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当前共找到 741 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-10-06 |
A spatial atlas of chemoradiation therapy in pancreatic cancer identifies cellular and microenvironmental determinants of persister populations
2025-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.20.660757
PMID:40667350
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研究论文 | 本研究构建了胰腺癌放化疗的空间图谱，揭示了耐受性细胞群体的细胞和微环境决定因素 | 开发了新型统计方法SpaCCI解析空间细胞互作，首次发现CXCL12/TGFβ驱动的耐受细胞生态位及其对铁死亡和铜死亡途径的抵抗机制 | 样本量相对有限（50例患者样本），空间转录组数据存在细胞类型混合的技术局限 | 阐明胰腺导管腺癌对放疗的适应性机制和细胞间相互作用 | 胰腺导管腺癌患者样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | SpaCCI统计模型 | 转录组数据, 空间数据 | 50例患者样本（16例纵向匹配单细胞RNA测序，34例空间转录组样本） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 162 | 2025-10-06 |
The transcriptome of playfulness is sex biased in the juvenile rat medial amygdala: A role for inhibitory neurons
2025-Jun-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115782
PMID:40478737
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索了幼年大鼠内侧杏仁核中游戏行为的性别差异转录组特征 | 首次揭示了游戏行为相关转录组在内侧杏仁核中的性别特异性表达模式，并确定抑制性神经元是驱动这种性别差异的关键细胞类型 | 研究仅针对大鼠模型，结果在其他物种中的普适性需要进一步验证 | 探索游戏行为在内侧杏仁核中的分子机制和性别差异基础 | 幼年大鼠的内侧杏仁核组织 | 神经科学, 转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 整合生物信息学分析 | NA | 转录组数据 | 新生和幼年大鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 163 | 2025-10-06 |
Immunosuppressive Tumor Microenvironment of Osteosarcoma
2025-Jun-24, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17132117
PMID:40647416
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析骨肉瘤的免疫微环境特征 | 首次在骨肉瘤中系统鉴定免疫抑制细胞群体并揭示MDSCs通过NF-κB通路促进免疫抑制微环境的机制 | 样本量较小（12个单细胞RNA测序样本），需要更大队列验证 | 解析骨肉瘤免疫微环境的组成和功能 | 骨肉瘤肿瘤活检样本 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 细胞-细胞通讯模型 | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | 12个骨肉瘤活检样本（6个新测序+6个已发表） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 164 | 2025-10-06 |
Developmental Plasticity and Stromal Co-option Shape a Pituitary Neuroendocrine Tumor Transcriptional Continuum
2025-Jun-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.18.659743
PMID:40666832
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研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学解析垂体神经内分泌肿瘤的发育可塑性和微环境相互作用 | 发现垂体神经内分泌肿瘤存在跨越亚型的转录连续谱，挑战传统离散分类；揭示肿瘤细胞共用了正常成体神经内分泌细胞的细胞通讯网络 | 样本来源仅限于人类正常垂体和垂体神经内分泌肿瘤，未涉及其他物种或更广泛的肿瘤类型 | 解析垂体神经内分泌肿瘤的细胞起源、分子异质性和微环境相互作用 | 人类正常垂体和垂体神经内分泌肿瘤组织 | 数字病理学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 419,874个细胞 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 165 | 2025-10-06 |
Cerebellum metastasis model of HER2-positive breast cancer unveils key role of IL34-induced Arg1+ macrophages
2025-Jun-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.17.660224
PMID:40666928
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研究论文 | 本研究通过建立HER2阳性乳腺癌小脑转移模型，揭示了IL34诱导的Arg1+巨噬细胞在脑转移中的关键作用 | 首次开发了免疫活性小鼠的HER2阳性乳腺癌小脑转移模型，并发现癌细胞产生的IL34通过诱导Arg1+巨噬细胞促进脑转移生长 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探究HER2阳性乳腺癌小脑转移的分子机制及治疗策略 | HER2阳性乳腺癌小鼠模型和小脑转移灶 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学，MRI，光学成像 | 小鼠移植瘤模型 | 基因表达数据，影像数据 | 未明确说明 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 166 | 2025-10-06 |
The Human LRRK2-R1441G Mutation Drives Age-Dependent Oxidative Stress and Mitochondrial Dysfunction in Dopaminergic Neurons
2025-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.16.660029
PMID:40667152
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研究论文 | 本研究探讨LRRK2-R1441G突变如何通过年龄依赖性方式导致多巴胺神经元线粒体功能障碍和氧化应激 | 首次结合BAC转基因小鼠模型和线粒体靶向氧化还原成像技术，揭示LRRK2突变引起年龄依赖性线粒体功能衰退的机制 | 研究基于转基因小鼠模型，与人类帕金森病存在物种差异 | 探究LRRK2-R1441G突变对中脑多巴胺神经元线粒体功能的影响 | BAC转基因小鼠模型中的中脑多巴胺神经元 | 神经科学 | 帕金森病 | 双光子成像、空间转录组学、线粒体靶向氧化还原成像 | BAC转基因小鼠模型 | 图像、基因表达数据 | 3、6、10月龄小鼠脑切片 | NA | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx数字空间分析仪 |
| 167 | 2025-10-06 |
OrgaCCC: Orthogonal graph autoencoders for constructing cell-cell communication networks on spatial transcriptomics data
2025-Jun, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013212
PMID:40577399
|
研究论文 | 提出一种基于正交图自编码器的空间转录组数据细胞间通讯网络构建方法 | 使用两个正交耦合的变分图自编码器分别捕获细胞/点和基因维度特征，并通过最大化重建特征相似性进行整合 | NA | 从空间转录组数据推断细胞间通讯网络 | 细胞间通讯机制 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 变分图自编码器 | 基因表达谱，空间位置数据 | 五个空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 168 | 2025-10-06 |
Deciphering cholangiocarcinoma heterogeneity and specific progenitor cell niche of extrahepatic cholangiocarcinoma at single-cell resolution
2025-Jun-23, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-025-01716-z
PMID:40551145
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学方法揭示胆管癌的分子异质性及肝外胆管癌特异性祖细胞生态位 | 首次在单细胞分辨率下系统比较肝内和肝外胆管癌的肿瘤生态系统差异，发现肝外胆管癌特有的LY6D+基底样癌细胞亚群及其ISG15富集的微环境 | 样本量相对有限（28个样本），需要更大规模研究验证发现 | 解析胆管癌异质性并识别肝外胆管癌特异性祖细胞生态位 | 胆管癌患者组织样本（包括慢性胆道炎症和不同解剖部位胆管癌） | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序,空间RNA原位测序,多组学分析,组织微阵列,患者来源类器官,小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,多组学数据 | 109,071个单细胞来自28个样本（7个慢性胆道炎症,21个胆管癌） | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 169 | 2025-10-06 |
[Biological characteristics of liver zonation and its role in disease and aging]
2025-Jun-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
|
综述 | 本文总结了肝脏分区代谢特征在维持肝功能中的重要作用及其与疾病和衰老的关系 | 整合单细胞基因组学和空间转录组学新技术揭示肝脏分区在疾病与衰老中的作用机制 | NA | 探讨肝脏分区的生物学特性及其在疾病和衰老过程中的作用 | 肝脏细胞沿门静脉-中央静脉轴的异质性 | 空间转录组学 | 肝脏疾病 | 单细胞基因组学, 空间转录组学 | NA | 基因组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 170 | 2025-10-06 |
Two Specialized Intrinsic Cardiac Neuron Types Safeguard Heart Homeostasis and Stress Resilience
2025-Jun-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.13.659555
PMID:40661461
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研究论文 | 通过单细胞转录组学等技术发现心脏内存在两种分子特征不同的神经元亚型，分别负责维持心脏稳态和应激韧性 | 首次在分子水平识别出两种功能特化的心脏内神经元亚型，并阐明其各自在维持冠状动脉灌注和心脏电稳定性中的独特作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类心脏中验证 | 探索心脏内在神经系统的分子和功能组织 | 小鼠心脏内在神经元 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、高分辨率成像、细胞特异性遗传工具 | NA | 基因表达数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 171 | 2025-10-06 |
Stc1-expressing myofibroblasts are a developmentally distinct lineage cleared through intrinsic apoptosis in the neonatal lung
2025-Jun-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.12.659126
PMID:40661545
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研究论文 | 本研究通过建立遗传标记小鼠模型，揭示了表达Stc1的次级嵴肌成纤维细胞(SCMF)是发育过程中独特的细胞谱系，并通过内在凋亡途径在新生儿肺中被清除 | 首次建立了能够特异性标记发育性短暂SCMF的遗传工具，并证明SCMF与肺泡管肌成纤维细胞(DMF)具有不同的祖细胞群和生态位 | 研究主要基于小鼠模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明肺肌成纤维细胞不同谱系在发育和疾病中的独特贡献 | 小鼠肺组织中的次级嵴肌成纤维细胞(SCMF)和肺泡管肌成纤维细胞(DMF) | 发育生物学 | 肺发育疾病 | 单细胞RNA测序, 胚胎谱系追踪, 遗传操作 | 遗传工程小鼠模型 | 基因表达数据, 细胞谱系数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 172 | 2025-10-06 |
ASXL1 truncating mutations drive leukemic resistance to T cell attack
2025-Jun-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.29.656798
PMID:40661385
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研究论文 | 本研究通过整合分子分析和免疫功能研究，揭示了ASXL1截断突变通过抑制HLA-I表达驱动白血病对T细胞攻击产生耐药性的新机制 | 首次发现ASXL1截断突变是DLI耐药性的遗传基础，并阐明其通过Polycomb非依赖性机制抑制HLA-I表达的免疫逃逸通路 | 研究主要基于白血病细胞系K562和有限的患者队列，需要在更广泛的样本中验证 | 鉴定驱动白血病对供体淋巴细胞输注(DLI)产生耐药性的分子机制 | 接受DLI治疗的白血病患者和K562白血病细胞系 | 癌症免疫学 | 白血病 | 全外显子组测序, 靶向突变panel测序, 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, CRISPR基因编辑 | NA | 基因组测序数据, 单细胞转录组数据, 表观遗传数据 | 138,152个骨髓单个髓系细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 173 | 2025-10-06 |
Single-cell multi-omic analysis of mesenchymal cells reveals molecular signatures and putative regulators of lung allograft fibrosis
2025-Jun-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.27.625698
PMID:40661599
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研究论文 | 通过单细胞多组学技术分析肺移植受体间充质细胞的分子特征，揭示肺移植物纤维化的调控机制 | 首次结合单细胞转录组和染色质可及性分析揭示CEBPD作为CLAD相关间充质细胞的关键调控因子 | 样本量有限，早期时间点差异不明显，需要更大队列验证 | 探索肺移植后慢性移植物功能障碍的分子机制 | 肺移植受体的支气管肺泡灌洗液中的间充质细胞 | 单细胞多组学 | 肺移植相关疾病 | 单细胞多组学测序, siRNA敲低, 染色质可及性分析 | 逻辑回归模型 | 单细胞RNA测序数据, 染色质可及性数据 | 肺移植受体支气管肺泡灌洗液样本（含CLAD和非CLAD对照组） | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 174 | 2025-10-06 |
Validation of Fiber-Dominant Expressing Gene Promoters in Populus trichocarpa
2025-Jun-25, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14131948
PMID:40647957
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据和AspWood数据库，鉴定并验证了毛果杨中木质部纤维优势表达基因的启动子 | 首次通过整合单细胞RNA测序和AspWood数据库系统鉴定毛果杨木质部纤维优势表达基因启动子，并创建了启动子::GUS转基因杨树进行功能验证 | 研究仅针对毛果杨这一树种，未在其他树种中验证启动子的保守性和功能 | 鉴定和验证适用于林木育种的木质部纤维特异性基因启动子 | 毛果杨（Populus trichocarpa）的基因启动子和转基因植株 | 植物分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 激光捕获显微切割, RT-qPCR, 组织化学GUS染色 | NA | 基因表达数据, 组织图像 | 32个候选基因，最终验证9个基因启动子 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 175 | 2025-10-06 |
A Reproducibility Focused Meta-Analysis Method for Single-Cell Transcriptomic Case-Control Studies Uncovers Robust Differentially Expressed Genes
2025-Jun-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.15.618577
PMID:39463993
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荟萃分析 | 开发了一种专注于可重复性的单细胞转录组病例对照研究荟萃分析方法，用于识别稳健的差异表达基因 | 提出基于跨数据集相对差异表达排序可重复性的非参数荟萃分析方法SumRank | 依赖已发表研究的质量和一致性，可能受原始实验设计差异影响 | 评估单细胞转录组研究中差异表达基因的可重复性并开发改进的识别方法 | 阿尔茨海默病、帕金森病、亨廷顿病、精神分裂症和COVID-19的单细胞RNA测序研究数据 | 生物信息学 | 神经退行性疾病,精神疾病,传染病 | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | 非参数荟萃分析模型 | 基因表达数据 | 多个已发表研究的汇总数据 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 176 | 2025-10-06 |
Defining Keypoints to Align H&E Images and Xenium DAPI-Stained Images Automatically
2025-Jun-30, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14131000
PMID:40643521
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研究论文 | 开发了一种自动生成关键点文件的方法Xenium-Align，用于在Xenium Explorer软件中实现H&E图像和Xenium DAPI染色图像的对齐 | 提出了首个自动生成关键点的方法，替代了需要领域专家手动标记关键点的传统流程 | 方法运行时间效率有待优化，可用性需要进一步提升 | 开发自动图像配准方法，用于空间转录组学研究中的图像对齐 | 人类肾脏样本和皮肤样本，包括健康和疾病状态 | 空间转录组学 | 肾脏疾病,皮肤疾病 | 图像配准,关键点识别 | NA | H&E图像,Xenium DAPI染色图像 | 14个人类肾脏样本和1个人类皮肤样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | 10x Xenium原位空间转录组平台 |
| 177 | 2025-10-06 |
PhytoCluster: a generative deep learning model for clustering plant single-cell RNA-seq data
2025-Jun, aBIOTECH
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s42994-025-00196-6
PMID:40641652
|
研究论文 | 提出了一种名为PhytoCluster的无监督深度学习算法，用于聚类植物单细胞RNA测序数据 | 开发了专门针对植物单细胞RNA测序数据的生成式深度学习聚类模型，在聚类准确性、噪声去除和信号保留方面优于现有方法 | NA | 解决植物单细胞RNA测序数据的高维度、稀疏性和生物噪声等计算挑战 | 植物单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 生成式深度学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | 4个模拟数据集和5个真实scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 178 | 2025-10-06 |
[Analysis of the number, type, and functional heterogeneity of senescent cells in the radiation-induced skin wounds in mice]
2025-Jun-20, Zhonghua shao shang yu chuang mian xiu fu za zhi
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研究论文 | 本研究通过实验和生物信息学分析探讨了辐射诱导小鼠皮肤伤口中衰老细胞的数量、类型和功能异质性 | 首次系统揭示了辐射诱导皮肤损伤中多种细胞类型的衰老特征及其功能异质性，发现了衰老细胞积累的剂量和时间依赖性规律 | 研究样本量有限，仅使用转基因小鼠模型，未验证其他动物模型或人类样本 | 探究辐射诱导皮肤伤口中衰老细胞的特征和功能异质性 | p16-diphtheria toxin receptor-tdTomato转基因小鼠和公开的大鼠单细胞转录组数据 | 细胞生物学 | 放射性皮肤损伤 | 免疫荧光法、流式细胞术、单细胞转录组测序、生物信息学分析 | NA | 实验数据、单细胞转录组数据 | 49只转基因小鼠（40只用于主要实验，9只用于流式分析）和公开的大鼠单细胞数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 179 | 2025-10-06 |
Spatial proteo-transcriptomic profiling reveals the molecular landscape of borderline ovarian tumors and their invasive progression
2025-Jun-20, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.06.004
PMID:40578359
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研究论文 | 本研究通过空间蛋白质组-转录组联合分析揭示了卵巢交界性肿瘤的分子景观及其向侵袭性进展的机制 | 首次整合细胞类型分辨的空间蛋白质组学和转录组学技术，系统解析卵巢交界性肿瘤向低级别浆液性癌的演进过程 | 样本量有限，需要更大规模研究验证发现 | 阐明卵巢交界性肿瘤向低级别浆液性癌侵袭性进展的分子机制 | 卵巢浆液性交界性肿瘤(SBT)和低级别浆液性癌(LGSC)患者组织样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 空间蛋白质组学, 空间转录组学 | NA | 空间蛋白质组数据, 空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间蛋白质组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 180 | 2025-10-06 |
Macrophages-derived NRG-1 promotes angiogenesis after ischemic stroke via the Akt-mTOR pathway
2025-Jun-19, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01323
PMID:40537024
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研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞来源的神经调节蛋白-1在缺血性脑卒中后通过Akt-mTOR通路促进血管生成的作用机制 | 首次发现外周血巨噬细胞是脑卒中后神经调节蛋白-1的来源，并阐明其通过Akt/mTOR/VEGF信号通路促进血管生成的神经保护机制 | NA | 探究神经调节蛋白-1在缺血性脑卒中中的来源、功能及分子机制 | 急性缺血性脑卒中患者和短暂性大脑中动脉闭塞小鼠模型 | 神经科学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞测序 | NA | 临床样本数据、动物实验数据 | 急性缺血性脑卒中患者的配对血栓和外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |