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当前共找到 717 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-05-08 |
Single-cell and spatial omics: exploring hypothalamic heterogeneity
2025-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00231
PMID:38993130
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综述 | 探讨单细胞与空间组学技术在下丘脑异质性研究中的应用与进展 | 系统总结了单细胞与空间转录组学技术在下丘脑复杂细胞类型和空间组织解析中的最新应用价值 | 单细胞/单核RNA测序可能丢失神经元网络的空间信息，且依赖细胞分离步骤 | 阐明下丘脑的细胞异质性和复杂动态细胞组织 | 下丘脑细胞类型与神经网络的分子遗传多样性 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 62 | 2026-05-08 |
Identification of NETs-related genes as diagnostic biomarkers in ischemic stroke using RNA sequencing and single-cell analysis
2025-06, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10117-z
PMID:40107980
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研究论文 | 利用RNA测序和单细胞分析鉴定缺血性卒中中NETs相关基因作为诊断生物标志物 | 首次整合RNA测序和单细胞RNA测序数据，系统鉴定NETs相关基因在缺血性卒中中的诊断标志物，并揭示中性粒细胞通过JAM通路与小胶质细胞和T细胞的细胞间通讯机制 | 基于动物模型（小鼠MCAO）的实验结果，尚需在人体样本中验证；单细胞数据仅证实了Tnf、Selp和Fcgr4在中性粒细胞中的表达，Ceacam3未在单细胞数据中确认 | 阐明NETs在缺血性卒中进展中的作用，并鉴定潜在的生物标志物和治疗靶点 | 小鼠MCAO模型脑组织样本及单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 缺血性卒中 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 小鼠MCAO模型脑组织样本（具体数量未说明） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 63 | 2026-05-08 |
Comprehensive analysis of breast cancer oxidative stress related gene signature: a combination of bulk and single-cell RNA sequencing analysis
2025-06, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10130-2
PMID:40274661
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研究论文 | 基于氧化应激相关基因的预后特征综合分析与乳腺癌预后及免疫状态的关系 | 结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，首次构建氧化应激相关评分（OSRS）模型，并识别出TFAP2B作为关键转录因子 | 研究依赖公共数据库，样本来源有限，需要更多独立数据集验证模型的泛化能力 | 开发基于氧化应激相关基因的预后基因特征，评估乳腺癌患者预后及免疫状态 | 乳腺癌患者样本 | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA-seq | Lasso回归，多变量Cox回归 | 基因表达数据，临床信息 | NA | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | 从UCSC Xena和GEO数据库获取的RNA-seq数据 |
| 64 | 2026-05-06 |
Transcriptomic profiling after B cell depletion reveals central and peripheral immune cell changes in multiple sclerosis
2025-Jun-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI182790
PMID:40067358
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示B细胞耗竭治疗多发性硬化症后中枢和外周免疫细胞的变化 | 首次使用单细胞RNA-Seq全面描绘B细胞耗竭治疗对多发性硬化症患者免疫景观的影响，发现细胞类型特异性的转录组变化 | 未提及 | 探索B细胞耗竭疗法如何调节多发性硬化症患者的免疫景观 | 多发性硬化症患者的脑脊液巨噬细胞和外周血单核细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未提及具体样本量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 65 | 2026-05-05 |
Immune reconstitution following allogeneic hematopoietic cell transplantation and CAR-T therapy: dynamics, determinants, and directions
2025-06, Best practice & research. Clinical haematology
DOI:10.1016/j.beha.2025.101634
PMID:40701740
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综述 | 综述异基因造血干细胞移植和CAR-T治疗后免疫重建的动态过程、决定因素及未来方向 | 综合比较了异基因造血干细胞移植和CAR-T治疗两种情境下免疫重建的动力学特征，并提出了基于先进免疫分析技术（如流式细胞术和单细胞RNA测序）的个性化监测策略 | 未涉及具体患者队列数据，可能缺乏对临床实践中复杂因素的深入量化分析 | 总结免疫重建的动力学知识，评估不同移植和CAR-T治疗方案的影响，探讨优化免疫监测和治疗的个性化策略 | 异基因造血干细胞移植和CAR-T治疗后的患者 | 机器学习 | 血液系统疾病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | NA |
| 66 | 2026-05-03 |
Stromal heterogeneity in the adult lung delineated by single-cell genomics
2025-Jun-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00285.2025
PMID:40353369
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综述 | 通过单细胞基因组学描绘成年肺间质细胞的异质性 | 系统总结了单细胞RNA测序研究揭示的肺间质细胞异质性及其功能特征和空间位置 | 未提及具体局限性 | 综述肺间质细胞异质性的单细胞基因组学研究进展 | 肺间质细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 67 | 2026-05-03 |
IL-32-mediated caspase-43 induction: Shaping macrophage differentiation & immunomodulation in glioblastoma multiforme
2025-06, The Indian journal of medical research
DOI:10.25259/IJMR_382_2024
PMID:40878339
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研究论文 | 研究IL-32在胶质母细胞瘤（GBM）中通过诱导caspase-43表达来调控单核细胞分化、巨噬细胞极化的免疫调节作用 | 首次揭示IL-32通过caspase-43介导单核细胞分化为巨噬细胞，并通过激活NF-κB通路诱导M1向M2表型转换，以及发现IL-32与RNA修饰基因（METTL3、TET2）的表观遗传调控关联 | 未提及具体局限性 | 探究IL-32在GBM中的免疫调节功能，特别是对单核细胞分化和巨噬细胞极化的影响 | 胶质母细胞瘤（GBM）组织和细胞系，以及单核细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 转录组分析、qPCR、蛋白质印迹、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据（基因表达）、单细胞RNA测序数据 | TCGA-GBM和GEO-GSE156902数据集，具体样本量未提及 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA |
| 68 | 2026-05-02 |
Elucidating brain transport pathways and cell type-dependent gene silencing of a durable lipid-siRNA conjugate administered into cerebrospinal fluid
2025-Jun-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf600
PMID:40598893
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研究论文 | 本研究开发了一种脂质-siRNA偶联物（L2-siRNA），注入脑脊液后可有效运输至大脑，实现区域性和细胞类型依赖的基因沉默 | 首次详细阐述了脂质-siRNA偶联物在脑脊液到大脑转运中的特性，展示了单次注射后长达5个月的持续基因沉默效果，并通过单细胞RNA测序构建了细胞类型特异性敲除图谱 | 未提供 | 阐明脂质-siRNA偶联物通过脑脊液给药后的大脑运输途径和细胞类型依赖性基因沉默机制 | 小鼠和大鼠的大脑组织及细胞 | 机器学习 | 神经疾病 | 单细胞RNA测序 | 未提供 | 测序数据 | 小鼠和大鼠样本 | 未提供 | 单细胞RNA测序 | 未提供 | 未提供 |
| 69 | 2026-05-02 |
Single-cell and spatiotemporal profile of ovulation in the mouse ovary
2025-Jun, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3003193
PMID:40554460
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学，构建小鼠卵巢排卵过程中的时空图谱，揭示卵巢细胞类型的时间依赖性转录状态和空间分布 | 首次在单细胞分辨率下详细描述排卵的精确时间窗口，并结合空间转录组学提供细胞类型的空间定位信息，同时发现新的配体-受体互作对 | 该研究仅基于小鼠模型，人类排卵机制可能存在差异，且细胞互作分析需进一步验证 | 揭示小鼠卵巢排卵过程中细胞类型的时空动态变化及其调控机制 | 小鼠卵巢细胞（包括卵母细胞、颗粒细胞、基质细胞等） | 数字病理学 | 生殖疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 多个时间点的小鼠卵巢配对样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 70 | 2026-05-01 |
Combining Machine Learning and Multiplexed, In Situ Profiling to Engineer Cell Type and Behavioral Specificity
2025-Jun-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.20.660790
PMID:40667316
|
研究论文 | 开发了一个结合机器学习与多重原位筛选的平台，用于发现具有细胞类型和行为特异性的增强子 | 创新性地将机器学习引导的增强子优先排序、模块化AAV组装和多重原位筛选整合到一个端到端平台，首次实现了在单一实验中同时筛选多种细胞类型的增强子，并解决了跨物种活性差异和空间细节缺失等关键挑战 | NA | 加速背侧脊髓中增强子的发现，以实现神经回路的精确控制，特别是针对疼痛和瘙痒处理的细胞类型特异性 | 背侧脊髓中的少突胶质细胞和15种背角神经元亚型 | 计算生物学、生物信息学 | 疼痛、瘙痒 | 多重原位筛选、染色质可及性分析、机器学习预测 | 机器学习模型 | 多物种染色质可及性数据、图像数据 | 小鼠体内实验，包含27种增强子AAV文库 | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2026-05-01 |
Construction and validation of a regulatory T cells-based classification of renal cell carcinoma: an integrated bioinformatic analysis and clinical cohort study
2025-Jun, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-01030-9
PMID:39714755
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析和临床队列研究，构建并验证了基于调节性T细胞的肾细胞癌分类系统 | 首次基于调节性T细胞状态相关基因构建肾细胞癌预后分类系统，并结合单细胞RNA-seq与批量RNA-seq数据，发现BATF-LAG3-免疫细胞轴可能是转移相关机制 | 研究基于回顾性临床数据，需前瞻性验证；亚型分类在Xinhua队列中验证，但样本量有限且仅使用免疫组化染色 | 探究调节性T细胞与肾细胞癌异质性的关系，建立预后分类系统以指导个性化治疗 | 肾细胞癌患者的单细胞RNA-seq和批量RNA-seq数据，以及Xinhua队列370例肾肿瘤患者的临床样本 | 机器学习 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫组化染色 | 聚类算法, Monocle2拟时序分析, Cox比例风险回归模型 | 基因表达数据, 临床数据 | 537例TCGA-KIRC队列批量RNA-seq样本及370例Xinhua队列肾肿瘤患者 | Illumina | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | Illumina NovaSeq | TCGA-KIRC队列的批量RNA-seq（Illumina平台）和单细胞RNA-seq数据 |
| 72 | 2026-05-01 |
Lung-resident memory CD4+ T cells are dependent on Batf3
2025-Jun-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf035
PMID:40184040
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研究论文 | 该研究揭示了转录因子Batf3对肺部CD4+常驻记忆T细胞发育的依赖性及其在过敏反应中的作用 | 首次发现Batf3通过影响树突状细胞（cDC1）发育调控肺内CD4+常驻记忆T细胞的形成，并鉴定出表达Cxcr6的细胞亚群 | 仅在小鼠模型中验证，缺乏人类样本数据支持；未详细阐述Batf3调控的分子机制 | 探究肺部常驻记忆T细胞积累的细胞和分子机制 | 小鼠模型（Batf3基因敲除小鼠与野生型小鼠） | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠（具体数量未在摘要中说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 73 | 2026-04-30 |
Redefining macrophage phenotypes after spinal cord injury: An open data approach
2025-Jun, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2025.115222
PMID:40113007
|
研究论文 | 通过开放数据方法重新定义脊髓损伤后巨噬细胞表型 | 利用三种公开单细胞RNA测序数据集进行跨数据集比较，采用无偏分析方法识别出脊髓损伤后四种保守的巨噬细胞群体 | 未提及具体局限性，但可能包括样本仅限于年轻雌性小鼠，且仅分析损伤后7天的时间点 | 利用公开单细胞RNA测序数据重新定义脊髓损伤后巨噬细胞的异质性 | 脊髓损伤后7天的年轻雌性小鼠 | 机器学习 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | Seurat分析流程、SingleR跨数据集比较工具 | 基因表达数据 | 三个独立研究团队的数据集，具体样本量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2026-04-29 |
Diminished and altered cellular senescence response in delayed wound healing of aging
2025-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.08.658533
PMID:40661498
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研究论文 | 研究发现，老年小鼠伤口愈合过程中细胞衰老反应减弱且发生了质变，从有益于愈合的细胞外基质重塑转变为有害的促炎状态，导致伤口闭合延迟 | 首次揭示了衰老相关伤口愈合延迟中，伤口微环境的衰老反应不仅数量减少，而且功能发生了从有益到有害的转变，并利用单细胞RNA测序鉴定出p16/p21/Ki67阳性衰老成纤维细胞的独特亚群 | NA | 探究衰老个体皮肤伤口愈合延迟中细胞衰老反应的变化及其机制 | 幼年和老年小鼠的全层背侧皮肤伤口组织，以及人伤口组织（来自年轻捐赠者） | 机器学习 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 若干幼年和老年小鼠的全层背侧皮肤伤口样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 75 | 2026-04-29 |
Proline mitigates antibiotic resistance evolution induced by ciprofloxacin at environmental concentrations
2025-06-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137561
PMID:39938368
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研究论文 | 发现脯氨酸能够显著缓解环境浓度下环丙沙星诱导的抗生素耐药性进化 | 首次发现脯氨酸可通过调控TCA循环代谢通量降低细菌质子动力势，从而抑制抗生素摄取并减少耐药亚群的形成，且该效应在土壤微宇宙实验中保持了微生物群落多样性 | 基于单一模式菌株（土壤分离大肠杆菌）和短期实验（24天），对其他抗生素和菌群的普适性验证有限 | 探索氨基酸类化合物在环境层面控制抗生素耐药性进化的可行性及机理 | 土壤分离大肠杆菌及土壤微生物群落 | 机器学习 | 传染性疾病 | 转录组学、碳代谢流分析、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据、代谢通量数据、单细胞转录组数据 | 24天进化实验（18种氨基酸筛选）、土壤微宇宙实验（1组最优剂量5 mg/kg） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒用于单细胞RNA-seq分析 |
| 76 | 2026-04-28 |
SOAR elucidates biological insights and empowers drug discovery through spatial transcriptomics
2025-Jun-13, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adt7450
PMID:40498826
|
研究论文 | 提出一个全面的空间转录组学分析平台SOAR，包含3461个统一处理样本，涵盖13个物种、42种组织类型和19种技术 | 首次构建集成多物种、多组织、多平台空间转录组数据的统一分析资源，并展示其在药物发现中的创新应用 | 未明确提及具体局限性，但可能包括数据覆盖的偏倚或分析方法对某些技术平台的适用性 | 通过空间转录组学数据整合与分析，推动生物学发现和药物研发 | 13个物种的空间转录组样本，包括人、小鼠等模式生物 | 数字病理学 | 癌症, 溃疡性结肠炎 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 3461个样本 | NA | 空间转录组学 | NA | 整合19种不同空间转录组学技术平台的数据 |
| 77 | 2026-04-28 |
Single-cell RNA sequencing reveals tissue-specific transcriptomic changes induced by perfluorooctanesulfonic acid (PFOS) in larval zebrafish (Danio rerio)
2025-06-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137515
PMID:39947082
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析PFOS暴露对斑马鱼幼虫组织特异性转录组的影响 | 首次使用单细胞RNA-seq揭示PFOS在斑马鱼幼虫中诱导的组织特异性转录组变化，并发现消化器官、肌肉和耳石是受影响最显著的组织 | 研究局限于单一浓度（16 µM）和短期暴露（3-72小时），未测试剂量-反应关系或长期效应 | 探究全氟辛烷磺酸（PFOS）对斑马鱼幼虫发育毒性的组织特异性分子机制 | 斑马鱼幼虫（Danio rerio） | 机器学习 | 发育毒性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 暴露于16 µM PFOS或0.01% DMSO的斑马鱼幼虫，共检测27,698个基因，其中2,390个差异表达 | 10x Genomics | 单细胞转录组 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 78 | 2026-04-28 |
Oncogene aberrations drive medulloblastoma progression, not initiation
2025-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08973-5
PMID:40335697
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research paper | 本研究利用单细胞技术揭示癌基因异常驱动髓母细胞瘤进展而非起始的过程 | 首次通过单细胞核RNA测序、单细胞核ATAC测序和空间转录组学技术，证明大规模染色体畸变是早期肿瘤起始事件，而单基因癌基因事件在后期出现并呈亚克隆性 | 未提及具体限制 | 阐明癌基因异常和广泛拷贝数变异在髓母细胞瘤肿瘤进化和治疗抵抗中的作用 | 3/4组髓母细胞瘤患者肿瘤样本 | 单细胞组学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞核RNA测序、单细胞核ATAC测序、空间转录组学 | 群体遗传学模型 | 基因表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | 一群已知MYC、MYCN和PRDM6癌基因改变的3/4组髓母细胞瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 79 | 2026-04-28 |
Concurrent loss of the Y chromosome in cancer and T cells impacts outcome
2025-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09071-2
PMID:40468066
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研究论文 | 该研究通过泛癌分析揭示Y染色体缺失在癌症与T细胞中并发存在并影响患者预后 | 首次系统证明外周血单核细胞和肿瘤中Y染色体缺失的关联性，并建立恶性上皮细胞与免疫细胞中LOY共存的预后模型 | 未明确LOY导致免疫抑制的分子机制及功能验证的局限性 | 探究Y染色体缺失在外周血单核细胞、免疫细胞和癌细胞中的相互关系及其对癌症死亡率的影响 | 29种人类肿瘤类型的bulk和单细胞RNA测序数据，以及自发性及同源小鼠肿瘤模型 | 数字病理学 | 泛癌种 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 文本序列数据 | 涵盖29种人类肿瘤类型及小鼠模型的多组学数据 | Illumina, 10x Genomics | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq, 10x Chromium | 使用Illumina NovaSeq进行bulk RNA测序，10x Chromium进行单细胞测序 |
| 80 | 2026-04-27 |
An updated and spatially validated somatic single-cell atlas of Hydractinia symbiolongicarpus
2025-Jun-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.03.657738
PMID:40502179
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研究论文 | 通过整合新数据构建了Hydractinia symbiolongicarpus的更新单细胞图谱，鉴定了主要体细胞谱系及新型免疫细胞群，并进行了空间验证 | 首次鉴定出假定的免疫细胞群、新神经亚型、两种空间分离的腺细胞群体及水螅体特异性细胞类型，并完善了刺细胞发育轨迹 | 现有图谱在细胞数量和转录组深度上仍有局限，细胞类型分配部分依赖计算方法 | 提升对Hydractinia symbiolongicarpus细胞多样性和动态变化的理解，为刺胞动物研究提供资源 | Hydractinia symbiolongicarpus的取食息肉和匍匐茎组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 超过47,000个细胞，来自固定细胞和活细胞数据整合 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |