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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2025-10-06 |
Embryological cellular origins and hypoxia-mediated mechanisms in PIK3CA-driven refractory vascular malformations
2025-Jun, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-025-00235-1
PMID:40234712
|
研究论文 | 本研究通过在小鼠心脏咽中胚层表达Pik3ca基因探究血管畸形的发病机制 | 首次揭示胚胎细胞起源和缺氧信号通路在PIK3CA驱动难治性血管畸形中的关键作用 | 动物模型研究结果需在人类中进一步验证 | 探究先天性血管畸形的发病机制 | 小鼠模型和人类血管畸形样本 | 发育生物学 | 血管畸形 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 462 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals the interaction between fibroblasts and activated immune cells: an exploratory bioinformatics study of pro-inflammatory mechanisms in slow transit constipation
2025-Jun-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002415
PMID:40265474
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序探索慢传输型便秘中成纤维细胞与活化免疫细胞相互作用的促炎机制 | 首次在STC患者中鉴定出特异性XCL2+CD8+T细胞,并揭示其通过IFNG和TNFSF14信号通路增强成纤维细胞促炎因子分泌的新机制 | 样本量较小(6例STC患者和6例对照),属于探索性生物信息学研究 | 阐明慢传输型便秘患者免疫微环境特征及免疫细胞与基质细胞相互作用的分子机制 | 慢传输型便秘患者和对照个体的肠道组织样本 | 生物信息学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例STC患者和6例对照个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 463 | 2025-10-06 |
Extended culture of 2D gastruloids to model human mesoderm development
2025-Jun, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02669-4
PMID:40335707
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研究论文 | 本研究开发了一种可延长培养至10天的2D胃泌体模型,用于模拟人类中胚层发育过程 | 将2D胃泌体培养时间从2天延长至10天,发现了第2-4天高度可重复的形态发生阶段 | 未明确说明样本规模和技术重复次数 | 建立扩展的2D胃泌体模型以研究人类中胚层发育 | 人类多能干细胞衍生的2D胃泌体 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | 2D胃泌体模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 464 | 2025-10-06 |
Microglial MS4A4A Protects against Epileptic Seizures in Alzheimer's Disease
2025-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417733
PMID:40349168
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研究论文 | 本研究揭示了微胶质细胞中MS4A4A基因通过增强吞噬作用对阿尔茨海默病中癫痫发作的保护机制 | 首次发现MS4A4A在癫痫脑损伤组织中特异性高表达于微胶质细胞,并阐明其通过调节钙内流和线粒体代谢功能介导吞噬作用的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究MS4A4A基因在阿尔茨海默病相关癫痫发作中的保护作用机制 | 淀粉样β蛋白驱动的阿尔茨海默病小鼠模型和癫痫患者脑组织 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 465 | 2025-10-06 |
Influenza A virus dissemination and infection leads to tissue resident cell injury and dysfunction in viral sepsis
2025-Jun, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105738
PMID:40367638
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研究论文 | 本研究通过建立小鼠病毒性败血症模型,揭示了甲型H1N1流感病毒通过血液传播感染肺外器官导致细胞死亡和器官功能障碍的机制 | 首次通过单细胞测序技术系统比较病毒性败血症和细菌性败血症中肺部和肝脏细胞组成及基因表达差异,揭示流感病毒通过血液传播感染肺外器官的特异性病理机制 | 研究仅使用C57BL/6J雄性小鼠模型,未涉及其他品系或雌性动物;样本量相对有限 | 探究流感病毒引起的病毒性败血症中肺外器官损伤的病理机制 | C57BL/6J雄性小鼠 | 单细胞生物学 | 病毒性败血症 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多组小鼠在不同感染时间点的肺部和肝脏组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 466 | 2025-10-06 |
Integrating Spatial and Single-Nucleus Transcriptomic Data to Assess the Effects of Intrauterine Hyperglycemia on Fetal Pancreatic Development
2025-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202411126
PMID:40387171
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研究论文 | 本研究整合空间转录组学和单核RNA测序数据,评估宫内高血糖对胎儿胰腺发育的影响 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术,系统揭示母体糖尿病对胎儿胰腺细胞功能和细胞间通讯的空间特异性影响 | 研究仅针对E16.5和E18.5两个发育时间点,未能覆盖更完整的发育过程 | 探究母体糖尿病对胎儿胰腺发育的分子机制和空间变化 | E16.5和E18.5胎鼠胰腺组织 | 空间转录组学 | 糖尿病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间基因表达数据 | E16.5和E18.5两个发育阶段的胎儿胰腺样本 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 467 | 2025-06-16 |
Integrating spatial transcriptomics and single-cell RNA-seq dissects immune microenvironment in fatty liver regeneration
2025-Jun, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70365
PMID:40515443
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 468 | 2025-10-06 |
Endothelial CLEC5A drives barrier dysfunction and vascular leakage responsible for lung injury in bacterial pneumonia and sepsis
2025-Jun-13, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adt7589
PMID:40498836
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研究论文 | 本研究揭示了内皮细胞CLEC5A在细菌性肺炎和脓毒症中驱动屏障功能障碍和血管渗漏导致肺损伤的机制 | 首次发现内皮细胞CLEC5A在调节内皮屏障功能中的关键作用,并证明其作为肺炎或脓毒症治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究CLEC5A在内皮屏障功能障碍和血管渗漏中的作用机制 | 小鼠内皮细胞、单核细胞/中性粒细胞 | 分子生物学 | 肺炎、脓毒症 | 单细胞RNA测序、基因敲除、体外细胞培养 | NA | 基因表达数据、生理指标数据 | 基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 469 | 2025-10-06 |
Early differentiation of committed erythroid cells defined by miR-144/451 expression
2025-Jun-12, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjae057
PMID:39777529
|
研究论文 | 本研究通过miR-144/451-eGFP敲入小鼠模型揭示了红系祖细胞早期分化的新标志物 | 首次发现miR-144/451表达可作为CMP中红系祖细胞早期分化的定义标志 | 研究仅限于小鼠模型,人类红系分化机制可能有所不同 | 阐明红系祖细胞在CMP发育阶段的早期分化机制 | miR-144/451-eGFP敲入小鼠的骨髓造血祖细胞 | 发育生物学 | 红细胞发育相关疾病 | 单细胞RNA测序,基因敲入技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 敲入小鼠模型的红系祖细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 470 | 2025-10-06 |
Spatial organization, chromatin accessibility and gene-regulatory programs defining mouse sensory neurons
2025-Jun-11, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08315-1
PMID:40500276
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,构建了小鼠感觉神经元的综合图谱,揭示了细胞类型特异性染色质可及性和基因调控程序 | 首次结合高质量scRNA-seq数据集和MERFISH空间转录组学技术,识别了先前未知的神经元类型,并揭示了神经元和非神经元细胞的空间分区模式 | 研究仅限于小鼠模型,结果向人类转化的适用性需要进一步验证 | 解析感觉神经元异质性的调控机制和空间组织特征 | 小鼠背根神经节中的44,000多个神经元 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,染色质可及性分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,染色质可及性数据 | 超过44,000个神经元 | Vizgen | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | MERSCOPE | MERSCOPE空间转录组技术 |
| 471 | 2025-10-06 |
Loss of LAPTM4A inhibits M2 polarization of tumor-associated macrophages in glioblastoma, promoting immune activation and enhancing anti-PD1 therapy
2025-Jun-11, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08147-z
PMID:40500284
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研究论文 | 本研究探讨LAPTM4A缺失对胶质母细胞瘤中肿瘤相关巨噬细胞极化的影响及其在调节抗肿瘤免疫中的作用 | 首次揭示LAPTM4A通过促进TAMs向M2表型极化驱动胶质瘤进展,并证明其缺失可增强抗PD-1治疗敏感性 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探索LAPTM4A在胶质瘤免疫微环境调节中的功能机制 | C57BL/6雄性小鼠原位胶质瘤模型及肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,体外共培养系统,体内抗PD-1治疗实验 | 小鼠原位胶质瘤模型 | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 472 | 2025-10-06 |
Mechanisms of organotropism in breast cancer and predicting metastasis to distant organs using deep learning
2025-Jun-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02905-5
PMID:40500539
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和深度学习技术探索乳腺癌器官趋向性转移的分子机制 | 结合单细胞RNA测序、bulk RNA测序、ChIP-seq数据和深度神经网络模型系统分析乳腺癌器官特异性转移机制 | 仅分析了骨、脑、肝、肺四个转移器官,未涵盖其他可能的转移部位 | 探索乳腺癌器官趋向性转移的分子机制并开发预测模型 | 乳腺癌及其向骨、脑、肝、肺的转移病灶 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,ChIP-seq,深度学习 | 深度神经网络(DNN) | 基因表达数据,表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,ChIP-seq | NA | NA |
| 473 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome reveals the reprogramming of immune microenvironment during the transition from MASH to HCC
2025-Jun-11, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02370-2
PMID:40500691
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了从代谢功能障碍相关脂肪性肝炎向肝细胞癌转变过程中免疫微环境的重编程过程 | 首次在单细胞水平描绘MASH向HCC转变过程中的免疫景观变化,并发现ApoE在MASH驱动肝癌发生中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,需要进一步在人类样本中验证 | 阐明MASH驱动HCC转变过程中的免疫学景观变化,识别导致MASH相关HCC发病机制的关键基因 | STAM小鼠模型中的CD45+免疫细胞,包括正常饮食、MASH以及配对癌旁和癌组织 | 单细胞组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,多重免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据 | 31,822个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 474 | 2025-10-06 |
OTUD1 exacerbates sepsis-associated encephalopathy by promoting HK2 mitochondrial release to drive microglia pyroptosis
2025-Jun-11, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03480-w
PMID:40500776
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研究论文 | 本研究揭示了OTUD1通过促进HK2从线粒体解离驱动小胶质细胞焦亡,从而加剧脓毒症相关脑病的机制 | 首次发现OTUD1-HK2轴在SAE中的调控作用,阐明OTUD1通过选择性K63连接去泛素化促进HK2从线粒体解离的新机制 | NA | 探讨OTUD1在脓毒症相关脑病发病机制中的作用 | 小鼠模型、原代小胶质细胞、BV2细胞系、临床样本 | 生物医学 | 脓毒症相关脑病 | 单细胞RNA测序, 分子对接, 共免疫沉淀, 免疫荧光, 蛋白质印迹, ELISA, qPCR | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 行为学数据, 组织学数据 | OTUD1基因敲除小鼠和野生型小鼠,原代细胞和细胞系,临床样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 475 | 2025-10-06 |
C5a/C5aR pathway blocking promoted CuS-mediated cancer therapy effect by inhibiting cuproptosis resistance
2025-Jun-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011472
PMID:40484643
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研究论文 | 本研究揭示了C5a/C5aR通路通过Wnt/β-catenin途径上调ATP7B表达导致铜死亡抵抗的机制,并证明联合CuS纳米颗粒与C5a受体拮抗剂可显著增强癌症治疗效果 | 首次证明C5a/C5aR通路介导的铜死亡抵抗机制,并开发了联合CuS纳米颗粒与C5aRA的新型协同治疗策略 | NA | 研究铜死亡抵抗机制并开发增强铜死亡治疗效果的新策略 | 乳腺癌细胞和异种移植小鼠模型 | 癌症治疗 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 生物信息学分析, 免疫组化, 流式细胞术, ELISA, 实时定量PCR, 蛋白质印迹 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 476 | 2025-10-06 |
Targeting TBK1 potentiates oncolytic virotherapy via amplifying ICAM1-mediated NK cell immunity in chemo-resistant colorectal cancer
2025-Jun-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-011455
PMID:40484646
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研究论文 | 本研究探索了通过联合使用溶瘤病毒和TBK1抑制剂治疗化疗耐药结直肠癌的新策略 | 首次揭示TBK1在化疗耐药结直肠癌中介导I型干扰素通路激活并损害病毒复制的机制,发现TBK1抑制剂与溶瘤病毒联合可增强ICAM1介导的NK细胞免疫 | 研究主要基于临床前模型,尚未在大型临床试验中验证 | 探索化疗耐药性对溶瘤病毒疗效的影响及联合治疗策略 | 化疗耐药结直肠癌 | 肿瘤免疫治疗 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,RNA测序分析,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 临床样本,体外和体内模型,患者来源类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 477 | 2025-10-06 |
Preclinical and clinical evaluation of intratumoral injection of an IL-12 expressing SKV-012 oncolytic virus for advanced solid tumors
2025-Jun-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011642
PMID:40484644
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研究论文 | 评估表达IL-12的溶瘤病毒SKV-012通过瘤内注射治疗晚期实体瘤的临床前和临床研究 | 开发了新型工程化溶瘤病毒SKV-012,结合了由Survivin启动子转录的ICP34.5基因和由CMV启动子驱动的IL-12基因 | 一期临床试验样本量较小,需要更大规模研究验证疗效 | 评估SKV-012溶瘤病毒在晚期实体瘤中的安全性和有效性 | 晚期实体瘤患者和临床前动物模型 | 肿瘤免疫治疗 | 实体瘤 | 溶瘤病毒治疗、免疫组织化学、单细胞转录组分析 | NA | 临床数据、实验室检测数据 | 6例晚期实体瘤患者(临床试验) | NA | 单细胞转录组分析 | NA | NA |
| 478 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing analysis reveals a lack of CXCL13+ T cell subsets associated with the recurrence of cervical squamous cell carcinoma following concurrent chemoradiotherapy
2025-Jun-04, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04083-3
PMID:40464813
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析宫颈鳞状细胞癌肿瘤微环境,揭示CXCL13+ T细胞亚群与CCRT治疗后复发的关系 | 首次在宫颈鳞癌中发现CXCL13+ T细胞亚群与肿瘤不复发的关联,并构建了基于CXCL13 T细胞特征的预测模型 | 样本量较小(仅6例患者),需要在更大队列中验证 | 探究宫颈鳞状细胞癌在同步放化疗后复发的免疫机制 | 宫颈鳞状细胞癌患者的肿瘤微环境细胞 | 单细胞测序分析 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 单细胞转录组数据 | 6例宫颈鳞癌患者(3例复发,3例未复发) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x单细胞测序平台 |
| 479 | 2025-10-06 |
OrthologAL: a Shiny application for quality-aware humanization of non-human pre-clinical high-dimensional gene expression data
2025-Jun-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf311
PMID:40392208
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研究论文 | 开发了一个名为OrthologAL的Shiny应用程序,用于将非人类临床前高维基因表达数据转换为人类直系同源基因数据 | 首个能够在不编写代码的情况下将非人类单细胞和空间转录组数据转换为人类直系同源基因数据的交互式应用程序 | 依赖Ensembl数据库的基因集,需要用户提供Seurat格式的数据 | 促进临床前研究中非人类转录组数据向人类直系同源基因的转换,以应用于药物转录组学分析 | 单细胞、单核和空间转录组数据,包括髓母细胞瘤患者来源的异种移植模型以及小鼠和大鼠脊髓损伤模型 | 生物信息学 | 髓母细胞瘤, 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 多个数据集,包括GSE129730、E-MTAB-11720、GSE213240和GSE234774 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组技术 |
| 480 | 2025-10-06 |
Combined spatially resolved metabolomics and spatial transcriptomics reveal the mechanism of RACK1-mediated fatty acid synthesis
2025-Jun, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.13752
PMID:39425259
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研究论文 | 本研究通过整合空间代谢组学和空间转录组学技术,揭示了RACK1通过AKT/mTOR/SREBP1信号通路促进脂肪酸合成并推动宫颈癌细胞生长的机制 | 首次结合空间代谢组学和空间转录组学技术,系统阐明了RACK1在宫颈癌脂质代谢中的调控作用及其分子机制 | 研究主要聚焦于宫颈癌,未验证在其他癌症类型中的普适性 | 探究RACK1在宫颈癌脂质代谢调控中的作用机制 | 宫颈癌样本和宫颈癌细胞 | 空间多组学 | 宫颈癌 | 空间代谢组学, 空间转录组学, 染色质免疫沉淀, 免疫共沉淀, 蛋白质印迹 | NA | 代谢组数据, 转录组数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 空间代谢组学, 空间转录组学 | NA | NA |