单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
441	2025-06-16	Integrating spatial transcriptomics and single-cell RNA-seq dissects immune microenvironment in fatty liver regeneration 2025-Jun, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1 DOI:10.1002/ctm2.70365 PMID:40515443	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
442	2025-06-18	[Single-cell transcriptomics combined with bioinformatics for comprehensive analysis of macrophage subpopulations and hub genes in ischemic stroke] 2025-Jun, Xi bao yu fen zi mian yi xue za zhi = Chinese journal of cellular and molecular immunology PMID:40525338	研究论文	通过单细胞RNA测序和生物信息学方法分析缺血性卒中中巨噬细胞亚群及其关键基因	首次结合scRNA-seq和hdWGCNA技术鉴定缺血性卒中特异性巨噬细胞亚群(MSM)，并发现CCL6-CCR1信号轴在神经炎症中的潜在作用	未进行实验验证关键基因的功能机制，样本来源和数量未明确说明	探究缺血性卒中后巨噬细胞亚群的特征及其在疾病中的作用	缺血性卒中患者的巨噬细胞亚群	生物信息学	缺血性卒中	scRNA-seq, hdWGCNA, 细胞间通讯分析, 伪时间轨迹分析	NA	单细胞转录组数据, 微阵列数据	NA
443	2025-06-17	Plaque erosion risk and JAK2 V617F variant 2025-Jun-16, European heart journal IF:37.6Q1 DOI:10.1093/eurheartj/ehaf114 PMID:40053703	research paper	该研究探讨了JAK2 V617F变异与心肌梗塞（MI）两种机制——斑块侵蚀和斑块破裂之间的具体关联	首次明确了JAK2 V617F变异与斑块侵蚀风险之间的显著关联，并通过单细胞RNA测序揭示了中性粒细胞激活的潜在机制	研究样本主要来自单一中心，可能限制结果的普遍性	探究JAK2 V617F变异与心肌梗塞不同机制之间的关联	728例斑块侵蚀患者、919例斑块破裂患者和804例对照个体	心血管疾病研究	心血管疾病	数字滴PCR、单细胞RNA测序	逻辑回归分析	基因测序数据、临床数据	728例侵蚀病例、919例破裂病例和804例对照
444	2025-06-17	Identification of potential drug targets for erectile dysfunction with single-cell RNA sequencing: A Mendelian randomization study 2025-Jun-15, Andrology IF:3.2Q1 DOI:10.1111/andr.70082 PMID:40518741	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法，识别了勃起功能障碍（ED）的潜在药物靶点	结合孟德尔随机化和单细胞RNA测序技术，发现了两个新的ED药物靶点，并验证了它们在特定细胞类型中的表达	研究依赖于现有的eQTL数据和ED统计摘要，可能受到样本来源和数量的限制	识别勃起功能障碍的新药物靶点，以改善当前治疗效果不佳的问题	勃起功能障碍患者	生物医学研究	勃起功能障碍	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、孟德尔随机化（MR）、分子对接	NA	基因表达数据、SNP数据	eQTLGen Consortium的31,684个体；两个ED队列共325,158个体（7,329 ED病例，317,829对照）
445	2025-06-17	Role and Validation of Lactylation-Related Gene Markers in Postmenopausal Osteoporosis 2025-Jun, Applied biochemistry and biotechnology IF:3.1Q2 DOI:10.1007/s12010-025-05216-1 PMID:40131629	研究论文	本研究探讨了乳酰化相关基因标记在绝经后骨质疏松症中的作用及其验证	首次结合单细胞RNA测序和转录组数据，利用多组学数据和机器学习算法识别与PMOP因果相关的基因及诊断基因	研究样本来源和数量未明确说明，可能影响结果的普适性	探究乳酰化相关基因在绝经后骨质疏松症发展中的具体作用及其作为诊断标志物的潜力	绝经后骨质疏松症患者	数字病理学	骨质疏松症	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 转录组分析, 孟德尔随机化(MR)分析	多种机器学习算法组合	单细胞RNA测序数据, 转录组数据	NA
446	2025-06-17	Genetic and genomic insights into male reproductive tract development 2025-Jun, Fertility and sterility IF:6.6Q1 DOI:10.1016/j.fertnstert.2025.03.024 PMID:40174856	综述	本文回顾了男性生殖道（MRT）发育的遗传和基因组分析，强调了单细胞测序在发现细胞类型和细胞过程中的应用	利用单细胞测序技术揭示了MRT发育中的细胞类型和过程，并系统性地整理了与MRT发育相关的表型术语和基因	小鼠数据与人类数据在表型术语和基因关联上存在差异，需要进一步的知识协调	理解男性生殖道发育的遗传基础及其与成年后医疗结果的关系	男性生殖道发育相关的基因和表型	基因组学	男性生殖系统疾病	单细胞RNA测序	NA	基因组数据	涉及269个独特基因和35个表型术语
447	2025-06-16	Integrated Metabolomics and Spatial Transcriptomics of Cystic Pancreatic Cancer Precursors Reveals Dysregulated Polyamine Metabolism as a Biomarker of Progression 2025-Jun-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1 DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2931 PMID:40184234	研究论文	通过代谢组学和空间细胞转录组学分析囊性胰腺癌前体，揭示多胺代谢失调作为进展的生物标志物	首次整合代谢组学和空间转录组学技术，识别出多胺代谢途径的紊乱与胰腺癌前体恶性风险相关	样本量相对有限（125例患者），且未涉及长期随访数据验证生物标志物的临床效用	鉴定可用于评估胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤（IPMN）恶性风险的代谢标志物	125例低级别（LG）或高级别（HG）异型增生IPMN患者的囊液及组织样本	癌症代谢组学	胰腺癌	非靶向代谢组学、空间转录组学、单细胞转录组学	NA	代谢组数据、转录组数据	125例患者囊液样本（含LG/HG异型增生及IPMN/PDAC病例）
448	2025-06-16	Single-Cell Transcriptomic Landscape Deciphers Intratumoral Heterogeneity and Subtypes of Acral and Mucosal Melanomas 2025-Jun-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1 DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3164 PMID:40192737	研究论文	通过单细胞转录组和基因组分析，揭示了肢端黑色素瘤和黏膜黑色素瘤的瘤内异质性、微环境特征及亚型特异性治疗策略	首次全面比较了肢端黑色素瘤和黏膜黑色素瘤的单细胞转录组特征，发现了亚型特异性的基质-免疫互作模式和分子程序，并提出了精准治疗靶点	样本量相对有限（42例），且未涵盖所有黑色素瘤亚型	解析肢端黑色素瘤和黏膜黑色素瘤的瘤内异质性及微环境特征，探索亚型特异性治疗策略	42例黑色素瘤样本（28例肢端型，11例黏膜型，3例非肢端皮肤型）	数字病理学	黑色素瘤	单细胞RNA测序、全外显子组测序、体外功能实验（迁移实验、共培养系统）和体内异种移植模型	NA	单细胞转录组数据、基因组数据	42例黑色素瘤样本（28 AM, 11 MM, 3非肢端皮肤型）
449	2025-06-16	Exploring the molecular mechanisms of lactylation-related biological functions and immune regulation in sepsis-associated acute kidney injury 2025-Jun-12, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2 DOI:10.1007/s10238-025-01745-5 PMID:40504273	研究论文	本研究探讨了乳酰化相关基因在脓毒症相关急性肾损伤(SA-AKI)中的表达模式及功能作用	首次系统研究了乳酰化修饰在SA-AKI中的作用机制，鉴定了关键基因PECR和TP53I3及其与免疫调节的关联	研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证	探索乳酰化相关基因在SA-AKI中的分子机制	脓毒症相关急性肾损伤患者样本	生物信息学	急性肾损伤	转录组分析、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、机器学习算法(Lasso回归和随机森林)	Lasso回归、随机森林	转录组数据	GSE232404数据集中的SA-AKI样本
450	2025-06-16	Comprehensive analysis of SELPLG as a potential immunotherapy target and prognostic biomarker in oncology 2025-Jun-12, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02934-0 PMID:40504320	研究论文	通过生物信息学分析全面评估SELPLG作为潜在免疫治疗靶点和预后生物标志物在肿瘤学中的作用	首次全面分析SELPLG在不同癌症类型和阶段的表达模式及其与免疫细胞浸润的关系	研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证	评估SELPLG作为癌症预后和治疗靶点的潜力	多种癌症类型中的SELPLG表达	生物信息学	多种癌症	生物信息学分析、单细胞测序、基因集富集分析(GSEA)	Cox比例风险回归模型	mRNA表达数据、单细胞测序数据、突变数据	多种癌症类型的肿瘤和正常组织样本
451	2025-06-16	Elucidating Cellular Senescence-related Genes in Benign Prostatic Hyperplasia Through Mendelian Randomization and Single-cell RNA Sequencing 2025-Jun-10, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences DOI:10.1093/gerona/glaf073 PMID:40269514	研究论文	通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序技术，识别与良性前列腺增生（BPH）因果相关的细胞衰老相关基因，并分析它们在不同前列腺细胞中的表达和调控网络	首次结合孟德尔随机化和单细胞RNA测序技术，系统地识别与BPH因果相关的细胞衰老基因，并揭示其表达模式和调控网络	研究结果需要进一步的实验验证，且样本来源仅限于特定数据库（eQTLGen、FinnGen Consortium和UKB）	阐明细胞衰老相关基因在良性前列腺增生中的作用机制	良性前列腺增生（BPH）患者的前列腺细胞	生物信息学	前列腺增生	孟德尔随机化、单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	来自eQTLGen、FinnGen Consortium和UKB数据库的数据
452	2025-06-16	Dysbiosis of the gut microbiome may contribute to the pathogenesis of oral lichen planus through Treg dysregulation 2025-Jun-09, Mucosal immunology IF:7.9Q1 DOI:10.1016/j.mucimm.2025.05.009 PMID:40499683	研究论文	本研究探讨了肠道菌群失调与口腔扁平苔藓（OLP）发病机制中CD4 T细胞的关系	首次揭示了肠道菌群失调通过影响调节性T细胞（Treg）功能参与OLP发病的新机制	样本量有限，未进行菌群移植实验验证因果关系	探究肠道菌群失调在OLP发病中的作用机制	OLP患者和肠道菌群	免疫学	口腔扁平苔藓	16S rRNA基因分析、质谱分析、多重免疫荧光、单细胞RNA测序、流式细胞术	NA	粪便样本、唾液样本、外周血样本	OLP患者的生物样本（具体数量未明确说明）
453	2025-06-16	WNT Mimetic-Induced Lacrimal Gland Regeneration Reverses Aqueous Tear Deficiency 2025-Jun-02, Translational vision science & technology IF:2.6Q2 DOI:10.1167/tvst.14.6.19 PMID:40492997	研究论文	研究通过WNT模拟物激活信号通路，促进泪腺腺泡细胞再生，逆转干眼病的水性泪液缺乏	首次使用抗体基础的WNT模拟物平台激活泪腺腺泡细胞，恢复泪液分泌	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体试验中验证	探索WNT信号激活对泪腺腺泡细胞再生和泪液分泌恢复的作用	小鼠泪腺腺泡细胞和干眼病模型	再生医学	干眼病	单细胞测序	小鼠器官模型	基因表达数据	小鼠泪腺腺泡细胞
454	2025-06-16	Increased ocular plasma cells induce damaging α-synuclein+ microglia in autoimmune uveitis 2025-Jun, Mucosal immunology IF:7.9Q1 DOI:10.1016/j.mucimm.2025.02.007 PMID:40015479	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光技术，揭示了自身免疫性葡萄膜炎（AIU）中α-突触核蛋白阳性小胶质细胞作为受损眼细胞的主要亚群，并探讨了眼内浸润浆细胞（PCs）在疾病中的作用	首次发现α-突触核蛋白阳性小胶质细胞是AIU中受损眼细胞的主要亚群，并揭示了MUC1 PCs作为主要致病亚群的新作用，以及Rab1A在PCs生存和炎症反应中的调控机制	研究主要基于小鼠模型（EAU），虽然也在VKH患者中验证了部分发现，但人类样本量有限	阐明自身免疫性葡萄膜炎（AIU）中免疫细胞亚群及其对视网膜损伤的贡献机制	实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）小鼠模型和Vogt-Koyanagi-Harada（VKH）患者的浆细胞	免疫学	葡萄膜炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫荧光	EAU小鼠模型	基因表达数据、图像数据	未明确提及具体样本数量，包括EAU小鼠和VKH患者样本
455	2025-06-16	Single-cell sequencing reveals the same heterogeneity of neutrophils in heatstroke-induced lung and liver injury 2025-Jun, Mucosal immunology IF:7.9Q1 DOI:10.1016/j.mucimm.2025.03.005 PMID:40158777	研究论文	通过单细胞RNA测序技术揭示热射病诱导的肺和肝损伤中中性粒细胞的异质性	研究发现中性粒细胞通过'Cxcr2-Cxcl2'受体-配体对增强浸润是热射病诱导肺损伤的显著特征，并揭示了Cd177+中性粒细胞在器官损伤中的关键作用及Cebpe作为其分化的关键转录调控因子	研究仅基于小鼠模型，结果在人体中的适用性尚需验证	探索热射病诱导的多器官功能障碍（MODS）的机制	热射病小鼠模型的肺组织和肝组织	数字病理学	热射病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	小鼠模型	RNA-seq数据	NA
456	2025-06-16	Photo-Biomodulation of the Hippocampus Using Near-Infrared Laser to Enhance Cognitive Function in Mice 2025-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202417380 PMID:40190133	研究论文	研究使用近红外激光对小鼠海马进行光生物调节以增强认知功能的效果	首次展示了808 nm近红外激光通过光生物调节显著改善小鼠的学习和记忆能力，并减轻麻醉、手术和脂多糖诱导的认知功能障碍	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证	探索近红外激光光生物调节作为非侵入性认知功能障碍治疗方法的潜力	小鼠海马体	神经科学	认知功能障碍	单细胞RNA测序	NA	行为测试数据、电生理数据、分子生物学数据	未明确说明小鼠数量
457	2025-06-16	Single-Cell Atlas Reveals Tumorigenic Profiles and Immune Dynamics of Adrenal Incidentalomas 2025-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202413493 PMID:40190189	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术探究了肾上腺偶发瘤的肿瘤发生特性及免疫微环境动态	揭示了肾上腺皮质细胞亚型的基因表达模式与肿瘤发生的关联，发现Clusterin作为肾上腺皮质腺瘤的潜在生物标志物，以及MYCN阳性簇与嗜铬细胞瘤较差生存率的相关性	NA	探究肾上腺偶发瘤的肿瘤发生特性及免疫微环境动态	肾上腺偶发瘤（包括无功能肾上腺皮质腺瘤、Conn综合征和嗜铬细胞瘤）	数字病理学	肾上腺疾病	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	302,696个细胞
458	2025-06-16	Single-Cell Sequencing-Guided Annotation of Rare Tumor Cells for Deep Learning-Based Cytopathologic Diagnosis of Early Lung Cancer 2025-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202416921 PMID:40231585	研究论文	本研究利用单细胞DNA测序技术指导罕见肿瘤细胞的标注，开发了一种基于深度学习的细胞病理学诊断模型，用于早期肺癌的诊断	首次将单细胞DNA测序技术用于生成无偏见的、准确标注的数据集，并开发了深度学习模型以提高支气管肺泡灌洗液细胞学诊断的敏感性	模型在外部验证队列中的敏感性仍有提升空间，且样本量相对有限	提高早期肺癌的诊断准确率，特别是通过支气管肺泡灌洗液细胞学检查	支气管肺泡灌洗液中的脱落肿瘤细胞和良性细胞	数字病理学	肺癌	单细胞DNA测序（scDNA-Seq）	深度学习模型	图像	训练集包含580个ETCs和1106个良性细胞，发现队列156例，验证队列158例，外部验证队列141例
459	2025-06-16	Embryological cellular origins and hypoxia-mediated mechanisms in PIK3CA-driven refractory vascular malformations 2025-Jun, EMBO molecular medicine IF:9.0Q1 DOI:10.1038/s44321-025-00235-1 PMID:40234712	研究论文	本研究探讨了PIK3CA驱动的难治性血管畸形的胚胎细胞起源和缺氧介导机制	揭示了Pik3ca在心脏咽中胚层(CPM)中表达导致头颈部血管异常的机制，并通过单细胞RNA测序发现Pik3ca通过HIF介导的缺氧信号上调内皮细胞中Vegf-a的表达	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限	探究血管畸形的发病机制并为治疗提供新靶点	小鼠模型和人类血管畸形样本	血管生物学	血管畸形	单细胞RNA测序	小鼠模型	基因表达数据	未明确说明具体数量，包括小鼠模型和人类样本
460	2025-06-16	Single-cell transcriptomics reveals the interaction between fibroblasts and activated immune cells: an exploratory bioinformatics study of pro-inflammatory mechanisms in slow transit constipation 2025-Jun-01, International journal of surgery (London, England) DOI:10.1097/JS9.0000000000002415 PMID:40265474	研究论文	通过单细胞转录组学揭示了成纤维细胞与激活的免疫细胞之间的相互作用，探索了慢传输型便秘中促炎机制的生物信息学研究	鉴定了STC特异性的XCL2 + CD8 + T细胞，并揭示了它们与其他免疫细胞和肠道基质细胞之间的广泛细胞间通讯	样本量较小，仅包括6例STC病例和6例对照病例	阐明STC患者免疫微环境的潜在机制	慢传输型便秘（STC）患者和对照组的肠道组织	生物信息学	肠道疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	6例STC病例和6例对照病例