单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 721 篇文献，本页显示第 501 - 520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2025-10-06 |
eIF5A maintains intestinal epithelial homeostasis by sustaining intestinal stem cells
2025-Jun-09, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-025-00243-z
PMID:40488929
|
研究论文 | 本研究揭示了eIF5A通过调控线粒体翻译维持肠道干细胞功能和肠道上皮稳态的关键作用 | 首次发现eIF5A通过调控线粒体翻译来维持肠道干细胞功能和肠道上皮稳态的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和肠道类器官，尚未在人类样本中验证 | 探究eIF5A在肠道上皮稳态维持中的功能及其分子机制 | 小鼠肠道上皮细胞、肠道干细胞、肠道类器官 | 细胞生物学 | 肠道疾病 | 条件性基因敲除、质谱分析、单细胞RNA测序、线粒体功能检测 | NA | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、功能实验数据 | 成年小鼠肠道上皮细胞和肠道类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 502 | 2025-10-06 |
Prognostic and immune modulatory effects of ammonia-induced cell death in head and neck squamous cell carcinoma
2025-Jun-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02508-0
PMID:40490575
|
研究论文 | 本研究探讨了氨诱导细胞死亡在头颈部鳞状细胞癌中的预后价值和免疫调节作用 | 首次建立氨死亡特征作为HNSC的新型预后生物标志物，揭示了氨代谢与肿瘤进展和免疫抑制的关联 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 评估氨诱导细胞死亡在头颈部鳞状细胞癌中的预后意义和免疫调节机制 | 头颈部鳞状细胞癌患者和单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 随机生存森林，单细胞RNA测序，ssGSEA，TIP分析 | RSF，Cox回归 | 转录组数据，单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 503 | 2025-10-06 |
Single-cell chromatin accessibility profiling reveals regulatory mechanisms and evolution in pig brains
2025-Jun-09, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02263-2
PMID:40490756
|
研究论文 | 通过单细胞染色质可及性测序揭示猪大脑的调控机制和进化特征 | 首次在家猪和野猪大脑中进行大规模单细胞染色质可及性分析，揭示了少突胶质细胞祖细胞可能具有更快的进化速率，并发现猪在阿尔茨海默病研究中的模型优势 | 研究仅聚焦于大脑皮层和小脑区域，未涵盖全脑所有区域；样本数量相对有限 | 探究猪大脑的调控机制及其在进化过程中的变化 | 家猪和野猪的大脑皮层和小脑细胞 | 单细胞基因组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞染色质可及性测序，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞测序数据 | 71,798个细胞 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 504 | 2025-10-06 |
Comprehensive analysis of immunoglobulin expression in the mouse brain from embryonic to adult stages
2025-Jun-09, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03457-9
PMID:40490799
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫球蛋白谱分析，系统揭示了小鼠大脑从胚胎到成年阶段免疫球蛋白的表达谱 | 首次全面阐明大脑中免疫球蛋白从胚胎到成年的表达动态，发现小胶质细胞和神经元表达特定Ig亚型，并揭示其与B细胞不同的表达调控机制 | 研究仅限于小鼠模型，人类大脑中的表达情况尚不清楚；功能验证实验相对有限 | 探究免疫球蛋白在小鼠大脑发育过程中的表达特征和潜在功能 | 小鼠大脑组织（从胚胎到成年阶段） | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序，免疫球蛋白谱分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠大脑多个发育阶段样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 505 | 2025-10-06 |
Exploring the causal links between inflammation-related genes and atherosclerosis through Mendelian randomization analysis
2025-Jun-06, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000042584
PMID:40489880
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化分析探索炎症相关基因与动脉粥样硬化之间的因果关系 | 整合多组学数据和单细胞RNA测序技术，系统分析颈动脉粥样硬化中关键基因在不同细胞类型中的表达特征 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证 | 阐明动脉粥样硬化的分子机制和潜在治疗靶点 | 动脉粥样硬化斑块中的基因表达谱和细胞类型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析 | DESeq2, clusterProfiler, Cytoscape, TwoSampleMR | 基因表达数据 | 多个公共数据集(GSE198600, GSE120521, GSE253903, GSE224273) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 506 | 2025-10-06 |
Spatial Heterogeneity of Macrophages in the Human Lung
2025-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.30.657106
PMID:40501812
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究人肺不同解剖结构中巨噬细胞亚群的空间分布特征 | 首次报告人肺巨噬细胞亚群按肺解剖结构的分数积累，并引入新的三级层次命名法 | 样本量较小（仅8名供体），仅关注吸烟因素而未涉及其他肺部疾病 | 确定转录定义的人巨噬细胞在主要肺解剖结构中的分布，以及吸烟引起的分布和编程变化 | 人肺组织中的间质巨噬细胞和肺泡巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序，显微解剖，免疫荧光显微镜 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 8名无肺部疾病的人类供体（4名吸烟者和4名非吸烟者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 507 | 2025-10-06 |
Microglia activation orchestrates CXCL10-mediated CD8+ T cell recruitment to promote aging-related white matter degeneration
2025-Jun, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-01955-w
PMID:40404995
|
研究论文 | 本研究揭示小胶质细胞激活通过CXCL10介导的CD8+ T细胞招募促进衰老相关白质退化的机制 | 首次阐明小胶质细胞功能障碍通过CXCL10-CXCR3轴招募CD8+ T细胞导致衰老白质退化的完整机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性需进一步验证 | 探究衰老过程中小胶质细胞功能与白质退化的关系 | 小鼠白质组织中的小胶质细胞和CD8+ T细胞 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组测序,空间转录组学,药理学方法,遗传学方法 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 508 | 2025-10-06 |
Intrathecal nivolumab and IL-2 for treatment of leptomeningeal metastases in EGFR-mutated lung adenocarcinoma
2025-Jun, Lung cancer (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.lungcan.2025.108586
PMID:40412102
|
病例报告 | 本研究报道了首例使用鞘内注射纳武利尤单抗联合IL-2治疗EGFR突变肺腺癌软脑膜转移的病例 | 首次报道鞘内联合免疫疗法在标准治疗失败的NSCLC软脑膜转移患者中的临床应用，并通过单细胞测序揭示免疫机制 | 单病例报告，样本量有限，需要前瞻性研究进一步验证 | 评估鞘内注射纳武利尤单抗联合IL-2治疗EGFR突变肺腺癌软脑膜转移的疗效和安全性 | 一例对多种EGFR酪氨酸激酶抑制剂和既往鞘内治疗耐药的NSCLC软脑膜转移患者 | 临床医学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患者，治疗前后脑脊液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 509 | 2025-10-06 |
l-Cysteine Alleviates Peritoneal Fibrosis by Repressing PKM2 in Peritoneal Mesothelial Cells
2025-Jun-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500229R
PMID:40497367
|
研究论文 | 本研究探讨了L-半胱氨酸通过抑制PKM2缓解腹膜纤维化的分子机制 | 首次揭示PKM2通过乙酰化H3K9促进SNAI2表达进而诱导间皮-间质转化的新机制 | 分子机制研究主要基于体外实验，需要更多体内实验验证 | 探索腹膜纤维化的发病机制及治疗策略 | 腹膜间皮细胞和腹膜透析患者 | 分子生物学 | 腹膜纤维化 | 单细胞RNA测序, 免疫共沉淀, 染色质免疫沉淀, 基因沉默 | NA | 单细胞RNA测序数据, 分子实验数据 | 长期腹膜透析患者的腹腔积液细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 510 | 2025-10-06 |
Filtering for Highly Variable Genes and High-Quality Spots Improves Phylogenetic Analysis of Cancer Spatial Transcriptomics Visium Data
2025-Jun-11, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2024.0614
PMID:40495757
|
研究论文 | 探索通过筛选高变异基因和高质量位点来改进癌症空间转录组学Visium数据系统发育分析的方法 | 首次在空间转录组学数据中应用高变异基因筛选和考虑RNA捕获异质性的预处理方法，改进了系统发育重建的准确性 | 仅针对Visium平台数据，方法在其他空间转录组技术中的适用性有待验证 | 开发优化的空间转录组数据预处理流程以提高癌症系统发育分析的准确性 | 癌症空间转录组学数据 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组测序 | 系统发育分析模型 | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间转录组学平台 |
| 511 | 2025-10-06 |
C-C Chemokine Receptor 2 is a Tissue Biomarker for Abdominal Aortic Aneurysmal and Occlusive Disease
2025-Jun-11, Annals of surgery
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/SLA.0000000000006778
PMID:40495781
|
研究论文 | 本研究评估CCR2作为主动脉疾病严重程度的组织生物标志物，特别是在腹主动脉瘤患者中的应用价值 | 首次系统评估CCR2在腹主动脉瘤和闭塞性疾病中的表达特征，并通过单细胞RNA测序技术明确其主要表达细胞类型 | 样本量相对有限（42例），且为观察性研究，需要更大规模研究验证 | 探索CCR2作为主动脉疾病生物标志物的潜力 | 人类主动脉组织样本，包括非破裂和破裂腹主动脉瘤、主髂动脉闭塞性疾病及正常主动脉组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，细胞因子检测 | NA | 组织样本，基因表达数据 | 42例个体主动脉组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 512 | 2025-10-06 |
SERPINA1 is a new frontier in cancer immunotherapy and drug targeting by pan-cancer analysis
2025-Jun-08, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02832-5
PMID:40483643
|
研究论文 | 通过泛癌分析发现SERPINA1在癌症免疫治疗和药物靶向中的新作用 | 首次通过多组学数据库全面分析SERPINA1在多种癌症中的表达、预后价值及免疫调节功能 | 研究主要基于数据库分析，需要进一步实验验证 | 探索SERPINA1作为癌症免疫治疗和靶向治疗新靶点的潜力 | 多种癌症类型，重点关注乳腺癌和胶质瘤 | 生物信息学 | 多种癌症 | 单细胞测序,多组学分析,DNA甲基化分析,基因突变分析 | NA | 基因组数据,转录组数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,多组学分析 | NA | NA |
| 513 | 2025-10-06 |
Establishment of M2 macrophage-related prognostic signature in pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-Jun-08, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02838-z
PMID:40483657
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序建立了胰腺导管腺癌中M2巨噬细胞相关的预后特征模型 | 首次在PDAC中鉴定出M2巨噬细胞的三种分化状态，并构建了基于M2标记基因的预后特征模型 | 研究结果仅为初步发现，需要通过体外/体内实验敲除特征基因或配体-受体对基因来验证其在巨噬细胞发育中的作用 | 探索M2巨噬细胞在胰腺导管腺癌中的潜在通讯机制和临床意义 | 胰腺导管腺癌(PDAC)中的M2巨噬细胞、恶性PDAC细胞和成纤维细胞 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 批量RNA测序(bulk RNA-seq) | LASSO算法 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 514 | 2025-10-06 |
Glutamate transporter SLC1A6 promotes resistance to immunotherapy in cancer
2025-Jun-07, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04074-4
PMID:40481876
|
研究论文 | 本研究探讨谷氨酸转运蛋白SLC1A6在癌症免疫治疗耐药中的作用机制 | 首次发现SLC1A6在免疫治疗耐药肿瘤中高表达，并证实其通过影响CD8⁺ T细胞功能介导耐药 | 研究主要基于膀胱癌和肺癌数据，需在其他癌种中验证 | 探究SLC1A6在癌症免疫治疗耐药中的作用及机制 | 膀胱癌和肺癌患者样本、CD8⁺ T细胞、体内肿瘤模型 | 癌症免疫学 | 膀胱癌,肺癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫荧光染色,转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,转录组数据,流式细胞数据,免疫荧光图像 | 膀胱癌新辅助免疫治疗患者队列,肺癌单细胞数据集,膀胱癌和肺癌转录组队列 | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术,转录组分析 | NA | NA |
| 515 | 2025-10-06 |
Annexin A1-FPR1 Interaction in dendritic cells promotes immune microenvironment modulation in Thyroid Cancer
2025-Jun-07, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-025-10042-6
PMID:40483281
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析揭示甲状腺癌中树突状细胞通过ANXA1-FPR1相互作用调控免疫微环境的机制 | 首次发现ANXA1与FPR1在树突状细胞中的相互作用及其在甲状腺癌免疫调控中的关键作用 | NA | 探索甲状腺癌免疫微环境中树突状细胞的功能及其调控机制 | 甲状腺癌组织中的树突状细胞群体 | 单细胞生物学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序,转录组RNA测序,meta分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 516 | 2025-10-06 |
Integrating spatial and single-cell transcriptomics to characterize mouse long bone fracture healing process
2025-Jun-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08316-0
PMID:40483363
|
研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单细胞转录组学技术，系统表征了小鼠长骨骨折愈合过程中的细胞定位和相互作用 | 优化了使用Morse溶液的去钙化方法显著提高RNA质量，结合Visium CytAssist平台和多种分析工具，首次实现了骨折愈合过程中关键细胞群体的精确定位和转化过程解析 | 研究仅限于小鼠模型，且仅分析了骨折后特定时间点（第0、5、15天），未能覆盖完整愈合过程的所有阶段 | 阐明骨折愈合过程中细胞间的协调相互作用和分子调控机制 | 小鼠股骨骨折模型 | 空间转录组学 | 骨折 | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | 小鼠股骨骨折模型在骨折前（第0天）和骨折后第5、15天的时间点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium CytAssist | Visium CytAssist空间转录组平台 |
| 517 | 2025-10-06 |
Unraveling the genetic blueprint of doxorubicin-induced cardiotoxicity through systems genetics approaches
2025-Jun-03, Cardio-oncology (London, England)
DOI:10.1186/s40959-025-00349-y
PMID:40462234
|
研究论文 | 本研究通过系统遗传学方法利用BXD重组近交系小鼠群体揭示多柔比星诱导心脏毒性的遗传基础 | 首次在BXD小鼠遗传参考群体中系统定位与多柔比星心脏毒性相关的数量性状位点和候选基因 | 研究仅限于小鼠模型，需要进一步在人类中验证候选基因的功能 | 阐明多柔比星诱导心脏毒性的遗传机制 | BXD重组近交系小鼠群体（58个品系）及亲本C57BL/6J和DBA/2J小鼠 | 系统遗传学 | 心血管疾病 | 数量性状位点定位、孟德尔随机化分析、超声心动图、单细胞RNA测序 | 遗传定位模型 | 基因型数据、表型数据、生存数据、心脏功能数据 | 58个BXD品系及亲本品系，每个品系每性别至少4只小鼠，总计超过464只3-4月龄小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 518 | 2025-10-06 |
mNSF: multi-sample non-negative spatial factorization
2025-Jun-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03601-x
PMID:40457480
|
研究论文 | 提出一种用于多样本空间转录组数据分析的无对齐框架mNSF | 将单样本空间因子分解扩展到多样本数据集，无需空间对齐即可建模样本特异性空间相关性 | 未明确说明方法在复杂生物系统中的适用性限制 | 开发多样本空间转录组数据的分析方法 | 多样本空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 非负空间因子分解 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 519 | 2025-10-06 |
Insights of immune cell heterogeneity, tumor-initiated subtype transformation, drug resistance, treatment and detecting technologies in glioma microenvironment
2025-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.07.033
PMID:39097088
|
综述 | 全面分析胶质瘤微环境中免疫细胞异质性、亚型转化机制及其对化疗耐药和治疗策略的影响 | 系统阐述胶质瘤诱导免疫细胞亚型转化的具体机制，并探索单细胞测序技术在免疫细胞亚型研究中的应用潜力 | NA | 深入理解胶质瘤微环境中免疫细胞的异质性及其在肿瘤进展和治疗中的作用 | 胶质瘤微环境中的中性粒细胞、巨噬细胞、淋巴细胞、髓源性抑制细胞等主要免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 胶质瘤 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 520 | 2025-10-06 |
Single-cell atlas of human gingiva unveils a NETs-related neutrophil subpopulation regulating periodontal immunity
2025-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.07.028
PMID:39084404
|
研究论文 | 通过单细胞测序构建人牙龈单细胞图谱，揭示NETs相关中性粒细胞亚群在牙周免疫中的调控作用 | 首次在牙周炎中发现并鉴定NETs相关中性粒细胞亚群(NrNeu)，揭示牙龈成纤维细胞通过MIF-CD74/CXCR4轴促进NETs产生的调控机制 | NA | 阐明NETs在牙周免疫病理中的具体功能和机制 | 健康个体和牙周炎患者的牙龈组织 | 单细胞生物学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序，高维加权基因共表达网络分析，伪时间分析，细胞间通讯分析 | 六种机器学习方法构建的预测模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |