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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-03-25 |
Primitive Hepatoblasts Driving Early Liver Development
2025-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.08.658502
PMID:40501632
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研究论文 | 本研究识别并表征了早期肝脏发育中一种先前未被认识的原始肝母细胞群,揭示了其在肝发生过程中的起源、分子特征和功能作用 | 发现并命名了源自腹侧前肠内胚层CDX2+FOXA2+祖细胞的一种新型原始肝母细胞群,揭示了其独特的分子标记和发育贡献,并阐明了WNT抑制和RA许可在此过程中的调控机制 | 原始肝母细胞在晚期胎儿和出生后发育中的贡献逐渐减少,其长期命运和功能转换的具体机制仍需进一步研究 | 探究早期肝脏发育过程中肝母细胞的异质性、起源和调控机制 | 小鼠和人类早期肝脏发育过程中的肝母细胞及前肠内胚层祖细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序、谱系追踪、表观遗传学和功能扰动研究 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 62 | 2026-03-24 |
Rescue of naïve porcine circovirus type 3 and its pathogenesis in CD pigs
2025-06-17, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00341-25
PMID:40353661
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研究论文 | 本研究首次成功拯救了天然猪圆环病毒3型(PCV3),并利用剖腹产仔猪模型阐明了其致病机制,包括病毒复制特征、组织病理学变化及免疫抑制机制 | 首次通过透射电镜观察到PCV3病毒颗粒,并首次在剖腹产仔猪模型中系统阐明了PCV3的免疫抑制机制,特别是发现Th2细胞减少导致体液免疫受损 | 研究仅使用剖腹产仔猪模型,未在常规饲养猪只中验证;病毒分离和拯救过程依赖人工合成基因组,可能与天然病毒存在差异 | 阐明天然PCV3病毒的致病机制和免疫抑制特性 | 猪圆环病毒3型(PCV3)病毒颗粒、PK-15细胞、剖腹产仔猪(CD pigs) | NA | 猪圆环病毒感染 | 病毒拯救、免疫荧光检测、Western blotting、透射电镜、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 显微镜图像、蛋白质印迹数据、病毒滴度数据、单细胞转录组数据 | 未明确说明具体动物数量,使用剖腹产仔猪作为感染模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 63 | 2026-03-24 |
Dissection of the global responses of mandarin fish pyloric cecum to an acute ranavirus (MRV) infection reveals the formation of serositis and then ascites
2025-06-17, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.02308-24
PMID:40366173
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了急性鳜鱼虹彩病毒感染如何靶向鳜鱼幽门盲囊的浆膜层,引发纤维性浆膜炎,并最终导致严重腹水形成的细胞和分子机制 | 首次在单细胞分辨率下解析了鳜鱼幽门盲囊对急性虹彩病毒感染的全局反应,明确了病毒驱动的浆膜炎是导致鳜鱼特有严重腹水症状的根本原因 | 研究主要关注急性感染期的反应,对慢性感染或恢复期的病理过程未作探讨,且实验模型为特定鱼类,结论的普适性有待验证 | 探究鳜鱼虹彩病毒急性感染导致严重腹水的病理机制 | 鳜鱼及其幽门盲囊组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 64 | 2026-03-24 |
Identifying Causal Brain Structures, Genes, and Proteins for Osteoarthritis: A Large-Scale Genetic Correlation Study Based on Brain Imaging-Derived Phenotypes, Transcriptomes, and Proteomes
2025-06-10, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glaf083
PMID:40247738
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研究论文 | 本研究通过整合脑影像衍生表型、转录组和蛋白质组数据,验证了脑结构与骨关节炎风险的遗传相关性,并识别了关键的因果基因和蛋白质 | 首次大规模整合脑影像表型、脑转录组、脑蛋白质组与骨关节炎GWAS数据,系统探索脑-关节轴的遗传基础,并利用单细胞RNA-seq eQTL数据在细胞类型水平定位因果基因 | 研究主要基于欧洲人群的遗传数据,结论在其他族群中的普适性需进一步验证;脑蛋白质组样本量相对较小(152例) | 验证脑结构与骨关节炎风险的遗传相关性,识别介导该关联的因果基因和蛋白质 | 骨关节炎患者及对照人群(GWAS样本826,690人)、脑转录组(5,138例)、脑蛋白质组(152例) | 生物信息学与遗传学 | 骨关节炎 | 全基因组关联研究(GWAS)、连锁不平衡评分回归(LDSC)、孟德尔随机化(MR)、转录组范围关联研究(TWAS)、蛋白质组范围关联研究(PWAS)、单细胞RNA-seq eQTL分析 | 统计遗传学模型(LDSC、MR、TWAS、PWAS) | 遗传汇总统计数据、脑影像衍生表型数据、脑转录组数据、脑蛋白质组数据、单细胞表达数据 | GWAS:826,690人;脑转录组:5,138例;脑蛋白质组:152例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 65 | 2026-03-24 |
Elucidating Cellular Senescence-related Genes in Benign Prostatic Hyperplasia Through Mendelian Randomization and Single-cell RNA Sequencing
2025-06-10, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glaf073
PMID:40269514
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序,识别了与良性前列腺增生(BPH)因果相关的细胞衰老相关基因,并分析了它们在多种前列腺细胞中的表达模式和调控网络 | 结合孟德尔随机化与单细胞RNA测序,首次系统性地识别了BPH中因果相关的细胞衰老基因,并揭示了跨细胞类型的一致表达模式和核心转录调控网络 | 研究主要基于欧洲人群的遗传数据(如FinnGen和UKB),可能限制了结果在其他人群中的普适性;单细胞数据样本量未明确说明,可能影响统计效力 | 识别与良性前列腺增生(BPH)因果相关的细胞衰老基因,并探究其在不同前列腺细胞中的表达和调控机制 | 良性前列腺增生(BPH)相关的细胞衰老基因及其在前列腺细胞(如成纤维细胞、巨噬细胞、T细胞、上皮细胞)中的表达 | 生物信息学 | 前列腺增生 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、共定位分析、单细胞调控网络推断与聚类 | NA | 遗传数据(eQTL)、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 66 | 2026-03-21 |
Lung endothelial cell heterogeneity in health and pulmonary vascular disease
2025-Jun-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00296.2024
PMID:39772753
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综述 | 本文探讨了肺内皮细胞在健康和肺血管疾病中的异质性,重点关注单细胞RNA测序技术带来的新见解 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了肺内皮细胞的新型亚群(如肺泡毛细血管内皮细胞和通用毛细血管内皮细胞)及其在肺动脉高压发病机制中的新通路和机制 | 作为一篇小型综述,可能未涵盖所有最新研究或技术细节,且依赖于现有文献的总结 | 综述肺内皮细胞异质性在肺血管疾病(特别是肺动脉高压)中的作用及研究进展 | 肺内皮细胞 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 67 | 2026-03-14 |
Multi-omic analyses of the development of obesity-related depression linked to the gut microbe Anaerotruncus colihominis and its metabolite glutamate
2025-06-15, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2025.04.010
PMID:40274437
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了肠道微生物Anaerotruncus colihominis及其代谢产物谷氨酸在肥胖相关抑郁症发展中的关键作用 | 首次将肥胖相关抑郁症与特定肠道微生物A. colihominis及其谷氨酸代谢联系起来,并通过单细胞RNA测序揭示了Efnb2-Ephb2互作在细胞通讯中的核心作用 | 研究主要基于动物模型和临床样本的相关性分析,因果关系和具体分子通路仍需进一步验证 | 探究肥胖相关抑郁症的发病机制,寻找潜在的治疗靶点 | 肥胖相关抑郁症患者、健康个体、高脂饮食小鼠、无菌小鼠 | 微生物组学 | 肥胖相关抑郁症 | 单细胞RNA测序、粪便微生物移植、多组学分析 | NA | 微生物组数据、转录组数据、代谢组数据 | 临床患者与健康个体样本、高脂饮食小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 68 | 2026-03-13 |
[Biological characteristics of liver zonation and its role in disease and aging]
2025-Jun-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
|
综述 | 本文总结了肝脏分区在维持肝功能中的重要作用及其与疾病和衰老的关系 | 利用单细胞基因组学和空间转录组学技术深化了对肝脏分区的理解 | NA | 探讨肝脏分区的生物学特性及其在疾病和衰老中的作用 | 肝脏细胞,特别是沿门静脉-中央静脉轴的肝细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞基因组学,空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 69 | 2026-03-06 |
Systematic characterization of the ovarian landscape across mouse menopause models
2025-Jun-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.658920
PMID:40661543
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研究论文 | 本研究系统比较了三种小鼠绝经模型,通过组织学、血清激素分析、单细胞转录组学和机器学习方法,揭示了卵泡丢失、内分泌紊乱和转录重塑的共性与模型特异性特征 | 首次系统比较三种小鼠绝经模型(自然衰老、化学诱导卵泡耗竭、遗传模型),并整合单细胞转录组学与机器学习进行多维度表征 | 研究局限于小鼠模型,人类绝经的分子机制可能存在物种差异 | 建立绝经研究的临床前模型选择框架,解析卵巢衰老的分子机制 | 三种小鼠绝经模型(自然衰老、VCD化学诱导、Foxl2单倍体不足遗传模型) | 计算生物学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序,机器学习 | 机器学习方法 | 转录组数据,组织图像,血清激素数据 | 多种年龄段的三种小鼠模型群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 70 | 2026-03-06 |
SMURF2 Facilitates GAP17 Isoform 1 Membrane Displacement to Promote Mutant p53-KRAS Oncogenic Synergy
2025-Jun-03, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-24-0701
PMID:39976545
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研究论文 | 本研究揭示了SMURF2通过PPLP基序与GAP17-1相互作用,使其从膜上移位,从而促进突变p53与KRAS的致癌协同作用 | 首次阐明SMURF2通过识别GAP17-1的PPLP基序导致其膜定位异常,从而维持突变KRAS的GTP结合活化状态,揭示了突变p53与KRAS协同致癌的新机制 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型,临床样本验证相对有限;GAP17-1膜移位的确切分子机制仍需进一步解析 | 探究突变p53与突变KRAS在胰腺癌中协同致癌的分子机制 | 胰腺癌细胞系、基因工程小鼠模型、临床胰腺导管腺癌样本 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、组织微阵列、基因沉默、突变分析 | 基因工程小鼠模型(iKras*; iKras*, p53*, and p48-Cre; Kras*) | 基因表达数据、组织病理数据、临床生存数据 | 多种胰腺癌细胞系、多个小鼠模型、临床前及临床样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 71 | 2026-03-06 |
Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics reveal unique subpopulations of infiltrating macrophages and dendritic cells following AKI
2025-Jun-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00059.2025
PMID:40331777
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序、空间转录组学和CITE测序技术,揭示了急性肾损伤后肾脏浸润巨噬细胞和树突状细胞的独特亚群及其时空动态特征 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和CITE测序技术,全面解析了AKI后肾脏浸润免疫细胞的时空异质性和动态变化,并发现了KIMs可能重编程表达KRM特征基因的新现象 | 研究主要基于小鼠缺血再灌注损伤模型,人类样本的验证和临床转化仍需进一步研究 | 阐明急性肾损伤后肾脏浸润免疫细胞的异质性、时空分布特征及其功能 | 小鼠肾脏浸润巨噬细胞(KIMs)、肾脏树突状细胞(KDCs)和肾脏驻留巨噬细胞(KRMs) | 单细胞组学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, CITE测序 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 表位数据 | 未明确样本数量,基于小鼠缺血再灌注损伤模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 72 | 2026-03-04 |
SpaceBF: Spatial coexpression analysis using Bayesian Fused approaches in spatial omics datasets
2025-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.29.646124
PMID:40236135
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研究论文 | 本文提出了一种名为SpaceBF的贝叶斯融合建模框架,用于在空间组学数据中分析分子间的空间共表达模式 | 开发了首个基于贝叶斯融合方法的框架,能够同时估计局部(位置特异性)和全局(组织范围)的分子共表达,相比现有主要依赖地理空间指标(如双变量莫兰指数和李氏指数)的方法具有更高的特异性和统计效力 | 未明确说明方法对计算资源的需求或可扩展性限制,也未讨论在超大规模数据集上的应用性能 | 开发稳健的统计方法来检测空间组学数据中分子对之间的空间变化共表达模式 | 空间转录组学和空间蛋白质组学数据中的分子(基因、肽段、脂质、N-聚糖)共表达关系 | 空间组学 | 癌症(多种类型) | 空间转录组学、质谱成像 | 贝叶斯融合模型 | 空间组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 73 | 2026-03-04 |
Multiomics identifies tumor-intrinsic SREBP1 driving immune exclusion in hepatocellular carcinoma
2025-Jun-15, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011537
PMID:40518290
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了肝细胞癌中肿瘤内在的SREBP1通过促进巨噬细胞M2样重编程驱动免疫排斥的机制 | 首次通过大规模多组学分析结合单细胞RNA测序和空间脂质组学,系统性识别了肝细胞癌中与免疫排斥相关的32条致癌通路,并确定SREBP1为核心调控因子 | 研究主要基于体外三维共培养模型,缺乏体内实验验证;样本量虽大但单细胞RNA测序样本相对较少(31个) | 识别肝细胞癌中导致免疫检查点抑制剂耐药的新治疗靶点 | 肝细胞癌患者样本(包括肿瘤组织)和体外培养的HepG2肝癌细胞系 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 成像质谱流式细胞术, 空间脂质组学, CRISPR基因敲除 | 三维共培养模型 | RNA测序数据, 蛋白质组数据, 单细胞RNA测序数据, 质谱成像数据 | 900多个人类样本(RNA测序和蛋白质组学)和31个肿瘤单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间脂质组学 | NA | NA |
| 74 | 2026-03-04 |
Single cell immunophenotyping identifies CD8+ GZMK+ IFNG+ T cells as a key immune population in cutaneous Lyme disease
2025-Jun-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.09.658661
PMID:40661371
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和适应性免疫受体测序,首次全面解析了莱姆病皮肤红斑移行(EM)病变中的T细胞免疫应答 | 首次在莱姆病皮肤病变中鉴定出CD8+ GZMK+ IFNG+ T细胞的关键免疫亚群,并发现其克隆扩增和干扰素调控基因的显著差异表达 | 研究样本量虽已扩大但仍有限,且主要聚焦于皮肤局部免疫应答,未涉及系统性免疫反应或长期随访 | 解析莱姆病皮肤病变(红斑移行)中的T细胞免疫表型及其在病原体防御中的作用 | 莱姆病患者的红斑移行(EM)皮肤病变组织与自体未受累皮肤组织 | 数字病理学 | 莱姆病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq),适应性免疫受体测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 扩大后的样本集(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 75 | 2026-03-03 |
Epigenetic Reprogramming of Autophagy Leads to Uncovering a Novel Therapeutic Target for Mutant IDH1 Astrocytomas
2025-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.08.584091
PMID:38559270
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研究论文 | 本研究揭示了自噬在突变IDH1胶质瘤生存中的关键作用,并通过靶向Atg7抑制自噬,增强了肿瘤对放疗的敏感性 | 首次发现mIDH1胶质瘤通过表观遗传重编程激活自噬作为能量来源,并开发了靶向Atg7的合成蛋白纳米颗粒siRNA递送系统,在体内实现放疗增敏 | 研究主要基于基因工程小鼠模型和患者样本分析,临床转化效果仍需进一步验证 | 探索mIDH1胶质瘤的生存机制并开发新的治疗靶点 | 突变IDH1胶质瘤细胞、患者肿瘤样本、基因工程小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 胶质瘤 | RNA-seq, ChIP-seq, scRNA-seq, siRNA纳米递送 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据、表观遗传数据、单细胞转录组数据 | 人类和小鼠mIDH1胶质瘤细胞及患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 76 | 2026-02-28 |
Single-cell transcriptomics showed that maternal PCB exposure dysregulated ER stress-mediated cell type-specific responses in the liver of female offspring
2025-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.04.657944
PMID:40501930
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了母体多氯联苯暴露如何通过内质网应激途径,在雌性后代肝脏中引起细胞类型特异性的代谢与免疫功能失调 | 首次在单细胞分辨率下系统阐明了围产期PCB暴露对雌性后代肝脏不同细胞类型的特异性转录重编程效应,并揭示了内质网应激通路的关键介导作用 | 研究仅针对雌性后代且观察时间点为出生后28天,未评估雄性后代、更长期效应或剂量依赖性反应 | 探究母体多氯联苯暴露对后代肝脏发育的细胞类型特异性影响 | 围产期暴露于多氯联苯混合物的雌性小鼠(出生后28天)的肝脏组织 | 单细胞转录组学 | 代谢功能障碍 | 单细胞RNA测序,RT-qPCR | NA | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | 围产期PCB暴露的雌性小鼠肝脏组织(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 77 | 2026-02-26 |
Endothelial Cell Phenotypic Plasticity in Cardiovascular Physiology and Disease: Mechanisms and Therapeutic Prospects
2025-Jun-16, American journal of hypertension
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/ajh/hpaf027
PMID:39989120
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综述 | 本文综述了内皮细胞在心血管生理和疾病中的表型可塑性,包括其机制、在疾病进展中的作用以及潜在的治疗前景 | 系统总结了内皮细胞向间充质、造血、成骨及免疫细胞样等多种表型转化的机制,并探讨了利用单细胞测序等新兴技术揭示其异质性的最新进展,以及通过内皮重编程等策略进行靶向治疗的新方向 | 本文是一篇综述,主要基于现有文献进行总结和分析,未报告新的原始实验数据或进行直接的机制验证 | 阐明内皮细胞的异质性和表型可塑性在心血管生理和疾病中的作用机制,并探索基于此的靶向治疗策略 | 内皮细胞及其在心血管系统中的表型转化 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 78 | 2026-02-26 |
A tumor necrosis factor-α-responsive cryptic promoter drives overexpression of the human endogenous retrovirus ERVK-7
2025-06, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.108568
PMID:40316021
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研究论文 | 本研究揭示了内源性逆转录病毒ERVK-7在肺腺癌中通过肿瘤坏死因子-α响应的隐蔽启动子驱动的过表达机制 | 发现了ERVK-7的两个新型转录本(ERVK-7.long和ERVK-7.short),并阐明了它们由不同上游启动子驱动、受炎症信号通路差异调控的机制 | 研究主要聚焦于肺腺癌,对其他癌症类型中ERVK-7的调控机制探讨有限 | 探究内源性逆转录病毒ERVK-7在肺腺癌中的表达调控机制及其临床意义 | 人类内源性逆转录病毒ERVK-7及其在肺腺癌中的转录调控 | 表观遗传学 | 肺腺癌 | 单细胞转录组测序、表观遗传图谱分析 | NA | RNA-seq数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 79 | 2026-02-26 |
NOTCH2 disrupts the synovial fibroblast identity and the inflammatory response of epiphyseal chondrocytes
2025-06, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110206
PMID:40345585
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研究论文 | 本研究探讨NOTCH2信号在小鼠骨骺软骨细胞中对转录组和细胞群体的影响,特别是在炎症反应和骨关节炎发病机制中的作用 | 通过NOTCH2功能获得性突变和条件性模型,结合bulk RNA-Seq和scRNA-Seq分析,揭示了NOTCH2如何增强炎症通路并破坏关节滑膜成纤维细胞的转录组特性 | 研究主要基于小鼠模型,可能无法完全反映人类骨关节炎的复杂性,且样本来源和实验条件存在一定限制 | 探究NOTCH2信号如何调控骨骺软骨细胞的转录组和细胞群体,以理解其在骨关节炎发病机制中的作用 | 小鼠骨骺软骨细胞,包括NOTCH2功能获得性突变模型和条件性表达NICD2的模型 | 单细胞组学 | 骨关节炎 | bulk RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq (scRNA-Seq) | NA | RNA序列数据 | 来自NOTCH2功能获得性突变小鼠和R26-NICD2小鼠的原代骨骺细胞 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 80 | 2026-02-26 |
A comparison of integration methods for single-cell RNA sequencing data and ATAC sequencing data
2025-Jun, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.91
PMID:41675510
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综述 | 本文系统回顾并评估了超过10种流行的单细胞RNA测序和ATAC测序数据整合方法 | 强调在生物学相关粒度上进行数据整合的重要性,并考虑不同模态间的固有差异以平衡生物学发现与噪声去除 | 讨论了这些整合方法的数据偏好、局限性、应用挑战及未来方向 | 比较和评估单细胞多模态数据整合方法,以解决细胞间对应关系识别这一挑战性任务 | 单细胞RNA测序数据和ATAC测序数据 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | 单细胞多模态数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |