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当前共找到 727 篇文献，本页显示第 701 - 720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 701 | 2025-10-07 |
Developmental landscape and asymmetric gene expression in the leaf vasculature of Brassica rapa revealed by single-cell transcriptome
2025-Jun, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhaf060
PMID:40271455
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研究论文 | 通过单细胞转录组技术揭示白菜叶脉系统的发育轨迹和不对称基因表达模式 | 首次构建白菜叶脉系统的单细胞转录组图谱，揭示不同维管细胞类型的特异性基因表达模式及同源基因的不对称表达 | 研究仅限于白菜叶脉系统，未与其他植物物种进行直接比较 | 解析叶脉系统细胞类型特征及其在叶片形态建成中的作用 | 白菜叶脉系统细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 12个细胞簇覆盖7种已知细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 702 | 2025-10-07 |
Fibroblasts fluctuating between mesenchyme and epithelium are involved in hair follicle mesenchyme development
2025-Jun, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102006
PMID:40271513
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组织化学分析，揭示了在新生小鼠皮肤中成纤维细胞在间充质和上皮间波动参与毛囊间充质发育的过程 | 首次发现表达特定标记的成纤维细胞具有向上皮细胞转换的能力，并证实这些细胞对毛囊真皮干细胞发育的重要贡献 | 研究仅限于小鼠模型，人类皮肤中的类似机制尚未验证 | 阐明上皮-间充质/间充质-上皮转换在皮肤发育中的具体作用和功能 | 新生小鼠皮肤组织 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学分析 | NA | 基因表达数据, 组织图像数据 | 小鼠皮肤样本（包括胚胎期16.5天和老年小鼠） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 703 | 2025-10-07 |
Mitigating ambient RNA and doublets effects on single cell transcriptomics analysis in cancer research
2025-Jun-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217693
PMID:40185305
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研究论文 | 本文探讨了单细胞转录组学分析中环境RNA污染和双细胞效应的缓解方法 | 采用深度学习技术同时解决环境RNA污染和背景噪声问题，提供端到端的数据准备策略 | NA | 提高单细胞转录组数据分析的准确性以支持精准肿瘤学发展 | 肿瘤微环境中的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 704 | 2025-10-07 |
Apigenin inhibits recurrent bladder cancer progression by targeting VEGF-β
2025-Jun-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217676
PMID:40185304
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和分子对接技术，揭示了芹菜素通过靶向VEGF-β抑制复发性膀胱癌进展的机制 | 首次发现VEGF-β在复发性膀胱癌成纤维细胞中显著上调，并证实芹菜素通过靶向VEGF-β抑制肿瘤进展 | 研究主要基于体外实验，缺乏体内动物模型验证 | 探究芹菜素抑制复发性膀胱癌进展的分子机制 | 膀胱癌细胞和成纤维细胞 | 癌症研究 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 分子对接, 体外实验 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 705 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic analysis identifies tissue-specific fibroblasts as the main modulators of myeloid cells in peritoneal metastasis of different origin
2025-Jun-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217678
PMID:40154914
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析发现组织特异性成纤维细胞是不同来源腹膜转移中髓系细胞的主要调节者 | 首次在结直肠癌腹膜转移中发现一种新型成纤维细胞亚群，该亚群具有免疫调节特性并在多种来源的腹膜恶性肿瘤中普遍存在 | 研究样本量有限，需要进一步验证该成纤维细胞亚群的功能机制 | 探究腹膜转移微环境中不同细胞类型间的相互作用机制 | 结直肠癌腹膜转移患者及结直肠癌患者的肿瘤组织和远端正常组织 | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据，组织图像数据 | 结直肠癌腹膜转移和结直肠癌患者的组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 706 | 2025-10-07 |
Multi-omics integration and machine learning identify and validate neutrophil extracellular trap-associated gene signatures in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2025-Jun, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2025.110473
PMID:40089249
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研究论文 | 本研究通过多组学整合和机器学习方法，识别并验证了慢性鼻窦炎伴鼻息肉中中性粒细胞胞外诱捕网相关基因特征 | 首次将多组学整合与机器学习相结合，识别出CXCR4、CYBB和PTAFR三个核心NETs相关基因，并验证其在CRSwNP中的诊断价值和临床相关性 | NA | 探索慢性鼻窦炎伴鼻息肉中中性粒细胞胞外诱捕网的分子特征 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者 | 机器学习 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序,差异表达基因分析,加权基因共表达网络分析 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 707 | 2025-10-07 |
Development and validation of a transcription factor regulatory network-based signature for individualized prognostic risk in lung adenocarcinoma
2025-Jun-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.35375
PMID:39960662
|
研究论文 | 开发并验证基于转录因子调控网络的肺腺癌个体化预后风险特征 | 利用单细胞RNA测序数据构建上皮细胞特异性转录因子调控网络，开发了包含3521个基因对的单细胞基因对特征（scGPS）用于预后预测 | NA | 开发可靠的肺腺癌预后特征用于风险分层 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，微阵列 | 基因对特征模型 | 基因表达数据 | 来自23个队列的2740名患者，包括1个单细胞RNA测序数据集、5个bulk RNA测序数据集和17个微阵列数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 708 | 2025-10-07 |
Fast analysis of Spatial Transcriptomics (FaST): an ultra lightweight and fast pipeline for the analysis of high resolution spatial transcriptomics
2025-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf044
PMID:40248491
|
研究论文 | 开发了一个名为FaST的超轻量快速分析流程，用于处理高分辨率空间转录组数据 | 首个能够在标准多核工作站上快速分析大规模空间转录组数据的流程，无需高性能计算集群 | 依赖spateo-release包进行RNA分割，未集成成像引导的细胞分割功能 | 开发高效的空间转录组数据分析工具 | 空间转录组测序数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组测序数据 | >5亿条测序reads | Illumina | 空间转录组学 | Illumina flow cells | 兼容OpenST、seq-scope、Stereo-seq等协议 |
| 709 | 2025-10-07 |
SciGeneX: enhancing transcriptional analysis through gene module detection in single-cell and spatial transcriptomics data
2025-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf043
PMID:40248490
|
研究论文 | 介绍用于单细胞和空间转录组数据分析的R包SciGeneX，通过基因模块检测增强转录分析能力 | 采用邻域分析和图分割方法生成共表达基因模块，能够发现传统方法忽略的稀有细胞群体 | NA | 开发新的计算方法来更好地解析单细胞和空间转录组数据中的细胞异质性 | 单细胞RNA测序和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 邻域分析，图分割方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 710 | 2025-10-07 |
OmniClust: A versatile clustering toolkit for single-cell and spatial transcriptomics data
2025-Jun, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2025.03.007
PMID:40057293
|
研究论文 | 开发了一个名为OmniClust的多功能聚类工具包，用于单细胞和空间转录组学数据分析 | 开发了首个同时整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据的聚类工具包，采用深度学习算法处理空间转录组数据，机器学习算法处理单细胞RNA测序数据 | NA | 开发一个能够整合单细胞和空间转录组学数据的通用聚类工具包 | 单细胞RNA测序数据和空间转录组学数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 深度学习，机器学习 | 转录组数据 | 12个空间转录组基准数据集和4个单细胞RNA测序基准数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 711 | 2025-10-07 |
Nanoparticle-mediated sodium butyrate delivery for repairing hypoxic-ischemic brain injury in premature infants
2025-Jun, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.101665
PMID:40230649
|
研究论文 | 本研究开发了一种负载丁酸钠的磁性荧光纳米颗粒，通过调节Sp1和TGF-β1信号通路修复早产儿缺氧缺血性脑损伤 | 首次利用磁性荧光纳米颗粒递送丁酸钠，通过磁靶向和聚焦超声技术实现脑部精准给药，并阐明其通过Sp1/TGF-β1信号通路促进脑修复的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在临床患者中验证；纳米颗粒的长期生物安全性需要进一步评估 | 探索纳米颗粒介导的丁酸钠递送系统对早产儿缺氧缺血性脑损伤的修复机制 | 缺氧缺血性脑病早产儿模型小鼠 | 纳米医学 | 新生儿缺氧缺血性脑病 | 单细胞RNA测序, 高通量转录组分析, 非靶向代谢组学 | NA | 代谢组数据, 转录组数据, 图像数据 | HIEP小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 712 | 2025-10-07 |
Precise measurement of CRISPR genome editing outcomes through single-cell DNA sequencing
2025-Jun-12, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2025.101449
PMID:40225018
|
研究论文 | 本研究利用单细胞DNA测序技术精确测量CRISPR基因组编辑结果 | 首次采用单细胞测序技术在单细胞水平全面分析CRISPR编辑结果，包括编辑合子性、结构变异和细胞克隆性 | 未明确说明样本规模和实验验证的局限性 | 开发精确测量基因编辑结果的方法以确保基因治疗产品的安全性 | 经过三重编辑的细胞基因型 | 基因组编辑 | NA | 单细胞DNA测序 | NA | DNA序列数据 | NA | Mission Bio | 单细胞DNA测序 | Tapestri | Tapestri单细胞DNA测序平台 |
| 713 | 2025-10-07 |
Proline mitigates antibiotic resistance evolution induced by ciprofloxacin at environmental concentrations
2025-Jun-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137561
PMID:39938368
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研究论文 | 本研究通过实验发现脯氨酸能够有效缓解环境中环丙沙星诱导的抗生素耐药性进化 | 首次发现脯氨酸可通过调节细菌代谢状态来抑制抗生素耐药性进化，并揭示了其作用机制 | 研究主要针对土壤分离的大肠杆菌，对其他菌种和环境的应用效果需进一步验证 | 探索氨基酸在控制环境抗生素耐药性进化中的作用 | 土壤分离的大肠杆菌及其他细菌种群（如假单胞菌属和沙雷氏菌属） | 微生物学 | 细菌感染 | 转录组学，C代谢通量分析，单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据，代谢通量数据，单细胞RNA测序数据 | 18种氨基酸筛选，24天进化实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 714 | 2025-10-07 |
PANoptosis-related gene biomarkers in aortic dissection
2025-Jun, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2025.110385
PMID:40086567
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析确定了主动脉夹层中血管平滑肌细胞PANoptosis相关的关键基因标志物 | 首次在主动脉夹层中系统评估了包含焦亡、凋亡和坏死性凋亡的PANoptosis过程，并识别出三个关键基因标志物 | 研究依赖于公共数据库数据，样本量有限，需要进一步实验验证 | 探究PANoptosis在主动脉夹层发病机制中的作用并识别相关基因标志物 | 主动脉夹层患者的血管平滑肌细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞测序, 加权基因共表达网络分析, 基因富集分析 | NA | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE213740, GSE153434, GSE147026, GSE52093)和患者组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 715 | 2025-10-07 |
PLA2G4F is a metabolic checkpoint in triple-negative breast cancer: Insights from multiple omics analysis and experiments
2025-Jun-18, Molecular therapy. Oncology
DOI:10.1016/j.omton.2025.200963
PMID:40212962
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验验证，发现PLA2G4F是三阴性乳腺癌的代谢检查点基因 | 首次系统分析TNBC代谢异质性，鉴定出104个候选代谢检查点基因，并通过单细胞RNA测序发现PLA2G4F在恶性细胞中特异性表达 | 未明确说明样本量大小，部分机制研究仍需深入验证 | 探索三阴性乳腺癌的代谢异质性及潜在治疗靶点 | 三阴性乳腺癌患者和肿瘤细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 多组学分析, 共识聚类 | NA | 基因表达数据, 突变谱, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 716 | 2025-10-07 |
Roles of Adam8 in Neuroinflammation in experimental ischemic Stroke: Insights from single-cell and ribosome-bound mRNA sequencing
2025-Jun, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2025.115207
PMID:40064361
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研究论文 | 本研究通过单细胞和核糖体结合mRNA测序技术揭示了Adam8在实验性缺血性卒中神经炎症中的关键作用 | 首次整合单细胞测序和核糖体结合mRNA测序数据，发现Adam8在转录和翻译水平均上调，并验证其作为治疗靶点的潜力 | 研究基于小鼠模型，临床转化需进一步验证；样本量相对有限 | 探究缺血性卒中后神经炎症的分子机制，特别是小胶质细胞迁移的调控机制 | 小鼠远端大脑中动脉闭塞模型中的小胶质细胞 | 神经科学 | 缺血性卒中 | 单细胞RNA测序, 核糖体结合mRNA测序, 蛋白质分析, 免疫荧光 | NA | 单细胞测序数据, 核糖体结合mRNA测序数据, 蛋白质数据 | 公共数据集GSE234052和GSE225110 | NA | 单细胞RNA测序, 核糖体结合mRNA测序 | NA | NA |
| 717 | 2025-10-07 |
Organoid-based single cell sequencing revealed the lineage evolution during docetaxel treatment in gastric cancer
2025-Jun-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217617
PMID:40118243
|
研究论文 | 通过类器官单细胞测序揭示胃癌多西他赛治疗过程中的谱系演化 | 首次利用胃癌类器官模型结合单细胞RNA测序系统解析多西他赛耐药过程中的细胞群体动态变化和关键基因调控机制 | 研究主要基于类器官模型，需要进一步在临床样本中验证 | 探索胃癌多西他赛耐药的细胞分子机制 | 胃癌类器官和细胞系 | 单细胞测序 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 敏感和耐药胃癌类器官模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 718 | 2025-10-07 |
Unveiling the crucial role of CD8+ T cell and endothelial cell interaction in rheumatoid arthritis through the integrated analysis of spatial transcriptomics and bulk/single-cell RNA-seq
2025-Jun, Journal of translational autoimmunity
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.jtauto.2025.100285
PMID:40212397
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研究论文 | 通过整合分析空间转录组学和批量/单细胞RNA-seq数据，揭示CD8+ T细胞与内皮细胞相互作用在类风湿关节炎中的关键作用 | 首次通过三阶段分析框架整合多种转录组数据，系统揭示CD8+ T细胞与内皮细胞通过趋化因子信号通路的相互作用是RA进展的关键驱动因素 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据分析，缺乏实验验证 | 阐明类风湿关节炎发病机制中关键的细胞间相互作用 | 类风湿关节炎患者的滑膜组织细胞 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 13个单细胞RNA测序数据集，包含多个GEO和EBI数据库样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 719 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity and regulatory modules of cell-specific RNA-binding proteins in patients with systemic lupus erythematosus
2025-Jun, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.101977
PMID:40212811
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示系统性红斑狼疮患者细胞特异性RNA结合蛋白的异质性和调控网络 | 首次在单细胞分辨率系统性分析SLE皮肤微环境中不同细胞类型的RBP表达异质性，并整合多组学数据构建RBP与可变剪接事件的调控网络 | 研究基于公开数据库的样本，样本量相对有限，且主要聚焦皮肤病变组织 | 阐明系统性红斑狼疮中RNA结合蛋白的细胞特异性表达模式和调控机制 | 系统性红斑狼疮患者和健康对照者的皮肤活检组织 | 单细胞转录组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-Seq, 可变剪接分析 | 共表达网络分析 | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | 来自公开数据库的SLE患者和健康对照皮肤活检样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 720 | 2025-10-07 |
Transcriptome analysis reveals the potential role of neural factor EN1 for long-terms survival in estrogen receptor-independent breast cancer
2025-Jun-18, Molecular therapy. Oncology
DOI:10.1016/j.omton.2025.200965
PMID:40207200
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研究论文 | 通过转录组分析揭示神经因子EN1在雌激素受体非依赖性乳腺癌长期生存中的潜在作用 | 首次发现神经相关通路在TNBC患者10年无复发生存中的差异富集，并开发了基于机器学习的早期复发指数预测模型 | 研究主要基于回顾性数据分析，需要进一步实验验证EN1的功能机制 | 探索雌激素受体阴性乳腺癌复发相关的生物标志物和生物学过程 | 乳腺癌患者，特别是三阴性乳腺癌和HER2阳性乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 机器学习 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 285个癌和癌旁样本（来自155名TNBC患者）及7,449名乳腺癌患者的11个独立公共队列数据 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |