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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2025-10-06 |
Fibroblast hierarchy dynamics during mammary gland morphogenesis and tumorigenesis
2025-Jun, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00422-3
PMID:40216939
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示小鼠乳腺发育和肿瘤发生过程中成纤维细胞的层级动态变化 | 首次对乳腺发育和肿瘤发生过程中超过45,000个成纤维细胞进行纵向单细胞转录组分析,揭示了CD34+间充质祖细胞的分化层级和Hedgehog信号的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究正常乳腺和乳腺癌中成纤维细胞的异质性和发育层级 | 小鼠乳腺组织中的成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过45,000个成纤维细胞,涵盖五个发育阶段和肿瘤发生过程 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 602 | 2025-10-06 |
Knockdown TNF family prognosis index crucial gene PDE4B promoted PANoptosis of ovarian carcinoma cell:Based in vitro and in vivo experiments
2025-Jun, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102333
PMID:40245751
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研究论文 | 通过体外和体内实验研究PDE4B基因调控卵巢癌细胞的PANoptosis过程 | 首次构建包含14个基因的卵巢癌预后模型,并发现PDE4B基因在调控卵巢癌细胞PANoptosis中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 阐明卵巢癌的发病机制并开发预后模型 | 卵巢癌组织和正常卵巢组织 | 生物信息学 | 卵巢癌 | bulk转录组测序,单细胞测序,GSVA,WGCNA,GO富集分析 | 多变量Cox回归,LASSO回归 | 转录组数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 603 | 2025-10-06 |
CCR5 + T cells as a potential biomarker for primary Sjögren's disease based on bioinformatics analysis
2025-Jun, Clinical rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s10067-025-07460-6
PMID:40293619
|
研究论文 | 通过生物信息学分析鉴定并验证原发性干燥综合征的潜在生物标志物CCR5 | 首次将CCR5确定为原发性干燥综合征的关键生物标志物,并发现其在唾液腺T细胞中特异性上调 | 研究主要基于公共数据库数据,需要更多实验验证 | 识别原发性干燥综合征的生物标志物并探索其分子免疫机制 | 原发性干燥综合征患者基因表达数据 | 生物信息学 | 自身免疫性疾病 | 生物信息学分析,单细胞RNA测序 | WGCNA,PPI网络分析,ROC分析 | 基因表达数据 | GEO数据库中的pSjD数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 604 | 2025-10-06 |
Role of aberrant activated fibro/adipogenic progenitors and suppressed ferroptosis in disused skeletal muscle atrophy and fatty infiltration
2025-Jun, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany)
DOI:10.1007/s00109-025-02548-7
PMID:40316864
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体外实验,探讨了废用性骨骼肌萎缩中脂肪浸润的机制,重点关注纤维/脂肪祖细胞的异常激活和铁死亡抑制的作用 | 首次在废用性骨骼肌萎缩模型中揭示FAPs异常增殖与铁死亡抑制基因上调的关联,并验证铁死亡抑制对FAPs成脂/成纤维能力的增强作用 | 仅初步探讨了铁死亡在FAPs成脂分化中的潜在作用,相关分子机制仍需深入研究 | 探究废用性骨骼肌萎缩中肌肉脂肪浸润的细胞和分子机制 | 废用性骨骼肌组织、骨骼肌成纤维细胞和纤维/脂肪祖细胞(FAPs) | 单细胞生物学 | 骨骼肌萎缩 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, 体外细胞培养 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 605 | 2025-10-06 |
Endothelial-to-mesenchymal transition gene signature derived from single-cell transcriptomics of human atherosclerotic tissue associates with stable plaque histological characteristics
2025-Jun, Vascular pharmacology
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.vph.2025.107498
PMID:40318741
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据分析确定了人类动脉粥样硬化斑块中内皮-间质转化的核心基因特征 | 首次在人类动脉粥样硬化组织中通过计算谱系追踪方法识别EndoMT过程的核心基因特征,而非仅关注完全分化的间质细胞状态 | 研究主要基于计算分析,需要进一步的实验验证 | 揭示人类动脉粥样硬化中内皮-间质转化的分子机制 | 人类颈动脉斑块组织、小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、计算谱系追踪、批量RNA测序 | 谱系追踪模型 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 46例人类颈动脉单细胞样本、632例患者批量RNA样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 606 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) and its insights into cellular heterogeneity in atherosclerosis
2025-Jun, Vascular pharmacology
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.vph.2025.107499
PMID:40345606
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在动脉粥样硬化研究中的应用及其对细胞异质性的新见解 | 通过单细胞RNA测序重新定义动脉粥样硬化斑块病理学,识别了多种细胞类型及其在斑块稳定性和疾病进展中的特定作用 | NA | 总结单细胞RNA测序在动脉粥样硬化研究中揭示的细胞异质性及其治疗意义 | 小鼠和人类组织中的非病变和动脉粥样硬化主动脉 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 607 | 2025-10-06 |
Integrative transcriptomic and single-cell analysis reveals IL27RA as a key immune regulator and therapeutic indicator in breast cancer
2025-Jun-01, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02811-w
PMID:40450602
|
研究论文 | 通过整合转录组和单细胞分析揭示IL27RA作为乳腺癌关键免疫调节因子和治疗指标 | 首次系统研究IL27RA在乳腺癌中的作用及其与免疫治疗反应的关系,利用单细胞转录组数据进行免疫分层 | 研究主要基于生物信息学分析,需要更多实验验证IL27RA的具体功能机制 | 探索IL27RA在乳腺癌中的表达特征、预后价值和治疗预测作用 | 乳腺癌患者样本和单细胞测序数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, Western blot | NA | 转录组数据, 单细胞数据, 蛋白质表达数据 | 来自TCGA、GEO和scRNA-seq数据集的多个队列样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 608 | 2025-10-06 |
Machine Learning-Assisted Analysis of the Oral Cancer Immune Microenvironment: From Single-Cell Level to Prognostic Model Construction
2025-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70637
PMID:40457149
|
研究论文 | 本研究结合机器学习方法和单细胞测序数据分析口腔癌免疫微环境,并构建免疫浸润预测模型 | 首次将机器学习算法与单细胞测序数据相结合,系统分析口腔癌免疫微环境并构建可靠的预后模型 | 模型验证仅限于训练集和独立测试集,需要更大规模的前瞻性研究验证 | 构建口腔癌免疫浸润预测模型,为个性化治疗和预后评估提供理论基础 | 口腔癌患者及其肿瘤免疫微环境 | 机器学习 | 口腔癌 | 单细胞测序 | Lasso回归, 随机森林, 梯度提升机 | 临床基因组数据, 单细胞测序数据 | 口腔癌患者队列(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 609 | 2025-10-06 |
Malvidin Alleviates Lipopolysaccharide-Induced Acute Lung Injury by Modulating JAK2/STAT3 Signaling to Inhibit Macrophage M1 Polarization and Oxidative Stress
2025-Jun-04, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c00077
PMID:40397040
|
研究论文 | 本研究探讨锦葵色素通过调节JAK2/STAT3信号通路抑制巨噬细胞M1极化和氧化应激,缓解脂多糖诱导的急性肺损伤 | 首次揭示锦葵色素通过靶向JAK2/STAT3信号通路调控巨噬细胞极化状态,并证实其结合JAK2的分子机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,尚未进行临床验证 | 评估锦葵色素对急性肺损伤的治疗效果并阐明其作用机制 | 小鼠急性肺损伤模型和巨噬细胞 | 分子生物学 | 急性肺损伤 | 单细胞转录组测序,RNA测序,分子对接,分子动力学模拟,Western blot,DPPH/ABTS自由基清除实验 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,分子相互作用数据 | 小鼠模型和细胞实验样本 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 610 | 2025-10-06 |
Deciphering the temporal transcriptional landscape of human fetal leptomeninges
2025-Jun-03, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awae397
PMID:39657259
|
研究论文 | 通过单核RNA测序揭示人类胎儿软脑膜发育过程中的转录组动态和细胞异质性 | 首次系统描绘人类胎儿软脑膜发育的时间转录组图谱,发现人类特异性层标记物和衰老特异性蛛网膜细胞簇 | 样本数量有限(8个人类胚胎),仅通过免疫染色验证部分发现 | 解析人类胚胎发育过程中软脑膜的细胞发育和分子机制 | 人类胎儿软脑膜组织 | 单细胞基因组学 | NA | 单核RNA测序,生物信息学分析,免疫染色 | NA | 单细胞转录组数据 | 8个人类胚胎(从早期胎儿到中晚期胎儿阶段) | NA | 单核RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 611 | 2025-10-06 |
The Application of Omics Technologies in Type II Diabetes Mellitus Research
2025-Jun-03, Current diabetes reviews
IF:2.4Q3
|
综述 | 本文探讨组学技术在2型糖尿病研究中的应用与进展 | 系统总结单细胞测序和LC-MS技术如何推动糖尿病精准医疗和生物标志物发现 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于文献综述 | 探索组学技术在2型糖尿病研究中的应用价值 | 2型糖尿病的分子机制和生物标志物 | 生物医学 | 2型糖尿病 | 基因组学,蛋白质组学,代谢组学,单细胞测序,液相色谱-质谱联用 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学,代谢组学 | NA | NA |
| 612 | 2025-10-06 |
A Genetic Perspective to Reveal the Impact of Mitochondrial Dysfunction-related Genes on Diabetic Kidney Disease: A Multi-omics Study
2025-Jun-03, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过多组学方法探讨线粒体功能障碍相关基因在糖尿病肾病中的作用,并确定ACTN1作为潜在治疗靶点 | 首次整合大规模数据库和单细胞RNA测序数据,识别出7个具有显著遗传因果效应的线粒体功能障碍相关基因,并预测了二氢麦角汀作为ACTN1的靶向化合物 | 研究主要基于生物信息学分析,需要更多实验验证;样本来源和数量未明确说明 | 探究线粒体功能障碍在糖尿病肾病进展中的分子机制,识别关键致病基因 | 糖尿病肾病相关的线粒体功能障碍基因 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, SMR分析, MR分析, 共定位分析, PheWAS分析, 分子动力学分析, 免疫荧光 | 预测模型 | 基因组数据, 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 613 | 2025-10-06 |
Targeting INF2 with DiosMetin 7-O-β-D-Glucuronide: a new stratagem for colorectal cancer therapy
2025-Jun-01, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14357-9
PMID:40452021
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别INF2作为结直肠癌特异性生物标志物,并发现天然化合物DiosMetin 7-O-β-D-葡萄糖醛酸苷可作为INF2抑制剂用于靶向治疗 | 首次将INF2鉴定为结直肠癌特异性预后标志物,并发现天然化合物DiosMetin 7-O-β-D-葡萄糖醛酸苷作为选择性INF2抑制剂 | NA | 识别结直肠癌特异性生物标志物并开发靶向治疗方法 | 结直肠癌组织和细胞 | 生物医学研究 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 机器学习, 免疫组织化学, 细胞生物学实验, 计算对接 | 机器学习模型 | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 614 | 2025-10-06 |
Novel roles for CREG1 in hematopoiesis revealed by single-cell RNA sequencing
2025-Jun-01, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01407-9
PMID:40452027
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示CREG1在斑马鱼造血过程中的新功能 | 首次在成年斑马鱼中利用单细胞RNA测序技术系统研究CREG1在造血过程中的作用,发现其对B细胞、T/NK细胞和红细胞谱系发育的关键调控功能 | 研究仅在斑马鱼模型中进行,尚未在哺乳动物系统中验证;具体的分子调控机制仍需进一步研究 | 探究CREG1在成年造血过程中的功能和机制 | 成年斑马鱼的肾脏骨髓造血组织 | 单细胞生物学 | 造血系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | creg1缺陷型斑马鱼肾脏骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 615 | 2025-10-06 |
Cryptorchidism: Novel genetic insights into CCDC149 mutations
2025-Jun-03, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.70072
PMID:40459248
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研究论文 | 本研究通过全外显子组测序和基因敲除小鼠模型,揭示了CCDC149基因突变在双侧隐睾症发病机制中的作用 | 首次发现CCDC149基因突变与隐睾症的关联,并通过单细胞RNA测序揭示了其与抗穆勒氏管激素和肌肉发育因子的调控关系 | 研究样本量较小,仅基于一名患者和动物模型,需要更大规模的人群验证 | 探究CCDC149突变在双侧隐睾症发展中的作用及其分子机制 | 8岁双侧隐睾症男孩和Ccdc149基因敲除小鼠 | 遗传学 | 隐睾症 | 全外显子组测序, CRISPR/Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因组数据, 基因表达数据 | 1名患者和基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 616 | 2025-10-06 |
AI-Driven Biomarker Discovery and Personalized Allergy Treatment: Utilizing Machine Learning and NGS
2025-Jun-03, Current allergy and asthma reports
IF:5.4Q1
DOI:10.1007/s11882-025-01207-8
PMID:40459653
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综述 | 探讨人工智能和二代测序技术在过敏性疾病诊断与个性化治疗中的变革潜力 | 结合AI算法与单细胞RNA测序技术揭示过敏免疫反应特征,推动精准诊断和个性化治疗 | 存在数据整合和临床实施挑战 | 提升过敏性疾病生物标志物发现、患者分层和个性化管理的精准度 | 过敏性疾病患者 | 机器学习 | 过敏性疾病 | NGS, 单细胞RNA测序 | 机器学习, 深度学习 | 分子数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 617 | 2025-10-06 |
Epigenetic alteration of smooth muscle cells regulates endothelin-dependent blood pressure and hypertensive arterial remodeling
2025-Jun-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI186146
PMID:40146226
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研究论文 | 本研究揭示了组蛋白去甲基化酶JMJD3通过调控平滑肌细胞表观遗传改变影响血压和高血压动脉重塑的机制 | 首次将高血压相关人类DNA变异rs62059712与平滑肌细胞JMJD3表达调控联系起来,并阐明其通过影响内皮素受体平衡调控血压的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,在人类中的直接验证仍需进一步研究 | 探索表观遗传调控在高血压发病机制中的作用,特别是平滑肌细胞可塑性对血压和动脉重塑的影响 | 平滑肌细胞、Jmjd3基因缺陷小鼠模型、人类动脉组织 | 表观遗传学 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究(GWAS)、统计精细定位、单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因组数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 618 | 2025-10-06 |
MBD2 promotes epithelial-to-mesenchymal transition (EMT) and ARDS-related pulmonary fibrosis by modulating FZD2
2025-06, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2025.167798
PMID:40081619
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研究论文 | 本研究探讨了MBD2蛋白通过调控FZD2促进上皮-间质转化和ARDS相关肺纤维化的作用机制 | 首次揭示MBD2通过调控FZD2促进ARDS相关肺纤维化的新机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,临床验证仍需进一步开展 | 探究MBD2在ARDS相关肺纤维化发病机制中的作用 | 小鼠模型、MLE-12细胞、原代人肺泡上皮细胞、ARDS患者单细胞测序数据 | 分子生物学 | 肺纤维化 | RNA-Seq, ChIP, 单细胞测序, 免疫组化, 免疫荧光, Western blot | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 单细胞测序数据 | 野生型和MBD2敲除小鼠模型, 人类肺纤维化样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 619 | 2025-10-06 |
Identification of NETs-related genes as diagnostic biomarkers in ischemic stroke using RNA sequencing and single-cell analysis
2025-Jun, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10117-z
PMID:40107980
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研究论文 | 本研究通过RNA测序和单细胞分析鉴定缺血性卒中中NETs相关基因作为诊断生物标志物 | 首次结合RNA测序和单细胞分析系统研究NETs在缺血性卒中中的作用机制,发现Ceacam3、Tnf、Selp和Fcgr4等关键基因的诊断价值 | 研究主要基于小鼠模型,需要在人类样本中进一步验证 | 阐明NETs在缺血性卒中进展中的作用并识别潜在生物标志物和治疗靶点 | 小鼠脑组织样本和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 缺血性卒中 | RNA测序,单细胞RNA测序 | limma包,Seurat包,CellChat分析 | 基因表达数据,单细胞数据 | 未明确样本数量 | NA | RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 620 | 2025-10-06 |
Single-cell multiome reveals root hair-specific responses to salt stress
2025-Jun, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70160
PMID:40269556
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学技术揭示了盐胁迫下不结球白菜根毛特异性响应机制 | 首次构建了不结球白菜正常和盐胁迫条件下根尖的单细胞转录组和染色质可及性图谱 | 研究聚焦于不结球白菜,其他作物中的普适性需要进一步验证 | 探究植物根系对盐胁迫的响应机制,特别是根毛分化的分子基础 | 不结球白菜(NHCC)根尖细胞 | 植物生物学 | 非疾病研究 | 单细胞多组学测序 | NA | 单细胞转录组数据、染色质可及性数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |