单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
801	2025-05-17	Single-cell transcriptome analysis identifies subclusters and signature with N-glycosylation in endometrial cancer 2025-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12094-024-03802-z PMID:39589706	research paper	通过单细胞转录组分析鉴定子宫内膜癌中与N-糖基化相关的亚群和特征	首次在子宫内膜癌中利用单细胞RNA测序技术结合非负矩阵分解方法，识别出与N-糖基化相关的恶性细胞亚型，并构建了一个包含8个差异表达基因的预后模型	样本量较小（仅5例患者），且为回顾性研究	阐明N-糖基化相关基因在子宫内膜癌细胞异质性、预后和免疫治疗反应中的作用	子宫内膜癌患者	digital pathology	endometrial cancer	scRNA-seq, NMF, 机器学习算法	非负矩阵分解(NMF), 多种机器学习算法集成	单细胞RNA测序数据	5例子宫内膜癌患者的30,233个细胞
802	2025-05-17	EXPLORING THE POTENTIAL OF BEND7 AS AN IMMUNOMODULATORY BIOMARKER IN SEPSIS THROUGH INTEGRATIVE GENOMIC AND TRANSCRIPTOMIC ANALYSIS 2025-Jun-01, Shock (Augusta, Ga.) DOI:10.1097/SHK.0000000000002529 PMID:39617402	研究论文	通过整合基因组和转录组分析，探索BEND7作为脓毒症免疫调节生物标志物的潜力	首次将BEND7鉴定为脓毒症中参与免疫调节的血小板特异性基因，并揭示了其通过细胞间粘附分子信号通路与免疫细胞（特别是单核细胞和中性粒细胞）的强相互作用	需要进一步实验验证BEND7在脓毒症免疫调节中的具体作用机制	探索脓毒症发病机制中的遗传因素，寻找新的治疗靶点	脓毒症相关基因，特别是BEND7基因	基因组学与转录组学	脓毒症	基于摘要数据的孟德尔随机化方法、全基因组关联研究、表达数量性状位点分析、单细胞RNA测序	NA	基因组数据、转录组数据	多个基因表达数据集（包括独立验证数据集）
803	2025-05-17	Diverse RNA methylation patterns in neutrophils: key drivers in hepatocellular carcinoma 2025-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12094-024-03756-2 PMID:39621240	研究论文	该研究探讨了中性粒细胞中RNA甲基化模式在肝细胞癌（HCC）中的作用及其与肿瘤微环境（TME）的关系	首次在中性粒细胞中识别出高/低RNA甲基化亚型，并开发了新的中性粒细胞RNA甲基化（NRM）评分系统，用于评估TME异质性和临床特征	研究基于单细胞测序数据，样本量可能有限，且需要进一步实验验证TRPM3的功能	探索中性粒细胞RNA甲基化在HCC中的作用及其临床意义	肝细胞癌（HCC）患者的中性粒细胞	肿瘤免疫学	肝细胞癌	单细胞测序、LASSO Cox回归分析	NRM评分系统	单细胞测序数据、lncRNA数据	未明确提及具体样本数量
804	2025-05-17	Biology and Pathophysiology of Placenta Accreta Spectrum Disorder 2025-Jun-01, Obstetrics and gynecology IF:5.7Q1 DOI:10.1097/AOG.0000000000005903 PMID:40209229	review	本文综述了胎盘植入谱系障碍（PAS）的生物学和病理生理学，探讨了其临床挑战和管理策略	整合了单细胞RNA测序和蛋白质组学分析的新兴技术，为PAS的生物标志物和干预途径提供了新见解	未提及具体研究样本量或实验数据，主要基于现有文献综述	理解PAS的病理生理学以指导临床管理和预防策略	胎盘植入谱系障碍（PAS）及其相关的生物学和病理生理学机制	病理生理学	胎盘植入谱系障碍	单细胞RNA测序，蛋白质组学分析	NA	NA	NA
805	2025-05-17	Novel approaches to CAR T cell target identification in acute myeloid leukemia 2025-Jun, Current opinion in pharmacology IF:4.0Q1 DOI:10.1016/j.coph.2025.102524 PMID:40311558	review	本文综述了急性髓系白血病（AML）中CAR T细胞靶点识别的新方法	介绍了结构表面组学识别肿瘤特异性蛋白构象，以及AI驱动的单细胞RNA测序整合多源数据以确定最佳靶点	NA	提高CAR T细胞的特异性并减少对正常组织的副作用，为AML及更广泛的癌症治疗提供更安全有效的途径	急性髓系白血病（AML）	肿瘤免疫治疗	急性髓系白血病	结构表面组学，AI驱动的单细胞RNA测序，细胞表面捕获技术	NA	RNA测序数据，蛋白质构象数据	NA
806	2025-05-17	Spatial Multiomics Toward Understanding Neurological Systems 2025-Jun, Journal of mass spectrometry : JMS IF:1.9Q2 DOI:10.1002/jms.5143 PMID:40360168	research paper	该论文探讨了空间多组学技术在理解神经系统动态生物过程中的应用及其潜力	结合代谢组学、转录组学和蛋白质组学，提供了一种更全面的方法来研究神经系统中的细胞相互作用	样本制备的优化、分子完整性的保持以及跨组学层数据的整合仍面临挑战	通过空间多组学技术增强对神经系统复杂疾病的理解	神经系统中的细胞类型及其相互作用	digital pathology	Alzheimer's disease, autism spectrum disorder	mass spectrometry imaging, transcriptomics, proteomics, metabolomics	NA	image, molecular data	NA
807	2025-05-17	Dissecting Autophagy Gene Expression in Endothelial Cells of Pulmonary Arterial Hypertension at Single-Cell Resolution 2025-Jun, Cardiology research IF:1.4Q3 DOI:10.14740/cr2055 PMID:40370624	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术分析了肺动脉高压（PAH）内皮细胞中自噬相关基因的表达特征，并鉴定了DDIT4作为潜在的生物标志物	首次在单细胞分辨率下解析PAH内皮细胞中自噬相关基因的表达特征，并发现DDIT4作为新的PAH生物标志物	研究主要基于体外模型和生物信息学分析，需要进一步的体内实验验证	探究肺动脉高压内皮细胞中自噬相关基因的表达特征及其在疾病进展中的作用	肺动脉高压患者的内皮细胞	单细胞转录组学	肺动脉高压	scRNA-seq, 高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA), 蛋白质印迹(Western blotting)	NA	单细胞RNA测序数据	NA
808	2025-05-15	Combining Single-Cell RNA Sequencing and Mendelian Randomization to Explore Novel Drug Targets for Parkinson's Disease 2025-Jun, Molecular neurobiology IF:4.6Q1 DOI:10.1007/s12035-025-04700-3 PMID:39890696	研究论文	结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化探索帕金森病的新药物靶点	首次结合scRNA-Seq和MR方法探索T细胞相关基因对帕金森病风险的因果效应，并识别出五个潜在药物靶点	需要进一步的研究和临床试验来验证这些潜在药物靶点的有效性	探索帕金森病的致病机制和潜在治疗靶点	帕金森病患者和健康对照者的外周血T细胞	生物信息学	帕金森病	单细胞RNA测序(scRNA-Seq), 孟德尔随机化(MR), GWAS	NA	基因表达数据	帕金森病患者和健康对照者的外周血T细胞scRNA-Seq数据集
809	2025-05-15	A Case-Driven Multi-Omics Analysis for Longitudinal Ibrutinib Response Evaluation of Patients With Chronic Lymphocytic Leukemia 2025-Jun, European journal of haematology IF:2.3Q2 DOI:10.1111/ejh.14397 PMID:39988467	研究论文	通过多组学方法评估慢性淋巴细胞白血病患者对伊布替尼的长期治疗反应	利用单细胞转录组学等多组学方法，首次在分子水平上探索了伊布替尼治疗期间克隆惰性的机制	研究样本量较小，仅包含两名患者的数据	评估慢性淋巴细胞白血病患者对伊布替尼治疗的长期分子和临床反应	两名接受伊布替尼单药治疗的慢性淋巴细胞白血病患者	数字病理学	慢性淋巴细胞白血病	单细胞转录组学, 多组学分析	NA	DNA和RNA数据	两名患者的血液样本
810	2025-05-14	Exploration of immune cell heterogeneity by single-cell RNA sequencing and identification of secretory leukocyte protease inhibitor as an oncogene in pancreatic cancer 2025-Jun, Environmental toxicology IF:4.4Q1 DOI:10.1002/tox.24200 PMID:38476085	研究论文	通过单细胞RNA测序探索胰腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞异质性，并鉴定分泌性白细胞蛋白酶抑制剂（SLPI）作为胰腺癌的致癌基因	利用单细胞测序技术鉴定了胰腺癌肿瘤微环境中的八种细胞亚群，并揭示了SLPI在胰腺癌中的致癌作用	研究未涉及SLPI作为治疗靶点的临床前或临床试验验证	探索胰腺癌肿瘤微环境的细胞异质性及潜在治疗靶点	胰腺癌肿瘤微环境中的细胞亚群及SLPI基因	数字病理学	胰腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
811	2025-05-14	RETRACTED: Exploring the tumor microenvironment: Chemokine-related genes and immunotherapy/chemotherapy response in clear-cell renal cell carcinoma 2025-Jun, Environmental toxicology IF:4.4Q1 DOI:10.1002/tox.24190 PMID:38488671	research paper	本研究通过分析透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的肿瘤微环境，识别了与化疗/免疫治疗反应相关的趋化因子相关基因，并构建了一个预后模型	构建了一个基于趋化因子相关基因的新型预后模型，并发现IGF2BP3在调节ccRCC对舒尼替尼耐药性中的关键作用	研究主要基于转录组数据，需要进一步的实验验证	探索肿瘤微环境中趋化因子相关基因对ccRCC治疗反应的影响	透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者和细胞系	digital pathology	肾癌	RNA-seq, scRNA-seq, CCK-8, Western blot, RT-qPCR	预后模型	转录组数据	531例批量转录组数据，单细胞RNA测序数据集GSE159115，786-O和A498细胞系
812	2025-05-14	Single-cell analysis of diquat-induced oxidative stress and its impact on organ-specific toxicity 2025-Jun-01, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118246 PMID:40327929	研究论文	通过单细胞/单核RNA测序技术，研究了敌草快（DQ）中毒后小鼠肺、肝和肾在多时间点的氧化应激微环境及其对多器官损伤的影响	首次构建了包含超过27万个细胞的多器官单细胞图谱，揭示了DQ诱导的氧化应激微环境在血管内皮细胞和实质细胞中的核心作用及其通过代谢重编程加剧组织损伤的机制	研究仅基于小鼠模型，未涉及人类样本；未探讨长期暴露于DQ的效应	阐明敌草快中毒导致多器官损伤的病理生理学和复杂分子机制	敌草快中毒小鼠的肺、肝和肾组织	单细胞组学	中毒性疾病	scRNA-seq/snRNA-seq	小鼠模型	单细胞转录组数据	超过27万个细胞（来自不同时间点的肺、肝、肾组织及对照组）
813	2025-05-14	Hypoxia-induced RHCG as a key regulator in psoriasis and its modulation by secukinumab 2025-Jun, APL bioengineering IF:6.6Q1 DOI:10.1063/5.0250742 PMID:40351602	研究论文	本文研究了缺氧诱导的RHCG在银屑病中的关键调控作用及其通过secukinumab的调节机制	揭示了RHCG在缺氧条件下对银屑病发病机制的新作用，并比较了不同治疗方法对RHCG表达的影响	RHCG在银屑病中的具体分子机制尚未完全阐明	探究RHCG在银屑病发病机制中的作用及其治疗潜力	角质形成细胞（KCs）和免疫细胞	生物信息学	银屑病	空间转录组学分析、单细胞转录组学分析、批量数据分析	NA	转录组数据、临床样本数据	未明确说明样本数量
814	2025-05-13	Differences in transcriptome characteristics and drug repositioning of Alzheimer's disease according to sex 2025-Jun-15, Neurobiology of disease IF:5.1Q1 DOI:10.1016/j.nbd.2025.106909 PMID:40220916	研究论文	本研究通过RNA测序和转录组分析，探讨了阿尔茨海默病（AD）患者中性别差异对转录组特征和药物重定位的影响	首次在AD患者的外周血和前额叶皮层组织中系统地研究了性别相关的转录组差异，并预测了性别特异性药物	样本量较小（54名患者），且部分数据来自公开数据库，可能影响结果的普遍性	探索AD患者中性别差异对转录组特征和药物重定位的影响	AD患者、轻度认知障碍（MCI）患者和健康对照者的外周血和前额叶皮层组织	转录组学	阿尔茨海默病	RNA-seq, snRNA-seq, 转录组分析	NA	RNA测序数据	54名患者（包括AD、MCI患者和健康对照者）
815	2025-05-13	IL-4 alters TLR7-induced B cell developmental program in lupus 2025-Jun, Clinical immunology (Orlando, Fla.) DOI:10.1016/j.clim.2025.110472 PMID:40068727	research paper	该研究探讨了IL-4如何改变TLR7诱导的B细胞发育程序，从而影响系统性红斑狼疮（SLE）中的自身抗体形成	研究发现IL-4能够重编程B细胞发育，减少自身抗体和特定B细胞亚群，为SLE治疗提供新思路	研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类SLE患者的临床适用性尚需进一步验证	探究IL-4对TLR7诱导的B细胞发育程序的影响及其在SLE中的作用	BXD2小鼠和SLE患者的B细胞	免疫学	系统性红斑狼疮	单细胞转录组分析	NA	基因表达数据	BXD2小鼠和SLE患者B细胞样本（具体数量未明确说明）
816	2025-05-13	MAP4K4 aggravates microvascular anomalies in diabetic retinopathy in a YTHDF2-dependent manner 2025-Jun, Diabetologia IF:8.4Q1 DOI:10.1007/s00125-025-06398-3 PMID:40072537	research paper	该研究揭示了MAP4K4通过YTHDF2依赖的方式加剧糖尿病视网膜病变中的微血管异常	首次发现MAP4K4通过YTHDF2/MAP4K4/NF-κB轴调控糖尿病视网膜病变的微血管异常，为治疗提供了新靶点	研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，未涉及大规模临床样本验证	探究MAP4K4在糖尿病视网膜病变微血管异常中的作用机制	糖尿病视网膜病变患者的纤维血管膜、db/db小鼠模型和人类原代视网膜内皮细胞	digital pathology	diabetic retinopathy	scRNA-seq	db/db小鼠模型	RNA测序数据、蛋白质表达数据	8例增殖性糖尿病视网膜病变患者的纤维血管膜和11例非糖尿病患者的正常视网膜组织
817	2025-05-13	Intrapancreatic adipocytes and beta cell dedifferentiation in human type 2 diabetes 2025-Jun, Diabetologia IF:8.4Q1 DOI:10.1007/s00125-025-06392-9 PMID:40072535	研究论文	本研究探讨了胰腺内脂肪沉积与2型糖尿病患者β细胞去分化的空间关系及其机制	首次在人类胰腺中证实脂肪含量与β细胞去分化标志物ALDH1A3表达的正相关性，并揭示脂肪细胞通过免疫微环境促进β细胞功能失调的机制	样本量较小（50例器官捐献者），且仅为观察性研究无法确定因果关系	探究2型糖尿病中胰腺脂肪与胰岛β细胞功能障碍的关联机制	人类胰腺组织（15例2型糖尿病患者 vs 35例非糖尿病患者）	糖尿病研究	2型糖尿病	组织学分析、单细胞RNA-seq生物信息学分析	NA	组织切片图像、单细胞转录组数据	50例器官捐献者胰腺样本（15例糖尿病+35例对照），另分析11例糖尿病单细胞RNA-seq数据
818	2025-05-13	Understanding Enzalutamide-Resistance Based on a Functional Single-Cell Approach 2025-Jun, The Prostate DOI:10.1002/pros.24895 PMID:40211483	研究论文	通过单细胞RNA测序和功能实验研究前列腺癌细胞对恩杂鲁胺的耐药机制	发现恩杂鲁胺治疗前存在的AR-low细胞亚群在治疗中被选择并扩增，导致耐药性	研究主要基于细胞系和异种移植模型，未涉及临床患者样本	探索前列腺癌细胞对恩杂鲁胺耐药的分子机制	前列腺癌细胞系LNCaP及其亚群	癌症生物学	前列腺癌	单细胞RNA测序(scRNA-Seq), 基因集富集分析(GSEA), 异种移植模型	NA	RNA测序数据	LNCaP细胞系及其亚群
819	2025-05-13	High-resolution transcriptome analysis on a mouse model of neonatal hypoxic-ischemic encephalopathy using single-nucleus RNA-seq 2025-Jun, Biochemistry and biophysics reports IF:2.3Q3 DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102026 PMID:40342532	research paper	该研究利用单核RNA测序技术对新生儿缺氧缺血性脑病小鼠模型进行了高分辨率转录组分析	首次在HIE研究中应用单核RNA测序技术，揭示了海马区神经元群体的显著减少和小胶质细胞的特定激活	研究仅基于小鼠模型，结果可能需要进一步验证才能推广到人类	深入理解新生儿缺氧缺血性脑病的发病机制	新生儿缺氧缺血性脑病小鼠模型	基因组学	新生儿缺氧缺血性脑病	单核RNA测序(snRNA-seq)	小鼠疾病模型	RNA测序数据	NA
820	2025-05-13	The human endometrium: atlases, models, and prospects 2025-Jun, Current opinion in genetics & development IF:3.7Q2 DOI:10.1016/j.gde.2025.102341 PMID:40154154	综述	本文综述了人类子宫内膜的单细胞转录图谱和模型，探讨了其在研究子宫内膜生物学中的新途径、局限性及未来方向	通过单细胞分析揭示了子宫内膜的多样性和动态性，发现了WNT、NOTCH和TGFβ信号通路的调控作用，并利用先进的体外模型捕捉子宫内膜的细胞异质性和结构	子宫内膜功能障碍的病因学研究不足，影响了有效的诊断和治疗	研究子宫内膜的生物学特性及其功能障碍的机制	人类子宫内膜	生物医学	子宫内膜异位症	单细胞转录组分析	体外模型	转录组数据	NA