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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-09-07
TREM2 macrophages mediate the beneficial effects of bariatric surgery against MASH
2025-06-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究通过小鼠模型发现垂直袖状胃切除术可减轻代谢功能障碍相关脂肪性肝炎的进展,且效果不依赖于体重减轻,并揭示了TREM2阳性巨噬细胞在其中发挥的关键修复作用 首次证明减重手术的免疫调节机制,发现TREM2+脂质相关巨噬细胞通过抑制炎症和增强溶酶体活性及胞葬功能介导MASH缓解,且效果与体重无关 未明确提及,但可推测主要基于小鼠模型,人类中该机制需进一步验证 探究减重手术(VSG)改善MASH的免疫调节机制,特别是TREM2+巨噬细胞的作用 小鼠模型中的肝脏巨噬细胞,特别是表达TREM2的脂质相关巨噬细胞 免疫学 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 涉及小鼠模型,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
22 2026-09-06
Endogenous Retroelement Activation is Implicated in Interferon-α Production and Anti-Cyclic Citrullinated Peptide Autoantibody Generation in Early Rheumatoid Arthritis
2025-06, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本研究首次在早期类风湿关节炎中检测内源性逆转录元件的表达,探讨其与干扰素-α产生及抗环瓜氨酸肽自身抗体的关联 首次在早期类风湿关节炎外周血和滑膜组织中检测内源性逆转录元件表达,发现其与干扰素-α及抗CCP抗体的潜在因果关系 NA 探讨内源性逆转录元件在早期类风湿关节炎中作为干扰素产生触发因素的可能性及其与自身抗体的关联 早期类风湿关节炎和早期银屑病关节炎患者的外周血样本、滑膜组织样本及B细胞亚群 免疫学 类风湿关节炎 逆转录聚合酶链反应、NanoString、流式细胞分选、单细胞测序再分析 NA 基因表达数据、单细胞测序数据 滑膜组织样本22例,全血样本56例 NanoString, 10x Genomics 批量RNA测序、单细胞测序 NanoString平台、10x单细胞平台 NanoString基因表达分析、单细胞RNA测序(平台配置未知)
23 2026-09-03
Primitive Hepatoblasts Driving Early Liver Development
2025-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究识别并表征了一类位于早期肝芽腹后侧、源自CDX2+FOXA2+内胚层祖细胞的原始肝母细胞,揭示其在早期肝脏发育中的贡献及调控机制 首次发现并定义了原始肝母细胞这一新的早期肝母细胞亚群,利用单细胞转录组学、谱系追踪和表观遗传扰动等手段揭示了其受WNT抑制和RA许可调控的起源机制,并通过人多能干细胞分化模型验证其功能 摘要未提及研究的局限性,可能包括样本数量有限、动物模型与人类的差异、以及早期发育阶段的动态调控尚未完全阐明 阐明早期肝脏发育中肝母细胞的谱系异质性和调控机制,为正常和异常肝脏发育的研究提供新框架 小鼠和人类胚胎早期的肝母细胞及其祖细胞,以及人多能干细胞衍生的原始肝母细胞样细胞 单细胞转录组学、发育生物学 不适用 单细胞RNA测序、谱系追踪、表观遗传与功能扰动、人多能干细胞分化 不适用 单细胞转录组数据、表观遗传数据、谱系追踪数据 小鼠和人类胚胎样本,具体数量未在摘要中提供 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
24 2026-09-03
Pdia3 deficiency exacerbates intestinal injury by disrupting goblet and Paneth cell function during ischemia/reperfusion
2025-06, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 本研究探讨了Pdia3缺乏通过破坏杯状细胞和潘氏细胞功能加剧肠缺血/再灌注损伤的作用机制 首次揭示PDIA3在肠道上皮细胞分化及抗菌肽分泌中的关键作用,并证实重组防御素α1可缓解Pdia3缺失引起的肠道损伤 摘要中未提及研究局限性 阐明PDIA3在肠缺血/再灌注损伤中维持肠道完整性和免疫功能的作用 人类和小鼠肠道组织,包括肠上皮细胞、杯状细胞、潘氏细胞及肠道微生物 分子生物学 肠缺血/再灌注损伤 单细胞RNA测序、免疫组化、转录组分析 条件性基因敲除小鼠模型 基因表达数据、组织图像、微生物组数据 人类患者及Pdia3条件性敲除小鼠 NA 单细胞RNA测序 NA NA
25 2026-08-31
Plin2 Coordinates Immune and Metabolic Reprogramming in Lacrimal Gland Aging
2025-06-02, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 本研究通过批量转录组和单细胞RNA测序,识别出Plin2作为泪腺衰老的核心调控因子,并揭示其在免疫失衡和代谢功能障碍中的作用 首次将Plin2确定为泪腺衰老中免疫-代谢重编程的主调控因子,并通过机器学习和单细胞测序验证其与促炎和抗炎免疫细胞的相关性 信息未提供,可能存在样本量有限或机制验证不足的限制 识别泪腺衰老的核心分子调控因子并阐明其在免疫失衡及代谢功能障碍中的角色 幼年和老年C57BL/6小鼠的泪腺组织 机器学习 干眼症 批量RNA测序、单细胞RNA测序(scRNA-seq) LASSO回归、支持向量机-递归特征消除(SVM-RFE) 转录组数据 未提供具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
26 2026-08-31
Single-Cell RNA Sequencing of Rabbit Sclera at Different Developmental Stages: Unveiling Scleral Cells Atlas and the Heterogeneity of Fibroblasts
2025-06-02, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 该研究构建了不同发育阶段兔巩膜的单细胞转录组图谱,揭示了成纤维细胞异质性、分化轨迹和细胞间通讯。 首次构建兔巩膜发育的单细胞图谱,揭示了成纤维细胞的异质性及其在基质重塑中的作用,并通过跨物种分析发现保守的分子特征。 未提及 构建兔巩膜发育的单细胞图谱,阐明成纤维细胞异质性、分化轨迹、基质体表达模式和细胞间通讯。 新西兰兔的巩膜组织,来自胚胎第25天和出生后第7、21、180天。 单细胞转录组学 眼部发育相关疾病(如近视) 单细胞RNA测序 Seurat、VIA、CellChat、AUCell、CACIMAR、hdWGCNA 单细胞转录组数据 4个发育阶段的兔巩膜样本(E25、P7、P21、P180) BGI 单细胞RNA测序 BGISEQ-2000 DNBelab C系列试剂盒,BGISEQ-2000平台
27 2026-08-31
Emerging technologies of single-cell multi-omics
2025-06-01, Haematologica IF:8.2Q1
综述 本文概述了单细胞多组学技术原理、历史发展及其在造血系统异质性研究中的应用,并指导研究者选择合适的平台 系统梳理了单细胞多组学技术的原理和发展历史,并针对造血系统的研究需求提供了平台选择的指导 未详述具体技术细节或实验方案,可能无法覆盖所有最新进展 综述单细胞多组学技术,并指导研究者根据研究问题选择合适平台 正常和恶性造血系统细胞 单细胞组学 血液系统疾病 单细胞多组学技术 NA 单细胞多组学数据 NA NA 单细胞多组学 NA NA
28 2026-08-31
Phosphodiesterase 5 inactivation in vascular smooth muscle cells aggravates aortic aneurysm and dissection
2025-06, The Journal of pathology IF:5.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和动物模型,发现血管平滑肌细胞中磷酸二酯酶5A的失活会加剧主动脉瘤和主动脉夹层的发生 首次揭示了平滑肌细胞特异性PDE5A在主动脉瘤和夹层发病中的因果作用,并阐明了其通过cGMP/PKG通路调节平滑肌收缩性的机制 摘要中未提及研究的局限性 探究平滑肌细胞特异性PDE5A在主动脉瘤和夹层发病机制中的作用 人类和小鼠主动脉组织、平滑肌细胞特异性PDE5A敲除和过表达小鼠 数字病理学 主动脉瘤和主动脉夹层 单细胞RNA测序、西方印迹、免疫荧光、免疫组织化学、体内成像、组织学分析 基因敲除和过表达小鼠模型 图像和基因组数据 未明确样本数量,涉及人类和小鼠主动脉组织及多种小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
29 2026-08-28
HKDC1 promotes liver cancer stemness under hypoxia through stabilizing β-catenin
2025-06-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究揭示HKDC1在缺氧条件下通过稳定β-catenin促进肝癌干性,从而推动转移,为晚期肝癌治疗提供新靶点 首次发现HKDC1与肝癌转移潜力最强相关,并通过结合糖原合成酶激酶3β稳定β-catenin,增强肝癌细胞干性 未提供具体局限性信息 比较HKDC1与其他HK在肝癌中的细胞类型特异性,并探究其促进肝癌转移的分子机制 肝癌细胞、小鼠模型及患者肿瘤样本 数字病理学 肝细胞癌、胆管癌 RNA原位杂交、单细胞RNA测序、代谢组学分析 NA 基因表达数据、代谢谱数据 来自两种肝癌小鼠模型的肿瘤和类器官,以及肝癌和胆管癌患者肿瘤样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序用于分析HKDC1在恶性细胞中的特异性表达
30 2026-08-27
Multi-omics Analysis Reveals Molecular Subtype of Mitochondrial Oxidative Stress and Prognostic Model Development in Sepsis
2025-06-20, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
研究论文 通过多组学分析揭示脓毒症中线粒体氧化应激相关基因的分子亚型,并构建预后模型 首次识别出三种关键线粒体氧化应激相关基因(RNASE2、CX3CR1和EPHX2)作为脓毒症的潜在诊断标志物,并通过单细胞RNA测序和体外实验验证了RNASE2在调控脓毒症线粒体氧化应激中的核心作用 研究主要基于公共数据库数据,样本来源有限,且缺乏体内实验验证,临床适用性需进一步评估 探究线粒体氧化应激相关基因在脓毒症免疫调节中的作用,并开发预后风险模型 脓毒症患者样本及正常对照样本 机器学习和生物信息学 脓毒症 转录组测序、单细胞RNA测序 加权基因共表达网络分析、LASSO回归、Cox回归 基因表达数据、单细胞转录组数据 来自GEO数据库的多个数据集,具体样本数未在摘要中明确 NA NA NA NA
31 2026-08-27
BCAT1 Activation Reprograms Branched-Chain Amino Acid Metabolism and Epigenetically Promotes Inflammation in Diabetic Retinopathy
2025-06-02, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 研究BCAT1激活如何重塑支链氨基酸代谢并通过表观遗传促进糖尿病视网膜病变中的炎症反应 首次揭示BCAT1在Müller细胞中介导BCAA代谢重塑,并通过减少α-酮戊二酸导致组蛋白甲基化增加,从而表观遗传上调炎症基因表达 未提及具体局限性 探讨支链氨基酸代谢重塑及其在糖尿病视网膜病变进展中的作用 糖尿病视网膜病变中的Müller细胞和小鼠模型 数字病理学 糖尿病视网膜病变 单细胞测序、靶向代谢组学、染色质免疫沉淀、RNA测序、激酶筛选 NA 基因表达数据、代谢物数据、组蛋白修饰数据 未提及具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
32 2026-08-26
Single-cell transcriptomics yield insights into the stress-immune interplay and inform disease risk
2025-Jun-12, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 利用单细胞转录组学揭示应激激素(皮质醇和去甲肾上腺素)对免疫细胞的细胞类型特异性影响,并关联疾病风险 首次在单细胞分辨率下探究生理应激水平激素对原代外周血单个核细胞和中性粒细胞的转录组响应,识别出新的应激激素依赖的细胞类型特异性基因和炎症相关特征,并应用于人类队列以区分应激相关疾病 摘要未提及局限性,可能涉及样本量或体外模型的局限性 阐明应激激素在单细胞和细胞类型水平上调节免疫功能的机制,并评估其对疾病风险的影响 原代外周血单个核细胞和中性粒细胞 单细胞转录组学 应激相关疾病(包括心血管疾病、精神疾病和自身免疫性疾病) 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 两个独立人类队列(具体数量未提供) NA 单细胞RNA-seq NA NA
33 2026-08-23
Histone deacetylases facilitate Th17-cell differentiation and pathogenicity in autoimmune uveitis via CDK6/ID2 axis
2025-06, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序和实验模型,揭示了组蛋白去乙酰化酶通过CDK6/ID2轴促进自身免疫性葡萄膜炎中Th17细胞分化和致病性的机制 首次发现HDACs通过CDK6/ID2正反馈环路调控Th17细胞致病性,并提出HDAC抑制剂Belinostat作为潜在治疗策略 未明确说明研究的局限性 探究自身免疫性葡萄膜炎中组蛋白去乙酰化酶对Th17细胞分化和致病性的作用机制,并评估HDAC抑制剂的治疗潜力 自身免疫性葡萄膜炎患者的外周血单个核细胞和小鼠实验性自身免疫性葡萄膜炎模型 免疫学 自身免疫性葡萄膜炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、siRNA、特异性抑制剂、过继转移实验 NA 单细胞转录组数据、流式细胞术数据 未明确说明患者和动物样本的具体数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
34 2026-08-22
Peripheral blood neutrophils contribute to Claudin18.2-specific CAR-T cell treatment resistance in advanced gastric cancer
2025-Jun, British journal of cancer IF:6.4Q1
研究论文 本研究探讨外周血中性粒细胞对晚期胃癌中Claudin18.2特异性CAR-T细胞治疗耐药性的贡献,并揭示其分子机制 首次揭示中性粒细胞与淋巴细胞比率(NLR)在CAR-T治疗中的预后价值,并通过单细胞测序识别出与疾病进展相关的中性粒细胞亚群(NE-3)及其促肿瘤机制 需要进一步验证以及探索减轻中性粒细胞诱导免疫抑制的策略 评估NLR在CLDN18.2特异性CAR-T细胞治疗中的预后价值,并阐明治疗耐药的分子机制 接受CLDN18.2特异性CAR-T细胞治疗的晚期胃癌患者 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序 NA 外周血样本的基因表达数据 未在标题和摘要中明确 NA 单细胞RNA测序 NA NA
35 2026-08-20
Lineage-resolved analysis of embryonic gene expression evolution in C. elegans and C. briggsae
2025-06-19, Science (New York, N.Y.)
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序比较了秀丽隐杆线虫和布氏杆线虫胚胎发育过程中的基因表达进化,发现尽管物种间分化了数千万年,基因表达程序仍高度相似,但数千个基因的细胞类型特异性表达存在差异,尤其在神经元细胞类型中更为显著 首次利用谱系分辨的单细胞RNA测序技术,在具有保守不变胚胎谱系的两种线虫中系统比较了同源细胞的基因表达进化,揭示了发育过程中基因表达进化的约束和分化模式 文章未提供明确的局限性信息,可能包括对神经元亚型差异的深入机制解析不足或未涉及非神经元功能验证等 探究发育过程中基因表达模式进化的约束,并识别细胞类型特异性表达差异的基因及其功能富集 秀丽隐杆线虫和布氏杆线虫的胚胎细胞 单细胞转录组学 不适用 单细胞RNA测序 不适用 单细胞基因表达数据 两种线虫的胚胎样本,具体数量未提供 不适用 单细胞RNA测序 不适用 不适用
36 2026-08-20
Multiomics identifies tumor-intrinsic SREBP1 driving immune exclusion in hepatocellular carcinoma
2025-Jun-15, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 通过多组学分析发现肿瘤内在的SREBP1驱动肝细胞癌的免疫排斥,并提出潜在治疗靶点 首次通过大规模多组学分析(RNA-seq、蛋白质组、单细胞RNA-seq、成像质谱细胞术和空间脂质组学)识别SREBP1作为肝细胞癌免疫排斥的关键调控因子,并利用3D共培养模型验证其通过M2样巨噬细胞重编程抑制CD8 T细胞浸润 研究主要基于体外3D共培养模型,缺乏体内实验验证,且未涉及临床ICI治疗反应的患者分层验证 识别肝细胞癌中与免疫排斥相关的肿瘤内在驱动因子,以克服免疫检查点抑制剂耐药 肝细胞癌肿瘤标本(900+人类样本)和31个肿瘤单细胞RNA-seq样本,包括HepG2细胞系 基因组学, 蛋白质组学, 单细胞转录组学 肝细胞癌 RNA-seq, 蛋白质组学, 单细胞RNA-seq, 成像质谱细胞术, 空间脂质组学(MALDI), CRISPR敲除, 3D共培养 NA 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据, 图像数据, 空间脂质组数据 900+人类肿瘤标本(用于RNA-seq和蛋白质组学)和31个肿瘤样本(用于单细胞RNA-seq) NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间脂质组学, 成像质谱细胞术 NA NA
37 2026-08-20
Fibroblast hierarchy dynamics during mammary gland morphogenesis and tumorigenesis
2025-Jun, The EMBO journal
研究论文 本研究通过纵向单细胞转录组分析,揭示了小鼠乳腺正常发育和肿瘤发生过程中成纤维细胞的层级动态变化 首次解析了乳腺正常发育和肿瘤发生过程中成纤维细胞的层级分化动态,并发现Wnt9a是CD34肌成纤维细胞癌相关成纤维细胞衰老的调控因子 研究基于小鼠模型,需进一步在人类样本中验证 阐明乳腺正常形态发生和肿瘤发生过程中成纤维细胞的层级动态及其调控机制 小鼠乳腺组织中的成纤维细胞 单细胞转录组学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 超过45,000个小鼠乳腺成纤维细胞,覆盖五个发育阶段和肿瘤发生过程 NA 单细胞RNA-seq NA NA
38 2026-08-19
Embryological cellular origins and hypoxia-mediated mechanisms in PIK3CA-driven refractory vascular malformations
2025-06, EMBO molecular medicine IF:9.0Q1
研究论文 本研究探讨了PIK3CA驱动的难治性血管畸形中胚胎细胞起源和缺氧介导机制,并通过小鼠模型和人类样本验证了HIF-1α和VEGF-A的致病作用 首次揭示了头颈部血管畸形中血管和淋巴管的胚胎起源为心咽中胚层,并发现了PIK3CA通过HIF介导的缺氧信号上调VEGF-A表达的新机制 研究主要基于小鼠模型和人类样本的关联性分析,未完全阐明PIK3CA突变导致血管畸形的全部分子通路,且人类样本验证的规模有限 阐明PIK3CA驱动的头颈部难治性血管畸形的发病机制,并探索潜在的治疗靶点 心咽中胚层(CPM)表达Pik3ca的小鼠模型以及人类血管畸形样本 分子生物学 血管畸形 单细胞RNA测序 小鼠模型 基因表达数据 小鼠模型和少量人类样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3'测序
39 2026-08-18
DDR2-mediated autophagy inhibition contributes to angiotensin II-induced adventitial remodeling
2025-06, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究探讨DDR2介导的自噬抑制在血管紧张素II诱导的外膜重塑中的作用及其机制 首次揭示DDR2通过PI3K/Akt/mTOR通路抑制自噬,促进成纤维细胞向肌成纤维细胞转化,从而加剧外膜重塑 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,临床相关性需进一步验证 探究DDR2是否通过mTOR信号通路抑制自噬,促进外膜成纤维细胞转化和外膜重塑 血管紧张素II处理的小鼠和原代外膜成纤维细胞 分子生物学 高血压 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠模型及细胞实验 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
40 2026-08-13
The impact of de novo lipogenesis on predicting survival and clinical therapy: an exploration based on a multigene prognostic model in hepatocellular carcinoma
2025-06-18, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 基于从头脂肪生成通路构建多基因预后模型,用于预测肝细胞癌的生存和临床治疗反应 首次构建基于从头脂肪生成通路的多基因预后模型,并结合单细胞RNA测序和多因子免疫荧光染色,揭示高风险组免疫抑制微环境与治疗耐药性的关联 未提及明显的局限性 探索从头脂肪生成在肝细胞癌预后预测中的作用,并评估其与免疫微环境和临床治疗的相关性 肝细胞癌患者样本 机器学习和数字病理学 肝细胞癌 RNA测序、单细胞RNA测序、免疫组化、Western blotting、多因子免疫荧光染色 LASSO-Cox回归模型 基因表达数据、免疫组化图像、单细胞转录组数据 TCGA、GEO、ICGC-LIRI数据集及湘雅队列(n=106) NA bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq NA NA
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