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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2025-10-06 |
KRT5high TP63-expressing urothelial basal cells act as a driver to bladder urothelium regeneration in rabbit
2025-Jun-07, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04417-z
PMID:40483513
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定KRT5high TP63表达基底细胞作为膀胱尿路上皮再生的驱动细胞,并开发了基于胶囊血管床的膀胱组织工程策略 | 首次在兔模型中证实KRT5high TP63表达基底细胞具有干细胞特性,能够分化为中间层和表层伞状细胞,并建立了基于胶囊血管床的尿路上皮组织工程新方法 | 研究仅在兔模型中进行,尚未在更高等动物或人体验证;样本量未明确说明 | 探索膀胱尿路上皮再生的细胞机制并开发组织工程修复策略 | 兔膀胱尿路上皮基底细胞 | 组织工程 | 膀胱疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 522 | 2025-10-06 |
Heterogeneous characteristics of γδ T cells in peripheral blood of diffuse large B-cell lymphoma
2025-Jun-07, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00795-x
PMID:40483533
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了弥漫性大B细胞淋巴瘤患者外周血中γδ T细胞的异质性特征及其与预后的关联 | 首次在DLBCL患者外周血中系统鉴定出6个功能各异的γδ T细胞亚群,并发现TIGIT+ γδ T细胞亚群与不良预后显著相关 | 样本量较小(6例患者和3例健康个体),需要在更大队列中验证研究结果 | 阐明DLBCL患者外周血中γδ T细胞的异质性及其临床相关性 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者和健康个体的外周血样本 | 单细胞基因组学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | 共识聚类, 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 9个血液样本(6例DLBCL患者和3例健康个体) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 523 | 2025-10-06 |
Cholangiocytes contribute to hepatocyte regeneration after partial liver injury during growth spurt in zebrafish
2025-Jun-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60334-y
PMID:40480975
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研究论文 | 本研究通过建立斑马鱼部分肝损伤模型,揭示了在快速生长期胆管细胞通过转分化为肝细胞参与肝脏再生的机制 | 首次在快速生长期动物模型中证明胆管细胞是新生肝细胞的主要来源,并发现mTORC1信号通路调控胆管细胞可塑性 | 研究仅限于斑马鱼模型,尚未在哺乳动物中验证 | 探究快速生长期肝脏再生的细胞来源和分子机制 | 斑马鱼肝脏 | 发育生物学 | 肝损伤 | 单细胞转录组测序,谱系追踪,基因组编辑 | NA | 基因表达数据,谱系追踪数据 | 斑马鱼部分肝损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 524 | 2025-10-06 |
RAN potentiates nuclear export of phosphorylated AMPK, reshaping lipid metabolism and impairing immune efficacy in lung adenocarcinoma
2025-Jun-06, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00977-8
PMID:40481101
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研究论文 | 本研究探讨RAN通过调节磷酸化AMPK核输出影响脂质代谢,从而削弱肺腺癌免疫治疗效果的机制 | 首次揭示RAN通过调控p-AMPK核输出重塑脂质代谢并影响免疫治疗效果的分子机制 | 样本量较小(n=15),需要更大规模研究验证 | 探索肺腺癌免疫治疗反应差异的代谢机制 | 肺腺癌患者和细胞系 | 单细胞转录组学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 15例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 525 | 2025-10-06 |
Identification of immune-associated genes and single-cell sequencing analysis in diagnosing Behçet's disease
2025-Jun-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-05086-x
PMID:40481130
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研究论文 | 通过批量测序和单细胞测序分析白塞病的免疫景观并鉴定新的诊断生物标志物 | 首次在单细胞分辨率下探索单核细胞在白塞病发生发展中的作用,并通过机器学习筛选出5个新的潜在诊断标志物 | 研究主要依赖公共数据库数据,实验验证仅限于小鼠模型 | 识别白塞病的免疫相关基因并开发诊断方法 | 白塞病患者和小鼠模型 | 生物信息学 | 白塞病 | 批量测序,单细胞测序,qRT-PCR | LASSO | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的白塞病数据和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 526 | 2025-10-06 |
BNT162b2 COVID-19 vaccination elicits the expansion of CD16+CD8+ T cells endowed with natural killer cell features
2025-Jun, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.01.024
PMID:39894227
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研究论文 | 本研究揭示了BNT162b2 mRNA疫苗接种可诱导具有自然杀伤细胞特征的CD16+CD8+ T细胞扩增 | 首次发现mRNA疫苗能诱导产生兼具适应性免疫和天然免疫特征的CD16+CD8+ T细胞亚群 | 样本量较小(30名健康个体),未评估长期免疫持久性 | 表征BNT162b2 mRNA疫苗接种后出现的非常规T细胞亚群 | 接受两剂BNT162b2 mRNA疫苗的健康人类个体 | 免疫学 | COVID-19 | 多参数流式细胞术,单细胞转录组分析 | NA | 流式细胞数据,单细胞转录组数据 | 30名健康个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 527 | 2025-10-06 |
Kinesin family member 4 a drives Cancer stem cell characteristics in breast Cancer: Insights from scRNA-Seq and experimental validation
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144308
PMID:40383330
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据识别乳腺癌癌症干细胞标志基因,并验证KIF4A在癌症干细胞特性中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序结合实验验证揭示KIF4A是乳腺癌癌症干细胞特性的关键调控因子 | 研究主要基于公共数据集和有限实验验证,需要进一步临床样本验证 | 识别乳腺癌癌症干细胞标志基因并验证其功能 | 乳腺癌细胞系和裸鼠模型 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,加权基因共表达网络分析 | NA | 基因表达数据 | GSE180286单细胞数据集和TCGA乳腺癌数据集 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 528 | 2025-10-06 |
Integrative genome-wide association studies, proteome-wide Mendelian randomization, and single-cell RNA sequencing identify interleukin-6 receptor protein as a therapeutic target in aortic aneurysm
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144380
PMID:40409638
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研究论文 | 本研究通过整合基因组关联研究、蛋白质组孟德尔随机化和单细胞RNA测序,识别白细胞介素-6受体蛋白作为主动脉瘤的潜在治疗靶点 | 首次将GWAS、PW-MR和单细胞RNA测序整合应用于主动脉瘤研究,发现IL6R在疾病机制中的关键作用 | 靶向IL6R的药物可能存在副作用需要进一步评估 | 识别主动脉瘤的新生物标志物和治疗靶点 | 主动脉瘤患者和健康对照人群 | 生物信息学 | 心血管疾病 | GWAS, PW-MR, 单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化模型, 多性状共定位分析 | 基因组数据, 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 8125例AA患者和381,977例对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 529 | 2025-10-06 |
CD44 Deficiency Induces Combinatory NRF2 Inhibition and Endoplasmic Reticulum Stress-Associated Dyserythropoiesis
2025-Jun-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500228R
PMID:40488748
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研究论文 | 本研究揭示了CD44缺失通过抑制NRF2通路和诱导内质网应激导致红细胞生成异常的作用机制 | 首次阐明CD44在终末红细胞生成中通过调控PI3K/AKT/NRF2和p62/NRF2通路维持氧化还原稳态和蛋白质稳态的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类红细胞生成中的验证尚不充分 | 探究CD44在红细胞生成中的具体功能和分子机制 | CD44基因敲除小鼠、红细胞前体细胞、小鼠胎肝细胞 | 分子生物学 | 溶血性贫血 | 单细胞测序、基因敲除、体外红细胞分化实验 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | CD44KO小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 530 | 2025-10-06 |
Loss of ARNTL Enhances ER Stress and Apoptosis in CKD Through Disruption of NRF2 Signaling
2025-Jun-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202403398RRR
PMID:40489010
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研究论文 | 本研究揭示了ARNTL通过调控NRF2信号通路在慢性肾病中抑制内质网应激和细胞凋亡的保护机制 | 首次发现ARNTL直接结合NRF2启动子区域并通过蛋白互作调控NRF2激活,在慢性肾病中形成关键保护轴 | 研究主要基于细胞模型和动物模型,临床转化价值需要进一步验证 | 探索慢性肾病中内质网应激导致肾小管细胞凋亡的分子机制 | 慢性肾病患者的肾脏组织、CKD模型小鼠、HK2人肾小管上皮细胞 | 分子生物学 | 慢性肾病 | 单细胞测序, 蛋白互作分析, 启动子结合实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白水平数据, 单细胞测序数据 | CKD患者和模型小鼠的肾脏组织样本,HK2细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 531 | 2025-10-06 |
Integrative Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveal Functional and Spatial Heterogeneity of Atrial and Ventricular Cardiomyocytes in the Heart
2025-Jun-09, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-025-01443-3
PMID:40488964
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示心脏中房性和室性心肌细胞的功能与空间异质性 | 首次结合单细胞RNA测序与空间定位技术,系统解析心肌细胞亚群的空间分布特征及细胞间通讯网络 | 研究基于分离的心脏细胞,可能丢失部分原生组织环境信息 | 阐明房性和室性心肌细胞的空间分布模式及其在能量代谢、泵功能和调节功能中的特异性作用 | 心脏组织中的房性心肌细胞(aCM)和室性心肌细胞(vCM) | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, PCA分析, t-SNE聚类, 配体-受体相互作用分析 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间定位数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 532 | 2025-10-06 |
A spatially organized Cd24a+/Pax9+ stem cell core governs postnatal tooth establishment
2025-Jun-06, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adu5653
PMID:40479070
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研究论文 | 本研究揭示了Cd24a+/Pax9+干细胞核心在出生后牙齿建立过程中的空间组织与功能 | 首次发现并表征了空间组织的Cd24a+/Pax9+干细胞核心在哺乳动物牙齿发育中的关键作用 | NA | 探究出生后牙齿建立过程中干细胞的空间组织与发育机制 | 小鼠和人类牙齿组织 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,CUT&Tag,空间图谱 | NA | 基因表达数据,表观遗传数据,空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 533 | 2025-10-06 |
Cathepsin C correlates with M2 macrophage infiltration and regulates the tumor growth and metastasis in non-small cell lung cancer
2025-Jun-05, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14341-3
PMID:40474091
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研究论文 | 本研究探讨组织蛋白酶C在非小细胞肺癌中的作用机制及其与M2巨噬细胞浸润的关系 | 首次通过单细胞测序揭示CTSC在非小细胞肺癌免疫微环境中的表达特征,并证实其与M2巨噬细胞浸润的正相关性 | 未明确CTSC调控M2巨噬细胞浸润的具体分子机制 | 阐明CTSC在非小细胞肺癌进展和转移中的调控作用 | 非小细胞肺癌细胞系、临床患者组织样本 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 基因集富集分析, 细胞功能实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 临床数据 | 临床非小细胞肺癌队列组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 534 | 2025-10-06 |
Targeting CD39 boosts PD-1 blockade antitumor therapeutic efficacy via strengthening CD8 + TILs function and recruiting B cells in cervical cancer
2025-Jun-03, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03500-0
PMID:40462160
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研究论文 | 本研究通过靶向CD39增强PD-1阻断在宫颈癌中的抗肿瘤疗效 | 发现CD39高表达与CD8+T细胞耗竭相关,并开发了含POM-1的脂质体增强治疗效果 | 样本量较小(仅10例患者),需更大规模研究验证 | 寻找增强免疫检查点抑制剂治疗宫颈癌疗效的新策略 | 宫颈癌患者样本和皮下肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 10例宫颈癌患者(本中心队列)+TCGA数据库队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 535 | 2025-10-06 |
PSMB10 maintains the stemness of chemotherapeutic drug-resistant leukemia cells by inhibiting senescence and cytotoxic T lymphocyte-mediated killing in a ubiquitinated degradation manner
2025-Jun-03, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03420-9
PMID:40462177
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研究论文 | 本研究揭示了PSMB10通过泛素化降解方式维持化疗耐药白血病细胞干性、抑制衰老和细胞毒性T淋巴细胞杀伤的新机制 | 首次发现PSMB10在化疗后非衰老白血病干细胞中特异性高表达,并阐明其通过调控SLC22A16介导的药物内吞和MHC-I蛋白降解双重机制维持白血病干细胞干性 | 研究主要基于体外实验和动物模型,临床转化仍需进一步验证 | 探索化疗耐药白血病干细胞维持干性的分子机制,寻找新的治疗靶点 | 急性髓系白血病细胞、白血病干细胞、细胞毒性T淋巴细胞 | 癌症生物学 | 白血病 | 单细胞RNA-seq、RT-qPCR、流式细胞术、免疫共沉淀、荧光素酶报告基因检测、定量蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞功能数据 | AML患者临床样本、人类AML异种移植模型、PSMB10敲除同源小鼠骨髓移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 536 | 2025-10-06 |
A resource for whole-body gene expression map of human tissues based on integration of single cell and bulk transcriptomics
2025-Jun-03, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03616-4
PMID:40462185
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研究论文 | 基于单细胞和批量转录组学整合构建人体组织全基因表达图谱资源 | 通过整合单细胞和批量转录组学数据,采用组织混合分析方法增强转录组覆盖深度,首次系统性地绘制了人体主要组织和器官的蛋白质编码基因表达图谱 | NA | 构建人体全组织基因表达图谱,探索基因和蛋白质在细胞中的空间分布 | 人体31种主要组织和器官的蛋白质编码基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序, 批量转录组测序, 抗体分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 31种人体组织,识别出557个独特细胞簇 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 537 | 2025-10-06 |
Exploring the Molecular Mechanisms of Fisetin in Treating Periodontitis Through Multiomics and Network Pharmacology
2025-Jun, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2024.12.012
PMID:39755534
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研究论文 | 本研究通过多组学和网络药理学方法探索非瑟酮治疗牙周炎的分子机制 | 首次结合网络药理学、动物模型和单细胞/空间转录组学技术系统研究非瑟酮治疗牙周炎的作用机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,尚未在临床患者中验证 | 探索非瑟酮治疗牙周炎的分子机制和疗效 | 牙周炎大鼠模型和人牙周膜成纤维细胞 | 多组学分析 | 牙周炎 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 网络药理学分析 | 动物疾病模型 | 转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 538 | 2025-10-06 |
Genomic determinants of antigen expression hierarchy in African trypanosomes
2025-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08720-w
PMID:40074895
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研究论文 | 本研究通过建立高灵敏度单细胞RNA测序方法,揭示了非洲锥虫抗原表达层次性的基因组决定因素 | 首次建立了针对布氏锥虫的高灵敏度单细胞RNA测序方法,能够在单细胞水平追踪抗原转换事件中的转录组变化和基因组重排 | 研究局限于模型原生动物寄生虫布氏锥虫,方法在其他病原体的适用性有待验证 | 揭示非洲锥虫抗原表达层次性的分子机制和基因组决定因素 | 布氏锥虫(Trypanosoma brucei)寄生虫 | 基因组学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 539 | 2025-10-06 |
Characterizing resistant cellular states in nasopharyngeal carcinoma during EBV lytic induction
2025-Jun, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03341-z
PMID:40133476
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学分析鼻咽癌细胞对EBV裂解诱导的异质性反应 | 首次发现并表征了EBV裂解诱导不敏感细胞状态,鉴定出SOX2和NTRK2作为该状态的关键标志物 | 研究仅使用NPC43细胞系,未在更多细胞模型或体内验证 | 探究鼻咽癌细胞对EBV裂解诱导治疗的异质性反应机制 | EBV阳性鼻咽癌细胞系NPC43 | 单细胞转录组学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NPC43细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 540 | 2025-10-06 |
sEV-mediated intercellular transformation from MGAT4AHigh to MGAT4ALow tumor cells via the HOTAIRM1/miR-196b-5p axis promotes apoptosis resistance in CTCL
2025-Jun, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03356-6
PMID:40155530
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研究论文 | 本研究揭示了sEV介导的HOTAIRM1/miR-196b-5p/MGAT4A轴通过调控N-糖基化修饰诱导CTCL细胞凋亡抵抗的机制 | 首次发现MGAT4AHigh肿瘤细胞通过sEV传递miR-196b-5p将MGAT4ALow良性细胞转化为凋亡抵抗细胞,并开发了工程化sEV靶向治疗策略 | NA | 探究HOTAIRM1/miR-196b-5p/MGAT4A轴在皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)凋亡抵抗中的作用机制 | CTCL肿瘤细胞、良性CD4+T细胞、小细胞外囊泡(sEVs) | 分子生物学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 全转录组测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |