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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2025-10-06 |
Exercise alters transcriptional profiles of senescence and gut barrier integrity in intestinal crypts of aging mice
2025-Jun-13, npj aging
IF:4.1Q2
DOI:10.1038/s41514-025-00242-z
PMID:40514364
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研究论文 | 本研究探讨了运动如何通过改变衰老小鼠肠道隐窝中衰老相关转录谱和肠道屏障完整性来影响肠道健康 | 首次在单细胞水平揭示运动通过调控DNA复制、细胞周期进程和核糖体生物合成相关基因表达来抑制肠道干细胞衰老的分子机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证;机制研究仍需进一步深入 | 探究运动对衰老过程中肠道干细胞功能和肠道屏障完整性的影响 | 衰老小鼠模型的肠道隐窝细胞 | 单细胞转录组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 衰老小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 442 | 2025-10-06 |
Resolving spatial subclonal genomic heterogeneity of loss of heterozygosity and extrachromosomal DNA in gliomas
2025-Jun-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59805-z
PMID:40514380
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学、肿瘤/正常DNA测序和bulk RNA测序,解析胶质瘤中空间亚克隆基因组异质性 | 首次结合空间转录组学与DNA测序技术系统揭示胶质瘤中染色体外DNA(ecDNA)和杂合性缺失的空间异质性模式 | 样本量有限(初始队列11例胶质瘤,验证队列6例胶质母细胞瘤),需要更大规模研究验证 | 解析胶质瘤中DNA水平体细胞拷贝数变化的空间组织特征 | 胶质瘤患者肿瘤组织(包含不同病理类型的初始队列和高级别胶质母细胞瘤验证队列) | 空间转录组学 | 胶质瘤 | 空间转录组学, 肿瘤/正常DNA测序, bulk RNA测序 | NA | 空间转录组数据, DNA测序数据, RNA测序数据 | 初始队列11例胶质瘤,验证队列6例高级别胶质母细胞瘤 | NA | 空间转录组学, DNA测序, RNA测序 | NA | NA |
| 443 | 2025-10-06 |
Gαi3: a crucial biomarker and therapeutic target in bladder cancer
2025-Jun-13, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00989-4
PMID:40514424
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研究论文 | 本研究探讨了Gαi3在膀胱癌中的表达、功能和作用机制 | 首次系统揭示Gαi3通过Akt-mTOR通路促进膀胱癌进展,并发现其受转录因子GATA4调控 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床样本验证相对有限 | 阐明Gαi3在膀胱癌发生发展中的生物学功能和治疗潜力 | 膀胱癌细胞系、患者组织样本和裸鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 膀胱癌 | 生物信息学分析、单细胞测序、shRNA沉默、CRISPR/Cas9基因编辑、Western blot | NA | 基因表达数据、蛋白质印迹数据、单细胞测序数据 | 多种膀胱癌细胞系和患者组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 444 | 2025-10-06 |
Identification of biomarkers associated with exhausted CD8 + T cells in the tumor microenvironment of intrahepatic cholangiocarcinoma based on Mendelian randomization and bioinformatics analysis
2025-Jun-13, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02970-w
PMID:40514625
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研究论文 | 通过整合多种生物信息学方法和单细胞RNA测序数据,鉴定肝内胆管癌肿瘤微环境中耗竭CD8+T细胞相关生物标志物 | 首次结合BayesPrism去卷积、WGCNA和汇总孟德尔随机化方法分析肝内胆管癌肿瘤微环境中的耗竭CD8+T细胞 | NA | 鉴定肝内胆管癌肿瘤微环境中与耗竭CD8+T细胞相关的生物标志物和治疗靶点 | 肝内胆管癌肿瘤微环境中的细胞亚群,特别是耗竭CD8+T细胞 | 生物信息学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序, BayesPrism去卷积, WGCNA, 汇总孟德尔随机化 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 445 | 2025-10-06 |
Development of a circadian-related prognostic signature highlights RBM17 as a stemness regulator in liver cancer
2025-Jun-13, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03843-6
PMID:40514677
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研究论文 | 本研究开发了基于昼夜节律基因的肝癌预后特征,并揭示RBM17通过促进癌症干细胞表型驱动肝癌进展 | 首次整合单细胞、批量和空间转录组学解析昼夜节律基因失调与肿瘤微环境的关联,并鉴定RBM17作为肝癌干细胞性调控因子 | 未明确说明样本量大小,机制研究仍需进一步验证 | 阐明昼夜节律失调影响肝癌进展的分子机制并开发预后预测模型 | 肝癌患者样本和实验模型 | 生物信息学 | 肝癌 | 多组学分析,机器学习,单细胞转录组测序,空间转录组测序,体内外实验 | 机器学习算法 | 基因组数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 446 | 2025-10-06 |
TORC: Target-Oriented Reference Construction for supervised cell-type identification in scRNA-seq
2025-Jun-10, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03614-6
PMID:40495172
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研究论文 | 本文提出了一种用于单细胞RNA测序监督细胞类型识别的目标导向参考数据构建方法 | 开发了首个针对单细胞RNA测序监督细胞类型识别的参考数据选择和构建方法,能够缓解参考数据与目标数据之间的数据分布和细胞类型组成差异 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 监督学习方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 447 | 2025-10-06 |
UDA-seq: universal droplet microfluidics-based combinatorial indexing for massive-scale multimodal single-cell sequencing
2025-Jun, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02586-y
PMID:39833568
|
研究论文 | 开发了一种通用的液滴微流控组合索引方法UDA-seq,用于大规模多模态单细胞测序 | 通过引入后索引步骤增强通量,并系统适配现有基于液滴的单细胞多模态方法,实现单次实验从数十个临床活检样本生成超过10万个高质量单细胞数据集 | NA | 开发通用型单细胞多模态测序工作流程,提高自动化程度和临床适用性 | 多种组织和细胞类型,包括临床活检标本 | 单细胞测序技术 | 癌症 | 单细胞多模态测序,液滴微流控技术 | NA | 单细胞多模态数据(RNA、VDJ、染色质、CRISPR扰动) | 从36个冷冻临床活检标本中生成超过100,000个高质量单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞多组学 | NA | 液滴微流控平台 |
| 448 | 2025-10-06 |
Exploring the Mechanisms of Microenergy Acoustic Pulse Therapy for the Treatment of Female Stress Urinary Incontinence-Part II
2025-Jun, Neurourology and urodynamics
IF:1.8Q3
DOI:10.1002/nau.70048
PMID:40338807
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术探索微能量声脉冲疗法治疗雌性压力性尿失禁的分子机制 | 首次在单细胞分辨率下研究MAP疗法对尿道组织微环境中细胞异质性和信号通路的影响 | 研究基于动物模型,结果需在临床试验中验证 | 探索MAP疗法治疗压力性尿失禁的作用机制 | 阴道分娩损伤诱导的压力性尿失禁大鼠模型 | 单细胞测序 | 压力性尿失禁 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 压力性尿失禁大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 449 | 2025-10-06 |
[Single-cell transcriptomics combined with bioinformatics for comprehensive analysis of macrophage subpopulations and hub genes in ischemic stroke]
2025-Jun, Xi bao yu fen zi mian yi xue za zhi = Chinese journal of cellular and molecular immunology
PMID:40525338
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研究论文 | 通过单细胞转录组学结合生物信息学方法分析缺血性脑卒中中巨噬细胞亚群特征及关键基因 | 首次结合单细胞RNA测序和hdWGCNA方法鉴定缺血性脑卒中特异性巨噬细胞亚群(MSM),并发现三个具有诊断价值的关键基因 | NA | 探索缺血性脑卒中中巨噬细胞亚群的特征及其在疾病中的作用机制 | 缺血性脑卒中模型中的巨噬细胞 | 生物信息学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞RNA测序, 高维加权基因共表达网络分析, 细胞间通讯分析, 伪时间轨迹分析, 基因集富集分析 | NA | 单细胞转录组数据, 微阵列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 450 | 2025-10-06 |
Plaque erosion risk and JAK2 V617F variant
2025-Jun-16, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehaf114
PMID:40053703
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研究论文 | 本研究探讨JAK2 V617F突变与斑块侵蚀风险之间的关联及其潜在机制 | 首次明确JAK2 V617F突变与心肌梗死特定机制——斑块侵蚀的强相关性,并通过单细胞RNA测序揭示中性粒细胞活化在其中的作用机制 | 病例对照研究设计无法确定因果关系,样本来源单一 | 探究JAK2 V617F突变与心肌梗死不同机制(斑块侵蚀vs斑块破裂)的关联性 | 728例斑块侵蚀患者、919例斑块破裂患者和804例对照个体 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 数字滴液PCR, 单细胞RNA测序 | 逻辑回归分析 | 基因测序数据, 临床数据 | 2451例(728侵蚀+919破裂+804对照) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 451 | 2025-10-06 |
Role and Validation of Lactylation-Related Gene Markers in Postmenopausal Osteoporosis
2025-Jun, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05216-1
PMID:40131629
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多组学数据分析,探讨了乳酸化相关基因在绝经后骨质疏松症中的作用并构建诊断模型 | 首次将乳酸化修饰与PMOP发病机制联系起来,结合单细胞测序、孟德尔随机化分析和多种机器学习算法构建诊断模型 | 研究样本量有限,需要更大规模的数据验证模型的泛化能力 | 探索乳酸化相关基因在绝经后骨质疏松症发病机制中的作用并开发诊断标志物 | 绝经后骨质疏松症患者的单细胞RNA测序数据和转录组数据 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 孟德尔随机化分析 | 多种机器学习算法组合 | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 452 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomic Landscape Deciphers Intratumoral Heterogeneity and Subtypes of Acral and Mucosal Melanomas
2025-Jun-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3164
PMID:40192737
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了肢端黑色素瘤和黏膜黑色素瘤的瘤内异质性及分子亚型 | 首次在单细胞水平系统比较肢端和黏膜黑色素瘤的肿瘤异质性,发现两种黑色素瘤具有不同的进化路径和微环境特征 | 样本量相对有限(42例),需要更大规模研究验证发现 | 解析肢端和黏膜黑色素瘤的瘤内异质性及微环境特征,为精准治疗提供依据 | 42例黑色素瘤样本(28例肢端黑色素瘤,11例黏膜黑色素瘤,3例非肢端皮肤黑色素瘤) | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,全外显子测序,体外迁移实验,共培养系统,异种移植模型 | NA | 单细胞转录组数据,基因组数据 | 42例黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq,全外显子测序 | NA | NA |
| 453 | 2025-10-06 |
Comprehensive analysis of SELPLG as a potential immunotherapy target and prognostic biomarker in oncology
2025-Jun-12, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02934-0
PMID:40504320
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研究论文 | 通过生物信息学方法全面分析SELPLG作为潜在免疫治疗靶点和预后生物标志物在肿瘤学中的作用 | 首次对SELPLG进行泛癌分析,整合多组学数据揭示其在肿瘤免疫微环境中的表达模式和临床意义 | 基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本来源和数量依赖于公共数据库 | 评估SELPLG作为肿瘤免疫治疗靶点和预后生物标志物的潜力 | 多种癌症类型(乳腺癌、胆管癌、食管癌、头颈癌、肾癌、胃癌、甲状腺癌等)的肿瘤组织和正常组织 | 生物信息学 | 多种癌症 | 生物信息学分析、单细胞测序、基因集富集分析、Cox回归分析 | Cox比例风险回归模型 | mRNA表达数据、单细胞测序数据、突变数据、临床数据 | 多种癌症类型的肿瘤和正常组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞测序、bulk RNA-seq | TIMER2, Sangerbox 3.0 | 多种生物信息学分析工具整合 |
| 454 | 2025-10-06 |
Dysbiosis of the gut microbiome may contribute to the pathogenesis of oral lichen planus through Treg dysregulation
2025-Jun-09, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2025.05.009
PMID:40499683
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研究论文 | 本研究探讨肠道菌群失调通过调节性T细胞功能紊乱参与口腔扁平苔藓发病的机制 | 首次揭示肠道菌群失调通过减少短链脂肪酸产生菌影响Treg功能,进而参与口腔扁平苔藓发病 | 样本量有限,机制研究仍需进一步验证 | 研究肠道菌群失调与CD4 T细胞在口腔扁平苔藓中的关联机制 | 口腔扁平苔藓患者 | 微生物组学 | 口腔扁平苔藓 | 16S rRNA基因分析,质谱分析,多重免疫荧光,单细胞RNA测序,流式细胞术,细胞培养 | NA | 微生物组数据,蛋白质组数据,单细胞转录组数据 | 口腔扁平苔藓患者的粪便、唾液、病变组织和外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | NA |
| 455 | 2025-10-06 |
WNT Mimetic-Induced Lacrimal Gland Regeneration Reverses Aqueous Tear Deficiency
2025-Jun-02, Translational vision science & technology
IF:2.6Q2
DOI:10.1167/tvst.14.6.19
PMID:40492997
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研究论文 | 本研究通过WNT模拟物激活泪腺腺泡细胞,逆转干眼病小鼠的泪液分泌不足 | 首次开发基于抗体的WNT模拟物平台用于泪腺再生,实现腺泡细胞增殖和组织修复 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 探索WNT信号激活对泪腺再生和干眼病治疗的作用 | 小鼠泪腺腺泡细胞和干眼病模型 | 再生医学 | 干眼病 | 单细胞测序,三维类器官培养 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 小鼠原代泪腺细胞和干眼病模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 456 | 2025-10-06 |
Increased ocular plasma cells induce damaging α-synuclein+ microglia in autoimmune uveitis
2025-Jun, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2025.02.007
PMID:40015479
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光技术揭示了自身免疫性葡萄膜炎中浆细胞通过TNF-α促进α-突触核蛋白阳性小胶质细胞产生的机制 | 首次发现眼内浸润浆细胞通过表达TNF-α促进α-突触核蛋白阳性小胶质细胞产生,并鉴定MUC1浆细胞为主要致病亚群,发现Rab1A蛋白调控浆细胞存活和炎症反应 | 研究主要基于实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究自身免疫性葡萄膜炎中免疫细胞亚群及其对视网膜损伤的贡献机制 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型和Vogt-Koyanagi-Harada患者样本 | 免疫学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 457 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals the same heterogeneity of neutrophils in heatstroke-induced lung and liver injury
2025-Jun, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2025.03.005
PMID:40158777
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示热射病诱导的肺和肝损伤中中性粒细胞的异质性特征 | 首次在热射病模型中系统揭示中性粒细胞异质性,发现Cd177+中性粒细胞亚群的主导作用及其通过NETs介导器官损伤的机制 | 研究基于小鼠模型,人体临床相关性需进一步验证 | 探索热射病导致多器官功能障碍的细胞机制 | 热射病小鼠模型的肺组织和肝组织 | 单细胞生物学 | 热射病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 热射病小鼠模型的组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 458 | 2025-10-06 |
Photo-Biomodulation of the Hippocampus Using Near-Infrared Laser to Enhance Cognitive Function in Mice
2025-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417380
PMID:40190133
|
研究论文 | 本研究探讨了近红外激光光生物调节对小鼠海马体认知功能的增强作用 | 首次系统验证808nm近红外激光通过调节海马体神经元振荡和θ-γ耦合来改善认知功能 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床试验中验证 | 探索近红外激光光生物调节对认知功能的改善作用及其神经机制 | 小鼠海马体 | 神经科学 | 认知功能障碍 | 单细胞RNA测序,钙成像,免疫组织化学 | NA | 行为学数据,电生理记录,基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 459 | 2025-10-06 |
Single-Cell Atlas Reveals Tumorigenic Profiles and Immune Dynamics of Adrenal Incidentalomas
2025-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413493
PMID:40190189
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示肾上腺偶发瘤的肿瘤发生特征和免疫动态 | 首次在单细胞水平系统描绘肾上腺偶发瘤的异质性,发现与肿瘤发生相关的三种肾上腺皮质细胞亚型,鉴定Clusterin作为肾上腺皮质腺瘤的潜在生物标志物 | NA | 研究肾上腺偶发瘤的肿瘤发生特性和免疫微环境动态 | 肾上腺偶发瘤,包括无功能肾上腺皮质腺瘤、Conn综合征和嗜铬细胞瘤 | 数字病理学 | 肾上腺肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 302,696个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 460 | 2025-10-06 |
Single-Cell Sequencing-Guided Annotation of Rare Tumor Cells for Deep Learning-Based Cytopathologic Diagnosis of Early Lung Cancer
2025-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202416921
PMID:40231585
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研究论文 | 利用单细胞DNA测序指导的罕见肿瘤细胞标注开发深度学习模型,用于早期肺癌的细胞病理学诊断 | 首次将单细胞DNA测序作为客观金标准用于肿瘤细胞标注,解决了传统细胞学诊断中肿瘤细胞稀少和形态差异细微的难题 | 样本量相对有限,需要进一步的外部验证和临床推广 | 开发基于深度学习的支气管肺泡灌洗液细胞病理学诊断模型,提高早期肺癌诊断准确性 | 支气管肺泡灌洗液中的脱落肿瘤细胞和良性细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞DNA测序 | 深度学习模型 | 细胞图像 | 训练集包含580个ETCs和1106个良性细胞,发现队列156例,验证队列158例,外部验证队列141例 | NA | 单细胞DNA测序 | NA | NA |