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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2025-10-06 |
LARP7 Protects Vascular Smooth Muscle Cell Contractile Phenotype in CKD by Coupling with P300
2025-Jun-16, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000761
PMID:40522739
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研究论文 | 本研究揭示了LARP7通过耦合P300维持血管平滑肌细胞收缩表型并减轻慢性肾病相关血管病变的新机制 | 首次发现LARP7作为内源性正向调节因子,通过增强P300组蛋白乙酰转移酶活性和H3K27乙酰化来维持VSMC收缩表型 | NA | 探究LARP7在维持血管平滑肌细胞收缩表型和减轻慢性肾病相关血管病变中的作用机制 | 血管平滑肌细胞、慢性肾病患者和小鼠模型 | 分子生物学 | 慢性肾病、血管钙化、动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序、免疫染色分析、功能获得和缺失实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 慢性肾病患者和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 422 | 2025-10-06 |
Role for Complement C5 in Eosinophilic Inflammation of Severe Asthma
2025-Jun-16, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16616
PMID:40524528
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研究论文 | 本研究通过痰液蛋白质组学分析探讨补体C5在重度哮喘嗜酸性粒细胞炎症中的作用 | 首次通过蛋白质组学方法确定补体C5与嗜酸性粒细胞炎症的直接关联,并发现巨噬细胞是C5的主要来源 | 样本量有限,主要依赖痰液蛋白质组学数据,需要更大规模研究验证 | 阐明补体系统特别是C5在重度哮喘发病机制中的作用 | 重度哮喘患者和健康对照者,以及哮喘小鼠模型 | 生物医学研究 | 哮喘 | 数据依赖性采集质谱、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、单细胞RNA测序、免疫荧光染色 | NA | 蛋白质组学数据、RNA测序数据、临床生理数据 | 重度哮喘患者和健康对照者(具体数量未明确说明) | NA | 质谱分析、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 423 | 2025-10-06 |
Loss of N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 leads to meiotic prophase abnormalities and male sub-fertility in mice†
2025-Jun-15, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf052
PMID:40079145
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研究论文 | 本研究揭示了N6AMT1在小鼠精子发生过程中对减数分裂进程的关键调控作用 | 首次证明N6AMT1通过调控减数分裂性染色体失活和DNA双链断裂修复影响雄性生育能力 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探究N6AMT1在精子发生过程中的功能机制 | 小鼠生殖细胞和精子发生过程 | 生殖生物学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 染色体铺展分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 转录组数据 | N6amt1基因敲除小鼠及其对照 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 424 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics identify a chemotherapy-resistance related cluster overexpressed CLIC3 in ovarian cancer
2025-Jun-14, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02882-9
PMID:40515890
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研究论文 | 通过单细胞转录组学识别卵巢癌中与化疗耐药相关的细胞亚群及其关键标志物CLIC3 | 首次在单细胞水平识别出与卵巢癌化疗耐药相关的特异性上皮细胞亚群c3,并发现其关键标志物CLIC3通过整合素β1重分布和PI3K-AKT通路介导耐药机制 | 样本量较小(仅5个卵巢癌样本),需要在更大规模队列中验证发现 | 探索卵巢癌化疗耐药机制并识别关键生物标志物 | 卵巢癌患者样本(3例耐药,2例敏感) | 单细胞转录组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | GSVA,细胞通讯分析,加权基因共表达网络分析 | 单细胞转录组数据 | 5个卵巢癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 425 | 2025-10-06 |
Single-cell and bulk RNA analysis identifies EMT-associated CAF signatures and prognostic model in lung adenocarcinoma
2025-Jun-14, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02951-z
PMID:40517220
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,识别与上皮间质转化相关的癌症相关成纤维细胞特征基因,并构建肺腺癌预后模型 | 首次整合单细胞和bulk转录组数据识别EMT相关的CAF特征基因,并构建具有临床价值的预后风险评分模型 | 需要进一步研究验证这些发现的临床适用性和生物学机制 | 识别EMT相关的CAF特征基因并构建肺腺癌预后模型 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | Cox回归, LASSO回归, 风险评分模型 | RNA测序数据, 临床信息 | TCGA和GEO数据库中的肺腺癌患者数据 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 426 | 2025-10-06 |
Enhanced cytotoxicity of aging associated NKG2C + CD8 + T cells in ankylosing spondylitis via HLA-B27
2025-Jun-14, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-025-03585-w
PMID:40517268
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研究论文 | 本研究探讨了衰老与强直性脊柱炎发病机制的共同机制,发现HLA-B27通过激活PI3K-Akt信号通路增强NKG2C+CD8+T细胞的细胞毒性 | 首次揭示HLA-B27通过PI3K-Akt信号通路驱动衰老相关NKG2C+CD8+T细胞细胞毒性增强的机制 | 样本量相对有限(87例患者),动物模型与人类疾病存在物种差异 | 探索衰老与强直性脊柱炎发病的共同机制并确定潜在治疗靶点 | 强直性脊柱炎患者、匹配对照、胶原诱导关节炎小鼠模型、HLA-B27转基因小鼠 | 免疫学 | 强直性脊柱炎 | 多维流式细胞术、单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | 流式细胞数据、RNA测序数据 | 87例AS患者及匹配对照 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 427 | 2025-10-06 |
Exercise alters transcriptional profiles of senescence and gut barrier integrity in intestinal crypts of aging mice
2025-Jun-13, npj aging
IF:4.1Q2
DOI:10.1038/s41514-025-00242-z
PMID:40514364
|
研究论文 | 本研究探讨了运动如何通过改变衰老小鼠肠道隐窝中衰老相关转录谱和肠道屏障完整性来影响肠道健康 | 首次在单细胞水平揭示运动通过调控DNA复制、细胞周期进程和核糖体生物合成相关基因表达来抑制肠道干细胞衰老的分子机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证;机制研究仍需进一步深入 | 探究运动对衰老过程中肠道干细胞功能和肠道屏障完整性的影响 | 衰老小鼠模型的肠道隐窝细胞 | 单细胞转录组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 衰老小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 428 | 2025-10-06 |
Resolving spatial subclonal genomic heterogeneity of loss of heterozygosity and extrachromosomal DNA in gliomas
2025-Jun-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59805-z
PMID:40514380
|
研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学、肿瘤/正常DNA测序和bulk RNA测序,解析胶质瘤中空间亚克隆基因组异质性 | 首次结合空间转录组学与DNA测序技术系统揭示胶质瘤中染色体外DNA(ecDNA)和杂合性缺失的空间异质性模式 | 样本量有限(初始队列11例胶质瘤,验证队列6例胶质母细胞瘤),需要更大规模研究验证 | 解析胶质瘤中DNA水平体细胞拷贝数变化的空间组织特征 | 胶质瘤患者肿瘤组织(包含不同病理类型的初始队列和高级别胶质母细胞瘤验证队列) | 空间转录组学 | 胶质瘤 | 空间转录组学, 肿瘤/正常DNA测序, bulk RNA测序 | NA | 空间转录组数据, DNA测序数据, RNA测序数据 | 初始队列11例胶质瘤,验证队列6例高级别胶质母细胞瘤 | NA | 空间转录组学, DNA测序, RNA测序 | NA | NA |
| 429 | 2025-10-06 |
Gαi3: a crucial biomarker and therapeutic target in bladder cancer
2025-Jun-13, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00989-4
PMID:40514424
|
研究论文 | 本研究探讨了Gαi3在膀胱癌中的表达、功能和作用机制 | 首次系统揭示Gαi3通过Akt-mTOR通路促进膀胱癌进展,并发现其受转录因子GATA4调控 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床样本验证相对有限 | 阐明Gαi3在膀胱癌发生发展中的生物学功能和治疗潜力 | 膀胱癌细胞系、患者组织样本和裸鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 膀胱癌 | 生物信息学分析、单细胞测序、shRNA沉默、CRISPR/Cas9基因编辑、Western blot | NA | 基因表达数据、蛋白质印迹数据、单细胞测序数据 | 多种膀胱癌细胞系和患者组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 430 | 2025-10-06 |
Identification of biomarkers associated with exhausted CD8 + T cells in the tumor microenvironment of intrahepatic cholangiocarcinoma based on Mendelian randomization and bioinformatics analysis
2025-Jun-13, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02970-w
PMID:40514625
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研究论文 | 通过整合多种生物信息学方法和单细胞RNA测序数据,鉴定肝内胆管癌肿瘤微环境中耗竭CD8+T细胞相关生物标志物 | 首次结合BayesPrism去卷积、WGCNA和汇总孟德尔随机化方法分析肝内胆管癌肿瘤微环境中的耗竭CD8+T细胞 | NA | 鉴定肝内胆管癌肿瘤微环境中与耗竭CD8+T细胞相关的生物标志物和治疗靶点 | 肝内胆管癌肿瘤微环境中的细胞亚群,特别是耗竭CD8+T细胞 | 生物信息学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序, BayesPrism去卷积, WGCNA, 汇总孟德尔随机化 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 431 | 2025-10-06 |
Development of a circadian-related prognostic signature highlights RBM17 as a stemness regulator in liver cancer
2025-Jun-13, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03843-6
PMID:40514677
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研究论文 | 本研究开发了基于昼夜节律基因的肝癌预后特征,并揭示RBM17通过促进癌症干细胞表型驱动肝癌进展 | 首次整合单细胞、批量和空间转录组学解析昼夜节律基因失调与肿瘤微环境的关联,并鉴定RBM17作为肝癌干细胞性调控因子 | 未明确说明样本量大小,机制研究仍需进一步验证 | 阐明昼夜节律失调影响肝癌进展的分子机制并开发预后预测模型 | 肝癌患者样本和实验模型 | 生物信息学 | 肝癌 | 多组学分析,机器学习,单细胞转录组测序,空间转录组测序,体内外实验 | 机器学习算法 | 基因组数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 432 | 2025-10-06 |
TORC: Target-Oriented Reference Construction for supervised cell-type identification in scRNA-seq
2025-Jun-10, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03614-6
PMID:40495172
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研究论文 | 本文提出了一种用于单细胞RNA测序监督细胞类型识别的目标导向参考数据构建方法 | 开发了首个针对单细胞RNA测序监督细胞类型识别的参考数据选择和构建方法,能够缓解参考数据与目标数据之间的数据分布和细胞类型组成差异 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 监督学习方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 433 | 2025-10-06 |
UDA-seq: universal droplet microfluidics-based combinatorial indexing for massive-scale multimodal single-cell sequencing
2025-Jun, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02586-y
PMID:39833568
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研究论文 | 开发了一种通用的液滴微流控组合索引方法UDA-seq,用于大规模多模态单细胞测序 | 通过引入后索引步骤增强通量,并系统适配现有基于液滴的单细胞多模态方法,实现单次实验从数十个临床活检样本生成超过10万个高质量单细胞数据集 | NA | 开发通用型单细胞多模态测序工作流程,提高自动化程度和临床适用性 | 多种组织和细胞类型,包括临床活检标本 | 单细胞测序技术 | 癌症 | 单细胞多模态测序,液滴微流控技术 | NA | 单细胞多模态数据(RNA、VDJ、染色质、CRISPR扰动) | 从36个冷冻临床活检标本中生成超过100,000个高质量单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞多组学 | NA | 液滴微流控平台 |
| 434 | 2025-10-06 |
Exploring the Mechanisms of Microenergy Acoustic Pulse Therapy for the Treatment of Female Stress Urinary Incontinence-Part II
2025-Jun, Neurourology and urodynamics
IF:1.8Q3
DOI:10.1002/nau.70048
PMID:40338807
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术探索微能量声脉冲疗法治疗雌性压力性尿失禁的分子机制 | 首次在单细胞分辨率下研究MAP疗法对尿道组织微环境中细胞异质性和信号通路的影响 | 研究基于动物模型,结果需在临床试验中验证 | 探索MAP疗法治疗压力性尿失禁的作用机制 | 阴道分娩损伤诱导的压力性尿失禁大鼠模型 | 单细胞测序 | 压力性尿失禁 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 压力性尿失禁大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 435 | 2025-10-06 |
Pioneer factor ETV2 safeguards endothelial cell specification by recruiting the repressor REST to restrict alternative lineage commitment
2025-Jun, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-025-00660-y
PMID:40495012
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研究论文 | 本研究揭示了先驱因子ETV2通过招募抑制因子REST来限制替代谱系承诺,从而保障内皮细胞定向分化的机制 | 首次在单细胞分辨率下阐明ETV2通过招募转录抑制因子REST来抑制非内皮细胞谱系基因的创新机制 | 研究主要基于体外诱导多能干细胞模型,尚未在体内发育环境中验证 | 探索ETV2调控内皮细胞谱系定向分化的分子机制 | 人诱导多能干细胞来源的中胚层祖细胞 | 发育生物学 | NA | CUT&RUN, 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 基因组学数据, 表观基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 436 | 2025-10-06 |
[Single-cell transcriptomics combined with bioinformatics for comprehensive analysis of macrophage subpopulations and hub genes in ischemic stroke]
2025-Jun, Xi bao yu fen zi mian yi xue za zhi = Chinese journal of cellular and molecular immunology
PMID:40525338
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研究论文 | 通过单细胞转录组学结合生物信息学方法分析缺血性脑卒中中巨噬细胞亚群特征及关键基因 | 首次结合单细胞RNA测序和hdWGCNA方法鉴定缺血性脑卒中特异性巨噬细胞亚群(MSM),并发现三个具有诊断价值的关键基因 | NA | 探索缺血性脑卒中中巨噬细胞亚群的特征及其在疾病中的作用机制 | 缺血性脑卒中模型中的巨噬细胞 | 生物信息学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞RNA测序, 高维加权基因共表达网络分析, 细胞间通讯分析, 伪时间轨迹分析, 基因集富集分析 | NA | 单细胞转录组数据, 微阵列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 437 | 2025-10-06 |
Plaque erosion risk and JAK2 V617F variant
2025-Jun-16, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehaf114
PMID:40053703
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研究论文 | 本研究探讨JAK2 V617F突变与斑块侵蚀风险之间的关联及其潜在机制 | 首次明确JAK2 V617F突变与心肌梗死特定机制——斑块侵蚀的强相关性,并通过单细胞RNA测序揭示中性粒细胞活化在其中的作用机制 | 病例对照研究设计无法确定因果关系,样本来源单一 | 探究JAK2 V617F突变与心肌梗死不同机制(斑块侵蚀vs斑块破裂)的关联性 | 728例斑块侵蚀患者、919例斑块破裂患者和804例对照个体 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 数字滴液PCR, 单细胞RNA测序 | 逻辑回归分析 | 基因测序数据, 临床数据 | 2451例(728侵蚀+919破裂+804对照) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 438 | 2025-10-06 |
Identification of potential drug targets for erectile dysfunction with single-cell RNA sequencing: A Mendelian randomization study
2025-Jun-15, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.70082
PMID:40518741
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法识别勃起功能障碍的潜在药物靶点 | 首次结合孟德尔随机化、共定位分析和单细胞RNA测序技术系统识别ED治疗靶点 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 识别勃起功能障碍的新型治疗靶点 | 勃起功能障碍患者和相关细胞类型 | 生物信息学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 分子对接 | 孟德尔随机化模型 | 基因表达数据, 基因组数据 | eQTLGen联盟31,684人;ED研究229,980人(6,175病例)和95,178人(1,154病例) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集GSE206528 |
| 439 | 2025-10-06 |
Role and Validation of Lactylation-Related Gene Markers in Postmenopausal Osteoporosis
2025-Jun, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05216-1
PMID:40131629
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多组学数据分析,探讨了乳酸化相关基因在绝经后骨质疏松症中的作用并构建诊断模型 | 首次将乳酸化修饰与PMOP发病机制联系起来,结合单细胞测序、孟德尔随机化分析和多种机器学习算法构建诊断模型 | 研究样本量有限,需要更大规模的数据验证模型的泛化能力 | 探索乳酸化相关基因在绝经后骨质疏松症发病机制中的作用并开发诊断标志物 | 绝经后骨质疏松症患者的单细胞RNA测序数据和转录组数据 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 孟德尔随机化分析 | 多种机器学习算法组合 | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 440 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomic Landscape Deciphers Intratumoral Heterogeneity and Subtypes of Acral and Mucosal Melanomas
2025-Jun-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3164
PMID:40192737
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了肢端黑色素瘤和黏膜黑色素瘤的瘤内异质性及分子亚型 | 首次在单细胞水平系统比较肢端和黏膜黑色素瘤的肿瘤异质性,发现两种黑色素瘤具有不同的进化路径和微环境特征 | 样本量相对有限(42例),需要更大规模研究验证发现 | 解析肢端和黏膜黑色素瘤的瘤内异质性及微环境特征,为精准治疗提供依据 | 42例黑色素瘤样本(28例肢端黑色素瘤,11例黏膜黑色素瘤,3例非肢端皮肤黑色素瘤) | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,全外显子测序,体外迁移实验,共培养系统,异种移植模型 | NA | 单细胞转录组数据,基因组数据 | 42例黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq,全外显子测序 | NA | NA |