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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2025-10-06 |
Targeting CD39 boosts PD-1 blockade antitumor therapeutic efficacy via strengthening CD8 + TILs function and recruiting B cells in cervical cancer
2025-Jun-03, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03500-0
PMID:40462160
|
研究论文 | 本研究通过靶向CD39增强PD-1阻断在宫颈癌中的抗肿瘤疗效 | 发现CD39高表达与CD8+T细胞耗竭相关,并开发了含POM-1的脂质体增强治疗效果 | 样本量较小(仅10例患者),需更大规模研究验证 | 寻找增强免疫检查点抑制剂治疗宫颈癌疗效的新策略 | 宫颈癌患者样本和皮下肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 10例宫颈癌患者(本中心队列)+TCGA数据库队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 542 | 2025-10-06 |
PSMB10 maintains the stemness of chemotherapeutic drug-resistant leukemia cells by inhibiting senescence and cytotoxic T lymphocyte-mediated killing in a ubiquitinated degradation manner
2025-Jun-03, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03420-9
PMID:40462177
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研究论文 | 本研究揭示了PSMB10通过泛素化降解方式维持化疗耐药白血病细胞干性、抑制衰老和细胞毒性T淋巴细胞杀伤的新机制 | 首次发现PSMB10在化疗后非衰老白血病干细胞中特异性高表达,并阐明其通过调控SLC22A16介导的药物内吞和MHC-I蛋白降解双重机制维持白血病干细胞干性 | 研究主要基于体外实验和动物模型,临床转化仍需进一步验证 | 探索化疗耐药白血病干细胞维持干性的分子机制,寻找新的治疗靶点 | 急性髓系白血病细胞、白血病干细胞、细胞毒性T淋巴细胞 | 癌症生物学 | 白血病 | 单细胞RNA-seq、RT-qPCR、流式细胞术、免疫共沉淀、荧光素酶报告基因检测、定量蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞功能数据 | AML患者临床样本、人类AML异种移植模型、PSMB10敲除同源小鼠骨髓移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 543 | 2025-10-06 |
A resource for whole-body gene expression map of human tissues based on integration of single cell and bulk transcriptomics
2025-Jun-03, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03616-4
PMID:40462185
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研究论文 | 基于单细胞和批量转录组学整合构建人体组织全基因表达图谱资源 | 通过整合单细胞和批量转录组学数据,采用组织混合分析方法增强转录组覆盖深度,首次系统性地绘制了人体主要组织和器官的蛋白质编码基因表达图谱 | NA | 构建人体全组织基因表达图谱,探索基因和蛋白质在细胞中的空间分布 | 人体31种主要组织和器官的蛋白质编码基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序, 批量转录组测序, 抗体分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 31种人体组织,识别出557个独特细胞簇 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 544 | 2025-10-06 |
Exploring the Molecular Mechanisms of Fisetin in Treating Periodontitis Through Multiomics and Network Pharmacology
2025-Jun, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2024.12.012
PMID:39755534
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研究论文 | 本研究通过多组学和网络药理学方法探索非瑟酮治疗牙周炎的分子机制 | 首次结合网络药理学、动物模型和单细胞/空间转录组学技术系统研究非瑟酮治疗牙周炎的作用机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,尚未在临床患者中验证 | 探索非瑟酮治疗牙周炎的分子机制和疗效 | 牙周炎大鼠模型和人牙周膜成纤维细胞 | 多组学分析 | 牙周炎 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 网络药理学分析 | 动物疾病模型 | 转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 545 | 2025-10-06 |
Genomic determinants of antigen expression hierarchy in African trypanosomes
2025-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08720-w
PMID:40074895
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研究论文 | 本研究通过建立高灵敏度单细胞RNA测序方法,揭示了非洲锥虫抗原表达层次性的基因组决定因素 | 首次建立了针对布氏锥虫的高灵敏度单细胞RNA测序方法,能够在单细胞水平追踪抗原转换事件中的转录组变化和基因组重排 | 研究局限于模型原生动物寄生虫布氏锥虫,方法在其他病原体的适用性有待验证 | 揭示非洲锥虫抗原表达层次性的分子机制和基因组决定因素 | 布氏锥虫(Trypanosoma brucei)寄生虫 | 基因组学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 546 | 2025-10-06 |
Characterizing resistant cellular states in nasopharyngeal carcinoma during EBV lytic induction
2025-Jun, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03341-z
PMID:40133476
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学分析鼻咽癌细胞对EBV裂解诱导的异质性反应 | 首次发现并表征了EBV裂解诱导不敏感细胞状态,鉴定出SOX2和NTRK2作为该状态的关键标志物 | 研究仅使用NPC43细胞系,未在更多细胞模型或体内验证 | 探究鼻咽癌细胞对EBV裂解诱导治疗的异质性反应机制 | EBV阳性鼻咽癌细胞系NPC43 | 单细胞转录组学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NPC43细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 547 | 2025-10-06 |
sEV-mediated intercellular transformation from MGAT4AHigh to MGAT4ALow tumor cells via the HOTAIRM1/miR-196b-5p axis promotes apoptosis resistance in CTCL
2025-Jun, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03356-6
PMID:40155530
|
研究论文 | 本研究揭示了sEV介导的HOTAIRM1/miR-196b-5p/MGAT4A轴通过调控N-糖基化修饰诱导CTCL细胞凋亡抵抗的机制 | 首次发现MGAT4AHigh肿瘤细胞通过sEV传递miR-196b-5p将MGAT4ALow良性细胞转化为凋亡抵抗细胞,并开发了工程化sEV靶向治疗策略 | NA | 探究HOTAIRM1/miR-196b-5p/MGAT4A轴在皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)凋亡抵抗中的作用机制 | CTCL肿瘤细胞、良性CD4+T细胞、小细胞外囊泡(sEVs) | 分子生物学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 全转录组测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 548 | 2025-10-06 |
Mitochondrial genetic landscape and its correlation with immune cell infiltration in preeclampsia: Insights from bioinformatics
2025-Jun, Journal of reproductive immunology
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.jri.2025.104527
PMID:40203595
|
研究论文 | 通过生物信息学方法识别先兆子痫中线粒体相关基因及其与免疫细胞浸润的关联 | 首次系统分析先兆子痫中线粒体相关基因与免疫微环境的相互作用,发现CYP11A1可能是HELLP综合征的潜在生物标志物 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 探索先兆子痫中线粒体相关基因的调控机制及其与免疫细胞浸润的关系 | 先兆子痫患者胎盘组织及相关基因表达数据 | 生物信息学 | 先兆子痫 | LASSO回归分析,ROC曲线分析,基因集富集分析,单细胞测序分析,免疫荧光染色 | 预测模型 | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE114691,GSE190971,GSE75010,GSE25906) | NA | 单细胞测序,基因表达分析 | NA | NA |
| 549 | 2025-10-06 |
Spatial Transcriptomics Shows a Distinctive Tumour Microenvironment in the Invasive Versus Premalignant Portion of Early Cutaneous Squamous Cell Carcinoma
2025-Jun, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70125
PMID:40462294
|
研究论文 | 通过空间转录组学分析早期皮肤鳞状细胞癌中侵袭性与癌前部分的肿瘤微环境差异 | 首次使用空间转录组学技术比较早期皮肤鳞癌中侵袭性与癌前部分在肿瘤细胞、免疫细胞和成纤维细胞中的基因表达差异 | 回顾性研究设计,样本量较小(17例患者) | 探究皮肤鳞状细胞癌从癌前病变向侵袭性癌转变过程中肿瘤微环境的基因表达变化 | 早期皮肤鳞状细胞癌组织样本,包含侵袭性和癌前部分 | 空间转录组学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 17例患者 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler |
| 550 | 2025-10-06 |
DDR2-mediated autophagy inhibition contributes to angiotensin II-induced adventitial remodeling
2025-Jun, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70361
PMID:40468620
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研究论文 | 本研究探讨了DDR2通过抑制自噬促进血管紧张素II诱导的血管外膜成纤维细胞表型转化和外膜重构的机制 | 首次揭示了DDR2通过PI3K/Akt/mTOR通路抑制自噬在血管外膜重构中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,在人类疾病中的适用性需要进一步验证 | 探究DDR2在血管紧张素II诱导的血管外膜重构中的作用机制 | 血管外膜成纤维细胞(AFs)和小鼠模型 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,基因敲除,药物干预 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 野生型小鼠和Ddr2条件性敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 551 | 2025-10-06 |
Multi-omic analyses of the development of obesity-related depression linked to the gut microbe Anaerotruncus colihominis and its metabolite glutamate
2025-Jun-15, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2025.04.010
PMID:40274437
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了肠道微生物Anaerotruncus colihominis及其代谢产物谷氨酸在肥胖相关抑郁症发展中的关键作用 | 首次发现A. colihominis通过谷氨酸代谢影响肠脑轴,并鉴定Efnb2-Ephb2相互作用在细胞通讯中的关键作用 | 研究主要基于动物模型,临床样本量有限,需要更大规模的人群研究验证 | 探索肥胖相关抑郁症的肠道微生物机制 | 肥胖相关抑郁症患者、高脂饮食小鼠、无菌小鼠 | 微生物组学 | 肥胖相关抑郁症 | 单细胞RNA测序, 粪便微生物移植, 多组学分析 | NA | 微生物组数据, 转录组数据, 代谢组数据 | 临床患者队列和高脂饮食小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 552 | 2025-10-06 |
Integrating Ambient Ionization Mass Spectrometry Imaging and Spatial Transcriptomics on the Same Cancer Tissues to Identify RNA-Metabolite Correlations
2025-Jun-10, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202502028
PMID:40216587
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研究论文 | 开发了一种在同一组织切片上整合空间代谢组学和空间转录组学的新方法 | 首次在同一组织切片上结合DESI-MSI空间代谢组学和Visium空间转录组学,避免了连续切片间的变异性问题 | 仅在人乳腺癌和肺癌组织中进行了验证,尚未在其他癌症类型或更大样本中测试 | 识别癌症组织中RNA与代谢物的空间相关性 | 人乳腺癌和肺癌组织 | 空间多组学 | 乳腺癌,肺癌 | 解吸电喷雾电离质谱成像,空间转录组学 | NA | 质谱成像数据,转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学,空间代谢组学 | Visium | Visium空间转录组学 |
| 553 | 2025-10-06 |
Glucocorticoid receptor suppresses GATA6-mediated RNA polymerase II pause release to modulate classical subtype identity in pancreatic cancer
2025-Jun-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-334374
PMID:39884837
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研究论文 | 本研究揭示了糖皮质激素受体通过抑制GATA6介导的RNA聚合酶II暂停释放来调控胰腺癌经典亚型身份的分子机制 | 首次发现GR激动剂通过与GATA6相互作用抑制经典转录程序,揭示了GATA6通过启动子近端暂停释放调控亚型特异性转录的新机制 | NA | 揭示控制胰腺癌亚型身份的转录调控机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)的经典和基底亚型 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq, HiChIP, PRO-seq, dCas9基因编辑 | NA | 基因组学数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 染色质可及性分析 | NA | NA |
| 554 | 2025-10-06 |
An erythroid-biased FOShi hematopoietic multipotent progenitor subpopulation contributes to adaptation to chronic hypoxia
2025-Jun-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.03.010
PMID:40220764
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别了一种促红细胞生成的FOShi多能祖细胞亚群,揭示了其在慢性缺氧适应中的关键作用及潜在治疗策略 | 首次发现具有干扰素信号响应特征的促红细胞生成多能祖细胞亚群(FOS MPP),并揭示其通过维持红系基因低甲基化实现缺氧记忆功能 | 研究仅基于小鼠高海拔红细胞增多症模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探索慢性缺氧适应的细胞和分子机制 | 小鼠造血干细胞和祖细胞(HSPCs)及红细胞 | 单细胞基因组学 | 高海拔红细胞增多症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠造血干细胞、祖细胞和红细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 555 | 2025-10-06 |
3D reconstruction of a human Carnegie stage 9 embryo provides a snapshot of early body plan formation
2025-Jun-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.04.007
PMID:40345192
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研究论文 | 利用空间转录组学对Carnegie stage 9人类胚胎进行3D重建,揭示早期身体计划形成的转录组和空间复杂性 | 首次通过空间转录组学对完整CS9人类胚胎进行详细分析,识别了后脑发育的两个不同轨迹、峡部组织者的精确定位以及神经中胚层祖细胞的双层结构 | 仅分析单个胚胎样本,可能无法代表所有CS9胚胎的发育变异 | 研究人类早期胚胎发育过程中的身体计划形成机制 | Carnegie stage 9人类胚胎 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,3D重建 | NA | 空间转录组数据,图像数据 | 1个人类胚胎,75个横切面冷冻切片 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 556 | 2025-10-06 |
Transmembrane emp24 domain-containing protein 3 promotes the malignant progression of glioma by regulating the ZBTB7A signaling axis
2025-Jun-05, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-025-00274-7
PMID:40471367
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研究论文 | 本研究揭示TMED3通过调控ZBTB7A信号轴促进胶质母细胞瘤恶性进展的机制 | 首次系统阐明TMED3在胶质母细胞瘤中的致癌作用及其通过ZBTB7A信号轴调控的分子机制 | TMED3与ZBTB7A相互作用的具体分子机制仍需进一步探索 | 探索胶质母细胞瘤的新治疗靶点 | 胶质母细胞瘤组织和细胞系 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,免疫共沉淀,体外实验,体内实验 | NA | 基因表达数据,实验数据 | TCGA数据库样本和实验样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 557 | 2025-10-06 |
Multi-omics exploration of CAV1+ tumor epithelial subcelltype in oral squamous cell carcinoma and its impact on the immune microenvironment
2025-Jun-05, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02843-2
PMID:40471478
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研究论文 | 通过多组学方法探索口腔鳞状细胞癌中CAV1+肿瘤上皮亚型的特征及其对免疫微环境的影响 | 首次在OSCC中鉴定出CAV1+上皮亚型,揭示其通过NECTIN1-CD96信号网络与T细胞相互作用导致免疫逃逸的新机制 | 研究基于单细胞和空间转录组数据,需要进一步实验验证机制 | 揭示口腔鳞癌肿瘤上皮细胞亚型特征及其在肿瘤进展中的作用 | 口腔鳞状细胞癌(OSCC)患者样本 | 数字病理 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 558 | 2025-10-06 |
Muscle stem cells in Duchenne muscular dystrophy exhibit molecular impairments and altered cell fate trajectories impacting regenerative capacity
2025-Jun-05, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07755-1
PMID:40473604
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了杜氏肌营养不良症中卫星细胞的分子损伤和细胞命运轨迹改变 | 首次在单细胞水平系统揭示DMD卫星细胞的转录组异常和分化能力受损机制,并发现诱导自噬可挽救DMD祖细胞分化 | 研究主要基于小鼠模型,人类DMD患者样本验证尚需进一步研究 | 探究杜氏肌营养不良症中卫星细胞功能障碍的分子机制 | 杜氏肌营养不良症小鼠模型(mdx和D2-mdx)中的肌肉卫星细胞 | 单细胞生物学 | 杜氏肌营养不良症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | mdx和D2-mdx DMD小鼠模型的卫星细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 559 | 2025-10-06 |
Machine learning and multi-omics analysis reveal key regulators of proneural-mesenchymal transition in glioblastoma
2025-Jun-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-04862-z
PMID:40473799
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研究论文 | 通过机器学习和多组学分析揭示胶质母细胞瘤中前神经-间质转化的关键调控因子 | 首次系统识别17个PMT相关基因,发现这些基因主要在免疫细胞和血管中表达而非肿瘤细胞 | 研究机制尚未完全阐明,需要进一步实验验证 | 探索胶质母细胞瘤前神经-间质转化的分子机制 | 胶质母细胞瘤患者组织和细胞亚群 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 转录组测序, 蛋白质组学, 单细胞转录组分析 | Lasso, Cox, Step算法 | 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞数据 | 胶质母细胞瘤患者数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 560 | 2025-10-06 |
Multi-omics analyses reveal interactions between GREM1+ fibroblasts and SPP1+ macrophages in gastric cancer
2025-Jun-05, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00967-w
PMID:40473882
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研究论文 | 通过多组学分析揭示胃癌中GREM1+成纤维细胞与SPP1+巨噬细胞间的相互作用 | 首次整合bulk RNA-seq、单细胞RNA测序和空间转录组学系统解析胃癌微环境中GREM1+成纤维细胞与SPP1+巨噬细胞的相互作用网络 | 研究主要基于转录组数据,需要进一步功能实验验证相互作用的分子机制 | 探究胃癌肿瘤微环境中细胞间相互作用的特征及其临床意义 | 胃癌组织样本及其微环境中的细胞组成 | 数字病理学 | 胃癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫组化染色 | NA | 转录组数据, 空间定位数据, 免疫组化图像 | 12个独立胃癌数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |