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当前共找到 845 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-12-16 |
Etiological basis for chronic pain genetic variation in brain and dorsal root ganglia cell types
2025-Jul-05, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.07.03.25330832
PMID:40630576
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研究论文 | 本研究通过整合慢性疼痛的GWAS数据与人类大脑、背根神经节及小鼠背角的单细胞测序数据，揭示了慢性疼痛在特定神经元亚型中的遗传基础 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示了慢性疼痛的遗传变异在人类大脑和背根神经节特定细胞类型中的富集模式，并整合了跨物种（人/鼠）的染色质可及性数据 | 样本量相对有限（特别是患者DRG样本仅12例），且小鼠模型数据与人类数据的直接可比性可能存在物种差异 | 解析慢性疼痛的细胞类型特异性遗传结构，为靶向治疗研究提供基础 | 慢性疼痛患者群体、人类大脑组织、人类背根神经节组织、小鼠背角组织 | 生物信息学 | 慢性疼痛 | 全基因组关联研究、单细胞RNA测序、单细胞染色质可及性分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、表观基因组数据 | GWAS样本1,235,695例；患者背根神经节样本12例 | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞染色质可及性分析 | NA | NA |
| 2 | 2025-12-16 |
Developmental Origins and Oncogenesis in Medulloblastoma
2025-07, Annual review of neuroscience
IF:12.1Q1
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综述 | 本文综述了髓母细胞瘤的发育起源和致癌机制，重点讨论了其分子亚群的细胞起源、可塑性、异质性以及相关的遗传和表观遗传改变 | 整合了最新的单细胞转录组学研究，提出了各分子亚群特异性遗传-表观遗传改变导致神经发育程序停滞并引发肿瘤的新观点，并强调了靶向特定致癌脆弱性的治疗进展 | NA | 探讨髓母细胞瘤的细胞起源、肿瘤发生机制以及相关治疗策略 | 髓母细胞瘤及其分子亚群 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2025-12-13 |
Evolution of SARS-CoV-2 T cell responses as a function of multiple COVID-19 boosters
2025-Jul-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115907
PMID:40580476
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研究论文 | 本研究通过一项为期3年的队列研究，探讨了重复接种COVID-19疫苗对适应性免疫的长期影响 | 首次通过长达3年的纵向研究，结合单细胞RNA测序技术，系统揭示了重复疫苗接种后T细胞反应的动态变化与表型特征，并发现了无症状感染对免疫应答的独特影响 | 样本量相对较小（78人），且依赖于自我报告的无症状感染证据，可能存在漏报或误报 | 评估重复COVID-19疫苗接种对适应性免疫（特别是T细胞反应）的长期影响 | 78名未报告有症状感染的个体 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 78名个体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2025-12-13 |
Molecular Mechanisms of Perivascular Macrophages in Alzheimer's Disease: Insights from Single-Cell Sequencing and Mendelian Randomization
2025-Jul-07, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-025-01590-w
PMID:40622473
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研究论文 | 本研究结合单细胞测序和孟德尔随机化分析，探讨了阿尔茨海默病中血管周围巨噬细胞的分子机制 | 首次将单细胞测序与孟德尔随机化分析结合，系统研究血管周围巨噬细胞在阿尔茨海默病中的分子机制，并识别出四个关键基因 | 研究主要基于公共数据集分析，缺乏实验验证；样本来源和数量可能限制结果的普适性 | 揭示血管周围巨噬细胞在阿尔茨海默病发病和进展中的具体分子机制 | 阿尔茨海默病患者中的血管周围巨噬细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序, 孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 表达数量性状位点数据 | 基于GSE264648和eQTLGen数据集，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2025-12-13 |
spRefine Denoises and Imputes Spatial Transcriptomics with a Reference-Free Framework Powered by Genomic Language Model
2025-Jul-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.22.649977
PMID:40631230
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研究论文 | 本文介绍了一种名为spRefine的深度学习框架，利用基因组语言模型对空间转录组数据进行去噪和插补 | 提出了一种无需参考的框架，结合基因组语言模型联合处理空间转录组数据，提高了数据整合的鲁棒性并支持模型预训练和新生物信号发现 | NA | 克服空间转录组数据的高噪声和基因测量缺失问题，提升数据质量和分析准确性 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习框架，基因组语言模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6 | 2025-12-13 |
CD36 promotes iron accumulation and dysfunction in CD8+ T cells via the p38-CEBPB-TfR1 axis in early-stage hepatocellular carcinoma
2025-07, Clinical and molecular hepatology
IF:14.0Q1
DOI:10.3350/cmh.2024.0948
PMID:40037690
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研究论文 | 本研究揭示了CD36通过p38-CEBPB-TfR1轴促进早期肝细胞癌中CD8+ T细胞铁积累和功能失调的机制 | 首次发现CD36通过调控铁摄取蛋白TfR1介导CD8+ T细胞铁积累和功能失调，并提出了NRF2激活作为潜在治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限，机制细节需进一步探索 | 探究早期肝细胞癌中CD8+ T细胞功能失调的分子机制 | 小鼠肝细胞癌模型中的CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | RNA测序数据，流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2025-12-11 |
Diminished SUV3 expression and its functional implications in the IFN-enriched monocyte subset of childhood Sjögren's disease
2025-Jul-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keaf193
PMID:40268748
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研究论文 | 本研究探讨了儿童干燥综合征中单核细胞IFN富集亚群SUV3表达降低的分子和功能意义，揭示了mt-dsRNA介导的PKR激活导致固有免疫功能缺陷的新机制 | 首次在儿童干燥综合征的IFN富集单核细胞亚群中发现SUV3表达降低，并阐明其通过mt-dsRNA在胞质中积累激活PKR，进而导致线粒体功能障碍和炎症特征的新致病机制 | 研究主要基于体外细胞模型和患者样本分析，缺乏体内动物模型验证；样本量相对有限；机制研究集中在PKR通路，可能存在其他未被探索的调控途径 | 探究儿童干燥综合征中单核细胞亚群SUV3表达降低的分子机制及其对固有免疫功能的影响 | 儿童干燥综合征患者的CD14+单核细胞（特别是IFN富集亚群）及单核细胞系 | 单细胞组学与免疫学 | 自身免疫性疾病（儿童干燥综合征） | 单细胞RNA测序，fCLIP-qPCR，透射电子显微镜，体外功能实验（氧化应激、ATP产生、迁移和吞噬作用测定） | 基因敲低细胞模型 | 单细胞转录组数据，免疫沉淀数据，显微镜图像，功能测定数据 | 儿童干燥综合征患者与对照的单核细胞样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2025-12-10 |
A systematic review of single-cell RNA sequencing applications and insights in Oryza sativa response to environmental stresses
2025-Jul-19, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-10836-1
PMID:40682700
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综述 | 本文系统综述了2017年至2024年间水稻单细胞RNA测序（scRNA-seq）的应用，重点关注其在解析水稻对环境胁迫响应中的作用 | 首次针对水稻的scRNA-seq研究进行系统性综述，填补了该领域在全面回顾方面的空白，并整合了ATCT-seq、snRNA-seq和Stereo-seq等最新转录组技术进展 | 作为综述文章，未进行原始实验研究，依赖现有文献的总结，可能无法涵盖所有相关研究或技术细节 | 系统概述scRNA-seq在水稻研究中的应用，特别是其在理解水稻对不同环境胁迫响应机制中的作用，以促进作物改良策略 | 水稻（Oryza sativa）及其组织（根、叶、小花、种子），以及其在低氮、高盐、缺铁和褐飞虱抗性等胁迫条件下的响应 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、ATCT-seq、snRNA-seq、Stereo-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-12-06 |
Combined bulk and single-cell transcriptomic analysis reveals cell-type-specific inflammatory crosstalk in pancreatic cancer
2025-Jul-25, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01815-8
PMID:40711603
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研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞转录组数据，揭示了胰腺导管腺癌中细胞类型特异性的炎症信号串扰，识别了关键调控非编码RNA、枢纽蛋白编码基因及细胞间通讯通路 | 结合bulk和单细胞转录组学分析，首次在PDAC中构建了ceRNA网络并利用单细胞数据解析了枢纽基因的细胞来源，发现了巨噬细胞-内皮细胞CXCL8-ACKR1信号轴 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证；数据来源于公共数据库，可能存在批次效应；单细胞数据样本量有限 | 阐明胰腺导管腺癌的复杂分子和细胞景观，识别可作为预后生物标志物和治疗靶点的关键调控元件 | 胰腺导管腺癌组织及癌旁正常组织 | 生物信息学 | 胰腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | ceRNA网络, PPI网络 | 转录组数据 | 多个GEO数据集中的PDAC和正常组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2025-12-06 |
Identification of a fibroblast-derived gene signature reveals prognostic and therapeutic insights in pancreatic cancer
2025-Jul-18, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01801-0
PMID:40676405
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研究论文 | 本研究基于胰腺导管腺癌（PDAC）中成纤维细胞特异性基因特征，构建了一个预后模型，并识别了潜在的治疗靶点基因 | 利用单细胞RNA测序数据，通过高维加权基因共表达网络分析识别PDAC中富集的成纤维细胞亚群，并构建了一个包含14个关键基因的成纤维细胞相关预后特征 | NA | 开发基于成纤维细胞特异性基因特征的预后模型，并识别可作为治疗靶点的关键基因 | 胰腺导管腺癌（PDAC）及癌旁正常组织 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2025-12-06 |
Single-cell RNA sequencing in human atherosclerotic plaques reveals a novel smooth muscle cell subtype that possesses multi differentiation potential and shapes the microenvironment
2025-Jul-16, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01735-7
PMID:40668312
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据，在人类冠状动脉粥样硬化斑块中发现了一种新型平滑肌细胞亚型SMC_C5，该亚型具有多向分化潜能并能重塑微环境 | 首次在人类冠状动脉粥样硬化斑块中鉴定出SMC_C5这一新型平滑肌细胞亚型，并揭示其与转录因子GABP1的关联及通过ALDOA基因调控代谢、缺氧反应和免疫微环境的新功能 | 研究主要基于生物信息学分析，虽使用ApoE小鼠模型进行验证，但人类样本的验证和机制研究仍需进一步深入 | 探究动脉粥样硬化斑块中平滑肌细胞亚型的异质性及其在疾病发生中的作用 | 人类冠状动脉粥样硬化斑块和平滑肌细胞，以及ApoE小鼠的主动脉斑块 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | pySCENIC | RNA测序数据 | 整合了三个单细胞RNA测序数据集，并使用ApoE小鼠模型进行验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2025-12-06 |
Exploring SERTAD4 as a prognostic biomarker and therapeutic target in breast cancer: insights from multidatabase analyses and in vitro studies
2025-Jul-14, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01792-y
PMID:40658117
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研究论文 | 本文通过多数据库分析和体外实验，探讨了SERTAD4作为乳腺癌预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 首次系统性地研究了SERTAD4在乳腺癌中的表达、临床相关性及其作为预后因子和治疗靶点的作用，并揭示了其与PI3K/AKT信号通路的关联 | 研究主要基于数据库分析和体外实验，缺乏体内实验验证，且临床样本量可能有限 | 探索SERTAD4在乳腺癌中的生物学功能、临床意义及其作为治疗靶点的潜力 | 乳腺癌细胞、临床乳腺癌样本、单细胞测序数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、siRNA敲低、分子对接、免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据、临床数据、单细胞测序数据 | 临床乳腺癌样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2025-12-06 |
Study on the prediction model of liver cancer based on chronic liver disease and the related molecular mechanism
2025 Jul-Dec, Annals of hepatology
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.aohep.2024.101572
PMID:39278407
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研究论文 | 本研究基于慢性肝病数据，开发了一个用于预测肝细胞癌预后的模型，并探讨了相关分子机制 | 通过整合肝炎、肝硬化和肝细胞癌数据集，识别了10个与预后相关的肝病进展基因，并基于这些基因建立了预后模型，同时利用单细胞测序揭示了MIF信号通路在肝细胞癌进展中的作用 | 研究依赖于公开数据库数据，可能受数据质量和样本异质性限制，且模型需进一步外部验证 | 开发一个新型预测模型以准确分类肝细胞癌，改善患者生存率 | 肝细胞癌患者数据，包括肝炎、肝硬化和肝细胞癌相关基因表达数据 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序，多变量Cox回归分析，生存分析，药物敏感性分析 | 预后模型（基于多变量Cox分析） | 基因表达数据 | 从TCGA和GEO数据库获取的HCV、肝硬化和肝细胞癌数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2025-12-05 |
Eed controls craniofacial osteoblast differentiation and mesenchymal proliferation from the neural crest
2025-Jul-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.13.584903
PMID:38558995
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研究论文 | 本研究揭示了PRC2复合物核心亚基Eed在神经嵴诱导后对颅面成骨细胞分化和间充质细胞增殖的关键调控作用 | 首次结合小鼠遗传学、单细胞RNA测序和表观遗传分析，系统阐明了Eed在神经嵴细胞迁移后阶段通过表观遗传调控转录因子程序驱动颅面发育的分子机制 | 研究主要聚焦于胚胎发育阶段，对出生后颅面维持和成年疾病关联的探讨有限 | 探究PRC2复合物在神经嵴诱导后对颅面发育的调控机制 | 小鼠胚胎神经嵴细胞、颅面间充质细胞、原代颅面细胞培养物 | 发育生物学 | 先天性颅面畸形 | 单细胞RNA测序、表观遗传分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2025-12-05 |
Linear structure unfolding : application to mouse brain in spatial transcriptomics
2025-Jul, Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual International Conference
DOI:10.1109/EMBC58623.2025.11251850
PMID:41335925
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研究论文 | 本文提出了一种用于空间转录组学中分析细长弯曲形状或点云的方法，通过展开线性结构来研究细胞或转录本类型沿主轴的分布 | 结合k-means聚类和旅行商问题优化自动计算形状的中心线，实现沿中心线或垂直方向的细胞或转录本空间分布分析 | NA | 解决空间转录组学中特定形状区域（如细长弯曲结构）的计算分析问题 | 小鼠大脑组织中的细胞或RNA分子点云 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | k-means聚类，旅行商问题优化 | 图像，点云数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 16 | 2025-12-01 |
Deciphering the tumor immune microenvironment: single-cell and spatial transcriptomic insights into cervical cancer fibroblasts
2025-Jul-05, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03432-5
PMID:40616092
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学技术解析宫颈癌肿瘤免疫微环境中成纤维细胞的异质性及其功能 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和反卷积分析系统鉴定宫颈癌中6种成纤维细胞亚型，发现C0 MYH11+成纤维细胞通过MDK-SDC1信号轴在肿瘤进展中的关键作用 | 研究结果仅部分揭示了CAFs在宫颈癌免疫微环境中的可能作用，需要进一步验证 | 探索宫颈癌肿瘤免疫微环境中成纤维细胞的异质性及其在肿瘤进展和治疗抵抗中的作用 | 宫颈癌组织样本和细胞系 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,反卷积分析,伪时间轨迹映射,荧光激活细胞分选,多重免疫荧光,免疫组织化学 | 预后模型 | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,批量RNA测序数据,图像数据 | 人类宫颈癌组织样本和培养细胞 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 17 | 2025-11-30 |
Ex vivo model of functioning human lymph node reveals role for innate lymphocytes and stroma in response to vaccine adjuvant
2025-Jul-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115938
PMID:40608517
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研究论文 | 本研究开发了一种功能性人类淋巴结体外模型，用于探索疫苗佐剂在淋巴组织中的免疫激活机制 | 首次建立保留完整组织结构的人类淋巴结切片模型，结合单细胞转录组学和多重成像技术揭示先天淋巴细胞和基质细胞在疫苗佐剂反应中的新作用 | 使用体外模型可能无法完全模拟体内免疫反应的复杂性 | 阐明人类免疫系统对疫苗佐剂的早期炎症反应机制 | 人类淋巴结组织 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学, 多重成像 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2025-11-29 |
Deciphering the molecular mechanism of YY1/HIF1A modulating ovarian cancer angiogenesis based on single-cell transcriptomics technology
2025 Jul-Dec, Mutation research
DOI:10.1016/j.mrfmmm.2025.111916
PMID:41072350
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术揭示了YY1通过调控FBXW7/HIF1A轴促进卵巢癌血管生成的具体分子机制 | 首次发现YY1通过竞争性结合FBXW7来稳定HIF1A表达，从而促进卵巢癌血管生成基因转录激活的新机制 | 研究主要基于体外实验，缺乏体内动物模型验证 | 深入探究YY1在卵巢癌血管生成中的作用机制 | 卵巢癌肿瘤样本和癌旁样本 | 单细胞转录组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析，共免疫沉淀，染色质免疫沉淀，双荧光素酶报告基因检测，qRT-PCR，血管生成实验，Western blotting | NA | 单细胞转录组数据 | 从GEO数据库下载的卵巢癌肿瘤和癌旁样本单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2025-11-27 |
Heterochronic parabiosis uncovers AdipoR1 as a critical player in retinal rejuvenation
2025-Jul-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv6642
PMID:40668916
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研究论文 | 本研究通过异时共生模型结合单细胞RNA测序技术，揭示AdipoR1在视网膜年轻化过程中的关键作用 | 首次通过异时共生模型系统分析视网膜衰老的转录组变化，并鉴定AdipoR1-AMPK信号通路作为视网膜年轻化的核心机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类视网膜中验证 | 探索视网膜衰老的分子驱动因素并鉴定抗衰老靶点 | 年轻、年老及异时共生配对小鼠的视网膜组织 | 单细胞转录组学 | 视网膜衰老 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻、年老及异时共生配对小鼠视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2025-11-26 |
Cannabidiol exerts anti-inflammatory effects but maintains T effector memory cell differentiation: A Single-Cell Study in Humans
2025-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.30.667742
PMID:40766582
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研究论文 | 通过单细胞研究探讨大麻二酚在人类中的抗炎作用及其对T效应记忆细胞分化的影响 | 首次在人体研究中结合单细胞RNA测序和流式细胞术分析大麻二酚对免疫细胞的调节作用 | 样本量较小（23名参与者），缺乏长期随访数据 | 评估大麻二酚对人类外周免疫细胞分布和功能的调节作用 | 23名接受口服大麻二酚治疗的人类参与者 | 免疫学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,细胞因子检测,串联质谱 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞术数据,蛋白质浓度数据 | 23名人类参与者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |