单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 727 篇文献，本页显示第 661 - 680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2025-10-06 |
Characterization of ROMK cellular heterogeneity along the mouse kidney thick ascending limb
2025-Jun, Pflugers Archiv : European journal of physiology
DOI:10.1007/s00424-025-03086-4
PMID:40358700
|
研究论文 | 本研究通过多模态技术揭示了小鼠肾脏厚壁升支中ROMK通道的细胞异质性分布模式 | 首次发现ROMK蛋白顶端分布与分子特征不同的TAL细胞类型相对应，揭示了尽管ROMK mRNA普遍表达，但蛋白定位存在明显功能异质性 | 研究仅限于小鼠模型，人类肾脏中是否存在类似异质性尚需验证 | 阐明肾脏厚壁升支中ROMK通道的细胞分布异质性及其功能意义 | 小鼠肾脏厚壁升支细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序,RNAscope原位杂交,迭代间接免疫荧光成像 | 机器学习 | 图像,转录组数据 | 小鼠肾脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 662 | 2025-10-06 |
Mendelian randomization combined with single-cell sequencing data analysis of chemokines and chemokine receptors and key genes and molecular mechanisms associated with epilepsy
2025-Jun-04, Neuroreport
IF:1.6Q4
DOI:10.1097/WNR.0000000000002168
PMID:40298633
|
研究论文 | 本研究结合孟德尔随机化与单细胞测序分析，探索趋化因子及其受体在癫痫中的作用机制 | 首次将孟德尔随机化与单细胞RNA测序相结合，系统分析趋化因子相关基因在癫痫中的因果作用和细胞特异性表达 | 未明确说明样本来源和数量，分析基于现有数据库可能受数据质量限制 | 探索趋化因子及其受体相关基因在癫痫中的功能和调控机制 | 癫痫相关的趋化因子及其受体基因 | 生物信息学 | 癫痫 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 差异表达分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 663 | 2025-10-06 |
The molecular mechanism by which CTSB degrades FPN to disrupt macrophage iron homeostasis and promote the progression of atherosclerosis
2025-Jun, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-025-05228-9
PMID:39960586
|
研究论文 | 本研究揭示了组织蛋白酶B通过降解铁转运蛋白破坏巨噬细胞铁稳态并诱导铁死亡，从而促进动脉粥样硬化进展的分子机制 | 首次发现CTSB通过降解FPN破坏巨噬细胞铁稳态并诱导铁死亡的新机制，阐明了CTSB在动脉粥样硬化中的关键作用 | 研究主要基于动物模型和体外实验，人类样本验证相对有限 | 探究CTSB在动脉粥样硬化进展中的分子机制及其与铁死亡的关系 | ApoE敲除小鼠、SD大鼠、人类AS组织、巨噬细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组分析、基因敲除、药理学抑制 | NA | 基因表达数据、蛋白质水平数据 | 两种AS动物模型（ApoE敲除小鼠和SD大鼠）及人类AS组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 664 | 2025-10-06 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomic profiling reveals that CD177+ Tregs enhance immunosuppression through apoptosis and resistance to immunotherapy in hepatocellular carcinoma
2025-Jun, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03330-2
PMID:40055567
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组分析，发现CD177+调节性T细胞通过凋亡机制增强免疫抑制功能并与肝癌免疫治疗抵抗相关 | 首次鉴定CD177作为肿瘤浸润Treg细胞的特异性生物标志物，并揭示其通过凋亡相关转录因子REL驱动分化的新机制 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型，需要进一步临床验证 | 探索肝癌中调节性T细胞的免疫抑制机制和潜在治疗靶点 | 肝细胞癌患者样本和CD177 Treg条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞组学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序，空间转录组分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据，空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 665 | 2025-10-06 |
Ifosfamide alleviates autoimmune toxicity and enhances antitumor efficacy in melanoma immunotherapy
2025-06, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2025.116851
PMID:40081767
|
研究论文 | 本研究评估了异环磷酰胺在自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型中的疗效及其在免疫检查点抑制剂治疗中的免疫调节作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示异环磷酰胺在自身免疫条件下的细胞特异性效应，并发现其能同时缓解自身免疫毒性并增强抗肿瘤免疫 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证 | 开发管理免疫相关不良事件的新策略，并提高免疫检查点抑制剂治疗的安全性和有效性 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型和荷瘤小鼠 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 666 | 2025-10-06 |
Swimming induces bone loss via regulating mechanical sensing pathways in bone marrow
2025-Jun, Mechanobiology in medicine
DOI:10.1016/j.mbm.2025.100125
PMID:40395774
|
研究论文 | 本研究通过建立小鼠长期游泳训练模型，揭示了低负荷运动通过调节骨髓中机械感应通路导致骨丢失的机制 | 首次系统阐明了游泳这种低负荷运动通过整合素和ERK1/2信号通路影响骨髓微环境，导致骨丢失的分子机制 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类中验证；机制研究仍需要更深入的功能验证实验 | 探究低负荷运动（游泳）对骨稳态影响的分子机制 | C57BL/6小鼠的胫骨骨髓组织 | 骨骼生物学 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序，microCT扫描，组织化学染色 | NA | 单细胞转录组数据，影像数据，组织学数据 | 多只C57BL/6小鼠的胫骨骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 667 | 2025-10-06 |
Deciphering the Premetastatic Lymphatic Niche of Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-Jun, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241307894
PMID:40082761
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了口腔鳞状细胞癌转移前淋巴结生态位的细胞结构，发现并验证了CD4+ Tex-pre细胞在塑造免疫抑制转移前环境中的作用 | 首次在口腔鳞癌转移前淋巴结中鉴定出具有前衰竭状态的CD4+ T细胞亚群，并证明其促进淋巴结转移的机制 | 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本，需要更大规模临床验证 | 探索口腔鳞状细胞癌转移前淋巴结生态位的细胞组成和免疫抑制机制 | 口腔鳞状细胞癌患者的转移前肿瘤引流淋巴结和对侧淋巴结 | 单细胞组学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，RNAscope原位染色，计算机分析，体内实验 | NA | 单细胞RNA测序数据，bulk RNA测序数据，图像数据 | OSCC患者的淋巴结样本（包括转移前肿瘤引流淋巴结和配对对侧淋巴结） | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 668 | 2025-10-06 |
Antioxidant interventions reduced cytokine-induced pyroptosis of peripheral MAIT cells in patients with HBV-related cirrhosis
2025-Jun-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000714
PMID:40377492
|
研究论文 | 本研究探讨了HBV相关肝硬化患者外周血MAIT细胞减少的特征及机制，发现细胞焦亡是主要因素，抗氧化干预可减轻此过程 | 首次揭示细胞焦亡是HBV相关肝硬化中MAIT细胞减少的关键机制，并证明抗氧化剂可有效干预 | 样本量有限（60例），缺乏长期随访数据 | 探究HBV相关肝硬化患者MAIT细胞耗竭的特征和机制 | 20名健康对照者和40名HBV相关肝硬化患者（代偿期20例，失代偿期20例） | 免疫学 | 乙型肝炎肝硬化 | 流式细胞术，单细胞RNA测序，多重免疫荧光，ELISA | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞数据，免疫荧光图像，蛋白浓度数据 | 60例样本（20健康对照+40患者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 669 | 2025-10-06 |
Single-cell analyses unravel ecosystem dynamics and intercellular crosstalk during gallbladder cancer malignant transformation
2025-Jun-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000697
PMID:40377484
|
研究论文 | 通过单细胞分析揭示胆囊癌恶性转化过程中的生态系统动态和细胞间通讯 | 首次构建了从正常组织到高级别上皮内瘤变再到侵袭性胆囊癌的单细胞图谱，揭示了TOP2A+上皮细胞亚型与免疫抑制巨噬细胞的关键作用 | 样本量相对有限（10个样本），需要更大队列验证发现 | 探索胆囊癌恶性转化过程中的细胞和分子变化，识别早期生物标志物和治疗靶点 | 胆囊组织样本，包括正常邻近组织、高级别上皮内瘤变和胆囊癌组织 | 单细胞生物学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，多重免疫荧光染色 | 10种机器学习方法 | 单细胞转录组数据，bulk RNA-seq数据，图像数据 | 98,113个细胞，来自2个正常组织、2个HGIN和6个GBC样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 670 | 2025-10-06 |
HKDC1 promotes liver cancer stemness under hypoxia through stabilizing β-catenin
2025-Jun-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001085
PMID:39250463
|
研究论文 | 本研究揭示HKDC1在缺氧条件下通过稳定β-连环蛋白促进肝癌干细胞特性 | 首次发现HKDC1在肝癌恶性细胞中特异性高表达，并阐明其通过结合GSK3β稳定β-连环蛋白促进肝癌转移的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验，尚未在大型临床队列中验证 | 探究HKDC1在肝癌转移中的分子机制 | 肝癌细胞、肝癌小鼠模型、肝癌患者肿瘤样本 | 癌症生物学 | 肝癌 | RNA原位杂交、单细胞RNA-seq、代谢组学分析 | NA | 基因表达数据、代谢组数据、单细胞测序数据 | 2种肝癌小鼠模型及其来源的类器官，肝癌患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 671 | 2025-10-06 |
TREM2 macrophages mediate the beneficial effects of bariatric surgery against MASH
2025-Jun-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001098
PMID:39292863
|
研究论文 | 本研究揭示了TREM2+巨噬细胞介导减重手术改善代谢功能障碍相关脂肪性肝炎的修复机制 | 首次证明减重手术通过TREM2+巨噬细胞以体重非依赖方式改善MASH，并阐明其分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 探究减重手术改善MASH的免疫调节机制 | 小鼠模型及肝脏脂质相关巨噬细胞 | 免疫学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 672 | 2025-05-17 |
miR142 silencing alleviates retinal inflammation by impairing mitochondrial function and reprogramming metabolism of CD4+ T cells via targeting MTFR1
2025-Jun-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114727
PMID:40334625
|
研究论文 | 研究miR-142在自身免疫性葡萄膜炎中的作用及其通过靶向MTFR1调控CD4+ T细胞线粒体功能和代谢重编程的机制 | 揭示了miR-142通过靶向MTFR1调控T细胞线粒体功能和代谢重编程的新机制，为自身免疫性葡萄膜炎的治疗提供了新靶点 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 阐明miR-142在葡萄膜炎发病中的作用及其分子机制 | 自身免疫性葡萄膜炎患者外周血单核细胞和实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)小鼠模型 | 分子免疫学 | 葡萄膜炎 | 流式细胞术、单细胞测序、Seahorse能量代谢分析、线粒体染色、电子显微镜分析、荧光素酶报告基因检测、Western blot | miR-142基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞功能数据 | 葡萄膜炎患者外周血单核细胞和EAU小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 673 | 2025-05-17 |
Inhibition of CTSC contributes to psoriasis inflammation and keratinocyte hyperproliferation by NF-κB signaling pathway
2025-Jun-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114808
PMID:40339488
|
研究论文 | 本研究探讨了CTSC在银屑病中的作用及其机制，发现抑制CTSC可通过NF-κB信号通路促进炎症和角质形成细胞过度增殖 | 首次揭示CTSC抑制通过NF-κB通路促进银屑病炎症和角质形成细胞过度增殖的机制 | 研究主要基于体外细胞和小鼠模型，临床样本验证有限 | 探究CTSC在银屑病中的作用及分子机制 | 银屑病患者皮肤组织、IMQ诱导的银屑病样小鼠模型、HaCaT细胞 | 分子生物学 | 银屑病 | scRNA-seq、siRNA敲降 | IMQ诱导的小鼠银屑病模型 | 基因表达数据、细胞增殖数据 | 银屑病患者皮肤组织、小鼠模型和HaCaT细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 674 | 2025-05-17 |
TGF-β1 induces autophagy and mediates the effect on macrophages differentiation in primary liver cancer
2025-Jun-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114799
PMID:40339499
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了原发性肝癌中肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的异质性和分化谱，并探讨了TGF-β1通过自噬信号调控TAMs表型转换的机制 | 首次在原发性肝癌中鉴定出四种不同的TAMs亚群，并发现TGF-β1通过自噬信号驱动TAMs表型转换的新机制 | 样本量相对较小（19例患者），且需要进一步验证TGF-β1调控TAMs分化的具体分子机制 | 探究原发性肝癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其分化机制 | 原发性肝癌患者的肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 原发性肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），Ingenuity通路分析（IPA） | NA | 单细胞转录组数据 | 19例原发性肝癌患者的单细胞数据，TCGA数据库中428例患者的生存数据 | NA | NA | NA | NA |
| 675 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis identifies subclusters and signature with N-glycosylation in endometrial cancer
2025-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-024-03802-z
PMID:39589706
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析鉴定子宫内膜癌中N-糖基化相关的亚群和特征 | 首次在子宫内膜癌中通过单细胞RNA测序结合非负矩阵分解识别N-糖基化相关细胞亚型，并整合多种机器学习算法构建预后特征 | 样本量较小（仅5例患者），数据来源于公共数据库缺乏实验验证 | 阐明N-糖基化相关基因在子宫内膜癌细胞异质性、预后和免疫治疗反应中的作用 | 子宫内膜癌患者细胞 | 单细胞转录组学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序，非负矩阵分解，机器学习算法 | 非负矩阵分解，集成机器学习框架 | 单细胞RNA测序数据 | 5例子宫内膜癌患者，30,233个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 676 | 2025-10-06 |
EXPLORING THE POTENTIAL OF BEND7 AS AN IMMUNOMODULATORY BIOMARKER IN SEPSIS THROUGH INTEGRATIVE GENOMIC AND TRANSCRIPTOMIC ANALYSIS
2025-Jun-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002529
PMID:39617402
|
研究论文 | 通过整合基因组和转录组分析探索BEND7作为脓毒症免疫调节生物标志物的潜力 | 首次通过整合GWAS和eQTL数据识别脓毒症相关基因，并利用单细胞RNA测序揭示BEND7在血小板中的特异性表达及其与免疫细胞的相互作用机制 | 需要进一步实验验证BEND7的功能机制，样本来源和数量可能限制结果的普适性 | 探索脓毒症的遗传基础并识别潜在的免疫调节生物标志物 | 脓毒症相关基因和血小板 | 生物信息学 | 脓毒症 | 基于汇总数据的孟德尔随机化，全基因组关联研究，表达数量性状位点分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，转录组数据 | 来自Gene Expression Omnibus的转录组数据集和独立验证数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 677 | 2025-10-06 |
Diverse RNA methylation patterns in neutrophils: key drivers in hepatocellular carcinoma
2025-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-024-03756-2
PMID:39621240
|
研究论文 | 本研究通过分析肝细胞癌中的单细胞测序数据，揭示了中性粒细胞RNA甲基化模式与肿瘤微环境异质性的关系 | 首次发现中性粒细胞中TRPM3特异性表达可能调控RNA修饰，并建立了新型中性粒细胞RNA甲基化评分系统 | 研究基于单细胞测序数据的生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 探索中性粒细胞RNA甲基化在肝细胞癌中的作用机制 | 肝细胞癌患者的中性粒细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序, LASSO Cox回归, 共识聚类 | 预后评分模型, nomogram | 单细胞测序数据, lncRNA数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 678 | 2025-05-17 |
Novel approaches to CAR T cell target identification in acute myeloid leukemia
2025-Jun, Current opinion in pharmacology
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/j.coph.2025.102524
PMID:40311558
|
review | 本文综述了急性髓系白血病（AML）中CAR T细胞靶点识别的新方法 | 介绍了结构表面组学识别肿瘤特异性蛋白构象，以及AI驱动的单细胞RNA测序整合多源数据以确定最佳靶点 | NA | 提高CAR T细胞的特异性并减少对正常组织的副作用，为AML及更广泛的癌症治疗提供更安全有效的途径 | 急性髓系白血病（AML） | 肿瘤免疫治疗 | 急性髓系白血病 | 结构表面组学，AI驱动的单细胞RNA测序，细胞表面捕获技术 | NA | RNA测序数据，蛋白质构象数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 679 | 2025-05-17 |
Dissecting Autophagy Gene Expression in Endothelial Cells of Pulmonary Arterial Hypertension at Single-Cell Resolution
2025-Jun, Cardiology research
IF:1.4Q3
DOI:10.14740/cr2055
PMID:40370624
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了肺动脉高压（PAH）内皮细胞中自噬相关基因的表达特征，并鉴定了DDIT4作为潜在的生物标志物 | 首次在单细胞分辨率下解析PAH内皮细胞中自噬相关基因的表达特征，并发现DDIT4作为新的PAH生物标志物 | 研究主要基于体外模型和生物信息学分析，需要进一步的体内实验验证 | 探究肺动脉高压内皮细胞中自噬相关基因的表达特征及其在疾病进展中的作用 | 肺动脉高压患者的内皮细胞 | 单细胞转录组学 | 肺动脉高压 | scRNA-seq, 高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA), 蛋白质印迹(Western blotting) | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 680 | 2025-10-06 |
Exploration of immune cell heterogeneity by single-cell RNA sequencing and identification of secretory leukocyte protease inhibitor as an oncogene in pancreatic cancer
2025-Jun, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24200
PMID:38476085
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序探索胰腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞异质性，并鉴定分泌性白细胞蛋白酶抑制剂作为胰腺癌致癌基因 | 首次在胰腺癌中通过单细胞测序识别八个细胞亚群，发现SPPI和血管内皮生长因子相关通路在不同细胞中的激活，并鉴定SLPI作为新的治疗靶点 | 未提及样本量大小和研究队列特征，功能验证实验可能不够充分 | 探索胰腺癌肿瘤微环境的细胞异质性并寻找新的治疗靶点 | 胰腺癌肿瘤微环境中的各类细胞（上皮细胞、髓系细胞、癌症相关成纤维细胞等） | 单细胞测序 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |