单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
61	2025-07-04	The CXCL16/CXCR6 axis is linked to immune effector cell-associated neurotoxicity in chimeric antigen receptor (CAR) T cell therapy 2025-Jun-30, Genome medicine IF:10.4Q1 DOI:10.1186/s13073-025-01498-6 PMID:40588764	research paper	该研究探讨了CAR T细胞疗法中免疫效应细胞相关神经毒性综合征(ICANS)的潜在机制，特别是CXCL16/CXCR6轴在其中的作用	首次揭示了CXCL16/CXCR6轴在招募细胞毒性CAR CD4+T细胞至中枢神经系统中的作用，并发现其与ICANS严重程度相关	样本量较小(n=11)，且部分数据来自单个死亡病例的尸检组织	探究CAR T细胞疗法中ICANS的发病机制	接受CAR T细胞治疗后出现ICANS的患者(11例)及其生物样本	免疫治疗	肿瘤免疫治疗并发症	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、多模态空间转录组学、免疫荧光	NA	外周血和脑脊液样本、尸检脑组织	11例ICANS患者(不同严重程度分级)及对照组患者
62	2025-07-04	Peritoneal cavity-derived GATA6+ macrophages inhibit fibrosis through IL33 in endometrium 2025-Jun-29, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2025.06.088 PMID:40592367	研究论文	本研究通过单细胞测序技术，识别并验证了GATA6+巨噬细胞在子宫内膜损伤修复和抑制纤维化中的关键作用	首次发现腹膜腔来源的GATA6+巨噬细胞通过IL33抑制子宫内膜纤维化的机制	研究样本可能仅限于特定类型的子宫内膜损伤患者，未涉及其他病因的子宫内膜疾病	探究子宫内膜损伤后修复过程中巨噬细胞的来源及其功能机制	正常子宫内膜和宫腔粘连(IUA)患者的子宫内膜组织	生殖医学	宫腔粘连	单细胞测序	NA	单细胞RNA测序数据	未明确提及具体样本数量，但包括正常子宫内膜和IUA患者的样本
63	2025-07-04	The progress and trends of the mechanism of cardiopulmonary bypass-associated acute lung injury: A narrative review 2025-Jun-27, Medicine IF:1.3Q2 DOI:10.1097/MD.0000000000043019 PMID:40587734	综述	本文回顾了心肺转流相关急性肺损伤机制的研究进展与趋势	强调未来研究应聚焦于炎症关键靶点（如中性粒细胞、巨噬细胞和糖萼细胞外衣）以及基因编辑和单细胞测序等先进技术	多年来该领域未取得突破性进展，导致管理策略和临床医学措施停滞不前	揭示心肺转流相关急性肺损伤的潜在机制并寻找有效的预防和治疗策略	心肺转流相关急性肺损伤的机制	临床医学	心血管疾病	基因编辑、单细胞测序	NA	NA	NA
64	2025-07-04	Cardiolipin-mimic lipid nanoparticles without antibody modification delivered senolytic in vivo CAR-T therapy for inflamm-aging 2025-Jun-26, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102209 PMID:40602406	研究论文	本研究开发了一种基于卡迪奥脂类似物的脂质纳米颗粒，用于体内递送senolytic CAR-T疗法，以治疗炎症性衰老相关疾病	首次使用无需抗体修饰的卡迪奥脂类似物脂质纳米颗粒实现体内T细胞转染，并延长mRNA表达时间	未提及临床前研究的样本量及长期安全性数据	开发更高效的体内CAR-T细胞工程递送系统，治疗衰老相关炎症性疾病	T细胞、衰老相关炎症性疾病（如肝纤维化和类风湿关节炎）	生物医学工程	类风湿关节炎、肝纤维化	mRNA递送、单细胞测序	CAR-T	RNA序列数据	NA
65	2025-07-04	Sp140L functions as a herpesvirus restriction factor suppressing viral transcription and activating interferon-stimulated genes 2025-Jun-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2426339122 PMID:40526717	研究论文	该研究揭示了Sp140L作为一种疱疹病毒限制因子，通过抑制病毒转录和激活干扰素刺激基因来发挥作用	首次发现Sp140L作为疱疹病毒的限制因子，并揭示了其在干扰素非依赖性先天免疫反应中的作用	研究主要基于EBV病毒模型，对其他疱疹病毒的普适性需要进一步验证	探究疱疹病毒如何逃避宿主防御机制以及宿主限制因子的作用	EB病毒（EBV）及其与宿主B细胞的相互作用	病毒学	多发性硬化症	单细胞RNA测序	EBNA-LP敲除（LPKO）模型	RNA-seq数据	未明确说明样本数量，使用EBNA-LP敲除感染的B细胞
66	2025-07-04	CRISPR for cystic fibrosis: Advances and insights from a systematic review 2025-Jun-17, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.ymthe.2025.06.021 PMID:40534129	系统综述	本文系统综述了CRISPR技术在囊性纤维化(CF)基因治疗中的应用进展，分析了27篇相关研究文章	通过跨研究比较，分析了多种CRISPR技术对CF致病变异的编辑效果，并提出了标准化报告编辑效率和功能恢复的建议	需要更多单细胞RNA测序和体内研究以达到临床相关结论	为CRISPR基因编辑技术在CF治疗中的进一步探索提供技术见解	囊性纤维化(CF)致病变异	基因编辑	囊性纤维化	CRISPR, 同源定向修复, 碱基编辑, 原始编辑	NA	研究文章	27篇研究文章
67	2025-07-04	Epigenetic Reprogramming of Autophagy Leads to Uncovering a Novel Therapeutic Target for Mutant IDH1 Astrocytomas 2025-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.03.08.584091 PMID:38559270	研究论文	本文揭示了自噬在mIDH1胶质瘤中的关键作用，并提出了通过抑制自噬来增强放射敏感性的新治疗策略	发现自噬是mIDH1胶质瘤生存的关键通路，并证明通过阻断该通路可增强放射敏感性	研究主要基于体外和动物模型，临床转化效果尚需进一步验证	探索mIDH1胶质瘤的治疗新靶点	人类和小鼠的mIDH1胶质瘤细胞	肿瘤学	胶质瘤	RNA-seq, ChIP-seq, scRNA-seq	NA	基因表达数据	人类和小鼠的mIDH1胶质瘤细胞及患者样本
68	2025-07-04	A Molecular, Spatial, and Regulatory Atlas of the Hydra vulgaris Nervous System 2025-Jun-11, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.03.15.531610 PMID:36993575	研究论文	本研究提供了Hydra vulgaris神经系统的最全面分子和空间特征	首次通过单细胞RNA测序鉴定了八种神经元类型，并进一步细分为十五种转录不同的亚型，每种亚型具有独特的空间分布和形态	研究仅针对Hydra vulgaris，结果可能不适用于其他生物	揭示神经系统发育、稳态和再生的分子机制	Hydra vulgaris的神经系统	神经科学	NA	单细胞RNA测序, ATAC-seq	NA	分子数据, 空间数据	NA
69	2025-07-04	Transcriptional landscape of pleural mesothelioma patients in relation to NF2 gene mutational status 2025-Jun-09, Journal of the Egyptian National Cancer Institute IF:2.1Q3 DOI:10.1186/s43046-025-00284-0 PMID:40484892	研究论文	本研究探讨了NF2基因突变状态对胸膜间皮瘤患者转录景观的影响	揭示了NF2突变如何影响肿瘤微环境、免疫浸润、细胞因子信号传导及化疗敏感性	样本量相对较小（82例），且缺乏实验验证	阐明NF2基因突变在胸膜间皮瘤生物学行为和治疗反应中的作用	82例胸膜间皮瘤患者	肿瘤基因组学	胸膜间皮瘤	RNA测序、单细胞RNA测序、生物信息学分析（xCell, Cytosig, pRRophetic）	逻辑回归模型	转录组数据	82例胸膜间皮瘤患者（来自TCGA数据库）
70	2025-07-04	Single-Cell RNA Sequencing of Rabbit Sclera at Different Developmental Stages: Unveiling Scleral Cells Atlas and the Heterogeneity of Fibroblasts 2025-Jun-02, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1 DOI:10.1167/iovs.66.6.83 PMID:40576432	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术构建了兔巩膜发育的单细胞转录组图谱，揭示了成纤维细胞的异质性、分化轨迹、基质组表达模式及细胞间通讯	首次构建兔巩膜发育的单细胞图谱，揭示了成纤维细胞的异质性及跨物种保守特征	研究仅针对新西兰兔，未涉及其他物种或人类样本的直接验证	阐明巩膜成纤维细胞的异质性及发育过程中的分子特征	新西兰兔巩膜组织（胚胎25天及出生后7天、21天、180天）	单细胞转录组学	近视	scRNA-seq	NA	单细胞转录组数据	新西兰兔巩膜组织（E25、P7、P21、P180四个发育阶段）
71	2025-07-04	Elevated Fcy receptor expression augments pro-inflammatory macrophage phagocytosis in systemic sclerosis and associated rheumatic diseases 2025-Jun-01, Rheumatology (Oxford, England) DOI:10.1093/rheumatology/keae688 PMID:39672802	research paper	本研究通过分析系统性硬化症（SSc）和其他风湿性疾病的巨噬细胞激活、信号通路及治疗反应，揭示了增强吞噬作用的机制	发现SSc患者巨噬细胞中FCGR基因表达升高及FcγR介导的吞噬途径富集，并指出FcγRI和FcγRII水平升高是增强吞噬活性和IL-6驱动炎症的关键因素	研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序数据，可能无法完全反映体内复杂的免疫环境	探究SSc及其他风湿性疾病中巨噬细胞的促吞噬表型及其机制	健康对照者及SSc、RA、PsA和axSpA患者的皮肤和肺巨噬细胞	免疫学	系统性硬化症及相关风湿性疾病	scRNA-seq, 流式细胞术, Western blot, RT-qPCR	NA	基因表达数据, 蛋白质数据	来自健康对照者及SSc、RA、PsA和axSpA患者的CD14+单核细胞衍生的巨噬细胞
72	2025-07-04	Lung-resident memory CD4+ T cells are dependent on Batf3 2025-Jun-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950) DOI:10.1093/jimmun/vkaf035 PMID:40184040	研究论文	本文研究了Batf3转录因子在肺组织中CD4+记忆T细胞积累中的作用及其对过敏反应的影响	揭示了Batf3通过促进特定CD4+记忆T细胞亚群的发育来调控过敏性反应的分子机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证	探究肺组织中记忆T细胞积累的细胞和分子机制	小鼠肺组织中的CD4+记忆T细胞	免疫学	哮喘	单细胞RNA测序	小鼠哮喘模型	基因表达数据	Batf3缺陷小鼠和对照小鼠
73	2025-07-03	CD38 ligation in sepsis promotes nicotinamide phosphoribosyltransferase-mediated IL-6 production in kidney stromal cells 2025-Jun-30, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association DOI:10.1093/ndt/gfae269 PMID:39568061	研究论文	本研究通过单细胞和单核RNA测序技术，探讨了CD38连接在脓毒症中对肾脏基质细胞产生IL-6的影响，并提出了NAMPT信号作为治疗靶点的新发现	揭示了CD38连接通过NAMPT信号促进肾脏基质细胞产生IL-6的新机制，并验证了其在人和小鼠脓毒症模型中的一致性	研究主要基于LPS诱导的脓毒症模型，可能无法完全反映其他类型脓毒症的病理过程	阐明CD38连接在脓毒症中的作用机制并寻找新的治疗靶点	小鼠腹膜免疫细胞、LPS诱导的脓毒症模型、人类脓毒症组织	免疫学	脓毒症	scRNA-seq, snRNA-seq	LPS诱导的脓毒症小鼠模型	RNA测序数据、组织学数据	小鼠模型和人类脓毒症组织样本（具体数量未明确说明）
74	2025-07-03	Molecular mechanisms of diquat-induced brain injury: Insights from network toxicology and single-cell RNA sequencing 2025-Jun-30, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118597 PMID:40592154	研究论文	本研究通过整合网络毒理学、单细胞RNA测序和分子对接技术，探讨了敌草快(DQ)诱导脑损伤的分子机制	结合网络毒理学、单细胞RNA测序和分子对接技术，首次系统性地揭示了DQ诱导脑损伤的分子机制	研究主要基于生物信息学分析和体外实验验证，缺乏体内实验数据支持	探究敌草快(DQ)诱导脑损伤的分子机制	敌草快(DQ)及其诱导的脑损伤相关分子靶点	分子毒理学	脑损伤	单细胞RNA测序、分子对接、网络毒理学	NA	基因表达数据	NA
75	2025-07-03	Multi-omics analysis of polyamine metabolism implicates NT5E/CD73 in the progression of pancreatic cancer 2025-Jun-27, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217887 PMID:40582491	研究论文	通过多组学分析探究多胺代谢在胰腺癌进展中的作用，并鉴定NT5E/CD73作为关键调控基因	首次系统性地通过多组学方法（包括转录组和单细胞RNA测序）分析多胺代谢在胰腺癌中的作用，并开发了基于多胺代谢的预后模型（PMscore）	研究主要基于体外和体内功能实验，临床转化潜力尚需进一步验证	探究多胺代谢在胰腺导管腺癌（PDAC）中的全面作用和临床意义	胰腺导管腺癌（PDAC）及其肿瘤微环境（TME）	肿瘤代谢	胰腺癌	bulk transcriptomics, scRNA-seq, 随机森林算法	随机森林算法	转录组数据	未明确提及具体样本数量
76	2025-07-03	CCR1hi/CCL5hi macrophage-mediated CCL5hi T cell chemotaxis in salivary gland aggravates Sjögren's syndrome 2025-Jun-27, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2025.06.076 PMID:40582566	research paper	该研究揭示了CCR1hi/CCL5hi巨噬细胞通过CCL5介导的T细胞趋化作用在唾液腺中加剧干燥综合征(SS)的发病机制	首次揭示了CCR1hi/CCL5hi巨噬细胞通过CCL5介导的T/B细胞顺序浸润在SS发病中的关键作用，并提出了CCR1/CCL5作为潜在治疗靶点	研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本验证仍需扩大样本量	探究CCR1/CCL5在唾液腺淋巴细胞浸润和SS进展中的作用	干燥综合征患者和NOD小鼠的唾液腺组织	免疫学	干燥综合征	scRNA-seq, bulk RNA-seq, mIF	NOD小鼠模型	RNA测序数据, 免疫荧光图像	SS患者和NOD小鼠的唾液腺组织样本
77	2025-07-03	Co-development of mesoderm and endoderm enables organotypic vascularization in lung and gut organoids 2025-Jun-27, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2025.05.041 PMID:40592324	研究论文	通过共分化中胚层和内胚层在同一个球体中，实现了从诱导多能干细胞（iPSCs）生成血管化的肺和肠道类器官	利用BMP信号调节内胚层与中胚层的比例，生成具有组织特异性的内皮和上皮祖细胞，揭示了内皮特异性驱动的关键配体	NA	研究人类器官发生和疾病中复杂的细胞间通讯	肺和肠道类器官	干细胞与再生医学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	NA
78	2025-07-03	Targeting Annexin A2 to reactivate tumor-associated antigens presentation and relieve immune tolerance in liver cancer 2025-Jun-26, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2025-011716 PMID:40571481	研究论文	本研究探讨了靶向Annexin A2在肝癌中重新激活肿瘤相关抗原呈递和缓解免疫耐受的作用	揭示了Annexin A2在肿瘤相关抗原呈递和免疫逃逸中的新机制，并验证了其作为癌症免疫治疗靶点的可行性	研究主要基于体外和动物模型，临床转化效果需进一步验证	探索肝癌免疫逃逸的分子机制并寻找干预措施	肝癌细胞和CD8+ T细胞	癌症免疫治疗	肝癌	CRISPR-Cas9基因敲除、单细胞测序、免疫共沉淀结合液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)	化学和基因诱导的原发性肝癌模型、原位植入肝肿瘤模型	测序数据、质谱数据、细胞实验数据	未明确说明具体样本数量，使用了多种肝癌模型和体外实验
79	2025-07-03	Cell-specific nanoengineering strategy to disrupt tolerogenic signaling from myeloid-derived suppressor cells and invigorate antitumor immunity in pancreatic cancer 2025-Jun-23, Cancer immunology, immunotherapy : CII DOI:10.1007/s00262-025-04096-y PMID:40549154	research paper	开发了一种纳米工程策略，特异性靶向PMN-MDSCs，以破坏其免疫抑制信号并增强胰腺癌的抗肿瘤免疫	利用CXCR2作为PMN-MDSC特异性靶点，设计了CXCR2-NP纳米颗粒，实现了对PMN-MDSCs的特异性药物递送，避免了系统性抑制的副作用	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证其安全性和有效性	开发一种特异性靶向PMN-MDSCs的纳米工程策略，以克服系统性抑制的局限性并增强抗肿瘤免疫	胰腺导管腺癌（PDAC）中的PMN-MDSCs	纳米医学	胰腺癌	单细胞RNA测序，流式细胞术，纳米颗粒工程	KPC小鼠模型	RNA测序数据，流式细胞数据，体内外实验数据	人类和小鼠PDAC样本，治疗初治PDAC患者的外周血细胞
80	2025-07-03	Identification of conserved and tissue-restricted transcriptional profiles for lipid associated macrophages 2025-Jun-23, Communications biology IF:5.2Q1 DOI:10.1038/s42003-025-08387-z PMID:40550904	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，在小鼠和人类多个组织及炎症条件下，分析了脂质相关巨噬细胞（LAMs）的多样性，定义了共享的LAM转录特征及组织特异性基因程序	首次在多组织和炎症条件下系统分析LAMs的转录特征，发现其标记基因在人类炎症中高度保守，为LAMs在疾病中的治疗干预提供了分子靶点	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需进一步扩展	揭示脂质相关巨噬细胞在不同组织和炎症条件下的转录特征，为相关疾病治疗提供靶点	小鼠和人类多个组织中的脂质相关巨噬细胞（LAMs）	免疫学	动脉粥样硬化, 肥胖症, 代谢功能障碍相关脂肪性肝病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	多组织来源的小鼠和人类样本（具体数量未明确说明）