完全反映组织特异性免疫变化;样本年龄跨度虽广,但未详细说明各年龄组样本量 探究年龄相关的免疫系统变化,特别是免疫衰老在健康衰老和衰弱状态中的机制 外周血单个核细胞(PBMCs) 生物信息学 老年疾病 RNA-seq NA 转录组数据 从儿童到衰弱老年人的PBMCs样本(具体数量未说明) NA single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
5 2026-02-11
Inactivation of Histone Chaperone HIRA Unmasks a Link Between Normal Embryonic Development of Melanoblasts and Maintenance of Adult Melanocyte Stem Cells
2025-Jul, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本文探讨组蛋白伴侣HIRA在小鼠色素系统中对胚胎期黑色素细胞发育和成年期黑色素干细胞维持的作用 首次揭示HIRA在胚胎期黑色素细胞发育中的功能缺陷会持续影响成年期黑色素干细胞的维持,建立了胚胎发育与成年组织干细胞衰老之间的直接遗传联系 研究主要基于小鼠模型,人类色素系统的相关性尚需进一步验证;单细胞RNA测序样本量可能有限 探究组蛋白伴侣HIRA在胚胎发育和成年组织干细胞维持中的双重作用机制 小鼠黑色素细胞谱系(包括黑色素母细胞和黑色素干细胞) 发育生物学 色素相关疾病 单细胞RNA测序, ATAC-seq, 基因敲除 基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 小鼠胚胎和成年组织样本 NA 单细胞RNA-seq, ATAC-seq NA NA
6 2026-02-10
Single-Cell Multiome Impact of Prenatal Heavy Metal Exposure on Early Airway Development
2025-Jul-30, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞多组学测序和高分辨率代谢组学,揭示了产前镉和砷暴露对小鼠早期胚胎肺发育的多层面分子和细胞破坏机制 首次结合单细胞多组学测序(scATAC-seq+scRNA-seq)和高分辨率代谢组学,系统描绘了产前重金属暴露对早期气道发育的多层面影响,并整合RNA剪接和染色质动力学进行细胞命运轨迹分析 研究仅针对小鼠E12胚胎肺,且暴露剂量为固定浓度,未涵盖更广泛的发育时间点或剂量效应关系 探究产前镉和砷暴露对早期肺发育的细胞类型特异性机制和分子调控网络 产前暴露于镉和砷的小鼠胚胎肺组织(E12、E14.5、E17) 单细胞多组学 肺发育障碍 单细胞多组学测序(scATAC-seq+scRNA-seq)、高分辨率代谢组学、基因调控网络分析、细胞命运轨迹分析 NA 单细胞多组学数据(RNA-seq、ATAC-seq)、代谢组学数据 小鼠胚胎肺组织(对照组和处理组,具体数量未明确说明) NA 单细胞多组学测序(scATAC-seq+scRNA-seq) NA NA
7 2026-02-05
SPP1 + macrophages facilitate pancreatic cancer progression via ITGB6-mediated interactions: evidence from integrated multi-omics analysis and experimental validation
2025-Jul-28, Immunologic research IF:3.3Q3
研究论文 本研究通过整合多组学分析和实验验证,揭示了SPP1+巨噬细胞通过ITGB6介导的相互作用促进胰腺癌进展的机制 建立了基于基底膜相关基因的新型胰腺癌亚型分类和预后标志物,并首次在单细胞水平上描绘了肿瘤相关巨噬细胞的图谱,阐明了SPP1+巨噬细胞通过ITGB6介导的相互作用驱动肿瘤进展的新机制 研究主要基于公共数据库数据,实验验证可能受样本量限制,且机制研究集中在ITGB6,其他潜在分子通路有待进一步探索 探究基底膜和肿瘤相关巨噬细胞在胰腺癌进展中的作用机制,并开发预后预测模型 胰腺癌组织和细胞 生物信息学 胰腺癌 单细胞RNA测序,多组学分析,机器学习算法 LASSO,生存SVM RNA-seq数据,单细胞RNA-seq数据 来自公共数据库的胰腺癌队列数据,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
8 2026-02-05
The impact of neddylation on prognosis in the immune microenvironment of neuroblastoma: a single-cell transcriptomic analysis
2025-Jul-17, Immunologic research IF:3.3Q3
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析,探讨了neddylation在神经母细胞瘤免疫微环境中的预后影响,并建立了一个neddylation相关的预后特征 首次在神经母细胞瘤中结合单细胞RNA测序和加权基因共表达网络分析,构建neddylation相关预后特征,并揭示其与免疫微环境及治疗响应的关联 研究基于回顾性数据,需要前瞻性临床验证来确认预后特征的普遍适用性 评估neddylation在神经母细胞瘤预后中的作用,并开发一个相关的预后特征以指导个性化治疗 神经母细胞瘤患者 数字病理学 神经母细胞瘤 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 单样本基因集富集分析 NA 基因表达数据, 单细胞转录组数据 171,992个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
9 2026-02-05
ShinySC: An R/Shiny-based desktop application for seamless analysis of scRNA-Seq data
2025-Jul-01, Biomedical journal IF:4.1Q2
研究论文 本文介绍了一款基于R/Shiny的桌面应用程序ShinySC,旨在通过直观的图形界面简化单细胞RNA测序数据的全面分析 ShinySC整合了多种自动细胞类型注释方法(包括基于参考的SingleR、基于标记的ScType和scCATCH,以及基于GPT的GPTCelltype),并支持并排比较和手动标签优化,为无编程经验的用户提供了一个统一、可扩展的平台 分析性能受限于标准桌面系统的硬件配置(如64 GB RAM),且分析时长依赖于具体任务和注释方法,可能不适用于超大规模数据集 开发一个用户友好的工具,以降低单细胞RNA测序数据分析的门槛,提高可访问性和可重复性 单细胞RNA测序数据,包括来自PBMC和干扰素刺激数据集的示例 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 基准测试表明可处理多达200,000个细胞的数据集 10x Genomics, BD Biosciences 单细胞RNA-seq 10x Chromium, BD Rhapsody 支持多种输入格式,包括10x Genomics、BD Rhapsody、Seurat、Scanpy和CellView
10 2026-02-03
Spatiotemporal transcriptomic profiling reveals metabolic dysfunction prior to overt tauopathy in the PS19 mouse model
2025-Jul-10, Research square
研究论文 本研究利用PS19小鼠模型,通过空间转录组学分析揭示了在tau蛋白病变前,海马和皮质区域中代谢功能障碍的早期变化 首次在PS19小鼠模型中,结合空间转录组学技术,揭示了在tau蛋白缠结病理出现前,易感脑区(如CA3区)已发生代谢通路基因的早期上调,强调了代谢应激和胶质细胞激活在tau病变及区域脆弱性中的作用 研究基于转基因小鼠模型,可能不完全模拟人类神经退行性疾病的复杂性;空间转录组学分析的时间点和区域有限,可能未覆盖所有疾病阶段或脑区 探究tau蛋白病变中区域脆弱性与转录组变化之间的关系,特别是代谢功能障碍在疾病早期的作用 PS19转基因小鼠模型(tau P301S突变),重点关注海马和皮质区域 空间转录组学 阿尔茨海默病 空间转录组学分析 NA 转录组数据 PS19小鼠模型在选定疾病阶段的海马和皮质区域样本 NA 空间转录组学 NA NA
11 2026-01-30
Intestinal Bacteroides drives glioma progression by regulating CD8+ T cell tumor infiltration
2025-Jul-30, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 本研究揭示了肠道微生物Bacteroides通过调节CD8+ T细胞肿瘤浸润驱动神经纤维瘤病1型相关低级别胶质瘤进展的机制 首次建立了肠道微生物Bacteroides与NF1-LGG病理生物学之间的机制性联系,并揭示了TGFβ介导的免疫调节通路 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 探究肠道微生物对神经纤维瘤病1型相关视路胶质瘤进展的影响机制 Nf1突变小鼠模型(Nf1OPG小鼠)的视路胶质瘤 肿瘤免疫学 神经胶质瘤 16S基因分型,单细胞RNA测序 NA 基因测序数据 使用Nf1OPG小鼠模型进行研究 NA 单细胞RNA测序 NA NA
12 2026-01-28
Integrated single-nuclei and spatial transcriptomic profiling of human sacrococcygeal teratomas reveals heterogeneity in cellular composition and X-chromosome inactivation
2025-Jul-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过整合单核RNA测序和空间转录组学技术,揭示了人类骶尾部畸胎瘤的细胞组成异质性及其与X染色体失活状态的联系 首次在骶尾部畸胎瘤中结合单核RNA测序与空间转录组学分析,揭示了X染色体双等位基因激活与肿瘤细胞身份及性别偏好的关联 样本量较小(仅8个肿瘤),且未检测到假定的多能性细胞群 探究骶尾部畸胎瘤的细胞起源、临床分层机制及性别偏好的分子基础 人类骶尾部畸胎瘤组织样本(包括产后和产前样本) 单细胞组学 骶尾部畸胎瘤 单核RNA测序,空间转录组学 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 8个骶尾部畸胎瘤样本(6个产后样本:1男5女;2个产前样本:均为女性) NA 单核RNA-seq,空间转录组学 NA NA
13 2026-01-26
Clonal hematopoiesis is clonally unrelated to multiple myeloma and is associated with specific microenvironmental changes
2025-Jul-31, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究探讨了克隆造血与多发性骨髓瘤的共存关系及其对肿瘤微环境的影响 首次证明克隆造血与多发性骨髓瘤在诊断时频繁共存,且两者克隆起源无关,并通过单细胞RNA测序揭示了克隆造血阳性患者肿瘤微环境的显著变化 样本量相对较小(106例患者),且克隆造血与较低血红蛋白中位数的关联趋势不显著 研究克隆造血在多发性骨髓瘤肿瘤微环境中的修饰作用及其临床意义 多发性骨髓瘤患者 数字病理学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 106例多发性骨髓瘤患者,其中16例进行了单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA-seq NA NA
14 2026-01-25
SETDB1 ensures the continuity of embryonic to adult neural stem cells through metabolic alterations in the dentate gyrus
2025-Jul-29, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究揭示了SETDB1通过调控代谢状态,确保胚胎神经祖细胞向成年神经干细胞(aNSCs)的连续性,防止其分化为星形胶质细胞 发现SETDB1通过靶向线粒体复合物成分COX6B2调控氧化磷酸化,从而控制aNSCs命运,防止星形胶质细胞分化 NA 探究胚胎神经祖细胞如何过渡为成年神经干细胞,同时避免星形胶质细胞命运,以维持aNSCs池 齿状回发育过程中的胚胎神经祖细胞和成年神经干细胞 神经科学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
15 2026-01-24
Integration of scRNA-seq and bulk tissue RNA-seq data to identify cancer-associated fibroblast-related gene RGMA as a potential treatment target for esophageal cancer
2025-Jul-11, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量组织RNA测序数据,识别出癌症相关成纤维细胞相关基因RGMA,并探讨其作为食管癌潜在治疗靶点的作用 首次结合scRNA-seq和WGCNA分析识别CAF相关基因RGMA,并验证其在食管癌中的抑癌功能及调控机制 研究主要基于公共数据集和细胞系实验,缺乏大规模临床样本验证,且体内实验模型有限 识别食管癌中癌症相关成纤维细胞的关键基因,探索其作为治疗靶点的潜力 食管癌组织、细胞系(ECA109)、癌症相关成纤维细胞(CAFs)和正常成纤维细胞(NFs) 生物信息学 食管癌 scRNA-seq, 批量RNA-seq, WGCNA, RT-qPCR, western blot, 体外和体内实验 NA 基因表达数据 TCGA-ESCA队列数据集和GSE196756 scRNA-seq数据集 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
16 2026-01-24
Palmitoylation Dynamics in Systemic Lupus Erythematosus: Multi-Omics Insights and Potential Therapeutic Implications
2025-Jul, International journal of rheumatic diseases IF:2.4Q2
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了棕榈酰化在系统性红斑狼疮中的动态作用及其潜在治疗靶点 结合多组学数据、单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法,首次系统性鉴定了与SLE相关的棕榈酰化相关基因及因果代谢物 研究结果基于公共数据集GSE61635,需要进一步实验验证;样本来源和临床异质性可能影响结论的普适性 探究棕榈酰化在系统性红斑狼疮发病机制中的作用并识别潜在生物标志物和治疗靶点 系统性红斑狼疮患者与健康对照的基因表达数据及免疫细胞 生物信息学 系统性红斑狼疮 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 机器学习模型, 孟德尔随机化 机器学习模型 基因表达数据 基于公共数据集GSE61635,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
17 2026-01-24
Noncanonical Differentiation of Memory B Cells Drives Latent Tuberculosis Infection Reactivation Upon Tumor Necrosis Factor-Alpha Inhibitor Therapy: An Integrative Transcriptomic Study
2025-Jul, International journal of rheumatic diseases IF:2.4Q2
研究论文 本研究通过整合转录组学分析,揭示了记忆B细胞在结核病进展和肿瘤坏死因子抑制剂治疗中的非经典分化轨迹及其代谢重编程作用 首次识别ROR1+记忆B细胞在结核病进展中的非经典分化轨迹,并发现其代谢重编程可能破坏免疫平衡,导致潜伏结核感染再激活 研究基于六个转录组数据集,样本量有限,且为回顾性分析,需进一步实验验证 探究肿瘤坏死因子抑制剂治疗中潜伏结核感染再激活的致病机制 记忆B细胞在结核病进展和肿瘤坏死因子抑制剂治疗中的转录变化 生物信息学 结核病 转录组分析、单细胞RNA测序 NA 转录组数据 六个转录组数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
18 2026-01-21
Spatia: Multimodal Model for Prediction and Generation of Spatial Cell Phenotypes
2025-Jul-07, ArXiv
PMID:40671942
研究论文 本文介绍了一种名为Spatia的多模态模型,用于预测和生成空间细胞表型,通过融合细胞形态、基因表达和空间上下文信息来学习统一表示 Spatia首次提出了一种多尺度生成和预测模型,能够整合图像衍生的形态标记和转录组向量标记,并通过跨注意力机制和Transformer模块在单细胞、生态位和组织水平上捕获空间依赖性,同时利用生成扩散解码器合成高分辨率细胞图像 NA 学习统一的、空间感知的表示,以整合细胞形态、基因表达和空间上下文,从而理解组织功能 细胞形态、基因表达和空间组织 数字病理学 NA 空间转录组学 Transformer, 生成扩散模型 图像, 基因表达数据 涉及49名捐赠者、17种组织类型和12种疾病状态,包括1700万个细胞-基因对、100万个生态位-基因对和1万个组织-基因对 NA 空间转录组学 NA NA
19 2026-01-20
Ex vivo model of functioning human lymph node reveals role for innate lymphocytes and stroma in response to vaccine adjuvant
2025-Jul-22, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本文介绍了一种使用人淋巴结切片作为功能性模型系统,研究疫苗佐剂早期炎症反应的方法 开发了精确切割的人淋巴结切片作为保持组织结构完整的全器官模型系统,结合单细胞转录组学和多重成像技术,揭示了先天淋巴细胞和基质细胞在疫苗佐剂反应中的新作用 模型系统可能无法完全模拟体内复杂免疫环境,且研究聚焦于早期炎症反应,长期效应未涉及 研究人类免疫系统对疫苗佐剂的早期炎症反应机制 人淋巴结切片中的免疫细胞和基质细胞 免疫学 NA 单细胞转录组学,多重成像 NA 转录组数据,图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
20 2026-01-18
Spatial Transcriptomics Advances the Use of Canine Patients in Cancer Research: Analysis of Osteosarcoma-Bearing Pet Dogs Enrolled in a Clinical Trial
2025-Jul-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 本研究首次将GeoMx犬类癌症图谱应用于骨肉瘤临床试验中犬类患者的预后相关样本,通过空间转录组学分析揭示了与疾病无进展间隔相关的基因和通路 首次在犬类骨肉瘤临床试验样本中应用GeoMx犬类癌症图谱进行空间转录组学分析,验证了犬类模型在人类癌症研究中的价值 样本量较小(n=16),仅基于疾病无进展间隔进行分组,可能未涵盖所有临床变量 利用犬类骨肉瘤模型研究人类骨肉瘤的分子机制和预后标志物 犬类骨肉瘤患者的原发性肿瘤组织样本 数字病理学 骨肉瘤 空间转录组学 NA 空间转录组数据 16个犬类骨肉瘤样本(高DFI组8个,低DFI组8个) NA 空间转录组学 GeoMx Digital Spatial Profiler GeoMx犬类癌症图谱,用于福尔马林固定石蜡包埋组织的空间转录组分析
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