单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202506-202506] [清除筛选条件]
当前共找到 717 篇文献,本页显示第 521 - 540 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
521 2025-10-06
C-C Chemokine Receptor 2 is a Tissue Biomarker for Abdominal Aortic Aneurysmal and Occlusive Disease
2025-Jun-11, Annals of surgery IF:7.5Q1
研究论文 本研究评估CCR2作为主动脉疾病严重程度的组织生物标志物,特别是在腹主动脉瘤患者中的应用价值 首次系统评估CCR2在腹主动脉瘤和闭塞性疾病中的表达特征,并通过单细胞RNA测序技术明确其主要表达细胞类型 样本量相对有限(42例),且为观察性研究,需要更大规模研究验证 探索CCR2作为主动脉疾病生物标志物的潜力 人类主动脉组织样本,包括非破裂和破裂腹主动脉瘤、主髂动脉闭塞性疾病及正常主动脉组织 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序,免疫组织化学,细胞因子检测 NA 组织样本,基因表达数据 42例个体主动脉组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
522 2025-10-06
SERPINA1 is a new frontier in cancer immunotherapy and drug targeting by pan-cancer analysis
2025-Jun-08, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过泛癌分析发现SERPINA1在癌症免疫治疗和药物靶向中的新作用 首次通过多组学数据库全面分析SERPINA1在多种癌症中的表达、预后价值及免疫调节功能 研究主要基于数据库分析,需要进一步实验验证 探索SERPINA1作为癌症免疫治疗和靶向治疗新靶点的潜力 多种癌症类型,重点关注乳腺癌和胶质瘤 生物信息学 多种癌症 单细胞测序,多组学分析,DNA甲基化分析,基因突变分析 NA 基因组数据,转录组数据,蛋白质组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,多组学分析 NA NA
523 2025-10-06
Establishment of M2 macrophage-related prognostic signature in pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-Jun-08, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞和批量RNA测序建立了胰腺导管腺癌中M2巨噬细胞相关的预后特征模型 首次在PDAC中鉴定出M2巨噬细胞的三种分化状态,并构建了基于M2标记基因的预后特征模型 研究结果仅为初步发现,需要通过体外/体内实验敲除特征基因或配体-受体对基因来验证其在巨噬细胞发育中的作用 探索M2巨噬细胞在胰腺导管腺癌中的潜在通讯机制和临床意义 胰腺导管腺癌(PDAC)中的M2巨噬细胞、恶性PDAC细胞和成纤维细胞 生物信息学 胰腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 批量RNA测序(bulk RNA-seq) LASSO算法 RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
524 2025-10-06
Glutamate transporter SLC1A6 promotes resistance to immunotherapy in cancer
2025-Jun-07, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 本研究探讨谷氨酸转运蛋白SLC1A6在癌症免疫治疗耐药中的作用机制 首次发现SLC1A6在免疫治疗耐药肿瘤中高表达,并证实其通过影响CD8⁺ T细胞功能介导耐药 研究主要基于膀胱癌和肺癌数据,需在其他癌种中验证 探究SLC1A6在癌症免疫治疗耐药中的作用及机制 膀胱癌和肺癌患者样本、CD8⁺ T细胞、体内肿瘤模型 癌症免疫学 膀胱癌,肺癌 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫荧光染色,转录组分析 NA 单细胞RNA测序数据,转录组数据,流式细胞数据,免疫荧光图像 膀胱癌新辅助免疫治疗患者队列,肺癌单细胞数据集,膀胱癌和肺癌转录组队列 NA 单细胞RNA测序,流式细胞术,转录组分析 NA NA
525 2025-10-06
Annexin A1-FPR1 Interaction in dendritic cells promotes immune microenvironment modulation in Thyroid Cancer
2025-Jun-07, Cell biology and toxicology IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析揭示甲状腺癌中树突状细胞通过ANXA1-FPR1相互作用调控免疫微环境的机制 首次发现ANXA1与FPR1在树突状细胞中的相互作用及其在甲状腺癌免疫调控中的关键作用 NA 探索甲状腺癌免疫微环境中树突状细胞的功能及其调控机制 甲状腺癌组织中的树突状细胞群体 单细胞生物学 甲状腺癌 单细胞RNA测序,转录组RNA测序,meta分析 NA 单细胞RNA测序数据,转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序,转录组测序 NA NA
526 2025-10-06
Integrating spatial and single-cell transcriptomics to characterize mouse long bone fracture healing process
2025-Jun-07, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过整合空间转录组学和单细胞转录组学技术,系统表征了小鼠长骨骨折愈合过程中的细胞定位和相互作用 优化了使用Morse溶液的去钙化方法显著提高RNA质量,结合Visium CytAssist平台和多种分析工具,首次实现了骨折愈合过程中关键细胞群体的精确定位和转化过程解析 研究仅限于小鼠模型,且仅分析了骨折后特定时间点(第0、5、15天),未能覆盖完整愈合过程的所有阶段 阐明骨折愈合过程中细胞间的协调相互作用和分子调控机制 小鼠股骨骨折模型 空间转录组学 骨折 空间转录组学, 单细胞转录组学 NA 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 小鼠股骨骨折模型在骨折前(第0天)和骨折后第5、15天的时间点 10x Genomics 空间转录组学 Visium CytAssist Visium CytAssist空间转录组平台
527 2025-10-06
Unraveling the genetic blueprint of doxorubicin-induced cardiotoxicity through systems genetics approaches
2025-Jun-03, Cardio-oncology (London, England)
研究论文 本研究通过系统遗传学方法利用BXD重组近交系小鼠群体揭示多柔比星诱导心脏毒性的遗传基础 首次在BXD小鼠遗传参考群体中系统定位与多柔比星心脏毒性相关的数量性状位点和候选基因 研究仅限于小鼠模型,需要进一步在人类中验证候选基因的功能 阐明多柔比星诱导心脏毒性的遗传机制 BXD重组近交系小鼠群体(58个品系)及亲本C57BL/6J和DBA/2J小鼠 系统遗传学 心血管疾病 数量性状位点定位、孟德尔随机化分析、超声心动图、单细胞RNA测序 遗传定位模型 基因型数据、表型数据、生存数据、心脏功能数据 58个BXD品系及亲本品系,每个品系每性别至少4只小鼠,总计超过464只3-4月龄小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
528 2025-10-06
mNSF: multi-sample non-negative spatial factorization
2025-Jun-02, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 提出一种用于多样本空间转录组数据分析的无对齐框架mNSF 将单样本空间因子分解扩展到多样本数据集,无需空间对齐即可建模样本特异性空间相关性 未明确说明方法在复杂生物系统中的适用性限制 开发多样本空间转录组数据的分析方法 多样本空间转录组数据 空间转录组学 NA 空间转录组学 非负空间因子分解 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
529 2025-10-06
Single-cell atlas of human gingiva unveils a NETs-related neutrophil subpopulation regulating periodontal immunity
2025-Jun, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 通过单细胞测序构建人牙龈单细胞图谱,揭示NETs相关中性粒细胞亚群在牙周免疫中的调控作用 首次在牙周炎中发现并鉴定NETs相关中性粒细胞亚群(NrNeu),揭示牙龈成纤维细胞通过MIF-CD74/CXCR4轴促进NETs产生的调控机制 NA 阐明NETs在牙周免疫病理中的具体功能和机制 健康个体和牙周炎患者的牙龈组织 单细胞生物学 牙周炎 单细胞RNA测序,高维加权基因共表达网络分析,伪时间分析,细胞间通讯分析 六种机器学习方法构建的预测模型 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
530 2025-10-06
RNA modification gene WDR4 facilitates tumor progression and immunotherapy resistance in breast cancer
2025-Jun, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究基于RNA修饰相关基因开发了RMscore评分系统,用于预测乳腺癌患者的治疗反应和生存结局 首次整合13种RNA修饰模式相关基因建立九基因标志物,并发现WDR4通过m7G修饰调控细胞周期和mTORC1信号通路 NA 探索RNA修饰相关基因在乳腺癌中的临床价值并建立治疗反应预测策略 乳腺癌患者 生物信息学 乳腺癌 批量转录组分析、单细胞转录组分析、基因组学分析、流式细胞术、免疫组织化学、免疫荧光染色 基因特征评分模型 转录组数据、基因组数据、实验数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
531 2025-10-06
Histone deacetylases facilitate Th17-cell differentiation and pathogenicity in autoimmune uveitis via CDK6/ID2 axis
2025-Jun, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究揭示了组蛋白去乙酰化酶通过CDK6/ID2轴促进Th17细胞分化和致病性在自身免疫性葡萄膜炎中的作用机制 首次发现HDACs通过CDK6/ID2正反馈环路调控Th17细胞分化和致病性的新机制 研究主要基于动物模型和体外实验,临床样本验证相对有限 探究组蛋白去乙酰化酶在自身免疫性葡萄膜炎发病机制中的作用 自身免疫性葡萄膜炎患者外周血单核细胞和实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型 免疫学 自身免疫性葡萄膜炎 单细胞RNA测序,流式细胞术,siRNA敲低,特异性抑制剂,过继转移实验 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型 单细胞转录组数据,流式细胞数据 AU患者PBMCs和EAU小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
532 2025-10-06
Comprehensive analysis based on IFN-γ and SASP related genes, bulk RNA and single-cell sequencing to evaluate the prognosis and immune landscape of stomach adenocarcinoma
2025-Jun, Genes & genomics IF:1.6Q3
研究论文 基于IFN-γ和SASP相关基因开发胃腺癌预后风险模型并评估免疫景观 首次结合IFN-γ和衰老相关分泌表型相关基因对胃腺癌进行分子分型,并整合bulk RNA和单细胞测序数据构建预后模型 数据主要来源于TCGA数据库,需要外部验证 识别胃腺癌分子亚型并开发预后风险模型 胃腺癌患者 生物信息学 胃腺癌 Cox回归分析, LASSO回归分析, 非负矩阵分解, 单细胞测序, bulk RNA测序 预后风险模型 基因组数据, 临床数据, 单细胞数据 TCGA数据库中的胃腺癌样本 NA 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 NA NA
533 2025-10-06
One probe fits all: a highly customizable modular RNA in situ hybridization platform expanding the application of SABER DNA probes
2025-Jun-01, Development (Cambridge, England)
研究论文 开发了一种高度可定制的模块化RNA原位杂交平台OneSABER,扩展了SABER DNA探针的应用 创建统一开放平台连接多种常用和新开发的原位杂交方法,使用单一类型DNA探针实现信号扩增 NA 开发通用型RNA原位杂交平台以简化实验流程并降低研究成本 再生性扁虫Macrostomum lignano和Schmidtea mediterranea的整体样本,以及福尔马林固定石蜡包埋的小鼠肠道切片 分子生物学 NA RNA原位杂交,信号扩增交换反应 NA 图像数据 多种生物样本包括扁虫和小鼠组织 NA RNA原位杂交,单重和多重检测,比色和荧光检测 OneSABER平台 基于SABER方法的模块化DNA探针系统,支持多种信号检测技术
534 2025-10-06
Long Noncoding RNA Interleukin 6 Antisense RNA 1 Promotes Inflammatory Effects in Lung Macrophages via Exosomes Through the S100A9/TLR4 Pathway in Chronic Obstructive Pulmonary Disease Progression
2025-Jun, MedComm IF:10.7Q1
研究论文 探讨长链非编码RNA IL6-AS1通过外泌体和S100A9/TLR4通路在慢性阻塞性肺疾病进展中促进肺部炎症的作用机制 首次揭示IL6-AS1通过外泌体介导的S100A9/TLR4通路促进成纤维细胞与巨噬细胞间通讯,加剧COPD肺部炎症 研究主要基于小鼠模型和细胞共培养系统,人类样本验证相对有限 阐明IL6-AS1在COPD发病机制中的具体作用机制 小鼠模型、COPD患者样本、肺成纤维细胞-巨噬细胞共培养系统 分子生物学 慢性阻塞性肺疾病 单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析、腺相关病毒转染 NA 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 小鼠模型和COPD患者样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
535 2025-10-06
scEVE: a single-cell RNA-seq ensemble clustering algorithm capitalizing on the differences of predictions between multiple clustering methods
2025-Jun, NAR genomics and bioinformatics IF:4.0Q1
研究论文 开发了一种名为scEVE的单细胞RNA测序集成聚类算法,通过利用多种聚类方法预测差异而非最小化差异来改进细胞群体识别 提出了一种新的集成聚类方法,通过描述聚类结果之间的差异而不是最小化差异,能够生成具有不确定性值和多分辨率的聚类结果 NA 开发改进的单细胞RNA测序集成聚类算法 单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 集成聚类算法 基因表达数据 15个实验数据集和最多1200个合成数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
536 2025-10-06
KRT5high TP63-expressing urothelial basal cells act as a driver to bladder urothelium regeneration in rabbit
2025-Jun-07, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序鉴定KRT5high TP63表达基底细胞作为膀胱尿路上皮再生的驱动细胞,并开发了基于胶囊血管床的膀胱组织工程策略 首次在兔模型中证实KRT5high TP63表达基底细胞具有干细胞特性,能够分化为中间层和表层伞状细胞,并建立了基于胶囊血管床的尿路上皮组织工程新方法 研究仅在兔模型中进行,尚未在更高等动物或人体验证;样本量未明确说明 探索膀胱尿路上皮再生的细胞机制并开发组织工程修复策略 兔膀胱尿路上皮基底细胞 组织工程 膀胱疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
537 2025-10-06
Heterogeneous characteristics of γδ T cells in peripheral blood of diffuse large B-cell lymphoma
2025-Jun-07, Biomarker research IF:9.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了弥漫性大B细胞淋巴瘤患者外周血中γδ T细胞的异质性特征及其与预后的关联 首次在DLBCL患者外周血中系统鉴定出6个功能各异的γδ T细胞亚群,并发现TIGIT+ γδ T细胞亚群与不良预后显著相关 样本量较小(6例患者和3例健康个体),需要在更大队列中验证研究结果 阐明DLBCL患者外周血中γδ T细胞的异质性及其临床相关性 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者和健康个体的外周血样本 单细胞基因组学 弥漫性大B细胞淋巴瘤 单细胞RNA测序, 流式细胞术 共识聚类, 伪时间分析 单细胞转录组数据 9个血液样本(6例DLBCL患者和3例健康个体) NA 单细胞RNA测序 NA NA
538 2025-10-06
Cholangiocytes contribute to hepatocyte regeneration after partial liver injury during growth spurt in zebrafish
2025-Jun-06, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过建立斑马鱼部分肝损伤模型,揭示了在快速生长期胆管细胞通过转分化为肝细胞参与肝脏再生的机制 首次在快速生长期动物模型中证明胆管细胞是新生肝细胞的主要来源,并发现mTORC1信号通路调控胆管细胞可塑性 研究仅限于斑马鱼模型,尚未在哺乳动物中验证 探究快速生长期肝脏再生的细胞来源和分子机制 斑马鱼肝脏 发育生物学 肝损伤 单细胞转录组测序,谱系追踪,基因组编辑 NA 基因表达数据,谱系追踪数据 斑马鱼部分肝损伤模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
539 2025-10-06
RAN potentiates nuclear export of phosphorylated AMPK, reshaping lipid metabolism and impairing immune efficacy in lung adenocarcinoma
2025-Jun-06, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究探讨RAN通过调节磷酸化AMPK核输出影响脂质代谢,从而削弱肺腺癌免疫治疗效果的机制 首次揭示RAN通过调控p-AMPK核输出重塑脂质代谢并影响免疫治疗效果的分子机制 样本量较小(n=15),需要更大规模研究验证 探索肺腺癌免疫治疗反应差异的代谢机制 肺腺癌患者和细胞系 单细胞转录组学 肺腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 15例患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
540 2025-10-06
Identification of immune-associated genes and single-cell sequencing analysis in diagnosing Behçet's disease
2025-Jun-06, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 通过批量测序和单细胞测序分析白塞病的免疫景观并鉴定新的诊断生物标志物 首次在单细胞分辨率下探索单核细胞在白塞病发生发展中的作用,并通过机器学习筛选出5个新的潜在诊断标志物 研究主要依赖公共数据库数据,实验验证仅限于小鼠模型 识别白塞病的免疫相关基因并开发诊断方法 白塞病患者和小鼠模型 生物信息学 白塞病 批量测序,单细胞测序,qRT-PCR LASSO 基因表达数据 来自GEO数据库的白塞病数据和小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
回到顶部