单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 717 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-06-18 |
Two types of regenerative cell populations appear in acute liver injury
2025-06-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102503
PMID:40345206
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研究论文 | 通过对对乙酰氨基酚处理小鼠的公开单细胞RNA测序数据分析，发现急性肝损伤中出现两种再生细胞群体 | 在同一个再生过程中发现两种不同的再生细胞群体同时出现，且其中一种由坏死组织接触诱导，具有去分化特征和更高增殖能力 | NA | 研究急性肝损伤中肝脏再生的机制 | 对乙酰氨基酚处理的小鼠肝脏再生过程中的细胞 | 机器学习 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 公开数据中的对乙酰氨基酚处理小鼠样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | 公开单细胞RNA测序数据 |
| 22 | 2026-06-18 |
Stem cell fate decisions: Substates and attractors
2025-06-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102532
PMID:40499510
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综述 | 本文回顾了人类多能干细胞占据不同亚稳态亚状态对其分化结果影响的研究，并基于荧光标记动力学模型提出亚状态转换可能受确定性混沌和随机波动共同调控 | 提出亚状态转换可能受确定性混沌和随机波动共同驱动的新模型，超越了传统仅考虑随机性的观点 | 未明确说明具体局限性，但模型基于荧光标记分布序列，可能受限于实验观测的时空分辨率 | 理解干细胞命运决定中基因表达异质性的机制 | 人类多能干细胞及其亚稳态亚状态 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2026-06-17 |
Stiffness sensing fuels matrix-driven metabolic reboot for kidney repair and regeneration
2025-Jun-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.22.660927
PMID:40667238
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研究论文 | 本研究通过组织工程、遗传和药理学模型及多组学技术，揭示了微纤维相关蛋白2（Mfap2）在急性肾损伤后肾脏修复中通过感知基质刚度驱动代谢重启的关键作用 | 首次发现Mfap2作为细胞外基质力学传感器通过Esr2-Lats1非经典通路调控肾小管代谢重编程，将组织刚度与肾脏修复的代谢需求联系起来 | NA | 阐明急性肾损伤后细胞外基质驱动的肾脏修复机制，特别是Mfap2在机械信号转导和代谢调控中的作用 | 小鼠急性肾损伤模型中的肾脏细胞（成纤维细胞、周细胞、肾小管细胞）及脱细胞基质 | 机器学习和多组学分析 | 急性肾损伤 | 蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、空间转录组学、组织工程、遗传模型 | NA | 蛋白质组、磷酸化蛋白质组、空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学 | NA | NA |
| 24 | 2026-06-17 |
Single-cell transcriptomics reveal differences between chorionic and basal plate cytotrophoblasts and trophoblast stem cells
2025-Jun-11, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6797967/v1
PMID:40585209
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析，比较早期和晚期妊娠早期胎盘绒毛细胞滋养层细胞、基底板和绒毛膜板细胞滋养层细胞及滋养层干细胞间的差异 | 首次揭示不同妊娠周龄和胎盘区域（基底板与绒毛膜板）细胞滋养层细胞的转录多样性，并发现滋养层干细胞最类似绒毛外滋养层前体细胞 | 研究未涉及功能验证实验，且样本量有限，可能限制结果的普适性 | 探究早期和晚期妊娠早期胎盘绒毛细胞滋养层细胞与滋养层干细胞的转录差异，并明确后者的细胞起源 | 早期（6-8周）和晚期（12-14周）妊娠早期胎盘绒毛组织，基底板和绒毛膜板区域细胞滋养层细胞，以及三种滋养层干细胞系 | 单细胞转录组学 | 正常妊娠 | 单细胞RNA测序，空间转录组学（GeoMx） | NA | 基因表达数据，空间转录组数据 | 多个胎盘组织样本（早期和晚期各阶段）及三种滋养层干细胞系，具体数量未说明 | 10x Genomics, NanoString | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, NanoString GeoMx | 10x Chromium单细胞3'测序，NanoString GeoMx空间转录组学 |
| 25 | 2026-06-15 |
Identifying Immunomodulatory Subpopulations of Adipose Stromal Vascular Fraction and Stem/Stromal Cells Through Single-Cell Transcriptomics and Bulk Proteomics
2025-06, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-025-10889-6
PMID:40366552
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研究论文 | 通过单细胞转录组学与批量蛋白质组学整合分析，鉴定脂肪基质血管组分中具有免疫调节活性的间充质干细胞亚群 | 首次通过多模态整合方法（Scissor算法结合单细胞RNA测序与批量蛋白质组学）在未培养的脂肪SVF中鉴定出与细胞因子处理的培养ASCs表型相似的免疫调节亚群，揭示其通过IL6和SEMA4信号通路发挥应激适应免疫调节功能 | 未提及明显局限性 | 阐明脂肪组织中基质血管组分来源的ASCs的异质性免疫调节潜力，为治疗策略提供依据 | 脂肪组织中的基质血管组分和脂肪来源的间充质干细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 批量蛋白质组学, Scissor算法 | Scissor算法 | 单细胞转录组数据, 蛋白质组学数据 | 培养至第二代（P2）的ASCs和未培养（P0）的SVF样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量蛋白质组学 | NA | NA |
| 26 | 2026-06-07 |
Mesenchymal stem/stromal cell therapy improves immune recovery in a feline model of severe coronavirus infection
2025-06-25, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szaf025
PMID:40659357
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研究论文 | 间充质干细胞疗法在猫严重冠状病毒感染模型中改善免疫恢复 | 首次在猫传染性腹膜炎自然感染模型中评估间充质干细胞联合抗病毒治疗对免疫恢复的影响，并通过单细胞RNA测序揭示免疫恢复的转录组学机制 | 研究中残余细胞因子升高持续存在，表明慢性免疫失调的部分特征未完全恢复；结果需要在更大样本和人类临床试验中验证 | 评估间充质干细胞疗法联合抗病毒治疗对猫严重冠状病毒感染免疫功能障碍的改善作用 | 患有渗出型猫传染性腹膜炎的猫 | 机器学习 | 冠状病毒感染 | 单细胞RNA测序 | 主成分分析 | 单细胞转录组数据、血清细胞因子数据 | 未具体说明样本数量，涉及猫传染性腹膜炎猫模型及健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 对肠系膜淋巴结进行单细胞RNA测序 |
| 27 | 2026-06-07 |
Identification and Mapping of Human Lymph Node Stromal Cell Subsets by Combining Single-Cell RNA Sequencing with Spatial Transcriptomics
2025-06, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202451218
PMID:40498289
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研究论文 | 结合单细胞RNA测序与空间转录组学鉴定并定位人类淋巴结基质细胞亚群 | 首次在人类淋巴结中通过单细胞RNA测序全面定义了10种成纤维细胞亚型的基因特征，并利用空间转录组学数据预测了它们在淋巴结组织中的空间位置 | 仅使用一个淋巴结样本进行单细胞RNA测序，且空间转录组数据来自公共数据集而非实验验证 | 阐明人类淋巴结基质细胞的异质性及其空间分布与免疫调节功能的关系 | 从人类淋巴结分离的基质细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 13个淋巴结捐赠者（其中1个用于scRNA-seq，其余用于验证） | 10x Genomics, 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3'用于单细胞RNA测序，10x Visium用于空间转录组学 |
| 28 | 2026-06-07 |
Narrowing Down Key Players in Autoimmunity via Single-Cell Multiomics
2025-06, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202451233
PMID:40534591
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综述 | 本文综述了单细胞多组学技术在自身免疫性疾病研究中的应用，探讨如何通过识别疾病相关细胞状态和细胞通讯网络来揭示自身免疫机制 | 系统总结了单细胞多组学技术在自身免疫研究中的最新进展，特别是在绘制自身反应性淋巴细胞图谱方面达到前所未有的分辨率 | 未提供具体的实验数据或定量分析结果 | 探讨单细胞多组学技术如何阐明自身免疫性疾病的分子机制 | 健康人和患者组织中的T细胞和B细胞 | 机器学习 | 自身免疫性疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 29 | 2026-06-07 |
NKG7 is a Stable Marker of Cytotoxicity Across Immune Contexts and Within the Tumor Microenvironment
2025-06, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202551885
PMID:40538191
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研究论文 | 该研究利用公开的单细胞RNA测序数据集，全面分析了免疫亚群和组织中的细胞毒性特征，发现NKG7作为细胞毒性标志物具有更高的稳定性和可靠性 | 首次证明NKG7作为细胞毒性标志物在多种免疫环境和肿瘤微环境中的表达稳定性优于传统标志物颗粒酶B和穿孔素，并且与整体细胞毒性活性高度相关 | 主要依赖公共单细胞RNA测序数据集，可能无法涵盖所有免疫环境；NKG7的具体功能机制尚不明确 | 评估NKG7作为细胞毒性标志物在不同免疫环境中的表达模式和可靠性 | 人类免疫细胞亚群和组织中的细胞毒性成分 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2026-05-31 |
A multi-step immune-competent genetic mouse model reveals phenotypic plasticity in uveal melanoma
2025-Jun-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.04.657841
PMID:40502063
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研究论文 | 开发了一种多步免疫健全的遗传小鼠模型，揭示了葡萄膜黑色素瘤的表型可塑性 | 首次利用内源位点条件性表达突变GNAQ并结合BAP1缺失和MYC激活，构建出具有转移潜力的完全外显免疫健全小鼠模型，并通过单细胞RNA测序揭示恶性细胞的转录异质性和分化可塑性 | 模型仅模拟了部分人类疾病关键遗传事件，且8号染色体额外驱动因子的协同作用机制尚待明确 | 构建生理相关且免疫健全的葡萄膜黑色素瘤小鼠模型，用于研究肿瘤生物学、特征化候选驱动基因及开发免疫治疗策略 | 葡萄膜黑色素瘤小鼠模型及人类葡萄膜黑色素瘤样本 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 基因工程小鼠模型、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠模型（具体数量未在摘要中说明）及人类葡萄膜黑色素瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium平台进行单细胞RNA测序 |
| 31 | 2026-05-31 |
Neuroprotectin D1 and GPR37 protect against chemotherapy-induced peripheral neuropathy and the transition from acute to chronic pain
2025-06, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2025.107746
PMID:40287118
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研究论文 | 研究揭示神经保护素D1及其受体GPR37在化疗诱导的周围神经病变和急性疼痛向慢性疼痛转化中的保护作用 | 首次发现GPR37在化疗诱导的周围神经病变中调控急性疼痛向慢性疼痛转化，并阐明NPD1通过GPR37保护感觉神经元和缓解神经病理性疼痛的机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类DRG的空间转录组学分析仅为初步结果，GPR37在人类中的具体机制仍需进一步验证 | 探讨GPR37在化疗诱导的周围神经病变中的作用及NPD1通过GPR37的镇痛和神经保护机制 | 小鼠背根神经节神经元和巨噬细胞、人类DRG组织样本 | 机器学习 | 周围神经病变 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组学数据 | 小鼠（野生型和Gpr37敲除型）及人类DRG组织 | NA | 空间转录组学 | NA | 人类DRG的空间转录组学分析 |
| 32 | 2026-05-27 |
Decoding Cellular Communication Networks and Signaling Pathways in Bone, Skeletal Muscle, and Bone-Muscle Crosstalk Through Spatial Transcriptomics
2025-Jun-12, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6701121/v1
PMID:40585205
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研究论文 | 通过空间转录组学解码骨、骨骼肌及骨-肌交互中的细胞通讯网络和信号通路 | 首次提供了骨和骨骼肌跨组织细胞间通讯的空间分辨图谱，揭示了骨-肌交互中的新配体-受体对和信号通路 | 研究仅基于小鼠模型，且空间转录组学技术在骨-肌交互中的应用仍有限 | 探究骨和骨骼肌中细胞间通讯网络及信号通路在组织稳态和疾病中的作用 | 小鼠股骨及相邻骨骼肌组织 | 数字病理学 | 骨质疏松症、肌肉减少症、代谢综合征 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 小鼠股骨和骨骼肌样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium空间转录组学分析 |
| 33 | 2026-05-27 |
Glucocorticoid receptor suppresses GATA6-mediated RNA polymerase II pause release to modulate classical subtype identity in pancreatic cancer
2025-06-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-334374
PMID:39884837
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序、ATAC-seq、ChIP-seq、HiChIP和PRO-seq等多种组学技术，揭示了糖皮质激素受体（GR）通过抑制GATA6介导的RNA聚合酶II暂停释放来调控胰腺癌经典亚型身份的分子机制 | 首次发现GR激动剂通过直接与GATA6互作抑制经典转录程序，并阐明GATA6通过启动子近端暂停释放控制经典特异性转录的机制 | NA | 揭示控制胰腺导管腺癌（PDAC）亚型身份的转录调控机制 | 胰腺导管腺癌细胞及其经典亚型和基底亚型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序， ATAC-seq， ChIP-seq， HiChIP， PRO-seq， 多光谱成像 | NA | 测序数据， 图像数据 | 原发肿瘤单细胞RNA测序样本， 患者来源异种移植RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA测序， 单细胞ATAC测序， 空间转录组学 | NA | NA |
| 34 | 2026-05-25 |
The Dual Molecular Identity of Vestibular Kinocilia: Bridging Structural and Functional Traits of Primary and Motile Cilia
2025-Jun-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.16.647417
PMID:40568142
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和活细胞成像，揭示了前庭动纤毛兼具初级纤毛和运动纤毛的分子特征及其主动运动功能 | 首次证明前庭动纤毛具有初级纤毛和运动纤毛的双重分子身份，并发现其能自发产生运动，挑战了传统认为动纤毛仅为感觉结构的观点 | 未详细说明成像技术的分辨率限制及跨物种比较中可能存在的差异 | 阐明前庭动纤毛的结构、分子组成和功能特征 | 成年小鼠、斑马鱼、牛蛙和人类的前庭毛细胞及动纤毛 | 分子生物学, 细胞生物学 | 前庭疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫染色, 活细胞成像 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 成年小鼠和人类的前庭毛细胞（未明确具体数量） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2026-05-25 |
PANoptosis-related gene biomarkers in aortic dissection
2025-06, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2025.110385
PMID:40086567
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研究论文 | 本研究探讨了PANoptosis相关基因在主动脉夹层中的生物标志物作用 | 首次在单细胞水平上评估血管平滑肌细胞中PANoptosis（包括焦亡、凋亡和坏死性凋亡）评分，并鉴定出关键基因GADD45B、CDKN1A和SOD2 | 未在更大规模临床样本中验证，机制研究依赖于公共数据集 | 阐明PANoptosis相关基因在主动脉夹层发病机制中的作用 | 主动脉夹层患者和动物模型中的血管平滑肌细胞 | 机器学习和生物信息学 | 主动脉夹层 | 单细胞测序 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | GSE213740（单细胞测序数据集）、GSE153434、GSE147026和GSE52093共4个公共数据集，以及患者和小鼠血管组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | GSE213740单细胞测序数据集 |
| 36 | 2026-05-23 |
Low-dose radiotherapy enhances the efficacy of PD-L1 blockade and induces the abscopal effect
2025-Jun-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011487
PMID:40588370
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研究论文 | 低剂量放疗能增强PD-L1免疫检查点抑制剂的疗效并诱导远端未照射肿瘤的远隔效应，通过单细胞RNA测序揭示肿瘤相关巨噬细胞向促炎表型极化是关键机制 | 首次证明低剂量放疗联合抗PD-L1可诱导与高剂量放疗相当的远隔效应，并阐明肿瘤相关巨噬细胞在该效应中的关键作用 | 研究仅局限于小鼠肿瘤模型（MC38和CT26），尚未在临床试验中验证 | 探究低剂量放疗在增强免疫检查点抑制剂疗效和诱导远隔效应中的潜力及其机制 | 小鼠肿瘤模型（MC38或CT26）中的肿瘤微环境、免疫细胞及治疗反应 | 机器学习 | 癌症（肿瘤） | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据（单细胞转录组） | 免疫健全小鼠（分别携带MC38或CT26肿瘤，每只小鼠1或2个肿瘤） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 37 | 2026-05-23 |
Targeting Annexin A2 to reactivate tumor-associated antigens presentation and relieve immune tolerance in liver cancer
2025-Jun-26, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011716
PMID:40571481
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研究论文 | 靶向Annexin A2恢复肝癌中肿瘤相关抗原呈递并缓解免疫耐受 | 首次发现Annexin A2通过抑制与HSP90的结合来阻碍肿瘤相关抗原呈递，并证明靶向Annexin A2可增强CD8+ T细胞杀伤肿瘤效果，提高抗PD-1治疗的疗效 | 未明确提及，但可能局限在于仅使用小鼠模型，临床样本验证不足 | 阐明Annexin A2在肝癌中调控肿瘤相关抗原呈递和免疫逃逸的分子机制，并探索其作为免疫治疗靶点的潜力 | Annexin A2蛋白，HSP90蛋白，肿瘤相关抗原，CD8+ T细胞 | 机器学习 | 肝癌 | CRISPR-Cas9基因敲除，共免疫沉淀偶联液相色谱串联质谱，单细胞测序 | NA | NA | 化学和基因诱导的原发性肝癌模型及原位肝癌移植模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 38 | 2026-05-23 |
Hyperglycemia induces an immunosuppressive microenvironment in colorectal cancer liver metastases by recruiting peripheral blood monocytes through the CCL3-CCR1 axis
2025-Jun-22, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-011310
PMID:40550559
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研究论文 | 研究高血糖通过CCL3-CCR1轴招募外周血单核细胞，从而在结直肠癌肝转移中诱导免疫抑制微环境 | 首次揭示了高血糖通过CCL3-CCR1信号轴调控结直肠癌肝转移中免疫抑制的新机制 | 主要基于小鼠模型和有限的人类样本分析，可能无法完全代表人类疾病的复杂性 | 探讨2型糖尿病背景下结直肠癌肝转移的免疫微环境并识别潜在治疗靶点 | 高血糖结直肠癌肝转移小鼠模型以及人类外周血单核细胞和肝转移样本 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 20个结直肠癌肝转移样本及匹配的外周血单核细胞数据集，加上健康供体和2型糖尿病患者的PBMC数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 39 | 2026-05-23 |
STS2 deficiency revives CD8+T cells from exhaustion and augments checkpoint blockade efficacy in cancer immunotherapy
2025-Jun-22, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010735
PMID:40550566
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研究论文 | 本研究揭示了STS2缺失通过调控PD-1表达和内吞作用，恢复CD8+ T细胞功能，增强抗PD-1免疫检查点疗法在肿瘤免疫治疗中的效果 | 首次发现STS2作为T细胞耗竭的多面调控因子，通过与PD-1蛋白直接相互作用调节其表达、内吞和降解，为增强抗肿瘤免疫和改善免疫治疗疗效提供新靶点 | NA | 研究STS2在调控肿瘤微环境中CD8+ T细胞耗竭中的作用及其对免疫检查点疗法的影响 | 小鼠模型中的CD8+肿瘤浸润淋巴细胞 | machine learning | 肿瘤 | 遗传敲除、流式细胞术、质谱流式、单细胞转录组学、免疫共沉淀、蛋白降解实验、内吞测量 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2026-05-23 |
EZH2 inhibition and 5-azacytidine enhance antitumor immunity in PTEN-deficient glioblastoma by activation viral mimicry response
2025-Jun-13, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011650
PMID:40514071
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研究论文 | 通过抑制EZH2与5-氮杂胞苷联合治疗，在PTEN缺陷的胶质母细胞瘤中激活病毒拟态反应，增强抗肿瘤免疫 | 首次揭示EZH2抑制与5-氮杂胞苷联合通过表观遗传调控重新激活内源性逆转录病毒-病毒拟态通路，克服PTEN缺陷胶质母细胞瘤的免疫逃逸 | 未提及具体局限性 | 探索PTEN缺陷胶质母细胞瘤中通过病毒拟态通路增强抗肿瘤免疫的治疗策略 | PTEN缺陷的胶质母细胞瘤及其免疫微环境 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |