单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 717 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2025-10-06 |
Low-dose interleukin-2 induces clonal expansion of BACH2-repressed effector regulatory T cells following acute coronary syndrome
2025-Jun, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-025-00652-y
PMID:40461772
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和T细胞受体分析，揭示低剂量IL-2在急性冠脉综合征患者中诱导效应调节性T细胞克隆性扩张的机制 | 首次发现低剂量IL-2能克隆性扩张BACH2抑制的效应调节性T细胞，并揭示其绕过BACH2调控的机制 | 研究样本量有限，需要更大规模研究验证 | 探索低剂量IL-2对急性冠脉综合征患者T细胞免疫调节的作用机制 | 急性冠脉综合征患者的T细胞 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序, T细胞受体分析 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 急性冠脉综合征患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 402 | 2025-10-06 |
TSC22 domain family member 3 links natural killer cells to CD8+ T cell-mediated drug hypersensitivity
2025-Jun-21, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02300-0
PMID:40544157
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示TSC22D3调控的自然杀伤细胞在药物超敏反应中的关键作用 | 首次发现TSC22D3缺陷通过增强NK细胞效应功能，将免疫应答从CD4+T细胞转向CD8+T细胞功能 | 研究主要基于DHS患者和小鼠模型，需在其他SCARs类型中验证 | 探索自然杀伤细胞在严重皮肤药物不良反应发病机制中的作用 | DHS患者、dapsone耐受个体和小鼠模型 | 免疫学 | 药物超敏反应 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | DHS患者与dapsone耐受个体的血液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 403 | 2025-10-06 |
BCAT1 Activation Reprograms Branched-Chain Amino Acid Metabolism and Epigenetically Promotes Inflammation in Diabetic Retinopathy
2025-Jun-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.6.59
PMID:40530920
|
研究论文 | 本研究探讨了BCAT1激活如何重编程支链氨基酸代谢并通过表观遗传机制促进糖尿病视网膜病变中的炎症反应 | 首次揭示BCAT1在糖尿病条件下通过调节α-酮戊二酸水平影响组蛋白甲基化状态，从而表观遗传调控炎症基因表达的新机制 | 研究主要聚焦于Müller细胞，其他视网膜细胞类型的作用尚未完全阐明 | 研究支链氨基酸代谢重编程及其在糖尿病视网膜病变进展中的贡献 | 糖尿病小鼠模型和Müller细胞 | 代谢组学与表观遗传学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞测序, 靶向代谢组学, 染色质免疫沉淀, RNA测序, 激酶筛选 | 糖尿病小鼠模型 | 基因表达数据, 代谢物数据, 表观遗传数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 404 | 2025-10-06 |
Multigenerational cell tracking of DNA replication and heritable DNA damage
2025-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08986-0
PMID:40399682
|
研究论文 | 通过多代单细胞追踪技术研究DNA复制模式和可遗传DNA损伤如何导致细胞异质性 | 开发了基于内源性标记蛋白的多代单细胞追踪方法，结合CRISPR基因组编辑同时追踪DNA复制模式和可遗传DNA损伤 | 研究仅限于异步生长的细胞，最多追踪四代细胞 | 阐明致癌扰动如何诱导姐妹细胞不对称性和表型异质性 | 哺乳动物细胞系 | 单细胞分析 | 癌症 | CRISPR基因组编辑, 单细胞转录组测序, 迭代染色 | 自定义计算工具 | 图像, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 405 | 2025-10-06 |
Integrated spatial omics of metabolic reprogramming and the tumor microenvironment in pancreatic cancer
2025-Jun-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112681
PMID:40538442
|
研究论文 | 通过整合单细胞转录组学、空间转录组学和空间代谢组学，研究胰腺癌中代谢重编程与肿瘤微环境的空间关系 | 首次将单细胞转录组学、空间转录组学和空间代谢组学整合分析，可视化代谢物与基因表达的空间共定位 | NA | 探索胰腺癌代谢重编程与肿瘤微环境的相互作用机制 | 胰腺癌肿瘤样本 | 空间多组学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 空间代谢组学, 伪时间轨迹分析 | scMetabolism | 转录组数据, 代谢组数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 406 | 2025-10-06 |
Comparison of spatial transcriptomics technologies using tumor cryosections
2025-Jun-20, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03624-4
PMID:40542418
|
研究论文 | 比较五种空间转录组技术在髓母细胞瘤冰冻切片中的应用性能 | 首次系统比较四种成像技术和一种测序技术的空间转录组方法，并开发了重成像策略提高细胞分割准确性 | 仅使用一种肿瘤类型（MBEN）进行评估，可能不适用于其他肿瘤类型 | 评估不同空间转录组技术的性能差异，为方法选择提供指导 | 髓母细胞瘤伴广泛结节性（MBEN）的冰冻切片 | 空间转录组学 | 髓母细胞瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据，图像数据 | NA | 10x Genomics, NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | Visium, RNAscope HiPlex, Molecular Cartography, Merscope, Xenium | Visium（测序基础方法），四种成像基础方法：RNAscope HiPlex、Molecular Cartography、Merscope和Xenium |
| 407 | 2025-10-06 |
The impact of de novo lipogenesis on predicting survival and clinical therapy: an exploration based on a multigene prognostic model in hepatocellular carcinoma
2025-Jun-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06704-y
PMID:40533802
|
研究论文 | 基于从头脂质生成相关基因构建肝细胞癌预后风险模型并探索其与免疫微环境和治疗反应的关系 | 首次基于从头脂质生成通路构建包含六个特征基因的肝细胞癌预后模型，并系统分析风险分型与免疫细胞浸润模式及治疗反应的关联 | 样本量相对有限，需要更多独立队列验证模型的普适性 | 开发肝细胞癌预后预测模型并探索从头脂质生成在肿瘤进展中的作用机制 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | LASSO-Cox回归分析，免疫组织化学，Western blotting，多重免疫荧光染色，单细胞RNA测序 | 预后风险模型 | 基因表达数据，临床数据，单细胞测序数据 | TCGA、GEO、ICGC-LIRI数据集及湘雅队列106例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 408 | 2025-10-06 |
Artificial intelligence approaches for tumor phenotype stratification from single-cell transcriptomic data
2025-Jun-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98469
PMID:40511682
|
研究论文 | 提出一种基于NLP文档嵌入技术的单细胞RNA测序分析框架SCellBOW，用于肿瘤表型分层和风险评估 | 首次将自然语言处理中的文档嵌入技术应用于单细胞转录组数据分析，能够识别具有临床意义的肿瘤亚群并评估其侵袭风险 | 缺乏与临床注释的直接关联，肿瘤表型空间复杂性带来的分析挑战 | 开发计算框架用于肿瘤表型异质性分析和风险分层 | 单细胞转录组数据中的恶性与非恶性细胞亚型 | 自然语言处理 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | 文档嵌入模型 | 单细胞转录组数据 | 人类脾细胞和匹配的外周血单个核细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 409 | 2025-10-06 |
Novel Aortic Dissection Model Links Endothelial Dysfunction and Immune Infiltration
2025-Jun-20, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326230
PMID:40365676
|
研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9技术构建了携带FBN1基因新型错义突变的自发性主动脉夹层小鼠模型，揭示了内皮功能障碍与免疫细胞浸润在疾病发生中的关键作用 | 首次将非综合征性家族性主动脉夹层患者中发现的FBN1 p.G234D突变引入小鼠模型，并系统阐明了该突变导致TGFβ信号下调及免疫细胞浸润的分子机制 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类患者中验证相关发现；样本量相对有限 | 探究主动脉夹层的分子触发机制和病理进展过程 | 携带Fbn1G234D/G234D突变的基因编辑小鼠 | 分子病理学 | 主动脉夹层 | CRISPR/Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, 电子显微镜, 同步辐射成像, Western blot | 基因编辑小鼠模型 | 基因测序数据, 组织图像, 蛋白质印迹数据 | Fbn1G234D/G234D突变小鼠群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 410 | 2025-10-06 |
SM22α-Lineage Perivascular Stromal Cells Contribute to Abdominal Aortic Aneurysm
2025-Jun-20, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325750
PMID:40371535
|
研究论文 | 本研究揭示了SM22α谱系血管周围基质细胞通过PGC-1α/YAP信号通路调控腹主动脉瘤发展的机制 | 首次发现SM22α谱系血管周围基质细胞在腹主动脉瘤中的作用机制，并证实PGC-1α通过调控YAP信号通路影响细胞分化平衡 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究血管周围脂肪组织在腹主动脉瘤发病机制中的作用 | 年轻和老年小鼠的血管周围基质细胞、人类动脉瘤样本 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，功能获得和缺失实验，转录组分析 | NA | 基因表达数据，影像数据 | 年轻（2-3月）和老年（18-20月）小鼠，人类动脉瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序，放射组学分析 | NA | NA |
| 411 | 2025-10-06 |
Multidimensional bioinformatics analysis of chondrosarcoma subtypes and TGF-β signaling networks using big data approaches
2025-Jun-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02931-3
PMID:40526169
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和生物信息学方法分析软骨肉瘤的细胞亚型及TGF-β信号网络 | 首次在软骨肉瘤中应用单细胞RNA测序技术揭示细胞异质性，重建细胞间相互作用网络，并利用机器学习模型进行基因表达模式分类 | 未提及样本数量限制或技术验证的局限性 | 解析软骨肉瘤的分子机制并识别潜在治疗靶点 | 临床和实验软骨肉瘤样本 | 生物信息学 | 软骨肉瘤 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | 机器学习模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 412 | 2025-10-06 |
Exploring genetic causal relationships between spinal cord injury and glioma: a Mendelian randomization study
2025-Jun-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02919-z
PMID:40526188
|
研究论文 | 使用孟德尔随机化方法探索脊髓损伤与胶质瘤之间的遗传因果关系 | 首次采用孟德尔随机化方法系统研究脊髓损伤与胶质瘤之间的遗传因果关系，并结合多种数据分析方法进行验证 | 研究结果显示无显著因果关系，存在中度异质性，样本量有限 | 探究脊髓损伤与胶质瘤之间的潜在遗传因果关系 | 脊髓损伤和胶质瘤患者 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 孟德尔随机化，RNA测序，单细胞RNA测序，机器学习 | MR Egger回归，逆方差加权，加权模式 | 遗传数据，基因表达数据 | FinnGen R11发布数据集，TCGA和GEO数据库数据，GSE131928单细胞RNA测序数据 | NA | RNA-seq，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 413 | 2025-10-06 |
Roles of ACSL4/GPX4 and FSP1 in oxalate-induced acute kidney injury
2025-Jun-17, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02557-y
PMID:40527896
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了草酸盐诱导急性肾损伤中铁死亡的关键调控机制 | 首次在草酸盐诱导的急性肾损伤模型中证实ACSL4/GPX4和FSP1在肾小管细胞铁死亡中的关键调控作用 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究铁死亡关键基因在草酸盐诱导急性肾损伤中的调控作用和机制 | 小鼠急性肾损伤模型和鼠肾小管上皮细胞系(MTECs) | 单细胞测序分析 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 414 | 2025-10-06 |
Pathway-based cancer transcriptome deciphers a high-resolution intrinsic heterogeneity within bladder cancer classification
2025-Jun-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06682-1
PMID:40528211
|
研究论文 | 本研究通过基于通路的癌症转录组分析，揭示了膀胱癌内在异质性并建立了新的分子分型系统 | 首次利用单细胞转录组数据识别纯肿瘤细胞，建立了不受肿瘤微环境干扰的膀胱癌内在分子分型系统 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证分型的临床适用性 | 探索膀胱癌内在基因表达谱对患者分类和预后的贡献程度及机制 | 膀胱癌患者样本 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 机器学习算法 | 多种机器学习算法 | 单细胞转录组数据, 批量RNA测序数据 | GSE135337和TCGA膀胱癌数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 415 | 2025-10-06 |
Decoding hippocampal subfield and glial responses in ischemia using single-cell transcriptomics
2025-Jun-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06738-2
PMID:40528218
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组技术解析缺血条件下海马不同亚区和胶质细胞的分子响应特征 | 首次在单细胞水平揭示海马CA1和CA3-DG区域在缺血后胶质细胞和血管细胞的异质性响应，发现新的少突胶质细胞亚型及区域特异性周细胞变化 | 研究仅使用大鼠模型，样本量有限，且未验证功能机制 | 探究全脑缺血条件下海马不同亚区的细胞分子变化机制 | Sprague-Dawley大鼠海马CA1和CA3-DG区域细胞 | 单细胞组学 | 脑缺血 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 四血管阻塞模型大鼠与正常对照大鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 416 | 2025-10-06 |
Mechanical tension-induced Dalrd3 elevation enhances osteogenic differentiation of bone suture stem cells by upregulating Id3 translation
2025-Jun-17, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04380-9
PMID:40528244
|
研究论文 | 本研究揭示了机械张力通过上调Dalrd3表达增强骨缝干细胞成骨分化的分子机制 | 首次发现机械张力通过Dalrd3调控tRNA m3C修饰进而促进Id3翻译激活骨缝干细胞成骨分化 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究机械张力调控颅颌面骨缝重塑的分子机制 | 小鼠骨缝干细胞 | 单细胞生物学 | 颅面畸形 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠快速上颌扩张模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 417 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial transcriptome analyses reveal MAZ(+) NPC-like clusters as key role contributing to glioma recurrence and drug resistance
2025-Jun-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06706-w
PMID:40524155
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组分析揭示MAZ(+) NPC样细胞簇在胶质瘤复发和耐药中的关键作用 | 首次在单细胞和空间转录组水平系统揭示MAZ(+) NPC样细胞簇是胶质瘤替莫唑胺耐药的关键细胞群体，并阐明MAZ通过上调FOXM1增强干细胞特性和DNA修复能力的分子机制 | 研究样本量有限，需要更大规模队列验证；机制研究主要在细胞水平，缺乏动物模型验证 | 探究胶质瘤替莫唑胺耐药的细胞异质性机制和潜在治疗策略 | 胶质瘤患者肿瘤样本（替莫唑胺治疗前后） | 数字病理 | 胶质瘤 | 单细胞测序, 空间转录组, 批量RNA测序 | 细胞聚类分析, 转录因子活性分析, 药物敏感性分析 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量RNA测序数据 | 替莫唑胺治疗前后的胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | NA | NA |
| 418 | 2025-10-06 |
The high efficacy of claudin18.2-targeted CAR-T cell therapy in advanced pancreatic cancer with an antibody-dependent safety strategy
2025-Jun-04, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.01.012
PMID:39797399
|
研究论文 | 本研究报道了使用表达tEGFR的claudin18.2靶向CAR-T细胞治疗晚期胰腺癌患者的疗效和安全性 | 首次报道claudin18.2靶向CAR-T细胞在晚期胰腺癌中的临床应用，并采用抗体依赖性安全开关策略控制脱靶毒性 | 样本量较小（仅3例患者），需要更大规模研究验证 | 评估claudin18.2靶向CAR-T细胞治疗晚期胰腺癌的疗效和安全性 | 3例晚期胰腺癌患者 | 肿瘤免疫治疗 | 胰腺癌 | CAR-T细胞治疗，单细胞转录组测序，T细胞受体测序 | NA | 临床数据，单细胞测序数据 | 3例患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 419 | 2025-10-06 |
The release of NETs during SFTSV infection downregulates the specific inflammatory factors that lead to liver and spleen damage
2025-Jun-04, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiaf053
PMID:40275780
|
研究论文 | 本研究探讨了严重发热伴血小板减少综合征病毒感染期间中性粒细胞胞外诱捕网释放对特定炎症因子的下调作用及其导致的肝脾损伤机制 | 首次发现SFTSV感染可触发NETosis过程，并通过单细胞测序和转录组分析揭示了NETs对炎症因子的下调作用及其与器官损伤的关联 | 研究提出的机制仍处于假设阶段，需要进一步实验验证 | 探究SFTSV感染过程中NETs释放对炎症因子表达和器官损伤的影响机制 | SFTSV感染患者样本、细胞模型和动物模型 | 传染病学 | 病毒感染性疾病 | 单细胞测序, 转录组测序 | 细胞模型, 动物模型 | 基因表达数据 | SFTSV患者单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 420 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis Reveals Fibroblast-Derived Migrasomes as CXCL12 Carriers Promoting Skin Wound Repair
2025-Jun, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70112
PMID:40527746
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析发现成纤维细胞来源的迁移体可作为CXCL12载体促进皮肤伤口修复 | 首次报道迁移体在组织修复中的作用，发现成纤维细胞来源的迁移体通过传递CXCL12促进伤口愈合 | NA | 探究迁移体在皮肤伤口修复过程中的功能机制 | 人类和大鼠皮肤、口腔黏膜、成纤维细胞、HaCaT细胞 | 单细胞分析 | 皮肤伤口 | 超分辨率共聚焦显微镜、聚焦离子束扫描电子显微镜、多重免疫荧光染色、活细胞成像、单细胞测序 | NA | 图像、测序数据 | 人类和大鼠皮肤及口腔黏膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |