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当前共找到 736 篇文献，本页显示第 701 - 720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 701 | 2025-10-07 |
Integrating Bulk RNA and Single-Cell Sequencing Data Unveils Efferocytosis Patterns and ceRNA Network in Ischemic Stroke
2025-Jun, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-024-01255-8
PMID:38678526
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA和单细胞测序数据，揭示了缺血性脑卒中中的胞葬作用模式和ceRNA网络 | 首次整合bulk RNA和单细胞测序数据系统分析缺血性脑卒中中的胞葬作用，并构建了相关的ceRNA调控网络 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限 | 探索缺血性脑卒中后炎症反应和胞葬作用的细胞分子机制及其对脑损伤和恢复的影响 | 缺血性脑卒中患者和小鼠模型 | 生物信息学 | 缺血性脑卒中 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 生物信息学分析 | LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 多个GEO数据集（GSE137482, GSE30655, GSE174574等），包括小鼠和人类样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 702 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomics Revealed White Matter Repair Following Subarachnoid Hemorrhage
2025-Jun, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-024-01265-6
PMID:38861152
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了蛛网膜下腔出血后白质修复的细胞机制 | 首次在SAH模型中识别出修复性小胶质细胞在白质富集区域的浸润和克隆扩增，并发现小胶质细胞相关多效蛋白通过mTOR信号通路调节少突胶质前体细胞 | 研究仅使用小鼠模型，结果向人类临床应用的转化需要进一步验证 | 阐明蛛网膜下腔出血急性期和亚急性期脑细胞亚群在白质修复中的作用机制 | 蛛网膜下腔出血模型小鼠 | 单细胞组学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, 磁共振成像, 免疫荧光双染色, Western blot | NA | 单细胞转录组数据, 影像数据, 蛋白质数据 | SAH模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 703 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals tissue-specific transcriptomic changes induced by perfluorooctanesulfonic acid (PFOS) in larval zebrafish (Danio rerio)
2025-Jun-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137515
PMID:39947082
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究全氟辛烷磺酸(PFOS)对斑马鱼幼虫组织特异性转录组变化的影响 | 首次在斑马鱼幼虫中应用单细胞RNA测序技术揭示PFOS的组织特异性毒性机制 | 仅使用16μM单一浓度PFOS暴露，缺乏剂量效应关系研究 | 探究PFOS发育毒性的分子机制和组织特异性效应 | 斑马鱼(Danio rerio)幼虫 | 单细胞生物学 | 发育毒性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼幼虫样本(3-72小时受精后) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 704 | 2025-10-07 |
Uncovering differences in cadmium accumulation capacity of different Ipomoea aquatica cultivars at the level of root cell types
2025-Jun, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhaf077
PMID:40297020
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了不同空心菜品种根部细胞类型在镉积累能力差异中的机制 | 首次在单细胞水平比较了低镉积累和高镉积累空心菜品种根部细胞类型的基因表达差异，揭示了表皮细胞木质素沉积和激素相关基因在镉固定与转运中的关键作用 | 研究仅针对两个栽培品种，样本规模有限，且机制验证主要基于基因表达分析和荧光检测，需要进一步的功能实验证实 | 阐明不同空心菜品种根部细胞类型在镉积累能力差异中的分子机制 | 空心菜（Ipomoea aquatica）QLQ（低镉积累）和T308（高镉积累）两个栽培品种的根尖细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序，荧光检测 | NA | 基因表达数据，荧光成像数据 | 两个空心菜栽培品种的根尖细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 705 | 2025-10-07 |
Broflanilide induces zebrafish neurobehavioral defects by interfering with synaptic homeostasis
2025-Jun, Aquatic toxicology (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.aquatox.2025.107355
PMID:40209298
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研究论文 | 研究溴虫氟苯双酰胺通过干扰突触稳态诱导斑马鱼神经行为缺陷的机制 | 首次在斑马鱼模型中揭示溴虫氟苯双酰胺通过跨细胞类型的转录调控介导神经毒性 | 仅研究单一农药的长期暴露效应，缺乏多农药联合暴露的对比研究 | 探究溴虫氟苯双酰胺对斑马鱼神经行为的影响及其神经细胞异质性机制 | 成年斑马鱼 | 神经毒理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序,靶向代谢组学,神经行为测试 | 斑马鱼模型 | 基因表达数据,代谢组数据,行为数据 | 暴露于5和25 μg/L溴虫氟苯双酰胺30天的斑马鱼 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 706 | 2025-10-07 |
Spatially resolved multi-omics reveals the renal cortex-metabolic reprogramming of Shenhua Tablet for intervention on IgA nephropathy
2025-Jun, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.156742
PMID:40233505
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研究论文 | 本研究利用空间多组学技术揭示了肾华片通过调节谷胱甘肽代谢、糖酵解和L-脯氨酸代谢干预IgA肾病的分子机制 | 首次采用空间多组学策略解析中药复方在肾脏不同区域的代谢重编程作用机制 | 研究基于大鼠模型，缺乏人体临床试验验证 | 探索肾华片干预IgA肾病的分子机制 | IgA肾病大鼠模型 | 空间多组学 | IgA肾病 | 空间代谢组学, 空间转录组学, 质谱成像 | NA | 代谢组数据, 转录组数据, 图像数据 | IgA肾病大鼠模型 | NA | 空间代谢组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 707 | 2025-10-07 |
Discovering governing equations of biological systems through representation learning and sparse model discovery
2025-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf048
PMID:40290314
|
研究论文 | 提出了一种名为CLERA的端到端计算框架，通过表示学习和稀疏模型发现来揭示生物系统的控制方程 | 将监督自编码器架构与非线性动力学稀疏识别相结合，利用先验知识同时提取低维表示并发现驱动过程的潜在动力系统 | NA | 从单细胞RNA测序数据中发现简约的动态模型并识别活跃基因程序 | 合成数据和生物数据中的基因表达动态 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 监督自编码器, Sparse Identification of Nonlinear Dynamics | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 708 | 2025-10-07 |
Identifying similar populations across independent single cell studies without data integration
2025-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf042
PMID:40276039
|
研究论文 | 提出一种无需数据整合即可量化独立单细胞研究间细胞群相似性的统计方法 | 开发了无需数据校正或整合即可跨数据集比较细胞群相似性的新方法，避免了信息丢失和人为误差 | NA | 开发跨独立单细胞研究识别相似细胞群体的计算方法 | 单细胞数据中的细胞群体 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞蛋白质组学 | 统计方法 | 单细胞多组学数据 | 成年小鼠运动皮层和脊髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 709 | 2025-10-07 |
Decoding glioblastoma's diversity: Are neurons part of the game?
2025-Jun-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217666
PMID:40147584
|
综述 | 本文综述胶质母细胞瘤与神经元相互作用的机制，分析其如何利用神经发育途径并重塑神经元网络 | 首次系统整合胶质母细胞瘤-神经元相互作用研究，并通过生物信息学分析提出驱动胶质瘤-神经元动态的细胞间相互作用假说 | 依赖公开数据库的snRNA-seq数据，需要进一步实验验证提出的相互作用机制 | 阐明胶质母细胞瘤与神经元的相互作用机制及其治疗潜力 | 胶质母细胞瘤（WHO 4级）及其与神经元的相互作用 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单核RNA测序（snRNA-seq），生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 公开数据库中的snRNA-seq数据集 | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 710 | 2025-10-07 |
Developmental landscape and asymmetric gene expression in the leaf vasculature of Brassica rapa revealed by single-cell transcriptome
2025-Jun, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhaf060
PMID:40271455
|
研究论文 | 通过单细胞转录组技术揭示白菜叶脉系统的发育轨迹和不对称基因表达模式 | 首次构建白菜叶脉系统的单细胞转录组图谱，揭示不同维管细胞类型的特异性基因表达模式及同源基因的不对称表达 | 研究仅限于白菜叶脉系统，未与其他植物物种进行直接比较 | 解析叶脉系统细胞类型特征及其在叶片形态建成中的作用 | 白菜叶脉系统细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 12个细胞簇覆盖7种已知细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 711 | 2025-10-07 |
Fibroblasts fluctuating between mesenchyme and epithelium are involved in hair follicle mesenchyme development
2025-Jun, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102006
PMID:40271513
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组织化学分析，揭示了在新生小鼠皮肤中成纤维细胞在间充质和上皮间波动参与毛囊间充质发育的过程 | 首次发现表达特定标记的成纤维细胞具有向上皮细胞转换的能力，并证实这些细胞对毛囊真皮干细胞发育的重要贡献 | 研究仅限于小鼠模型，人类皮肤中的类似机制尚未验证 | 阐明上皮-间充质/间充质-上皮转换在皮肤发育中的具体作用和功能 | 新生小鼠皮肤组织 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学分析 | NA | 基因表达数据, 组织图像数据 | 小鼠皮肤样本（包括胚胎期16.5天和老年小鼠） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 712 | 2025-10-07 |
Mitigating ambient RNA and doublets effects on single cell transcriptomics analysis in cancer research
2025-Jun-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217693
PMID:40185305
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研究论文 | 本文探讨了单细胞转录组学分析中环境RNA污染和双细胞效应的缓解方法 | 采用深度学习技术同时解决环境RNA污染和背景噪声问题，提供端到端的数据准备策略 | NA | 提高单细胞转录组数据分析的准确性以支持精准肿瘤学发展 | 肿瘤微环境中的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 713 | 2025-10-07 |
Apigenin inhibits recurrent bladder cancer progression by targeting VEGF-β
2025-Jun-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217676
PMID:40185304
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和分子对接技术，揭示了芹菜素通过靶向VEGF-β抑制复发性膀胱癌进展的机制 | 首次发现VEGF-β在复发性膀胱癌成纤维细胞中显著上调，并证实芹菜素通过靶向VEGF-β抑制肿瘤进展 | 研究主要基于体外实验，缺乏体内动物模型验证 | 探究芹菜素抑制复发性膀胱癌进展的分子机制 | 膀胱癌细胞和成纤维细胞 | 癌症研究 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 分子对接, 体外实验 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 714 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic analysis identifies tissue-specific fibroblasts as the main modulators of myeloid cells in peritoneal metastasis of different origin
2025-Jun-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217678
PMID:40154914
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析发现组织特异性成纤维细胞是不同来源腹膜转移中髓系细胞的主要调节者 | 首次在结直肠癌腹膜转移中发现一种新型成纤维细胞亚群，该亚群具有免疫调节特性并在多种来源的腹膜恶性肿瘤中普遍存在 | 研究样本量有限，需要进一步验证该成纤维细胞亚群的功能机制 | 探究腹膜转移微环境中不同细胞类型间的相互作用机制 | 结直肠癌腹膜转移患者及结直肠癌患者的肿瘤组织和远端正常组织 | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据，组织图像数据 | 结直肠癌腹膜转移和结直肠癌患者的组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 715 | 2025-10-07 |
Multi-omics integration and machine learning identify and validate neutrophil extracellular trap-associated gene signatures in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2025-Jun, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2025.110473
PMID:40089249
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研究论文 | 本研究通过多组学整合和机器学习方法，识别并验证了慢性鼻窦炎伴鼻息肉中中性粒细胞胞外诱捕网相关基因特征 | 首次将多组学整合与机器学习相结合，识别出CXCR4、CYBB和PTAFR三个核心NETs相关基因，并验证其在CRSwNP中的诊断价值和临床相关性 | NA | 探索慢性鼻窦炎伴鼻息肉中中性粒细胞胞外诱捕网的分子特征 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者 | 机器学习 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序,差异表达基因分析,加权基因共表达网络分析 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 716 | 2025-10-07 |
Development and validation of a transcription factor regulatory network-based signature for individualized prognostic risk in lung adenocarcinoma
2025-Jun-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.35375
PMID:39960662
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研究论文 | 开发并验证基于转录因子调控网络的肺腺癌个体化预后风险特征 | 利用单细胞RNA测序数据构建上皮细胞特异性转录因子调控网络，开发了包含3521个基因对的单细胞基因对特征（scGPS）用于预后预测 | NA | 开发可靠的肺腺癌预后特征用于风险分层 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，微阵列 | 基因对特征模型 | 基因表达数据 | 来自23个队列的2740名患者，包括1个单细胞RNA测序数据集、5个bulk RNA测序数据集和17个微阵列数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 717 | 2025-10-07 |
Fast analysis of Spatial Transcriptomics (FaST): an ultra lightweight and fast pipeline for the analysis of high resolution spatial transcriptomics
2025-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf044
PMID:40248491
|
研究论文 | 开发了一个名为FaST的超轻量快速分析流程，用于处理高分辨率空间转录组数据 | 首个能够在标准多核工作站上快速分析大规模空间转录组数据的流程，无需高性能计算集群 | 依赖spateo-release包进行RNA分割，未集成成像引导的细胞分割功能 | 开发高效的空间转录组数据分析工具 | 空间转录组测序数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组测序数据 | >5亿条测序reads | Illumina | 空间转录组学 | Illumina flow cells | 兼容OpenST、seq-scope、Stereo-seq等协议 |
| 718 | 2025-10-07 |
SciGeneX: enhancing transcriptional analysis through gene module detection in single-cell and spatial transcriptomics data
2025-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf043
PMID:40248490
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研究论文 | 介绍用于单细胞和空间转录组数据分析的R包SciGeneX，通过基因模块检测增强转录分析能力 | 采用邻域分析和图分割方法生成共表达基因模块，能够发现传统方法忽略的稀有细胞群体 | NA | 开发新的计算方法来更好地解析单细胞和空间转录组数据中的细胞异质性 | 单细胞RNA测序和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 邻域分析，图分割方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 719 | 2025-10-07 |
OmniClust: A versatile clustering toolkit for single-cell and spatial transcriptomics data
2025-Jun, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2025.03.007
PMID:40057293
|
研究论文 | 开发了一个名为OmniClust的多功能聚类工具包，用于单细胞和空间转录组学数据分析 | 开发了首个同时整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据的聚类工具包，采用深度学习算法处理空间转录组数据，机器学习算法处理单细胞RNA测序数据 | NA | 开发一个能够整合单细胞和空间转录组学数据的通用聚类工具包 | 单细胞RNA测序数据和空间转录组学数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 深度学习，机器学习 | 转录组数据 | 12个空间转录组基准数据集和4个单细胞RNA测序基准数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 720 | 2025-10-07 |
Nanoparticle-mediated sodium butyrate delivery for repairing hypoxic-ischemic brain injury in premature infants
2025-Jun, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.101665
PMID:40230649
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研究论文 | 本研究开发了一种负载丁酸钠的磁性荧光纳米颗粒，通过调节Sp1和TGF-β1信号通路修复早产儿缺氧缺血性脑损伤 | 首次利用磁性荧光纳米颗粒递送丁酸钠，通过磁靶向和聚焦超声技术实现脑部精准给药，并阐明其通过Sp1/TGF-β1信号通路促进脑修复的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在临床患者中验证；纳米颗粒的长期生物安全性需要进一步评估 | 探索纳米颗粒介导的丁酸钠递送系统对早产儿缺氧缺血性脑损伤的修复机制 | 缺氧缺血性脑病早产儿模型小鼠 | 纳米医学 | 新生儿缺氧缺血性脑病 | 单细胞RNA测序, 高通量转录组分析, 非靶向代谢组学 | NA | 代谢组数据, 转录组数据, 图像数据 | HIEP小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |