单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
441	2025-06-19	Exploring T-cell metabolism in tuberculosis: development of a diagnostic model using metabolic genes 2025-Jun-16, European journal of medical research IF:2.8Q2 DOI:10.1186/s40001-025-02768-0 PMID:40524207	研究论文	通过单细胞RNA测序分析结核病患者外周血单个核细胞，开发基于代谢基因的诊断模型	首次利用T细胞相关代谢差异表达基因构建结核病诊断模型，并揭示免疫代谢重编程在结核病进展中的关键作用	样本量较小（仅7人），需要更大规模验证	阐明活动性结核与潜伏感染免疫调控机制，开发新型诊断方法	结核病患者外周血单个核细胞（PBMCs）	数字病理	结核病	scRNA-seq	XGBoost, SVM-RFE, Boruta	RNA测序数据	7人（2健康对照+2潜伏感染+3活动性结核）
442	2025-06-19	Cancer-associated fibroblasts promote drug resistance in ALK-driven lung adenocarcinoma cells by upregulating lipid biosynthesis 2025-Jun-16, Cancer & metabolism IF:6.0Q1 DOI:10.1186/s40170-025-00400-7 PMID:40524253	research paper	本研究探讨了癌症相关成纤维细胞（CAFs）通过上调脂质生物合成促进ALK驱动的肺腺癌细胞对药物产生耐药的机制	揭示了CAFs通过重编程脂质代谢促进ALK-TKIs耐药的分子网络，并提出通过靶向脂质代谢或诱导铁死亡来克服耐药的新治疗策略	研究主要基于3D球体共培养模型，尚未在体内模型或临床样本中验证	探究CAFs驱动的分子网络如何影响ALK驱动肺腺癌细胞的治疗敏感性	ALK重排肺腺癌细胞和癌症相关成纤维细胞（CAFs）	肿瘤微环境	肺腺癌	单细胞RNA测序，3D球体共培养	3D球体共培养模型	基因表达数据	NA
443	2025-06-19	Elevated CD14 in B cells associates with reduced ovarian cancer risk via CD80 + dendritic cell interaction: a multi-omics study 2025-Jun-15, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02956-8 PMID:40517355	研究论文	通过多组学研究探讨B细胞中CD14升高通过CD80+树突状细胞相互作用降低卵巢癌风险的机制	首次揭示了CD14在B细胞中的表达与卵巢癌风险降低的关联，并发现CD80在髓系树突状细胞中作为中介分子	研究样本量未明确说明，且机制研究仍需进一步实验验证	探究B细胞及免疫分子对卵巢癌风险的影响机制	卵巢癌患者和健康捐赠者的外周血单个核细胞(PBMCs)	多组学分析	卵巢癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、孟德尔随机化(MR)分析、中介分析	NA	单细胞转录组数据、eQTL和pQTL数据库数据	NA
444	2025-06-19	A Prognostic Lysine Crotonylation Signature Shapes the Immune Microenvironment in Hepatocellular Carcinoma 2025-Jun-13, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2 DOI:10.2174/0109298673381518250529110617 PMID:40525440	研究论文	本研究通过分析赖氨酸巴豆酰化相关基因（CRGs）在肝细胞癌（HCC）中的表达，建立了一个8基因风险评分模型，用于预测HCC患者的预后和免疫微环境特征	首次揭示了CRGs在HCC中的预后价值及其与肿瘤免疫微环境的关联，并开发了一个结合风险评分和列线图的预测模型	需要开发标准化的巴豆酰化测量方法，并在不同病因的HCC中进行验证，同时需要进一步研究巴豆酰化调节剂的功能影响	探索CRGs在HCC中的预后和治疗相关性	肝细胞癌（HCC）患者	肿瘤学	肝细胞癌	转录组分析、单细胞测序、CIBERSORT、OncoPredict	Cox和LASSO回归分析	转录组和临床数据	来自TCGA和GEO数据库的HCC患者数据
445	2025-06-19	Systematic Pan-Cancer Analysis of the Oncogenic and Immunological Function of Stanniocalcin-1 (STC1) 2025-Jun-13, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2 DOI:10.2174/0109298673358794250531003706 PMID:40525442	研究论文	本研究通过多组学分析和实验验证，系统性分析了STC1在泛癌中的致癌和免疫学功能	首次系统性揭示了STC1作为新型泛癌因子的双重作用：既通过EMT和干性调控促进肿瘤进展，又参与免疫微环境重塑	实验验证部分仅针对胃腺癌(STAD)进行了组织芯片和细胞系验证，其他癌症类型的实验证据不足	确立STC1的泛癌预后意义并阐明其与免疫特征的关联	33种癌症类型(TCGA泛癌数据集)和胃腺癌(STAD)组织样本	癌症基因组学	泛癌研究(重点关注胃腺癌)	多组学分析(UALCAN/cBioPortal/HPA/GTA)、多重荧光染色、Western blot、单细胞RNA测序	NA	基因组数据、蛋白质组数据、组织芯片图像数据	TCGA泛癌数据集+30例STAD组织芯片+STAD细胞系
446	2025-06-19	DNA damage repair (DDR) related prognostic risk model in multiple myeloma based on single-cell and bulk sequencing 2025-Jun-13, DNA repair IF:3.0Q2 DOI:10.1016/j.dnarep.2025.103857 PMID:40527059	研究论文	基于单细胞和批量测序数据，构建了多发性骨髓瘤中DNA损伤修复相关基因的预后风险模型	首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据筛选DDR基因，并构建了多发性骨髓瘤的预后模型，发现了关键的DDR相关基因	研究结果需要进一步实验验证，样本量可能有限	研究多发性骨髓瘤中DNA损伤修复基因的作用及其对疾病预后的影响	多发性骨髓瘤患者	基因组学	多发性骨髓瘤	单细胞RNA测序, 批量RNA测序, WGCNA, 差异表达分析	预后风险模型	RNA测序数据	训练和验证队列中的多发性骨髓瘤患者样本
447	2025-06-19	Multi-omics characterization of prognostic signature and novel molecular subtypes associated with anoikis and in vitro validation of CDKN2A in thyroid carcinoma 2025-Jun-08, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2025.156956 PMID:40527061	研究论文	本研究通过多组学方法分析了甲状腺癌中与失巢凋亡相关的基因，并验证了CDKN2A在其中的关键作用	首次建立了甲状腺癌的多组学分子亚型，并提供了失巢凋亡在甲状腺癌中的全面调控框架	研究主要基于TCGA数据库，需要进一步实验验证	探索甲状腺癌中失巢凋亡相关基因的调控机制及其在分子分型和治疗中的应用	甲状腺癌患者	生物信息学	甲状腺癌	多组学分析（转录组、甲基化、miRNA）、单细胞测序	风险评分模型	多组学数据	TCGA数据库中的甲状腺癌患者样本
448	2025-06-19	Adulthood outcomes of thymic transplantation in a case of congenital athymia due to FOXN1 mutation 2025-Jun, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jaci.2025.02.006 PMID:39956280	research paper	本文报告了一例因FOXN1突变导致先天性无胸腺症患者接受胸腺移植后的长期临床和免疫学结果	首次报道了同种异体胸腺移植后19年的长期随访结果，揭示了移植胸腺中T细胞的独特生物学特性	仅为一例个案研究，样本量有限	评估先天性无胸腺症患者胸腺移植后的长期免疫重建效果	一名R255X纯合FOXN1突变导致的先天性无胸腺症成年患者	免疫学	先天性免疫缺陷	高维光谱流式细胞术、单细胞RNA测序、T细胞受体测序	NA	临床数据、免疫学数据、测序数据	1例患者+年龄匹配对照
449	2025-06-19	Machine learning approach to single cell transcriptomic analysis of Sjogren's disease reveals altered activation states of B and T lymphocytes 2025-Jun, Journal of autoimmunity IF:7.9Q1 DOI:10.1016/j.jaut.2025.103419 PMID:40318561	研究论文	通过单细胞转录组分析揭示Sjögren病患者B和T淋巴细胞的异常激活状态	首次在Sjögren病患者外周血单核细胞中发现B和T淋巴细胞的独特基因表达模式，特别是Th1细胞的激活状态	研究样本仅限于外周血单核细胞，未涉及唾液腺等直接受累组织	探究Sjögren病的发病机制	Sjögren病患者和对照组的B和T淋巴细胞	数字病理学	自身免疫性疾病	单细胞转录组分析	非负矩阵分解(NMF)	基因表达数据	Sjögren病患者和对照组的外周血单核细胞样本
450	2025-06-19	Single-Cell RNA Sequencing Reveals Macrophage-Endothelial Cell Crosstalk in Viral Myocarditis 2025-Jun, Journal of medical virology IF:6.8Q1 DOI:10.1002/jmv.70440 PMID:40525609	研究论文	通过单细胞RNA测序揭示了病毒性心肌炎中巨噬细胞与内皮细胞的相互作用	首次使用单细胞RNA测序技术系统分析了病毒性心肌炎中免疫细胞与基质细胞的相互作用，特别是发现了巨噬细胞通过VEGFA信号通路促进血管生成的心脏保护机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证	阐明病毒性心肌炎中免疫细胞与基质细胞的相互作用机制	CVB3诱导的病毒性心肌炎小鼠模型	单细胞组学	心肌炎	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	小鼠疾病模型	单细胞转录组数据	不同时间点的病毒感染小鼠心脏组织和外周血单个核细胞(PBMCs)
451	2025-06-18	Suppression of the Prostaglandin I2-Type 1 Interferon Axis Induces Extramedullary Hematopoiesis to Promote Cardiac Repair After Myocardial Infarction 2025-Jun-17, Circulation IF:35.5Q1 DOI:10.1161/CIRCULATIONAHA.124.069420 PMID:40289806	research paper	本研究探讨了脾脏髓外造血（EMH）在心肌梗死（MI）后心脏修复中的作用及其机制	揭示了PGI2-IFN轴在MI后脾脏EMH中的作用，为缺血性心脏损伤提供了新的治疗靶点	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证	探究脾脏EMH在MI后心脏修复中的作用及其调控机制	小鼠模型中的脾脏造血干细胞/祖细胞（HSPCs）	心血管疾病	心肌梗死	流式细胞术、液相色谱-串联质谱、单细胞RNA测序	Tcf21CreER Scfflox/flox MI小鼠模型	转录组数据、脂质组数据	未明确提及具体样本数量，但使用了GFP+造血干细胞和Tcf21CreER Scfflox/flox小鼠
452	2025-06-18	Single-Cell RNA Sequencing Delineates Renal Anti-Fibrotic Mechanisms Mediated by TRPC6 Inhibition 2025-Jun-17, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202501175 PMID:40525246	research paper	该研究通过单细胞RNA测序技术揭示了TRPC6通道抑制在慢性肾脏病中的抗纤维化机制	发现了一种新型内皮细胞亚群ECRIN，并揭示了TRPC6抑制通过Prnp转录因子调控网络减轻肾纤维化的新机制	研究主要基于小鼠模型和有限的人类CKD样本，临床转化需要进一步验证	探究TRPC6通道抑制在慢性肾脏病中的治疗潜力及其分子机制	小鼠UUO模型、2个月慢性缺血再灌注损伤模型及人类CKD患者的肾脏样本	digital pathology	chronic kidney disease	scRNA-Seq, immunofluorescence, western blot	NA	RNA-seq数据	小鼠模型和人类CKD患者的肾脏样本（具体数量未明确说明）
453	2025-06-18	LARP7 Protects Vascular Smooth Muscle Cell Contractile Phenotype in CKD by Coupling with P300 2025-Jun-16, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1 DOI:10.1681/ASN.0000000761 PMID:40522739	研究论文	本研究探讨了LARP7在维持血管平滑肌细胞（VSMC）收缩表型及缓解慢性肾病（CKD）相关血管病变中的作用	发现了LARP7作为内源性正调节因子通过其与P300的相互作用维持VSMC收缩表型的新机制	研究主要基于体外和动物模型，临床样本验证有限	探究LARP7在CKD相关血管病变中的作用机制	血管平滑肌细胞（VSMC）	分子生物学	慢性肾病（CKD）	单细胞RNA测序、免疫染色分析	NA	RNA测序数据、免疫染色图像	CKD患者及小鼠模型样本
454	2025-06-18	Spatial Transcriptomics to Study Virus-Host Interactions 2025-Jun-16, Annual review of virology IF:8.1Q1 DOI:10.1146/annurev-virology-092623-104926 PMID:40523107	review	本文探讨了空间转录组学在研究病毒-宿主相互作用中的潜力及其技术细节	强调了空间转录组学在病毒致病机制研究中的变革性潜力	未提及具体的技术实施难点或数据解读的限制	开发新的抗病毒治疗方法和诱导保护性免疫的策略	植物、动物和人类中的病毒疾病	digital pathology	NA	spatial transcriptomics	NA	transcriptomic data	NA
455	2025-06-18	Comprehensive identification of crucial biomarkers and therapeutic targets in cholestasis via integrated single-cell RNA and transcriptome sequencing analysis 2025-Jun-16, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society IF:2.7Q2 DOI:10.1007/s00335-025-10146-8 PMID:40523982	研究论文	通过整合单细胞RNA和转录组测序分析，全面鉴定胆汁淤积症的关键生物标志物和治疗靶点	利用单细胞和转录组测序技术揭示了IL32、CRIP2、ANXA2和VWF作为胆汁淤积症的关键基因，并通过药物重定位分析提出了潜在的治疗药物	样本量较小（13例胆汁淤积性肝病患者和10例对照），且研究结果需要进一步验证	探究胆汁淤积症的细胞通讯网络和分子机制，寻找生物标志物和治疗靶点	胆汁淤积性肝病（CLD）患者和对照组的肝组织	数字病理学	胆汁淤积症	单细胞RNA测序、转录组测序	Lasso回归	RNA测序数据	13例胆汁淤积性肝病患者和10例对照
456	2025-06-18	Single-cell and bulk RNA sequencing reveals specific Trem2 positive B cell subtype niche after myocardial infarction in mice 2025-Jun-16, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society IF:2.7Q2 DOI:10.1007/s00335-025-10144-w PMID:40523981	研究论文	本研究通过单细胞和批量RNA测序技术，揭示了小鼠心肌梗死后特定Trem2阳性B细胞亚型的生态位	发现了一种具有调节性B细胞特征的特定B细胞亚型B_Trem2，其过表达Spp1，并揭示了Apoe可能通过结合Lrp1、Sdc4和Sdc3受体促进Spp1表达的机制	仅比较了心肌梗死后不同时间点及稳态条件下梗死区域免疫细胞群的变化，未涉及其他区域或其他时间点的分析	鉴定心肌梗死后小鼠B细胞亚型并寻找不良重塑的潜在治疗靶点	心肌梗死后小鼠的B细胞亚型	数字病理	心血管疾病	scRNA-seq, bulk RNA-seq	NA	RNA测序数据	来自GEO数据库的scRNA-seq数据(GSE163129)和批量RNA测序数据(GSE19322)
457	2025-06-18	Functional defects in FOXG1 variants predict the severity of brain anomalies in FOXG1 syndrome 2025-Jun-16, Molecular psychiatry IF:9.6Q1 DOI:10.1038/s41380-025-03077-y PMID:40524015	研究论文	研究FOXG1基因变异如何影响脑部异常严重程度及其功能缺陷	通过结合蛋白表达、COUP-TFI抑制和神经元迁移实验，开发了一种预测FOXG1综合征严重程度的分层范式	样本量较小（14例），可能影响结果的普遍性	探究FOXG1基因变异与脑部异常严重程度之间的精确关系	14名携带FOXG1变异的个体及小鼠胚胎脑部	神经科学	神经发育障碍	scRNA-seq, IUE, 荧光素酶报告基因检测	NA	基因表达数据、脑部影像数据	14名FOXG1变异个体及小鼠胚胎脑部
458	2025-06-18	Role for Complement C5 in Eosinophilic Inflammation of Severe Asthma 2025-Jun-16, Allergy IF:12.6Q1 DOI:10.1111/all.16616 PMID:40524528	research paper	该研究探讨了补体系统，特别是补体C5，在严重哮喘中嗜酸性炎症的作用	首次通过痰蛋白质组学分析揭示了补体C5在严重哮喘嗜酸性炎症中的直接作用，并验证了C5抑制在小鼠模型中的抗炎效果	研究样本可能有限，且小鼠模型结果需进一步验证是否完全适用于人类	阐明补体C5在严重哮喘嗜酸性炎症中的病理机制	健康对照者和严重哮喘患者的痰样本，以及哮喘小鼠模型	生物医学研究	哮喘	数据依赖性采集质谱、加权相关网络分析(WGCNA)、单细胞RNA测序、免疫荧光染色	小鼠哮喘模型	蛋白质表达数据、RNA测序数据	健康对照者和严重哮喘患者（具体数量未明确说明）
459	2025-06-18	Loss of N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 leads to meiotic prophase abnormalities and male sub-fertility in mice† 2025-Jun-15, Biology of reproduction IF:3.1Q2 DOI:10.1093/biolre/ioaf052 PMID:40079145	研究论文	本研究揭示了N-6腺嘌呤特异性DNA甲基转移酶1（N6AMT1）在小鼠精子发生过程中的减数分裂进展中的关键作用	首次证明N6AMT1在减数分裂性染色体失活（MSCI）和DNA双链断裂（DSB）修复中的重要作用	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他哺乳动物中进行验证	探究N6AMT1在精子发生和雄性生育能力中的作用机制	小鼠生殖细胞特别是精母细胞	生殖生物学	男性不育症	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序（bulk RNA-seq）	基因敲除小鼠模型	RNA测序数据	N6amt1基因敲除小鼠及其对照组的生殖细胞样本
460	2025-06-18	The role of tumor microenvironment and immune cell crosstalk in triple-negative breast cancer (TNBC): Emerging therapeutic opportunities 2025-Jun-15, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217865 PMID:40516902	综述	本文综述了三阴性乳腺癌（TNBC）中肿瘤微环境（TME）和免疫细胞相互作用的研究现状，以探索新兴的治疗机会	整合单细胞RNA测序和空间分析技术，揭示了T细胞异质性和细胞间相互作用对TNBC预后的影响，并提出了针对Tregs和TK1等新靶点的治疗策略	需要更多多组学数据和患者来源模型来验证和优化治疗干预措施	探索TNBC中肿瘤微环境和免疫细胞相互作用的新治疗机会	三阴性乳腺癌（TNBC）的肿瘤微环境和免疫细胞	肿瘤学	三阴性乳腺癌	单细胞RNA测序、空间转录组学	NA	基因组数据、转录组数据	NA