单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 721 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2025-10-06 |
RNA modification gene WDR4 facilitates tumor progression and immunotherapy resistance in breast cancer
2025-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.06.029
PMID:38960276
|
研究论文 | 本研究基于RNA修饰相关基因开发了RMscore评分系统，用于预测乳腺癌患者的治疗反应和生存结局 | 首次整合13种RNA修饰模式相关基因建立九基因标志物，并发现WDR4通过m7G修饰调控细胞周期和mTORC1信号通路 | NA | 探索RNA修饰相关基因在乳腺癌中的临床价值并建立治疗反应预测策略 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 批量转录组分析、单细胞转录组分析、基因组学分析、流式细胞术、免疫组织化学、免疫荧光染色 | 基因特征评分模型 | 转录组数据、基因组数据、实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 522 | 2025-10-06 |
Histone deacetylases facilitate Th17-cell differentiation and pathogenicity in autoimmune uveitis via CDK6/ID2 axis
2025-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.07.029
PMID:39107200
|
研究论文 | 本研究揭示了组蛋白去乙酰化酶通过CDK6/ID2轴促进Th17细胞分化和致病性在自身免疫性葡萄膜炎中的作用机制 | 首次发现HDACs通过CDK6/ID2正反馈环路调控Th17细胞分化和致病性的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，临床样本验证相对有限 | 探究组蛋白去乙酰化酶在自身免疫性葡萄膜炎发病机制中的作用 | 自身免疫性葡萄膜炎患者外周血单核细胞和实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型 | 免疫学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,siRNA敲低,特异性抑制剂,过继转移实验 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型 | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | AU患者PBMCs和EAU小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 523 | 2025-10-06 |
ST6GALNAC1-mediated sialylation in uterine endometrial epithelium facilitates the epithelium-embryo attachment
2025-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.07.021
PMID:39111624
|
研究论文 | 本研究揭示了ST6GALNAC1介导的子宫内膜上皮细胞唾液酸化通过sTn-Siglecs轴促进胚胎附着的分子机制 | 首次证实ST6GALNAC1/sTn-Siglecs轴在胚胎植入过程中的关键作用，并鉴定CD44作为sTn修饰的关键载体蛋白 | 研究主要基于细胞模型和小鼠实验，人类临床验证仍需进一步研究 | 探究ST6GALNAC1/sTn-Siglecs轴在胚胎植入过程中的作用机制 | 人类和小鼠子宫内膜、胚胎、AN3CA细胞系、JAR细胞球 | 生殖生物学 | 生殖系统疾病 | 免疫组织化学、体外植入模型、免疫沉淀-质谱分析、单细胞RNA测序、蛋白互作检测、免疫荧光染色 | NA | 图像、测序数据、蛋白质互作数据 | 人类和小鼠子宫内膜组织、细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 524 | 2025-10-06 |
Interrogating mediators of single-cell transcriptional changes in the acute damaged cerebral cortex: Insights into endothelial-astrocyte interactions
2025-Jun, Molecular and cellular neurosciences
DOI:10.1016/j.mcn.2025.104003
PMID:40090391
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究内皮细胞EphA4在脑损伤后调控星形胶质细胞转录组变化的作用机制 | 首次揭示内皮细胞特异性敲除EphA4可通过影响星形胶质细胞基因表达和亚群分布促进神经保护反应 | 研究基于实验性TBI模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究脑损伤后细胞特异性转录变化的介导机制 | 大脑皮层中的内皮细胞和星形胶质细胞 | 单细胞转录组学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 525 | 2025-10-06 |
Comprehensive analysis based on IFN-γ and SASP related genes, bulk RNA and single-cell sequencing to evaluate the prognosis and immune landscape of stomach adenocarcinoma
2025-Jun, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01646-7
PMID:40293675
|
研究论文 | 基于IFN-γ和SASP相关基因开发胃腺癌预后风险模型并评估免疫景观 | 首次结合IFN-γ和衰老相关分泌表型相关基因对胃腺癌进行分子分型，并整合bulk RNA和单细胞测序数据构建预后模型 | 数据主要来源于TCGA数据库，需要外部验证 | 识别胃腺癌分子亚型并开发预后风险模型 | 胃腺癌患者 | 生物信息学 | 胃腺癌 | Cox回归分析, LASSO回归分析, 非负矩阵分解, 单细胞测序, bulk RNA测序 | 预后风险模型 | 基因组数据, 临床数据, 单细胞数据 | TCGA数据库中的胃腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 526 | 2025-10-06 |
One probe fits all: a highly customizable modular RNA in situ hybridization platform expanding the application of SABER DNA probes
2025-Jun-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204775
PMID:40446186
|
研究论文 | 开发了一种高度可定制的模块化RNA原位杂交平台OneSABER，扩展了SABER DNA探针的应用 | 创建统一开放平台连接多种常用和新开发的原位杂交方法，使用单一类型DNA探针实现信号扩增 | NA | 开发通用型RNA原位杂交平台以简化实验流程并降低研究成本 | 再生性扁虫Macrostomum lignano和Schmidtea mediterranea的整体样本，以及福尔马林固定石蜡包埋的小鼠肠道切片 | 分子生物学 | NA | RNA原位杂交，信号扩增交换反应 | NA | 图像数据 | 多种生物样本包括扁虫和小鼠组织 | NA | RNA原位杂交，单重和多重检测，比色和荧光检测 | OneSABER平台 | 基于SABER方法的模块化DNA探针系统，支持多种信号检测技术 |
| 527 | 2025-10-06 |
Long Noncoding RNA Interleukin 6 Antisense RNA 1 Promotes Inflammatory Effects in Lung Macrophages via Exosomes Through the S100A9/TLR4 Pathway in Chronic Obstructive Pulmonary Disease Progression
2025-Jun, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70204
PMID:40487749
|
研究论文 | 探讨长链非编码RNA IL6-AS1通过外泌体和S100A9/TLR4通路在慢性阻塞性肺疾病进展中促进肺部炎症的作用机制 | 首次揭示IL6-AS1通过外泌体介导的S100A9/TLR4通路促进成纤维细胞与巨噬细胞间通讯，加剧COPD肺部炎症 | 研究主要基于小鼠模型和细胞共培养系统，人类样本验证相对有限 | 阐明IL6-AS1在COPD发病机制中的具体作用机制 | 小鼠模型、COPD患者样本、肺成纤维细胞-巨噬细胞共培养系统 | 分子生物学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析、腺相关病毒转染 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 小鼠模型和COPD患者样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 528 | 2025-10-06 |
scEVE: a single-cell RNA-seq ensemble clustering algorithm capitalizing on the differences of predictions between multiple clustering methods
2025-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf073
PMID:40491972
|
研究论文 | 开发了一种名为scEVE的单细胞RNA测序集成聚类算法，通过利用多种聚类方法预测差异而非最小化差异来改进细胞群体识别 | 提出了一种新的集成聚类方法，通过描述聚类结果之间的差异而不是最小化差异，能够生成具有不确定性值和多分辨率的聚类结果 | NA | 开发改进的单细胞RNA测序集成聚类算法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成聚类算法 | 基因表达数据 | 15个实验数据集和最多1200个合成数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 529 | 2025-10-06 |
KRT5high TP63-expressing urothelial basal cells act as a driver to bladder urothelium regeneration in rabbit
2025-Jun-07, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04417-z
PMID:40483513
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定KRT5high TP63表达基底细胞作为膀胱尿路上皮再生的驱动细胞，并开发了基于胶囊血管床的膀胱组织工程策略 | 首次在兔模型中证实KRT5high TP63表达基底细胞具有干细胞特性，能够分化为中间层和表层伞状细胞，并建立了基于胶囊血管床的尿路上皮组织工程新方法 | 研究仅在兔模型中进行，尚未在更高等动物或人体验证；样本量未明确说明 | 探索膀胱尿路上皮再生的细胞机制并开发组织工程修复策略 | 兔膀胱尿路上皮基底细胞 | 组织工程 | 膀胱疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 530 | 2025-10-06 |
Heterogeneous characteristics of γδ T cells in peripheral blood of diffuse large B-cell lymphoma
2025-Jun-07, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00795-x
PMID:40483533
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了弥漫性大B细胞淋巴瘤患者外周血中γδ T细胞的异质性特征及其与预后的关联 | 首次在DLBCL患者外周血中系统鉴定出6个功能各异的γδ T细胞亚群，并发现TIGIT+ γδ T细胞亚群与不良预后显著相关 | 样本量较小（6例患者和3例健康个体），需要在更大队列中验证研究结果 | 阐明DLBCL患者外周血中γδ T细胞的异质性及其临床相关性 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者和健康个体的外周血样本 | 单细胞基因组学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | 共识聚类, 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 9个血液样本（6例DLBCL患者和3例健康个体） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 531 | 2025-10-06 |
Cholangiocytes contribute to hepatocyte regeneration after partial liver injury during growth spurt in zebrafish
2025-Jun-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60334-y
PMID:40480975
|
研究论文 | 本研究通过建立斑马鱼部分肝损伤模型，揭示了在快速生长期胆管细胞通过转分化为肝细胞参与肝脏再生的机制 | 首次在快速生长期动物模型中证明胆管细胞是新生肝细胞的主要来源，并发现mTORC1信号通路调控胆管细胞可塑性 | 研究仅限于斑马鱼模型，尚未在哺乳动物中验证 | 探究快速生长期肝脏再生的细胞来源和分子机制 | 斑马鱼肝脏 | 发育生物学 | 肝损伤 | 单细胞转录组测序,谱系追踪,基因组编辑 | NA | 基因表达数据,谱系追踪数据 | 斑马鱼部分肝损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 532 | 2025-10-06 |
RAN potentiates nuclear export of phosphorylated AMPK, reshaping lipid metabolism and impairing immune efficacy in lung adenocarcinoma
2025-Jun-06, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00977-8
PMID:40481101
|
研究论文 | 本研究探讨RAN通过调节磷酸化AMPK核输出影响脂质代谢，从而削弱肺腺癌免疫治疗效果的机制 | 首次揭示RAN通过调控p-AMPK核输出重塑脂质代谢并影响免疫治疗效果的分子机制 | 样本量较小（n=15），需要更大规模研究验证 | 探索肺腺癌免疫治疗反应差异的代谢机制 | 肺腺癌患者和细胞系 | 单细胞转录组学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 15例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 533 | 2025-10-06 |
Identification of immune-associated genes and single-cell sequencing analysis in diagnosing Behçet's disease
2025-Jun-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-05086-x
PMID:40481130
|
研究论文 | 通过批量测序和单细胞测序分析白塞病的免疫景观并鉴定新的诊断生物标志物 | 首次在单细胞分辨率下探索单核细胞在白塞病发生发展中的作用，并通过机器学习筛选出5个新的潜在诊断标志物 | 研究主要依赖公共数据库数据，实验验证仅限于小鼠模型 | 识别白塞病的免疫相关基因并开发诊断方法 | 白塞病患者和小鼠模型 | 生物信息学 | 白塞病 | 批量测序,单细胞测序,qRT-PCR | LASSO | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的白塞病数据和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 534 | 2025-10-06 |
BNT162b2 COVID-19 vaccination elicits the expansion of CD16+CD8+ T cells endowed with natural killer cell features
2025-Jun, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.01.024
PMID:39894227
|
研究论文 | 本研究揭示了BNT162b2 mRNA疫苗接种可诱导具有自然杀伤细胞特征的CD16+CD8+ T细胞扩增 | 首次发现mRNA疫苗能诱导产生兼具适应性免疫和天然免疫特征的CD16+CD8+ T细胞亚群 | 样本量较小（30名健康个体），未评估长期免疫持久性 | 表征BNT162b2 mRNA疫苗接种后出现的非常规T细胞亚群 | 接受两剂BNT162b2 mRNA疫苗的健康人类个体 | 免疫学 | COVID-19 | 多参数流式细胞术，单细胞转录组分析 | NA | 流式细胞数据，单细胞转录组数据 | 30名健康个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 535 | 2025-10-06 |
Kinesin family member 4 a drives Cancer stem cell characteristics in breast Cancer: Insights from scRNA-Seq and experimental validation
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144308
PMID:40383330
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据识别乳腺癌癌症干细胞标志基因，并验证KIF4A在癌症干细胞特性中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序结合实验验证揭示KIF4A是乳腺癌癌症干细胞特性的关键调控因子 | 研究主要基于公共数据集和有限实验验证，需要进一步临床样本验证 | 识别乳腺癌癌症干细胞标志基因并验证其功能 | 乳腺癌细胞系和裸鼠模型 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,加权基因共表达网络分析 | NA | 基因表达数据 | GSE180286单细胞数据集和TCGA乳腺癌数据集 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 536 | 2025-10-06 |
Integrative genome-wide association studies, proteome-wide Mendelian randomization, and single-cell RNA sequencing identify interleukin-6 receptor protein as a therapeutic target in aortic aneurysm
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144380
PMID:40409638
|
研究论文 | 本研究通过整合基因组关联研究、蛋白质组孟德尔随机化和单细胞RNA测序，识别白细胞介素-6受体蛋白作为主动脉瘤的潜在治疗靶点 | 首次将GWAS、PW-MR和单细胞RNA测序整合应用于主动脉瘤研究，发现IL6R在疾病机制中的关键作用 | 靶向IL6R的药物可能存在副作用需要进一步评估 | 识别主动脉瘤的新生物标志物和治疗靶点 | 主动脉瘤患者和健康对照人群 | 生物信息学 | 心血管疾病 | GWAS, PW-MR, 单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化模型, 多性状共定位分析 | 基因组数据, 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 8125例AA患者和381,977例对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 537 | 2025-10-06 |
CD44 Deficiency Induces Combinatory NRF2 Inhibition and Endoplasmic Reticulum Stress-Associated Dyserythropoiesis
2025-Jun-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500228R
PMID:40488748
|
研究论文 | 本研究揭示了CD44缺失通过抑制NRF2通路和诱导内质网应激导致红细胞生成异常的作用机制 | 首次阐明CD44在终末红细胞生成中通过调控PI3K/AKT/NRF2和p62/NRF2通路维持氧化还原稳态和蛋白质稳态的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类红细胞生成中的验证尚不充分 | 探究CD44在红细胞生成中的具体功能和分子机制 | CD44基因敲除小鼠、红细胞前体细胞、小鼠胎肝细胞 | 分子生物学 | 溶血性贫血 | 单细胞测序、基因敲除、体外红细胞分化实验 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | CD44KO小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 538 | 2025-10-06 |
Loss of ARNTL Enhances ER Stress and Apoptosis in CKD Through Disruption of NRF2 Signaling
2025-Jun-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202403398RRR
PMID:40489010
|
研究论文 | 本研究揭示了ARNTL通过调控NRF2信号通路在慢性肾病中抑制内质网应激和细胞凋亡的保护机制 | 首次发现ARNTL直接结合NRF2启动子区域并通过蛋白互作调控NRF2激活，在慢性肾病中形成关键保护轴 | 研究主要基于细胞模型和动物模型，临床转化价值需要进一步验证 | 探索慢性肾病中内质网应激导致肾小管细胞凋亡的分子机制 | 慢性肾病患者的肾脏组织、CKD模型小鼠、HK2人肾小管上皮细胞 | 分子生物学 | 慢性肾病 | 单细胞测序, 蛋白互作分析, 启动子结合实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白水平数据, 单细胞测序数据 | CKD患者和模型小鼠的肾脏组织样本，HK2细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 539 | 2025-10-06 |
A spatially organized Cd24a+/Pax9+ stem cell core governs postnatal tooth establishment
2025-Jun-06, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adu5653
PMID:40479070
|
研究论文 | 本研究揭示了Cd24a+/Pax9+干细胞核心在出生后牙齿建立过程中的空间组织与功能 | 首次发现并表征了空间组织的Cd24a+/Pax9+干细胞核心在哺乳动物牙齿发育中的关键作用 | NA | 探究出生后牙齿建立过程中干细胞的空间组织与发育机制 | 小鼠和人类牙齿组织 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,CUT&Tag,空间图谱 | NA | 基因表达数据,表观遗传数据,空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 540 | 2025-10-06 |
Cathepsin C correlates with M2 macrophage infiltration and regulates the tumor growth and metastasis in non-small cell lung cancer
2025-Jun-05, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14341-3
PMID:40474091
|
研究论文 | 本研究探讨组织蛋白酶C在非小细胞肺癌中的作用机制及其与M2巨噬细胞浸润的关系 | 首次通过单细胞测序揭示CTSC在非小细胞肺癌免疫微环境中的表达特征，并证实其与M2巨噬细胞浸润的正相关性 | 未明确CTSC调控M2巨噬细胞浸润的具体分子机制 | 阐明CTSC在非小细胞肺癌进展和转移中的调控作用 | 非小细胞肺癌细胞系、临床患者组织样本 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 基因集富集分析, 细胞功能实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 临床数据 | 临床非小细胞肺癌队列组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |