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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2025-10-06 |
Novel roles for CREG1 in hematopoiesis revealed by single-cell RNA sequencing
2025-Jun-01, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01407-9
PMID:40452027
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示CREG1在斑马鱼造血过程中的新功能 | 首次在成年斑马鱼中利用单细胞RNA测序技术系统研究CREG1在造血过程中的作用,发现其对B细胞、T/NK细胞和红细胞谱系发育的关键调控功能 | 研究仅在斑马鱼模型中进行,尚未在哺乳动物系统中验证;具体的分子调控机制仍需进一步研究 | 探究CREG1在成年造血过程中的功能和机制 | 成年斑马鱼的肾脏骨髓造血组织 | 单细胞生物学 | 造血系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | creg1缺陷型斑马鱼肾脏骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 622 | 2025-10-06 |
Single cell RNA sequencing shows that cells expressing Sox9 postnatally populate most skeletal lineages in mouse bone
2025-Jun-03, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/jbmr/zjaf043
PMID:40143416
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术,揭示了小鼠骨骼中表达Sox9的祖细胞在出生后仍能分化为多种骨骼谱系细胞 | 首次证明出生后骨骼中所有成骨细胞前体细胞均来源于表达Sox9的祖细胞,并鉴定了一种位于软骨膜和生长板软骨细胞柱之间的特殊软骨细胞群 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类或其他物种中验证 | 探究小鼠骨骼中成骨细胞谱系的细胞来源和发育路径 | 小鼠骨骼组织中的多种细胞类型 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠骨骼组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 623 | 2025-10-06 |
Cryptorchidism: Novel genetic insights into CCDC149 mutations
2025-Jun-03, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.70072
PMID:40459248
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研究论文 | 本研究通过全外显子组测序和基因敲除小鼠模型,揭示了CCDC149基因突变在双侧隐睾症发病机制中的作用 | 首次发现CCDC149基因突变与隐睾症的关联,并通过单细胞RNA测序揭示了其与抗穆勒氏管激素和肌肉发育因子的调控关系 | 研究样本量较小,仅基于一名患者和动物模型,需要更大规模的人群验证 | 探究CCDC149突变在双侧隐睾症发展中的作用及其分子机制 | 8岁双侧隐睾症男孩和Ccdc149基因敲除小鼠 | 遗传学 | 隐睾症 | 全外显子组测序, CRISPR/Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因组数据, 基因表达数据 | 1名患者和基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 624 | 2025-10-06 |
AI-Driven Biomarker Discovery and Personalized Allergy Treatment: Utilizing Machine Learning and NGS
2025-Jun-03, Current allergy and asthma reports
IF:5.4Q1
DOI:10.1007/s11882-025-01207-8
PMID:40459653
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综述 | 探讨人工智能和二代测序技术在过敏性疾病诊断与个性化治疗中的变革潜力 | 结合AI算法与单细胞RNA测序技术揭示过敏免疫反应特征,推动精准诊断和个性化治疗 | 存在数据整合和临床实施挑战 | 提升过敏性疾病生物标志物发现、患者分层和个性化管理的精准度 | 过敏性疾病患者 | 机器学习 | 过敏性疾病 | NGS, 单细胞RNA测序 | 机器学习, 深度学习 | 分子数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 625 | 2025-10-06 |
Epigenetic alteration of smooth muscle cells regulates endothelin-dependent blood pressure and hypertensive arterial remodeling
2025-Jun-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI186146
PMID:40146226
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研究论文 | 本研究揭示了组蛋白去甲基化酶JMJD3通过调控平滑肌细胞表观遗传改变影响血压和高血压动脉重塑的机制 | 首次将高血压相关人类DNA变异rs62059712与平滑肌细胞JMJD3表达调控联系起来,并阐明其通过影响内皮素受体平衡调控血压的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,在人类中的直接验证仍需进一步研究 | 探索表观遗传调控在高血压发病机制中的作用,特别是平滑肌细胞可塑性对血压和动脉重塑的影响 | 平滑肌细胞、Jmjd3基因缺陷小鼠模型、人类动脉组织 | 表观遗传学 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究(GWAS)、统计精细定位、单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因组数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 626 | 2025-10-06 |
MBD2 promotes epithelial-to-mesenchymal transition (EMT) and ARDS-related pulmonary fibrosis by modulating FZD2
2025-06, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2025.167798
PMID:40081619
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研究论文 | 本研究探讨了MBD2蛋白通过调控FZD2促进上皮-间质转化和ARDS相关肺纤维化的作用机制 | 首次揭示MBD2通过调控FZD2促进ARDS相关肺纤维化的新机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,临床验证仍需进一步开展 | 探究MBD2在ARDS相关肺纤维化发病机制中的作用 | 小鼠模型、MLE-12细胞、原代人肺泡上皮细胞、ARDS患者单细胞测序数据 | 分子生物学 | 肺纤维化 | RNA-Seq, ChIP, 单细胞测序, 免疫组化, 免疫荧光, Western blot | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 单细胞测序数据 | 野生型和MBD2敲除小鼠模型, 人类肺纤维化样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 627 | 2025-10-06 |
Identification of NETs-related genes as diagnostic biomarkers in ischemic stroke using RNA sequencing and single-cell analysis
2025-Jun, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10117-z
PMID:40107980
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研究论文 | 本研究通过RNA测序和单细胞分析鉴定缺血性卒中中NETs相关基因作为诊断生物标志物 | 首次结合RNA测序和单细胞分析系统研究NETs在缺血性卒中中的作用机制,发现Ceacam3、Tnf、Selp和Fcgr4等关键基因的诊断价值 | 研究主要基于小鼠模型,需要在人类样本中进一步验证 | 阐明NETs在缺血性卒中进展中的作用并识别潜在生物标志物和治疗靶点 | 小鼠脑组织样本和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 缺血性卒中 | RNA测序,单细胞RNA测序 | limma包,Seurat包,CellChat分析 | 基因表达数据,单细胞数据 | 未明确样本数量 | NA | RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 628 | 2025-10-06 |
Single-cell multiome reveals root hair-specific responses to salt stress
2025-Jun, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70160
PMID:40269556
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学技术揭示了盐胁迫下不结球白菜根毛特异性响应机制 | 首次构建了不结球白菜正常和盐胁迫条件下根尖的单细胞转录组和染色质可及性图谱 | 研究聚焦于不结球白菜,其他作物中的普适性需要进一步验证 | 探究植物根系对盐胁迫的响应机制,特别是根毛分化的分子基础 | 不结球白菜(NHCC)根尖细胞 | 植物生物学 | 非疾病研究 | 单细胞多组学测序 | NA | 单细胞转录组数据、染色质可及性数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 629 | 2025-10-06 |
Comprehensive analysis of breast cancer oxidative stress related gene signature: a combination of bulk and single-cell RNA sequencing analysis
2025-Jun, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10130-2
PMID:40274661
|
研究论文 | 本研究通过结合bulk和单细胞RNA测序分析,开发了基于氧化应激相关基因的乳腺癌预后基因特征 | 首次结合bulk和单细胞RNA测序构建氧化应激相关基因特征,并识别TFAP2B作为基底样乳腺癌的关键调控因子 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 开发基于氧化应激相关基因的预后特征以评估乳腺癌患者预后和免疫状态 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | Lasso回归, 多变量Cox回归 | 基因表达数据, 临床信息 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 630 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals extracellular matrix remodeling and collagen dynamics during lactation in sheep mammary gland
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143669
PMID:40319976
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示绵羊乳腺在哺乳期细胞外基质重塑和胶原蛋白动态变化 | 首次在绵羊乳腺中应用单细胞转录组学技术,系统描绘哺乳期细胞图谱并揭示成纤维细胞-上皮细胞互导驱动的胶原重塑机制 | 仅分析了产后60天和150天两个时间点,未能覆盖整个哺乳周期;物种间比较仅限于细胞类型保守性分析 | 解析绵羊乳腺在哺乳期的细胞结构和分子调控机制 | 绵羊乳腺组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 产后60天和150天两个时间点的绵羊乳腺样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 631 | 2025-10-06 |
KDELR3 and YOD1 proteins as critical endoplasmic reticulum stress mediators and potential therapeutic targets in diabetic foot ulcers: An integrated bioinformatics analysis
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144095
PMID:40354856
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析鉴定糖尿病足溃疡中内质网应激关键介质KDELR3和YOD1蛋白作为潜在治疗靶点 | 首次系统鉴定糖尿病足溃疡中内质网应激相关差异表达蛋白,并通过多组学分析揭示KDELR3和YOD1的关键作用 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限 | 探索糖尿病足溃疡发病机制中的内质网应激关键蛋白及其治疗潜力 | 糖尿病足溃疡患者组织样本和GEO数据库数据集 | 生物信息学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序, WGCNA, 机器学习, 分子对接, qRT-PCR, 孟德尔随机化分析 | 机器学习算法 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | GEO数据库糖尿病足溃疡数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 632 | 2025-10-06 |
The Potential Role of Monocyte-Derived Macrophages in Preventing Malarial Parasitemic Recrudescence in a Mouse Model
2025-Jun, Parasite immunology
IF:1.4Q3
DOI:10.1111/pim.70010
PMID:40459245
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究单核细胞来源巨噬细胞在预防疟疾寄生虫血症复发中的潜在作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析疟疾感染过程中脾脏吞噬细胞的动态变化,揭示MDMs在控制寄生虫血症复发中的新作用机制 | 研究仅限于小鼠模型,CCR2小鼠实验表明单核细胞向MDMs的转化可能不存在于该模型中 | 探究特定吞噬细胞类型在控制疟疾寄生虫复发中的作用机制 | 感染Plasmodium chabaudi chabaudi AS的小鼠脾脏吞噬细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 633 | 2025-10-06 |
SARS-CoV-2 Infection of Human Lung Air-Liquid Interface Cultures Reveals Basal Cells as Relevant Targets
2025-Jun-02, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf125
PMID:40065723
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研究论文 | 通过人类肺气液界面培养模型研究SARS-CoV-2感染机制,发现基底细胞是重要感染靶点 | 首次揭示除纤毛细胞和分泌细胞外,基底细胞也是SARS-CoV-2(包括Alpha变种)的重要感染靶点,并证实其在上呼吸道免疫反应中的关键作用 | 研究基于体外培养模型,可能与体内实际情况存在差异;存在供体特异性差异 | 探究SARS-CoV-2感染上呼吸道时涉及的上皮细胞类型及其免疫反应机制 | 人类原代鼻和支气管上皮细胞的气液界面培养物 | 传染病学 | COVID-19 | 病毒复制分析,单细胞RNA测序,光谱显微镜 | NA | 单细胞转录组数据,显微镜图像数据 | 人类原代上皮细胞培养物(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 634 | 2025-10-06 |
Cxcr3 promotes protection from colorectal cancer liver metastasis by driving NK cell infiltration and plasticity
2025-Jun-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI184036
PMID:40168086
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研究论文 | 本研究揭示了CXCR3通过驱动NK细胞浸润和可塑性在结直肠癌肝转移中发挥保护作用的机制 | 首次阐明CXCR3/配体轴通过促进巨噬细胞依赖的NK细胞积累和功能维持来抑制结直肠癌肝转移 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究NK细胞在结直肠癌肝转移中浸润和获得抗肿瘤特性的分子机制 | 结直肠癌肝转移微环境中的NK细胞和巨噬细胞 | 癌症免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,条件性基因敲除,抗体介导的细胞清除 | MC38小鼠模型,SL4诱导的CRC转移模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | 未治疗结直肠癌患者队列的已发表单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 635 | 2025-10-06 |
Perivascular Niche-Resident Alveolar Macrophages Promote Interstitial Pneumonitis Related to Trastuzumab Deruxtecan Treatment
2025-Jun-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-2021
PMID:40300097
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研究论文 | 本研究揭示了曲妥珠单抗德鲁替康(T-DXd)通过肺泡巨噬细胞的Fc-FcγR相互作用引发间质性肺炎的机制 | 首次发现T-DXd诱导的ILD是脱靶不良反应而非靶向脱瘤不良反应,并阐明了肺泡巨噬细胞通过Fc-FcγR摄取T-DXd导致SPP1通路介导的炎症机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化需要进一步验证 | 探究T-DXd诱导间质性肺病的分子机制 | 免疫活性小鼠模型和肺泡巨噬细胞 | 免疫学 | 间质性肺病 | 单细胞RNA测序,活体显微镜检查 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据,影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 636 | 2025-10-06 |
Lung endothelial cell heterogeneity in health and pulmonary vascular disease
2025-Jun-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00296.2024
PMID:39772753
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综述 | 本文通过单细胞RNA测序技术探讨肺内皮细胞异质性在健康和肺血管疾病中的作用 | 利用单细胞RNA测序技术识别了新型功能特异性肺内皮细胞亚群(如aerocytes和通用毛细血管内皮细胞)及其在肺动脉高压发病机制中的作用 | 作为小型综述,主要总结现有研究进展,未提供新的实验数据 | 探讨肺内皮细胞异质性在肺血管疾病发生发展中的作用机制 | 肺内皮细胞及其亚群 | 单细胞生物学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 637 | 2025-10-06 |
Characterization of the recombination activity in the pituitary and ovary of Prop1-iCre knockin mice
2025-Jun-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
DOI:10.1152/ajpendo.00049.2025
PMID:40327412
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研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9系统构建了Prop1-iCre基因敲入小鼠,并验证了其在垂体内分泌细胞和卵巢颗粒细胞中的特异性重组活性 | 首次利用CRISPR/Cas9技术构建Prop1-iCre基因敲入小鼠模型,证实其在垂体内分泌细胞中具有特异性重组活性,同时发现其在卵巢颗粒细胞中的意外重组活性 | 发现Prop1-iCre在卵巢颗粒细胞中存在非预期的重组活性,可能影响实验数据解读 | 开发用于垂体生物学研究的特异性基因操作工具 | Prop1-iCre基因敲入小鼠 | 分子生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑技术,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,组织特异性重组活性数据 | Prop1-iCre小鼠及其与Rosa-tdTomato报告基因小鼠的杂交后代 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 638 | 2025-10-06 |
Oncostatin-M: a novel leukocyte-derived factor facilitating the ovulatory process in the human ovary
2025-Jun-01, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deaf076
PMID:40327872
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研究论文 | 本研究揭示了白细胞来源的制瘤素M在人类排卵过程中的调控作用 | 首次证实白细胞来源的OSM通过激活STAT3、ERK1/2等信号通路调控人类排卵过程 | 使用体外培养的颗粒黄体细胞,可能无法完全模拟体内排卵动态;结果仅适用于人类样本 | 探究白细胞来源的制瘤素M是否调控人类优势卵泡的排卵过程 | 自然周期女性的优势卵泡和IVF患者的卵泡抽吸物 | 生殖生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序,定量PCR,免疫组化,Western blotting,RNA测序 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,激素测定数据 | 自然周期女性19例,IVF患者12例 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 639 | 2025-10-06 |
Dynamics of T Cell-Mediated Immune Signaling Network During Pathogenesis of Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2025-Jun, Yonsei medical journal
IF:2.6Q1
DOI:10.3349/ymj.2024.0227
PMID:40414827
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研究论文 | 通过多组学测序分析慢性阻塞性肺疾病进展过程中T细胞介导的免疫信号网络动态 | 首次结合bulk RNA测序、单细胞RNA测序和单核RNA测序系统分析COPD疾病进展,并发现中度COPD与COVID-19存在相似生物学模式 | 样本量相对有限,数据集来源不同可能存在批次效应 | 识别COPD从轻度到重度进展的特征,探索COVID-19与COPD之间的相关性 | 健康个体、COPD患者(轻度/中度/重度)和COVID-19患者 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 总计126个样本(43健康人+39 COPD患者+30单细胞样本+27单核样本) | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, single-nuclei RNA-seq | NA | NA |
| 640 | 2025-10-06 |
Endogenous Retroelement Activation is Implicated in Interferon-α Production and Anti-Cyclic Citrullinated Peptide Autoantibody Generation in Early Rheumatoid Arthritis
2025-Jun, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.43083
PMID:39681508
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研究论文 | 本研究首次在早期类风湿关节炎中探讨内源性逆转录元件表达与干扰素-α产生及抗环瓜氨酸肽自身抗体生成的关系 | 首次在早期类风湿关节炎中系统研究内源性逆转录元件表达,发现其与干扰素-α产生和抗环瓜氨酸肽自身抗体的潜在因果关系 | 样本量相对有限,疾病早期阶段研究需进一步验证 | 探讨内源性逆转录元件在早期类风湿关节炎发病机制中的作用 | 早期类风湿关节炎患者、早期银屑病关节炎患者、骨关节炎患者的血液和滑膜组织样本 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 逆转录聚合酶链反应, NanoString, 流式细胞术, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 单细胞测序数据 | 早期类风湿关节炎滑膜组织样本22例,全血样本56例,另包括早期银屑病关节炎和骨关节炎对照样本 | NanoString | 基因表达分析 | NanoString | NA |