单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 716 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2025-10-06 |
Multi-omics analyses of the heterogenous immune microenvironment in triple-negative breast cancer implicate UQCRFS1 potentiates tumor progression
2025-Jun-16, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-025-00672-1
PMID:40524231
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研究论文 | 通过多组学分析揭示三阴性乳腺癌异质性免疫微环境，发现UQCRFS1促进肿瘤进展 | 首次通过单细胞RNA测序系统分析TNBC免疫微环境异质性，建立恶性细胞指数模型并验证UQCRFS1的促癌功能 | 样本量较小（仅9例初治TNBC患者），需更大队列验证 | 解析三阴性乳腺癌免疫微环境异质性及其与肿瘤进展的关系 | 三阴性乳腺癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组, 蛋白质组, qRT-PCR, 蛋白质印迹 | LASSO-Cox回归, CellChat算法, 伪时序分析 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 蛋白质组数据 | 9例初治三阴性乳腺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 342 | 2025-10-06 |
Next generation genetic screens in kinetoplastids
2025-Jun-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf515
PMID:40530689
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综述 | 本文综述了动质体寄生虫中遗传筛选技术的发展与应用 | 探讨了将基于图像的筛选和单细胞测序技术与遗传筛选相结合的新方法 | NA | 系统理解基因组功能元件及其扰动对细胞功能的影响 | 动质体寄生虫的编码和非编码基因组区域 | 基因组学 | 寄生虫病 | 遗传筛选, CRISPR-Cas技术, 单细胞测序, 图像分析 | NA | 基因组数据, 图像数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 343 | 2025-10-06 |
Macrophage polarization, inflammatory monocytes, and impaired MDSCs are associated with murine and human immune aplastic anemia
2025-Jun-04, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiaf073
PMID:40411822
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型和人类样本探讨骨髓源性细胞在免疫性再生障碍性贫血发病机制中的作用 | 首次揭示CSF-1R抑制会加剧骨髓衰竭并促进M1巨噬细胞极化，同时发现JAK抑制剂可缓解疾病进程 | 研究样本量有限，人类样本仅针对严重AA患者 | 探索骨髓衰竭疾病中髓系细胞的免疫病理机制 | 小鼠骨髓衰竭模型和人类再生障碍性贫血患者样本 | 免疫学 | 再生障碍性贫血 | 流式细胞术, 细胞因子分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 细胞群体数据 | CByB6F1小鼠和严重AA患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 344 | 2025-10-06 |
Regional differences in progenitor metabolism shape brain growth during development
2025-Jun-26, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.04.003
PMID:40300602
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研究论文 | 本研究通过单细胞分辨率的小鼠大脑发育图谱揭示了前脑与后脑神经发生的区域差异，并发现线粒体蛋白FAM210B通过调节代谢影响神经前体细胞增殖的机制 | 首次提供了小鼠大脑单细胞分辨率的发育时间图谱，揭示了区域特异性神经发生模式，并鉴定出线粒体蛋白FAM210B作为调节神经前体细胞代谢和增殖的关键因子 | 研究主要基于小鼠模型，在人类中的保守性需要进一步验证 | 探究哺乳动物大脑区域发育差异的分子机制 | 小鼠大脑发育过程中的神经前体细胞 | 发育神经生物学 | NA | 单细胞RNA测序，功能获得和功能缺失实验 | NA | 单细胞转录组数据，发育时间序列数据 | 小鼠大脑发育不同阶段的细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 345 | 2025-10-06 |
Advantages of cell proliferation and immune regulation in CD146+NESTIN+ HUMSCs: insights from single-cell RNA sequencing
2025-Jun-24, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxae063
PMID:39428975
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析不同胎龄人脐带间充质干细胞中CD146+NESTIN+亚群的增殖和免疫调节优势 | 首次在单细胞水平揭示早产HUMSCs中CD146+Nestin+亚群具有更高的增殖能力和免疫调节功能 | 样本量较小（仅3个供体），需要更大规模研究验证 | 探究不同胎龄HUMSCs的细胞异质性及其功能差异 | 人脐带间充质干细胞（HUMSCs）和骨髓间充质干细胞（BMSCs） | 单细胞组学 | 干细胞治疗 | 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析 | 单细胞转录组数据 | 3个不同胎龄HUMSCs供体（22+5周、28周、39周）和2个公共数据库BMSCs样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 346 | 2025-10-06 |
Heterologous prime-boost with an mRNA vaccine and an oncolytic virus enhances tumor regression through overcoming intratumoral immune suppression
2025-Jun-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115745
PMID:40411783
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研究论文 | 本研究开发了一种通过mRNA疫苗与溶瘤病毒异源初免-加强策略增强HPV相关肿瘤消退的方法 | 首次将mRNA疫苗与HSV-1溶瘤病毒结合使用，通过异源初免-加强策略协同激活系统性和肿瘤内免疫反应 | 研究基于小鼠同系肿瘤模型，尚未在人类临床试验中验证 | 开发克服肿瘤内免疫抑制的新型联合免疫疗法 | HPV相关癌症模型 | 免疫治疗 | HPV相关癌症 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | 小鼠同系肿瘤模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 347 | 2025-10-06 |
RORγt is crucial for gut homeostasis by regulating the expression of HB-EGF rather than IL-22 in activated ILC3s
2025-Jun-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115793
PMID:40478733
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了RORγt在活化ILC3细胞中的关键作用，特别是对HB-EGF表达的调控 | 发现RORγt缺失后ILC3细胞仍能产生足够IL-22维持肠道健康，但HB-EGF产生受损，这为理解RORγt功能提供了新视角 | 研究主要基于小鼠模型，人类ILC3细胞中RORγt功能是否相同尚需验证 | 阐明RORγt在3型先天淋巴样细胞(ILC3s)中的具体功能机制 | IL-22命运示踪小鼠模型中的ILC3细胞 | 免疫学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序，命运示踪技术 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 348 | 2025-10-06 |
Widespread and cell-type-specific transcriptomic reorganization following mild traumatic brain injury
2025-Jun-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115795
PMID:40478731
|
研究论文 | 利用空间转录组学研究轻度创伤性脑损伤后全脑范围和细胞类型特异性的转录组重组 | 首次结合CHIMERA TBI模型和空间转录组学技术，系统揭示轻度脑损伤后跨脑区和细胞类型特异性的转录组变化模式 | 研究基于小鼠模型，结果向人类转化的适用性需进一步验证；仅关注亚急性期变化，缺乏长期随访数据 | 解析创伤性脑损伤的多尺度分子机制和细胞特异性反应 | 小鼠脑组织（特别是齿状回分子层星形胶质细胞和丘脑神经元） | 空间转录组学 | 创伤性脑损伤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 多只CHIMERA TBI模型小鼠 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 349 | 2025-10-06 |
Id2 levels determine the development of effector vs. exhausted tissue-resident memory CD8+ T cells during CNS chronic infection
2025-Jun-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115861
PMID:40531616
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了转录调节因子Id2在慢性中枢神经系统感染期间调控CD8+组织驻留记忆T细胞向效应或耗竭表型分化的分子机制 | 首次发现Id2表达水平决定CD8+ Trm细胞在慢性感染中向效应表型或耗竭表型分化的命运 | 研究仅限于弓形虫感染的小鼠模型，未验证其他慢性感染模型 | 探究组织驻留记忆T细胞异质性的分子调控机制 | 慢性弓形虫感染小鼠脑组织中的CD8+ T细胞 | 单细胞转录组学 | 中枢神经系统慢性感染 | 单细胞转录组测序，混合骨髓嵌合体实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 慢性弓形虫感染小鼠脑组织CD8 T细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 350 | 2025-10-06 |
Robust self-supervised machine learning for single cell embeddings and annotations
2025-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.05.658097
PMID:40502088
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研究论文 | 开发了一种用于单细胞数据降维和聚类的自监督元算法DR-GEM | 结合分布鲁棒优化与平衡共识机器学习原理，通过重建误差识别关注不良嵌入样本，使用平衡共识学习提高鲁棒性 | 未明确说明算法在特定数据类型或规模下的性能限制 | 解决单细胞基因组学中现有降维和聚类方法对主要模式过拟合、忽略稀有细胞类型及对技术噪声敏感的问题 | 单细胞组学数据、单细胞分辨率空间转录组数据和Perturb-seq数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,Perturb-seq | 自监督机器学习,元算法 | 单细胞组学数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,单细胞多组学 | NA | NA |
| 351 | 2025-10-06 |
Baseline total lesion glycolysis identifies high-risk patients with immunosuppressive signatures in early-stage natural killer/T-cell lymphoma
2025-Jun-04, The oncologist
DOI:10.1093/oncolo/oyaf164
PMID:40492497
|
研究论文 | 本研究探讨基线总病灶糖酵解作为早期NK/T细胞淋巴瘤高风险患者的生物标志物 | 首次发现基线总病灶糖酵解可识别具有免疫抑制特征的早期NK/T细胞淋巴瘤高风险患者 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证 | 评估基线PET/CT放射组学标志物在早期NK/T细胞淋巴瘤预后预测中的价值 | 早期NK/T细胞淋巴瘤患者 | 医学影像分析 | NK/T细胞淋巴瘤 | 18F-FDG PET/CT, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 医学影像, 基因表达数据 | 192例患者（训练队列127例，验证队列65例），其中10例进行单细胞RNA测序，65例进行批量RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 352 | 2025-10-06 |
Dissecting crosstalk induced by cell-cell communication using single-cell transcriptomic data
2025-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.31.657197
PMID:40501904
|
研究论文 | 提出一种基于机器学习的SigXTalk方法，利用单细胞转录组数据分析细胞间通讯诱导的信号通路串扰 | 首次从信号通路串扰角度系统分析细胞间通讯，引入信号保真度和特异性两个关键指标量化串扰效应 | NA | 分析细胞间通讯过程中不同配体-受体对激活通路之间的串扰现象 | 细胞间通讯网络中的受体、转录因子和靶基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 超图学习 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 353 | 2025-10-06 |
Spatially separated epithelium-associated and lamina propria neutrophils present distinct functional identities in the inflamed colon mucosa
2025-Jun, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2025.02.008
PMID:40057307
|
研究论文 | 本研究揭示了炎症性肠病结肠黏膜中空间位置不同的中性粒细胞具有截然不同的功能特性 | 首次证明结肠黏膜中不同空间定位的中性粒细胞（上皮相关中性粒细胞和固有层中性粒细胞）具有独特的功能特性 | NA | 探究炎症性肠病中不同空间定位中性粒细胞的功能特性和临床意义 | 炎症性肠病患者和小鼠结肠炎模型中的中性粒细胞 | 单细胞生物学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序, 空间RNA转录组学, 实时活体成像 | NA | 基因表达数据, 影像数据 | 人类患者和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 354 | 2025-10-06 |
Accurate Transcription Factor Activity Inference to Decipher Cell Identity from Single-Cell Transcriptomic Data with MetaTF
2025-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202410745
PMID:40397381
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研究论文 | 提出metaTF计算框架，用于从单细胞转录组数据推断转录因子活性以解析细胞身份 | 开发了优于现有方法的转录因子活性推断框架，能识别乳腺癌中神经调节T细胞新亚群 | NA | 通过推断转录因子活性来解析细胞身份和功能 | 小鼠造血干细胞、乳腺癌上皮细胞、肿瘤免疫微环境中的T细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 计算框架 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 355 | 2025-10-06 |
Nanomedicine and Spleen-Targeting Strategies for Precision Immunomodulation: Advances, Challenges, and Future Perspectives
2025-Jun-27, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c04836
PMID:40576399
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综述 | 本文综述了基于纳米药物的脾脏靶向策略在精准免疫调节中的进展、挑战与未来前景 | 系统整合了脾脏靶向纳米策略与系统免疫学方法（包括空间转录组学）的协同应用 | NA | 探讨脾脏靶向纳米药物在免疫调节治疗中的潜力 | 脾脏免疫细胞及纳米药物递送系统 | 纳米医学 | 肿瘤、自身免疫疾病 | 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 356 | 2025-10-06 |
Integrated transcriptome analysis and combinatorial machine learning to construct a homeostatic model of acetylation for ccRCC and validate the key gene GCNT4
2025-Jun-25, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03837-4
PMID:40563096
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研究论文 | 通过整合转录组分析和组合机器学习构建ccRCC乙酰化稳态模型并验证关键基因GCNT4 | 首次从乙酰化角度构建ccRCC稳态模型，使用10种机器学习算法的101种组合进行预后分析，发现GCNT4通过调节O-GlcNAc修饰影响乙酰化的新机制 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多独立队列验证模型的普适性 | 探索ccRCC中乙酰化的潜在生物学机制并构建预后风险模型 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者组织和肾癌细胞 | 机器学习 | 肾癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, GSEA, 细胞实验 | LASSO+RSF组合模型, 机器学习算法组合 | RNA-seq数据, 单细胞RNA测序数据, 临床信息 | 来自TCGA、ICGC和GEO数据库的ccRCC样本 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 357 | 2025-10-06 |
Ectopic expression of GDF15 in cancer-associated fibroblasts enhances melanoma immunosuppression via the GFRAL/RET cascade
2025-Jun-24, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-011036
PMID:40555562
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研究论文 | 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞通过异位表达GDF15促进黑色素瘤免疫抑制微环境形成的分子机制 | 首次发现CAFs通过GDF15/GFRAL/RET信号级联诱导巨噬细胞M2极化和肿瘤干细胞性增强 | NA | 阐明CAFs在黑色素瘤免疫微环境中的关键作用机制 | 黑色素瘤、癌症相关成纤维细胞、巨噬细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,分子动力学模拟,免疫共沉淀,染色质免疫沉淀,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据,蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 358 | 2025-10-06 |
A novel mesothelioma molecular classification based on malignant cell differentiation
2025-Jun-24, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03816-9
PMID:40555979
|
研究论文 | 基于恶性细胞分化状态开发了一种新的间皮瘤分子分型系统和预后预测模型 | 首次基于肿瘤细胞分化状态对间皮瘤进行分子分型，识别了8种恶性细胞亚型和3种临床相关亚型 | 研究基于公共数据库数据，需要更多临床样本验证 | 建立间皮瘤的分子分型系统和预后预测模型 | 间皮瘤肿瘤细胞 | 生物信息学 | 间皮瘤 | 单细胞RNA测序，多组学分析，调控网络构建 | 降维分析，聚类分析，预测模型 | 单细胞RNA测序数据 | 来自GEO数据库的间皮瘤单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 359 | 2025-10-06 |
Molecular and genetic characterization of sex-linked orange coat color in the domestic cat
2025-Jun-23, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2025.04.055
PMID:40378841
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研究论文 | 本研究揭示了家猫性连锁橙色被毛颜色的分子遗传机制 | 首次发现性连锁橙色突变由5-kb缺失引起，导致Arhgap36基因在黑色素细胞中异位表达，并证实其通过抑制PKA催化亚基影响毛色形成 | 研究主要基于胎儿猫皮肤样本，成年猫中的机制可能需要进一步验证 | 解析家猫性连锁橙色被毛颜色的遗传和分子机制 | 家猫（特别是玳瑁猫和三花猫）的毛色形成机制 | 遗传学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 胎儿猫皮肤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 360 | 2025-10-06 |
High glucose burden disrupts the glucose responsiveness of human pancreatic beta cells encapsulated in alginate fibers during Long-Term culture
2025-Jun-20, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149639
PMID:40544971
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研究论文 | 本研究通过藻酸盐封装技术长期培养人胰岛细胞，揭示了高葡萄糖负荷破坏β细胞葡萄糖响应性的分子机制 | 首次利用藻酸盐封装技术实现人胰岛细胞长期功能维持，并通过多组学分析鉴定出导致β细胞功能障碍的关键基因 | 研究仅使用两个批次的样本，样本量有限；体外培养模型可能无法完全模拟体内环境 | 探究高葡萄糖负荷下人胰腺β细胞功能障碍的分子机制 | 藻酸盐封装的人胰岛细胞 | 细胞生物学 | 糖尿病 | RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个不同批次的培养样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |