单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
681	2025-06-03	Wnt1's Differential Effects on Craniofacial Bone and Tooth Development 2025-Jun-02, Journal of dental research IF:5.7Q1 DOI:10.1177/00220345251336191 PMID:40454459	research paper	该研究探讨了Wnt1信号通路在小鼠颅面骨和牙齿发育中的不同作用	揭示了Wnt1在不同发育阶段对颅面骨和牙齿发育的差异性影响，并发现了其对破骨细胞生成的剂量依赖性抑制作用	研究仅基于小鼠模型，结果可能无法完全适用于人类	探究Wnt1信号通路在颅面骨和牙齿发育中的具体机制	小鼠颅面骨和牙齿	发育生物学	颅面发育异常	单细胞测序、RNA测序、显微CT	转基因小鼠模型	基因表达数据、影像数据	NA
682	2025-06-03	Lung endothelial cell heterogeneity in health and pulmonary vascular disease 2025-Jun-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology DOI:10.1152/ajplung.00296.2024 PMID:39772753	mini-review	本文探讨了肺内皮细胞（ECs）在健康和肺血管疾病中的异质性，特别关注单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术的应用	通过scRNA-seq技术揭示了肺内皮细胞的异质性，发现了新的细胞类型如aerocytes和general capillary ECs，并识别了与肺动脉高压（PH）发病机制相关的多个新途径和机制	NA	探索肺内皮细胞异质性在肺血管疾病中的作用，特别是肺动脉高压（PH）的发病机制	肺内皮细胞（ECs）	生物医学研究	肺动脉高压（PH）	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单核RNA测序、空间转录组学	NA	基因表达数据	NA
683	2025-06-03	Characterization of the recombination activity in the pituitary and ovary of Prop1-iCre knockin mice 2025-Jun-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism DOI:10.1152/ajpendo.00049.2025 PMID:40327412	研究论文	本研究描述了Prop1-iCre敲入小鼠在垂体内分泌细胞和卵巢颗粒细胞中的重组活性	通过CRISPR/Cas9系统引入IRES-Cre盒，实现了Prop1和Cre重组酶的双顺反子表达，展示了在垂体内分泌细胞和卵巢颗粒细胞中的特异性重组活性	Prop1-iCre小鼠在卵巢颗粒细胞中的重组活性可能会对数据解释造成复杂影响	研究Prop1-iCre敲入小鼠的重组活性，为垂体生物学提供基因操作工具	Prop1-iCre敲入小鼠的垂体内分泌细胞和卵巢颗粒细胞	分子生物学	NA	CRISPR/Cas9系统，单细胞RNA测序分析	NA	基因表达数据	Prop1-iCre小鼠及其与Rosa-tdTomato报告鼠的杂交后代
684	2025-06-03	Oncostatin-M: a novel leukocyte-derived factor facilitating the ovulatory process in the human ovary 2025-Jun-01, Human reproduction (Oxford, England) DOI:10.1093/humrep/deaf076 PMID:40327872	研究论文	研究探讨了白细胞衍生的Oncostatin-M (OSM)在人类优势卵泡排卵过程中的调控作用	首次揭示了OSM在人类排卵过程中的关键作用，特别是在激活信号通路、调节类固醇生成和前列腺素合成方面的功能	研究使用的是体外培养的人类颗粒/黄体细胞(hGLCs)，可能无法完全模拟体内排卵动态，且结果仅适用于人类样本，需要在其他哺乳动物物种中验证	探索白细胞衍生的OSM是否调控人类优势卵泡的排卵过程	人类优势卵泡和体外培养的人类颗粒/黄体细胞(hGLCs)	生殖生物学	NA	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、定量PCR(qPCR)、免疫组化、Western blotting、RNA测序	NA	基因表达数据、蛋白质数据	自然周期女性优势卵泡(n=19)和IVF患者卵泡抽吸物(n=12)
685	2025-06-03	Dynamics of T Cell-Mediated Immune Signaling Network During Pathogenesis of Chronic Obstructive Pulmonary Disease 2025-Jun, Yonsei medical journal IF:2.6Q1 DOI:10.3349/ymj.2024.0227 PMID:40414827	研究论文	本研究通过RNA测序技术分析了慢性阻塞性肺病（COPD）从轻度到重度阶段的免疫信号网络动态，并探讨了COPD与COVID-19之间的相关性	首次通过单细胞RNA测序揭示了COPD从轻度到重度阶段的免疫反应变化，并发现中度COPD与COVID-19具有相似的生物学模式	样本量相对较小，尤其是重度COPD患者仅3例，可能影响结果的普遍性	识别COPD病情进展的特征标志物，并探索COPD与COVID-19之间的相关性	健康个体（43例）、COPD患者（39例）和COVID-19患者（20例）	生物医学	慢性阻塞性肺病（COPD）和COVID-19	Bulk RNA测序、单细胞RNA测序、单核RNA测序	NA	RNA测序数据	总计119例样本（43健康人+39 COPD+7轻度+7中度+3重度+20 COVID-19）
686	2025-06-02	Endogenous Retroelement Activation is Implicated in Interferon-α Production and Anti-Cyclic Citrullinated Peptide Autoantibody Generation in Early Rheumatoid Arthritis 2025-Jun, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.) DOI:10.1002/art.43083 PMID:39681508	研究论文	本研究探讨了内源性逆转录元件(EREs)在早期类风湿性关节炎(eRA)中的表达及其与干扰素-α(IFN-α)产生和抗环瓜氨酸肽(anti-CCP)自身抗体生成的关系	首次在eRA中研究了外周血和滑膜组织中ERE的表达，揭示了ERE与IFN-I产生之间的潜在因果关系以及与anti-CCP自身抗体的有趣关联	样本量相对较小(eRA滑膜组织n=22，全血样本n=56)，且未进行机制验证实验	探究EREs作为类风湿性关节炎(RA)中干扰素源性触发因素的潜在作用	早期类风湿性关节炎(eRA)患者和早期银屑病关节炎(ePsA)患者的血液和滑膜组织样本	风湿病学	类风湿性关节炎	逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)、NanoString技术、流式细胞分选、单细胞测序数据分析	NA	基因表达数据、蛋白质水平数据、单细胞测序数据	eRA滑膜组织样本22例，全血样本56例，以及ePsA患者样本
687	2025-06-02	Association of Synovial Innate Immune Exhaustion With Worse Pain in Knee Osteoarthritis 2025-Jun, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.) DOI:10.1002/art.43089 PMID:39690716	research paper	该研究探讨了膝关节骨关节炎（OA）患者滑膜先天免疫细胞耗竭与更严重疼痛之间的关联	首次发现滑膜免疫调节性巨噬细胞的耗竭和功能障碍与OA患者更严重的疼痛相关，并可能成为重要治疗靶点	样本量相对有限（n=122），且未探讨因果关系	识别与膝关节OA患者更严重疼痛相关的滑膜先天免疫细胞亚群和病理生理机制	122名轻度至重度膝关节OA疼痛患者	免疫病理学	骨关节炎	空间转录组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序	NA	组织活检样本、转录组数据、蛋白质组数据	122例膝关节OA患者的滑膜组织活检（其中32例进行空间组学分析，8例进行单细胞测序）
688	2025-06-01	Prediction of Clinically Significant Prostate Cancer by a Specific Collagen-related Transcriptome, Proteome, and Urinome Signature 2025-Jun, European urology oncology IF:8.3Q1 DOI:10.1016/j.euo.2024.05.014 PMID:38851995	研究论文	通过胶原相关转录组、蛋白质组和尿液组特征预测临床显著性前列腺癌	研究发现胶原相关基因和蛋白质在前列腺癌中的差异表达，并建立了基于胶原的机器学习模型，其预测性能优于PSA和年龄，与mpMRI相当	研究的回顾性性质是一个限制	分析胶原相关转录组、蛋白质组和尿液组变化以检测临床显著性前列腺癌	前列腺癌患者	数字病理学	前列腺癌	单细胞RNA测序, 机器学习	机器学习模型	转录组数据, 蛋白质组数据, 尿液组数据	转录组(n=1393), 蛋白质组(n=104), 尿液组(n=923)
689	2025-06-01	Construction and validation of a regulatory T cells-based classification of renal cell carcinoma: an integrated bioinformatic analysis and clinical cohort study 2025-Jun, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands) DOI:10.1007/s13402-024-01030-9 PMID:39714755	研究论文	通过整合生物信息学分析和临床队列研究，构建并验证了基于调节性T细胞的肾细胞癌分类系统	首次定义了44个与Treg状态相关的预后基因，并构建了RCC-TSC分类系统，揭示了高免疫浸润肾细胞癌亚型的预后和治疗意义	研究主要基于回顾性数据，需要前瞻性研究进一步验证	探索调节性T细胞与肾细胞癌异质性的关系，并建立预后分类系统	肾细胞癌患者	数字病理学	肾细胞癌	单细胞RNA测序、免疫组化染色	monocle2伪时间分析、多变量Cox比例风险回归分析	RNA-seq数据、临床数据	TCGA-KIRC队列的537个RNA-seq样本和新华队列的370例肾肿瘤患者
690	2025-06-01	ENPP1 promotes immune suppression, drug resistance, and adverse outcomes in bladder cancer: Potential for targeted therapy 2025-Jun, Cancer genetics IF:1.4Q4 DOI:10.1016/j.cancergen.2025.03.001 PMID:40058167	research paper	本研究探讨了ENPP1在膀胱癌中的表达及其对肿瘤进展、凋亡和免疫微环境的影响	首次系统研究了ENPP1在膀胱癌中的作用机制，并发现其与免疫抑制、药物耐药性和不良预后的关联	样本量相对较小（36例患者），且主要基于体外细胞实验和生物信息学分析	探索ENPP1在膀胱癌中的作用及其作为治疗靶点的潜力	膀胱癌组织和细胞系	肿瘤学	膀胱癌	RT-qPCR、Western blotting、免疫组化、scRNA-seq	NA	基因表达数据、临床数据、单细胞RNA测序数据	TCGA-BLCA和GEO数据集中的膀胱癌样本，以及36例本地临床膀胱癌患者样本
691	2025-06-01	Characterizing the Cellular Constituents of Proximal Airway Disease in Granulomatosis With Polyangiitis 2025-Jun, Otolaryngology--head and neck surgery : official journal of American Academy of Otolaryngology-Head and Neck Surgery DOI:10.1002/ohn.1197 PMID:40062629	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了肉芽肿性多血管炎(GPA)患者近端气道黏膜的细胞组成，揭示了GPA风险基因在免疫细胞中的定位及其独特的炎症T细胞亚群	首次使用单细胞RNA测序技术全面解析GPA气道疾病的细胞组成，并发现GPA特有的CD4-/CD8-炎症T细胞亚群	研究样本量较小(n=9 GPA患者)，且为单中心研究	阐明GPA近端气道疾病的细胞组成和发病机制	肉芽肿性多血管炎(GPA)患者的近端气道黏膜组织	数字病理学	肉芽肿性多血管炎	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	Monocle 3(用于伪时间分析)	RNA测序数据	GPA患者9例，特发性声门下狭窄(iSGS)7例，插管后近端狭窄(PIPS)5例，对照10例
692	2025-06-01	Bioinformatics identification of shared signaling pathways and core targets linking Benzo[a]pyrene exposure to HCC progression 2025-06, Toxicology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.tox.2025.154129 PMID:40174762	研究论文	本研究通过生物信息学方法探索苯并[a]芘(BaP)在肝癌进展中的潜在分子机制	首次通过综合数据库分析和分子对接技术，识别了BaP与肝癌相关的核心靶点及其作用通路	研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证	探索环境污染物BaP在肝癌进展中的分子机制	苯并[a]芘(BaP)与肝癌的关联机制	生物信息学	肝癌	生物信息学分析、分子对接	NA	基因组数据、蛋白质互作数据	从多个数据库获取的数据，具体样本量未明确说明
693	2025-06-01	Alterations in genomic features and the tumour immune microenvironment predict immunotherapy outcomes in advanced biliary tract cancer patients 2025-Jun, British journal of cancer IF:6.4Q1 DOI:10.1038/s41416-025-03011-7 PMID:40211026	研究论文	本研究构建了一个多维策略，用于预测晚期胆道癌患者免疫治疗的预后	通过整合基因组特征、肿瘤免疫微环境和单细胞转录组数据，开发了一个新的预测模型（EM-CXCL10），其预测性能优于传统的肿瘤突变负荷（TMB）和突变评分	样本量较小（60例患者），且仅部分患者接受了基因测序和细胞因子检测	预测晚期胆道癌患者对免疫治疗的反应	晚期胆道癌患者	肿瘤免疫学	胆道癌	520基因面板测序、多重循环细胞因子检测、单细胞转录组测序	LASSO算法、Cox回归模型	基因组数据、转录组数据、临床数据	60例晚期胆道癌患者（30例基因测序，50例细胞因子检测）
694	2025-06-01	Alternative splicing in autism spectrum disorder: Recent insights from mechanisms to therapy 2025-Jun, Asian journal of psychiatry IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.ajp.2025.104501 PMID:40273800	review	本文综述了自闭症谱系障碍(ASD)中可变剪接(AS)的最新研究进展，从机制到治疗	强调了异常剪接事件及其调节因子在ASD发病机制中的作用，并探讨了新兴技术在AS研究中的应用	NA	理解ASD中异常剪接的机制及其功能后果，以揭示该疾病的分子基础并促进治疗策略的开发	自闭症谱系障碍(ASD)中的可变剪接(AS)机制	自然语言处理	自闭症谱系障碍	长读长测序、单细胞测序、空间转录组学和CRISPR-Cas系统	NA	RNA数据	NA
695	2025-06-01	Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics reveal unique subpopulations of infiltrating macrophages and dendritic cells following AKI 2025-Jun-01, American journal of physiology. Renal physiology DOI:10.1152/ajprenal.00059.2025 PMID:40331777	研究论文	通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了急性肾损伤后浸润的巨噬细胞和树突状细胞的独特亚群	结合单细胞RNA测序、空间转录组学和CITE测序技术，首次全面描述了急性肾损伤后肾脏浸润巨噬细胞和树突状细胞的时空及转录特征	研究仅关注了缺血再灌注损伤模型，未涉及其他类型的肾损伤	阐明急性肾损伤后肾脏浸润免疫细胞的动态变化特征	肾脏浸润巨噬细胞(KIMs)和肾脏树突状细胞(KDCs)	单细胞组学	急性肾损伤	scRNAseq, 空间转录组学, CITE测序	NA	单细胞转录组数据, 空间转录组数据	NA
696	2025-06-01	Identification and regulation of EMT cells in vivo by laser stimulation 2025-Jun, APL bioengineering IF:6.6Q1 DOI:10.1063/5.0268350 PMID:40438388	research paper	本研究通过激光刺激方法探究PLCG2在上皮-间质转化(EMT)细胞中的作用及其调控机制	首次使用飞秒激光扫描光刺激方法激活细胞内钙信号并诱导PLCG2上调，揭示了PLCG2在EMT调控中的直接作用	PLCG2抑制剂对转移性细胞无显著影响，其作用机制仍需进一步研究	探究PLCG2在上皮-间质转化(EMT)和肿瘤发展中的调控作用	前列腺癌PC3细胞及皮下肿瘤模型	肿瘤生物学	前列腺癌	飞秒激光扫描光刺激、单细胞RNA测序	皮下肿瘤模型	基因表达数据	NA
697	2025-05-31	The influence of age on cellular senescence in injured versus healthy muscle and its implications on rotator cuff injuries 2025-Jun, Journal of shoulder and elbow surgery IF:2.9Q1 DOI:10.1016/j.jse.2025.02.008 PMID:40057173	研究论文	研究年龄对受伤与健康肌肉中细胞衰老的影响及其在肩袖损伤中的意义	首次在肩袖肌肉组织中识别出六种主要细胞群，并发现老年FAPs中衰老标志物和纤维化炎症相关基因表达增加	样本来源仅限于手术患者，可能无法完全代表一般人群	探究年龄对肩袖损伤中细胞衰老的影响机制	年轻和老年患者的肩袖肌肉组织样本	生物医学	肩袖损伤	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	年轻和老年患者的肩袖肌肉组织样本（具体数量未提及）
698	2025-05-31	Multi-omics analysis identified and confirmed TNF-α as a key initiator of the inflammatory response following spinal cord injury 2025-Jun, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143866 PMID:40319972	研究论文	本研究通过多组学分析揭示了锌离子如何通过调节TNF-α信号通路减轻脊髓损伤后的免疫炎症反应	首次整合转录组学、代谢组学和单细胞RNA测序技术，阐明锌离子通过抑制TNF-α信号通路调控脊髓损伤后的免疫炎症反应	锌离子调控TNF-α信号通路的具体分子机制仍需进一步研究	探究锌离子在脊髓损伤后免疫炎症反应中的调控机制	脊髓损伤后的免疫炎症反应及锌离子的调控作用	生物医学	脊髓损伤	多组学分析（转录组学、代谢组学、单细胞RNA测序）	NA	组学数据	人类和小鼠的免疫细胞图谱
699	2025-05-31	Lipopolysaccharide alters cell communication at the maternal-fetal interface revealed by single-cell RNA-sequencing 2025-Jun, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143939 PMID:40328399	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了脂多糖（LPS）诱导的炎症对母胎界面细胞组成、细胞间相互作用及关键信号通路的影响	首次利用单细胞RNA测序技术揭示LPS如何改变母胎界面的细胞通讯及信号通路	研究仅关注了LPS诱导的炎症效应，未涉及其他类型感染或炎症的影响	探究LPS诱导的炎症对母胎界面细胞通讯的影响	母胎界面细胞（包括子宫内膜上皮细胞、基质细胞、成纤维细胞等）	生殖医学	妊娠相关疾病	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	NA	RNA测序数据	未明确说明样本数量，但涉及多种细胞类型（包括15种其他细胞类型）
700	2025-05-29	Decellularised Amniotic Membrane for the Neurogenic Expression of Human Mesenchymal Stem Cells 2025-Jun, Journal of biomedical materials research. Part B, Applied biomaterials DOI:10.1002/jbm.b.35588 PMID:40424302	研究论文	研究脱细胞羊膜（DAM）对人间充质干细胞（hMSCs）神经分化的诱导作用，以促进周围神经病变的神经再生	使用DAM诱导hMSCs神经分化，并通过空间转录组测序和网络药理学分析揭示其促进神经修复的机制	未提及具体样本量及实验设计的详细局限性	探究DAM在神经再生中的作用及其潜在治疗应用	人间充质干细胞（hMSCs）和脱细胞羊膜（DAM）	再生医学	周围神经病变	空间转录组测序、免疫荧光染色、网络药理学分析	NA	基因表达数据、细胞图像数据	NA