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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
481 2025-10-06
Autophagy-related gene SQSTM1 predicts the prognosis of hepatocellular carcinoma
2025-Jun, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1
研究论文 本研究基于自噬相关基因构建了肝细胞癌预后预测模型,并筛选出核心基因SQSTM1 结合机器学习与蛋白质相互作用网络分析筛选核心基因SQSTM1,发现其在肿瘤相关巨噬细胞中显著分布 机制研究尚不完善,需要进一步实验验证 构建肝细胞癌预后预测模型并探索治疗靶点 肝细胞癌患者 生物信息学 肝细胞癌 生物信息学分析,机器学习,单细胞测序 预后风险模型,机器学习 基因表达数据 TCGA、GEO和ICGC数据库中的肝细胞癌样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
482 2025-10-06
Single-cell RNA sequencing reveals altered placental microenvironment due to maternal high-fat diet
2025-Jun-26, Placenta IF:3.0Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序技术研究母体高脂饮食对胎盘微环境的改变 首次在单细胞水平揭示母体高脂饮食导致胎盘微环境炎症特征增强和代谢特性异常 研究仅使用小鼠模型,需要在人类样本中进一步验证 探究母体高脂饮食对胎盘微环境的影响及其与子代代谢疾病的关联 C57BL/6J小鼠胎盘组织 单细胞组学 代谢疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 高脂饮食组和对照组小鼠胎盘组织(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
483 2025-10-06
New insights into the pharmacological mechanisms of Jinqi Jiangtang Tablets in the treatment of type 2 diabetes mellitus: A multi-omics approach combined with experimental validation
2025-Jun-26, Journal of ethnopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过多组学方法结合实验验证揭示了金芪降糖片治疗2型糖尿病的药理机制 首次结合网络药理学、单细胞RNA测序、代谢组学和肠道微生物组学系统阐明金芪降糖片的多靶点、多通路作用机制 研究主要基于计算预测和实验验证,临床转化效果需进一步验证 阐明金芪降糖片治疗2型糖尿病的活性成分和作用机制 2型糖尿病患者相关靶点和金芪降糖片活性成分 生物信息学 2型糖尿病 LC-MS, 单细胞RNA测序, 代谢组学, 16S rDNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟 网络药理学, PPI网络分析, ssGSEA, CIBERSORT 组学数据, 实验数据 NA NA 单细胞RNA测序, 代谢组学, 16S rDNA测序 NA NA
484 2025-10-06
The Dynamically Evolving Cell States and Ecosystem from Benign Nevi to Melanoma
2025-Jun-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序揭示了从良性痣到黑色素瘤演变过程中的细胞状态动态变化和关键机制 首次在先天性黑色素细胞痣发展为黑色素瘤的患者中,通过多部位配对组织单细胞测序识别了四个不同的黑色素细胞亚群状态及其功能动态变化 样本量较小(仅5名患者),且仅针对先天性黑色素细胞痣来源的黑色素瘤 探索从良性痣向黑色素瘤恶性转化的动态变化机制和关键驱动因素 来自5名先天性黑色素细胞痣发展为黑色素瘤患者的多个配对组织部位 单细胞生物学 黑色素瘤 单细胞转录组测序,bulk RNA测序 恶性进展预测模型 单细胞RNA测序数据,bulk RNA测序数据 5名患者的多部位配对组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
485 2025-10-06
Impact of HLA alloimmunization on clinical outcomes of severe aplastic anemia treated with immunosuppressive therapy
2025-Jun-10, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 研究HLA同种免疫对接受免疫抑制治疗的严重再生障碍性贫血患者临床结局的影响 首次在大型iAA患者队列中系统评估HLA同种免疫的临床意义,并利用单细胞RNA测序揭示免疫机制 研究基于5项前瞻性试验的观察性数据,需要进一步验证 探讨HLA同种免疫在免疫性再生障碍性贫血中的临床相关性 444名接受免疫抑制治疗的严重再生障碍性贫血患者 血液病学 再生障碍性贫血 单细胞RNA测序 NA 临床数据、测序数据 444例患者(其中99例存在HLA同种免疫) NA 单细胞RNA测序 NA NA
486 2025-10-06
Multi-omics analysis of tumor necrosis factor superfamily 4 reveals its prognostic value with T cell exhaustion feature in cancer
2025-Jun-10, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过多组学分析揭示TNFSF4在泛癌中的预后价值及其与T细胞耗竭特征的关系 首次在泛癌水平系统分析TNFSF4的表达特征、预后价值及其与T细胞耗竭的关联 主要基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证和机制研究 探究TNFSF4在泛癌中的表达模式、预后价值及其在免疫调节中的作用 TCGA和GEO数据库中的多种癌症样本 生物信息学 泛癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫组化染色, 基因集富集分析 Cox回归模型, 相关性分析 RNA测序数据, 临床数据, 单细胞测序数据 TCGA数据库的多种癌症样本和GEO数据库的免疫治疗队列 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
487 2025-10-06
Multi-omics analysis of canine aging markers and evaluation of stem cell intervention
2025-Jun-10, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 通过多组学技术分析犬类衰老标志物并评估干细胞干预效果 首次在犬类中鉴定出9个衰老相关细胞群和9个跨物种保守的CD8+T细胞衰老标志物,发现两个一致的代谢衰老标志物,并证明过表达NMNAT1的间充质干细胞可延缓或逆转犬类衰老 样本规模有限,研究结果需要在更大群体中验证 探索犬类衰老的分子机制并开发抗衰老干预策略 不同年龄的犬类 生物医学 老年疾病 单细胞RNA测序, 多组学技术 NA 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据 不同年龄的犬类样本 NA single-cell RNA-seq, 多组学分析 NA NA
488 2025-10-06
spaMGCN: a graph convolutional network with autoencoder for spatial domain identification using multi-scale adaptation
2025-Jun-10, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 提出一种基于图卷积网络和自编码器的空间域识别方法spaMGCN,专门用于处理离散组织分布 整合空间转录组和空间表观基因组数据,采用多尺度自适应图卷积网络,特别针对离散组织分布进行优化 NA 开发能够有效识别离散空间域的空间转录组分析方法 小鼠脾脏中的离散T细胞区域和人类淋巴结中的滤泡细胞 空间转录组学 NA 空间转录组学,空间表观基因组学 图卷积网络(GCN),自编码器 空间转录组数据,空间表观基因组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
489 2025-10-06
Integration of single-cell and spatial transcriptomics by SEU-TCA reveals the spatial origin of early cardiac progenitors
2025-Jun-10, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 开发SEU-TCA方法提高单细胞空间映射精度,并应用于小鼠原肠胚形成研究 利用迁移成分分析开发SEU-TCA方法,显著提升单细胞空间映射准确性 NA 提高空间转录组学中单细胞空间定位的准确性 小鼠原肠胚形成过程中的心脏前体细胞 空间转录组学 先天性心脏病 单细胞转录组测序, 空间转录组测序 迁移成分分析 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 多个单细胞和空间转录组数据集 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
490 2025-10-06
SLC6A6-Mediated Taurine Uptake Sustains Corneal Epithelial Stem/Progenitor Cell Function to Counteract Age-Related Dysfunction
2025-Jun-02, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 本研究揭示了SLC6A6介导的牛磺酸转运在维持角膜缘干细胞功能及对抗年龄相关功能障碍中的作用 首次发现SLC6A6介导的牛磺酸摄取通过Notch1信号通路调控角膜缘干细胞稳态,为年龄相关性角膜疾病提供了新的治疗策略 研究主要基于小鼠模型和细胞系,需要进一步验证在人类角膜组织中的适用性 阐明SLC6A6介导的牛磺酸转运在维持角膜缘干细胞功能及年龄相关性角膜愈合中的作用机制 C57BL/6J小鼠角膜组织、小鼠角膜上皮干细胞/祖细胞(TKE2细胞) 干细胞生物学 角膜疾病 液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)、单细胞RNA测序、定量PCR、免疫荧光染色、转录组分析 NA 基因表达数据、蛋白质数据、代谢物浓度数据 小鼠角膜组织样本和TKE2细胞系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
491 2025-10-06
Age-Dependent Clonal Expansion of Non-Sperm-Forming Spermatogonial Stem Cells in Mouse Testes
2025-Jun, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和谱系追踪揭示了老年小鼠睾丸中不形成精子的精原干细胞克隆的年龄依赖性扩增现象 首次发现老年小鼠睾丸中存在不参与精子形成的精原干细胞克隆,这些克隆在睾丸开放微环境中发生空间扩增 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类或其他哺乳动物中验证 阐明生理衰老对睾丸开放微环境中精原干细胞克隆命运行为的影响 年轻和老年小鼠的精原干细胞 单细胞生物学 生殖衰老 单细胞RNA测序, 谱系追踪, 活体实时成像 NA 单细胞转录组数据, 成像数据 年轻和老年小鼠睾丸组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
492 2025-10-06
A Single-Cell Transcriptome Atlas Characterizes the Immune Landscape of Human Testes During Aging
2025-Jun, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序构建了人类睾丸在衰老过程中的免疫细胞图谱 首次系统揭示了人类睾丸中免疫细胞在衰老过程中的变化特征,发现单核细胞和MRC1组织驻留巨噬细胞随年龄变化的规律 样本数量相对有限(33例),年龄跨度较大但样本分布可能不均 探究衰老对人类睾丸免疫细胞的影响 人类睾丸组织样本 单细胞组学 生殖系统衰老 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 33例人类睾丸样本(年龄21-69岁) NA 单细胞RNA-seq NA NA
493 2025-10-06
Macrophage Subpopulation Promotes Skeletal Muscle Regeneration Through HGF/MET Signaling-Mediated Skeletal Muscle Stem Cell Proliferation
2025-Jun, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序发现Mac_1巨噬细胞亚群通过HGF/MET信号通路促进骨骼肌干细胞增殖,从而驱动骨骼肌再生 首次在单细胞水平鉴定出促进骨骼肌再生的特异性巨噬细胞亚群,并阐明其通过HGF/c-Met信号通路调控肌肉干细胞增殖的分子机制 研究主要基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 探究巨噬细胞亚群在骨骼肌再生中的作用机制及与年龄相关再生障碍的关系 年轻(8周)和老年(24个月)小鼠的骨骼肌组织、肌肉卫星细胞、巨噬细胞亚群 单细胞生物学 肌肉疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 年轻和老年小鼠骨骼肌样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
494 2025-10-06
The transcriptomes, connections and development of submucosal neuron classes in the mouse small intestine
2025-Jun, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示小鼠小肠黏膜下神经丛的神经元分类、连接和发育过程 发现了两个新的分泌运动神经元类别和一个先前未被识别的黏膜下内在初级传入神经元类别,并揭示了它们与肠嗜铬细胞的意外紧密关联 研究仅限于小鼠小肠模型,尚未在人类或其他物种中验证 解析肠道黏膜下神经丛的神经元组成和发育机制 小鼠小肠黏膜下神经丛神经元 单细胞生物学 消化系统疾病 单细胞RNA测序,病毒介导标记,谱系追踪 NA 单细胞转录组数据,形态学数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
495 2025-10-06
Identification and Mapping of Human Lymph Node Stromal Cell Subsets by Combining Single-Cell RNA Sequencing with Spatial Transcriptomics
2025-Jun, European journal of immunology IF:4.5Q2
研究论文 通过结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,识别并定位人类淋巴结基质细胞亚群 首次系统鉴定人类淋巴结基质细胞的10个成纤维细胞亚型,并通过空间转录组学预测其在淋巴结组织中的定位 研究样本数量有限,仅分析了13个淋巴结供体的数据 解析人类淋巴结基质细胞的异质性及其空间分布特征 人类淋巴结基质细胞 单细胞生物学 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 9267个淋巴结基质细胞,来自13个淋巴结供体 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
496 2025-10-06
T2T-CHM13 versus hg38: accurate identification of immunoglobulin isotypes from scRNA-seq requires a genome reference matched for ancestry
2025-Jun, NAR genomics and bioinformatics IF:4.0Q1
研究论文 比较T2T-CHM13和hg38基因组参考在单细胞RNA测序中准确识别免疫球蛋白同种型的能力 首次证明基因组参考序列的祖先起源对免疫球蛋白同种型准确识别的重要性 研究样本的遗传背景有限,仅测试了欧洲和东亚来源的样本 评估不同基因组参考序列在单细胞RNA测序中识别免疫球蛋白同种型的准确性 B细胞和抗体分泌细胞 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
497 2025-10-06
Grape-Derived Exosome-Like Nanovesicles Effectively Ameliorate Skin Photoaging by Protecting Epithelial Cells
2025-Jun, Journal of food science IF:3.2Q2
研究论文 本研究探讨葡萄来源的外泌体样纳米颗粒对光老化皮肤的保护作用及机制 首次发现葡萄来源的外泌体样纳米颗粒可通过调节上皮细胞增殖分化有效改善皮肤光老化 未明确说明样本量及具体作用机制细节 开发新型抗光老化治疗方法 光老化皮肤及上皮细胞 皮肤生物学 皮肤光老化 单细胞测序 NA 测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
498 2025-10-06
Machine learning-driven construction and validation of an intra-tumoral heterogeneity-associated prognostic model for bladder urothelial carcinoma
2025-Jun-11, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering IF:1.7Q3
研究论文 本研究构建并验证了一个基于肿瘤内异质性相关基因的膀胱尿路上皮癌预后模型 首次结合LASSO和随机生存森林算法开发14基因预后特征,并通过单细胞RNA测序分析验证模型基因的表达模式 研究依赖于公共数据库数据,缺乏前瞻性验证 构建膀胱尿路上皮癌的预后预测模型 膀胱尿路上皮癌患者 机器学习 膀胱癌 单细胞RNA测序,转录组分析 LASSO,随机生存森林 转录组数据,临床数据 多个公共队列数据 NA 单细胞RNA测序,转录组测序 NA NA
499 2025-10-06
Differentiation of lung tissue-resident c-Kit+ cells into microvascular endothelial cells alleviates pulmonary vascular remodeling
2025-Jun-09, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 本研究揭示了肺组织驻留c-Kit+细胞通过分化为微血管内皮细胞缓解肺血管重构的机制 首次阐明肺组织驻留c-Kit+细胞在肺血管重构中的保护作用及其通过NR2F2调控的分化机制 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步研究 探究肺c-Kit细胞分化在肺血管重构中的作用机制 肺组织驻留c-Kit+细胞及其分化的内皮细胞 病理生理学 肺动脉高压 遗传谱系追踪,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据,单细胞测序数据 SU5416/低氧诱导的肺血管重构小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
500 2025-10-06
Spatial transcriptomics reveals tryptophan metabolism restricting maturation of intratumoral tertiary lymphoid structures
2025-Jun-09, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学揭示色氨酸代谢抑制肝细胞癌内三级淋巴结构成熟的机制 首次发现恶性细胞塑造的色氨酸富集代谢微环境导致三级淋巴结构成熟偏离,并证明抑制色氨酸代谢可促进三级淋巴结构成熟并增强免疫治疗效果 研究主要聚焦于肝细胞癌,在其他癌种中的普适性需要进一步验证 探究三级淋巴结构成熟机制及其对免疫治疗的影响 肝细胞癌中的三级淋巴结构及其微环境 空间转录组学 肝细胞癌 空间转录组学 NA 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA 近单细胞空间转录组图谱
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