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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2025-10-06 |
Multidimensional bioinformatics analysis of chondrosarcoma subtypes and TGF-β signaling networks using big data approaches
2025-Jun-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02931-3
PMID:40526169
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和生物信息学方法分析软骨肉瘤的细胞亚型及TGF-β信号网络 | 首次在软骨肉瘤中应用单细胞RNA测序技术揭示细胞异质性,重建细胞间相互作用网络,并利用机器学习模型进行基因表达模式分类 | 未提及样本数量限制或技术验证的局限性 | 解析软骨肉瘤的分子机制并识别潜在治疗靶点 | 临床和实验软骨肉瘤样本 | 生物信息学 | 软骨肉瘤 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | 机器学习模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 382 | 2025-10-06 |
Exploring genetic causal relationships between spinal cord injury and glioma: a Mendelian randomization study
2025-Jun-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02919-z
PMID:40526188
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研究论文 | 使用孟德尔随机化方法探索脊髓损伤与胶质瘤之间的遗传因果关系 | 首次采用孟德尔随机化方法系统研究脊髓损伤与胶质瘤之间的遗传因果关系,并结合多种数据分析方法进行验证 | 研究结果显示无显著因果关系,存在中度异质性,样本量有限 | 探究脊髓损伤与胶质瘤之间的潜在遗传因果关系 | 脊髓损伤和胶质瘤患者 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 孟德尔随机化,RNA测序,单细胞RNA测序,机器学习 | MR Egger回归,逆方差加权,加权模式 | 遗传数据,基因表达数据 | FinnGen R11发布数据集,TCGA和GEO数据库数据,GSE131928单细胞RNA测序数据 | NA | RNA-seq,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 383 | 2025-10-06 |
Roles of ACSL4/GPX4 and FSP1 in oxalate-induced acute kidney injury
2025-Jun-17, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02557-y
PMID:40527896
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了草酸盐诱导急性肾损伤中铁死亡的关键调控机制 | 首次在草酸盐诱导的急性肾损伤模型中证实ACSL4/GPX4和FSP1在肾小管细胞铁死亡中的关键调控作用 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究铁死亡关键基因在草酸盐诱导急性肾损伤中的调控作用和机制 | 小鼠急性肾损伤模型和鼠肾小管上皮细胞系(MTECs) | 单细胞测序分析 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 384 | 2025-10-06 |
Pathway-based cancer transcriptome deciphers a high-resolution intrinsic heterogeneity within bladder cancer classification
2025-Jun-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06682-1
PMID:40528211
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研究论文 | 本研究通过基于通路的癌症转录组分析,揭示了膀胱癌内在异质性并建立了新的分子分型系统 | 首次利用单细胞转录组数据识别纯肿瘤细胞,建立了不受肿瘤微环境干扰的膀胱癌内在分子分型系统 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证分型的临床适用性 | 探索膀胱癌内在基因表达谱对患者分类和预后的贡献程度及机制 | 膀胱癌患者样本 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 机器学习算法 | 多种机器学习算法 | 单细胞转录组数据, 批量RNA测序数据 | GSE135337和TCGA膀胱癌数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 385 | 2025-10-06 |
Decoding hippocampal subfield and glial responses in ischemia using single-cell transcriptomics
2025-Jun-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06738-2
PMID:40528218
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组技术解析缺血条件下海马不同亚区和胶质细胞的分子响应特征 | 首次在单细胞水平揭示海马CA1和CA3-DG区域在缺血后胶质细胞和血管细胞的异质性响应,发现新的少突胶质细胞亚型及区域特异性周细胞变化 | 研究仅使用大鼠模型,样本量有限,且未验证功能机制 | 探究全脑缺血条件下海马不同亚区的细胞分子变化机制 | Sprague-Dawley大鼠海马CA1和CA3-DG区域细胞 | 单细胞组学 | 脑缺血 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 四血管阻塞模型大鼠与正常对照大鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 386 | 2025-10-06 |
Mechanical tension-induced Dalrd3 elevation enhances osteogenic differentiation of bone suture stem cells by upregulating Id3 translation
2025-Jun-17, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04380-9
PMID:40528244
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研究论文 | 本研究揭示了机械张力通过上调Dalrd3表达增强骨缝干细胞成骨分化的分子机制 | 首次发现机械张力通过Dalrd3调控tRNA m3C修饰进而促进Id3翻译激活骨缝干细胞成骨分化 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究机械张力调控颅颌面骨缝重塑的分子机制 | 小鼠骨缝干细胞 | 单细胞生物学 | 颅面畸形 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠快速上颌扩张模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 387 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial transcriptome analyses reveal MAZ(+) NPC-like clusters as key role contributing to glioma recurrence and drug resistance
2025-Jun-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06706-w
PMID:40524155
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组分析揭示MAZ(+) NPC样细胞簇在胶质瘤复发和耐药中的关键作用 | 首次在单细胞和空间转录组水平系统揭示MAZ(+) NPC样细胞簇是胶质瘤替莫唑胺耐药的关键细胞群体,并阐明MAZ通过上调FOXM1增强干细胞特性和DNA修复能力的分子机制 | 研究样本量有限,需要更大规模队列验证;机制研究主要在细胞水平,缺乏动物模型验证 | 探究胶质瘤替莫唑胺耐药的细胞异质性机制和潜在治疗策略 | 胶质瘤患者肿瘤样本(替莫唑胺治疗前后) | 数字病理 | 胶质瘤 | 单细胞测序, 空间转录组, 批量RNA测序 | 细胞聚类分析, 转录因子活性分析, 药物敏感性分析 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量RNA测序数据 | 替莫唑胺治疗前后的胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | NA | NA |
| 388 | 2025-10-06 |
The high efficacy of claudin18.2-targeted CAR-T cell therapy in advanced pancreatic cancer with an antibody-dependent safety strategy
2025-Jun-04, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.01.012
PMID:39797399
|
研究论文 | 本研究报道了使用表达tEGFR的claudin18.2靶向CAR-T细胞治疗晚期胰腺癌患者的疗效和安全性 | 首次报道claudin18.2靶向CAR-T细胞在晚期胰腺癌中的临床应用,并采用抗体依赖性安全开关策略控制脱靶毒性 | 样本量较小(仅3例患者),需要更大规模研究验证 | 评估claudin18.2靶向CAR-T细胞治疗晚期胰腺癌的疗效和安全性 | 3例晚期胰腺癌患者 | 肿瘤免疫治疗 | 胰腺癌 | CAR-T细胞治疗,单细胞转录组测序,T细胞受体测序 | NA | 临床数据,单细胞测序数据 | 3例患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 389 | 2025-10-06 |
The release of NETs during SFTSV infection downregulates the specific inflammatory factors that lead to liver and spleen damage
2025-Jun-04, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiaf053
PMID:40275780
|
研究论文 | 本研究探讨了严重发热伴血小板减少综合征病毒感染期间中性粒细胞胞外诱捕网释放对特定炎症因子的下调作用及其导致的肝脾损伤机制 | 首次发现SFTSV感染可触发NETosis过程,并通过单细胞测序和转录组分析揭示了NETs对炎症因子的下调作用及其与器官损伤的关联 | 研究提出的机制仍处于假设阶段,需要进一步实验验证 | 探究SFTSV感染过程中NETs释放对炎症因子表达和器官损伤的影响机制 | SFTSV感染患者样本、细胞模型和动物模型 | 传染病学 | 病毒感染性疾病 | 单细胞测序, 转录组测序 | 细胞模型, 动物模型 | 基因表达数据 | SFTSV患者单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 390 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis Reveals Fibroblast-Derived Migrasomes as CXCL12 Carriers Promoting Skin Wound Repair
2025-Jun, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70112
PMID:40527746
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析发现成纤维细胞来源的迁移体可作为CXCL12载体促进皮肤伤口修复 | 首次报道迁移体在组织修复中的作用,发现成纤维细胞来源的迁移体通过传递CXCL12促进伤口愈合 | NA | 探究迁移体在皮肤伤口修复过程中的功能机制 | 人类和大鼠皮肤、口腔黏膜、成纤维细胞、HaCaT细胞 | 单细胞分析 | 皮肤伤口 | 超分辨率共聚焦显微镜、聚焦离子束扫描电子显微镜、多重免疫荧光染色、活细胞成像、单细胞测序 | NA | 图像、测序数据 | 人类和大鼠皮肤及口腔黏膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 391 | 2025-10-06 |
The bone marrow NK-cell profile predicts MRD negativity in patients with multiple myeloma treated with daratumumab-based therapy
2025-Jun-19, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024026455
PMID:40019438
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学、流式细胞术和功能实验,探讨骨髓NK细胞特征对多发性骨髓瘤患者达雷妥尤单抗治疗后MRD阴性状态的预测价值 | 首次揭示诊断时骨髓CD16+ NK细胞比例与达雷妥尤单抗治疗后MRD阴性率的相关性,并证明这种预测作用具有治疗特异性 | 研究基于CASSIOPEIA临床试验队列,样本来源和治疗方案相对特定 | 评估骨髓NK细胞特征对多发性骨髓瘤免疫治疗疗效的预测作用 | 多发性骨髓瘤患者 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组学, 流式细胞术, 功能实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 功能实验数据 | CASSIOPEIA临床试验患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 392 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome unveils mesenchymal cell diversity in endometriosis
2025-Jun-18, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaf065
PMID:40302519
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示子宫内膜异位症中间充质细胞的多样性及其功能 | 首次构建子宫内膜异位症的单细胞图谱,鉴定出6个间充质细胞亚群并揭示其在疾病中的关键功能 | 样本量较小(仅6个卵巢组织),仅关注间充质细胞而未涉及其他细胞类型 | 探究子宫内膜异位症中间充质细胞的异质性及其在疾病发生中的作用机制 | 人类卵巢组织(3个子宫内膜异位症样本和3个正常卵巢样本) | 单细胞组学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6个卵巢组织(3个病变,3个正常) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 393 | 2025-10-06 |
Microglial pruning of glycinergic synapses disinhibits spinal PKCγ interneurons to drive pain hypersensitivity in mice
2025-Jun-18, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adk8096
PMID:40531965
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研究论文 | 本研究揭示脊髓小胶质细胞通过修剪抑制性突触导致PKCγ中间神经元去抑制,从而驱动神经病理性疼痛的机制 | 首次阐明小胶质细胞通过特异性修剪甘氨酸能突触导致脊髓PKCγ中间神经元去抑制,并鉴定出参与此过程的LXR/ApoE/C1q信号通路 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证;机制研究主要聚焦于脊髓水平 | 探究脊髓小胶质细胞在神经病理性疼痛相关神经环路调控中的具体作用机制 | 小鼠脊髓小胶质细胞和PKCγ中间神经元 | 神经科学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序, 药理学干预, 光遗传学, 基因操作, 行为学测试, 共聚焦成像, 膜片钳记录 | NA | 基因表达数据, 电生理数据, 行为学数据, 影像数据 | 小鼠神经病理性疼痛模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 394 | 2025-10-06 |
ECT2+ cell group acts as cancer stem cell in malignant pleomorphic adenoma
2025-Jun-17, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00974-x
PMID:40523903
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别了恶性多形性腺瘤中的癌症干细胞群ECT2+细胞 | 首次在恶性多形性腺瘤中鉴定出ECT2+细胞作为癌症干细胞,并证明其与肿瘤侵袭性和预后的关联 | NA | 探索恶性多形性腺瘤中癌症干细胞的特性及其临床意义 | 恶性多形性腺瘤肿瘤组织和细胞系 | 数字病理学 | 唾液腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 395 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics analysis of the healing process of ligament rupture
2025-Jun-17, Bone & joint research
IF:4.7Q1
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了韧带断裂修复过程中的细胞组成和遗传特征 | 首次在韧带组织中明确区分了肌腱细胞和成纤维细胞,并发现了人类前交叉韧带组织中肌腱细胞的10种不同亚型 | 样本量较小(仅6例),时间点有限(仅三个时间点) | 研究韧带断裂修复和愈合过程中的细胞和遗传学特征 | 前交叉韧带组织(来自3名健康个体和3名韧带断裂患者) | 单细胞组学 | 韧带损伤 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 单细胞基因表达数据 | 6例样本(3例健康,3例患者),83,195个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 396 | 2025-10-06 |
Single-cell dissection of prognostic architecture and immunotherap response in Helicobacter pylori infection-associated gastric cancer
2025-Jun-17, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.99337
PMID:40525824
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示幽门螺杆菌感染相关胃癌的细胞异质性及其对免疫治疗反应的影响 | 首次在单细胞水平系统解析HpGC的细胞组成异质性,发现iCAF与Angio-TAM的相互作用机制,并建立可预测免疫治疗疗效的分子标志 | 样本量有限(共24例),缺乏独立验证队列 | 解析幽门螺杆菌感染相关胃癌的细胞分子特征与免疫治疗反应机制 | 胃癌患者(当前感染/既往感染/未感染)和健康对照的胃组织样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 24例样本(9例HpGC、3例ex-HpGC、6例non-HpGC、6例健康对照) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 397 | 2025-10-06 |
Single-Cell Expression Analysis of Ductal Carcinoma In Situ Identifies Complex Genotypic-Phenotypic Relationships Altering Epithelial Composition
2025-Jun-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-3023
PMID:40101158
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析乳腺导管原位癌,揭示肿瘤内克隆异质性与细胞状态变化对基底膜完整性的影响 | 首次在单细胞水平揭示DCIS中克隆异质性与细胞状态分化的关系,发现基底膜完整性失衡是侵袭转化的关键机制 | 样本量有限,需要更大队列验证细胞状态比例与预后的关联 | 探究乳腺导管原位癌向浸润性乳腺癌转化的分子机制 | 乳腺导管原位癌病变组织与匹配的正常乳腺组织 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 系统发育分析 | 单细胞转录组数据 | DCIS病变和匹配正常组织的临床标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 398 | 2025-10-06 |
A multi-type programmed cell death gene signature predicts survival and reveals therapeutic targets in osteosarcoma
2025-Jun-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02944-y
PMID:40522389
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研究论文 | 本研究通过整合多种程序性细胞死亡相关基因,构建了一个能够预测骨肉瘤患者生存期的预后模型 | 首次整合18种程序性细胞死亡类型相关基因,建立了四基因预后特征模型,并利用单细胞RNA测序技术验证基因在不同细胞类型中的表达 | 研究基于公共数据库的回顾性数据,需要前瞻性研究进一步验证模型的临床适用性 | 开发骨肉瘤预后预测模型并识别潜在治疗靶点 | 骨肉瘤患者 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 转录组分析,单细胞RNA-seq,LASSO回归,功能富集分析 | LASSO回归模型 | 基因表达数据,临床数据 | 来自GEO和TARGET数据库的骨肉瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 399 | 2025-10-06 |
Whole genome sequencing and single-cell transcriptomics identify KMT2D inactivation as a potential new driver for pituitary tumors: a case report
2025-Jun-16, BJC reports
DOI:10.1038/s44276-025-00155-0
PMID:40523964
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病例报告 | 通过全基因组测序和单细胞转录组学识别KMT2D失活作为垂体肿瘤潜在新驱动因子的病例研究 | 首次发现组蛋白甲基转移酶KMT2D可能是垂体神经内分泌肿瘤的新驱动基因,并揭示了其与转移性癌症相似的分子特征 | 仅基于单个病例报告,需要更大样本量验证 | 探索垂体神经内分泌肿瘤的分子驱动机制 | 一名50多岁混合性生长激素-催乳素细胞瘤患者 | 数字病理学 | 垂体肿瘤 | 全基因组测序, 单细胞RNA测序, DNA甲基化分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | 1例垂体肿瘤患者样本 | NA | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 400 | 2025-10-06 |
Integrative analysis of bulk and single-cell gene expression profiles to identify bone marrow mesenchymal cell heterogeneity and prognostic significance in multiple myeloma
2025-Jun-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06637-6
PMID:40524208
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研究论文 | 通过整合单细胞和bulk转录组数据分析多发性骨髓瘤中骨髓间充质细胞的异质性及其预后意义 | 首次发现并定义了表达高迁移率族蛋白的独特间充质干细胞亚群HMGhMSC,并基于此构建了预后模型 | 样本量相对有限,需要更大规模的研究验证 | 探究多发性骨髓瘤中骨髓间充质细胞的异质性及其在疾病进展中的作用 | 健康供体和多发性骨髓瘤患者的骨髓样本 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,bulk转录组测序 | COX回归,LASSO回归 | 基因表达数据 | 使用GSE4581和GSE136337数据集作为训练集和验证集 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |