单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
641	2025-06-09	Multi-omics exploration of CAV1+ tumor epithelial subcelltype in oral squamous cell carcinoma and its impact on the immune microenvironment 2025-Jun-05, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02843-2 PMID:40471478	研究论文	本研究通过多组学方法探索口腔鳞状细胞癌中CAV1+肿瘤上皮亚细胞类型的特征及其对免疫微环境的影响	首次鉴定出CAV1+上皮亚细胞类型(CAV1+EIP)并揭示其通过NECTIN1-CD96信号网络与T细胞相互作用导致免疫逃逸的机制	研究样本量有限，且未在更大规模的队列中验证发现	揭示口腔鳞癌肿瘤上皮细胞亚型的特征及其在肿瘤进展中的作用	口腔鳞状细胞癌(OSCC)肿瘤上皮细胞亚型和免疫微环境	数字病理	口腔鳞状细胞癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组学	NA	单细胞转录组数据和空间转录组数据	未明确说明具体样本数量，仅提及来自口腔鳞癌患者的样本
642	2025-06-09	Muscle stem cells in Duchenne muscular dystrophy exhibit molecular impairments and altered cell fate trajectories impacting regenerative capacity 2025-Jun-05, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-025-07755-1 PMID:40473604	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了杜氏肌营养不良症（DMD）中卫星细胞的分子损伤和细胞命运轨迹变化，及其对再生能力的影响	首次使用单细胞RNA测序技术揭示DMD卫星细胞的转录组和细胞组成变化，并发现自噬诱导可以挽救DMD前体细胞的分化能力	研究主要基于小鼠模型，结果在人类DMD患者中的适用性需要进一步验证	探究DMD中卫星细胞功能障碍的分子机制及其对肌肉再生的影响	杜氏肌营养不良症（DMD）小鼠模型中的卫星细胞	分子生物学	杜氏肌营养不良症	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	使用mdx和D2-mdx两种DMD小鼠模型的卫星细胞
643	2025-06-09	Machine learning and multi-omics analysis reveal key regulators of proneural-mesenchymal transition in glioblastoma 2025-Jun-05, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-04862-z PMID:40473799	研究论文	该研究通过机器学习和多组学分析揭示了胶质母细胞瘤中前神经-间质转化的关键调控因子	鉴定了17个与PMT相关的关键基因，并发现这些基因主要在免疫细胞和血管中表达，为胶质母细胞瘤治疗提供了新靶点	PMT的细胞和分子机制仍不完全清楚	探索胶质母细胞瘤前神经-间质转化(PMT)的关键调控机制	胶质母细胞瘤(GBM)及其前神经和间质亚型	数字病理学	胶质母细胞瘤	转录组分析、蛋白组学、单细胞转录组分析	Lasso、Cox、Step机器学习算法	转录组数据、蛋白组数据、单细胞数据	NA
644	2025-06-09	Multi-omics analyses reveal interactions between GREM1+ fibroblasts and SPP1+ macrophages in gastric cancer 2025-Jun-05, NPJ precision oncology IF:6.8Q1 DOI:10.1038/s41698-025-00967-w PMID:40473882	研究论文	通过多组学分析揭示了胃癌中GREM1+成纤维细胞与SPP1+巨噬细胞之间的相互作用	整合了bulk RNA-seq、scRNA-seq和空间转录组学技术，首次揭示了GREM1+成纤维细胞与SPP1+巨噬细胞在胃癌中的相互作用及其临床意义	研究主要基于转录组数据，缺乏功能性实验验证这些细胞相互作用的分子机制	探索胃癌微环境中细胞间相互作用的特征及其治疗潜力	胃癌组织中的GREM1+成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞	肿瘤微环境研究	胃癌	bulk RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学, 多重免疫组化染色	NA	转录组数据, 空间转录组数据	12个独立的胃癌数据集
645	2025-06-09	Dissecting the tumor microenvironment in primary breast angiosarcoma: insights from single-cell RNA sequencing 2025-Jun-05, Breast cancer research : BCR IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s13058-025-02022-9 PMID:40474296	研究论文	通过单细胞RNA测序技术解析原发性乳腺血管肉瘤的肿瘤微环境，揭示其细胞异质性及潜在治疗靶点	首次利用单细胞RNA测序技术对原发性乳腺血管肉瘤的肿瘤微环境进行深入分析，识别出关键信号通路和细胞间通讯网络	样本量较小（仅3例患者），可能限制结果的广泛适用性	阐明原发性乳腺血管肉瘤的致病机制并改善治疗策略	原发性乳腺血管肉瘤和浸润性乳腺癌患者的肿瘤样本	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	3例患者（1例双侧原发性乳腺血管肉瘤，2例浸润性乳腺癌）共31,771个细胞
646	2025-06-09	Treatment with senolytic drugs ameliorates steroid-induced osteonecrosis of the femoral head by inhibiting osteoclastogenesis 2025-Jun-05, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114963 PMID:40480005	研究论文	本研究探讨了通过清除衰老细胞来改善类固醇诱导的股骨头坏死（ONFH）的治疗效果	揭示了巨噬细胞中的细胞衰老促进破骨细胞过度活化和ONFH进展的新机制，并展示了使用senolytic药物（Dasatinib和Quercetin）的治疗潜力	研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步在人体中进行验证	探索细胞衰老在ONFH发病机制中的作用及senolytic药物的治疗效果	股骨头坏死（ONFH）患者和小鼠模型，以及骨髓来源的巨噬细胞（BMDMs）	骨科疾病研究	股骨头坏死	单细胞测序、TRAP染色、SA-β-gal染色	小鼠ONFH模型	基因表达数据、细胞染色数据	未明确提及具体样本数量，涉及ONFH患者数据和小鼠模型
647	2025-06-09	SPaSE: Spatially resolved pathology scores using optimal transport on spatial transcriptomics data 2025-Jun-03, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2025.101301 PMID:40480226	research paper	提出了一种基于最优传输的空间转录组数据分析算法SPaSE，用于量化疾病组织中的病理影响	SPaSE算法通过最优传输方法比较疾病和对照组织的空间转录组数据，为每个点计算病理评分，创新性地量化了病理影响	NA	开发一种能够量化空间变异病理影响的分析方法	小鼠心肌梗死后的心脏组织、人类心肌梗死后的数据、创伤性脑损伤和杜氏肌营养不良小鼠模型	digital pathology	cardiovascular disease	spatial transcriptomics (ST)	optimal transport-based algorithm	spatial transcriptomics data	小鼠和人类的心肌梗死后数据、创伤性脑损伤和杜氏肌营养不良小鼠模型数据
648	2025-06-09	ICOSL, OX40L, and CD30L control persistence of asthmatic CD4 tissue-resident memory CD4 T cells 2025-Jun, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jaci.2024.12.1097 PMID:39921040	research paper	研究探讨了ICOSL、OX40L和CD30L这三种共刺激分子在控制哮喘CD4组织驻留记忆T细胞持久性中的作用	首次发现联合抑制ICOSL与OX40L或CD30L能有效减少肺部炎症性Trm细胞的积累，并提出潜在的治疗哮喘的新方法	研究主要基于小鼠模型，人类临床应用的可行性和效果尚需进一步验证	寻找控制过敏原诱导的记忆CD4 T细胞再激活的共刺激分子，并评估其靶向治疗对哮喘相关记忆T细胞群体的影响	哮喘患者和小鼠模型中的肺CD4 T细胞	免疫学	哮喘	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
649	2025-06-09	Injury and obesity differentially and synergistically induce dysregulation of synovial immune cells in osteoarthritis 2025-Jun, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1 DOI:10.1016/j.ard.2025.03.001 PMID:40188009	研究论文	研究探讨了损伤和肥胖如何差异性和协同性地影响骨关节炎（OA）中滑膜免疫细胞的失调	揭示了损伤和肥胖独立及协同作用对滑膜免疫细胞景观失调的影响，为OA发病机制提供了新见解	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性有待验证	探究损伤和肥胖对骨关节炎滑膜免疫细胞的影响	小鼠膝关节囊中的免疫细胞	免疫学	骨关节炎	单细胞转录组学、免疫分析、转基因小鼠模型、遗传命运图谱方法	转基因小鼠模型	转录组数据、免疫分析数据	未明确提及具体样本数量，但使用了对照组和肥胖组小鼠
650	2025-06-09	Identification of MAGE-A10 specific T cell receptor promising in immunotherapy of hepatocellular carcinoma 2025-Jun, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144243 PMID:40379175	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和TCR测序技术，鉴定了针对肝细胞癌（HCC）中MAGE-A10抗原的特异性T细胞受体（TCR），为HCC的TCR-T免疫治疗提供了新策略	首次鉴定了针对HCC中MAGE-A10抗原的特异性TCR，并通过功能验证证实了其识别和杀伤HCC细胞的能力	研究样本量有限，且未进行体内实验验证TCR-T的治疗效果	探索肝细胞癌的新型免疫治疗方法	肝细胞癌患者样本中的T细胞受体	免疫治疗	肝细胞癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、TCR测序（scTCR-seq）、NetMHCpan、DLpTCR	NA	单细胞转录组数据、TCR序列数据	肝细胞癌患者样本（具体数量未说明）
651	2025-06-08	Habitual Exercise Modulates Neuroimmune Interaction to Mitigate Aortic Stiffness 2025-Jun-06, Circulation research IF:16.5Q1 DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325656 PMID:40304034	research paper	研究探讨了习惯性运动如何通过调节神经免疫相互作用来减轻主动脉硬化	揭示了运动通过调节交感神经与免疫细胞的相互作用减轻主动脉硬化的新机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证	探究运动对主动脉硬化中神经免疫相互作用的调节作用	C57BL/6小鼠	心血管疾病研究	心血管疾病	单细胞RNA测序，免疫组化，基因敲除	小鼠模型	基因表达数据，免疫组化数据	未明确说明具体数量，使用C57BL/6小鼠进行实验
652	2025-06-08	RORγt is crucial for gut homeostasis by regulating the expression of HB-EGF rather than IL-22 in activated ILC3s 2025-Jun-05, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.115793 PMID:40478733	research paper	该研究探讨了RORγt在调节ILC3s中HB-EGF表达而非IL-22表达中的关键作用，及其对肠道稳态的影响	通过单细胞RNA测序分析揭示了RORγt在ILC3激活中的基本参与，并发现RORγt缺失后ILC3仍能维持肠道健康	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证	阐明RORγt在ILC3s中的具体作用及其对肠道稳态的影响	ILC3s及其产生的HB-EGF和IL-22	免疫学	炎症性肠病	单细胞RNA测序，Il22Rosa26Rorc小鼠模型	NA	基因表达数据	NA
653	2025-06-08	Widespread and cell-type-specific transcriptomic reorganization following mild traumatic brain injury 2025-Jun-05, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.115795 PMID:40478731	研究论文	该研究通过小鼠模型和空间转录组学技术，探讨了轻度创伤性脑损伤（TBI）后大脑的广泛和细胞类型特异性转录组重组	使用CHIMERA TBI模型和空间转录组学技术，首次在亚急性期系统地识别了TBI的跨脑区和细胞类型特异性转录组特征	研究仅基于小鼠模型，结果可能无法完全反映人类TBI的复杂性	理解轻度创伤性脑损伤（TBI）如何改变大脑的转录组	小鼠大脑	神经科学	创伤性脑损伤	空间转录组学	CHIMERA TBI模型	转录组数据	多只小鼠
654	2025-06-08	Olaparib and Radiotherapy Induce Type I Interferon- and CD8+ T Cell-Dependent Sensitization to Immunotherapy in Pancreatic Cancer 2025-Jun-04, Molecular cancer therapeutics IF:5.3Q1 DOI:10.1158/1535-7163.MCT-24-0210 PMID:39688341	研究论文	该研究探讨了PARP抑制剂奥拉帕尼联合放疗如何通过诱导I型干扰素和CD8+ T细胞依赖的免疫反应，增强胰腺癌对免疫治疗的敏感性	揭示了奥拉帕尼增强放疗诱导的I型干扰素介导的免疫信号和适应性免疫反应的新机制，为胰腺癌免疫治疗提供了新策略	研究主要基于免疫健全模型，临床转化效果需进一步验证	探究奥拉帕尼联合放疗对胰腺癌免疫治疗的增敏作用及其机制	胰腺导管腺癌(PDAC)	肿瘤免疫治疗	胰腺癌	单细胞RNA测序、免疫组化(IHC)、流式细胞术	NA	基因表达数据、免疫细胞表型数据	免疫健全小鼠模型（具体数量未明确说明）
655	2025-06-08	Activity-dependent development of the body's touch receptors 2025-Jun-04, Neuron IF:14.7Q1 DOI:10.1016/j.neuron.2025.04.015 PMID:40381613	research paper	研究发现神经元活动在体感神经元发育中的作用，特别是Piezo2和Na1.6通道对机械感受器终末器官形成的影响	揭示了机械刺激引发的神经元活动在早期生命中对机械感受器终末器官成熟的关键作用	研究主要关注Piezo2和Na1.6通道，可能还有其他未被发现的机制参与这一过程	探究神经元活动在体感神经元发育中的作用	体感神经元和机械感受器终末器官	神经科学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
656	2025-06-08	CTSE inhibits anti-tumor T cell response by promoting des-γ-carboxy prothrombin releasing in hepatocellular carcinoma 2025-Jun-04, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-025-07753-3 PMID:40467555	研究论文	本研究探讨了CTSE在肝细胞癌中通过促进DCP释放抑制抗肿瘤T细胞反应的机制	揭示了CTSE高表达的癌细胞通过上调泛醌信号通路促进DCP合成和释放，进而抑制T细胞免疫反应的新机制	研究主要基于公共数据库的单细胞测序数据和体外实验，临床样本验证不足	探究肝细胞癌中癌细胞与免疫细胞相互作用的调控机制	肝细胞癌细胞和T细胞	肿瘤免疫学	肝细胞癌	单细胞测序	NA	单细胞测序数据	NA
657	2025-06-08	SMURF2 Facilitates GAP17 Isoform 1 Membrane Displacement to Promote Mutant p53-KRAS Oncogenic Synergy 2025-Jun-03, Molecular cancer research : MCR IF:4.1Q2 DOI:10.1158/1541-7786.MCR-24-0701 PMID:39976545	研究论文	本文揭示了SMURF2通过PPLP基序与GAP17-1相互作用，促使其从膜上移位，从而增强突变p53和KRAS的致癌协同作用	首次发现SMURF2通过PPLP基序介导GAP17-1的膜移位机制，阐明了突变p53和KRAS协同致癌的新机制	研究主要基于细胞系和小鼠模型，临床样本验证仍需扩大	探究突变p53和KRAS协同致癌的分子机制	胰腺癌细胞系、小鼠模型及临床样本	肿瘤分子生物学	胰腺癌	单细胞RNA测序、组织微阵列	iKras; iKras, p53, and p48-Cre; Kras小鼠模型	基因表达数据、组织病理数据	多个胰腺癌细胞系、三种基因工程小鼠模型、临床前和临床样本
658	2025-06-08	Transcriptomic profiling after B cell depletion reveals central and peripheral immune cell changes in multiple sclerosis 2025-Jun-02, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI182790 PMID:40067358	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术探索了B细胞耗竭疗法如何调节多发性硬化症患者的免疫景观	首次使用单细胞RNA测序技术全面分析了B细胞耗竭治疗后多发性硬化症患者中枢和外周免疫细胞的变化	研究样本量有限，且未探讨这些免疫变化与临床症状改善的直接关系	探究B细胞耗竭疗法对多发性硬化症患者免疫系统的调节机制	多发性硬化症患者在接受B细胞耗竭治疗前后的免疫细胞	免疫学	多发性硬化症	单细胞RNA测序(scRNA-Seq)	NA	转录组数据	未明确说明样本数量，但涉及脑脊液和外周血样本
659	2025-06-08	Enhancer Extrachromosomal Circular DNA ANKRD28 Elicits Drug Resistance via POU2F2-Mediated Transcriptional Network in Multiple Myeloma 2025-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202415695 PMID:40167268	研究论文	本研究揭示了非编码区eccDNA ANKRD28通过POU2F2介导的转录网络在多发性骨髓瘤中引发药物抵抗的机制	首次发现非编码区eccDNA作为增强子在多发性骨髓瘤药物抵抗中的作用，并揭示了POU2F2介导的转录网络机制	研究主要基于体外和动物模型，临床样本量有限	探索多发性骨髓瘤药物抵抗的分子机制	多发性骨髓瘤患者血清样本和VRd耐药细胞系	表观遗传学	多发性骨髓瘤	H3K27ac ChIP-seq, scRNA-seq, scATAC-seq, CUT&Tag, CRISPR/Cas9	NA	基因组数据、转录组数据、表观遗传数据	多发性骨髓瘤患者血清样本和VRd耐药细胞系
660	2025-06-08	Glycolysis-Derived Lactate Induces ACSL4 Expression and Lactylation to Activate Ferroptosis during Intervertebral Disc Degeneration 2025-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202416149 PMID:40171826	研究论文	本研究揭示了糖酵解衍生的乳酸通过诱导ACSL4表达和乳酰化激活铁死亡在椎间盘退变中的作用机制	首次发现乳酸通过促进Histon H3K18乳酰化转录ACSL4，并增加ACSL4在K412位点的乳酰化，从而激活铁死亡	研究主要基于动物实验，尚未在人体临床试验中验证	探究椎间盘退变过程中髓核细胞的代谢变化及乳酸的作用机制	髓核细胞(NPCs)	细胞生物学	椎间盘退变	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 腺相关病毒9(AAV9)基因沉默	NA	基因表达数据	NA