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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2025-10-06 |
Annexin A1-FPR1 Interaction in dendritic cells promotes immune microenvironment modulation in Thyroid Cancer
2025-Jun-07, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-025-10042-6
PMID:40483281
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析揭示甲状腺癌中树突状细胞通过ANXA1-FPR1相互作用调控免疫微环境的机制 | 首次发现ANXA1与FPR1在树突状细胞中的相互作用及其在甲状腺癌免疫调控中的关键作用 | NA | 探索甲状腺癌免疫微环境中树突状细胞的功能及其调控机制 | 甲状腺癌组织中的树突状细胞群体 | 单细胞生物学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序,转录组RNA测序,meta分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 542 | 2025-10-06 |
Integrating spatial and single-cell transcriptomics to characterize mouse long bone fracture healing process
2025-Jun-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08316-0
PMID:40483363
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单细胞转录组学技术,系统表征了小鼠长骨骨折愈合过程中的细胞定位和相互作用 | 优化了使用Morse溶液的去钙化方法显著提高RNA质量,结合Visium CytAssist平台和多种分析工具,首次实现了骨折愈合过程中关键细胞群体的精确定位和转化过程解析 | 研究仅限于小鼠模型,且仅分析了骨折后特定时间点(第0、5、15天),未能覆盖完整愈合过程的所有阶段 | 阐明骨折愈合过程中细胞间的协调相互作用和分子调控机制 | 小鼠股骨骨折模型 | 空间转录组学 | 骨折 | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | 小鼠股骨骨折模型在骨折前(第0天)和骨折后第5、15天的时间点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium CytAssist | Visium CytAssist空间转录组平台 |
| 543 | 2025-10-06 |
Unraveling the genetic blueprint of doxorubicin-induced cardiotoxicity through systems genetics approaches
2025-Jun-03, Cardio-oncology (London, England)
DOI:10.1186/s40959-025-00349-y
PMID:40462234
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研究论文 | 本研究通过系统遗传学方法利用BXD重组近交系小鼠群体揭示多柔比星诱导心脏毒性的遗传基础 | 首次在BXD小鼠遗传参考群体中系统定位与多柔比星心脏毒性相关的数量性状位点和候选基因 | 研究仅限于小鼠模型,需要进一步在人类中验证候选基因的功能 | 阐明多柔比星诱导心脏毒性的遗传机制 | BXD重组近交系小鼠群体(58个品系)及亲本C57BL/6J和DBA/2J小鼠 | 系统遗传学 | 心血管疾病 | 数量性状位点定位、孟德尔随机化分析、超声心动图、单细胞RNA测序 | 遗传定位模型 | 基因型数据、表型数据、生存数据、心脏功能数据 | 58个BXD品系及亲本品系,每个品系每性别至少4只小鼠,总计超过464只3-4月龄小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 544 | 2025-10-06 |
mNSF: multi-sample non-negative spatial factorization
2025-Jun-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03601-x
PMID:40457480
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研究论文 | 提出一种用于多样本空间转录组数据分析的无对齐框架mNSF | 将单样本空间因子分解扩展到多样本数据集,无需空间对齐即可建模样本特异性空间相关性 | 未明确说明方法在复杂生物系统中的适用性限制 | 开发多样本空间转录组数据的分析方法 | 多样本空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 非负空间因子分解 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 545 | 2025-10-06 |
Single-cell atlas of human gingiva unveils a NETs-related neutrophil subpopulation regulating periodontal immunity
2025-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.07.028
PMID:39084404
|
研究论文 | 通过单细胞测序构建人牙龈单细胞图谱,揭示NETs相关中性粒细胞亚群在牙周免疫中的调控作用 | 首次在牙周炎中发现并鉴定NETs相关中性粒细胞亚群(NrNeu),揭示牙龈成纤维细胞通过MIF-CD74/CXCR4轴促进NETs产生的调控机制 | NA | 阐明NETs在牙周免疫病理中的具体功能和机制 | 健康个体和牙周炎患者的牙龈组织 | 单细胞生物学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序,高维加权基因共表达网络分析,伪时间分析,细胞间通讯分析 | 六种机器学习方法构建的预测模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 546 | 2025-10-06 |
RNA modification gene WDR4 facilitates tumor progression and immunotherapy resistance in breast cancer
2025-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.06.029
PMID:38960276
|
研究论文 | 本研究基于RNA修饰相关基因开发了RMscore评分系统,用于预测乳腺癌患者的治疗反应和生存结局 | 首次整合13种RNA修饰模式相关基因建立九基因标志物,并发现WDR4通过m7G修饰调控细胞周期和mTORC1信号通路 | NA | 探索RNA修饰相关基因在乳腺癌中的临床价值并建立治疗反应预测策略 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 批量转录组分析、单细胞转录组分析、基因组学分析、流式细胞术、免疫组织化学、免疫荧光染色 | 基因特征评分模型 | 转录组数据、基因组数据、实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 547 | 2025-10-06 |
Comprehensive analysis based on IFN-γ and SASP related genes, bulk RNA and single-cell sequencing to evaluate the prognosis and immune landscape of stomach adenocarcinoma
2025-Jun, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01646-7
PMID:40293675
|
研究论文 | 基于IFN-γ和SASP相关基因开发胃腺癌预后风险模型并评估免疫景观 | 首次结合IFN-γ和衰老相关分泌表型相关基因对胃腺癌进行分子分型,并整合bulk RNA和单细胞测序数据构建预后模型 | 数据主要来源于TCGA数据库,需要外部验证 | 识别胃腺癌分子亚型并开发预后风险模型 | 胃腺癌患者 | 生物信息学 | 胃腺癌 | Cox回归分析, LASSO回归分析, 非负矩阵分解, 单细胞测序, bulk RNA测序 | 预后风险模型 | 基因组数据, 临床数据, 单细胞数据 | TCGA数据库中的胃腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 548 | 2025-10-06 |
Long Noncoding RNA Interleukin 6 Antisense RNA 1 Promotes Inflammatory Effects in Lung Macrophages via Exosomes Through the S100A9/TLR4 Pathway in Chronic Obstructive Pulmonary Disease Progression
2025-Jun, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70204
PMID:40487749
|
研究论文 | 探讨长链非编码RNA IL6-AS1通过外泌体和S100A9/TLR4通路在慢性阻塞性肺疾病进展中促进肺部炎症的作用机制 | 首次揭示IL6-AS1通过外泌体介导的S100A9/TLR4通路促进成纤维细胞与巨噬细胞间通讯,加剧COPD肺部炎症 | 研究主要基于小鼠模型和细胞共培养系统,人类样本验证相对有限 | 阐明IL6-AS1在COPD发病机制中的具体作用机制 | 小鼠模型、COPD患者样本、肺成纤维细胞-巨噬细胞共培养系统 | 分子生物学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析、腺相关病毒转染 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 小鼠模型和COPD患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 549 | 2025-10-06 |
scEVE: a single-cell RNA-seq ensemble clustering algorithm capitalizing on the differences of predictions between multiple clustering methods
2025-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf073
PMID:40491972
|
研究论文 | 开发了一种名为scEVE的单细胞RNA测序集成聚类算法,通过利用多种聚类方法预测差异而非最小化差异来改进细胞群体识别 | 提出了一种新的集成聚类方法,通过描述聚类结果之间的差异而不是最小化差异,能够生成具有不确定性值和多分辨率的聚类结果 | NA | 开发改进的单细胞RNA测序集成聚类算法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成聚类算法 | 基因表达数据 | 15个实验数据集和最多1200个合成数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 550 | 2025-10-06 |
KRT5high TP63-expressing urothelial basal cells act as a driver to bladder urothelium regeneration in rabbit
2025-Jun-07, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04417-z
PMID:40483513
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定KRT5high TP63表达基底细胞作为膀胱尿路上皮再生的驱动细胞,并开发了基于胶囊血管床的膀胱组织工程策略 | 首次在兔模型中证实KRT5high TP63表达基底细胞具有干细胞特性,能够分化为中间层和表层伞状细胞,并建立了基于胶囊血管床的尿路上皮组织工程新方法 | 研究仅在兔模型中进行,尚未在更高等动物或人体验证;样本量未明确说明 | 探索膀胱尿路上皮再生的细胞机制并开发组织工程修复策略 | 兔膀胱尿路上皮基底细胞 | 组织工程 | 膀胱疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 551 | 2025-10-06 |
Heterogeneous characteristics of γδ T cells in peripheral blood of diffuse large B-cell lymphoma
2025-Jun-07, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00795-x
PMID:40483533
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了弥漫性大B细胞淋巴瘤患者外周血中γδ T细胞的异质性特征及其与预后的关联 | 首次在DLBCL患者外周血中系统鉴定出6个功能各异的γδ T细胞亚群,并发现TIGIT+ γδ T细胞亚群与不良预后显著相关 | 样本量较小(6例患者和3例健康个体),需要在更大队列中验证研究结果 | 阐明DLBCL患者外周血中γδ T细胞的异质性及其临床相关性 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者和健康个体的外周血样本 | 单细胞基因组学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | 共识聚类, 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 9个血液样本(6例DLBCL患者和3例健康个体) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 552 | 2025-10-06 |
Cholangiocytes contribute to hepatocyte regeneration after partial liver injury during growth spurt in zebrafish
2025-Jun-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60334-y
PMID:40480975
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研究论文 | 本研究通过建立斑马鱼部分肝损伤模型,揭示了在快速生长期胆管细胞通过转分化为肝细胞参与肝脏再生的机制 | 首次在快速生长期动物模型中证明胆管细胞是新生肝细胞的主要来源,并发现mTORC1信号通路调控胆管细胞可塑性 | 研究仅限于斑马鱼模型,尚未在哺乳动物中验证 | 探究快速生长期肝脏再生的细胞来源和分子机制 | 斑马鱼肝脏 | 发育生物学 | 肝损伤 | 单细胞转录组测序,谱系追踪,基因组编辑 | NA | 基因表达数据,谱系追踪数据 | 斑马鱼部分肝损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 553 | 2025-10-06 |
RAN potentiates nuclear export of phosphorylated AMPK, reshaping lipid metabolism and impairing immune efficacy in lung adenocarcinoma
2025-Jun-06, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00977-8
PMID:40481101
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研究论文 | 本研究探讨RAN通过调节磷酸化AMPK核输出影响脂质代谢,从而削弱肺腺癌免疫治疗效果的机制 | 首次揭示RAN通过调控p-AMPK核输出重塑脂质代谢并影响免疫治疗效果的分子机制 | 样本量较小(n=15),需要更大规模研究验证 | 探索肺腺癌免疫治疗反应差异的代谢机制 | 肺腺癌患者和细胞系 | 单细胞转录组学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 15例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 554 | 2025-10-06 |
Identification of immune-associated genes and single-cell sequencing analysis in diagnosing Behçet's disease
2025-Jun-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-05086-x
PMID:40481130
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研究论文 | 通过批量测序和单细胞测序分析白塞病的免疫景观并鉴定新的诊断生物标志物 | 首次在单细胞分辨率下探索单核细胞在白塞病发生发展中的作用,并通过机器学习筛选出5个新的潜在诊断标志物 | 研究主要依赖公共数据库数据,实验验证仅限于小鼠模型 | 识别白塞病的免疫相关基因并开发诊断方法 | 白塞病患者和小鼠模型 | 生物信息学 | 白塞病 | 批量测序,单细胞测序,qRT-PCR | LASSO | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的白塞病数据和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 555 | 2025-10-06 |
BNT162b2 COVID-19 vaccination elicits the expansion of CD16+CD8+ T cells endowed with natural killer cell features
2025-Jun, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.01.024
PMID:39894227
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研究论文 | 本研究揭示了BNT162b2 mRNA疫苗接种可诱导具有自然杀伤细胞特征的CD16+CD8+ T细胞扩增 | 首次发现mRNA疫苗能诱导产生兼具适应性免疫和天然免疫特征的CD16+CD8+ T细胞亚群 | 样本量较小(30名健康个体),未评估长期免疫持久性 | 表征BNT162b2 mRNA疫苗接种后出现的非常规T细胞亚群 | 接受两剂BNT162b2 mRNA疫苗的健康人类个体 | 免疫学 | COVID-19 | 多参数流式细胞术,单细胞转录组分析 | NA | 流式细胞数据,单细胞转录组数据 | 30名健康个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 556 | 2025-10-06 |
Kinesin family member 4 a drives Cancer stem cell characteristics in breast Cancer: Insights from scRNA-Seq and experimental validation
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144308
PMID:40383330
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据识别乳腺癌癌症干细胞标志基因,并验证KIF4A在癌症干细胞特性中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序结合实验验证揭示KIF4A是乳腺癌癌症干细胞特性的关键调控因子 | 研究主要基于公共数据集和有限实验验证,需要进一步临床样本验证 | 识别乳腺癌癌症干细胞标志基因并验证其功能 | 乳腺癌细胞系和裸鼠模型 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,加权基因共表达网络分析 | NA | 基因表达数据 | GSE180286单细胞数据集和TCGA乳腺癌数据集 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 557 | 2025-10-06 |
Integrative genome-wide association studies, proteome-wide Mendelian randomization, and single-cell RNA sequencing identify interleukin-6 receptor protein as a therapeutic target in aortic aneurysm
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144380
PMID:40409638
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研究论文 | 本研究通过整合基因组关联研究、蛋白质组孟德尔随机化和单细胞RNA测序,识别白细胞介素-6受体蛋白作为主动脉瘤的潜在治疗靶点 | 首次将GWAS、PW-MR和单细胞RNA测序整合应用于主动脉瘤研究,发现IL6R在疾病机制中的关键作用 | 靶向IL6R的药物可能存在副作用需要进一步评估 | 识别主动脉瘤的新生物标志物和治疗靶点 | 主动脉瘤患者和健康对照人群 | 生物信息学 | 心血管疾病 | GWAS, PW-MR, 单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化模型, 多性状共定位分析 | 基因组数据, 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 8125例AA患者和381,977例对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 558 | 2025-10-06 |
CD44 Deficiency Induces Combinatory NRF2 Inhibition and Endoplasmic Reticulum Stress-Associated Dyserythropoiesis
2025-Jun-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500228R
PMID:40488748
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研究论文 | 本研究揭示了CD44缺失通过抑制NRF2通路和诱导内质网应激导致红细胞生成异常的作用机制 | 首次阐明CD44在终末红细胞生成中通过调控PI3K/AKT/NRF2和p62/NRF2通路维持氧化还原稳态和蛋白质稳态的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类红细胞生成中的验证尚不充分 | 探究CD44在红细胞生成中的具体功能和分子机制 | CD44基因敲除小鼠、红细胞前体细胞、小鼠胎肝细胞 | 分子生物学 | 溶血性贫血 | 单细胞测序、基因敲除、体外红细胞分化实验 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | CD44KO小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 559 | 2025-10-06 |
Loss of ARNTL Enhances ER Stress and Apoptosis in CKD Through Disruption of NRF2 Signaling
2025-Jun-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202403398RRR
PMID:40489010
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研究论文 | 本研究揭示了ARNTL通过调控NRF2信号通路在慢性肾病中抑制内质网应激和细胞凋亡的保护机制 | 首次发现ARNTL直接结合NRF2启动子区域并通过蛋白互作调控NRF2激活,在慢性肾病中形成关键保护轴 | 研究主要基于细胞模型和动物模型,临床转化价值需要进一步验证 | 探索慢性肾病中内质网应激导致肾小管细胞凋亡的分子机制 | 慢性肾病患者的肾脏组织、CKD模型小鼠、HK2人肾小管上皮细胞 | 分子生物学 | 慢性肾病 | 单细胞测序, 蛋白互作分析, 启动子结合实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白水平数据, 单细胞测序数据 | CKD患者和模型小鼠的肾脏组织样本,HK2细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 560 | 2025-10-06 |
A spatially organized Cd24a+/Pax9+ stem cell core governs postnatal tooth establishment
2025-Jun-06, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adu5653
PMID:40479070
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研究论文 | 本研究揭示了Cd24a+/Pax9+干细胞核心在出生后牙齿建立过程中的空间组织与功能 | 首次发现并表征了空间组织的Cd24a+/Pax9+干细胞核心在哺乳动物牙齿发育中的关键作用 | NA | 探究出生后牙齿建立过程中干细胞的空间组织与发育机制 | 小鼠和人类牙齿组织 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,CUT&Tag,空间图谱 | NA | 基因表达数据,表观遗传数据,空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |