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当前共找到 741 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 21 | 2025-12-06 |
Olaparib and Radiotherapy Induce Type I Interferon- and CD8+ T Cell-Dependent Sensitization to Immunotherapy in Pancreatic Cancer
2025-Jun-04, Molecular cancer therapeutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1158/1535-7163.MCT-24-0210
PMID:39688341
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研究论文 | 本研究探讨了PARP抑制剂奥拉帕尼联合放疗如何通过增强I型干扰素介导的免疫信号和适应性免疫反应，使胰腺癌对αPD-L1免疫疗法敏感 | 首次揭示了奥拉帕尼与放疗联合治疗能增强I型干扰素产生，重塑肿瘤微环境，并促进CD8+ T细胞介导的抗肿瘤免疫反应，从而克服胰腺癌对免疫疗法的耐药性 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证；单细胞RNA测序样本量有限，可能未能完全捕捉肿瘤微环境的异质性 | 探究奥拉帕尼联合放疗是否能增强胰腺癌对免疫疗法的敏感性，并阐明其免疫调节机制 | 胰腺导管腺癌（PDAC）小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据，免疫组织化学图像，流式细胞术数据 | 未明确指定样本数量，但使用了免疫活性小鼠模型进行实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2025-12-06 |
Mesenchymal Stem Cells and Fibroblasts Contribute to Microvascular Proliferation in Glioblastoma and are Correlated with Immunosuppression and Poor Outcome
2025-Jun-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0743
PMID:40131028
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了胶质母细胞瘤中微血管增殖（MVP）相关的间充质干细胞和成纤维细胞的作用，及其与免疫抑制和不良预后的关联 | 首次在胶质瘤中通过单细胞RNA测序识别出与MVP相关的间充质干细胞和癌症相关成纤维细胞等血管/血管周围基质细胞，并发现PDGFRB作为驱动基因引导细胞成熟，同时揭示了这些细胞与免疫抑制性髓系细胞的相互作用 | 研究样本量相对较小（16例），且主要基于转录组数据，功能验证和机制探索有待进一步实验证实 | 探究胶质母细胞瘤中微血管增殖的机制及其生物学后果，特别是血管/血管周围基质细胞和免疫细胞的作用 | 16例原发性胶质瘤患者的CD45-CD105+血管/血管周围基质细胞和CD45+CD105±免疫细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，RNA速度分析，信号网络分析，数字空间分析 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 16例原发性胶质瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2025-12-05 |
Single-cell resolution uncovers neighboring cell subtypes that share steroidogenic capacity during fetal testis development
2025-Jun-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2501392122
PMID:40460128
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研究论文 | 本研究利用单细胞技术揭示了小鼠胎儿睾丸发育过程中类固醇生成细胞（如胎儿Leydig细胞）的异质性及其在雄激素生产中的协同作用 | 通过单分子荧光原位杂交和单细胞RNA测序，首次发现胎儿Leydig细胞在类固醇生成基因表达上存在不同步性和不完整性，并揭示了邻近细胞类型间的合作机制 | 研究仅基于小鼠模型，未涉及人类或其他物种；且主要关注胎儿发育阶段，成年期变化未探讨 | 探究胎儿睾丸发育过程中单个及集体类固醇生成细胞对雄激素生产的贡献 | 小鼠胎儿睾丸中的类固醇生成细胞（包括胎儿Leydig细胞和其他间质细胞类型） | 数字病理学 | NA | 单分子荧光原位杂交, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2025-12-05 |
SMURF2 Facilitates GAP17 Isoform 1 Membrane Displacement to Promote Mutant p53-KRAS Oncogenic Synergy
2025-Jun-03, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-24-0701
PMID:39976545
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研究论文 | 本研究揭示了SMURF2通过PPLP基序与GAP17-1相互作用，使其从膜上移位，从而促进突变p53介导的突变KRAS过度激活的分子机制 | 首次阐明SMURF2通过识别GAP17-1的PPLP基序导致其膜定位异常，从而解释突变p53与KRAS致癌协同作用的具体通路 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型，临床样本验证仍需扩大规模；GAP17-1膜移位的确切结构机制有待进一步解析 | 探究突变p53与KRAS在胰腺癌中协同致癌的分子机制 | 胰腺癌细胞系、基因工程小鼠模型、临床胰腺导管腺癌样本 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、组织芯片 | NA | 基因表达数据、组织病理数据 | 多种胰腺癌细胞系、三种基因工程小鼠模型（iKras*; iKras*, p53*, and p48-Cre; Kras*）、临床前与临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2025-12-03 |
Uncovering the Regional and Cell Specific Bioactivity of Injectable Extracellular Matrix Biomaterials in Myocardial Infarction through Spatial and Single Nucleus Transcriptomics
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.25.661525
PMID:40667036
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和单核RNA测序技术，揭示了注射性细胞外基质生物材料在心肌梗死中的区域和细胞特异性生物活性 | 首次结合空间转录组学和单核RNA测序技术，系统探究细胞外基质水凝胶在心肌梗死治疗中的区域和细胞特异性生物活性，揭示了未发现的治疗靶点 | 未明确提及样本量或实验设计的局限性，可能缺乏长期疗效评估或临床转化验证 | 探究细胞外基质生物材料在心肌梗死治疗中的治疗活性和机制 | 心肌梗死模型中的心脏组织，包括巨噬细胞、成纤维细胞、淋巴管、血管、平滑肌细胞和心肌细胞等 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学，单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学，单核RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2025-12-03 |
TFcomb identifies transcription factor combinations for cellular reprogramming based on single-cell multiomics data
2025-Jun-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279955.124
PMID:40210438
|
研究论文 | 本文提出了一种名为TFcomb的计算方法，利用单细胞多组学数据识别细胞重编程所需的转录因子及其组合 | 将寻找重编程转录因子及其组合的任务建模为逆问题，采用Tikhonov正则化保证解的泛化能力，并设计图注意力网络增强基于单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据构建的基因调控网络 | NA | 开发计算工具以识别驱动细胞状态转换的重编程转录因子组合 | 细胞重编程过程 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 图注意力网络 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 27 | 2025-12-03 |
Dissecting multilayer cell-cell communications with signaling feedback loops from spatial transcriptomics data
2025-Jun-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279857.124
PMID:40262896
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研究论文 | 本文介绍了一种名为stMLnet的方法，用于从空间转录组学数据中解析多层细胞间通讯及信号反馈环路 | stMLnet创新性地整合了空间信息和多层信号调控机制，以识别多层细胞间通讯中的信号反馈环路，相比现有方法在配体-受体推断和细胞内靶基因预测方面表现更优 | NA | 开发一种工具以更好地解析空间转录组学数据中的多层细胞间通讯和信号反馈机制 | 空间转录组学数据，包括来自seqFISH+、Slide-seq v2、MERFISH和Stereo-seq等多种技术的样本 | 空间转录组学 | COVID-19感染 | 空间转录组学 | 扩散模型和质量作用模型 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | seqFISH+, Slide-seq v2, MERFISH, Stereo-seq | NA |
| 28 | 2025-12-03 |
STCC enhances spatial domain detection through consensus clustering of spatial transcriptomics data
2025-Jun-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280031.124
PMID:40355284
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为STCC的新型共识聚类框架，用于整合空间转录组学数据中的空间域检测工具，以提高聚类准确性和稳定性 | 开发了STCC共识聚类框架，首次整合了多种先进工具和共识策略（如Onehot-based、average-based、hypergraph-based和wNMF-based方法），以优化空间转录组学数据的空间域检测 | 未明确说明框架在处理高度异质性或复杂组织样本时的具体局限性，且可能依赖于输入参数的设置 | 通过共识策略整合不同工具，提高空间转录组学数据中空间域检测的准确性和稳定性 | 空间转录组学数据，包括模拟数据和来自不同实验平台的真实数据，涉及正常组织和肿瘤样本 | 空间转录组学 | NA | 共识聚类 | NA | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 29 | 2025-11-29 |
Integrated Analysis of Single-Cell and Bulk RNA-Sequencing Defines N7-Methylguanosine (m7G)-Mediated Modifications' Role in Prognosis and the Tumor Immune Microenvironment in Hepatocellular Carcinoma
2025-Jun, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70992
PMID:40485623
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研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，研究m7G修饰在肝细胞癌预后和肿瘤免疫微环境中的作用 | 首次系统分析m7G修饰模式在肝细胞癌中的临床意义，建立m7Gscore评分系统并验证其预后价值 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 探讨m7G修饰在肝细胞癌预后、肿瘤免疫微环境和免疫治疗敏感性中的作用 | 肝细胞癌患者样本和公共数据库数据 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 主成分分析, ssGSEA, GSVA, 蛋白质印迹, 免疫组化, RT-qPCR | 无监督聚类, 主成分分析 | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据, 蛋白质数据 | 来自GEO、TCGA、ICGC数据库的多中心数据集 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2025-11-26 |
Genital herpes shedding episodes associate with alterations in the spatial organization and activation of mucosal immune cells
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.24.661157
PMID:40667113
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研究论文 | 本研究探讨了HSV-2感染期间生殖器疱疹脱落对阴道黏膜免疫细胞空间组织和活化的影响 | 首次结合空间转录组学和免疫荧光成像技术揭示活动性HSV-2脱落期间阴道黏膜免疫细胞的空间重分布和基因表达变化 | 研究样本量相对有限（232名参与者），且主要关注黏膜局部免疫反应 | 研究HSV-2对宫颈阴道道免疫系统的影响机制 | HSV-2血清阳性和血清阴性参与者的宫颈阴道组织和血液样本 | 免疫学 | 生殖器疱疹 | 流式细胞术,免疫荧光成像,可溶性免疫因子分析,空间转录组学 | NA | 组织样本,血液样本,图像数据,基因表达数据 | 232名HSV-2血清阳性和血清阴性参与者 | NA | 空间转录组学,流式细胞术,免疫荧光成像 | NA | NA |
| 31 | 2025-11-24 |
Combining Machine Learning and Multiplexed, In Situ Profiling to Engineer Cell Type and Behavioral Specificity
2025-Jun-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.20.660790
PMID:40667316
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研究论文 | 开发结合机器学习和多重原位分析的端到端平台，用于加速脊髓背角增强子发现 | 整合机器学习引导的增强子优先排序、模块化AAV组装和多重原位筛选，实现空间分辨的多重增强子分析 | 增强子发现成功率较低，存在物种特异性差异，AAV多重化面临挑战 | 开发精确控制神经回路的技术，加速细胞靶向工具发现和基因治疗发展 | 小鼠脊髓背角神经元亚型、少突胶质细胞、运动神经元 | 机器学习 | 疼痛和瘙痒相关疾病 | 机器学习、染色质可及性分析、空间平行报告基因检测 | 机器学习模型 | 染色质可及性数据、空间表达数据 | 27个增强子-AAV文库在小鼠体内测试 | NA | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | ESCargoT平台整合机器学习引导的增强子优先排序、模块化AAV组装和多重原位筛选 |
| 32 | 2025-11-22 |
Comprehensive profiling of migratory primordial germ cells reveals niche-specific differences in non-canonical Wnt and Nodal-Lefty signaling in anterior vs posterior migrants
2025-Jun-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.29.610420
PMID:39257761
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了小鼠迁移过程中原始生殖细胞及其周围体细胞生态位的转录异质性 | 首次揭示了前后位置迁移PGCs在非经典Wnt和Nodal-Lefty信号通路的生态位特异性差异，并验证了人类中的保守性 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据的验证依赖于重新分析已发表数据集 | 阐明迁移过程中原始生殖细胞与不同体细胞生态位相互作用的分子机制 | 小鼠原始生殖细胞和周围体细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序，全胚胎免疫荧光染色 | 轨迹推断方法 | 单细胞转录组数据，免疫荧光图像数据 | 13,262个小鼠PGCs和7,868个周围体细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 33 | 2025-11-19 |
A multi-omics resource of B cell activation reveals genetic mechanisms for immune-mediated diseases
2025-Jun-14, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.05.22.25328104
PMID:40475139
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研究论文 | 本研究构建了一个B细胞激活的多组学资源，揭示了免疫介导疾病的遗传机制 | 首次系统表征了26名健康女性供体B细胞在六种不同激活条件下的多组学响应，揭示了刺激特异性开放染色质区域与免疫疾病遗传风险的关联 | 样本仅来自健康女性供体，未包括男性或患者样本，且样本量相对有限 | 阐明B细胞激活状态在免疫介导疾病中的遗传机制 | 来自26名健康女性供体的B细胞 | 基因组学 | 自身免疫疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, CITE-seq | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观基因组数据 | 26名健康女性供体 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 表观基因组学 | NA | CITE-seq（单细胞RNA-seq与表面蛋白标记联合检测） |
| 34 | 2025-11-16 |
Unlocking novel T cell-based immunotherapy for hepatocellular carcinoma through neoantigen-driven T cell receptor isolation
2025-Jun-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-334148
PMID:39832892
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研究论文 | 本研究通过分离肝细胞癌患者中对新抗原反应的T细胞及其T细胞受体，探索基于T细胞的免疫治疗新策略 | 首次系统分析肝细胞癌微环境中新抗原反应性T细胞的功能特征，并发现肝灌洗液和淋巴结是反应性T细胞的重要来源 | 研究样本量较小（7名患者），需要在更大队列中验证结果 | 评估晚期肝细胞癌患者的T细胞反应，识别可用于免疫治疗的T细胞群体 | 肝细胞癌患者的肿瘤组织、肝灌洗液和肝引流淋巴结 | 免疫肿瘤学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序，生物信息学分析 | NA | 转录组数据，蛋白质组数据，测序数据 | 7名肝细胞癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2025-11-10 |
Functional diversity of cardiac macrophages in health and disease
2025-Jun, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-024-01109-8
PMID:39743564
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综述 | 本文综述了心脏巨噬细胞在健康和疾病状态下的功能多样性、发育起源及其在心脏稳态和病理过程中的作用 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术揭示了心脏巨噬细胞的新细胞状态和疾病相关细胞邻域 | NA | 探讨心脏巨噬细胞的发育起源、功能多样性及其在心脏疾病发病机制中的作用 | 心脏巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 36 | 2025-10-29 |
Thymic DC2 are heterogenous and include a novel population of transitional dendritic cells
2025-Jun-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.13.659520
PMID:40666966
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示胸腺DC2细胞的异质性并鉴定出新型过渡性树突状细胞群体 | 发现传统认为的'DC2'实际上包含4个不同细胞谱系，并首次鉴定出CX3CR1过渡性树突状细胞这一新型胸腺细胞群体 | 研究主要基于小鼠模型，人类胸腺中这些细胞群体的存在和功能需要进一步验证 | 解析胸腺髓系细胞的起源、发育和稳态维持机制 | 胸腺髓系细胞，特别是树突状细胞DC2亚群 | 单细胞生物学 | 自身免疫疾病 | 单细胞转录组测序，谱系定义小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2025-10-25 |
A Molecular, Spatial, and Regulatory Atlas of the Hydra vulgaris Nervous System
2025-Jun-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.15.531610
PMID:36993575
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和ATAC-seq技术构建了水螅神经系统的分子、空间和调控图谱 | 首次对水螅神经系统进行了最全面的分子和空间表征，识别了8种神经元类型和15种转录亚型，并构建了基因调控网络 | NA | 揭示水螅神经系统发育、稳态和再生的分子机制 | 水螅（Hydra vulgaris）神经系统 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序，ATAC-seq，轨迹推断 | NA | 单细胞转录组数据，染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 38 | 2025-10-21 |
Single-cell technology grows up: Leveraging high-resolution omics approaches to understand neurodevelopmental disorders
2025-Jun, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2025.102990
PMID:40036988
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综述 | 探讨利用单细胞和空间转录组学技术研究神经发育障碍的病因和机制 | 系统整合单细胞基因组学技术与神经发育障碍模型，在细胞分辨率层面定义疾病病因 | NA | 理解神经发育障碍的分子、细胞和环路机制 | 神经发育障碍模型和人类脑组织 | 基因组学 | 神经发育障碍 | 单细胞基因组学、空间转录组学 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 39 | 2025-10-18 |
High-resolution spatial mapping of cell state and lineage dynamics in vivo with PEtracer
2025-Jun-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.15.659774
PMID:40661400
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研究论文 | 开发了一种基于prime editing的谱系追踪技术PEtracer，能够在高空间分辨率下同时分析细胞状态和谱系关系 | 结合prime editing和空间转录组学，首次实现了在完整组织中同时追踪细胞谱系和状态的高分辨率空间映射 | NA | 研究细胞命运决定的时空动态，特别是在发育和疾病过程中的细胞状态与谱系关系 | 小鼠肿瘤转移模型中的肿瘤细胞 | 空间转录组学 | 肿瘤转移 | prime editing, MERFISH空间转录组分析 | NA | 空间转录组数据，成像数据 | NA | NA | 单细胞测序，空间转录组学，多模态成像 | NA | NA |
| 40 | 2025-10-05 |
Non-disruptive 3D profiling of combinations of epigenetic marks in single cells
2025-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.13.659535
PMID:40666962
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研究论文 | 开发了一种非破坏性的基于成像的单细胞空间表观遗传分析技术Epi-PHR，能够在保持基因组3D结构的同时检测多种表观遗传标记的组合 | 首次实现了在单细胞水平上同时检测多种表观遗传标记的组合，同时保持基因组的三维空间结构 | 技术仍处于开发阶段，尚未在大规模样本中验证 | 研究单细胞中表观遗传标记组合的三维空间分布及其与染色质构象的关系 | 海马体组织切片中的单细胞 | 空间组学 | NA | 表观遗传邻近杂交反应(Epi-PHR)，染色质追踪 | NA | 成像数据，空间表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞空间表观遗传分析 | Epi-PHR | 表观遗传邻近杂交反应技术，能够检测数百个单基因靶点的表观遗传标记组合 |