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当前共找到 736 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2025-10-06 |
Colorectal cancer cell line-derived organoid model with stem cell properties captures the regrowing state of residual cancer cells after neoadjuvant chemotherapy
2025-Jun-20, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02567-w
PMID:40537472
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研究论文 | 本研究建立了结直肠癌细胞系来源的类器官再生模型，用于研究新辅助化疗后残留癌细胞的再生状态 | 首次利用具有癌症干细胞特性的患者来源细胞系建立结直肠癌类器官再生模型，并发现RNA聚合酶I抑制剂BMH-21能显著抑制肿瘤生长 | 研究仅基于单一患者来源的细胞系，需要更多样本验证结果的普适性 | 研究结直肠癌新辅助化疗后残留癌细胞的再生机制并寻找治疗靶点 | 结直肠癌细胞系来源的类器官模型 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 基因表达数据 | 单一患者来源的细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 342 | 2025-10-06 |
Gap junction protein beta 5 interacts with Gαi3 to promote Akt activation and cervical cancer cell growth
2025-Jun-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07768-w
PMID:40537499
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研究论文 | 本研究探讨了间隙连接蛋白β5在宫颈癌中的表达、功能及其通过Gαi3促进Akt信号通路激活的机制 | 首次发现GJB5与Gαi3相互作用并通过该机制激活Akt-mTOR信号通路促进宫颈癌进展 | NA | 探索GJB5在宫颈癌中的致癌作用及其分子机制 | 宫颈癌细胞系和异种移植模型 | 癌症生物学 | 宫颈癌 | shRNA、CRISPR/Cas9基因敲除、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA数据库宫颈癌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 343 | 2025-10-06 |
scExtract: leveraging large language models for fully automated single-cell RNA-seq data annotation and prior-informed multi-dataset integration
2025-Jun-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03639-x
PMID:40537825
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研究论文 | 开发了一个利用大语言模型自动化单细胞RNA测序数据分析的框架scExtract | 首次将大语言模型应用于单细胞RNA测序数据的全自动注释和先验信息引导的多数据集整合 | NA | 解决公共单细胞RNA测序数据集分析中的注释和整合挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理, 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 大语言模型 | 文本, 基因表达数据 | 44万个细胞，来自14个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 344 | 2025-10-06 |
Vispro improves imaging analysis for Visium spatial transcriptomics
2025-Jun-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03648-w
PMID:40533768
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研究论文 | 开发用于Visium空间转录组学的端到端自动化图像处理工具Vispro，提升成像分析质量 | 首个专门针对10x Visium数据优化的端到端图像处理工具，包含基准标记检测、图像恢复、组织区域检测和分离组织区域分割模块 | NA | 解决空间转录组学中组织学图像因基准标记和背景区域干扰而质量下降的问题 | Visium空间转录组学数据中的组织学图像 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间转录组学平台 |
| 345 | 2025-10-06 |
Two types of regenerative cell populations appear in acute liver injury
2025-Jun-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102503
PMID:40345206
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现急性肝损伤中同时出现两种不同的再生细胞群 | 首次揭示在相同再生过程中同时存在两种形态、分化、定位、增殖率和信号响应显著不同的再生细胞群，其中一种通过与坏死组织接触诱导产生 | 研究基于公开数据且仅使用对乙酰氨基酚处理的小鼠模型，可能无法完全代表所有类型的急性肝损伤 | 探究急性肝损伤中肝脏再生的细胞机制 | 对乙酰氨基酚诱导急性肝损伤的小鼠肝脏细胞 | 单细胞生物学 | 肝损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 公开数据集中的对乙酰氨基酚处理小鼠肝脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 346 | 2025-10-06 |
Stem cell fate decisions: Substates and attractors
2025-Jun-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102532
PMID:40499510
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综述 | 本文回顾了人类多能干细胞在基因表达异质性方面的研究，重点探讨其占据不同亚状态的能力及其对分化结果的影响 | 提出了一种建模荧光标记分布时间序列的新方法，表明亚状态间的转换可能受确定性混沌和基因表达随机波动的共同调控 | NA | 探索干细胞命运决定的动态机制和亚状态转换规律 | 人类多能干细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学、荧光标记动态分析 | NA | 基因表达数据、荧光标记分布数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 347 | 2025-10-06 |
Human microglia in brain assembloids display region-specific diversity and respond to hyperexcitable neurons carrying SCN2A mutation: Microglial diversity and response in assembloids
2025-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.04.657874
PMID:40501840
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研究论文 | 本研究通过构建包含人类小胶质细胞的区域特异性大脑类器官和组装体，揭示了小胶质细胞的区域多样性及其对携带SCN2A突变神经元过度兴奋的反应机制 | 首次在人类大脑组装体中展示小胶质细胞的区域特异性多样性，并发现小胶质细胞通过GABA受体对突变介导的神经元过度兴奋产生增强的钙反应和过度突触修剪 | 研究基于体外类器官模型，可能与体内真实大脑环境存在差异 | 解析人类小胶质细胞在特定神经回路中的区域特异性特性及其在神经精神疾病中的作用 | 人类小胶质细胞、大脑类器官（皮质、纹状体、中脑）和组装体 | 神经科学 | 自闭症 | 单细胞RNA测序，化学遗传学，钙成像 | 大脑类器官，组装体模型 | 基因表达数据，钙信号数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 348 | 2025-10-06 |
Spatial Transcriptomics Reveals Cancer and Stromal Cell Heterogeneity Between Center and Invasive Front of Pancreatic Cancer
2025-Jun, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2025.100726
PMID:39889965
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示胰腺癌肿瘤中心与侵袭前沿的癌细胞和癌症相关成纤维细胞的转录异质性 | 首次在空间维度上系统比较胰腺癌肿瘤中心与侵袭前沿的癌细胞和CAFs转录组差异，发现侵袭前沿细胞具有更强的应激反应、增殖、糖酵解和上皮间质转化活性 | 仅分析了4例高分化胰腺癌样本，样本量较小；仅包含常规形态学病例 | 探究胰腺导管腺癌肿瘤内部空间异质性 | 人类胰腺导管腺癌组织样本 | 空间转录组学 | 胰腺癌 | 数字空间分析，全转录组测序，免疫组织化学验证 | NA | 空间转录组数据，免疫组织化学图像 | 4例用于空间转录组分析的高分化PDAC，17例用于免疫组化验证的不同分化程度PDAC | Nanostring | 空间转录组学 | GeoMx系统 | GeoMx数字空间分析系统，全转录组检测 |
| 349 | 2025-10-06 |
New Anti-Fibrotic Strategies for Keloids: Insights From Single-Cell Multi-Omics
2025-Jun, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13818
PMID:39902627
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研究论文 | 通过单细胞多组学技术研究瘢痕疙瘩的细胞异质性和分子机制，识别关键成纤维细胞亚群及其在纤维化中的作用 | 首次在瘢痕疙瘩中识别POSTN阳性间充质成纤维细胞和IGFBP2阳性成纤维细胞两个关键亚群，揭示它们在纤维化中的相反作用 | 样本量较小（仅3个瘢痕疙瘩组织和3个正常皮肤样本），需要更大规模研究验证 | 探索瘢痕疙瘩的发病机制并开发新的抗纤维化治疗策略 | 瘢痕疙瘩组织和正常皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 3个瘢痕疙瘩组织, 3个正常皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 350 | 2025-10-06 |
GeneDX-PBMC: An adversarial autoencoder framework for unlocking Alzheimer's disease biomarkers using blood single-cell RNA sequencing data
2025-Jun, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110283
PMID:40311462
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研究论文 | 本研究开发了一个结合自编码器和分类器的深度学习框架，通过血液单细胞RNA测序数据识别阿尔茨海默病的生物标志物 | 采用对抗自编码器框架整合差异表达基因和传统方法常忽略的细微遗传变异，首次在PBMC单细胞水平系统分析AD相关基因 | 单核细胞数据存在限制需依赖随机森林分类器处理，样本来源仅限于外周血单核细胞 | 识别阿尔茨海默病的血液生物标志物和治疗靶点 | 阿尔茨海默病患者和认知正常对照者的外周血单核细胞 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 对抗自编码器, 随机森林 | 基因表达数据 | AD患者和正常对照的PBMC样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 351 | 2025-10-06 |
Deciphering the Regulatory Networks of the Migrasome-Associated Cell Subpopulation in Heterotopic Ossification via Multi-Omics Analysis
2025-Jun-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500965R
PMID:40540299
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研究论文 | 通过多组学分析揭示异位骨化中迁移体相关细胞亚群的调控网络 | 首次识别出间充质谱系细胞作为关键的迁移体相关细胞亚型，并确定Ppib和Tagln为关键分子，构建了其调控网络和空间分布模式 | 研究主要基于公共数据库数据，实验验证可能有限 | 阐明异位骨化的关键生物分子网络和调控机制 | 异位骨化组织样本 | 生物信息学 | 异位骨化 | 单细胞转录组测序, 批量转录组测序, 空间转录组测序, 多组学分析 | 高维加权基因共表达网络分析, 机器学习 | 转录组数据, 空间转录组数据 | 来自GEO数据库的多个数据集和临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 352 | 2025-10-06 |
Integrating Single-Cell and Experimental Analyses Uncover Macrophage Ferroptosis Is a Key Event in the Development of Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2025-Jun-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501120R
PMID:40542598
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研究论文 | 通过整合单细胞测序和实验分析，揭示巨噬细胞铁死亡是慢性阻塞性肺疾病发展的关键事件 | 首次结合单细胞测序和实验验证，系统阐明香烟烟雾通过诱导巨噬细胞铁死亡促进COPD发展的机制 | 研究主要基于公共数据库和小鼠模型，需要进一步人类样本验证 | 探究香烟烟雾诱导的巨噬细胞铁死亡在COPD发病机制中的作用 | COPD患者肺组织、RAW264.7细胞系、BMDM细胞、COPD小鼠模型 | 单细胞生物学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 免疫组化, qRT-PCR, western blotting | NA | 单细胞测序数据, 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 公共数据库GSE171541和GSE173896的单细胞数据，体外和体内细胞系实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 353 | 2025-10-06 |
Quantitative measurement of phenotype dynamics during cancer drug resistance evolution using genetic barcoding
2025-Jun-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59479-7
PMID:40541962
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研究论文 | 提出一种通过遗传谱系追踪和种群规模数据推断癌症耐药性动态的数学框架 | 无需直接测量耐药表型即可推断耐药性动态的数学框架 | 未直接测量耐药表型，依赖推断方法 | 理解癌症耐药性进化机制 | 结直肠癌细胞系SW620和HCT116 | 计算生物学 | 结直肠癌 | 遗传条形码技术、单细胞RNA测序、单细胞DNA测序 | 数学框架 | 遗传谱系追踪数据、种群规模数据 | 两种结直肠癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞DNA测序 | NA | NA |
| 354 | 2025-10-06 |
ISCU-p53 axis orchestrates macrophage polarization to dictate immunotherapy response in esophageal squamous cell carcinoma
2025-Jun-20, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07787-7
PMID:40541964
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示食管鳞状细胞癌中ISCU-p53轴通过调控巨噬细胞极化影响免疫治疗反应的机制 | 首次发现ISCU通过胞质滞留p53促进M2巨噬细胞极化的新机制，并证明靶向ISCU可增强抗PD-1抗体疗效 | NA | 探索食管鳞状细胞癌免疫治疗反应差异的分子机制 | 食管鳞状细胞癌患者的肿瘤微环境细胞 | 单细胞生物学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 接受PD-1抑制剂治疗的部分缓解、疾病稳定患者及未接受术前治疗的手术患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 355 | 2025-10-06 |
The critical role of PDGFRa + Sca1 + fibroblasts in angiogenesis and vascular repair in the corpus cavernosum
2025-Jun-20, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04434-y
PMID:40542354
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了阴茎海绵体中PDGFRa+Sca1+成纤维细胞在血管生成和修复中的关键作用 | 首次发现并鉴定了一个独特的PDGFRa+Sca1+成纤维细胞亚群，该亚群具有分化为内皮细胞和平滑肌细胞的潜力，并参与血管修复过程 | 研究主要基于动物模型，尚未在人类样本中得到验证 | 探究成纤维细胞在勃起功能障碍发病机制中的作用 | 糖尿病性ED和海绵体神经损伤性ED动物模型中的阴茎海绵体组织 | 单细胞生物学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | ED动物模型组织 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 356 | 2025-10-06 |
Human induced neural progenitor cells generated from three-dimensional aggregate-based culture significantly improve post-stroke recovery in tMCAO mice
2025-Jun-20, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04433-z
PMID:40542444
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研究论文 | 本研究开发了一种基于3D聚集体培养的高效诱导神经祖细胞生产方法，并验证其在脑卒中小鼠模型中的治疗效果 | 开发了可扩展的3D悬浮培养系统，避免了有害的细胞解离和重铺过程，并通过单细胞RNA测序揭示了iNPC的亚群特征 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未进行人体临床试验 | 开发高效的iNPC生产方法并评估其在脑卒中恢复中的治疗潜力 | 诱导多能干细胞来源的神经祖细胞和tMCAO小鼠模型 | 再生医学 | 脑卒中 | 单细胞RNA测序，3D细胞培养 | NA | 基因表达数据，细胞表型数据 | 3个iPSC细胞系，tMCAO小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 357 | 2025-10-06 |
Integrating multi-omics data to optimize immunotherapy in endometrial cancer: a comprehensive study
2025-Jun-20, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02978-2
PMID:40540226
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研究论文 | 通过整合多组学数据研究子宫内膜癌患者对免疫治疗反应的分子机制和肿瘤微环境特征 | 首次综合运用多组学数据和多种计算框架系统分析子宫内膜癌免疫治疗反应差异，特别关注肿瘤相关巨噬细胞亚型的作用 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 优化子宫内膜癌免疫治疗策略 | 子宫内膜癌患者 | 生物信息学 | 子宫内膜癌 | 多组学分析,单细胞RNA测序,体细胞突变分析,拷贝数变异分析 | TIDE,EaSIeR,ImmunoPhenoScore,ESTIMATE,TIMER,EPIC,Scissor算法 | 基因组学数据,转录组学数据,单细胞测序数据 | 来自公共数据库的子宫内膜癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 358 | 2025-10-06 |
Sequence Diversity and Encoded Enzymatic Differences of Monocistronic L1 ORF2 mRNA Variants in the Aged Normal and Alzheimer's Disease Brain
2025-Jun-18, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.2298-24.2025
PMID:40368603
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研究论文 | 本研究通过功能分析和长读长测序揭示了阿尔茨海默病和正常衰老大脑中L1逆转录转座子ORF2 mRNA的序列多样性及其编码的酶活性差异 | 首次在大脑中发现大量单顺反子ORF2 mRNA变体，其序列多样性远超人类参考基因组，并证实这些变体具有不同的逆转录酶和核酸内切酶活性 | 样本量相对有限（31个大脑样本），且主要关注大脑皮层区域 | 探究人类大脑中内源性逆转录酶活性的来源和L1 mRNA的多样性 | 阿尔茨海默病患者和正常衰老捐赠者的大脑皮层样本 | 基因组学 | 阿尔茨海默病 | PacBio HiFi长读长测序, 空间转录组学, 酶功能分析 | NA | RNA序列数据, 酶活性数据, 空间表达数据 | 31个大脑样本（阿尔茨海默病和正常衰老捐赠者，包含两性） | PacBio | 长读长测序, 空间转录组学 | PacBio HiFi | PacBio HiFi长读长测序技术 |
| 359 | 2025-10-06 |
In mice, discrete odors can selectively promote the neurogenesis of sensory neuron subtypes that they stimulate
2025-Jun-18, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.96152
PMID:40531183
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研究论文 | 研究发现特定气味能选择性促进小鼠嗅觉感觉神经元亚型的神经发生 | 首次证明离散气味能特异性加速对其敏感的嗅觉神经元亚型的生成速率 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在其它哺乳动物验证 | 探究嗅觉刺激如何影响特定嗅觉感觉神经元亚型的神经发生 | 小鼠嗅觉感觉神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 亚型特异性神经元出生日期标记 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 360 | 2025-10-06 |
The spatial and single-cell landscape of skin: Charting the multiscale regulation of skin immune function
2025-06, Seminars in immunology
IF:7.4Q1
DOI:10.1016/j.smim.2025.101958
PMID:40267702
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学技术在揭示皮肤免疫系统多尺度异质性方面的应用 | 整合单细胞和空间技术系统解析皮肤免疫景观的多尺度调控机制 | NA | 探讨皮肤免疫功能的分子和细胞特征及其空间调控机制 | 皮肤组织中的先天性和适应性免疫细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |