单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
761	2025-05-29	Decellularised Amniotic Membrane for the Neurogenic Expression of Human Mesenchymal Stem Cells 2025-Jun, Journal of biomedical materials research. Part B, Applied biomaterials DOI:10.1002/jbm.b.35588 PMID:40424302	研究论文	研究脱细胞羊膜（DAM）对人间充质干细胞（hMSCs）神经分化的诱导作用，以促进周围神经病变的神经再生	使用DAM诱导hMSCs神经分化，并通过空间转录组测序和网络药理学分析揭示其促进神经修复的机制	未提及具体样本量及实验设计的详细局限性	探究DAM在神经再生中的作用及其潜在治疗应用	人间充质干细胞（hMSCs）和脱细胞羊膜（DAM）	再生医学	周围神经病变	空间转录组测序、免疫荧光染色、网络药理学分析	NA	基因表达数据、细胞图像数据	NA
762	2025-05-28	Synergistic effects of mTOR inhibitors with VEGFR3 inhibitors on the interaction between TSC2-mutated cells and lymphatic endothelial cells 2025-Jun, Science China. Life sciences DOI:10.1007/s11427-024-2760-4 PMID:39862344	research paper	本研究探讨了mTOR抑制剂与VEGFR3抑制剂对TSC2突变细胞与淋巴管内皮细胞之间相互作用的协同效应	发现雷帕霉素与VEGFR3抑制剂的联合使用不仅增强了雷帕霉素的效果，还抑制了淋巴管相关表现，为LAM及其他TSC2突变疾病的治疗提供了新策略	研究仅通过体外实验和小鼠异种移植模型验证，尚未进行临床试验	探索LAM细胞与淋巴管内皮细胞的相互作用及雷帕霉素对此的影响，以寻找LAM治疗的新靶点	TSC2缺失细胞与淋巴管内皮细胞（LECs）	肿瘤学	淋巴管平滑肌瘤病（LAM）	单细胞测序、异种移植模型	NA	细胞培养数据、测序数据	NA
763	2025-05-28	Mechanistic insights into Hippo-YAP pathway activation for enhanced DFU healing 2025-Jun-01, American journal of physiology. Cell physiology DOI:10.1152/ajpcell.01067.2024 PMID:40261295	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序，全面探讨了TFAP2A-LIFR-Hippo-YAP信号轴在调节巨噬细胞M2极化及其在糖尿病足溃疡(DFU)伤口愈合中的关键作用	揭示了TFAP2A在DFU中的新型免疫调节作用，并提供了治疗慢性糖尿病伤口的有前景的靶点	NA	探讨TFAP2A-LIFR-Hippo-YAP信号轴在糖尿病足溃疡愈合中的作用机制	巨噬细胞M2极化及其在糖尿病足溃疡(DFU)伤口愈合中的作用	生物医学研究	糖尿病足溃疡	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 批量RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
764	2025-05-28	Pathway Enrichment-Based Unsupervised Learning Identifies Novel Subtypes of Cancer-Associated Fibroblasts in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma 2025-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences DOI:10.1007/s12539-025-00705-7 PMID:40272703	研究论文	提出了一种基于通路富集的无监督学习方法scPathClus，用于识别胰腺导管腺癌中癌症相关成纤维细胞的新亚型	开发了scPathClus方法，通过通路富集矩阵和潜在特征矩阵克服单细胞RNA测序数据中基因表达丢失的问题，并发现了两种新的CAF亚型	方法的应用仅限于胰腺导管腺癌的scRNA-seq数据，未在其他癌症类型中验证	开发一种新的单细胞聚类方法，以更准确地识别癌症相关成纤维细胞的亚型	胰腺导管腺癌中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）	生物信息学	胰腺癌	scRNA-seq, 空间转录组分析, 伪时间分析	无监督学习, 社区检测	单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据	未明确提及具体样本数量，但使用了多个PDAC scRNA-seq数据集
765	2025-05-28	Single-cell transcriptomic analysis reveals alterations to cellular dynamics and paracrine signaling in radiation-induced muscle pathology 2025-Jun-01, American journal of physiology. Cell physiology DOI:10.1152/ajpcell.00115.2025 PMID:40316295	研究论文	通过单细胞转录组分析揭示了辐射诱导肌肉病理中的细胞动态变化和旁分泌信号改变	首次使用scRNA-seq技术描述了辐射暴露后骨骼肌微环境中的转录变化，揭示了FAPs的纤维化和衰老转录组特征	研究仅基于小鼠模型，未在人体中进行验证	探究辐射治疗引起的骨骼肌萎缩和纤维化的潜在机制	小鼠辐射模型中的肌肉干细胞和纤维脂肪祖细胞	单细胞转录组学	肌肉萎缩和纤维化	scRNA-seq	NA	单细胞RNA测序数据	辐射后24小时和56天的小鼠肌肉组织样本
766	2025-05-28	Stromal heterogeneity in the adult lung delineated by single-cell genomics 2025-Jun-01, American journal of physiology. Cell physiology DOI:10.1152/ajpcell.00285.2025 PMID:40353369	review	本文综述了通过单细胞RNA测序研究揭示的肺基质细胞异质性，并强调了各细胞群的功能特性和位置	利用单细胞RNA测序技术揭示了肺基质细胞的异质性及其在空间分布上的独特性	NA	探讨肺基质细胞的异质性及其功能特性	肺基质细胞	单细胞基因组学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
767	2025-05-28	Super-resolution imaging informed scRNA sequencing analysis reveals the critical role of GDF15 in rejuvenating aged hematopoietic stem cells 2025-Jun, Blood science (Baltimore, Md.) DOI:10.1097/BS9.0000000000000236 PMID:40416726	研究论文	本文通过超分辨率成像和单细胞RNA测序分析，揭示了GDF15在衰老造血干细胞再生中的关键作用	结合超分辨率显微镜和单细胞RNA测序技术，首次揭示了GDF15在调节线粒体信号和形态以影响造血干细胞命运中的新作用	研究样本量相对较小，仅涉及约200个年轻和年老小鼠的造血干细胞	探索造血干细胞衰老过程中线粒体形态变化的分子和细胞机制	年轻和年老小鼠的造血干细胞	数字病理学	老年病	超分辨率显微镜、单细胞RNA测序	NA	图像、RNA序列数据	约200个年轻和年老小鼠的造血干细胞
768	2025-05-27	The upregulation of TNKS1 drives the phenotypic switching of vascular smooth muscle cells in aortic dissection through the activation of ferroptosis 2025-Jun-17, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114722 PMID:40359887	研究论文	本研究探讨了TNKS1在主动脉夹层（AD）中对人类主动脉平滑肌细胞（HASMCs）表型转换的影响，揭示了TNKS1通过激活铁死亡驱动HASMCs表型转换的机制	首次发现TNKS1通过激活铁死亡驱动HASMCs表型转换，揭示了TNKS1在AD发病中的关键作用	研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在临床患者中进行验证	探究TNKS1在AD发病中的作用机制	人类主动脉平滑肌细胞（HASMCs）	心血管疾病研究	主动脉夹层	单细胞RNA测序、WB、免疫荧光、RT-q-PCR、划痕实验、Co-IP	NA	基因表达数据、蛋白质相互作用数据	NA
769	2025-05-27	Bile acids produced by gut microbiota activate TGR5 to promote colorectal liver metastasis progression by inducing MDSCs infiltration in liver 2025-Jun-17, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114829 PMID:40367692	research paper	该研究揭示了肠道微生物产生的胆汁酸通过激活TGR5促进结直肠肝转移的机制	发现了LCA通过TGR5-CCL3轴招募MDSCs的新机制，并揭示了MDSCs在肿瘤微环境中的双重作用	研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证	探究结直肠肝转移(CRLM)的免疫抑制微环境形成机制	结直肠癌肝转移小鼠模型	肿瘤免疫学	结直肠癌	单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光、Luminex多重检测	小鼠疾病模型	代谢组学数据、单细胞转录组数据	四个小鼠队列(CRC、CRLM、LCA-fed CRC和LCA-fed CRLM)
770	2025-05-27	Compromised adenosine-A2AR axis contributes to recurrent spontaneous abortion by promoting proinflammatory macrophage polarization 2025-Jun-17, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114838 PMID:40373597	研究论文	本研究探讨了复发性自然流产(RSA)与巨噬细胞极化之间的关系，发现腺苷(Ado)可能作为生物标志物和治疗靶点	揭示了腺苷-A2AR轴在RSA中的作用机制，发现HK2过表达与巨噬细胞极化相关	研究样本量未明确说明，且体外实验结果需进一步体内验证	探究RSA的发病机制并寻找潜在治疗靶点	RSA患者的蜕膜组织和正常妊娠组织	生殖医学	复发性自然流产	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
771	2025-05-27	Multidimensional bioinformatics analysis reveals the potential carcinogenic role of acrylamide in colorectal cancer 2025-Jun-15, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118281 PMID:40347726	研究论文	本研究通过多维生物信息学分析揭示了丙烯酰胺在结直肠癌中的潜在致癌作用	识别了四个关键的丙烯酰胺相关结直肠癌驱动基因，并揭示了它们通过PI3K-AKT通路和免疫抑制微环境的作用机制	需要在更多队列和实验模型中验证关键靶点	阐明丙烯酰胺诱导结直肠癌的分子机制，为早期诊断和预防提供理论基础	丙烯酰胺相关基因和结直肠癌差异表达基因	生物信息学	结直肠癌	双向双样本孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、分子对接	NA	基因表达数据	来自GEO和CTDbase数据库的数据，以及TCGA数据
772	2025-05-27	Network toxicological and single-cell sequencing reveals the potential mechanisms of psoriatic toxicity of polybrominated diphenyl ethers 2025-Jun-15, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118307 PMID:40367614	研究论文	本研究通过网络毒理学和单细胞测序技术探讨了多溴联苯醚（PBDEs）诱导银屑病毒性的潜在机制	结合网络毒理学和单细胞测序技术，首次在单细胞分辨率下揭示了PBDEs通过IL-24信号通路激活免疫细胞的机制，并鉴定了与银屑病发病相关的关键靶点	研究主要基于生物信息学分析和分子对接，缺乏体内或体外实验验证	探究多溴联苯醚（PBDEs）诱导银屑病毒性的分子机制	多溴联苯醚（PBDEs）与银屑病的关联机制	网络毒理学与单细胞测序	银屑病	网络毒理学分析、单细胞测序、分子对接	NA	基因表达数据、蛋白质相互作用数据	NA
773	2025-05-27	Machine Learning and Mendelian Randomization Reveal a Tumor Immune Cell Profile for Predicting Bladder Cancer Risk and Immunotherapy Outcomes 2025-Jun, The American journal of pathology DOI:10.1016/j.ajpath.2025.01.016 PMID:40122457	研究论文	本研究旨在利用肿瘤浸润免疫细胞（TIIC）相关基因开发膀胱癌（BLCA）的预测模型	构建了一个新的TIIC特征评分，用于BLCA的预后和免疫治疗预测，并发现该评分与患者生存状态、肿瘤分期及PD-L1免疫治疗反应显著相关	未发现非癌性膀胱状况与BLCA之间的显著统计学关联，仅在SNP位点rs3763840上发现显著关联	开发膀胱癌的预测模型并评估其预后和免疫治疗反应	膀胱癌患者及其肿瘤浸润免疫细胞相关基因	机器学习	膀胱癌	RNA表达数据分析、scRNA-seq、孟德尔随机化	20种机器学习算法	RNA表达数据、单细胞RNA测序数据	来自TCGA和GEO数据库的多个RNA表达数据集和scRNA-seq数据
774	2025-05-25	Apocrine Gland Damage and the Release of Specific Keratins in Early Stage Indicate the Crucial Involvement of Apocrine Glands in Hidradenitis Suppurativa 2025-Jun, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.jid.2024.09.021 PMID:39547394	research paper	本研究探讨了顶泌汗腺在化脓性汗腺炎（HS）发病机制中的潜在作用，通过免疫组织化学和单细胞测序技术分析了HS患者和健康对照组的非病变皮肤和早期病变皮肤	首次报道了顶泌汗腺在HS早期病变中的损伤及释放特定角蛋白的现象，揭示了顶泌汗腺在HS发病机制中的关键作用	样本量较小（HS患者n=12，健康对照n=8），且仅针对早期病变进行研究	探讨顶泌汗腺在化脓性汗腺炎发病机制中的作用	化脓性汗腺炎患者和健康对照组的非病变皮肤和早期病变皮肤	皮肤病学	化脓性汗腺炎	免疫组织化学，单细胞测序	NA	组织样本，血清样本	HS患者n=12（组织样本），n=20（血清样本）；健康对照n=8
775	2025-01-07	Single-Cell RNA Sequencing Reveals Age-Related Changes in Epidermal Cell Populations and Interactions 2025-Jun, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.jid.2024.12.013 PMID:39756533	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
776	2025-05-25	Transcriptional reprogramming triggered by neonatal UV radiation or Lkb1 loss prevents BRAFV600E-induced growth arrest in melanocytes 2025-Jun, Oncogene IF:6.9Q1 DOI:10.1038/s41388-025-03339-7 PMID:40057604	研究论文	该研究揭示了新生儿UV辐射或Lkb1缺失通过触发转录重编程阻止BRAFV600E诱导的生长停滞，从而促进黑色素瘤发展的机制	发现了独立于痣进展的BRAF突变黑色素瘤发展新机制，并识别出潜在治疗靶点	研究主要基于小鼠模型，人类临床验证仍需进一步研究	阐明UVB引发的新生儿特异性黑色素瘤与BRAF相关的生长停滞机制	黑色素细胞和黑色素瘤	肿瘤生物学	黑色素瘤	单细胞转录组学、基因组分析	小鼠模型	基因组数据、转录组数据、临床数据	未明确说明具体样本数量（包含小鼠模型和人类临床数据）
777	2025-05-25	GeneDX-PBMC: An adversarial autoencoder framework for unlocking Alzheimer's disease biomarkers using blood single-cell RNA sequencing data 2025-Jun, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110283 PMID:40311462	研究论文	通过结合单细胞RNA测序数据和深度学习技术，识别阿尔茨海默病的血液生物标志物和治疗靶点	开发了一个结合自编码器、分类器和判别器的深度学习框架，分析免疫细胞中的基因表达，包括传统方法常忽略的细微遗传变异	研究主要关注外周血单个核细胞，可能未涵盖所有相关细胞类型或组织	识别阿尔茨海默病的血液生物标志物和治疗靶点	阿尔茨海默病患者和认知正常对照者的外周血单个核细胞	数字病理学	阿尔茨海默病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	对抗自编码器(AAE)	基因表达数据	NA
778	2025-05-24	Response of astrocytes and their interaction with surrounding brain cells after acute ischemia-reperfusion analyzed by single-cell transcriptome sequencing 2025-Jun-15, Brain research bulletin IF:3.5Q2 DOI:10.1016/j.brainresbull.2025.111355 PMID:40286940	研究论文	通过单细胞转录组测序分析急性缺血再灌注后星形胶质细胞的反应及其与周围脑细胞的相互作用	揭示了星形胶质细胞在缺血再灌注后12小时的异质性，并鉴定了9个潜在的治疗靶点基因和6个特异性抵抗缺血再灌注损伤的基因	研究仅关注缺血再灌注后12小时的时间点，未涉及其他时间段的动态变化	揭示星形胶质细胞在缺血性中风中的抗损伤反应机制	小鼠星形胶质细胞及其与周围脑细胞的相互作用	神经科学	缺血性中风	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）	NA	转录组数据	未明确说明样本数量，研究对象为小鼠星形胶质细胞
779	2025-05-24	The janus face of astrocytes in multiple sclerosis: Balancing protection and pathology 2025-Jun-15, Brain research bulletin IF:3.5Q2 DOI:10.1016/j.brainresbull.2025.111356 PMID:40288545	review	本文综述了星形胶质细胞在多发性硬化症（MS）中的双重作用及其治疗潜力	揭示了人类星形胶质细胞状态的连续性，超越了传统的A1/A2二分法，并探讨了星形胶质细胞-小胶质细胞串扰和代谢重编程在MS病理中的关键作用	将小鼠A1/A2概念转化到人类MS研究中存在挑战，人类星形胶质细胞表现出异质性、依赖于区域微环境和疾病阶段的反应	探讨星形胶质细胞在MS中的双重作用及其作为治疗靶点的潜力	多发性硬化症（MS）中的星形胶质细胞	神经科学	多发性硬化症	单细胞转录组学、空间转录组学、空间多组学	NA	转录组数据	NA
780	2025-05-24	Single-cell analysis reveals fibroblast heterogeneity and myofibroblast conversion in ligamentum flavum hypertrophy 2025-Jun, The spine journal : official journal of the North American Spine Society DOI:10.1016/j.spinee.2024.12.001 PMID:39653186	研究论文	通过单细胞分析揭示韧带黄韧带肥大中的成纤维细胞异质性和肌成纤维细胞转化	识别了成纤维细胞向肌成纤维细胞的转分化过程，以及新的信号通路如GAS和GRN在黄韧带肥大中的作用	样本量较小，仅来自3名患者	研究黄韧带肥大中的细胞比例和信号通路	黄韧带组织	单细胞分析	腰椎管狭窄症	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	3名患者的黄韧带组织