单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202506-202506] [清除筛选条件]
当前共找到 716 篇文献,本页显示第 141 - 160 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
141 2026-04-12
Alterations in genomic features and the tumour immune microenvironment predict immunotherapy outcomes in advanced biliary tract cancer patients
2025-Jun, British journal of cancer IF:6.4Q1
研究论文 本研究构建了一个多维策略,用于预测晚期胆道癌患者免疫治疗的预后和反应 通过整合基因组特征(如序列熵和突变)与肿瘤免疫微环境(如单细胞转录组数据中的细胞通讯分析),开发了集成模型EM-CXCL10,其预测性能优于传统指标如肿瘤突变负荷 样本量相对较小(60名患者),且部分分析基于公共单细胞数据集(GSE125449),可能限制模型的泛化能力 预测晚期胆道癌患者对免疫治疗(抗PD-1)的反应和预后,以指导个性化临床决策 晚期胆道癌患者 机器学习 胆道癌 520基因面板测序、多重循环细胞因子检测、单细胞转录组测序 LASSO算法、Cox回归 基因组序列数据、细胞因子数据、单细胞转录组数据 60名晚期胆道癌患者,其中30名进行基因面板测序,50名进行细胞因子检测 NA 单细胞RNA-seq NA NA
142 2026-04-09
Guanylate-Binding Proteins Promote Host Defense Against Leishmania major by Balancing iNOS/Arg-1 in Myeloid Cells
2025-Jun-30, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文探讨了鸟苷酸结合蛋白在宿主防御利什曼原虫感染中的作用,通过平衡骨髓细胞中的iNOS/Arg-1表达来促进寄生虫控制 首次揭示了GBPs在皮肤利什曼病中的关键作用,通过调节iNOS和Arg-1的表达平衡来影响寄生虫生长环境,独立于GBPs的寄生虫定位 研究主要基于小鼠模型,未在人类样本中验证;体外实验可能无法完全模拟体内复杂免疫环境 探究GBPs在皮肤利什曼病免疫防御机制中的具体作用 C57Bl/6小鼠、GBPChr3敲除小鼠的骨髓来源巨噬细胞和单核细胞 免疫学 皮肤利什曼病 RNA-Seq、单细胞RNA-Seq NA 基因表达数据 C57Bl/6小鼠和GBPChr3敲除小鼠的骨髓细胞 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
143 2026-04-04
Intrinsic immunosuppressive features of monocytes suppress CAR-T19 through IL-1 pathway modulation in mantle cell lymphoma
2025-Jun-18, Molecular therapy. Oncology
研究论文 本研究揭示了单核细胞通过IL-1通路调节抑制CAR-T19的内在免疫抑制特征,在套细胞淋巴瘤中 首次将IL-1受体拮抗剂识别为M2样巨噬细胞抑制CAR-T19的介质,并作为增强CAR-T19疗效的潜在靶点 研究主要基于临床前模型和ZUMA-2试验样本,需进一步验证在更广泛患者群体中的适用性 探索CAR-T19在套细胞淋巴瘤中失效的机制,并寻找增强其疗效的潜在靶点 套细胞淋巴瘤患者、CAR-T19产品、单核细胞和巨噬细胞 免疫学 套细胞淋巴瘤 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据、临床样本数据 ZUMA-2试验的临床样本及临床前模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
144 2026-04-02
Chromoanagenesis in Osteosarcoma
2025-06-07, Biomolecules IF:4.8Q1
综述 本文综述了染色体灾难性事件(chromoanagenesis)在骨肉瘤中的作用机制及其对肿瘤进展的影响 系统阐述了染色体碎裂和染色体再合成等关键机制如何源于复制应激和DNA修复缺陷,并推动骨肉瘤的基因组不稳定性 针对骨肉瘤的靶向治疗仍难以实现,且基于染色体灾难性事件的临床转化策略尚处探索阶段 阐明染色体灾难性事件在骨肉瘤发生发展中的分子机制,并探索其作为治疗靶点的潜力 骨肉瘤(儿童和青少年中最常见的恶性骨肿瘤)及其相关的基因组重排事件 基因组学 骨肉瘤 下一代测序(NGS)、光学基因组图谱、单细胞测序 NA 基因组数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
145 2026-04-01
Cell-Type Annotation for scATAC-Seq Data by Integrating Chromatin Accessibility and Genome Sequence
2025-06-27, Biomolecules IF:4.8Q1
研究论文 提出了一种名为scAttG的新型深度学习框架,通过整合染色质可及性与基因组序列信息,用于scATAC-seq数据的细胞类型注释 首次将图注意力网络(GATs)与卷积神经网络(CNNs)相结合,同时利用染色质可及性信号和基因组序列特征,解决了现有跨组学和组内方法在数据对齐与批次效应方面的局限性 论文未明确说明模型在跨物种或跨组织类型应用中的泛化能力,也未详细讨论计算资源需求或运行时间效率 开发一种更准确、更稳健的单细胞ATAC-seq数据细胞类型注释方法 单细胞ATAC-seq数据 机器学习 NA scATAC-seq GAT, CNN 基因组序列, 染色质可及性数据 NA NA 单细胞ATAC-seq NA NA
146 2026-04-01
Single cell RNA sequencing shows that cells expressing Sox9 postnatally populate most skeletal lineages in mouse bone
2025-Jun-03, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research IF:5.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和谱系追踪,揭示了小鼠骨骼中Sox9表达细胞在出生后对多数骨骼谱系的贡献 首次证明出生后骨骼中的多种成骨细胞前体均源自Sox9表达祖细胞,并鉴定了一类位于软骨膜和生长板软骨柱之间的独特软骨细胞亚群 研究仅基于小鼠模型,未在人类或其他物种中验证 探究小鼠骨骼生长过程中成骨细胞谱系的细胞来源 小鼠骨骼中的细胞类型,包括生长板软骨细胞、软骨膜细胞和CXCL12富集的网状骨髓基质细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序,谱系追踪 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
147 2026-03-31
Podocyte YAP and TAZ hyperactivation drives glomerular epithelial proliferative diseases in mice and humans
2025-Jun-25, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 本研究通过免疫染色和空间转录组学分析,揭示了足细胞中YAP和TAZ的异常过度激活是驱动肾小球上皮细胞增殖性疾病的共同机制 首次发现足细胞YAP-TAZ过度激活是多种肾小球上皮增殖性疾病的共同驱动因子,为这类疾病提供了统一的致病机制解释 研究主要基于小鼠模型和人类活检样本,需要进一步验证在更广泛人群中的普适性 探究肾小球上皮细胞增殖性疾病的共同致病机制 人类肾活检样本(塌陷性肾小球病和ANCA血管炎诱导的新月体性肾小球肾炎患者)及小鼠模型 数字病理学 肾脏疾病 免疫染色,空间转录组学 NA 图像,空间转录组数据 人类肾活检样本(具体数量未明确说明) NA 空间转录组学 NA NA
148 2026-03-30
Interpretable niche-based cell‒cell communication inference using multi-view graph neural networks
2025-06, Nature computational science IF:12.0Q1
研究论文 本文介绍了一种基于空间转录组学的细胞间通讯推断工具STCase,利用多视图图神经网络识别细胞类型的生态位并揭示生态位特异性通讯事件 提出首个考虑生态位异质性的单细胞/斑点水平细胞间通讯推断方法,通过可解释的多视图图神经网络和CCC感知注意力机制 NA 开发能够捕捉生态位特异性细胞间通讯的计算工具 人类支气管腺体和口腔鳞状细胞癌组织 数字病理学 口腔鳞状细胞癌 空间转录组学 多视图图神经网络 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
149 2026-03-25
Unraveling the cross-talk between a highly virulent PEDV strain and the host via single-cell transcriptomic analysis
2025-06-17, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了一种高毒力猪流行性腹泻病毒(PEDV)毒株与宿主之间的相互作用机制 首次利用单细胞测序技术全面解析PEDV感染后宿主肠道细胞的组成、基因表达和细胞间通讯变化,并发现病毒可在B和T淋巴细胞中启动复制但无法产生感染性子代 研究仅针对一种PEDV毒株,样本量相对有限,且未深入探讨病毒在不同细胞类型中的长期感染动态 探究PEDV与宿主的相互作用机制,以理解病毒致病性和宿主免疫反应 感染PEDV的仔猪空肠细胞,包括上皮细胞、干细胞、免疫细胞等 数字病理学 猪流行性腹泻 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 19,612个空肠细胞,来自PEDV感染和对照仔猪 NA 单细胞RNA-seq NA NA
150 2026-03-24
Rescue of naïve porcine circovirus type 3 and its pathogenesis in CD pigs
2025-06-17, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本研究首次成功拯救了天然猪圆环病毒3型(PCV3),并利用剖腹产仔猪模型阐明了其致病机制,包括病毒复制特征、组织病理学变化及免疫抑制机制 首次通过透射电镜观察到PCV3病毒颗粒,并首次在剖腹产仔猪模型中系统阐明了PCV3的免疫抑制机制,特别是发现Th2细胞减少导致体液免疫受损 研究仅使用剖腹产仔猪模型,未在常规饲养猪只中验证;病毒分离和拯救过程依赖人工合成基因组,可能与天然病毒存在差异 阐明天然PCV3病毒的致病机制和免疫抑制特性 猪圆环病毒3型(PCV3)病毒颗粒、PK-15细胞、剖腹产仔猪(CD pigs) NA 猪圆环病毒感染 病毒拯救、免疫荧光检测、Western blotting、透射电镜、单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 显微镜图像、蛋白质印迹数据、病毒滴度数据、单细胞转录组数据 未明确说明具体动物数量,使用剖腹产仔猪作为感染模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
151 2026-03-24
Dissection of the global responses of mandarin fish pyloric cecum to an acute ranavirus (MRV) infection reveals the formation of serositis and then ascites
2025-06-17, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了急性鳜鱼虹彩病毒感染如何靶向鳜鱼幽门盲囊的浆膜层,引发纤维性浆膜炎,并最终导致严重腹水形成的细胞和分子机制 首次在单细胞分辨率下解析了鳜鱼幽门盲囊对急性虹彩病毒感染的全局反应,明确了病毒驱动的浆膜炎是导致鳜鱼特有严重腹水症状的根本原因 研究主要关注急性感染期的反应,对慢性感染或恢复期的病理过程未作探讨,且实验模型为特定鱼类,结论的普适性有待验证 探究鳜鱼虹彩病毒急性感染导致严重腹水的病理机制 鳜鱼及其幽门盲囊组织 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
152 2026-03-24
Identifying Causal Brain Structures, Genes, and Proteins for Osteoarthritis: A Large-Scale Genetic Correlation Study Based on Brain Imaging-Derived Phenotypes, Transcriptomes, and Proteomes
2025-06-10, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
研究论文 本研究通过整合脑影像衍生表型、转录组和蛋白质组数据,验证了脑结构与骨关节炎风险的遗传相关性,并识别了关键的因果基因和蛋白质 首次大规模整合脑影像表型、脑转录组、脑蛋白质组与骨关节炎GWAS数据,系统探索脑-关节轴的遗传基础,并利用单细胞RNA-seq eQTL数据在细胞类型水平定位因果基因 研究主要基于欧洲人群的遗传数据,结论在其他族群中的普适性需进一步验证;脑蛋白质组样本量相对较小(152例) 验证脑结构与骨关节炎风险的遗传相关性,识别介导该关联的因果基因和蛋白质 骨关节炎患者及对照人群(GWAS样本826,690人)、脑转录组(5,138例)、脑蛋白质组(152例) 生物信息学与遗传学 骨关节炎 全基因组关联研究(GWAS)、连锁不平衡评分回归(LDSC)、孟德尔随机化(MR)、转录组范围关联研究(TWAS)、蛋白质组范围关联研究(PWAS)、单细胞RNA-seq eQTL分析 统计遗传学模型(LDSC、MR、TWAS、PWAS) 遗传汇总统计数据、脑影像衍生表型数据、脑转录组数据、脑蛋白质组数据、单细胞表达数据 GWAS:826,690人;脑转录组:5,138例;脑蛋白质组:152例 NA 单细胞RNA-seq NA NA
153 2026-03-24
Elucidating Cellular Senescence-related Genes in Benign Prostatic Hyperplasia Through Mendelian Randomization and Single-cell RNA Sequencing
2025-06-10, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
研究论文 本研究通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序,识别了与良性前列腺增生(BPH)因果相关的细胞衰老相关基因,并分析了它们在多种前列腺细胞中的表达模式和调控网络 结合孟德尔随机化与单细胞RNA测序,首次系统性地识别了BPH中因果相关的细胞衰老基因,并揭示了跨细胞类型的一致表达模式和核心转录调控网络 研究主要基于欧洲人群的遗传数据(如FinnGen和UKB),可能限制了结果在其他人群中的普适性;单细胞数据样本量未明确说明,可能影响统计效力 识别与良性前列腺增生(BPH)因果相关的细胞衰老基因,并探究其在不同前列腺细胞中的表达和调控机制 良性前列腺增生(BPH)相关的细胞衰老基因及其在前列腺细胞(如成纤维细胞、巨噬细胞、T细胞、上皮细胞)中的表达 生物信息学 前列腺增生 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、共定位分析、单细胞调控网络推断与聚类 NA 遗传数据(eQTL)、单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
154 2026-03-21
Lung endothelial cell heterogeneity in health and pulmonary vascular disease
2025-Jun-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
综述 本文探讨了肺内皮细胞在健康和肺血管疾病中的异质性,重点关注单细胞RNA测序技术带来的新见解 通过单细胞RNA测序技术揭示了肺内皮细胞的新型亚群(如肺泡毛细血管内皮细胞和通用毛细血管内皮细胞)及其在肺动脉高压发病机制中的新通路和机制 作为一篇小型综述,可能未涵盖所有最新研究或技术细节,且依赖于现有文献的总结 综述肺内皮细胞异质性在肺血管疾病(特别是肺动脉高压)中的作用及研究进展 肺内皮细胞 数字病理学 肺动脉高压 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
155 2026-03-14
Multi-omic analyses of the development of obesity-related depression linked to the gut microbe Anaerotruncus colihominis and its metabolite glutamate
2025-06-15, Science bulletin IF:18.8Q1
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了肠道微生物Anaerotruncus colihominis及其代谢产物谷氨酸在肥胖相关抑郁症发展中的关键作用 首次将肥胖相关抑郁症与特定肠道微生物A. colihominis及其谷氨酸代谢联系起来,并通过单细胞RNA测序揭示了Efnb2-Ephb2互作在细胞通讯中的核心作用 研究主要基于动物模型和临床样本的相关性分析,因果关系和具体分子通路仍需进一步验证 探究肥胖相关抑郁症的发病机制,寻找潜在的治疗靶点 肥胖相关抑郁症患者、健康个体、高脂饮食小鼠、无菌小鼠 微生物组学 肥胖相关抑郁症 单细胞RNA测序、粪便微生物移植、多组学分析 NA 微生物组数据、转录组数据、代谢组数据 临床患者与健康个体样本、高脂饮食小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
156 2026-03-13
[Biological characteristics of liver zonation and its role in disease and aging]
2025-Jun-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
综述 本文总结了肝脏分区在维持肝功能中的重要作用及其与疾病和衰老的关系 利用单细胞基因组学和空间转录组学技术深化了对肝脏分区的理解 NA 探讨肝脏分区的生物学特性及其在疾病和衰老中的作用 肝脏细胞,特别是沿门静脉-中央静脉轴的肝细胞 数字病理学 NA 单细胞基因组学,空间转录组学 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
157 2026-03-06
Systematic characterization of the ovarian landscape across mouse menopause models
2025-Jun-15, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究系统比较了三种小鼠绝经模型,通过组织学、血清激素分析、单细胞转录组学和机器学习方法,揭示了卵泡丢失、内分泌紊乱和转录重塑的共性与模型特异性特征 首次系统比较三种小鼠绝经模型(自然衰老、化学诱导卵泡耗竭、遗传模型),并整合单细胞转录组学与机器学习进行多维度表征 研究局限于小鼠模型,人类绝经的分子机制可能存在物种差异 建立绝经研究的临床前模型选择框架,解析卵巢衰老的分子机制 三种小鼠绝经模型(自然衰老、VCD化学诱导、Foxl2单倍体不足遗传模型) 计算生物学 妇科疾病 单细胞RNA测序,机器学习 机器学习方法 转录组数据,组织图像,血清激素数据 多种年龄段的三种小鼠模型群体 NA 单细胞RNA-seq NA NA
158 2026-03-06
SMURF2 Facilitates GAP17 Isoform 1 Membrane Displacement to Promote Mutant p53-KRAS Oncogenic Synergy
2025-Jun-03, Molecular cancer research : MCR IF:4.1Q2
研究论文 本研究揭示了SMURF2通过PPLP基序与GAP17-1相互作用,使其从膜上移位,从而促进突变p53与KRAS的致癌协同作用 首次阐明SMURF2通过识别GAP17-1的PPLP基序导致其膜定位异常,从而维持突变KRAS的GTP结合活化状态,揭示了突变p53与KRAS协同致癌的新机制 研究主要基于细胞系和小鼠模型,临床样本验证相对有限;GAP17-1膜移位的确切分子机制仍需进一步解析 探究突变p53与突变KRAS在胰腺癌中协同致癌的分子机制 胰腺癌细胞系、基因工程小鼠模型、临床胰腺导管腺癌样本 癌症生物学 胰腺癌 单细胞RNA测序、组织微阵列、基因沉默、突变分析 基因工程小鼠模型(iKras*; iKras*, p53*, and p48-Cre; Kras*) 基因表达数据、组织病理数据、临床生存数据 多种胰腺癌细胞系、多个小鼠模型、临床前及临床样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
159 2026-03-06
Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics reveal unique subpopulations of infiltrating macrophages and dendritic cells following AKI
2025-Jun-01, American journal of physiology. Renal physiology
研究论文 本研究结合单细胞RNA测序、空间转录组学和CITE测序技术,揭示了急性肾损伤后肾脏浸润巨噬细胞和树突状细胞的独特亚群及其时空动态特征 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和CITE测序技术,全面解析了AKI后肾脏浸润免疫细胞的时空异质性和动态变化,并发现了KIMs可能重编程表达KRM特征基因的新现象 研究主要基于小鼠缺血再灌注损伤模型,人类样本的验证和临床转化仍需进一步研究 阐明急性肾损伤后肾脏浸润免疫细胞的异质性、时空分布特征及其功能 小鼠肾脏浸润巨噬细胞(KIMs)、肾脏树突状细胞(KDCs)和肾脏驻留巨噬细胞(KRMs) 单细胞组学 急性肾损伤 单细胞RNA测序, 空间转录组学, CITE测序 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 表位数据 未明确样本数量,基于小鼠缺血再灌注损伤模型 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
160 2026-03-04
SpaceBF: Spatial coexpression analysis using Bayesian Fused approaches in spatial omics datasets
2025-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种名为SpaceBF的贝叶斯融合建模框架,用于在空间组学数据中分析分子间的空间共表达模式 开发了首个基于贝叶斯融合方法的框架,能够同时估计局部(位置特异性)和全局(组织范围)的分子共表达,相比现有主要依赖地理空间指标(如双变量莫兰指数和李氏指数)的方法具有更高的特异性和统计效力 未明确说明方法对计算资源的需求或可扩展性限制,也未讨论在超大规模数据集上的应用性能 开发稳健的统计方法来检测空间组学数据中分子对之间的空间变化共表达模式 空间转录组学和空间蛋白质组学数据中的分子(基因、肽段、脂质、N-聚糖)共表达关系 空间组学 癌症(多种类型) 空间转录组学、质谱成像 贝叶斯融合模型 空间组学数据 NA NA 空间转录组学, 空间蛋白质组学 NA NA
回到顶部