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当前共找到 727 篇文献，本页显示第 581 - 600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2025-10-06 |
Between Cluster Analysis: Supervised Dimensionality Reduction for Trajectory Inference
2025-Jun-05, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf306
PMID:40471707
|
研究论文 | 提出一种用于轨迹推断的监督式降维方法——簇间分析 | 开发了利用细胞簇标签作为先验信息的监督式线性降维技术，能最大化簇间方差并改善轨迹推断效果 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的轨迹推断分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 监督式线性降维 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 582 | 2025-10-06 |
CagA-dependent Hobit+ gastric tissue-resident memory T cells confer full protection from Helicobacter pylori reinfection
2025-Jun-05, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-334781
PMID:40473399
|
研究论文 | 本研究揭示了Hobit+胃组织驻留记忆T细胞在幽门螺杆菌再感染中提供完全保护的机制 | 首次发现转录因子Hobit调控胃TRM细胞的诱导和发育，且该过程依赖幽门螺杆菌毒力因子CagA | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究幽门螺杆菌感染期间胃组织驻留记忆T细胞的诱导、发育和功能 | 小鼠和人类的胃幽门螺杆菌特异性TRM细胞 | 免疫学 | 幽门螺杆菌感染 | 流式细胞术, 免疫组织化学, 免疫荧光, ChipCytometry染色, 单细胞RNA测序 | NA | 细胞表型数据, 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 小鼠模型和人类样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 583 | 2025-10-06 |
Therapeutic potential of tumor-associated neutrophils: dual role and phenotypic plasticity
2025-Jun-04, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02242-7
PMID:40461514
|
综述 | 本文总结了肿瘤相关中性粒细胞（TANs）在肿瘤微环境中的双重作用、表型可塑性及其治疗潜力 | 系统阐述了TANs通过单细胞RNA测序分析鉴定的亚型及其表型转换机制，并聚焦于TANs靶向治疗的最新策略 | NA | 探讨肿瘤相关中性粒细胞在肿瘤发生发展中的双重作用及其免疫治疗潜力 | 肿瘤相关中性粒细胞（TANs）及其与肿瘤微环境的相互作用 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 584 | 2025-10-06 |
Identify the co-expressed genes of hypertensive nephropathy and diabetic nephropathy
2025-Jun-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-04679-w
PMID:40461634
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析识别高血压肾病和糖尿病肾病的共同表达基因及潜在治疗靶点 | 首次系统识别HN和DN的42个共享差异表达基因，并通过单细胞测序分析发现TNFSF10和NR4A1在两种肾病细胞中高表达 | 研究基于公共数据库的样本数据，缺乏实验验证 | 探索高血压肾病和糖尿病肾病在分子和病理机制上的内在联系 | 高血压肾病和糖尿病肾病的基因表达数据 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | 基因表达分析,GO/KEGG富集分析,GSEA分析,PPI网络分析,单细胞测序分析,分子对接模拟 | NA | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的四个数据集：GSE37460、GSE142153（训练集）、GSE37455、GSE30529（验证集） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 585 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal and single-cell atlases to dissect regional specific cell types of the developing ovary
2025-Jun-03, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08277-4
PMID:40461746
|
研究论文 | 结合空间转录组学和单细胞RNA测序构建从胎儿期到成年期卵巢的时空发育图谱 | 首次整合空间转录组学和单细胞RNA测序揭示卵巢发育过程中的区域特异性细胞类型分布 | NA | 解析卵巢发育过程中细胞异质性和区域特异性 | 从胎儿期到成年期的卵巢组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 586 | 2025-10-06 |
Pericytes in castration-resistant prostate cancer associated with disease progression and immunotherapy response: insights from single-cell analysis
2025-Jun-03, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03838-3
PMID:40462105
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示周细胞在去势抵抗性前列腺癌中的关键作用及其与免疫治疗反应的关系 | 首次在单细胞水平鉴定出CRPC特异性周细胞亚群，发现其通过PDGF信号通路促进肿瘤进展并抑制抗肿瘤免疫 | 研究主要基于临床样本分析和小鼠模型验证，需要进一步的功能实验确认机制 | 解析周细胞在去势抵抗性前列腺癌中的生物学功能及其与肿瘤微环境的相互作用 | 前列腺癌组织样本、小鼠RM-1皮下肿瘤模型 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组测序、免疫荧光染色、RNA-seq、微阵列分析 | NA | 单细胞转录组数据、批量RNA-seq数据、微阵列数据、图像数据 | 多个前列腺癌临床数据集和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 587 | 2025-10-06 |
DeepGFT: identifying spatial domains in spatial transcriptomics of complex and 3D tissue using deep learning and graph Fourier transform
2025-Jun-03, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03631-5
PMID:40462157
|
研究论文 | 提出一种结合深度学习和图傅里叶变换的空间转录组学分析方法DeepGFT，用于识别复杂组织和3D组织的空间结构域 | 首次将深度学习与图傅里叶变换相结合，同时建模位点间和基因间关系，实现更准确的空间结构域识别 | NA | 开发空间转录组数据分析方法以准确识别组织空间结构域 | 人类乳腺癌组织、人类淋巴结组织、3D果蝇发育数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间分辨转录组学 | 深度学习 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 588 | 2025-10-06 |
PDE3B and HBB are key prognostic biomarkers driving cell proliferation and regulating immune microenvironment in breast cancer
2025-Jun-03, Hereditas
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s41065-025-00470-z
PMID:40462176
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和TCGA数据分析，发现PDE3B和HBB是乳腺癌的关键预后生物标志物，驱动细胞增殖并调节免疫微环境 | 首次在单细胞水平识别恶性细胞亚群类型3的高增殖潜力，并确定PDE3B和HBB作为乳腺癌预后和免疫调节的关键驱动因子 | 研究主要基于MDA-MB-231细胞系验证，需要在更多乳腺癌细胞模型和临床样本中进一步验证 | 探索PDE3B和HBB在乳腺癌中的预后价值和功能作用，特别是对细胞增殖和免疫微环境调节的贡献 | 乳腺癌细胞、单细胞RNA测序数据、TCGA数据库、MDA-MB-231细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 免疫组织化学, Western blot, 增殖实验 | LASSO回归, Kaplan-Meier生存分析, EPIC反卷积 | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 临床生存数据 | TCGA数据库乳腺癌样本和单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 589 | 2025-10-06 |
Transcriptional analysis of metastatic hormone-naïve prostate cancer primary tumor biopsies reveals a relevant role for SOX11 in prostate cancer cell dissemination
2025-Jun-03, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03623-5
PMID:40462200
|
研究论文 | 首次对转移性激素初治前列腺癌原发肿瘤进行转录组学表征，发现SOX11在肿瘤细胞转移中的关键作用 | 首次提供mHNPC原发肿瘤的全面转录组学特征，发现SOX11在触发异型通讯和转移特性获得中的核心作用 | NA | 探索转移性激素初治前列腺癌的分子特征和转移机制 | 转移性激素初治前列腺癌患者的原发肿瘤标本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 590 | 2025-10-06 |
Emerging technologies of single-cell multi-omics
2025-Jun-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2022.282557
PMID:39911109
|
综述 | 本文概述了单细胞多组学技术的发展历程、原理及其在造血系统研究中的应用 | 系统梳理了单细胞多组学技术从概念到高通量平台的发展历程，强调其在解析分子生物学中心法则各层面关系中的独特价值 | NA | 指导研究人员根据具体科学问题选择最合适的单细胞多组学技术平台 | 造血系统（包括正常和恶性状态）的细胞群体 | 分子生物学 | 血液系统恶性肿瘤 | 单细胞测序，单细胞多组学技术 | NA | 基因组学，转录组学，表观基因组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 591 | 2025-10-06 |
scDMSC: Deep Multi-View Subspace Clustering for Single-Cell Multi-Omics Data
2025-Jun, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3532784
PMID:40031269
|
研究论文 | 提出一种基于深度多视图子空间学习的单细胞多组学数据无监督聚类算法 | 通过加权重构协调组学数据的异质性，并利用深度子空间学习识别共享潜在特征 | NA | 开发单细胞多组学数据的聚类分析方法 | 单细胞多组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞多组学测序 | 深度多视图子空间学习 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 592 | 2025-10-06 |
Consensus nonnegative matrix factorization reveals metastatic gene expression program and identifies E74-like ETS transcription factor 3 confers to the lymph nodes metastasis in papillary thyroid cancer
2025-Jun, Endocrine
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s12020-025-04205-y
PMID:40048012
|
研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，利用共识非负矩阵分解识别甲状腺乳头状癌中的基因表达程序，发现ELF3基因驱动淋巴结转移 | 首次应用共识非负矩阵分解方法识别甲状腺乳头状癌中的EMT相关基因表达程序，并发现ELF3作为关键驱动基因 | 研究样本量有限，需要在更大队列中验证发现 | 探索甲状腺乳头状癌的转录异质性及其与淋巴结转移的关系 | 甲状腺乳头状癌恶性细胞 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 机器学习, 体外功能验证, 药物筛选 | 共识非负矩阵 factorization, 机器学习框架 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 593 | 2025-10-06 |
Molecular Mechanisms of Intervertebral Disc Degeneration: Significance of SPARC Gene Expression
2025-Jun-01, Journal of musculoskeletal & neuronal interactions
IF:1.7Q4
PMID:40452200
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和体外实验探讨SPARC基因在椎间盘退变中的作用 | 结合单细胞测序数据和体外实验验证SPARC基因在椎间盘退变中的表达变化及其功能 | NA | 探索SPARC基因在椎间盘退变发病机制中的作用 | 髓核细胞 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 单细胞测序, RT-qPCR, Western blot, 免疫荧光, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 594 | 2025-10-06 |
CXCL10highTNFαhighKi67+ Microglia Recruit and Activate CD8+ T Cells in the Brainstem During Experimental Cerebral Malaria
2025-Jun, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70425
PMID:40457525
|
研究论文 | 本研究通过实验性脑疟疾模型鉴定了一种新型小胶质细胞亚型，并揭示了其通过CXCL10和TNFα介导CD8+ T细胞在脑干中募集和持续激活的机制 | 首次识别出CXCL10highTNFαhighKi67+小胶质细胞亚型，并阐明其在脑疟疾神经炎症中调控CD8+ T细胞活化的新机制 | 研究基于小鼠实验性脑疟疾模型，结果向人类疾病的转化需进一步验证 | 探究实验性脑疟疾中小胶质细胞的异质性及其在CD8+ T细胞募集和激活中的作用 | C57BL/6J小鼠、小胶质细胞、CD8+ T细胞 | 神经免疫学 | 脑疟疾 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、电子显微镜、transwell实验、粘附实验、细胞毒性测试 | NA | 基因表达数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 595 | 2025-10-06 |
Intrinsic immunosuppressive features of monocytes suppress CAR-T19 through IL-1 pathway modulation in mantle cell lymphoma
2025-Jun-18, Molecular therapy. Oncology
DOI:10.1016/j.omton.2025.200985
PMID:40458688
|
研究论文 | 本研究揭示了单核细胞通过IL-1通路调控抑制CAR-T19在套细胞淋巴瘤中的疗效机制 | 首次发现M2样巨噬细胞来源的IL-1ra通过抑制IL-1信号通路削弱CAR-T19功能 | 主要基于临床前模型，需进一步临床验证 | 探究CAR-T19在套细胞淋巴瘤中疗效受限的免疫抑制机制 | 套细胞淋巴瘤患者样本、CAR-T19产品、髓系细胞 | 肿瘤免疫学 | 套细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | 临床前模型 | 基因表达数据、临床样本数据 | ZUMA-2临床试验样本及临床前模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 596 | 2025-10-06 |
Sustained macrophage reprogramming is required for CD8+ T cell-dependent long-term tumor eradication
2025-Jun-05, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0797
PMID:40471151
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研究论文 | 本研究揭示了通过重复TLR3和CD40激动剂联合治疗可维持肿瘤相关巨噬细胞的抗肿瘤表型，从而实现CD8+ T细胞依赖的长期肿瘤消除 | 首次发现肿瘤相关巨噬细胞重编程具有瞬时性特征，并通过重复给药策略克服这一局限性 | 研究基于小鼠乳腺癌模型，临床转化效果需进一步验证 | 探究肿瘤相关巨噬细胞功能状态及其在抗肿瘤免疫中的作用机制 | 小鼠乳腺癌模型中的肿瘤相关巨噬细胞和CD8+ T细胞 | 免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同肿瘤阶段和治疗后时间点的肿瘤相关巨噬细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 597 | 2025-10-06 |
Therapeutic B cell depletion identifies immunoregulatory networks
2025-Jun-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI189442
PMID:40454471
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研究论文 | 本研究通过B细胞耗竭疗法揭示了多发性硬化症中的免疫调节网络 | 首次在单细胞水平系统分析B细胞耗竭对免疫系统的全面影响，发现抗炎性脑脊液巨噬细胞增加和外周CD16+单核细胞TNF-α表达升高等新机制 | NA | 探索B细胞耗竭疗法在多发性硬化症中的免疫调节机制 | 多发性硬化症患者的免疫细胞 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 598 | 2025-10-06 |
Divergent combinations of enhancers encode spatial gene expression
2025-Jun-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60482-1
PMID:40456823
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研究论文 | 开发eSpatial计算框架，通过整合基因表达和染色质可及性的空间图谱，解析增强子对空间基因表达的调控机制 | 提出“空间增强子编码”概念，揭示不同增强子组合在空间隔离区域调控同一基因的表达模式 | NA | 探索增强子如何调控空间基因表达模式 | 小鼠胚胎和大脑，人类黑色素瘤和乳腺癌组织 | 空间转录组学 | 黑色素瘤，乳腺癌 | 空间转录组学，空间表观基因组学，原位杂交，MERFISH，转基因报告实验，CRISPR/Cas9基因编辑 | 计算框架(eSpatial) | 空间基因表达数据，染色质可及性数据 | 多种生物样本（小鼠胚胎、大脑，人类肿瘤组织） | NA | 空间转录组学，空间表观基因组学，MERFISH | NA | NA |
| 599 | 2025-10-06 |
SC2Spa: a deep learning based approach to map transcriptome to spatial origins at cellular resolution
2025-Jun-02, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06173-6
PMID:40457183
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研究论文 | 提出了一种基于深度学习的SC2Spa方法，能够将转录组数据映射到细胞分辨率的空间位置 | 开发了能够从空间转录组数据学习复杂空间关系的深度学习模型，能够识别传统方法无法发现的空间变异基因 | NA | 解决细胞在组织中空间位置映射的挑战，理解细胞异质性 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 深度学习 | 转录组数据，空间坐标数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | Visium | Visium检测技术 |
| 600 | 2025-10-06 |
Multi-omics unveils BCAA metabolism markers L-leucine and HMGCS1 as prognostic marker for immunotherapy efficacy in non-small cell lung cancer
2025-Jun-02, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03277-8
PMID:40457349
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了支链氨基酸代谢标志物L-亮氨酸和HMGCS1作为非小细胞肺癌免疫治疗疗效的预后标志物 | 首次将血浆BCAA代谢物与基因特征结合构建预后风险模型，并在多个癌种和平台验证HMGCS1的独立预后价值 | 样本量相对有限，部分验证队列样本数较少，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 识别能够增强非小细胞肺癌免疫治疗预后评估的BCAA血浆代谢物和基因特征 | 非小细胞肺癌患者、黑色素瘤患者、泛癌种免疫检查点抑制剂治疗队列、弥漫大B细胞淋巴瘤患者 | 多组学分析 | 非小细胞肺癌, 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 非靶向UPLC-MS/MS, 多重免疫荧光, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学 | 预后风险模型, Kaplan-Meier分析, ROC曲线分析 | 代谢组数据, 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据, 蛋白质表达数据 | 多个队列总计超过1000例样本，包括NSCLC(94+40+274+176+196+16+27+24+339)、黑色素瘤(25)、泛癌种(330+81)、DLBCL(10+39)等 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 代谢组学 | NA | 非靶向UPLC-MS/MS用于血浆代谢物检测，多重免疫荧光用于免疫细胞浸润验证 |