单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
101	2025-07-22	A multi-step immune-competent genetic mouse model reveals phenotypic plasticity in uveal melanoma 2025-Jun-07, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.06.04.657841 PMID:40502063	研究论文	开发了一种多步骤免疫能力遗传小鼠模型，用于研究葡萄膜黑色素瘤的表型可塑性	创建了一种新的遗传工程小鼠模型，能够逐步模拟人类葡萄膜黑色素瘤的进展，并保留了免疫能力以研究肿瘤免疫微环境和治疗干预	NA	研究葡萄膜黑色素瘤的生物学特性、候选驱动基因的功能特征以及开发免疫治疗策略	葡萄膜黑色素瘤	肿瘤生物学	葡萄膜黑色素瘤	单细胞RNA测序	遗传工程小鼠模型	基因表达数据	NA
102	2025-07-22	Habitual Exercise Modulates Neuroimmune Interaction to Mitigate Aortic Stiffness 2025-Jun-06, Circulation research IF:16.5Q1 DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325656 PMID:40304034	研究论文	研究探讨了习惯性运动如何通过调节神经免疫相互作用来减轻主动脉硬化	揭示了运动通过调节交感神经与免疫细胞的相互作用来减轻主动脉硬化的新机制	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证	探究运动对主动脉硬化中神经免疫相互作用的调节作用	C57BL/6小鼠	心血管疾病	心血管疾病	单细胞RNA测序，免疫组织化学	小鼠模型	基因表达数据，生理参数	未明确说明具体数量，使用C57BL/6小鼠进行实验
103	2025-07-22	Transcriptomic profiling after B cell depletion reveals central and peripheral immune cell changes in multiple sclerosis 2025-Jun-02, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI182790 PMID:40067358	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，探索了B细胞耗竭疗法如何调节多发性硬化症患者的免疫景观	首次使用单细胞RNA-Seq技术全面分析B细胞耗竭治疗后多发性硬化症患者免疫景观的变化，揭示了特定免疫细胞亚群的转录组特征和功能改变	研究样本量有限，且仅关注了B细胞耗竭治疗的短期效果	探究B细胞耗竭疗法对多发性硬化症患者免疫系统的调节机制	多发性硬化症患者的脑脊液巨噬细胞和外周血单核细胞	免疫学	多发性硬化症	单细胞RNA-Seq	NA	转录组数据	未明确说明样本数量
104	2025-07-21	Mesenchymal stem/stromal cell therapy improves immune recovery in a feline model of severe coronavirus infection 2025-Jun-25, Stem cells translational medicine IF:5.4Q1 DOI:10.1093/stcltm/szaf025 PMID:40659357	研究论文	本研究评估了同种异体间充质干细胞/基质细胞（MSC）疗法联合抗病毒治疗在猫传染性腹膜炎（FIP）中的安全性和有效性	首次在猫传染性腹膜炎模型中证明MSC疗法可增强免疫恢复，并通过单细胞RNA测序揭示免疫 rejuvenation的转录组变化	研究结束时仍存在残余细胞因子升高，表明慢性免疫调节异常特征可能未被完全解决	探索MSC疗法对严重冠状病毒感染引起的免疫功能障碍的改善作用	患有渗出性猫传染性腹膜炎的猫	兽医学与转化医学	冠状病毒感染（猫传染性腹膜炎）	单细胞RNA测序，血清细胞因子分析，流式细胞术	NA	转录组数据，细胞因子数据，免疫表型数据	未明确提及具体样本量（猫传染性腹膜炎患猫）
105	2025-07-21	Regulatory network analysis of Dclk1 gene expression reveals a tuft cell-ILC2 axis that inhibits pancreatic tumor progression 2025-Jun-24, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.115734 PMID:40408246	研究论文	本研究通过Dclk1报告小鼠模型和单细胞RNA测序（scRNA-seq）定义了Dclk1表达细胞，揭示了其在胰腺肿瘤进展中的双重作用	揭示了Dclk1在胰腺肿瘤中的双重作用，并发现了一个保护性的tuft细胞-ILC2轴	未提及具体样本量，且研究结果可能仅适用于特定类型的胰腺肿瘤	研究Dclk1基因表达在胰腺肿瘤进展中的作用	Dclk1表达细胞及其在胰腺肿瘤中的功能	分子生物学	胰腺肿瘤	scRNA-seq	Dclk1报告小鼠模型	RNA测序数据	NA
106	2025-07-21	The glycolytic reaction PGAM restrains Th17 pathogenicity and Th17-dependent autoimmunity 2025-Jun-24, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.115799 PMID:40482033	研究论文	本研究探讨了糖酵解反应PGAM如何调控Th17细胞的致病性及其在自身免疫性疾病中的作用	发现PGAM酶与Th17细胞致病性呈负相关，这与其它糖酵解酶的作用相反	研究主要基于小鼠模型，人类Th17细胞的类似机制需要进一步验证	阐明糖酵解反应对Th17细胞致病性的调控机制	Th17细胞及其在实验性自身免疫性脑脊髓炎中的作用	免疫代谢	自身免疫性疾病	单细胞RNA测序, Compass算法分析	实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)小鼠模型	基因表达数据	NA
107	2025-07-21	Tumor suppressors in Sox2-mediated lung cancers promote distinct cell-intrinsic and immunologic remodeling 2025-Jun-23, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.171364 PMID:40327401	研究论文	本研究探讨了肿瘤抑制基因Trp53和Pten在SOX2介导的非小细胞肺癌（NSCLC）中的协同作用及其对肿瘤微环境的影响	揭示了Trp53和Pten在SOX2介导的NSCLC肿瘤进展中的协同作用，以及它们对肿瘤粘蛋白产生和免疫微环境重塑的影响	研究主要基于小鼠模型，结果在人类患者中的适用性需要进一步验证	探究肿瘤抑制基因Trp53和Pten在SOX2介导的NSCLC中的作用机制	小鼠模型中的非小细胞肺癌（NSCLC）	肿瘤生物学	肺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	小鼠遗传模型	基因表达数据	多种遗传背景的小鼠模型（SNL, SNL-Trp53, SNL-Pten, LN2A）
108	2025-07-21	Spatial Multiomics Toward Understanding Neurological Systems 2025-Jun, Journal of mass spectrometry : JMS IF:1.9Q2 DOI:10.1002/jms.5143 PMID:40360168	research paper	该论文探讨了空间多组学技术在理解神经系统动态生物过程中的应用	结合代谢组学、转录组学和蛋白质组学，提供更全面的分子景观研究	样本制备优化、分子完整性保持以及跨组学数据整合仍存在挑战	通过多模态成像技术增强对神经系统和复杂疾病的理解	大脑中的细胞类型及其相互作用	digital pathology	Alzheimer's disease, autism spectrum disorder	mass spectrometry imaging, spatial transcriptomics, spatial proteomics	NA	image, omics data	NA
109	2025-07-20	The CXCL16/CXCR6 axis is linked to immune effector cell-associated neurotoxicity in chimeric antigen receptor (CAR) T cell therapy 2025-Jun-30, Genome medicine IF:10.4Q1 DOI:10.1186/s13073-025-01498-6 PMID:40588764	研究论文	探讨CXCL16/CXCR6轴在CAR T细胞治疗中免疫效应细胞相关神经毒性综合征(ICANS)中的作用	首次发现CXCR6+ T细胞在ICANS中的富集及其与CXCL16表达髓系细胞的空间关联，为ICANS的发病机制提供了新的分子机制解释	样本量较小(n=11)，且部分数据来自单个死亡病例的尸检组织	阐明CAR T细胞治疗中ICANS的潜在分子机制	接受CAR T细胞治疗后发生ICANS的患者(n=11)及其对照样本	免疫治疗	神经毒性综合征	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、多模态空间转录组学、免疫荧光	NA	外周血和脑脊液样本、尸检脑组织	11例ICANS患者(分级:1级3例，2级4例，3级1例，4级3例)及对照组样本
110	2025-07-20	Regulatory TCRαβ+ Double Negative T Cells Suppress γδ T Cells and Alleviate Colitis 2025-Jun-10, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101553 PMID:40505772	研究论文	研究探讨了调节性TCRαβ+双阴性T细胞（DNT）在结肠炎中的作用及其通过抑制γδ T细胞缓解炎症的机制	揭示了DNT细胞通过E-cadherin和NKG2D增强对γδ T细胞的细胞毒性，从而缓解结肠炎的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类DNT细胞的作用尚需进一步验证	探究调节性DNT细胞在结肠炎中的免疫调节作用及其治疗潜力	小鼠结肠炎模型中的DNT细胞和γδ T细胞	免疫学	炎症性肠病	单细胞RNA测序和细胞过继转移	NA	基因表达数据和细胞表型数据	小鼠模型中的DNT细胞和γδ T细胞群体
111	2025-07-20	Mesenchymal Stem Cells and Fibroblasts Contribute to Microvascular Proliferation in Glioblastoma and are Correlated with Immunosuppression and Poor Outcome 2025-Jun-04, Cancer immunology research IF:8.1Q1 DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0743 PMID:40131028	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了胶质母细胞瘤中的微血管增殖（MVP）机制，揭示了间充质干细胞和成纤维细胞在MVP中的作用及其与免疫抑制和不良预后的关联	首次在胶质母细胞瘤中通过单细胞RNA测序鉴定了与MVP相关的间充质干细胞和成纤维细胞，并发现了PDGFRB作为驱动基因的新作用	研究样本量较小（16例），且仅针对原发性胶质瘤患者	探究胶质母细胞瘤中微血管增殖的机制及其与免疫抑制的关系	16例原发性胶质瘤患者的CD45-CD105+血管/血管周围基质细胞和CD45+CD105±免疫细胞	数字病理学	胶质母细胞瘤	单细胞RNA测序，RNA速度分析，数字空间分析	NA	RNA测序数据	16例原发性胶质瘤患者样本
112	2025-07-20	Transcriptomic profiling of senescence effects on blood-brain barrier-related gene expression in brain capillary endothelial cells in a mouse model of paclitaxel-induced chemobrain 2025-Jun, GeroScience IF:5.3Q1 DOI:10.1007/s11357-025-01561-5 PMID:39976844	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了紫杉醇诱导的脑毛细血管内皮细胞衰老对血脑屏障相关基因表达的影响	首次揭示了紫杉醇通过诱导内皮细胞衰老导致血脑屏障功能障碍的转录组学机制，并发现VTN和PTN通路在衰老状态中的富集	研究仅基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	探究紫杉醇诱导的内皮细胞衰老如何影响血脑屏障完整性的基因表达模式	紫杉醇处理的小鼠脑毛细血管内皮细胞	转录组学	化疗相关认知障碍	scRNA-seq	小鼠模型	转录组数据	紫杉醇处理组和对照组小鼠的脑组织样本
113	2025-07-19	Identification of Prognostic Biomarkers in Gene Expression Profile of Neuroblastoma Via Machine Learning 2025-Jun, Pediatric discovery DOI:10.1002/pdi3.70009 PMID:40666234	research paper	该研究通过机器学习方法识别神经母细胞瘤的预后生物标志物，并探索其与肿瘤微环境和化疗药物的关联	提出了一种基于网络的机器学习方法，整合了批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，发现了11个与神经母细胞瘤预后相关的核心生物标志物	未提及样本量大小，可能影响结果的普遍性	识别神经母细胞瘤的预后生物标志物，探索潜在治疗靶点	神经母细胞瘤的基因表达谱和肿瘤微环境	machine learning	neuroblastoma	RNA-seq, single-cell RNA sequencing	support vector machine	gene expression data	NA
114	2025-07-18	Decoding Cellular Communication Networks and Signaling Pathways in Bone, Skeletal Muscle, and Bone-Muscle Crosstalk Through Spatial Transcriptomics 2025-Jun-12, Research square DOI:10.21203/rs.3.rs-6701121/v1 PMID:40585205	研究论文	通过空间转录组学解码骨骼、骨骼肌及骨肌互作中的细胞通讯网络和信号通路	首次提供了骨骼和骨骼肌之间细胞通讯的空间解析图谱，揭示了新的分子互作机制	研究仅限于小鼠模型，人类样本的验证尚未进行	研究骨骼和骨骼肌之间的分子互作机制及其在疾病中的作用	小鼠的股骨和邻近骨骼肌	空间转录组学	骨质疏松症、肌肉减少症、代谢综合征	10X Genomics Visium 空间转录组分析	NA	空间转录组数据	小鼠的股骨和邻近骨骼肌样本
115	2025-07-17	GPX1 and RCN1 as New Endoplasmic Reticulum Stress-Related Biomarkers in Multiple Sclerosis Brain Tissue and Their Involvement in the APP-CD74 Pathway: An Integrated Study Combining Machine Learning and Multi-Omics 2025-Jun-29, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26136286 PMID:40650067	研究论文	本研究通过整合生物信息学分析、单细胞测序和动物模型验证，鉴定了与多发性硬化症（MS）相关的13个内质网应激（ERS）相关生物标志物，并探讨了它们在APP-CD74通路中的作用	首次结合机器学习算法和多组学方法，鉴定了MS中新的ERS相关生物标志物GPX1和RCN1，并揭示了它们在APP-CD74通路中的参与机制	研究结果主要基于生物信息学分析和动物模型，需要在更大规模的临床样本中进行验证	探索多发性硬化症中内质网应激相关生物标志物的作用机制及其诊断和治疗潜力	多发性硬化症患者脑组织和实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）小鼠模型	生物信息学	多发性硬化症	加权基因共表达网络分析、机器学习算法、单细胞测序	机器学习算法	基因表达数据	未明确说明样本数量，涉及MS患者和EAE小鼠模型
116	2025-07-17	Epidermal γδ T cells, CD8 T cells and macrophages are increased in number in alopecia areata and express BST2 as part of an interferon-driven antiviral gene signature 2025-Jun-28, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.06.26.661822 PMID:40667382	research paper	该研究探讨了斑秃中表皮γδ T细胞、CD8 T细胞和巨噬细胞数量的增加及其表达的BST2作为干扰素驱动的抗病毒基因特征的一部分	确定了表皮γδ T细胞和巨噬细胞在斑秃中的作用，并将BST2定位为干扰素驱动的免疫激活标志物	研究主要基于小鼠模型和公开的单细胞RNA测序数据，人类样本的研究相对有限	阐明斑秃发病机制中其他免疫细胞群的作用	斑秃患者和小鼠模型中的免疫细胞	免疫学	斑秃	单细胞RNA测序（scRNAseq）	NA	基因表达数据	C3H/HeJ小鼠和人类斑秃皮肤样本
117	2025-07-17	Identification of Potential Therapeutic Targets for Coronary Atherosclerosis from an Inflammatory Perspective Through Integrated Proteomics and Single-Cell Omics 2025-Jun-27, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26136201 PMID:40649979	研究论文	通过整合蛋白质组学和单细胞组学数据，从炎症角度识别冠状动脉粥样硬化的潜在治疗靶点	首次通过蛋白质组范围的孟德尔随机化分析结合单细胞RNA测序，识别出与冠状动脉粥样硬化相关的11种蛋白质，并确认其中5种基因在平滑肌细胞中的特异性表达	研究主要基于欧洲人群数据，可能不适用于其他种族群体	识别冠状动脉粥样硬化的炎症相关治疗靶点	冠状动脉粥样硬化患者	生物医学	心血管疾病	孟德尔随机化分析(MR)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、蛋白质组学	NA	蛋白质组数据、单细胞转录组数据	UK-PPP队列(54,219名参与者，2,923种蛋白质)和冰岛队列(35,559名参与者，4,907种蛋白质)
118	2025-07-17	Strain-Specific Tropism and Transcriptional Responses of Enterovirus D68 Infection in Human Spinal Cord Organoids 2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.06.27.661907 PMID:40666885	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了人类脊髓类器官中肠道病毒D68（EV-D68）感染的细胞趋向性和转录反应	首次在人类脊髓类器官模型中揭示了EV-D68不同毒株的细胞趋向性差异及其宿主转录反应	研究仅使用了体外类器官模型，可能无法完全模拟体内感染情况	探究EV-D68感染导致急性弛缓性脊髓炎（AFM）的潜在机制	人类脊髓类器官（hSCOs）	神经生物学	神经系统疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	人类诱导多能干细胞（iPSCs）衍生的脊髓类器官模型	单细胞转录组数据	未明确说明具体样本数量，使用了两种EV-D68毒株（B2和B3）感染的人类脊髓类器官
119	2025-07-17	Uncovering the Regional and Cell Specific Bioactivity of Injectable Extracellular Matrix Biomaterials in Myocardial Infarction through Spatial and Single Nucleus Transcriptomics 2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.06.25.661525 PMID:40667036	研究论文	通过空间转录组学和单核RNA测序技术，研究可注射细胞外基质生物材料在心肌梗死中的区域和细胞特异性生物活性	首次将单细胞和空间分辨转录组学应用于探究生物材料支架在心脏中的治疗活性	未提及具体样本量或实验设计的详细限制	揭示ECM水凝胶在心肌梗死治疗中的区域和细胞特异性生物活性	心肌梗死模型中的细胞外基质生物材料	生物医学工程	心血管疾病	空间转录组学、单核RNA测序	NA	转录组数据	NA
120	2025-07-17	Personalized Gut-Liver Microphysiological System Maps Donor-Specific Tissue-Resident Immunity and Reveals a Conserved Metabolic Crosstalk 2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.05.05.652244 PMID:40667172	研究论文	本研究构建了一个个性化的肠道-肝脏微生理系统（MPS），用于模拟个体特异的组织驻留免疫（TRI）特征，并揭示了一种保守的代谢互作	首次构建了个性化的肠道-肝脏微生理系统，结合原代结肠上皮细胞、肝细胞和自体CD45⁺ TRI细胞，揭示了TRI的个体差异和保守的代谢互作	研究仅涉及两名供体的样本，样本量较小	探索个体特异的组织驻留免疫特征及其在免疫代谢疾病中的作用	肠道和肝脏的组织驻留免疫细胞及其代谢互作	免疫代谢	免疫代谢疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	微生理系统（MPS）	单细胞转录组数据	两名供体的原代结肠上皮细胞、肝细胞和自体CD45⁺ TRI细胞