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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2025-10-06 |
Loss of LAPTM4A inhibits M2 polarization of tumor-associated macrophages in glioblastoma, promoting immune activation and enhancing anti-PD1 therapy
2025-Jun-11, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08147-z
PMID:40500284
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研究论文 | 本研究探讨LAPTM4A缺失对胶质母细胞瘤中肿瘤相关巨噬细胞极化的影响及其在调节抗肿瘤免疫中的作用 | 首次揭示LAPTM4A通过促进TAMs向M2表型极化驱动胶质瘤进展,并证明其缺失可增强抗PD-1治疗敏感性 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探索LAPTM4A在胶质瘤免疫微环境调节中的功能机制 | C57BL/6雄性小鼠原位胶质瘤模型及肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,体外共培养系统,体内抗PD-1治疗实验 | 小鼠原位胶质瘤模型 | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 462 | 2025-10-06 |
Mechanisms of organotropism in breast cancer and predicting metastasis to distant organs using deep learning
2025-Jun-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02905-5
PMID:40500539
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和深度学习技术探索乳腺癌器官趋向性转移的分子机制 | 结合单细胞RNA测序、bulk RNA测序、ChIP-seq数据和深度神经网络模型系统分析乳腺癌器官特异性转移机制 | 仅分析了骨、脑、肝、肺四个转移器官,未涵盖其他可能的转移部位 | 探索乳腺癌器官趋向性转移的分子机制并开发预测模型 | 乳腺癌及其向骨、脑、肝、肺的转移病灶 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,ChIP-seq,深度学习 | 深度神经网络(DNN) | 基因表达数据,表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,ChIP-seq | NA | NA |
| 463 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome reveals the reprogramming of immune microenvironment during the transition from MASH to HCC
2025-Jun-11, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02370-2
PMID:40500691
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了从代谢功能障碍相关脂肪性肝炎向肝细胞癌转变过程中免疫微环境的重编程过程 | 首次在单细胞水平描绘MASH向HCC转变过程中的免疫景观变化,并发现ApoE在MASH驱动肝癌发生中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,需要进一步在人类样本中验证 | 阐明MASH驱动HCC转变过程中的免疫学景观变化,识别导致MASH相关HCC发病机制的关键基因 | STAM小鼠模型中的CD45+免疫细胞,包括正常饮食、MASH以及配对癌旁和癌组织 | 单细胞组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,多重免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据 | 31,822个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 464 | 2025-10-06 |
OTUD1 exacerbates sepsis-associated encephalopathy by promoting HK2 mitochondrial release to drive microglia pyroptosis
2025-Jun-11, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03480-w
PMID:40500776
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研究论文 | 本研究揭示了OTUD1通过促进HK2从线粒体解离驱动小胶质细胞焦亡,从而加剧脓毒症相关脑病的机制 | 首次发现OTUD1-HK2轴在SAE中的调控作用,阐明OTUD1通过选择性K63连接去泛素化促进HK2从线粒体解离的新机制 | NA | 探讨OTUD1在脓毒症相关脑病发病机制中的作用 | 小鼠模型、原代小胶质细胞、BV2细胞系、临床样本 | 生物医学 | 脓毒症相关脑病 | 单细胞RNA测序, 分子对接, 共免疫沉淀, 免疫荧光, 蛋白质印迹, ELISA, qPCR | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 行为学数据, 组织学数据 | OTUD1基因敲除小鼠和野生型小鼠,原代细胞和细胞系,临床样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 465 | 2025-10-06 |
C5a/C5aR pathway blocking promoted CuS-mediated cancer therapy effect by inhibiting cuproptosis resistance
2025-Jun-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011472
PMID:40484643
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研究论文 | 本研究揭示了C5a/C5aR通路通过Wnt/β-catenin途径上调ATP7B表达导致铜死亡抵抗的机制,并证明联合CuS纳米颗粒与C5a受体拮抗剂可显著增强癌症治疗效果 | 首次证明C5a/C5aR通路介导的铜死亡抵抗机制,并开发了联合CuS纳米颗粒与C5aRA的新型协同治疗策略 | NA | 研究铜死亡抵抗机制并开发增强铜死亡治疗效果的新策略 | 乳腺癌细胞和异种移植小鼠模型 | 癌症治疗 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 生物信息学分析, 免疫组化, 流式细胞术, ELISA, 实时定量PCR, 蛋白质印迹 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 466 | 2025-10-06 |
Targeting TBK1 potentiates oncolytic virotherapy via amplifying ICAM1-mediated NK cell immunity in chemo-resistant colorectal cancer
2025-Jun-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-011455
PMID:40484646
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研究论文 | 本研究探索了通过联合使用溶瘤病毒和TBK1抑制剂治疗化疗耐药结直肠癌的新策略 | 首次揭示TBK1在化疗耐药结直肠癌中介导I型干扰素通路激活并损害病毒复制的机制,发现TBK1抑制剂与溶瘤病毒联合可增强ICAM1介导的NK细胞免疫 | 研究主要基于临床前模型,尚未在大型临床试验中验证 | 探索化疗耐药性对溶瘤病毒疗效的影响及联合治疗策略 | 化疗耐药结直肠癌 | 肿瘤免疫治疗 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,RNA测序分析,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 临床样本,体外和体内模型,患者来源类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 467 | 2025-10-06 |
Preclinical and clinical evaluation of intratumoral injection of an IL-12 expressing SKV-012 oncolytic virus for advanced solid tumors
2025-Jun-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011642
PMID:40484644
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研究论文 | 评估表达IL-12的溶瘤病毒SKV-012通过瘤内注射治疗晚期实体瘤的临床前和临床研究 | 开发了新型工程化溶瘤病毒SKV-012,结合了由Survivin启动子转录的ICP34.5基因和由CMV启动子驱动的IL-12基因 | 一期临床试验样本量较小,需要更大规模研究验证疗效 | 评估SKV-012溶瘤病毒在晚期实体瘤中的安全性和有效性 | 晚期实体瘤患者和临床前动物模型 | 肿瘤免疫治疗 | 实体瘤 | 溶瘤病毒治疗、免疫组织化学、单细胞转录组分析 | NA | 临床数据、实验室检测数据 | 6例晚期实体瘤患者(临床试验) | NA | 单细胞转录组分析 | NA | NA |
| 468 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing analysis reveals a lack of CXCL13+ T cell subsets associated with the recurrence of cervical squamous cell carcinoma following concurrent chemoradiotherapy
2025-Jun-04, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04083-3
PMID:40464813
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析宫颈鳞状细胞癌肿瘤微环境,揭示CXCL13+ T细胞亚群与CCRT治疗后复发的关系 | 首次在宫颈鳞癌中发现CXCL13+ T细胞亚群与肿瘤不复发的关联,并构建了基于CXCL13 T细胞特征的预测模型 | 样本量较小(仅6例患者),需要在更大队列中验证 | 探究宫颈鳞状细胞癌在同步放化疗后复发的免疫机制 | 宫颈鳞状细胞癌患者的肿瘤微环境细胞 | 单细胞测序分析 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 单细胞转录组数据 | 6例宫颈鳞癌患者(3例复发,3例未复发) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x单细胞测序平台 |
| 469 | 2025-10-06 |
OrthologAL: a Shiny application for quality-aware humanization of non-human pre-clinical high-dimensional gene expression data
2025-Jun-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf311
PMID:40392208
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研究论文 | 开发了一个名为OrthologAL的Shiny应用程序,用于将非人类临床前高维基因表达数据转换为人类直系同源基因数据 | 首个能够在不编写代码的情况下将非人类单细胞和空间转录组数据转换为人类直系同源基因数据的交互式应用程序 | 依赖Ensembl数据库的基因集,需要用户提供Seurat格式的数据 | 促进临床前研究中非人类转录组数据向人类直系同源基因的转换,以应用于药物转录组学分析 | 单细胞、单核和空间转录组数据,包括髓母细胞瘤患者来源的异种移植模型以及小鼠和大鼠脊髓损伤模型 | 生物信息学 | 髓母细胞瘤, 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 多个数据集,包括GSE129730、E-MTAB-11720、GSE213240和GSE234774 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组技术 |
| 470 | 2025-10-06 |
Combined spatially resolved metabolomics and spatial transcriptomics reveal the mechanism of RACK1-mediated fatty acid synthesis
2025-Jun, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.13752
PMID:39425259
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研究论文 | 本研究通过整合空间代谢组学和空间转录组学技术,揭示了RACK1通过AKT/mTOR/SREBP1信号通路促进脂肪酸合成并推动宫颈癌细胞生长的机制 | 首次结合空间代谢组学和空间转录组学技术,系统阐明了RACK1在宫颈癌脂质代谢中的调控作用及其分子机制 | 研究主要聚焦于宫颈癌,未验证在其他癌症类型中的普适性 | 探究RACK1在宫颈癌脂质代谢调控中的作用机制 | 宫颈癌样本和宫颈癌细胞 | 空间多组学 | 宫颈癌 | 空间代谢组学, 空间转录组学, 染色质免疫沉淀, 免疫共沉淀, 蛋白质印迹 | NA | 代谢组数据, 转录组数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 空间代谢组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 471 | 2025-10-06 |
Autophagy-related gene SQSTM1 predicts the prognosis of hepatocellular carcinoma
2025-Jun, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110358
PMID:40378566
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研究论文 | 本研究基于自噬相关基因构建了肝细胞癌预后预测模型,并筛选出核心基因SQSTM1 | 结合机器学习与蛋白质相互作用网络分析筛选核心基因SQSTM1,发现其在肿瘤相关巨噬细胞中显著分布 | 机制研究尚不完善,需要进一步实验验证 | 构建肝细胞癌预后预测模型并探索治疗靶点 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 生物信息学分析,机器学习,单细胞测序 | 预后风险模型,机器学习 | 基因表达数据 | TCGA、GEO和ICGC数据库中的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 472 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals altered placental microenvironment due to maternal high-fat diet
2025-Jun-26, Placenta
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.placenta.2025.04.011
PMID:40381453
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究母体高脂饮食对胎盘微环境的改变 | 首次在单细胞水平揭示母体高脂饮食导致胎盘微环境炎症特征增强和代谢特性异常 | 研究仅使用小鼠模型,需要在人类样本中进一步验证 | 探究母体高脂饮食对胎盘微环境的影响及其与子代代谢疾病的关联 | C57BL/6J小鼠胎盘组织 | 单细胞组学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 高脂饮食组和对照组小鼠胎盘组织(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 473 | 2025-10-06 |
New insights into the pharmacological mechanisms of Jinqi Jiangtang Tablets in the treatment of type 2 diabetes mellitus: A multi-omics approach combined with experimental validation
2025-Jun-26, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120020
PMID:40449695
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研究论文 | 本研究通过多组学方法结合实验验证揭示了金芪降糖片治疗2型糖尿病的药理机制 | 首次结合网络药理学、单细胞RNA测序、代谢组学和肠道微生物组学系统阐明金芪降糖片的多靶点、多通路作用机制 | 研究主要基于计算预测和实验验证,临床转化效果需进一步验证 | 阐明金芪降糖片治疗2型糖尿病的活性成分和作用机制 | 2型糖尿病患者相关靶点和金芪降糖片活性成分 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | LC-MS, 单细胞RNA测序, 代谢组学, 16S rDNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟 | 网络药理学, PPI网络分析, ssGSEA, CIBERSORT | 组学数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 代谢组学, 16S rDNA测序 | NA | NA |
| 474 | 2025-10-06 |
The Dynamically Evolving Cell States and Ecosystem from Benign Nevi to Melanoma
2025-Jun-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2971
PMID:40094420
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了从良性痣到黑色素瘤演变过程中的细胞状态动态变化和关键机制 | 首次在先天性黑色素细胞痣发展为黑色素瘤的患者中,通过多部位配对组织单细胞测序识别了四个不同的黑色素细胞亚群状态及其功能动态变化 | 样本量较小(仅5名患者),且仅针对先天性黑色素细胞痣来源的黑色素瘤 | 探索从良性痣向黑色素瘤恶性转化的动态变化机制和关键驱动因素 | 来自5名先天性黑色素细胞痣发展为黑色素瘤患者的多个配对组织部位 | 单细胞生物学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组测序,bulk RNA测序 | 恶性进展预测模型 | 单细胞RNA测序数据,bulk RNA测序数据 | 5名患者的多部位配对组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 475 | 2025-10-06 |
Impact of HLA alloimmunization on clinical outcomes of severe aplastic anemia treated with immunosuppressive therapy
2025-Jun-10, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024015301
PMID:40085951
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研究论文 | 研究HLA同种免疫对接受免疫抑制治疗的严重再生障碍性贫血患者临床结局的影响 | 首次在大型iAA患者队列中系统评估HLA同种免疫的临床意义,并利用单细胞RNA测序揭示免疫机制 | 研究基于5项前瞻性试验的观察性数据,需要进一步验证 | 探讨HLA同种免疫在免疫性再生障碍性贫血中的临床相关性 | 444名接受免疫抑制治疗的严重再生障碍性贫血患者 | 血液病学 | 再生障碍性贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、测序数据 | 444例患者(其中99例存在HLA同种免疫) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 476 | 2025-10-06 |
Multi-omics analysis of tumor necrosis factor superfamily 4 reveals its prognostic value with T cell exhaustion feature in cancer
2025-Jun-10, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02666-1
PMID:40493100
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研究论文 | 通过多组学分析揭示TNFSF4在泛癌中的预后价值及其与T细胞耗竭特征的关系 | 首次在泛癌水平系统分析TNFSF4的表达特征、预后价值及其与T细胞耗竭的关联 | 主要基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证和机制研究 | 探究TNFSF4在泛癌中的表达模式、预后价值及其在免疫调节中的作用 | TCGA和GEO数据库中的多种癌症样本 | 生物信息学 | 泛癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫组化染色, 基因集富集分析 | Cox回归模型, 相关性分析 | RNA测序数据, 临床数据, 单细胞测序数据 | TCGA数据库的多种癌症样本和GEO数据库的免疫治疗队列 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 477 | 2025-10-06 |
Multi-omics analysis of canine aging markers and evaluation of stem cell intervention
2025-Jun-10, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08333-z
PMID:40494876
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研究论文 | 通过多组学技术分析犬类衰老标志物并评估干细胞干预效果 | 首次在犬类中鉴定出9个衰老相关细胞群和9个跨物种保守的CD8+T细胞衰老标志物,发现两个一致的代谢衰老标志物,并证明过表达NMNAT1的间充质干细胞可延缓或逆转犬类衰老 | 样本规模有限,研究结果需要在更大群体中验证 | 探索犬类衰老的分子机制并开发抗衰老干预策略 | 不同年龄的犬类 | 生物医学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序, 多组学技术 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据 | 不同年龄的犬类样本 | NA | single-cell RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 478 | 2025-10-06 |
spaMGCN: a graph convolutional network with autoencoder for spatial domain identification using multi-scale adaptation
2025-Jun-10, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03637-z
PMID:40495225
|
研究论文 | 提出一种基于图卷积网络和自编码器的空间域识别方法spaMGCN,专门用于处理离散组织分布 | 整合空间转录组和空间表观基因组数据,采用多尺度自适应图卷积网络,特别针对离散组织分布进行优化 | NA | 开发能够有效识别离散空间域的空间转录组分析方法 | 小鼠脾脏中的离散T细胞区域和人类淋巴结中的滤泡细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,空间表观基因组学 | 图卷积网络(GCN),自编码器 | 空间转录组数据,空间表观基因组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 479 | 2025-10-06 |
Integration of single-cell and spatial transcriptomics by SEU-TCA reveals the spatial origin of early cardiac progenitors
2025-Jun-10, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03633-3
PMID:40495257
|
研究论文 | 开发SEU-TCA方法提高单细胞空间映射精度,并应用于小鼠原肠胚形成研究 | 利用迁移成分分析开发SEU-TCA方法,显著提升单细胞空间映射准确性 | NA | 提高空间转录组学中单细胞空间定位的准确性 | 小鼠原肠胚形成过程中的心脏前体细胞 | 空间转录组学 | 先天性心脏病 | 单细胞转录组测序, 空间转录组测序 | 迁移成分分析 | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | 多个单细胞和空间转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 480 | 2025-10-06 |
SLC6A6-Mediated Taurine Uptake Sustains Corneal Epithelial Stem/Progenitor Cell Function to Counteract Age-Related Dysfunction
2025-Jun-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.6.25
PMID:40478558
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研究论文 | 本研究揭示了SLC6A6介导的牛磺酸转运在维持角膜缘干细胞功能及对抗年龄相关功能障碍中的作用 | 首次发现SLC6A6介导的牛磺酸摄取通过Notch1信号通路调控角膜缘干细胞稳态,为年龄相关性角膜疾病提供了新的治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系,需要进一步验证在人类角膜组织中的适用性 | 阐明SLC6A6介导的牛磺酸转运在维持角膜缘干细胞功能及年龄相关性角膜愈合中的作用机制 | C57BL/6J小鼠角膜组织、小鼠角膜上皮干细胞/祖细胞(TKE2细胞) | 干细胞生物学 | 角膜疾病 | 液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)、单细胞RNA测序、定量PCR、免疫荧光染色、转录组分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、代谢物浓度数据 | 小鼠角膜组织样本和TKE2细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |