单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 727 篇文献，本页显示第 621 - 640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2025-10-06 |
Comprehensive analysis of breast cancer oxidative stress related gene signature: a combination of bulk and single-cell RNA sequencing analysis
2025-Jun, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10130-2
PMID:40274661
|
研究论文 | 本研究通过结合bulk和单细胞RNA测序分析，开发了基于氧化应激相关基因的乳腺癌预后基因特征 | 首次结合bulk和单细胞RNA测序构建氧化应激相关基因特征，并识别TFAP2B作为基底样乳腺癌的关键调控因子 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 开发基于氧化应激相关基因的预后特征以评估乳腺癌患者预后和免疫状态 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | Lasso回归, 多变量Cox回归 | 基因表达数据, 临床信息 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 622 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals extracellular matrix remodeling and collagen dynamics during lactation in sheep mammary gland
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143669
PMID:40319976
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示绵羊乳腺在哺乳期细胞外基质重塑和胶原蛋白动态变化 | 首次在绵羊乳腺中应用单细胞转录组学技术，系统描绘哺乳期细胞图谱并揭示成纤维细胞-上皮细胞互导驱动的胶原重塑机制 | 仅分析了产后60天和150天两个时间点，未能覆盖整个哺乳周期；物种间比较仅限于细胞类型保守性分析 | 解析绵羊乳腺在哺乳期的细胞结构和分子调控机制 | 绵羊乳腺组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 产后60天和150天两个时间点的绵羊乳腺样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 623 | 2025-10-06 |
KDELR3 and YOD1 proteins as critical endoplasmic reticulum stress mediators and potential therapeutic targets in diabetic foot ulcers: An integrated bioinformatics analysis
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144095
PMID:40354856
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析鉴定糖尿病足溃疡中内质网应激关键介质KDELR3和YOD1蛋白作为潜在治疗靶点 | 首次系统鉴定糖尿病足溃疡中内质网应激相关差异表达蛋白，并通过多组学分析揭示KDELR3和YOD1的关键作用 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限 | 探索糖尿病足溃疡发病机制中的内质网应激关键蛋白及其治疗潜力 | 糖尿病足溃疡患者组织样本和GEO数据库数据集 | 生物信息学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序, WGCNA, 机器学习, 分子对接, qRT-PCR, 孟德尔随机化分析 | 机器学习算法 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | GEO数据库糖尿病足溃疡数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 624 | 2025-10-06 |
The Potential Role of Monocyte-Derived Macrophages in Preventing Malarial Parasitemic Recrudescence in a Mouse Model
2025-Jun, Parasite immunology
IF:1.4Q3
DOI:10.1111/pim.70010
PMID:40459245
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究单核细胞来源巨噬细胞在预防疟疾寄生虫血症复发中的潜在作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析疟疾感染过程中脾脏吞噬细胞的动态变化，揭示MDMs在控制寄生虫血症复发中的新作用机制 | 研究仅限于小鼠模型，CCR2小鼠实验表明单核细胞向MDMs的转化可能不存在于该模型中 | 探究特定吞噬细胞类型在控制疟疾寄生虫复发中的作用机制 | 感染Plasmodium chabaudi chabaudi AS的小鼠脾脏吞噬细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 625 | 2025-10-06 |
SARS-CoV-2 Infection of Human Lung Air-Liquid Interface Cultures Reveals Basal Cells as Relevant Targets
2025-Jun-02, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf125
PMID:40065723
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研究论文 | 通过人类肺气液界面培养模型研究SARS-CoV-2感染机制，发现基底细胞是重要感染靶点 | 首次揭示除纤毛细胞和分泌细胞外，基底细胞也是SARS-CoV-2（包括Alpha变种）的重要感染靶点，并证实其在上呼吸道免疫反应中的关键作用 | 研究基于体外培养模型，可能与体内实际情况存在差异；存在供体特异性差异 | 探究SARS-CoV-2感染上呼吸道时涉及的上皮细胞类型及其免疫反应机制 | 人类原代鼻和支气管上皮细胞的气液界面培养物 | 传染病学 | COVID-19 | 病毒复制分析，单细胞RNA测序，光谱显微镜 | NA | 单细胞转录组数据，显微镜图像数据 | 人类原代上皮细胞培养物（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 626 | 2025-10-06 |
Cxcr3 promotes protection from colorectal cancer liver metastasis by driving NK cell infiltration and plasticity
2025-Jun-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI184036
PMID:40168086
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研究论文 | 本研究揭示了CXCR3通过驱动NK细胞浸润和可塑性在结直肠癌肝转移中发挥保护作用的机制 | 首次阐明CXCR3/配体轴通过促进巨噬细胞依赖的NK细胞积累和功能维持来抑制结直肠癌肝转移 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究NK细胞在结直肠癌肝转移中浸润和获得抗肿瘤特性的分子机制 | 结直肠癌肝转移微环境中的NK细胞和巨噬细胞 | 癌症免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，条件性基因敲除，抗体介导的细胞清除 | MC38小鼠模型，SL4诱导的CRC转移模型 | 基因表达数据，细胞表型数据 | 未治疗结直肠癌患者队列的已发表单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 627 | 2025-10-06 |
Perivascular Niche-Resident Alveolar Macrophages Promote Interstitial Pneumonitis Related to Trastuzumab Deruxtecan Treatment
2025-Jun-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-2021
PMID:40300097
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研究论文 | 本研究揭示了曲妥珠单抗德鲁替康（T-DXd）通过肺泡巨噬细胞的Fc-FcγR相互作用引发间质性肺炎的机制 | 首次发现T-DXd诱导的ILD是脱靶不良反应而非靶向脱瘤不良反应，并阐明了肺泡巨噬细胞通过Fc-FcγR摄取T-DXd导致SPP1通路介导的炎症机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化需要进一步验证 | 探究T-DXd诱导间质性肺病的分子机制 | 免疫活性小鼠模型和肺泡巨噬细胞 | 免疫学 | 间质性肺病 | 单细胞RNA测序，活体显微镜检查 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据，影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 628 | 2025-10-06 |
Characterization of the recombination activity in the pituitary and ovary of Prop1-iCre knockin mice
2025-Jun-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
DOI:10.1152/ajpendo.00049.2025
PMID:40327412
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研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9系统构建了Prop1-iCre基因敲入小鼠，并验证了其在垂体内分泌细胞和卵巢颗粒细胞中的特异性重组活性 | 首次利用CRISPR/Cas9技术构建Prop1-iCre基因敲入小鼠模型，证实其在垂体内分泌细胞中具有特异性重组活性，同时发现其在卵巢颗粒细胞中的意外重组活性 | 发现Prop1-iCre在卵巢颗粒细胞中存在非预期的重组活性，可能影响实验数据解读 | 开发用于垂体生物学研究的特异性基因操作工具 | Prop1-iCre基因敲入小鼠 | 分子生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑技术，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，组织特异性重组活性数据 | Prop1-iCre小鼠及其与Rosa-tdTomato报告基因小鼠的杂交后代 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 629 | 2025-10-06 |
Oncostatin-M: a novel leukocyte-derived factor facilitating the ovulatory process in the human ovary
2025-Jun-01, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deaf076
PMID:40327872
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研究论文 | 本研究揭示了白细胞来源的制瘤素M在人类排卵过程中的调控作用 | 首次证实白细胞来源的OSM通过激活STAT3、ERK1/2等信号通路调控人类排卵过程 | 使用体外培养的颗粒黄体细胞，可能无法完全模拟体内排卵动态；结果仅适用于人类样本 | 探究白细胞来源的制瘤素M是否调控人类优势卵泡的排卵过程 | 自然周期女性的优势卵泡和IVF患者的卵泡抽吸物 | 生殖生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序，定量PCR，免疫组化，Western blotting，RNA测序 | NA | 基因表达数据，蛋白质数据，激素测定数据 | 自然周期女性19例，IVF患者12例 | NA | 单细胞RNA测序，RNA测序 | NA | NA |
| 630 | 2025-10-06 |
Dynamics of T Cell-Mediated Immune Signaling Network During Pathogenesis of Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2025-Jun, Yonsei medical journal
IF:2.6Q1
DOI:10.3349/ymj.2024.0227
PMID:40414827
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研究论文 | 通过多组学测序分析慢性阻塞性肺疾病进展过程中T细胞介导的免疫信号网络动态 | 首次结合bulk RNA测序、单细胞RNA测序和单核RNA测序系统分析COPD疾病进展，并发现中度COPD与COVID-19存在相似生物学模式 | 样本量相对有限，数据集来源不同可能存在批次效应 | 识别COPD从轻度到重度进展的特征，探索COVID-19与COPD之间的相关性 | 健康个体、COPD患者（轻度/中度/重度）和COVID-19患者 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 总计126个样本（43健康人+39 COPD患者+30单细胞样本+27单核样本） | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, single-nuclei RNA-seq | NA | NA |
| 631 | 2025-10-06 |
Endogenous Retroelement Activation is Implicated in Interferon-α Production and Anti-Cyclic Citrullinated Peptide Autoantibody Generation in Early Rheumatoid Arthritis
2025-Jun, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.43083
PMID:39681508
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研究论文 | 本研究首次在早期类风湿关节炎中探讨内源性逆转录元件表达与干扰素-α产生及抗环瓜氨酸肽自身抗体生成的关系 | 首次在早期类风湿关节炎中系统研究内源性逆转录元件表达，发现其与干扰素-α产生和抗环瓜氨酸肽自身抗体的潜在因果关系 | 样本量相对有限，疾病早期阶段研究需进一步验证 | 探讨内源性逆转录元件在早期类风湿关节炎发病机制中的作用 | 早期类风湿关节炎患者、早期银屑病关节炎患者、骨关节炎患者的血液和滑膜组织样本 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 逆转录聚合酶链反应, NanoString, 流式细胞术, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 单细胞测序数据 | 早期类风湿关节炎滑膜组织样本22例，全血样本56例，另包括早期银屑病关节炎和骨关节炎对照样本 | NanoString | 基因表达分析 | NanoString | NA |
| 632 | 2025-10-06 |
Association of Synovial Innate Immune Exhaustion With Worse Pain in Knee Osteoarthritis
2025-Jun, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.43089
PMID:39690716
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研究论文 | 本研究探讨膝关节骨关节炎疼痛与滑膜先天免疫细胞耗竭的关联 | 首次发现滑膜先天免疫细胞耗竭与更严重疼痛相关，揭示了免疫调节性巨噬细胞功能失调在OA疼痛中的新机制 | 样本量相对有限（单细胞RNA测序仅8例），需更大规模研究验证 | 识别与膝关节OA更严重疼痛相关的滑膜先天免疫细胞亚群和病理生理机制 | 122例轻度至重度膝关节OA疼痛患者的滑膜组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 空间转录组学,空间蛋白质组学,单细胞RNA测序 | NA | 组织切片,基因表达数据,蛋白质数据 | 122例患者（组织学分析），32例（空间组学），8例（单细胞测序） | NA | 空间转录组学,空间蛋白质组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 633 | 2025-10-06 |
Prediction of Clinically Significant Prostate Cancer by a Specific Collagen-related Transcriptome, Proteome, and Urinome Signature
2025-Jun, European urology oncology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.euo.2024.05.014
PMID:38851995
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研究论文 | 本研究通过分析胶原相关转录组、蛋白质组和尿液组特征，开发了预测临床显著性前列腺癌的机器学习模型 | 首次系统整合胶原相关转录组、蛋白质组和尿液组数据，建立优于PSA和年龄的csPCa预测模型，在mpMRI模糊病变中表现优异 | 研究为回顾性研究设计 | 开发基于胶原相关特征的临床显著性前列腺癌检测方法 | 前列腺癌患者组织样本和尿液样本 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 蛋白质组分析, 尿液组分析 | 机器学习模型 | 转录组数据, 蛋白质组数据, 尿液组数据 | 转录组1393例, 蛋白质组104例, 尿液组923例 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序, 蛋白质组学, 尿液组学 | NA | NA |
| 634 | 2025-10-06 |
Construction and validation of a regulatory T cells-based classification of renal cell carcinoma: an integrated bioinformatic analysis and clinical cohort study
2025-Jun, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-01030-9
PMID:39714755
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析和临床队列研究，构建并验证了基于调节性T细胞的肾细胞癌分类系统 | 首次基于调节性T细胞状态构建肾细胞癌预后分类系统，并在独立临床队列中验证其预后价值 | 回顾性研究设计，需要在前瞻性研究中进一步验证 | 探索调节性T细胞与肾细胞癌异质性的关系，建立预后分类系统 | 肾细胞癌患者 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学染色, 多组学分析 | Cox比例风险回归模型, 单细胞轨迹分析 | RNA测序数据, 临床数据, 免疫组化数据 | TCGA-KIRC队列537例样本 + 新华队列370例肾肿瘤患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 免疫组织化学 | NA | NA |
| 635 | 2025-10-06 |
ENPP1 promotes immune suppression, drug resistance, and adverse outcomes in bladder cancer: Potential for targeted therapy
2025-Jun, Cancer genetics
IF:1.4Q4
DOI:10.1016/j.cancergen.2025.03.001
PMID:40058167
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证探讨ENPP1在膀胱癌中的促癌作用及其对免疫微环境和化疗耐药性的影响 | 首次系统揭示ENPP1在膀胱癌中通过调节免疫细胞浸润和凋亡通路促进肿瘤进展和化疗耐药的新机制 | 样本量有限（36例本地临床队列），需要更大规模研究验证 | 探究ENPP1在膀胱癌进展、免疫调节和化疗耐药中的作用机制 | 膀胱癌患者组织样本、TCGA和GEO数据库数据、UMUC3和J82膀胱癌细胞系 | 癌症生物学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、RT-qPCR、Western blotting、免疫组织化学、功能实验 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、临床数据 | TCGA-BLCA数据集、GEO数据集、36例本地膀胱癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 636 | 2025-10-06 |
Characterizing the Cellular Constituents of Proximal Airway Disease in Granulomatosis With Polyangiitis
2025-Jun, Otolaryngology--head and neck surgery : official journal of American Academy of Otolaryngology-Head and Neck Surgery
DOI:10.1002/ohn.1197
PMID:40062629
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肉芽肿性多血管炎患者近端气道病变的细胞组成 | 首次在GPA气道瘢痕中发现独特的CD4-/CD8-炎症性T细胞亚群 | 单中心研究，样本量有限 | 表征GPA近端气道病变的细胞组成和疾病发病机制 | GPA患者及疾病对照组的近端气道组织样本 | 单细胞组学 | 肉芽肿性多血管炎 | 单细胞RNA测序 | Monocle 3 | 单细胞转录组数据 | GPA患者9例，特发性声门下狭窄7例，插管后近端狭窄5例，对照10例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 637 | 2025-10-06 |
Bioinformatics identification of shared signaling pathways and core targets linking Benzo[a]pyrene exposure to HCC progression
2025-06, Toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.tox.2025.154129
PMID:40174762
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研究论文 | 通过生物信息学方法鉴定苯并[a]芘暴露与肝细胞癌进展相关的共享信号通路和核心靶点 | 首次系统识别了BaP与HCC关联的169个潜在靶点，并通过分子对接验证了核心靶点与BaP的高结合稳定性 | 研究主要基于数据库分析和计算预测，缺乏实验验证 | 探索苯并[a]芘在肝癌进展中的潜在分子机制 | 苯并[a]芘暴露相关的分子靶点和肝细胞癌 | 生物信息学 | 肝癌 | 生物信息学分析、分子对接、单细胞测序分析 | PPI网络分析、分子对接模型 | 基因组数据、蛋白质互作数据、临床数据 | 基于多个公共数据库（ChEMBL、TCGA等）的数据 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 638 | 2025-10-06 |
Alterations in genomic features and the tumour immune microenvironment predict immunotherapy outcomes in advanced biliary tract cancer patients
2025-Jun, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03011-7
PMID:40211026
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研究论文 | 本研究构建了一个多维度策略来预测晚期胆道癌患者免疫治疗的预后 | 开发了整合基因组特征和肿瘤免疫微环境的综合模型，发现序列熵和突变特征比传统TMB具有更好的预测性能 | 样本量较小（60例患者），需要更大规模验证 | 预测晚期胆道癌患者对免疫治疗的反应和预后 | 晚期胆道癌患者 | 生物信息学 | 胆道癌 | 520基因panel测序，多重循环细胞因子检测，单细胞转录组分析 | LASSO算法，Cox回归，集成模型 | 基因组测序数据，细胞因子数据，单细胞转录组数据 | 60例接受抗PD-1治疗的晚期胆道癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq，靶向测序 | NA | NA |
| 639 | 2025-10-06 |
Alternative splicing in autism spectrum disorder: Recent insights from mechanisms to therapy
2025-Jun, Asian journal of psychiatry
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.ajp.2025.104501
PMID:40273800
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综述 | 本文综述了自闭症谱系障碍中异常选择性剪接的机制、调控因子及基于RNA剪接的治疗策略 | 系统整合了长读长测序、单细胞测序、空间转录组学和CRISPR-Cas系统等新兴技术对ASD中选择性剪接研究的新见解 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据和研究方法的具体细节 | 探讨异常剪接机制在自闭症谱系障碍发病中的作用及治疗策略开发 | 自闭症谱系障碍相关的选择性剪接事件和剪接调控因子 | 自然语言处理 | 自闭症谱系障碍 | 长读长测序，单细胞测序，空间转录组学，CRISPR-Cas系统 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 640 | 2025-10-06 |
Identification and regulation of EMT cells in vivo by laser stimulation
2025-Jun, APL bioengineering
IF:6.6Q1
DOI:10.1063/5.0268350
PMID:40438388
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研究论文 | 本研究通过飞秒激光光刺激方法调控细胞内钙信号，探究PLCG2在上皮-间质转化(EMT)过程中的作用机制 | 首次采用紧密聚焦的飞秒激光扫描技术激活细胞内钙信号并诱导PLCG2上调，实时观察EMT细胞在体内的动态变化 | 研究仅使用前列腺癌PC3细胞构建皮下肿瘤模型，未验证其他肿瘤类型；PLCG2抑制剂对转移细胞无显著影响的具体机制尚不明确 | 探究PLCG2是否作为EMT的直接驱动因子及其在肿瘤发展中的作用 | 前列腺癌PC3细胞及由其构建的皮下肿瘤模型 | 单细胞分析 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，飞秒激光光刺激 | NA | 单细胞转录组数据 | 前列腺癌PC3细胞构建的皮下肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |