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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-05-03
IL-32-mediated caspase-43 induction: Shaping macrophage differentiation & immunomodulation in glioblastoma multiforme
2025-06, The Indian journal of medical research
研究论文 研究IL-32在胶质母细胞瘤(GBM)中通过诱导caspase-43表达来调控单核细胞分化、巨噬细胞极化的免疫调节作用 首次揭示IL-32通过caspase-43介导单核细胞分化为巨噬细胞,并通过激活NF-κB通路诱导M1向M2表型转换,以及发现IL-32与RNA修饰基因(METTL3、TET2)的表观遗传调控关联 未提及具体局限性 探究IL-32在GBM中的免疫调节功能,特别是对单核细胞分化和巨噬细胞极化的影响 胶质母细胞瘤(GBM)组织和细胞系,以及单核细胞和巨噬细胞 数字病理学 胶质母细胞瘤 转录组分析、qPCR、蛋白质印迹、单细胞RNA测序 NA 转录组数据(基因表达)、单细胞RNA测序数据 TCGA-GBM和GEO-GSE156902数据集,具体样本量未提及 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA NA
22 2026-05-02
Elucidating brain transport pathways and cell type-dependent gene silencing of a durable lipid-siRNA conjugate administered into cerebrospinal fluid
2025-Jun-20, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本研究开发了一种脂质-siRNA偶联物(L2-siRNA),注入脑脊液后可有效运输至大脑,实现区域性和细胞类型依赖的基因沉默 首次详细阐述了脂质-siRNA偶联物在脑脊液到大脑转运中的特性,展示了单次注射后长达5个月的持续基因沉默效果,并通过单细胞RNA测序构建了细胞类型特异性敲除图谱 未提供 阐明脂质-siRNA偶联物通过脑脊液给药后的大脑运输途径和细胞类型依赖性基因沉默机制 小鼠和大鼠的大脑组织及细胞 机器学习 神经疾病 单细胞RNA测序 未提供 测序数据 小鼠和大鼠样本 未提供 单细胞RNA测序 未提供 未提供
23 2026-05-02
Single-cell and spatiotemporal profile of ovulation in the mouse ovary
2025-Jun, PLoS biology IF:7.8Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和空间转录组学,构建小鼠卵巢排卵过程中的时空图谱,揭示卵巢细胞类型的时间依赖性转录状态和空间分布 首次在单细胞分辨率下详细描述排卵的精确时间窗口,并结合空间转录组学提供细胞类型的空间定位信息,同时发现新的配体-受体互作对 该研究仅基于小鼠模型,人类排卵机制可能存在差异,且细胞互作分析需进一步验证 揭示小鼠卵巢排卵过程中细胞类型的时空动态变化及其调控机制 小鼠卵巢细胞(包括卵母细胞、颗粒细胞、基质细胞等) 数字病理学 生殖疾病 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 基因表达数据, 空间转录组数据 多个时间点的小鼠卵巢配对样本 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学
24 2026-05-01
Combining Machine Learning and Multiplexed, In Situ Profiling to Engineer Cell Type and Behavioral Specificity
2025-Jun-21, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了一个结合机器学习与多重原位筛选的平台,用于发现具有细胞类型和行为特异性的增强子 创新性地将机器学习引导的增强子优先排序、模块化AAV组装和多重原位筛选整合到一个端到端平台,首次实现了在单一实验中同时筛选多种细胞类型的增强子,并解决了跨物种活性差异和空间细节缺失等关键挑战 NA 加速背侧脊髓中增强子的发现,以实现神经回路的精确控制,特别是针对疼痛和瘙痒处理的细胞类型特异性 背侧脊髓中的少突胶质细胞和15种背角神经元亚型 计算生物学、生物信息学 疼痛、瘙痒 多重原位筛选、染色质可及性分析、机器学习预测 机器学习模型 多物种染色质可及性数据、图像数据 小鼠体内实验,包含27种增强子AAV文库 NA NA NA NA
25 2026-05-01
Construction and validation of a regulatory T cells-based classification of renal cell carcinoma: an integrated bioinformatic analysis and clinical cohort study
2025-Jun, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
研究论文 通过整合生物信息学分析和临床队列研究,构建并验证了基于调节性T细胞的肾细胞癌分类系统 首次基于调节性T细胞状态相关基因构建肾细胞癌预后分类系统,并结合单细胞RNA-seq与批量RNA-seq数据,发现BATF-LAG3-免疫细胞轴可能是转移相关机制 研究基于回顾性临床数据,需前瞻性验证;亚型分类在Xinhua队列中验证,但样本量有限且仅使用免疫组化染色 探究调节性T细胞与肾细胞癌异质性的关系,建立预后分类系统以指导个性化治疗 肾细胞癌患者的单细胞RNA-seq和批量RNA-seq数据,以及Xinhua队列370例肾肿瘤患者的临床样本 机器学习 肾细胞癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫组化染色 聚类算法, Monocle2拟时序分析, Cox比例风险回归模型 基因表达数据, 临床数据 537例TCGA-KIRC队列批量RNA-seq样本及370例Xinhua队列肾肿瘤患者 Illumina 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq Illumina NovaSeq TCGA-KIRC队列的批量RNA-seq(Illumina平台)和单细胞RNA-seq数据
26 2026-05-01
Lung-resident memory CD4+ T cells are dependent on Batf3
2025-Jun-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 该研究揭示了转录因子Batf3对肺部CD4+常驻记忆T细胞发育的依赖性及其在过敏反应中的作用 首次发现Batf3通过影响树突状细胞(cDC1)发育调控肺内CD4+常驻记忆T细胞的形成,并鉴定出表达Cxcr6的细胞亚群 仅在小鼠模型中验证,缺乏人类样本数据支持;未详细阐述Batf3调控的分子机制 探究肺部常驻记忆T细胞积累的细胞和分子机制 小鼠模型(Batf3基因敲除小鼠与野生型小鼠) 数字病理学 哮喘 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠(具体数量未在摘要中说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序系统
27 2026-04-30
Redefining macrophage phenotypes after spinal cord injury: An open data approach
2025-Jun, Experimental neurology IF:4.6Q1
研究论文 通过开放数据方法重新定义脊髓损伤后巨噬细胞表型 利用三种公开单细胞RNA测序数据集进行跨数据集比较,采用无偏分析方法识别出脊髓损伤后四种保守的巨噬细胞群体 未提及具体局限性,但可能包括样本仅限于年轻雌性小鼠,且仅分析损伤后7天的时间点 利用公开单细胞RNA测序数据重新定义脊髓损伤后巨噬细胞的异质性 脊髓损伤后7天的年轻雌性小鼠 机器学习 脊髓损伤 单细胞RNA测序 Seurat分析流程、SingleR跨数据集比较工具 基因表达数据 三个独立研究团队的数据集,具体样本量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
28 2026-04-29
Diminished and altered cellular senescence response in delayed wound healing of aging
2025-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 研究发现,老年小鼠伤口愈合过程中细胞衰老反应减弱且发生了质变,从有益于愈合的细胞外基质重塑转变为有害的促炎状态,导致伤口闭合延迟 首次揭示了衰老相关伤口愈合延迟中,伤口微环境的衰老反应不仅数量减少,而且功能发生了从有益到有害的转变,并利用单细胞RNA测序鉴定出p16/p21/Ki67阳性衰老成纤维细胞的独特亚群 NA 探究衰老个体皮肤伤口愈合延迟中细胞衰老反应的变化及其机制 幼年和老年小鼠的全层背侧皮肤伤口组织,以及人伤口组织(来自年轻捐赠者) 机器学习 老年病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 若干幼年和老年小鼠的全层背侧皮肤伤口样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
29 2026-04-29
Proline mitigates antibiotic resistance evolution induced by ciprofloxacin at environmental concentrations
2025-06-05, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1
研究论文 发现脯氨酸能够显著缓解环境浓度下环丙沙星诱导的抗生素耐药性进化 首次发现脯氨酸可通过调控TCA循环代谢通量降低细菌质子动力势,从而抑制抗生素摄取并减少耐药亚群的形成,且该效应在土壤微宇宙实验中保持了微生物群落多样性 基于单一模式菌株(土壤分离大肠杆菌)和短期实验(24天),对其他抗生素和菌群的普适性验证有限 探索氨基酸类化合物在环境层面控制抗生素耐药性进化的可行性及机理 土壤分离大肠杆菌及土壤微生物群落 机器学习 传染性疾病 转录组学、碳代谢流分析、单细胞RNA-seq NA 基因表达数据、代谢通量数据、单细胞转录组数据 24天进化实验(18种氨基酸筛选)、土壤微宇宙实验(1组最优剂量5 mg/kg) 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒用于单细胞RNA-seq分析
30 2026-04-28
The Dual Molecular Identity of Vestibular Kinocilia: Bridging Structural and Functional Traits of Primary and Motile Cilia
2025-Jun-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过对前庭毛细胞的单细胞RNA测序,揭示前庭动纤毛同时具有初级纤毛和运动纤毛的分子特征,并发现其自发性运动功能 首次发现前庭动纤毛同时表达初级纤毛与运动纤毛相关基因,且具有自发性运动能力,改变了传统上对动纤毛仅为感觉支撑结构的认知 未明确动纤毛自发性运动的确切分子机制,且样本局限于成年动物模型,缺乏人类活体功能验证 阐明前庭动纤毛的分子组成、结构特性及其在毛细胞束中的功能角色 成年小鼠、牛蛙、斑马鱼和人类的前庭毛细胞 数字病理学 前庭系统疾病 单细胞RNA测序、免疫染色、活细胞成像 NA 基因表达数据、图像数据 成年小鼠前庭和耳蜗毛细胞(未提供具体数量)、牛蛙与小鼠壶腹嵴毛细胞(未提供具体数量)、斑马鱼和人类前庭毛细胞(未提供具体数量) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
31 2026-04-28
SOAR elucidates biological insights and empowers drug discovery through spatial transcriptomics
2025-Jun-13, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 提出一个全面的空间转录组学分析平台SOAR,包含3461个统一处理样本,涵盖13个物种、42种组织类型和19种技术 首次构建集成多物种、多组织、多平台空间转录组数据的统一分析资源,并展示其在药物发现中的创新应用 未明确提及具体局限性,但可能包括数据覆盖的偏倚或分析方法对某些技术平台的适用性 通过空间转录组学数据整合与分析,推动生物学发现和药物研发 13个物种的空间转录组样本,包括人、小鼠等模式生物 数字病理学 癌症, 溃疡性结肠炎 空间转录组学 NA 基因表达数据 3461个样本 NA 空间转录组学 NA 整合19种不同空间转录组学技术平台的数据
32 2026-04-28
Single-cell RNA sequencing reveals tissue-specific transcriptomic changes induced by perfluorooctanesulfonic acid (PFOS) in larval zebrafish (Danio rerio)
2025-06-05, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析PFOS暴露对斑马鱼幼虫组织特异性转录组的影响 首次使用单细胞RNA-seq揭示PFOS在斑马鱼幼虫中诱导的组织特异性转录组变化,并发现消化器官、肌肉和耳石是受影响最显著的组织 研究局限于单一浓度(16 µM)和短期暴露(3-72小时),未测试剂量-反应关系或长期效应 探究全氟辛烷磺酸(PFOS)对斑马鱼幼虫发育毒性的组织特异性分子机制 斑马鱼幼虫(Danio rerio) 机器学习 发育毒性 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 暴露于16 µM PFOS或0.01% DMSO的斑马鱼幼虫,共检测27,698个基因,其中2,390个差异表达 10x Genomics 单细胞转录组 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
33 2026-04-28
Oncogene aberrations drive medulloblastoma progression, not initiation
2025-06, Nature IF:50.5Q1
research paper 本研究利用单细胞技术揭示癌基因异常驱动髓母细胞瘤进展而非起始的过程 首次通过单细胞核RNA测序、单细胞核ATAC测序和空间转录组学技术,证明大规模染色体畸变是早期肿瘤起始事件,而单基因癌基因事件在后期出现并呈亚克隆性 未提及具体限制 阐明癌基因异常和广泛拷贝数变异在髓母细胞瘤肿瘤进化和治疗抵抗中的作用 3/4组髓母细胞瘤患者肿瘤样本 单细胞组学 髓母细胞瘤 单细胞核RNA测序、单细胞核ATAC测序、空间转录组学 群体遗传学模型 基因表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 一群已知MYC、MYCN和PRDM6癌基因改变的3/4组髓母细胞瘤患者 NA 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组学 NA NA
34 2026-04-28
Concurrent loss of the Y chromosome in cancer and T cells impacts outcome
2025-06, Nature IF:50.5Q1
研究论文 该研究通过泛癌分析揭示Y染色体缺失在癌症与T细胞中并发存在并影响患者预后 首次系统证明外周血单核细胞和肿瘤中Y染色体缺失的关联性,并建立恶性上皮细胞与免疫细胞中LOY共存的预后模型 未明确LOY导致免疫抑制的分子机制及功能验证的局限性 探究Y染色体缺失在外周血单核细胞、免疫细胞和癌细胞中的相互关系及其对癌症死亡率的影响 29种人类肿瘤类型的bulk和单细胞RNA测序数据,以及自发性及同源小鼠肿瘤模型 数字病理学 泛癌种 RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA 文本序列数据 涵盖29种人类肿瘤类型及小鼠模型的多组学数据 Illumina, 10x Genomics bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq Illumina NovaSeq, 10x Chromium 使用Illumina NovaSeq进行bulk RNA测序,10x Chromium进行单细胞测序
35 2026-04-27
An updated and spatially validated somatic single-cell atlas of Hydractinia symbiolongicarpus
2025-Jun-07, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过整合新数据构建了Hydractinia symbiolongicarpus的更新单细胞图谱,鉴定了主要体细胞谱系及新型免疫细胞群,并进行了空间验证 首次鉴定出假定的免疫细胞群、新神经亚型、两种空间分离的腺细胞群体及水螅体特异性细胞类型,并完善了刺细胞发育轨迹 现有图谱在细胞数量和转录组深度上仍有局限,细胞类型分配部分依赖计算方法 提升对Hydractinia symbiolongicarpus细胞多样性和动态变化的理解,为刺胞动物研究提供资源 Hydractinia symbiolongicarpus的取食息肉和匍匐茎组织 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 超过47,000个细胞,来自固定细胞和活细胞数据整合 NA 单细胞RNA测序 NA NA
36 2026-04-25
Single-cell RNA sequencing-derived signatures define response patterns to atezolizumab + bevacizumab in advanced hepatocellular carcinoma
2025-Jun, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序技术解析阿替利珠单抗联合贝伐珠单抗在晚期肝细胞癌中的应答模式 首次通过单细胞RNA测序衍生基因表达特征,揭示阿替利珠单抗联合贝伐珠单抗在晚期肝细胞癌中的两种不同应答模式(免疫介导响应和血管生成相关响应),并定义分子亚群 样本数量有限(317例治疗组),可能无法完全覆盖所有应答亚型;单细胞RNA测序衍生的特征需在更大队列中验证 阐明晚期肝细胞癌对阿替利珠单抗联合贝伐珠单抗临床获益与耐药的细胞机制 晚期肝细胞癌患者(422例RNA测序样本,包括317例联合治疗、47例单药和58例索拉非尼对照组) 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 422例晚期肝细胞癌患者RNA测序样本(317例阿替利珠单抗+贝伐珠单抗治疗、47例阿替利珠单抗治疗、58例索拉非尼治疗) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
37 2026-04-25
Single-cell profiling in ovarian germ cell and sex cord-stromal tumours
2025-Jun, British journal of cancer IF:6.4Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序绘制卵巢生殖细胞肿瘤和性索间质肿瘤的微环境图谱 首次对罕见卵巢生殖细胞肿瘤和性索间质肿瘤进行单细胞水平免疫和基质景观描绘 样本量有限,新鲜肿瘤样本仅来自12例,且部分肿瘤类型仅有单一样本 探索罕见卵巢生殖细胞肿瘤和性索间质肿瘤的免疫和基质微环境 66,919个细胞来自12个新鲜肿瘤样本,包括7例成人颗粒细胞瘤、1例幼年颗粒细胞瘤、1例支持-间质细胞瘤、2例未成熟畸胎瘤和1例无性细胞瘤 数字病理 卵巢生殖细胞肿瘤和性索间质肿瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 12个新鲜肿瘤样本,共66,919个细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
38 2026-04-24
Mechanisms of hematopoietic clonal dominance in VEXAS syndrome
2025-Jun, Nature medicine IF:58.7Q1
研究论文 本研究通过免疫表型分析和单细胞转录组学,揭示了VEXAS综合征中造血克隆优势的机制,并开发了人类化疾病模型 首次揭示UBA1突变造血干细胞的衰老样程序在炎症微环境中获得优势的克隆竞争机制,并利用碱基编辑技术构建了首个VEXAS综合征人类化模型 样本量有限(仅9名男性患者),且模型仅模拟单一突变的效应 阐明VEXAS综合征中驱动突变造血克隆优势的致病机制 VEXAS综合征患者和基因编辑造血干细胞移植小鼠模型 数字病理学 自身炎症性疾病(VEXAS综合征) 单细胞RNA测序、碱基编辑 人类化小鼠模型 单细胞转录组数据、免疫表型数据 9名VEXAS综合征男性患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
39 2026-04-24
Broad rim lesions are a new pathological and imaging biomarker for rapid disease progression in multiple sclerosis
2025-Jun, Nature medicine IF:58.7Q1
研究论文 本研究分析了多发性硬化症尸检队列,发现了一种新的病变类型,其特征为广泛的髓样细胞边缘,并与快速疾病进展相关,同时利用PET成像验证了其作为生物标记物的潜力 首次发现并定义了一种新的多发性硬化症病变类型——宽边缘病变,并利用空间转录组学和PET成像证实其与快速疾病进展的关联 尸检队列样本量有限,且仅基于荷兰脑库的数据;PET验证研究为独立队列,但缺乏纵向动态观察 探索多发性硬化症快速进展的病理机制并寻找新的影像学生物标记物 多发性硬化症患者的脑组织尸检样本(186例)和PET影像(114例) 数字病理学 多发性硬化症 空间转录组学 NA 组织切片和PET影像 尸检队列186例,PET队列114例 NA 空间转录组学 NA NA
40 2026-04-24
Endothelial-to-mesenchymal transition gene signature derived from single-cell transcriptomics of human atherosclerotic tissue associates with stable plaque histological characteristics
2025-06, Vascular pharmacology IF:3.5Q2
research paper 利用单细胞转录组数据从人动脉粥样硬化组织中提取内皮-间质转化基因特征,并发现该特征与稳定斑块的组织学特征相关 通过计算机模拟谱系追踪从人斑块组织的单细胞转录组数据中识别内皮-间质转化过程中的上调基因,而非仅关注终末分化状态 未明确提及局限性,但可能包括依赖公开数据集、样本量有限、动物模型的外推性等 揭示人动脉粥样硬化中内皮-间质转化的分子机制,并定义其核心基因表达特征 人动脉粥样硬化斑块组织中的内皮细胞和血管平滑肌细胞亚群 计算机视觉 动脉粥样硬化 单细胞转录组测序 NA 基因表达数据 46个来自人颈动脉的单细胞转录组样本,632个来自人颈动脉的批量RNA测序样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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