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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-10-06 |
MHCIIhiLYVE1loCCR2hi Interstitial Macrophages Promote Medial Fibrosis in Pulmonary Arterioles and Contribute to Pulmonary Hypertension
2025-Jun-20, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326173
PMID:40357547
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研究论文 | 本研究揭示了MHCIIhiLYVE1loCCR2hi间质巨噬细胞通过WNT11/PCP通路促进肺动脉中膜纤维化并导致肺动脉高压的机制 | 首次鉴定出MHCIIhiLYVE1loCCR2hi间质巨噬细胞亚群在肺动脉中膜纤维化中的关键作用,并阐明其通过WNT11/平面细胞极性通路促进肺动脉平滑肌细胞向成纤维细胞样表型转化的分子机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,人类样本验证相对有限,且未涉及其他肺动脉高压亚型的验证 | 探究间质巨噬细胞浸润与肺动脉纤维化在肺动脉高压中的关联机制 | 特发性肺动脉高压患者肺组织样本、实验性肺动脉高压动物模型、间质巨噬细胞和肺动脉平滑肌细胞 | 病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序,谱系追踪,组织学分析,细胞共培养,转基因动物实验 | NA | 基因表达数据,组织图像数据,细胞表型数据 | 特发性肺动脉高压患者和实验动物肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 162 | 2025-10-06 |
Dissecting the liver inflammation ecosystem identifies annexin A1 as a pro-resolving target for liver failure
2025-Jun-12, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001427
PMID:40560812
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研究论文 | 本研究通过多组学技术解析慢加急性肝衰竭的免疫微环境,发现膜联蛋白A1可作为促进炎症消退的治疗靶点 | 首次系统描绘ACLF肝脏免疫图谱,发现CCL4+中性粒细胞亚群驱动持续炎症,并鉴定ANXA1-FPR1轴作为关键负反馈机制 | 临床样本量有限,机制研究主要依赖体外实验和动物模型 | 解析慢加急性肝衰竭的免疫特征并寻找治疗靶点 | 慢加急性肝衰竭患者肝脏组织及免疫细胞 | 数字病理 | 肝衰竭 | 单细胞RNA测序,空间转录组测序,批量RNA测序,生物信息学分析 | NA | 基因表达数据,空间定位数据 | ACLF患者与对照组的肝脏组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 163 | 2025-10-06 |
Serum amyloid A1-induced intrahepatic regulatory T-cell dysfunction drives autoimmune hepatitis progression
2025-Jun-09, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001419
PMID:40489740
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现自身免疫性肝炎中肝内调节性T细胞功能失调,并揭示血清淀粉样蛋白A1通过Toll样受体2介导这一过程 | 首次揭示肝内Treg细胞在AIH中功能失调的具体机制,发现SAA1通过TLR2通路损害Treg功能,并提出靶向SAA1的治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型,人类AIH中Treg功能失调机制需进一步验证 | 探究自身免疫性肝炎中调节性T细胞功能失调的机制及治疗策略 | 小鼠模型中的调节性T细胞和自身免疫性肝炎病理过程 | 免疫学 | 自身免疫性肝炎 | 单细胞RNA测序,流体动力学转染,AAV介导的基因治疗 | FoxP3-DTR/eGFP转基因小鼠模型 | 单细胞转录组数据,病理学数据 | 未明确样本数量的小鼠模型 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 164 | 2025-10-06 |
Deficient FANCL Predisposes Endothelial Damage: A New Therapeutic Target for Pulmonary Hypertension
2025-Jun-06, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202408-1655OC
PMID:40479584
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研究论文 | 本研究揭示了FANCL缺陷通过导致内皮细胞DNA损伤和BMP/TGF-β信号通路失衡促进肺动脉高压(PAH)的机制 | 首次发现FANCL缺陷可自发诱发PAH,并证明靶向修复FANCL可成为PAH治疗新策略 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,临床转化需进一步验证 | 阐明FA通路、DNA损伤与PAH之间的相互作用机制 | FANCL基因敲除小鼠、PAH患者肺标本和肺动脉内皮细胞、原代培养肺微血管内皮细胞 | 分子病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序、基因敲除、腺相关病毒基因过表达、转录组分析 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 患者肺标本和内皮细胞、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 165 | 2025-10-06 |
A single-cell spatial chart of the airway wall reveals proinflammatory cellular ecosystems and their interactions in health and asthma
2025-Jun, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02161-3
PMID:40399607
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研究论文 | 本研究应用单细胞空间转录组学揭示了健康与哮喘状态下气道壁的细胞空间分布图谱,发现了促炎性细胞生态系统及其相互作用 | 首次绘制了气道壁的单细胞空间图谱,揭示了健康与哮喘中存在于特定空间微环境中的促炎性细胞生态系统及其独特机制 | NA | 揭示气道壁在健康和哮喘状态下的细胞空间组织特征及促炎性细胞生态系统的相互作用机制 | 健康与哮喘患者的气道壁组织样本 | 空间转录组学 | 哮喘 | 单细胞空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 166 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analyses reveal the mechanism of mitochondrial activity in erectile dysfunction
2025-Jun, Sexual medicine
IF:2.6Q2
DOI:10.1093/sexmed/qfaf049
PMID:40689149
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示线粒体活性在勃起功能障碍中的机制 | 首次在单细胞水平系统表征ED的细胞景观,发现成纤维细胞和内皮细胞中线粒体异质性与ED的关联 | 样本代表性有限且缺乏直接实验验证 | 研究线粒体功能对细胞异质性的影响 | 勃起功能障碍患者样本 | 单细胞组学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 64,993个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 167 | 2025-10-06 |
Iterative transcription factor screening enables rapid generation of microglia-like cells from human iPSC
2025-Jun-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59596-3
PMID:40494892
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研究论文 | 开发了一种迭代高通量单细胞转录因子筛选方法,用于快速将人类iPSC分化为小胶质细胞样细胞 | 提出迭代转录因子筛选方法,可在4天内通过六个转录因子将iPSC分化为小胶质细胞样细胞,并开发了新的计算方法构建基因调控网络 | NA | 开发高效的人类iPSC向特定细胞类型分化的方法 | 人类诱导多能干细胞(iPSC)和小胶质细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,转录因子扰动实验 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 168 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis of Host Responses in Bovine Milk Somatic Cells (bMSCs) Following HPAIV Bovine H5N1 Influenza Exposure
2025-06-03, Viruses
DOI:10.3390/v17060811
PMID:40573402
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析牛乳体细胞在H5N1禽流感病毒暴露后的宿主免疫反应 | 首次对H5N1病毒暴露的牛乳体细胞进行单细胞分析,揭示了乳腺免疫反应向2型免疫转变的动态特征 | 单细胞测序数据中未检测到病毒读数,免疫反应可能仅源于病毒成分暴露而非生产性感染 | 理解牛乳腺对H5N1病毒暴露的宿主免疫反应机制 | 体外暴露于H5N1病毒的牛乳体细胞(bMSCs) | 单细胞组学 | 禽流感 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 169 | 2025-10-06 |
Redefining macrophage phenotypes after spinal cord injury: An open data approach
2025-Jun, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2025.115222
PMID:40113007
|
研究论文 | 通过整合分析三个公开的单细胞RNA测序数据集,重新定义了脊髓损伤后巨噬细胞表型的异质性 | 采用无偏倚的数据整合方法,首次在三个独立数据集中一致识别出四种保守的巨噬细胞群体 | 研究仅聚焦于7天损伤时间点的年轻雌性小鼠模型,未涵盖其他时间点或不同性别/年龄的动物 | 重新定义脊髓损伤后巨噬细胞的表型异质性 | 脊髓损伤后小鼠脊髓组织中的巨噬细胞 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | Seurat, SingleR | 单细胞基因表达数据 | 三个独立研究团队的公开数据集,样本来自接受中胸段脊髓挫伤的年轻雌性小鼠7天损伤时间点 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 170 | 2025-10-06 |
scRNA-seq reveals transcriptional plasticity of var gene expression in Plasmodium falciparum for host immune avoidance
2025-Jun, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-025-02008-5
PMID:40379932
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示恶性疟原虫var基因表达的可塑性及其在宿主免疫逃避中的作用 | 首次在单细胞水平证明恶性疟原虫除了单等位基因var基因表达外,还能同时表达多个var基因或进入低/无表达状态 | 研究仅使用了3D7和IT4两个克隆寄生虫系,可能需要更多寄生虫株验证 | 探究恶性疟原虫var基因表达机制及其在免疫逃避中的作用 | 恶性疟原虫克隆株3D7和IT4 | 单细胞生物学 | 疟疾 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 两个克隆寄生虫系(3D7和IT4) | NA | 单细胞RNA-seq | 便携式微孔系统 | 使用富集探针和便携式微孔系统的单细胞转录组学技术 |
| 171 | 2025-10-06 |
A spatial transcriptomic atlas of the host response to oropharyngeal candidiasis
2025-Jun-30, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00849-25
PMID:40586608
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研究论文 | 利用空间转录组学技术构建宿主对口腔念珠菌病免疫反应的细胞图谱 | 首次通过空间转录组学揭示口腔念珠菌感染微环境中2型免疫反应和M2巨噬细胞的平衡作用,发现新型富含脯氨酸抗菌蛋白家族 | 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探索口腔念珠菌病感染环境中免疫平衡机制 | 小鼠口腔念珠菌感染模型中的舌组织 | 空间转录组学 | 口腔念珠菌病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组技术 |
| 172 | 2025-10-06 |
Protocol for deep-learning-driven cell type label transfer in single-cell RNA sequencing data
2025-Jun-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103768
PMID:40232935
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研究论文 | 介绍使用SIMS工具进行单细胞RNA测序数据中细胞类型标签转移的详细操作流程 | 提出了一个基于深度学习的标准化协议,用于单细胞RNA测序数据中的细胞类型标签转移,支持多种使用方式 | NA | 开发单细胞RNA测序数据中细胞类型标签转移的标准化操作流程 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 173 | 2025-10-06 |
Identifying condition-related cell-cell communication events using supervised tensor analysis
2025-Jun-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.15.571918
PMID:38168391
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研究论文 | 开发了一种名为STACCato的监督张量分析工具,用于识别与生物条件相关的细胞间通讯事件 | 首次将监督张量分析方法应用于细胞间通讯研究,能够同时调整混杂因素和考虑CCC事件间的依赖关系 | 方法主要基于scRNA-seq数据,可能不适用于其他类型的数据 | 开发统计方法来识别与生物条件相关的细胞间通讯事件 | 细胞间通讯事件 | 生物信息学 | 狼疮,自闭症 | 单细胞RNA测序 | 张量回归模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 174 | 2025-10-06 |
Radiotherapy promotes cuproptosis and synergizes with cuproptosis inducers to overcome tumor radioresistance
2025-Jun-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.03.031
PMID:40215978
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研究论文 | 本研究揭示了放疗通过调控铜代谢诱导铜死亡的新机制,并提出联合铜离子载体治疗可克服肿瘤放疗抵抗 | 首次发现放疗可诱导铜死亡,阐明其通过上调CTR1和耗竭谷胱甘肽的分子机制,并鉴定BACH1-MT1E/X轴是放疗抵抗的关键调控通路 | 研究主要聚焦于食管癌模型,未验证其他癌种中的普适性 | 探索放疗与铜死亡的关联机制,开发克服肿瘤放疗抵抗的新策略 | 食管癌细胞系、患者肿瘤样本、细胞系来源和患者来源的异种移植模型 | 肿瘤生物学 | 食管癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 放疗不敏感患者的食管肿瘤样本及多种实验模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 175 | 2025-10-06 |
Habitual Exercise Modulates Neuroimmune Interaction to Mitigate Aortic Stiffness
2025-Jun-06, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325656
PMID:40304034
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研究论文 | 本研究探讨了习惯性运动通过调节神经免疫相互作用缓解血管紧张素II诱导的主动脉硬化的机制 | 首次揭示了运动通过β2-肾上腺素能受体调节巨噬细胞与交感神经的相互作用,进而抑制成纤维细胞活化和细胞外基质沉积的新机制 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体验证;神经免疫相互作用的详细分子通路仍需进一步阐明 | 探究运动如何调节交感神经与免疫细胞的相互作用以缓解主动脉硬化 | C57BL/6小鼠模型,包括野生型、Ccr2敲除小鼠和Col1a1-tdT报告基因小鼠 | 心血管生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色,神经化学去神经术,细胞通讯分析 | 动物模型 | 基因表达数据,蛋白质表达数据,生理测量数据 | 未明确样本数量的小鼠实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 176 | 2025-10-06 |
Transcriptomic profiling after B cell depletion reveals central and peripheral immune cell changes in multiple sclerosis
2025-Jun-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI182790
PMID:40067358
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索B细胞耗竭疗法如何调节多发性硬化症患者的免疫景观 | 首次使用单细胞RNA测序全面分析B细胞耗竭治疗后中枢和外周免疫细胞的变化,揭示细胞类型特异性重编程 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 | 研究B细胞耗竭疗法对多发性硬化症患者免疫系统的调节机制 | 多发性硬化症患者在接受B细胞耗竭治疗前后的脑脊液和外周血免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 177 | 2025-10-06 |
Mesenchymal stem/stromal cell therapy improves immune recovery in a feline model of severe coronavirus infection
2025-Jun-25, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szaf025
PMID:40659357
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研究论文 | 评估同种异体间充质干细胞联合抗病毒治疗在猫传染性腹膜炎中的安全性和有效性 | 首次在自然发生的猫冠状病毒感染模型中证明MSC疗法能促进免疫恢复,揭示PDGF-bb在淋巴细胞恢复中的潜在作用 | 研究结束时仍存在残余细胞因子升高,样本量未明确说明 | 评估MSC疗法改善严重冠状病毒感染免疫恢复的效果 | 患有渗出性猫传染性腹膜炎的猫 | 免疫学 | 冠状病毒感染 | 单细胞RNA测序,血清细胞因子分析,主成分分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,血液学数据,细胞因子数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 178 | 2025-10-06 |
Regulatory network analysis of Dclk1 gene expression reveals a tuft cell-ILC2 axis that inhibits pancreatic tumor progression
2025-Jun-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115734
PMID:40408246
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示Dclk1基因在胰腺肿瘤中的双相调控机制及保护性簇细胞-ILC2轴 | 首次明确Dclk1+细胞在胰腺肿瘤中的异质性,发现ADM样细胞与簇样细胞的相反作用,并揭示SPIB转录因子和ILC2-CAF旁分泌环路的关键调控机制 | 研究基于小鼠模型,人类胰腺肿瘤中的适用性需进一步验证 | 解析Dclk1基因在胰腺肿瘤进展中的调控网络与细胞功能 | Dclk1报告基因小鼠模型中的胰腺细胞群体 | 单细胞生物学 | 胰腺肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 179 | 2025-10-06 |
Tumor suppressors in Sox2-mediated lung cancers promote distinct cell-intrinsic and immunologic remodeling
2025-Jun-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.171364
PMID:40327401
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研究论文 | 本研究探讨了Trp53和Pten肿瘤抑制因子在Sox2介导的非小细胞肺癌中的协同作用机制 | 首次在Sox2高表达背景下揭示Trp53和Pten缺失对肺癌亚型分化、粘蛋白组成和免疫微环境重塑的协同调控作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证有限 | 阐明肿瘤抑制因子在Sox2介导的肺癌进展中的分子机制 | 非小细胞肺癌小鼠模型和细胞系 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,组织学分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,组织学图像 | 多种基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 180 | 2025-10-06 |
Spatial Multiomics Toward Understanding Neurological Systems
2025-Jun, Journal of mass spectrometry : JMS
IF:1.9Q2
DOI:10.1002/jms.5143
PMID:40360168
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综述 | 本文探讨空间多组学技术在理解神经系统复杂相互作用中的应用与前景 | 提出整合代谢组学、转录组学和蛋白质组学的空间多组学方法,突破传统单组学研究的局限 | 样本制备优化、分子完整性维持和多组学数据整合仍存在挑战 | 通过空间多组学技术增强对神经系统细胞相互作用的理解 | 大脑中的动态生物过程和细胞间相互作用 | 空间多组学 | 阿尔茨海默病,自闭症谱系障碍 | 质谱成像,空间转录组学,空间蛋白质组学,多模态成像 | NA | 空间分子数据,成像数据 | NA | NA | 空间代谢组学,空间转录组学,空间蛋白质组学,多组学整合 | NA | NA |