单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 717 篇文献，本页显示第 501 - 520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2025-10-06 |
Integration of single-cell and spatial transcriptomics by SEU-TCA reveals the spatial origin of early cardiac progenitors
2025-Jun-10, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03633-3
PMID:40495257
|
研究论文 | 开发SEU-TCA方法提高单细胞空间映射精度，并应用于小鼠原肠胚形成研究 | 利用迁移成分分析开发SEU-TCA方法，显著提升单细胞空间映射准确性 | NA | 提高空间转录组学中单细胞空间定位的准确性 | 小鼠原肠胚形成过程中的心脏前体细胞 | 空间转录组学 | 先天性心脏病 | 单细胞转录组测序, 空间转录组测序 | 迁移成分分析 | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | 多个单细胞和空间转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 502 | 2025-10-06 |
Age-Dependent Clonal Expansion of Non-Sperm-Forming Spermatogonial Stem Cells in Mouse Testes
2025-Jun, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70019
PMID:39985763
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和谱系追踪揭示了老年小鼠睾丸中不形成精子的精原干细胞克隆的年龄依赖性扩增现象 | 首次发现老年小鼠睾丸中存在不参与精子形成的精原干细胞克隆，这些克隆在睾丸开放微环境中发生空间扩增 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他哺乳动物中验证 | 阐明生理衰老对睾丸开放微环境中精原干细胞克隆命运行为的影响 | 年轻和老年小鼠的精原干细胞 | 单细胞生物学 | 生殖衰老 | 单细胞RNA测序, 谱系追踪, 活体实时成像 | NA | 单细胞转录组数据, 成像数据 | 年轻和老年小鼠睾丸组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 503 | 2025-10-06 |
A Single-Cell Transcriptome Atlas Characterizes the Immune Landscape of Human Testes During Aging
2025-Jun, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70032
PMID:40051066
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了人类睾丸在衰老过程中的免疫细胞图谱 | 首次系统揭示了人类睾丸中免疫细胞在衰老过程中的变化特征，发现单核细胞和MRC1组织驻留巨噬细胞随年龄变化的规律 | 样本数量相对有限（33例），年龄跨度较大但样本分布可能不均 | 探究衰老对人类睾丸免疫细胞的影响 | 人类睾丸组织样本 | 单细胞组学 | 生殖系统衰老 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 33例人类睾丸样本（年龄21-69岁） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 504 | 2025-10-06 |
Macrophage Subpopulation Promotes Skeletal Muscle Regeneration Through HGF/MET Signaling-Mediated Skeletal Muscle Stem Cell Proliferation
2025-Jun, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70042
PMID:40132988
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现Mac_1巨噬细胞亚群通过HGF/MET信号通路促进骨骼肌干细胞增殖，从而驱动骨骼肌再生 | 首次在单细胞水平鉴定出促进骨骼肌再生的特异性巨噬细胞亚群，并阐明其通过HGF/c-Met信号通路调控肌肉干细胞增殖的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究巨噬细胞亚群在骨骼肌再生中的作用机制及与年龄相关再生障碍的关系 | 年轻(8周)和老年(24个月)小鼠的骨骼肌组织、肌肉卫星细胞、巨噬细胞亚群 | 单细胞生物学 | 肌肉疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻和老年小鼠骨骼肌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 505 | 2025-10-06 |
The transcriptomes, connections and development of submucosal neuron classes in the mouse small intestine
2025-Jun, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-01962-x
PMID:40442499
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小鼠小肠黏膜下神经丛的神经元分类、连接和发育过程 | 发现了两个新的分泌运动神经元类别和一个先前未被识别的黏膜下内在初级传入神经元类别，并揭示了它们与肠嗜铬细胞的意外紧密关联 | 研究仅限于小鼠小肠模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 解析肠道黏膜下神经丛的神经元组成和发育机制 | 小鼠小肠黏膜下神经丛神经元 | 单细胞生物学 | 消化系统疾病 | 单细胞RNA测序，病毒介导标记，谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据，形态学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 506 | 2025-10-06 |
T2T-CHM13 versus hg38: accurate identification of immunoglobulin isotypes from scRNA-seq requires a genome reference matched for ancestry
2025-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf074
PMID:40503052
|
研究论文 | 比较T2T-CHM13和hg38基因组参考在单细胞RNA测序中准确识别免疫球蛋白同种型的能力 | 首次证明基因组参考序列的祖先起源对免疫球蛋白同种型准确识别的重要性 | 研究样本的遗传背景有限，仅测试了欧洲和东亚来源的样本 | 评估不同基因组参考序列在单细胞RNA测序中识别免疫球蛋白同种型的准确性 | B细胞和抗体分泌细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 507 | 2025-10-06 |
Grape-Derived Exosome-Like Nanovesicles Effectively Ameliorate Skin Photoaging by Protecting Epithelial Cells
2025-Jun, Journal of food science
IF:3.2Q2
DOI:10.1111/1750-3841.70309
PMID:40504599
|
研究论文 | 本研究探讨葡萄来源的外泌体样纳米颗粒对光老化皮肤的保护作用及机制 | 首次发现葡萄来源的外泌体样纳米颗粒可通过调节上皮细胞增殖分化有效改善皮肤光老化 | 未明确说明样本量及具体作用机制细节 | 开发新型抗光老化治疗方法 | 光老化皮肤及上皮细胞 | 皮肤生物学 | 皮肤光老化 | 单细胞测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 508 | 2025-10-06 |
Machine learning-driven construction and validation of an intra-tumoral heterogeneity-associated prognostic model for bladder urothelial carcinoma
2025-Jun-11, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering
IF:1.7Q3
DOI:10.1080/10255842.2025.2516767
PMID:40500142
|
研究论文 | 本研究构建并验证了一个基于肿瘤内异质性相关基因的膀胱尿路上皮癌预后模型 | 首次结合LASSO和随机生存森林算法开发14基因预后特征，并通过单细胞RNA测序分析验证模型基因的表达模式 | 研究依赖于公共数据库数据，缺乏前瞻性验证 | 构建膀胱尿路上皮癌的预后预测模型 | 膀胱尿路上皮癌患者 | 机器学习 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | LASSO,随机生存森林 | 转录组数据,临床数据 | 多个公共队列数据 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 509 | 2025-10-06 |
Differentiation of lung tissue-resident c-Kit+ cells into microvascular endothelial cells alleviates pulmonary vascular remodeling
2025-Jun-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.01.010
PMID:39909047
|
研究论文 | 本研究揭示了肺组织驻留c-Kit+细胞通过分化为微血管内皮细胞缓解肺血管重构的机制 | 首次阐明肺组织驻留c-Kit+细胞在肺血管重构中的保护作用及其通过NR2F2调控的分化机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证仍需进一步研究 | 探究肺c-Kit细胞分化在肺血管重构中的作用机制 | 肺组织驻留c-Kit+细胞及其分化的内皮细胞 | 病理生理学 | 肺动脉高压 | 遗传谱系追踪,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | SU5416/低氧诱导的肺血管重构小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 510 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics reveals tryptophan metabolism restricting maturation of intratumoral tertiary lymphoid structures
2025-Jun-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.03.011
PMID:40185093
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学揭示色氨酸代谢抑制肝细胞癌内三级淋巴结构成熟的机制 | 首次发现恶性细胞塑造的色氨酸富集代谢微环境导致三级淋巴结构成熟偏离，并证明抑制色氨酸代谢可促进三级淋巴结构成熟并增强免疫治疗效果 | 研究主要聚焦于肝细胞癌，在其他癌种中的普适性需要进一步验证 | 探究三级淋巴结构成熟机制及其对免疫治疗的影响 | 肝细胞癌中的三级淋巴结构及其微环境 | 空间转录组学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 近单细胞空间转录组图谱 |
| 511 | 2025-10-06 |
eIF5A maintains intestinal epithelial homeostasis by sustaining intestinal stem cells
2025-Jun-09, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-025-00243-z
PMID:40488929
|
研究论文 | 本研究揭示了eIF5A通过调控线粒体翻译维持肠道干细胞功能和肠道上皮稳态的关键作用 | 首次发现eIF5A通过调控线粒体翻译来维持肠道干细胞功能和肠道上皮稳态的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和肠道类器官，尚未在人类样本中验证 | 探究eIF5A在肠道上皮稳态维持中的功能及其分子机制 | 小鼠肠道上皮细胞、肠道干细胞、肠道类器官 | 细胞生物学 | 肠道疾病 | 条件性基因敲除、质谱分析、单细胞RNA测序、线粒体功能检测 | NA | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、功能实验数据 | 成年小鼠肠道上皮细胞和肠道类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 512 | 2025-10-06 |
Prognostic and immune modulatory effects of ammonia-induced cell death in head and neck squamous cell carcinoma
2025-Jun-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02508-0
PMID:40490575
|
研究论文 | 本研究探讨了氨诱导细胞死亡在头颈部鳞状细胞癌中的预后价值和免疫调节作用 | 首次建立氨死亡特征作为HNSC的新型预后生物标志物，揭示了氨代谢与肿瘤进展和免疫抑制的关联 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 评估氨诱导细胞死亡在头颈部鳞状细胞癌中的预后意义和免疫调节机制 | 头颈部鳞状细胞癌患者和单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 随机生存森林，单细胞RNA测序，ssGSEA，TIP分析 | RSF，Cox回归 | 转录组数据，单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 513 | 2025-10-06 |
Single-cell chromatin accessibility profiling reveals regulatory mechanisms and evolution in pig brains
2025-Jun-09, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02263-2
PMID:40490756
|
研究论文 | 通过单细胞染色质可及性测序揭示猪大脑的调控机制和进化特征 | 首次在家猪和野猪大脑中进行大规模单细胞染色质可及性分析，揭示了少突胶质细胞祖细胞可能具有更快的进化速率，并发现猪在阿尔茨海默病研究中的模型优势 | 研究仅聚焦于大脑皮层和小脑区域，未涵盖全脑所有区域；样本数量相对有限 | 探究猪大脑的调控机制及其在进化过程中的变化 | 家猪和野猪的大脑皮层和小脑细胞 | 单细胞基因组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞染色质可及性测序，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞测序数据 | 71,798个细胞 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 514 | 2025-10-06 |
Comprehensive analysis of immunoglobulin expression in the mouse brain from embryonic to adult stages
2025-Jun-09, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03457-9
PMID:40490799
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫球蛋白谱分析，系统揭示了小鼠大脑从胚胎到成年阶段免疫球蛋白的表达谱 | 首次全面阐明大脑中免疫球蛋白从胚胎到成年的表达动态，发现小胶质细胞和神经元表达特定Ig亚型，并揭示其与B细胞不同的表达调控机制 | 研究仅限于小鼠模型，人类大脑中的表达情况尚不清楚；功能验证实验相对有限 | 探究免疫球蛋白在小鼠大脑发育过程中的表达特征和潜在功能 | 小鼠大脑组织（从胚胎到成年阶段） | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序，免疫球蛋白谱分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠大脑多个发育阶段样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 515 | 2025-10-06 |
Exploring the causal links between inflammation-related genes and atherosclerosis through Mendelian randomization analysis
2025-Jun-06, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000042584
PMID:40489880
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化分析探索炎症相关基因与动脉粥样硬化之间的因果关系 | 整合多组学数据和单细胞RNA测序技术，系统分析颈动脉粥样硬化中关键基因在不同细胞类型中的表达特征 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证 | 阐明动脉粥样硬化的分子机制和潜在治疗靶点 | 动脉粥样硬化斑块中的基因表达谱和细胞类型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析 | DESeq2, clusterProfiler, Cytoscape, TwoSampleMR | 基因表达数据 | 多个公共数据集(GSE198600, GSE120521, GSE253903, GSE224273) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 516 | 2025-10-06 |
Spatial Heterogeneity of Macrophages in the Human Lung
2025-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.30.657106
PMID:40501812
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究人肺不同解剖结构中巨噬细胞亚群的空间分布特征 | 首次报告人肺巨噬细胞亚群按肺解剖结构的分数积累，并引入新的三级层次命名法 | 样本量较小（仅8名供体），仅关注吸烟因素而未涉及其他肺部疾病 | 确定转录定义的人巨噬细胞在主要肺解剖结构中的分布，以及吸烟引起的分布和编程变化 | 人肺组织中的间质巨噬细胞和肺泡巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序，显微解剖，免疫荧光显微镜 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 8名无肺部疾病的人类供体（4名吸烟者和4名非吸烟者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 517 | 2025-10-06 |
Microglia activation orchestrates CXCL10-mediated CD8+ T cell recruitment to promote aging-related white matter degeneration
2025-Jun, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-01955-w
PMID:40404995
|
研究论文 | 本研究揭示小胶质细胞激活通过CXCL10介导的CD8+ T细胞招募促进衰老相关白质退化的机制 | 首次阐明小胶质细胞功能障碍通过CXCL10-CXCR3轴招募CD8+ T细胞导致衰老白质退化的完整机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性需进一步验证 | 探究衰老过程中小胶质细胞功能与白质退化的关系 | 小鼠白质组织中的小胶质细胞和CD8+ T细胞 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组测序,空间转录组学,药理学方法,遗传学方法 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 518 | 2025-10-06 |
Intrathecal nivolumab and IL-2 for treatment of leptomeningeal metastases in EGFR-mutated lung adenocarcinoma
2025-Jun, Lung cancer (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.lungcan.2025.108586
PMID:40412102
|
病例报告 | 本研究报道了首例使用鞘内注射纳武利尤单抗联合IL-2治疗EGFR突变肺腺癌软脑膜转移的病例 | 首次报道鞘内联合免疫疗法在标准治疗失败的NSCLC软脑膜转移患者中的临床应用，并通过单细胞测序揭示免疫机制 | 单病例报告，样本量有限，需要前瞻性研究进一步验证 | 评估鞘内注射纳武利尤单抗联合IL-2治疗EGFR突变肺腺癌软脑膜转移的疗效和安全性 | 一例对多种EGFR酪氨酸激酶抑制剂和既往鞘内治疗耐药的NSCLC软脑膜转移患者 | 临床医学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患者，治疗前后脑脊液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 519 | 2025-10-06 |
l-Cysteine Alleviates Peritoneal Fibrosis by Repressing PKM2 in Peritoneal Mesothelial Cells
2025-Jun-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500229R
PMID:40497367
|
研究论文 | 本研究探讨了L-半胱氨酸通过抑制PKM2缓解腹膜纤维化的分子机制 | 首次揭示PKM2通过乙酰化H3K9促进SNAI2表达进而诱导间皮-间质转化的新机制 | 分子机制研究主要基于体外实验，需要更多体内实验验证 | 探索腹膜纤维化的发病机制及治疗策略 | 腹膜间皮细胞和腹膜透析患者 | 分子生物学 | 腹膜纤维化 | 单细胞RNA测序, 免疫共沉淀, 染色质免疫沉淀, 基因沉默 | NA | 单细胞RNA测序数据, 分子实验数据 | 长期腹膜透析患者的腹腔积液细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 520 | 2025-10-06 |
Filtering for Highly Variable Genes and High-Quality Spots Improves Phylogenetic Analysis of Cancer Spatial Transcriptomics Visium Data
2025-Jun-11, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2024.0614
PMID:40495757
|
研究论文 | 探索通过筛选高变异基因和高质量位点来改进癌症空间转录组学Visium数据系统发育分析的方法 | 首次在空间转录组学数据中应用高变异基因筛选和考虑RNA捕获异质性的预处理方法，改进了系统发育重建的准确性 | 仅针对Visium平台数据，方法在其他空间转录组技术中的适用性有待验证 | 开发优化的空间转录组数据预处理流程以提高癌症系统发育分析的准确性 | 癌症空间转录组学数据 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组测序 | 系统发育分析模型 | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间转录组学平台 |