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当前共找到 721 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-04-23 |
A pre-menopausal single-cell atlas for ovarian drug discovery
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.20.660779
PMID:40666883
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研究论文 | 本研究构建了一个绝经前女性的单细胞图谱（PreMeno Atlas），用于卵巢生物学研究和药物靶点发现 | 首次创建了专注于绝经前女性的多组织单细胞图谱，并系统比较了卵巢细胞类型的转录组特征，识别了潜在的卵巢特异性药物靶点 | 样本来源和数量可能有限，未涵盖所有绝经前年龄段或病理状态 | 构建绝经前女性单细胞图谱以促进卵巢生物学理解和药物靶点发现 | 绝经前女性的卵巢及其他13种组织 | 单细胞组学 | 生育管理 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 511,365个细胞，来自14种组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 42 | 2026-04-21 |
Single-cell transcriptomics reveal how root tissues adapt to soil stress
2025-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08941-z
PMID:40307555
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学方法，揭示了水稻根部组织如何通过细胞特异性转录响应适应土壤压力 | 首次在单细胞分辨率下展示了根部组织如何响应土壤异质性和压实压力，并识别了由韧皮部细胞释放的脱落酸调控的细胞壁重塑和屏障形成机制 | 研究主要基于水稻模型，可能无法完全代表其他植物物种的响应机制 | 探究根部组织在单细胞尺度上如何适应不同土壤条件和压力 | 水稻根部细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 43 | 2026-04-20 |
Consensus nonnegative matrix factorization reveals metastatic gene expression program and identifies E74-like ETS transcription factor 3 confers to the lymph nodes metastasis in papillary thyroid cancer
2025-06, Endocrine
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s12020-025-04205-y
PMID:40048012
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，通过共识非负矩阵分解揭示甲状腺乳头状癌中的基因表达程序，并识别ELF3在淋巴结转移中的关键作用 | 采用共识非负矩阵分解方法识别与淋巴结转移相关的EMT基因表达程序，并首次将ELF3确立为BRAF突变型PTC中驱动肿瘤侵袭和血管生成的核心基因 | 研究主要基于转录组数据，缺乏体内动物模型验证，且样本量可能有限，未涵盖所有PTC亚型 | 探究甲状腺乳头状癌的转录异质性，识别驱动淋巴结转移的基因表达程序和关键分子标记 | 甲状腺乳头状癌患者的恶性细胞 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 共识非负矩阵分解, 机器学习框架 | RNA测序数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 44 | 2026-04-19 |
Peripheral blood neutrophils contribute to Claudin18.2-specific CAR-T cell treatment resistance in advanced gastric cancer
2025-Jun, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03015-3
PMID:40246985
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研究论文 | 本研究探讨了外周血中性粒细胞在晚期胃癌患者接受Claudin18.2特异性CAR-T细胞治疗中导致耐药的作用 | 首次将中性粒细胞与淋巴细胞比值（NLR）与CLDN18.2特异性CAR-T细胞治疗的预后联系起来，并通过单细胞RNA测序鉴定出与疾病进展相关的循环中性粒细胞亚群（NE-3）及其促肿瘤机制 | 需要进一步验证，并探索减轻中性粒细胞诱导的免疫抑制的策略 | 研究CLDN18.2特异性CAR-T细胞治疗在晚期胃癌中疗效差异的机制，特别是中性粒细胞介导的耐药作用 | 接受CLDN18.2特异性CAR-T细胞治疗的晚期胃癌患者及其外周血样本 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据，单细胞RNA测序数据 | 未明确指定患者数量，但涉及接受CAR-T治疗的胃癌患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2026-04-18 |
Sequence Diversity and Encoded Enzymatic Differences of Monocistronic L1 ORF2 mRNA Variants in the Aged Normal and Alzheimer's Disease Brain
2025-06-18, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.2298-24.2025
PMID:40368603
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研究论文 | 本研究通过酶功能测定、靶向PacBio HiFi长读长测序和定量空间转录组学，评估了31个阿尔茨海默病和正常大脑皮层样本中的内源性逆转录酶活性和L1 mRNA多样性 | 首次在人类大脑中鉴定出超过550种编码蛋白质的单顺反子ORF2序列变体，其数量是参考基因组的两倍多，并揭示了这些变体在逆转录酶和核酸内切酶活性上的功能差异 | 样本量相对较小（31个大脑），且主要关注皮层区域，可能未完全代表大脑其他区域的L1表达和活性 | 探究人类大脑中内源性逆转录酶活性的来源及其在阿尔茨海默病和正常衰老大脑中的差异 | 31个阿尔茨海默病和正常人类大脑的皮层样本 | 基因组学 | 阿尔茨海默病 | 靶向PacBio HiFi长读长测序, 定量空间转录组学, 酶功能测定 | NA | RNA序列数据, 空间转录组数据 | 31个大脑样本（包括阿尔茨海默病和正常个体，两性均有） | PacBio | 长读长测序, 空间转录组学 | PacBio HiFi | 靶向PacBio HiFi长读长测序用于L1 mRNA多样性分析 |
| 46 | 2026-04-17 |
Identification of Immune Hub Genes in Obese Postmenopausal Women Using Microarray and Single-Cell RNA Seq Data
2025-Jun-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16070783
PMID:40725440
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研究论文 | 本研究通过整合微阵列和单细胞RNA测序数据，识别了绝经后肥胖女性脂肪组织中的关键免疫枢纽基因 | 结合WGCNA、PPI网络分析和单细胞RNA测序验证，首次在绝经后肥胖女性中鉴定出与脂肪组织炎症相关的免疫枢纽基因，并揭示了NK细胞在这些基因表达中的重要作用 | 研究样本来源于公共数据库，可能受限于原始数据质量；动物模型验证仅使用斑马鱼，与人类生理存在差异 | 阐明绝经后肥胖女性脂肪组织中免疫失调的分子机制 | 绝经后肥胖女性的脂肪组织 | 生物信息学 | 肥胖症 | 微阵列分析, 单细胞RNA测序, RT-qPCR | WGCNA, PPI网络分析, ssGSEA | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的微阵列数据集GSE151839和单细胞RNA测序数据集GSE176171，以及肥胖和对照斑马鱼模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 47 | 2026-04-17 |
Decoding Cellular Communication Networks and Signaling Pathways in Bone, Skeletal Muscle, and Bone-Muscle Crosstalk Through Spatial Transcriptomics
2025-Jun-12, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6701121/v1
PMID:40585205
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术解码了小鼠股骨和相邻骨骼肌中的细胞间通讯网络和信号通路，首次绘制了骨与骨骼肌之间空间解析的细胞通讯图谱 | 首次应用空间转录组学技术系统性地绘制了骨与骨骼肌之间的空间解析细胞通讯图谱，揭示了13个关键的信号通路和特定的配体-受体对，为理解骨肌互作提供了新的分子见解 | 研究仅基于小鼠模型，样本量有限，且未涵盖所有可能的细胞类型或疾病状态 | 研究骨与骨骼肌之间的细胞通讯网络和信号通路，以理解骨肌互作的分子机制 | 小鼠的股骨和相邻骨骼肌组织 | 空间转录组学 | 骨质疏松症、肌肉减少症、代谢综合征 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium ST profiling |
| 48 | 2026-04-17 |
Radiotherapy promotes cuproptosis and synergizes with cuproptosis inducers to overcome tumor radioresistance
2025-Jun-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.03.031
PMID:40215978
|
研究论文 | 本研究揭示了放疗通过上调铜转运蛋白CTR1、消耗线粒体谷胱甘肽来诱导铜死亡，并发现放疗抵抗与BACH1下调导致的铜螯合蛋白MT1E/X表达升高有关，铜离子载体治疗可增强放疗敏感性 | 首次揭示了放疗诱导铜死亡的机制，并发现铜死亡诱导剂可协同放疗克服肿瘤放疗抵抗 | NA | 阐明放疗诱导铜死亡的机制，并探索通过靶向铜死亡克服肿瘤放疗抵抗的治疗策略 | 食管癌细胞、患者肿瘤样本、细胞系及患者来源的异种移植模型 | NA | 食管癌 | RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 49 | 2026-04-17 |
Machine learning approach to single cell transcriptomic analysis of Sjogren's disease reveals altered activation states of B and T lymphocytes
2025-Jun, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2025.103419
PMID:40318561
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了干燥综合征患者外周血单个核细胞中B细胞和T细胞独特的基因表达模式和异常的激活状态 | 首次在干燥综合征患者中应用单细胞转录组学结合机器学习方法，系统揭示了B细胞和T细胞中独特的基因表达特征和激活状态改变 | 研究样本量未明确说明，且仅分析了外周血单个核细胞，未直接研究唾液腺等靶器官中的免疫细胞 | 探究干燥综合征的发病机制，识别参与疾病过程的细胞类型和功能变化 | 干燥综合征患者和症状性非干燥综合征对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 50 | 2026-04-13 |
EVscope: A Comprehensive Bioinformatics Pipeline for Accurate and Robust Analysis of Total RNA Sequencing from Extracellular Vesicles
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.24.660984
PMID:40666973
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研究论文 | 本文介绍了一个名为EVscope的开源生物信息学流程，专门用于处理细胞外囊泡RNA测序数据，以提高RNA生物标志物和细胞间通信研究的准确性和鲁棒性 | EVscope采用优化的全基因组期望最大化算法，显著提高了单碱基分辨率下的多映射读段分配，并首次生成基于EM的BigWig文件用于下游分析，这是现有工具所不具备的功能 | NA | 开发一个标准化的计算工作流程，以应对细胞外囊泡RNA测序数据分析中的挑战，包括低丰度、片段化及污染问题 | 细胞外囊泡RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 总RNA测序 | 期望最大化算法 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 51 | 2026-04-12 |
Alterations in genomic features and the tumour immune microenvironment predict immunotherapy outcomes in advanced biliary tract cancer patients
2025-Jun, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03011-7
PMID:40211026
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研究论文 | 本研究构建了一个多维策略，用于预测晚期胆道癌患者免疫治疗的预后和反应 | 通过整合基因组特征（如序列熵和突变）与肿瘤免疫微环境（如单细胞转录组数据中的细胞通讯分析），开发了集成模型EM-CXCL10，其预测性能优于传统指标如肿瘤突变负荷 | 样本量相对较小（60名患者），且部分分析基于公共单细胞数据集（GSE125449），可能限制模型的泛化能力 | 预测晚期胆道癌患者对免疫治疗（抗PD-1）的反应和预后，以指导个性化临床决策 | 晚期胆道癌患者 | 机器学习 | 胆道癌 | 520基因面板测序、多重循环细胞因子检测、单细胞转录组测序 | LASSO算法、Cox回归 | 基因组序列数据、细胞因子数据、单细胞转录组数据 | 60名晚期胆道癌患者，其中30名进行基因面板测序，50名进行细胞因子检测 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 52 | 2026-04-09 |
Guanylate-Binding Proteins Promote Host Defense Against Leishmania major by Balancing iNOS/Arg-1 in Myeloid Cells
2025-Jun-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.26.661809
PMID:40631203
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研究论文 | 本文探讨了鸟苷酸结合蛋白在宿主防御利什曼原虫感染中的作用，通过平衡骨髓细胞中的iNOS/Arg-1表达来促进寄生虫控制 | 首次揭示了GBPs在皮肤利什曼病中的关键作用，通过调节iNOS和Arg-1的表达平衡来影响寄生虫生长环境，独立于GBPs的寄生虫定位 | 研究主要基于小鼠模型，未在人类样本中验证；体外实验可能无法完全模拟体内复杂免疫环境 | 探究GBPs在皮肤利什曼病免疫防御机制中的具体作用 | C57Bl/6小鼠、GBPChr3敲除小鼠的骨髓来源巨噬细胞和单核细胞 | 免疫学 | 皮肤利什曼病 | RNA-Seq、单细胞RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | C57Bl/6小鼠和GBPChr3敲除小鼠的骨髓细胞 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 53 | 2026-04-04 |
Intrinsic immunosuppressive features of monocytes suppress CAR-T19 through IL-1 pathway modulation in mantle cell lymphoma
2025-Jun-18, Molecular therapy. Oncology
DOI:10.1016/j.omton.2025.200985
PMID:40458688
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研究论文 | 本研究揭示了单核细胞通过IL-1通路调节抑制CAR-T19的内在免疫抑制特征，在套细胞淋巴瘤中 | 首次将IL-1受体拮抗剂识别为M2样巨噬细胞抑制CAR-T19的介质，并作为增强CAR-T19疗效的潜在靶点 | 研究主要基于临床前模型和ZUMA-2试验样本，需进一步验证在更广泛患者群体中的适用性 | 探索CAR-T19在套细胞淋巴瘤中失效的机制，并寻找增强其疗效的潜在靶点 | 套细胞淋巴瘤患者、CAR-T19产品、单核细胞和巨噬细胞 | 免疫学 | 套细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、临床样本数据 | ZUMA-2试验的临床样本及临床前模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 54 | 2026-04-02 |
Chromoanagenesis in Osteosarcoma
2025-06-07, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15060833
PMID:40563473
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综述 | 本文综述了染色体灾难性事件（chromoanagenesis）在骨肉瘤中的作用机制及其对肿瘤进展的影响 | 系统阐述了染色体碎裂和染色体再合成等关键机制如何源于复制应激和DNA修复缺陷，并推动骨肉瘤的基因组不稳定性 | 针对骨肉瘤的靶向治疗仍难以实现，且基于染色体灾难性事件的临床转化策略尚处探索阶段 | 阐明染色体灾难性事件在骨肉瘤发生发展中的分子机制，并探索其作为治疗靶点的潜力 | 骨肉瘤（儿童和青少年中最常见的恶性骨肿瘤）及其相关的基因组重排事件 | 基因组学 | 骨肉瘤 | 下一代测序（NGS）、光学基因组图谱、单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 55 | 2026-04-01 |
Cell-Type Annotation for scATAC-Seq Data by Integrating Chromatin Accessibility and Genome Sequence
2025-06-27, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15070938
PMID:40723810
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研究论文 | 提出了一种名为scAttG的新型深度学习框架，通过整合染色质可及性与基因组序列信息，用于scATAC-seq数据的细胞类型注释 | 首次将图注意力网络（GATs）与卷积神经网络（CNNs）相结合，同时利用染色质可及性信号和基因组序列特征，解决了现有跨组学和组内方法在数据对齐与批次效应方面的局限性 | 论文未明确说明模型在跨物种或跨组织类型应用中的泛化能力，也未详细讨论计算资源需求或运行时间效率 | 开发一种更准确、更稳健的单细胞ATAC-seq数据细胞类型注释方法 | 单细胞ATAC-seq数据 | 机器学习 | NA | scATAC-seq | GAT, CNN | 基因组序列, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 56 | 2026-04-01 |
Single cell RNA sequencing shows that cells expressing Sox9 postnatally populate most skeletal lineages in mouse bone
2025-Jun-03, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/jbmr/zjaf043
PMID:40143416
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和谱系追踪，揭示了小鼠骨骼中Sox9表达细胞在出生后对多数骨骼谱系的贡献 | 首次证明出生后骨骼中的多种成骨细胞前体均源自Sox9表达祖细胞，并鉴定了一类位于软骨膜和生长板软骨柱之间的独特软骨细胞亚群 | 研究仅基于小鼠模型，未在人类或其他物种中验证 | 探究小鼠骨骼生长过程中成骨细胞谱系的细胞来源 | 小鼠骨骼中的细胞类型，包括生长板软骨细胞、软骨膜细胞和CXCL12富集的网状骨髓基质细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序，谱系追踪 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 57 | 2026-03-31 |
Podocyte YAP and TAZ hyperactivation drives glomerular epithelial proliferative diseases in mice and humans
2025-Jun-25, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adq3852
PMID:40560997
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研究论文 | 本研究通过免疫染色和空间转录组学分析，揭示了足细胞中YAP和TAZ的异常过度激活是驱动肾小球上皮细胞增殖性疾病的共同机制 | 首次发现足细胞YAP-TAZ过度激活是多种肾小球上皮增殖性疾病的共同驱动因子，为这类疾病提供了统一的致病机制解释 | 研究主要基于小鼠模型和人类活检样本，需要进一步验证在更广泛人群中的普适性 | 探究肾小球上皮细胞增殖性疾病的共同致病机制 | 人类肾活检样本（塌陷性肾小球病和ANCA血管炎诱导的新月体性肾小球肾炎患者）及小鼠模型 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 免疫染色，空间转录组学 | NA | 图像，空间转录组数据 | 人类肾活检样本（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 58 | 2026-03-30 |
Interpretable niche-based cell‒cell communication inference using multi-view graph neural networks
2025-06, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-025-00809-6
PMID:40425827
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研究论文 | 本文介绍了一种基于空间转录组学的细胞间通讯推断工具STCase，利用多视图图神经网络识别细胞类型的生态位并揭示生态位特异性通讯事件 | 提出首个考虑生态位异质性的单细胞/斑点水平细胞间通讯推断方法，通过可解释的多视图图神经网络和CCC感知注意力机制 | NA | 开发能够捕捉生态位特异性细胞间通讯的计算工具 | 人类支气管腺体和口腔鳞状细胞癌组织 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | 多视图图神经网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 59 | 2026-03-28 |
Targeting the Epigenetic Regulator CBX5 Promotes Fibroblast Metabolic Reprogramming and Inhibits Lung Fibrosis
2025-Jun, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0255OC
PMID:39642371
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研究论文 | 本研究揭示了表观遗传调控因子CBX5在肺纤维化过程中通过调控成纤维细胞代谢重编程促进其持续活化的关键作用 | 首次发现CBX5作为连接表观遗传改变与成纤维细胞代谢异常的关键分子，并证明靶向CBX5可协同增强二甲双胍的抗纤维化效果 | 研究主要基于体外细胞模型和动物模型，在人体内的直接治疗效应仍需进一步验证 | 探究表观遗传调控如何影响成纤维细胞代谢重编程从而促进肺纤维化进展 | 特发性肺纤维化（IPF）患者的成纤维细胞、博来霉素诱导的肺损伤模型、IPF肺组织外植体 | 表观遗传学与代谢研究 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、bulk RNA测序、代谢评估 | NA | 基因表达数据、代谢数据、组织图像 | 未明确具体样本数量，涉及IPF患者成纤维细胞、动物模型及肺组织外植体 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 60 | 2026-03-25 |
Unraveling the cross-talk between a highly virulent PEDV strain and the host via single-cell transcriptomic analysis
2025-06-17, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00555-25
PMID:40396761
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了一种高毒力猪流行性腹泻病毒（PEDV）毒株与宿主之间的相互作用机制 | 首次利用单细胞测序技术全面解析PEDV感染后宿主肠道细胞的组成、基因表达和细胞间通讯变化，并发现病毒可在B和T淋巴细胞中启动复制但无法产生感染性子代 | 研究仅针对一种PEDV毒株，样本量相对有限，且未深入探讨病毒在不同细胞类型中的长期感染动态 | 探究PEDV与宿主的相互作用机制，以理解病毒致病性和宿主免疫反应 | 感染PEDV的仔猪空肠细胞，包括上皮细胞、干细胞、免疫细胞等 | 数字病理学 | 猪流行性腹泻 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 19,612个空肠细胞，来自PEDV感染和对照仔猪 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |