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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2025-10-06 |
Integrating Single-Cell and Experimental Analyses Uncover Macrophage Ferroptosis Is a Key Event in the Development of Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2025-Jun-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501120R
PMID:40542598
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研究论文 | 通过整合单细胞测序和实验分析,揭示巨噬细胞铁死亡是慢性阻塞性肺疾病发展的关键事件 | 首次结合单细胞测序和实验验证,系统阐明香烟烟雾通过诱导巨噬细胞铁死亡促进COPD发展的机制 | 研究主要基于公共数据库和小鼠模型,需要进一步人类样本验证 | 探究香烟烟雾诱导的巨噬细胞铁死亡在COPD发病机制中的作用 | COPD患者肺组织、RAW264.7细胞系、BMDM细胞、COPD小鼠模型 | 单细胞生物学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 免疫组化, qRT-PCR, western blotting | NA | 单细胞测序数据, 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 公共数据库GSE171541和GSE173896的单细胞数据,体外和体内细胞系实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 422 | 2025-10-06 |
Quantitative measurement of phenotype dynamics during cancer drug resistance evolution using genetic barcoding
2025-Jun-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59479-7
PMID:40541962
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研究论文 | 提出一种通过遗传谱系追踪和种群规模数据推断癌症耐药性动态的数学框架 | 无需直接测量耐药表型即可推断耐药性动态的数学框架 | 未直接测量耐药表型,依赖推断方法 | 理解癌症耐药性进化机制 | 结直肠癌细胞系SW620和HCT116 | 计算生物学 | 结直肠癌 | 遗传条形码技术、单细胞RNA测序、单细胞DNA测序 | 数学框架 | 遗传谱系追踪数据、种群规模数据 | 两种结直肠癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞DNA测序 | NA | NA |
| 423 | 2025-10-06 |
ISCU-p53 axis orchestrates macrophage polarization to dictate immunotherapy response in esophageal squamous cell carcinoma
2025-Jun-20, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07787-7
PMID:40541964
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示食管鳞状细胞癌中ISCU-p53轴通过调控巨噬细胞极化影响免疫治疗反应的机制 | 首次发现ISCU通过胞质滞留p53促进M2巨噬细胞极化的新机制,并证明靶向ISCU可增强抗PD-1抗体疗效 | NA | 探索食管鳞状细胞癌免疫治疗反应差异的分子机制 | 食管鳞状细胞癌患者的肿瘤微环境细胞 | 单细胞生物学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 接受PD-1抑制剂治疗的部分缓解、疾病稳定患者及未接受术前治疗的手术患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 424 | 2025-10-06 |
The critical role of PDGFRa + Sca1 + fibroblasts in angiogenesis and vascular repair in the corpus cavernosum
2025-Jun-20, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04434-y
PMID:40542354
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了阴茎海绵体中PDGFRa+Sca1+成纤维细胞在血管生成和修复中的关键作用 | 首次发现并鉴定了一个独特的PDGFRa+Sca1+成纤维细胞亚群,该亚群具有分化为内皮细胞和平滑肌细胞的潜力,并参与血管修复过程 | 研究主要基于动物模型,尚未在人类样本中得到验证 | 探究成纤维细胞在勃起功能障碍发病机制中的作用 | 糖尿病性ED和海绵体神经损伤性ED动物模型中的阴茎海绵体组织 | 单细胞生物学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | ED动物模型组织 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 425 | 2025-10-06 |
Human induced neural progenitor cells generated from three-dimensional aggregate-based culture significantly improve post-stroke recovery in tMCAO mice
2025-Jun-20, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04433-z
PMID:40542444
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研究论文 | 本研究开发了一种基于3D聚集体培养的高效诱导神经祖细胞生产方法,并验证其在脑卒中小鼠模型中的治疗效果 | 开发了可扩展的3D悬浮培养系统,避免了有害的细胞解离和重铺过程,并通过单细胞RNA测序揭示了iNPC的亚群特征 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未进行人体临床试验 | 开发高效的iNPC生产方法并评估其在脑卒中恢复中的治疗潜力 | 诱导多能干细胞来源的神经祖细胞和tMCAO小鼠模型 | 再生医学 | 脑卒中 | 单细胞RNA测序,3D细胞培养 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 3个iPSC细胞系,tMCAO小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 426 | 2025-10-06 |
Integrating multi-omics data to optimize immunotherapy in endometrial cancer: a comprehensive study
2025-Jun-20, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02978-2
PMID:40540226
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研究论文 | 通过整合多组学数据研究子宫内膜癌患者对免疫治疗反应的分子机制和肿瘤微环境特征 | 首次综合运用多组学数据和多种计算框架系统分析子宫内膜癌免疫治疗反应差异,特别关注肿瘤相关巨噬细胞亚型的作用 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 优化子宫内膜癌免疫治疗策略 | 子宫内膜癌患者 | 生物信息学 | 子宫内膜癌 | 多组学分析,单细胞RNA测序,体细胞突变分析,拷贝数变异分析 | TIDE,EaSIeR,ImmunoPhenoScore,ESTIMATE,TIMER,EPIC,Scissor算法 | 基因组学数据,转录组学数据,单细胞测序数据 | 来自公共数据库的子宫内膜癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 427 | 2025-10-06 |
In mice, discrete odors can selectively promote the neurogenesis of sensory neuron subtypes that they stimulate
2025-Jun-18, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.96152
PMID:40531183
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研究论文 | 研究发现特定气味能选择性促进小鼠嗅觉感觉神经元亚型的神经发生 | 首次证明离散气味能特异性加速对其敏感的嗅觉神经元亚型的生成速率 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在其它哺乳动物验证 | 探究嗅觉刺激如何影响特定嗅觉感觉神经元亚型的神经发生 | 小鼠嗅觉感觉神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 亚型特异性神经元出生日期标记 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 428 | 2025-10-06 |
The spatial and single-cell landscape of skin: Charting the multiscale regulation of skin immune function
2025-06, Seminars in immunology
IF:7.4Q1
DOI:10.1016/j.smim.2025.101958
PMID:40267702
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学技术在揭示皮肤免疫系统多尺度异质性方面的应用 | 整合单细胞和空间技术系统解析皮肤免疫景观的多尺度调控机制 | NA | 探讨皮肤免疫功能的分子和细胞特征及其空间调控机制 | 皮肤组织中的先天性和适应性免疫细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 429 | 2025-10-06 |
Selective inhibition of stromal mechanosensing suppresses cardiac fibrosis
2025-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08945-9
PMID:40307543
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研究论文 | 本研究通过抑制基质机械感受机制联合TGFβ通路调控,实现心脏成纤维细胞向静息状态的转化并缓解心脏纤维化 | 首次发现SRC激酶作为成纤维细胞富集的机械感受器,联合抑制SRC机械感受与TGFβ信号可产生协同抗纤维化效应 | 研究主要基于小鼠模型和工程化心脏组织,尚未在人类临床试验中验证 | 开发治疗心血管纤维化的机械治疗策略 | 心脏成纤维细胞和肌成纤维细胞 | 分子细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞测序分析,药理学抑制,工程化心脏组织模型 | 小鼠心力衰竭模型 | 转录组数据,形态学数据,代谢数据 | 公共人类和小鼠单细胞测序数据集的荟萃分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 430 | 2025-10-06 |
Low-dose interleukin-2 induces clonal expansion of BACH2-repressed effector regulatory T cells following acute coronary syndrome
2025-Jun, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-025-00652-y
PMID:40461772
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和T细胞受体分析,揭示低剂量IL-2在急性冠脉综合征患者中诱导效应调节性T细胞克隆性扩张的机制 | 首次发现低剂量IL-2能克隆性扩张BACH2抑制的效应调节性T细胞,并揭示其绕过BACH2调控的机制 | 研究样本量有限,需要更大规模研究验证 | 探索低剂量IL-2对急性冠脉综合征患者T细胞免疫调节的作用机制 | 急性冠脉综合征患者的T细胞 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序, T细胞受体分析 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 急性冠脉综合征患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 431 | 2025-10-06 |
Multigenerational cell tracking of DNA replication and heritable DNA damage
2025-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08986-0
PMID:40399682
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研究论文 | 通过多代单细胞追踪技术研究DNA复制模式和可遗传DNA损伤如何导致细胞异质性 | 开发了基于内源性标记蛋白的多代单细胞追踪方法,结合CRISPR基因组编辑同时追踪DNA复制模式和可遗传DNA损伤 | 研究仅限于异步生长的细胞,最多追踪四代细胞 | 阐明致癌扰动如何诱导姐妹细胞不对称性和表型异质性 | 哺乳动物细胞系 | 单细胞分析 | 癌症 | CRISPR基因组编辑, 单细胞转录组测序, 迭代染色 | 自定义计算工具 | 图像, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 432 | 2025-10-06 |
Integrated spatial omics of metabolic reprogramming and the tumor microenvironment in pancreatic cancer
2025-Jun-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112681
PMID:40538442
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组学、空间转录组学和空间代谢组学,研究胰腺癌中代谢重编程与肿瘤微环境的空间关系 | 首次将单细胞转录组学、空间转录组学和空间代谢组学整合分析,可视化代谢物与基因表达的空间共定位 | NA | 探索胰腺癌代谢重编程与肿瘤微环境的相互作用机制 | 胰腺癌肿瘤样本 | 空间多组学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 空间代谢组学, 伪时间轨迹分析 | scMetabolism | 转录组数据, 代谢组数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 433 | 2025-10-06 |
Comparison of spatial transcriptomics technologies using tumor cryosections
2025-Jun-20, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03624-4
PMID:40542418
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研究论文 | 比较五种空间转录组技术在髓母细胞瘤冰冻切片中的应用性能 | 首次系统比较四种成像技术和一种测序技术的空间转录组方法,并开发了重成像策略提高细胞分割准确性 | 仅使用一种肿瘤类型(MBEN)进行评估,可能不适用于其他肿瘤类型 | 评估不同空间转录组技术的性能差异,为方法选择提供指导 | 髓母细胞瘤伴广泛结节性(MBEN)的冰冻切片 | 空间转录组学 | 髓母细胞瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据,图像数据 | NA | 10x Genomics, NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | Visium, RNAscope HiPlex, Molecular Cartography, Merscope, Xenium | Visium(测序基础方法),四种成像基础方法:RNAscope HiPlex、Molecular Cartography、Merscope和Xenium |
| 434 | 2025-10-06 |
Artificial intelligence approaches for tumor phenotype stratification from single-cell transcriptomic data
2025-Jun-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98469
PMID:40511682
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研究论文 | 提出一种基于NLP文档嵌入技术的单细胞RNA测序分析框架SCellBOW,用于肿瘤表型分层和风险评估 | 首次将自然语言处理中的文档嵌入技术应用于单细胞转录组数据分析,能够识别具有临床意义的肿瘤亚群并评估其侵袭风险 | 缺乏与临床注释的直接关联,肿瘤表型空间复杂性带来的分析挑战 | 开发计算框架用于肿瘤表型异质性分析和风险分层 | 单细胞转录组数据中的恶性与非恶性细胞亚型 | 自然语言处理 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | 文档嵌入模型 | 单细胞转录组数据 | 人类脾细胞和匹配的外周血单个核细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 435 | 2025-10-06 |
Novel Aortic Dissection Model Links Endothelial Dysfunction and Immune Infiltration
2025-Jun-20, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326230
PMID:40365676
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研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9技术构建了携带FBN1基因新型错义突变的自发性主动脉夹层小鼠模型,揭示了内皮功能障碍与免疫细胞浸润在疾病发生中的关键作用 | 首次将非综合征性家族性主动脉夹层患者中发现的FBN1 p.G234D突变引入小鼠模型,并系统阐明了该突变导致TGFβ信号下调及免疫细胞浸润的分子机制 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类患者中验证相关发现;样本量相对有限 | 探究主动脉夹层的分子触发机制和病理进展过程 | 携带Fbn1G234D/G234D突变的基因编辑小鼠 | 分子病理学 | 主动脉夹层 | CRISPR/Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, 电子显微镜, 同步辐射成像, Western blot | 基因编辑小鼠模型 | 基因测序数据, 组织图像, 蛋白质印迹数据 | Fbn1G234D/G234D突变小鼠群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 436 | 2025-10-06 |
SM22α-Lineage Perivascular Stromal Cells Contribute to Abdominal Aortic Aneurysm
2025-Jun-20, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325750
PMID:40371535
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研究论文 | 本研究揭示了SM22α谱系血管周围基质细胞通过PGC-1α/YAP信号通路调控腹主动脉瘤发展的机制 | 首次发现SM22α谱系血管周围基质细胞在腹主动脉瘤中的作用机制,并证实PGC-1α通过调控YAP信号通路影响细胞分化平衡 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究血管周围脂肪组织在腹主动脉瘤发病机制中的作用 | 年轻和老年小鼠的血管周围基质细胞、人类动脉瘤样本 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,功能获得和缺失实验,转录组分析 | NA | 基因表达数据,影像数据 | 年轻(2-3月)和老年(18-20月)小鼠,人类动脉瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序,放射组学分析 | NA | NA |
| 437 | 2025-10-06 |
Multidimensional bioinformatics analysis of chondrosarcoma subtypes and TGF-β signaling networks using big data approaches
2025-Jun-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02931-3
PMID:40526169
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和生物信息学方法分析软骨肉瘤的细胞亚型及TGF-β信号网络 | 首次在软骨肉瘤中应用单细胞RNA测序技术揭示细胞异质性,重建细胞间相互作用网络,并利用机器学习模型进行基因表达模式分类 | 未提及样本数量限制或技术验证的局限性 | 解析软骨肉瘤的分子机制并识别潜在治疗靶点 | 临床和实验软骨肉瘤样本 | 生物信息学 | 软骨肉瘤 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | 机器学习模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 438 | 2025-10-06 |
Exploring genetic causal relationships between spinal cord injury and glioma: a Mendelian randomization study
2025-Jun-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02919-z
PMID:40526188
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研究论文 | 使用孟德尔随机化方法探索脊髓损伤与胶质瘤之间的遗传因果关系 | 首次采用孟德尔随机化方法系统研究脊髓损伤与胶质瘤之间的遗传因果关系,并结合多种数据分析方法进行验证 | 研究结果显示无显著因果关系,存在中度异质性,样本量有限 | 探究脊髓损伤与胶质瘤之间的潜在遗传因果关系 | 脊髓损伤和胶质瘤患者 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 孟德尔随机化,RNA测序,单细胞RNA测序,机器学习 | MR Egger回归,逆方差加权,加权模式 | 遗传数据,基因表达数据 | FinnGen R11发布数据集,TCGA和GEO数据库数据,GSE131928单细胞RNA测序数据 | NA | RNA-seq,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 439 | 2025-10-06 |
Roles of ACSL4/GPX4 and FSP1 in oxalate-induced acute kidney injury
2025-Jun-17, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02557-y
PMID:40527896
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了草酸盐诱导急性肾损伤中铁死亡的关键调控机制 | 首次在草酸盐诱导的急性肾损伤模型中证实ACSL4/GPX4和FSP1在肾小管细胞铁死亡中的关键调控作用 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究铁死亡关键基因在草酸盐诱导急性肾损伤中的调控作用和机制 | 小鼠急性肾损伤模型和鼠肾小管上皮细胞系(MTECs) | 单细胞测序分析 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 440 | 2025-10-06 |
Mechanical tension-induced Dalrd3 elevation enhances osteogenic differentiation of bone suture stem cells by upregulating Id3 translation
2025-Jun-17, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04380-9
PMID:40528244
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研究论文 | 本研究揭示了机械张力通过上调Dalrd3表达增强骨缝干细胞成骨分化的分子机制 | 首次发现机械张力通过Dalrd3调控tRNA m3C修饰进而促进Id3翻译激活骨缝干细胞成骨分化 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究机械张力调控颅颌面骨缝重塑的分子机制 | 小鼠骨缝干细胞 | 单细胞生物学 | 颅面畸形 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠快速上颌扩张模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |