单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
741	2025-05-17	Diverse RNA methylation patterns in neutrophils: key drivers in hepatocellular carcinoma 2025-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12094-024-03756-2 PMID:39621240	研究论文	该研究探讨了中性粒细胞中RNA甲基化模式在肝细胞癌（HCC）中的作用及其与肿瘤微环境（TME）的关系	首次在中性粒细胞中识别出高/低RNA甲基化亚型，并开发了新的中性粒细胞RNA甲基化（NRM）评分系统，用于评估TME异质性和临床特征	研究基于单细胞测序数据，样本量可能有限，且需要进一步实验验证TRPM3的功能	探索中性粒细胞RNA甲基化在HCC中的作用及其临床意义	肝细胞癌（HCC）患者的中性粒细胞	肿瘤免疫学	肝细胞癌	单细胞测序、LASSO Cox回归分析	NRM评分系统	单细胞测序数据、lncRNA数据	未明确提及具体样本数量
742	2025-05-17	Biology and Pathophysiology of Placenta Accreta Spectrum Disorder 2025-Jun-01, Obstetrics and gynecology IF:5.7Q1 DOI:10.1097/AOG.0000000000005903 PMID:40209229	review	本文综述了胎盘植入谱系障碍（PAS）的生物学和病理生理学，探讨了其临床挑战和管理策略	整合了单细胞RNA测序和蛋白质组学分析的新兴技术，为PAS的生物标志物和干预途径提供了新见解	未提及具体研究样本量或实验数据，主要基于现有文献综述	理解PAS的病理生理学以指导临床管理和预防策略	胎盘植入谱系障碍（PAS）及其相关的生物学和病理生理学机制	病理生理学	胎盘植入谱系障碍	单细胞RNA测序，蛋白质组学分析	NA	NA	NA
743	2025-05-17	Novel approaches to CAR T cell target identification in acute myeloid leukemia 2025-Jun, Current opinion in pharmacology IF:4.0Q1 DOI:10.1016/j.coph.2025.102524 PMID:40311558	review	本文综述了急性髓系白血病（AML）中CAR T细胞靶点识别的新方法	介绍了结构表面组学识别肿瘤特异性蛋白构象，以及AI驱动的单细胞RNA测序整合多源数据以确定最佳靶点	NA	提高CAR T细胞的特异性并减少对正常组织的副作用，为AML及更广泛的癌症治疗提供更安全有效的途径	急性髓系白血病（AML）	肿瘤免疫治疗	急性髓系白血病	结构表面组学，AI驱动的单细胞RNA测序，细胞表面捕获技术	NA	RNA测序数据，蛋白质构象数据	NA
744	2025-05-17	Dissecting Autophagy Gene Expression in Endothelial Cells of Pulmonary Arterial Hypertension at Single-Cell Resolution 2025-Jun, Cardiology research IF:1.4Q3 DOI:10.14740/cr2055 PMID:40370624	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术分析了肺动脉高压（PAH）内皮细胞中自噬相关基因的表达特征，并鉴定了DDIT4作为潜在的生物标志物	首次在单细胞分辨率下解析PAH内皮细胞中自噬相关基因的表达特征，并发现DDIT4作为新的PAH生物标志物	研究主要基于体外模型和生物信息学分析，需要进一步的体内实验验证	探究肺动脉高压内皮细胞中自噬相关基因的表达特征及其在疾病进展中的作用	肺动脉高压患者的内皮细胞	单细胞转录组学	肺动脉高压	scRNA-seq, 高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA), 蛋白质印迹(Western blotting)	NA	单细胞RNA测序数据	NA
745	2025-05-15	Combining Single-Cell RNA Sequencing and Mendelian Randomization to Explore Novel Drug Targets for Parkinson's Disease 2025-Jun, Molecular neurobiology IF:4.6Q1 DOI:10.1007/s12035-025-04700-3 PMID:39890696	研究论文	结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化探索帕金森病的新药物靶点	首次结合scRNA-Seq和MR方法探索T细胞相关基因对帕金森病风险的因果效应，并识别出五个潜在药物靶点	需要进一步的研究和临床试验来验证这些潜在药物靶点的有效性	探索帕金森病的致病机制和潜在治疗靶点	帕金森病患者和健康对照者的外周血T细胞	生物信息学	帕金森病	单细胞RNA测序(scRNA-Seq), 孟德尔随机化(MR), GWAS	NA	基因表达数据	帕金森病患者和健康对照者的外周血T细胞scRNA-Seq数据集
746	2025-05-15	A Case-Driven Multi-Omics Analysis for Longitudinal Ibrutinib Response Evaluation of Patients With Chronic Lymphocytic Leukemia 2025-Jun, European journal of haematology IF:2.3Q2 DOI:10.1111/ejh.14397 PMID:39988467	研究论文	通过多组学方法评估慢性淋巴细胞白血病患者对伊布替尼的长期治疗反应	利用单细胞转录组学等多组学方法，首次在分子水平上探索了伊布替尼治疗期间克隆惰性的机制	研究样本量较小，仅包含两名患者的数据	评估慢性淋巴细胞白血病患者对伊布替尼治疗的长期分子和临床反应	两名接受伊布替尼单药治疗的慢性淋巴细胞白血病患者	数字病理学	慢性淋巴细胞白血病	单细胞转录组学, 多组学分析	NA	DNA和RNA数据	两名患者的血液样本
747	2025-05-14	Exploration of immune cell heterogeneity by single-cell RNA sequencing and identification of secretory leukocyte protease inhibitor as an oncogene in pancreatic cancer 2025-Jun, Environmental toxicology IF:4.4Q1 DOI:10.1002/tox.24200 PMID:38476085	研究论文	通过单细胞RNA测序探索胰腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞异质性，并鉴定分泌性白细胞蛋白酶抑制剂（SLPI）作为胰腺癌的致癌基因	利用单细胞测序技术鉴定了胰腺癌肿瘤微环境中的八种细胞亚群，并揭示了SLPI在胰腺癌中的致癌作用	研究未涉及SLPI作为治疗靶点的临床前或临床试验验证	探索胰腺癌肿瘤微环境的细胞异质性及潜在治疗靶点	胰腺癌肿瘤微环境中的细胞亚群及SLPI基因	数字病理学	胰腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
748	2025-05-14	RETRACTED: Exploring the tumor microenvironment: Chemokine-related genes and immunotherapy/chemotherapy response in clear-cell renal cell carcinoma 2025-Jun, Environmental toxicology IF:4.4Q1 DOI:10.1002/tox.24190 PMID:38488671	research paper	本研究通过分析透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的肿瘤微环境，识别了与化疗/免疫治疗反应相关的趋化因子相关基因，并构建了一个预后模型	构建了一个基于趋化因子相关基因的新型预后模型，并发现IGF2BP3在调节ccRCC对舒尼替尼耐药性中的关键作用	研究主要基于转录组数据，需要进一步的实验验证	探索肿瘤微环境中趋化因子相关基因对ccRCC治疗反应的影响	透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者和细胞系	digital pathology	肾癌	RNA-seq, scRNA-seq, CCK-8, Western blot, RT-qPCR	预后模型	转录组数据	531例批量转录组数据，单细胞RNA测序数据集GSE159115，786-O和A498细胞系
749	2025-05-14	Single-cell analysis of diquat-induced oxidative stress and its impact on organ-specific toxicity 2025-Jun-01, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118246 PMID:40327929	研究论文	通过单细胞/单核RNA测序技术，研究了敌草快（DQ）中毒后小鼠肺、肝和肾在多时间点的氧化应激微环境及其对多器官损伤的影响	首次构建了包含超过27万个细胞的多器官单细胞图谱，揭示了DQ诱导的氧化应激微环境在血管内皮细胞和实质细胞中的核心作用及其通过代谢重编程加剧组织损伤的机制	研究仅基于小鼠模型，未涉及人类样本；未探讨长期暴露于DQ的效应	阐明敌草快中毒导致多器官损伤的病理生理学和复杂分子机制	敌草快中毒小鼠的肺、肝和肾组织	单细胞组学	中毒性疾病	scRNA-seq/snRNA-seq	小鼠模型	单细胞转录组数据	超过27万个细胞（来自不同时间点的肺、肝、肾组织及对照组）
750	2025-05-14	Hypoxia-induced RHCG as a key regulator in psoriasis and its modulation by secukinumab 2025-Jun, APL bioengineering IF:6.6Q1 DOI:10.1063/5.0250742 PMID:40351602	研究论文	本文研究了缺氧诱导的RHCG在银屑病中的关键调控作用及其通过secukinumab的调节机制	揭示了RHCG在缺氧条件下对银屑病发病机制的新作用，并比较了不同治疗方法对RHCG表达的影响	RHCG在银屑病中的具体分子机制尚未完全阐明	探究RHCG在银屑病发病机制中的作用及其治疗潜力	角质形成细胞（KCs）和免疫细胞	生物信息学	银屑病	空间转录组学分析、单细胞转录组学分析、批量数据分析	NA	转录组数据、临床样本数据	未明确说明样本数量
751	2025-05-13	IL-4 alters TLR7-induced B cell developmental program in lupus 2025-Jun, Clinical immunology (Orlando, Fla.) DOI:10.1016/j.clim.2025.110472 PMID:40068727	research paper	该研究探讨了IL-4如何改变TLR7诱导的B细胞发育程序，从而影响系统性红斑狼疮（SLE）中的自身抗体形成	研究发现IL-4能够重编程B细胞发育，减少自身抗体和特定B细胞亚群，为SLE治疗提供新思路	研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类SLE患者的临床适用性尚需进一步验证	探究IL-4对TLR7诱导的B细胞发育程序的影响及其在SLE中的作用	BXD2小鼠和SLE患者的B细胞	免疫学	系统性红斑狼疮	单细胞转录组分析	NA	基因表达数据	BXD2小鼠和SLE患者B细胞样本（具体数量未明确说明）
752	2025-05-13	MAP4K4 aggravates microvascular anomalies in diabetic retinopathy in a YTHDF2-dependent manner 2025-Jun, Diabetologia IF:8.4Q1 DOI:10.1007/s00125-025-06398-3 PMID:40072537	research paper	该研究揭示了MAP4K4通过YTHDF2依赖的方式加剧糖尿病视网膜病变中的微血管异常	首次发现MAP4K4通过YTHDF2/MAP4K4/NF-κB轴调控糖尿病视网膜病变的微血管异常，为治疗提供了新靶点	研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，未涉及大规模临床样本验证	探究MAP4K4在糖尿病视网膜病变微血管异常中的作用机制	糖尿病视网膜病变患者的纤维血管膜、db/db小鼠模型和人类原代视网膜内皮细胞	digital pathology	diabetic retinopathy	scRNA-seq	db/db小鼠模型	RNA测序数据、蛋白质表达数据	8例增殖性糖尿病视网膜病变患者的纤维血管膜和11例非糖尿病患者的正常视网膜组织
753	2025-05-13	Intrapancreatic adipocytes and beta cell dedifferentiation in human type 2 diabetes 2025-Jun, Diabetologia IF:8.4Q1 DOI:10.1007/s00125-025-06392-9 PMID:40072535	研究论文	本研究探讨了胰腺内脂肪沉积与2型糖尿病患者β细胞去分化的空间关系及其机制	首次在人类胰腺中证实脂肪含量与β细胞去分化标志物ALDH1A3表达的正相关性，并揭示脂肪细胞通过免疫微环境促进β细胞功能失调的机制	样本量较小（50例器官捐献者），且仅为观察性研究无法确定因果关系	探究2型糖尿病中胰腺脂肪与胰岛β细胞功能障碍的关联机制	人类胰腺组织（15例2型糖尿病患者 vs 35例非糖尿病患者）	糖尿病研究	2型糖尿病	组织学分析、单细胞RNA-seq生物信息学分析	NA	组织切片图像、单细胞转录组数据	50例器官捐献者胰腺样本（15例糖尿病+35例对照），另分析11例糖尿病单细胞RNA-seq数据
754	2025-05-13	Understanding Enzalutamide-Resistance Based on a Functional Single-Cell Approach 2025-Jun, The Prostate DOI:10.1002/pros.24895 PMID:40211483	研究论文	通过单细胞RNA测序和功能实验研究前列腺癌细胞对恩杂鲁胺的耐药机制	发现恩杂鲁胺治疗前存在的AR-low细胞亚群在治疗中被选择并扩增，导致耐药性	研究主要基于细胞系和异种移植模型，未涉及临床患者样本	探索前列腺癌细胞对恩杂鲁胺耐药的分子机制	前列腺癌细胞系LNCaP及其亚群	癌症生物学	前列腺癌	单细胞RNA测序(scRNA-Seq), 基因集富集分析(GSEA), 异种移植模型	NA	RNA测序数据	LNCaP细胞系及其亚群
755	2025-05-13	High-resolution transcriptome analysis on a mouse model of neonatal hypoxic-ischemic encephalopathy using single-nucleus RNA-seq 2025-Jun, Biochemistry and biophysics reports IF:2.3Q3 DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102026 PMID:40342532	research paper	该研究利用单核RNA测序技术对新生儿缺氧缺血性脑病小鼠模型进行了高分辨率转录组分析	首次在HIE研究中应用单核RNA测序技术，揭示了海马区神经元群体的显著减少和小胶质细胞的特定激活	研究仅基于小鼠模型，结果可能需要进一步验证才能推广到人类	深入理解新生儿缺氧缺血性脑病的发病机制	新生儿缺氧缺血性脑病小鼠模型	基因组学	新生儿缺氧缺血性脑病	单核RNA测序(snRNA-seq)	小鼠疾病模型	RNA测序数据	NA
756	2025-05-13	The human endometrium: atlases, models, and prospects 2025-Jun, Current opinion in genetics & development IF:3.7Q2 DOI:10.1016/j.gde.2025.102341 PMID:40154154	综述	本文综述了人类子宫内膜的单细胞转录图谱和模型，探讨了其在研究子宫内膜生物学中的新途径、局限性及未来方向	通过单细胞分析揭示了子宫内膜的多样性和动态性，发现了WNT、NOTCH和TGFβ信号通路的调控作用，并利用先进的体外模型捕捉子宫内膜的细胞异质性和结构	子宫内膜功能障碍的病因学研究不足，影响了有效的诊断和治疗	研究子宫内膜的生物学特性及其功能障碍的机制	人类子宫内膜	生物医学	子宫内膜异位症	单细胞转录组分析	体外模型	转录组数据	NA
757	2025-05-12	Identification of KANK1 as a tumor suppressor gene in pancreatic ductal adenocarcinoma 2025-06-20, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151885 PMID:40288262	研究论文	本研究通过整合mRNA-蛋白质丰度相关性分析，鉴定出KANK1作为胰腺导管腺癌（PDAC）中的新型肿瘤抑制基因	首次将KANK1鉴定为PDAC中的肿瘤抑制基因，并揭示其通过拷贝数缺失和肿瘤缺氧下调的机制	未涉及KANK1在PDAC中的具体分子机制及其作为治疗靶点的临床验证	鉴定PDAC中的关键肿瘤抑制基因并探索其功能机制	胰腺导管腺癌（PDAC）	肿瘤生物学	胰腺癌	mRNA-蛋白质丰度相关性分析、单细胞RNA测序、免疫印迹分析	NA	mRNA表达数据、蛋白质表达数据、单细胞RNA测序数据	多个数据集（包括TCGA和CCLE数据库）的样本
758	2025-05-12	The integration of scRNA-seq with microarray and in-vivo experiments facilitates a comprehensive elucidation of the molecular mechanisms underlying endothelial cell involvement in myocardial infarction 2025-06-20, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151820 PMID:40288264	研究论文	本研究通过整合scRNA-seq、微阵列数据和体内实验，揭示了内皮细胞在心肌梗死中的关键基因及其分子机制	结合scRNA-seq、微阵列数据和体内实验，首次鉴定并验证了DBP、NR1D1和TEF在心肌梗死发展中的关键作用	研究依赖于公开数据库数据，样本量可能有限，且体内实验仅在特定模型中进行验证	阐明内皮细胞在心肌梗死发展中的分子机制	内皮细胞及其在心肌梗死中的功能	数字病理学	心血管疾病	scRNA-seq, 微阵列, WB, qPCR, 免疫荧光	hdWGCNA, scCODE, FindMarkers, PPI分析	基因表达数据, 图像数据	16个不同的细胞簇，涵盖7种独特的细胞类型，内皮细胞分为8个亚群
759	2025-05-11	Pdia3 deficiency exacerbates intestinal injury by disrupting goblet and Paneth cell function during ischemia/reperfusion 2025-Jun, Cellular signalling IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111682 PMID:39988288	research paper	本研究探讨了PDIA3在肠缺血/再灌注损伤中维持肠道完整性和免疫功能的作用	首次揭示了PDIA3在肠缺血/再灌注损伤中通过影响杯状细胞和潘氏细胞功能维持肠道屏障功能的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限	探索PDIA3在肠缺血/再灌注损伤中的保护作用及其机制	人类和小鼠的肠道上皮细胞，特别是杯状细胞和潘氏细胞	分子病理学	肠缺血/再灌注损伤	单细胞RNA测序、免疫组化、转录组分析	肠道上皮特异性条件性敲除小鼠模型	基因表达数据、组织病理学数据	人类肠系膜动脉缺血患者样本和Pdia3基因敲除小鼠模型
760	2025-05-11	Pathogenesis, attenuation, and treatment strategies for keloid management 2025-Jun, Tissue & cell IF:2.7Q3 DOI:10.1016/j.tice.2025.102800 PMID:39999656	review	该综述探讨了瘢痕疙瘩的发病机制、减缓和治疗策略	综述了单细胞RNA测序和转录组学在理解瘢痕疙瘩发病机制中的应用，并讨论了新型纳米治疗技术的进展	瘢痕疙瘩治疗后容易复发，治疗过程复杂，需要长期随访	探讨瘢痕疙瘩的发病机制及治疗策略	瘢痕疙瘩的病理生理学及治疗方法	NA	皮肤疾病	单细胞RNA测序, 转录组学	NA	NA	NA