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当前共找到 717 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-05-23 |
C5a/C5aR pathway blocking promoted CuS-mediated cancer therapy effect by inhibiting cuproptosis resistance
2025-Jun-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011472
PMID:40484643
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研究论文 | 本研究揭示了C5a/C5aR通路通过上调ATP7B表达介导铜死亡抵抗，并证明联合CuS纳米颗粒和C5a受体拮抗剂可显著增强抗肿瘤疗效 | 首次阐明C5a/C5aR通路通过Wnt/β-catenin信号上调ATP7B表达介导铜死亡抵抗，并提出CuS纳米颗粒联合C5aRA的协同治疗策略（整合铜死亡靶向、免疫治疗和光热治疗） | NA | 探究C5a/C5aR通路在铜死亡抵抗中的作用机制，并评估联合CuS纳米颗粒和C5aRA的癌症治疗疗效 | 乳腺癌细胞系、异种移植小鼠模型 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、RNA测序、生物信息学分析、免疫组化、ELISA | NA | 文本 | NA | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 单细胞RNA测序使用10x Chromium平台，批量RNA测序使用Illumina NovaSeq测序仪 |
| 42 | 2026-05-23 |
Characterization of the recombination activity in the pituitary and ovary of Prop1-iCre knockin mice
2025-06-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
DOI:10.1152/ajpendo.00049.2025
PMID:40327412
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研究论文 | 该论文描述了Prop1-iCre敲入小鼠在垂体和卵巢中的重组活性，为垂体内分泌细胞基因操作提供了有效工具，并提醒注意其在卵巢中的活性 | 通过CRISPR/Cas9系统生成Prop1-iCre敲入小鼠，实现Prop1与Cre重组酶的双顺反子表达，表现出在垂体内分泌细胞中稳健且特异的重组活性，无外位活性，同时意外发现卵巢颗粒细胞中的活性 | 未明确讨论该模型在其他组织中的潜在活性，且需进一步验证其在不同背景下的重复性和长期稳定性 | 评估Prop1-iCre敲入小鼠在垂体和卵巢中的Cre重组活性，为垂体生物学研究提供更可靠的基因操作工具 | Prop1-iCre敲入小鼠及其与Rosa-tdTomato报告品系杂交产生的后代，包括垂体和卵巢组织 | 数字病理学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 图像 | 上述小鼠品系的多个个体样本，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 43 | 2026-05-23 |
Characterization of ROMK cellular heterogeneity along the mouse kidney thick ascending limb
2025-06, Pflugers Archiv : European journal of physiology
DOI:10.1007/s00424-025-03086-4
PMID:40358700
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研究论文 | 该研究结合RNAscope原位杂交、迭代间接免疫荧光成像和机器学习技术，揭示了小鼠肾脏髓质升支粗段（TAL）中ROMK通道的细胞异质性，发现顶膜ROMK蛋白分布与不同的TAL细胞类型相关 | 首次证明虽然ROMK mRNA在TAL所有细胞中普遍表达，但顶膜ROMK蛋白分布具有细胞异质性，且与特定的分子标记（Ptger3、Foxq1）和紧密连接蛋白（Claudin-10b、Claudin-16/19）表达模式对齐，揭示了TAL功能异质性的分子基础 | 未提供具体局限性信息 | 探究ROMK通道在小鼠肾脏TAL中不同细胞类型的分布规律和分子特征 | 小鼠肾脏TAL细胞 | 数字病理学 | NA | RNAscope原位杂交、迭代间接免疫荧光成像、机器学习 | 机器学习 | 图像 | 灌注固定的小鼠肾脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 44 | 2026-05-22 |
Molecular Mechanisms of Intervertebral Disc Degeneration: Significance of SPARC Gene Expression
2025-06-01, Journal of musculoskeletal & neuronal interactions
IF:1.7Q4
PMID:40452200
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研究论文 | 通过生物信息学分析与体外实验探究SPARC基因在椎间盘退变中的作用 | 首次结合单细胞测序数据与体外实验系统揭示SPARC基因在椎间盘退变中的表达上调及其与COL2A1和ACAN表达变化的相关性 | 未明确提及具体局限性 | 探索SPARC基因在椎间盘退变中的分子机制及治疗靶点潜力 | 椎间盘退变相关的髓核细胞 | 机器学习和生物信息学 | 椎间盘退变 | 单细胞测序、RT-qPCR、Western blot、免疫荧光、免疫组化 | NA | 单细胞测序数据、实验数据 | 来自GEO和CNGBdb数据库的单细胞测序数据及体外实验样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 45 | 2026-05-20 |
High-throughput differentiation of human blood vessel organoids reveals overlapping and distinct functions of the cerebral cavernous malformation proteins
2025-06-06, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-025-09985-5
PMID:40478324
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研究论文 | 通过高通量分化人血管类器官，揭示了脑海绵状畸形蛋白CCM1、CCM2和CCM3在功能上的重叠与差异 | 结合高通量血管类器官分化、CRISPR敲除、单细胞RNA测序和高内涵成像，系统比较了三种CCM基因敲除在细胞类型特异性表达模式和增殖行为上的差异 | NA | 阐明CCM1、CCM2和CCM3突变导致不同临床表型（尤其是CCM3更严重）的分子和细胞机制 | 人诱导多能干细胞分化而来的血管类器官及其中的成纤维细胞、神经细胞、间充质细胞和内皮细胞 | 数字病理学 | 脑海绵状畸形 | 单细胞RNA测序、高内涵成像、CRISPR基因敲除 | NA | 图像、基因表达数据 | 96孔板格式中多次分化的血管类器官；涉及CCM1、CCM2和CCM3敲除及野生型对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 46 | 2026-05-19 |
Uncovering somatic genetic drivers in prostate cancer through comprehensive genome-wide analysis
2025-06, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01623-8
PMID:40156736
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研究论文 | 通过全基因组分析揭示前列腺癌体细胞遗传驱动因素 | 通过整合多组学数据（GTEx、UK Biobank、PRACTICAL、FinnGen、TCGA和单细胞RNA-seq）和孟德尔随机化分析，首次系统性地识别了150个与前列腺癌有因果关联的前列腺特异性基因，并进一步通过多种验证手段锁定MSMB为关键基因 | 仅67个基因在TCGA数据集中与MR分析结果一致，且研究主要基于欧洲人群队列，可能限制了结果的普适性 | 探索散发性前列腺癌的体细胞遗传驱动因素 | 前列腺特异性基因与前列腺癌的遗传关联 | 机器学习 | 前列腺癌 | 全基因组关联研究、孟德尔随机化、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、总结统计数据、单细胞转录组数据 | UK Biobank: 9131例病例和173493例对照; PRACTICAL: 79148例病例和61106例对照; FinnGen: 13216例病例和119948例对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 47 | 2026-05-18 |
Single-cell RNA sequencing-derived signatures define response patterns to atezolizumab + bevacizumab in advanced hepatocellular carcinoma
2025-06, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.12.016
PMID:39709141
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术揭示阿替利珠单抗联合贝伐珠单抗在晚期肝细胞癌中的反应模式 | 首次从单细胞层面解析晚期肝细胞癌对阿替利珠单抗+贝伐珠单抗治疗的两种不同反应模式（免疫胜任型和血管生成驱动型），并鉴定出原发性耐药的关键细胞和通路特征 | 样本量有限（共422例），且主要基于转录组数据，缺乏蛋白层面验证；需要更大规模前瞻性研究进一步验证分子分型的临床指导价值 | 阐明晚期肝细胞癌对阿替利珠单抗联合贝伐珠单抗治疗产生临床获益或耐药的潜在细胞和分子机制 | 接受阿替利珠单抗+贝伐珠单抗治疗的晚期肝细胞癌患者（317例），以及阿替利珠单抗（47例）或索拉非尼（58例）治疗的对照组患者 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 422例晚期肝细胞癌患者的RNA测序样本（包括317例联合治疗组、47例阿替利珠单抗组、58例索拉非尼组）及单细胞RNA测序数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 48 | 2026-05-16 |
A statistical framework for inferring genetic requirements from embryo-scale single-cell sequencing experiments
2025-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.03.646654
PMID:40236139
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研究论文 | 提出从胚胎尺度单细胞测序实验中推断遗传需求的统计框架 | 开发了Hooke和Platt两种软件工具，利用单细胞数据集中的统计模式来表征实验干预的直接分子和细胞后果 | NA | 建立统计框架以识别直接受遗传、化学或环境扰动影响的基因和细胞类型 | 斑马鱼胚胎的单细胞图谱 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 数千个扰动斑马鱼胚胎 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 49 | 2026-05-16 |
Oncogenic and tumor-suppressive forces converge on a progenitor-orchestrated niche to shape early tumorigenesis
2025-Jun-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.656791
PMID:40661354
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研究论文 | 整合谱系追踪、单细胞和空间转录组学，揭示胰腺导管腺癌起始过程中祖细胞样细胞协调的微环境如何汇聚致癌和抑癌力量，塑造早期肿瘤发生 | 首次通过多组学整合方法识别出祖细胞样群体作为致癌突变、可塑性和组织重塑的汇聚点，并揭示KRAS抑制与p53抑制对肿瘤起始微环境的相反调控作用 | 主要基于小鼠模型，其结果在人类胰腺导管腺癌中的直接适用性需进一步验证；研究聚焦于肿瘤起始阶段，对后续恶性进展的机制阐述有限 | 阐明良性向恶性转化过程中分子、细胞和组织水平事件如何促进或抑制恶性肿瘤形成的机制 | 胰腺导管腺癌小鼠模型中的Kras突变细胞、祖细胞样细胞及肿瘤微环境 | 机器学期 | 胰腺导管腺癌 | 谱系追踪, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据, 谱系追踪数据 | 涉及多时间点、多基因型的小鼠胰腺组织样本（具体数量未在摘要中说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium (用于单细胞测序), 10x Visium (用于空间转录组学) | 利用10x Chromium进行单细胞RNA测序分析，并使用10x Visium进行空间转录组分析 |
| 50 | 2026-05-16 |
Substrate stiffness dictates unique doxorubicin-induced senescence-associated secretory phenotypes and transcriptomic signatures in human pulmonary fibroblasts
2025-06, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01507-x
PMID:39826027
|
研究论文 | 探究基质刚度如何影响人肺成纤维细胞中阿霉素诱导的衰老相关分泌表型和转录组特征 | 首次揭示了机械张力（通过底物刚度模拟）对衰老相关分泌表型和转录组特征的影响，特别是在高刚度条件下发现独特的胶原蛋白富集特征 | 研究主要基于体外细胞培养模型，体内验证仅限于小鼠模型和公共数据集分析，缺乏更直接的临床样本验证 | 研究机械环境对细胞衰老和衰老相关分泌表型的影响 | 人原代肺成纤维细胞（IMR-90细胞） | 机器学习 | 肺纤维化 | 质谱分析、转录组测序、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 不同刚度底物上培养的IMR-90细胞样本；博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型组织样本；人间质性肺疾病的单细胞RNA测序公共数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2026-05-16 |
A multi-omic single-cell landscape of the aging mouse ovary
2025-06, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01556-2
PMID:39934558
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研究论文 | 结合小鼠年轻和年老卵巢的单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据，构建了卵巢老化的多组学单细胞图谱，揭示了细胞类型特异的转录变化及其调控元件 | 首次结合单细胞转录组和染色质可及性数据，全面表征小鼠卵巢老化过程中七种主要细胞类型的分子特征，并鉴定调控这些转录变化的顺式和反式调控元件 | NA | 研究卵巢老化的分子机制，特别是细胞类型特异的转录变化及其调控元件 | 年轻和年老小鼠的卵巢细胞 | 单细胞组学 | 卵巢老化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 小鼠年轻和年老卵巢样本 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 52 | 2026-05-16 |
Transcriptomic profiling of senescence effects on blood-brain barrier-related gene expression in brain capillary endothelial cells in a mouse model of paclitaxel-induced chemobrain
2025-06, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01561-5
PMID:39976844
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析紫杉醇诱导的脑毛细血管内皮细胞衰老对血脑屏障相关基因表达的影响 | 首次在单细胞水平揭示紫杉醇诱导的脑毛细血管内皮细胞衰老通过转录组改变（如下调细胞连接组装通路、上调细胞外基质重塑和炎症信号通路）导致血脑屏障功能障碍的机制 | 研究基于小鼠模型，可能需要进一步验证在人类中的适用性 | 探究紫杉醇诱导的内皮细胞衰老如何改变与血脑屏障完整性相关的基因表达模式 | 紫杉醇处理小鼠与对照组小鼠的脑毛细血管内皮细胞 | 数字病理学 | 化疗引起的认知障碍（化学脑） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 紫杉醇处理组和对照组小鼠脑组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2026-05-16 |
Machine Learning and Mendelian Randomization Reveal a Tumor Immune Cell Profile for Predicting Bladder Cancer Risk and Immunotherapy Outcomes
2025-06, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.01.016
PMID:40122457
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研究论文 | 利用肿瘤浸润免疫细胞相关基因构建模型，预测膀胱癌风险和免疫治疗效果 | 首次结合20种机器学习算法与孟德尔随机化方法，基于肿瘤浸润免疫细胞特征评分构建膀胱癌预后及免疫治疗预测模型 | 未提及明确局限性 | 开发基于肿瘤浸润免疫细胞的膀胱癌预测模型 | 膀胱癌患者 | 机器学习 | 膀胱癌 | RNA-seq, scRNA-seq | 机器学习集成模型（20种算法） | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | 多组RNA表达数据和单细胞RNA数据（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 54 | 2025-05-22 |
Corrigendum to "Deciphering the cell type-specific and zonal distribution of drug-metabolizing enzymes, transporters, and transcription factors in livers of mice using single-cell transcriptomics"
2025-Jun, Drug metabolism and disposition: the biological fate of chemicals
DOI:10.1016/j.dmd.2025.100088
PMID:40393347
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2026-05-15 |
Chikungunya virus persists in joint-associated macrophages and promotes chronic disease
2025-Jun-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6917990/v1
PMID:40678223
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序、空间转录组学和流式细胞术探究基孔肯雅病毒在小鼠关节相关组织中的持续存在及其对慢性疾病的促进作用 | 首次揭示了基孔肯雅病毒RNA在关节相关巨噬细胞中持续复制并驱动慢性关节炎症的机制，通过CD4 T细胞与巨噬细胞的相互作用阐明了慢性疾病的免疫病理学基础 | 研究主要基于小鼠模型，结果向人类疾病的转化仍需进一步验证；未详细说明病毒RNA复制的具体分子机制 | 阐明甲病毒（如基孔肯雅病毒）引起慢性肌肉骨骼疼痛和炎症的持久化机制 | 感染基孔肯雅病毒或其他甲病毒的小鼠关节相关组织 | 数字病理学 | 基孔肯雅病毒病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 序列数据 | 小鼠关节相关组织样本（具体数量未在摘要中提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞转录组平台和10x Visium空间转录组平台 |
| 56 | 2026-05-15 |
QCatch: A framework for quality control assessment and analysis of single-cell sequencing data
2025-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.15.659779
PMID:40667252
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研究论文 | 介绍QCatch，一个用于单细胞测序数据质量控制评估和生成的Python命令行工具 | 专门针对alevin-fry和simpleaf输出设计，生成交互式HTML质量控制报告，并以内附带注释的H5AD格式导出结果 | 未提及具体局限性 | 为单细胞测序数据提供标准化质量控制报告功能 | 单细胞测序数据 | 机器学习和生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 57 | 2026-05-12 |
Association of Obesity and Innate Immune Markers With Resistance to Biologic Therapy in Psoriasis
2025-Jun-01, JAMA dermatology
IF:11.5Q1
DOI:10.1001/jamadermatol.2025.0288
PMID:40172874
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研究论文 | 肥胖和先天免疫标志物与银屑病生物制剂治疗抵抗的关联 | 通过空间转录组学揭示了表皮先天免疫信号和中性粒细胞活性升高与生物制剂治疗反应持久性降低的关联 | 样本量相对较小（87例患者），且为单中心横断面研究 | 阐明影响重度银屑病患者对生物制剂持续治疗反应的炎症微环境因素 | 18岁以上重度银屑病患者 | 生物信息学 | 银屑病 | 空间转录组学 | NA | 组织切片 | 87例患者（平均年龄42.2岁，24例女性，63例男性） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 58 | 2026-05-08 |
TFcomb identifies transcription factor combinations for cellular reprogramming based on single-cell multiomics data
2025-06-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279955.124
PMID:40210438
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研究论文 | 提出了TFcomb，一种利用单细胞多组学数据识别重编程转录因子及其组合的计算方法 | 首次将重编程转录因子及其组合的识别建模为逆问题，并利用Tikhonov正则化保证泛化能力；设计图注意力网络增强基因调控网络 | 未提及具体限制 | 开发能够从单细胞多组学数据中识别重编程转录因子及其组合的计算方法 | 人类胚胎干细胞、小鼠毛囊发育数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | 图注意力网络 | 单细胞多组学数据 | 人类胚胎干细胞数据集，小鼠毛囊发育数据集 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 59 | 2026-05-08 |
Dissecting multilayer cell-cell communications with signaling feedback loops from spatial transcriptomics data
2025-06-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279857.124
PMID:40262896
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研究论文 | 提出stMLnet方法，从空间转录组数据中解析多层细胞间通讯及信号反馈环路 | 首次整合空间信息和多层信号调控机制，通过扩散和质量作用模型量化空间依赖的配体-受体信号活动，并映射到细胞内靶点，识别多层CCC中的信号反馈环路 | 未提及 | 开发从空间转录组数据推断功能细胞间通讯的方法，揭示多层信号反馈环路 | 动物模型与人类组织样本 | 机器学习 | COVID-19炎症反应 | 空间转录组学（ST） | 扩散模型、质量作用模型 | 空间基因表达数据 | 多种空间转录组数据集（seqFISH+、Slide-seq v2、MERFISH、Stereo-seq） | NA | 空间转录组学 | seqFISH+, Slide-seq v2, MERFISH, Stereo-seq | 包括不同空间分辨率和基因覆盖度的空间转录组技术平台 |
| 60 | 2026-05-08 |
STCC enhances spatial domain detection through consensus clustering of spatial transcriptomics data
2025-06-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280031.124
PMID:40355284
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研究论文 | 提出STCC共识聚类框架，整合多种空间域检测工具以提高空间转录组数据分析的准确性和稳定性 | 首次将共识策略系统性应用于空间转录组数据的空间域检测，提出四种共识策略（独热编码、平均、超图、加权非负矩阵分解）并综合评估其性能 | 对正常组织和肿瘤样本的分析表现存在差异；共识策略的选择需根据样本特征进行调整 | 开发一种可扩展且实用的空间域检测方法，通过共识聚类提升空间转录组数据聚类结果的准确性和鲁棒性 | 空间转录组数据（包含模拟数据和真实数据） | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 共识聚类 | 基因表达数据 | 模拟数据和来自不同实验平台的真实数据 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |