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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2025-10-06 |
Excess Neprilysin in Placental EVs Impairs CNP-NPRB-Mediated Vasodilation to Trigger Preeclamptic Hypertension
2025-Jun-06, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325673
PMID:40304042
|
研究论文 | 本研究揭示了先兆子痫胎盘细胞外囊泡中过量NEP通过降解CNP损害血管舒张功能导致高血压的机制 | 首次发现胎盘细胞外囊泡中过量NEP是连接先兆子痫两个发展阶段的关键因子,阐明了NEP通过降解CNP破坏血管舒张的新机制 | 动物模型可能无法完全模拟人类疾病进程,需要进一步临床验证 | 探究先兆子痫发病机制中胎盘来源物质的作用 | 胎盘细胞外囊泡、子宫动脉、血管内皮细胞、血管平滑肌细胞 | 生殖医学 | 先兆子痫 | 液相色谱-质谱联用, 单细胞RNA测序, 肌动描记法, 腺病毒转染 | NA | 蛋白质组学数据, 基因表达数据, 生理功能数据 | 正常和先兆子痫胎盘样本, 孕鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 602 | 2025-10-06 |
T Cell Exhaustion-Related Gene Signatures Predict Immunotherapy and Chemotherapy Response in Kidney Renal Clear Cell Carcinoma
2025-Jun-06, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
DOI:10.1089/cbr.2025.0060
PMID:40474808
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研究论文 | 本研究开发了基于T细胞耗竭基因特征的预后模型,用于预测肾透明细胞癌患者的生存结局和治疗反应 | 首次构建了基于T细胞耗竭相关基因的预后风险模型,并验证了其在免疫治疗和化疗反应预测中的价值 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要更多前瞻性临床研究验证 | 开发能够预测肾透明细胞癌患者治疗反应和预后的生物标志物模型 | 肾透明细胞癌患者 | 生物信息学 | 肾癌 | 基因集变异分析,加权基因共表达网络分析,单细胞RNA测序,实时定量PCR | 随机森林,LASSO-Cox回归 | 基因表达数据,临床数据 | 518例TCGA数据库的KIRC患者,外加IMvigor210和GDSC数据库验证 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 603 | 2025-10-06 |
Between Cluster Analysis: Supervised Dimensionality Reduction for Trajectory Inference
2025-Jun-05, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf306
PMID:40471707
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研究论文 | 提出一种用于轨迹推断的监督式降维方法——簇间分析 | 开发了利用细胞簇标签作为先验信息的监督式线性降维技术,能最大化簇间方差并改善轨迹推断效果 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的轨迹推断分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 监督式线性降维 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 604 | 2025-10-06 |
Identify the co-expressed genes of hypertensive nephropathy and diabetic nephropathy
2025-Jun-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-04679-w
PMID:40461634
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析识别高血压肾病和糖尿病肾病的共同表达基因及潜在治疗靶点 | 首次系统识别HN和DN的42个共享差异表达基因,并通过单细胞测序分析发现TNFSF10和NR4A1在两种肾病细胞中高表达 | 研究基于公共数据库的样本数据,缺乏实验验证 | 探索高血压肾病和糖尿病肾病在分子和病理机制上的内在联系 | 高血压肾病和糖尿病肾病的基因表达数据 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | 基因表达分析,GO/KEGG富集分析,GSEA分析,PPI网络分析,单细胞测序分析,分子对接模拟 | NA | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的四个数据集:GSE37460、GSE142153(训练集)、GSE37455、GSE30529(验证集) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 605 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal and single-cell atlases to dissect regional specific cell types of the developing ovary
2025-Jun-03, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08277-4
PMID:40461746
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研究论文 | 结合空间转录组学和单细胞RNA测序构建从胎儿期到成年期卵巢的时空发育图谱 | 首次整合空间转录组学和单细胞RNA测序揭示卵巢发育过程中的区域特异性细胞类型分布 | NA | 解析卵巢发育过程中细胞异质性和区域特异性 | 从胎儿期到成年期的卵巢组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 606 | 2025-10-06 |
Pericytes in castration-resistant prostate cancer associated with disease progression and immunotherapy response: insights from single-cell analysis
2025-Jun-03, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03838-3
PMID:40462105
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示周细胞在去势抵抗性前列腺癌中的关键作用及其与免疫治疗反应的关系 | 首次在单细胞水平鉴定出CRPC特异性周细胞亚群,发现其通过PDGF信号通路促进肿瘤进展并抑制抗肿瘤免疫 | 研究主要基于临床样本分析和小鼠模型验证,需要进一步的功能实验确认机制 | 解析周细胞在去势抵抗性前列腺癌中的生物学功能及其与肿瘤微环境的相互作用 | 前列腺癌组织样本、小鼠RM-1皮下肿瘤模型 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组测序、免疫荧光染色、RNA-seq、微阵列分析 | NA | 单细胞转录组数据、批量RNA-seq数据、微阵列数据、图像数据 | 多个前列腺癌临床数据集和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 607 | 2025-10-06 |
DeepGFT: identifying spatial domains in spatial transcriptomics of complex and 3D tissue using deep learning and graph Fourier transform
2025-Jun-03, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03631-5
PMID:40462157
|
研究论文 | 提出一种结合深度学习和图傅里叶变换的空间转录组学分析方法DeepGFT,用于识别复杂组织和3D组织的空间结构域 | 首次将深度学习与图傅里叶变换相结合,同时建模位点间和基因间关系,实现更准确的空间结构域识别 | NA | 开发空间转录组数据分析方法以准确识别组织空间结构域 | 人类乳腺癌组织、人类淋巴结组织、3D果蝇发育数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间分辨转录组学 | 深度学习 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 608 | 2025-10-06 |
PDE3B and HBB are key prognostic biomarkers driving cell proliferation and regulating immune microenvironment in breast cancer
2025-Jun-03, Hereditas
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s41065-025-00470-z
PMID:40462176
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和TCGA数据分析,发现PDE3B和HBB是乳腺癌的关键预后生物标志物,驱动细胞增殖并调节免疫微环境 | 首次在单细胞水平识别恶性细胞亚群类型3的高增殖潜力,并确定PDE3B和HBB作为乳腺癌预后和免疫调节的关键驱动因子 | 研究主要基于MDA-MB-231细胞系验证,需要在更多乳腺癌细胞模型和临床样本中进一步验证 | 探索PDE3B和HBB在乳腺癌中的预后价值和功能作用,特别是对细胞增殖和免疫微环境调节的贡献 | 乳腺癌细胞、单细胞RNA测序数据、TCGA数据库、MDA-MB-231细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 免疫组织化学, Western blot, 增殖实验 | LASSO回归, Kaplan-Meier生存分析, EPIC反卷积 | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 临床生存数据 | TCGA数据库乳腺癌样本和单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 609 | 2025-10-06 |
Transcriptional analysis of metastatic hormone-naïve prostate cancer primary tumor biopsies reveals a relevant role for SOX11 in prostate cancer cell dissemination
2025-Jun-03, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03623-5
PMID:40462200
|
研究论文 | 首次对转移性激素初治前列腺癌原发肿瘤进行转录组学表征,发现SOX11在肿瘤细胞转移中的关键作用 | 首次提供mHNPC原发肿瘤的全面转录组学特征,发现SOX11在触发异型通讯和转移特性获得中的核心作用 | NA | 探索转移性激素初治前列腺癌的分子特征和转移机制 | 转移性激素初治前列腺癌患者的原发肿瘤标本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 610 | 2025-10-06 |
Sustained macrophage reprogramming is required for CD8+ T cell-dependent long-term tumor eradication
2025-Jun-05, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0797
PMID:40471151
|
研究论文 | 本研究揭示了通过重复TLR3和CD40激动剂联合治疗可维持肿瘤相关巨噬细胞的抗肿瘤表型,从而实现CD8+ T细胞依赖的长期肿瘤消除 | 首次发现肿瘤相关巨噬细胞重编程具有瞬时性特征,并通过重复给药策略克服这一局限性 | 研究基于小鼠乳腺癌模型,临床转化效果需进一步验证 | 探究肿瘤相关巨噬细胞功能状态及其在抗肿瘤免疫中的作用机制 | 小鼠乳腺癌模型中的肿瘤相关巨噬细胞和CD8+ T细胞 | 免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同肿瘤阶段和治疗后时间点的肿瘤相关巨噬细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 611 | 2025-10-06 |
Therapeutic B cell depletion identifies immunoregulatory networks
2025-Jun-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI189442
PMID:40454471
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研究论文 | 本研究通过B细胞耗竭疗法揭示了多发性硬化症中的免疫调节网络 | 首次在单细胞水平系统分析B细胞耗竭对免疫系统的全面影响,发现抗炎性脑脊液巨噬细胞增加和外周CD16+单核细胞TNF-α表达升高等新机制 | NA | 探索B细胞耗竭疗法在多发性硬化症中的免疫调节机制 | 多发性硬化症患者的免疫细胞 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 612 | 2025-10-06 |
Divergent combinations of enhancers encode spatial gene expression
2025-Jun-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60482-1
PMID:40456823
|
研究论文 | 开发eSpatial计算框架,通过整合基因表达和染色质可及性的空间图谱,解析增强子对空间基因表达的调控机制 | 提出“空间增强子编码”概念,揭示不同增强子组合在空间隔离区域调控同一基因的表达模式 | NA | 探索增强子如何调控空间基因表达模式 | 小鼠胚胎和大脑,人类黑色素瘤和乳腺癌组织 | 空间转录组学 | 黑色素瘤,乳腺癌 | 空间转录组学,空间表观基因组学,原位杂交,MERFISH,转基因报告实验,CRISPR/Cas9基因编辑 | 计算框架(eSpatial) | 空间基因表达数据,染色质可及性数据 | 多种生物样本(小鼠胚胎、大脑,人类肿瘤组织) | NA | 空间转录组学,空间表观基因组学,MERFISH | NA | NA |
| 613 | 2025-10-06 |
SC2Spa: a deep learning based approach to map transcriptome to spatial origins at cellular resolution
2025-Jun-02, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06173-6
PMID:40457183
|
研究论文 | 提出了一种基于深度学习的SC2Spa方法,能够将转录组数据映射到细胞分辨率的空间位置 | 开发了能够从空间转录组数据学习复杂空间关系的深度学习模型,能够识别传统方法无法发现的空间变异基因 | NA | 解决细胞在组织中空间位置映射的挑战,理解细胞异质性 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 深度学习 | 转录组数据,空间坐标数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | Visium | Visium检测技术 |
| 614 | 2025-10-06 |
Multi-omics unveils BCAA metabolism markers L-leucine and HMGCS1 as prognostic marker for immunotherapy efficacy in non-small cell lung cancer
2025-Jun-02, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03277-8
PMID:40457349
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了支链氨基酸代谢标志物L-亮氨酸和HMGCS1作为非小细胞肺癌免疫治疗疗效的预后标志物 | 首次将血浆BCAA代谢物与基因特征结合构建预后风险模型,并在多个癌种和平台验证HMGCS1的独立预后价值 | 样本量相对有限,部分验证队列样本数较少,需要更大规模的前瞻性研究验证 | 识别能够增强非小细胞肺癌免疫治疗预后评估的BCAA血浆代谢物和基因特征 | 非小细胞肺癌患者、黑色素瘤患者、泛癌种免疫检查点抑制剂治疗队列、弥漫大B细胞淋巴瘤患者 | 多组学分析 | 非小细胞肺癌, 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 非靶向UPLC-MS/MS, 多重免疫荧光, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学 | 预后风险模型, Kaplan-Meier分析, ROC曲线分析 | 代谢组数据, 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据, 蛋白质表达数据 | 多个队列总计超过1000例样本,包括NSCLC(94+40+274+176+196+16+27+24+339)、黑色素瘤(25)、泛癌种(330+81)、DLBCL(10+39)等 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 代谢组学 | NA | 非靶向UPLC-MS/MS用于血浆代谢物检测,多重免疫荧光用于免疫细胞浸润验证 |
| 615 | 2025-10-06 |
Knockdown TNF family prognosis index crucial gene PDE4B promoted PANoptosis of ovarian carcinoma cell:Based in vitro and in vivo experiments
2025-Jun, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102333
PMID:40245751
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研究论文 | 通过体外和体内实验研究PDE4B基因调控卵巢癌细胞的PANoptosis过程 | 首次构建包含14个基因的卵巢癌预后模型,并发现PDE4B基因在调控卵巢癌细胞PANoptosis中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 阐明卵巢癌的发病机制并开发预后模型 | 卵巢癌组织和正常卵巢组织 | 生物信息学 | 卵巢癌 | bulk转录组测序,单细胞测序,GSVA,WGCNA,GO富集分析 | 多变量Cox回归,LASSO回归 | 转录组数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 616 | 2025-10-06 |
CCR5 + T cells as a potential biomarker for primary Sjögren's disease based on bioinformatics analysis
2025-Jun, Clinical rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s10067-025-07460-6
PMID:40293619
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研究论文 | 通过生物信息学分析鉴定并验证原发性干燥综合征的潜在生物标志物CCR5 | 首次将CCR5确定为原发性干燥综合征的关键生物标志物,并发现其在唾液腺T细胞中特异性上调 | 研究主要基于公共数据库数据,需要更多实验验证 | 识别原发性干燥综合征的生物标志物并探索其分子免疫机制 | 原发性干燥综合征患者基因表达数据 | 生物信息学 | 自身免疫性疾病 | 生物信息学分析,单细胞RNA测序 | WGCNA,PPI网络分析,ROC分析 | 基因表达数据 | GEO数据库中的pSjD数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 617 | 2025-10-06 |
Role of aberrant activated fibro/adipogenic progenitors and suppressed ferroptosis in disused skeletal muscle atrophy and fatty infiltration
2025-Jun, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany)
DOI:10.1007/s00109-025-02548-7
PMID:40316864
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体外实验,探讨了废用性骨骼肌萎缩中脂肪浸润的机制,重点关注纤维/脂肪祖细胞的异常激活和铁死亡抑制的作用 | 首次在废用性骨骼肌萎缩模型中揭示FAPs异常增殖与铁死亡抑制基因上调的关联,并验证铁死亡抑制对FAPs成脂/成纤维能力的增强作用 | 仅初步探讨了铁死亡在FAPs成脂分化中的潜在作用,相关分子机制仍需深入研究 | 探究废用性骨骼肌萎缩中肌肉脂肪浸润的细胞和分子机制 | 废用性骨骼肌组织、骨骼肌成纤维细胞和纤维/脂肪祖细胞(FAPs) | 单细胞生物学 | 骨骼肌萎缩 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, 体外细胞培养 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 618 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) and its insights into cellular heterogeneity in atherosclerosis
2025-Jun, Vascular pharmacology
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.vph.2025.107499
PMID:40345606
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在动脉粥样硬化研究中的应用及其对细胞异质性的新见解 | 通过单细胞RNA测序重新定义动脉粥样硬化斑块病理学,识别了多种细胞类型及其在斑块稳定性和疾病进展中的特定作用 | NA | 总结单细胞RNA测序在动脉粥样硬化研究中揭示的细胞异质性及其治疗意义 | 小鼠和人类组织中的非病变和动脉粥样硬化主动脉 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 619 | 2025-10-06 |
Integrative transcriptomic and single-cell analysis reveals IL27RA as a key immune regulator and therapeutic indicator in breast cancer
2025-Jun-01, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02811-w
PMID:40450602
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研究论文 | 通过整合转录组和单细胞分析揭示IL27RA作为乳腺癌关键免疫调节因子和治疗指标 | 首次系统研究IL27RA在乳腺癌中的作用及其与免疫治疗反应的关系,利用单细胞转录组数据进行免疫分层 | 研究主要基于生物信息学分析,需要更多实验验证IL27RA的具体功能机制 | 探索IL27RA在乳腺癌中的表达特征、预后价值和治疗预测作用 | 乳腺癌患者样本和单细胞测序数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, Western blot | NA | 转录组数据, 单细胞数据, 蛋白质表达数据 | 来自TCGA、GEO和scRNA-seq数据集的多个队列样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 620 | 2025-10-06 |
Malvidin Alleviates Lipopolysaccharide-Induced Acute Lung Injury by Modulating JAK2/STAT3 Signaling to Inhibit Macrophage M1 Polarization and Oxidative Stress
2025-Jun-04, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c00077
PMID:40397040
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研究论文 | 本研究探讨锦葵色素通过调节JAK2/STAT3信号通路抑制巨噬细胞M1极化和氧化应激,缓解脂多糖诱导的急性肺损伤 | 首次揭示锦葵色素通过靶向JAK2/STAT3信号通路调控巨噬细胞极化状态,并证实其结合JAK2的分子机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,尚未进行临床验证 | 评估锦葵色素对急性肺损伤的治疗效果并阐明其作用机制 | 小鼠急性肺损伤模型和巨噬细胞 | 分子生物学 | 急性肺损伤 | 单细胞转录组测序,RNA测序,分子对接,分子动力学模拟,Western blot,DPPH/ABTS自由基清除实验 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,分子相互作用数据 | 小鼠模型和细胞实验样本 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |