单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 741 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2025-10-06 |
Integrated Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Novel Insights into the Role of Opioid Signaling in the Pathophysiology of Inflammatory Bowel Disease
2025-Jun-06, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13061398
PMID:40564117
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示阿片信号在炎症性肠病病理生理中的新作用机制 | 首次在单细胞水平鉴定出表达高水平阿片信号相关基因的新型单核细胞亚群（OpiHi单核细胞），并发现其在IBD组织中的富集和TNF信号主导作用 | NA | 系统研究阿片信号相关基因在炎症性肠病中的作用和潜在机制 | 炎症性肠病（包括克罗恩病和溃疡性结肠炎）患者组织样本 | 单细胞组学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, CellChat分析, 转录因子活性评估 | 预测模型 | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 302 | 2025-10-06 |
Cell-surface proteomic profiling identifies CD72 as a regulator of microglial tiling
2025-Jun-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.02.657480
PMID:40501958
|
研究论文 | 通过细胞表面蛋白质组分析鉴定CD72作为调节小胶质细胞平铺现象的关键分子 | 首次采用细胞表面邻近标记技术结合质谱分析，系统研究小胶质细胞表面蛋白质组，并发现CD72在调节小胶质细胞平铺中的新功能 | 研究主要基于体外模型，需要进一步在体内验证CD72的调节机制 | 探索小胶质细胞平铺现象的分子调控机制 | 小胶质细胞 | 蛋白质组学 | 神经系统疾病 | 细胞表面邻近标记, 质谱分析, 单细胞RNA测序, 磷酸化蛋白质组学 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 质谱分析 | NA | NA |
| 303 | 2025-10-06 |
Integrative Analysis of Plasma Proteomics and Transcriptomics Reveals Potential Therapeutic Targets for Psoriasis
2025-Jun-04, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13061380
PMID:40564099
|
研究论文 | 通过整合血浆蛋白质组学和转录组学分析，揭示银屑病的潜在治疗靶点 | 首次将蛋白质组范围的孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序相结合，识别出与银屑病风险相关的13种蛋白质 | 研究主要基于欧洲人群数据，需要在其他人群中验证 | 探索银屑病的潜在治疗靶点 | 银屑病患者和健康对照 | 生物信息学 | 银屑病 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 蛋白质-蛋白质相互作用, 分子对接 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据, 基因型数据 | 发现阶段：10,312例病例和397,564例对照；蛋白质数据：54,219名UK Biobank参与者，2,923种蛋白质 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 304 | 2025-10-06 |
Synthbar: A Lightweight Tool for Adding Synthetic Barcodes to Sequencing Reads
2025-Jun-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.30.657070
PMID:40502055
|
研究论文 | 开发了一个轻量级工具Synthbar，用于向测序读段添加合成条形码 | 首个能够轻松添加合成细胞条形码的工具，填补了现有工具无法处理无细胞条形码测序数据的空白 | NA | 开发计算工具以扩展单细胞测序数据分析的兼容性 | 单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | SMART单细胞RNA测序方法 | 微孔板单细胞协议，SMART单细胞RNA测序方法家族 |
| 305 | 2025-10-06 |
NOTCH1 Mutation and Survival Analysis of Tislelizumab in Advanced or Metastatic Esophageal Squamous Cell Carcinoma: A Biomarker Analysis From the Randomized, Phase III, RATIONALE-302 Trial
2025-Jun, Journal of clinical oncology : official journal of the American Society of Clinical Oncology
IF:42.1Q1
DOI:10.1200/JCO-24-01818
PMID:40179324
|
研究论文 | 本研究通过RATIONALE-302试验分析NOTCH1突变作为替雷利珠单抗治疗晚期食管鳞状细胞癌的预测生物标志物 | 首次发现NOTCH1突变与替雷利珠单抗治疗食管鳞癌的生存获益相关，并通过单细胞测序揭示其潜在分子机制 | 研究样本来源于单一临床试验，需要进一步验证 | 探索食管鳞状细胞癌抗PD-1治疗的预测生物标志物 | 晚期或转移性食管鳞状细胞癌患者 | 肿瘤基因组学 | 食管鳞状细胞癌 | 全肿瘤基因组分析,转录组测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,转录组数据 | RATIONALE-302研究样本 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 306 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics Reveal a Novel Mechanism of Oligodendrocyte-Neuron Interaction in Cognitive Decline After High-Altitude Cerebral Edema
2025-Jun, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70485
PMID:40546220
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了高海拔脑水肿后认知功能下降中少突胶质细胞与神经元相互作用的新机制 | 首次发现PI3K/mTOR动态变化、Rps29-bax轴和Tnfrsf21-App相互作用是调节少突胶质细胞-神经元相互作用的新调控因子 | 仅使用小鼠模型，未在人类样本中验证 | 探索高海拔脑水肿导致认知功能下降的细胞和分子机制 | 高海拔脑水肿小鼠模型的少突胶质细胞和神经元 | 空间转录组学 | 高海拔脑水肿 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 高海拔脑水肿小鼠模型在暴露后3天和7天的海马体样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 307 | 2025-10-06 |
A Temporal Single-Cell Multi-Omics Atlas of Murine Pancreatic Islet Remodeling During Hyperglycaemia Progression
2025-Jun-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.29.656754
PMID:40568114
|
研究论文 | 本研究通过单细胞多组学技术构建了小鼠胰腺胰岛在高血糖进展过程中的细胞重塑图谱 | 首次采用纵向单细胞多组学方法系统揭示胰岛细胞在代谢压力下的动态重塑过程，发现β细胞亚群特异性调控机制 | 研究仅限于小鼠模型，人类数据仅通过数据库比对验证 | 探究肥胖诱导的胰岛素抵抗过程中胰腺胰岛细胞重塑的分子机制 | C57BL/6小鼠胰腺胰岛细胞 | 单细胞生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 高脂饮食喂养8、16、24周的C57BL/6小鼠及年龄匹配的对照组 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 308 | 2025-10-06 |
Nanocoding: Lipid Nanoparticle Barcoding for Multiplexed Single-Cell RNA Sequencing
2025-Jun-24, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c02111
PMID:40489257
|
研究论文 | 开发了一种名为纳米编码的新技术，利用脂质纳米颗粒进行多重单细胞RNA测序中的高密度条形码标记 | 首次将脂质纳米颗粒应用于单细胞RNA测序的多重样本标记，通过多种可控的细胞摄取方式实现10-100倍的条形码负载放大 | NA | 开发高效的多重单细胞RNA测序样本标记技术以解决高成本和批次效应问题 | 培养细胞系、组织消化物中的异质性细胞、脾脏消化物、肥胖啮齿动物脂肪组织 | 单细胞测序技术 | 肥胖相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6重条形码样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 309 | 2025-10-06 |
scGANSL: Graph Attention Network with Subspace Learning for scRNA-seq Data Clustering
2025-Jun-23, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.5c00731
PMID:40468846
|
研究论文 | 提出一种名为scGANSL的新型单细胞RNA测序数据聚类方法，结合图注意力网络和子空间学习 | 首次将图注意力网络与子空间学习相结合用于scRNA-seq数据聚类，采用多视图共享图自编码器和ZINB模型，并引入局部学习和自表达策略 | 未在摘要中明确说明方法的具体局限性 | 开发更有效的单细胞RNA测序数据聚类方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图注意力网络, 自编码器, ZINB模型 | 基因表达数据 | 多个scRNA-seq数据集（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 310 | 2025-10-06 |
Breaking ground: Resolving root growth on soil at the cellular level
2025-Jun-23, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.002
PMID:40555175
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示土壤环境对水稻根系细胞形态的影响机制 | 首次在单细胞水平解析土壤压实对水稻根系细胞形态的影响，发现脱落酸信号通路介导的细胞壁修饰机制 | NA | 研究土壤环境对植物根系生长发育的影响机制 | 水稻根系细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 311 | 2025-10-06 |
CD51 Promotes Gastric Cancer Stemness via Blocking Numb-Mediated Notch1 Degradation
2025-Jun-22, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217886
PMID:40555320
|
研究论文 | 本研究揭示了CD51通过阻断Numb介导的Notch1降解促进胃癌干细胞特性的机制 | 首次发现CD51通过调控Notch1受体 trafficking 从溶酶体降解转向质膜回收的新机制来增强胃癌干细胞特性 | NA | 探索CD51在胃癌干细胞特性和恶性进展中的调控作用 | 胃癌组织和细胞 | 癌症生物学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析,功能实验 | NA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | TCGA数据库胃癌组织数据,患者来源类器官和异种移植模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 312 | 2025-10-06 |
Protocol to identify proteins as regulators of gene expression noise
2025-Jun-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103763
PMID:40220303
|
研究论文 | 介绍一种识别基因表达噪声调控蛋白的实验方案 | 开发了整合单细胞RNA测序和质谱分析的数据整合方法，用于系统识别新型噪声调控蛋白 | 方案依赖于已知的调控因子-靶点相互作用数据库，可能受限于数据库的完整性 | 建立识别基因表达噪声调控蛋白的系统方法 | 细胞系中的蛋白质调控因子 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序，液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)，翻译抑制 | NA | 单细胞RNA测序数据，质谱数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，质谱分析 | NA | NA |
| 313 | 2025-10-06 |
Protocol for characterizing craniopharyngioma subtypes and their microenvironments using single-cell RNA sequencing and immunohistochemistry
2025-Jun-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103760
PMID:40238632
|
研究论文 | 本文提供了一个分析颅咽管瘤亚型及其肿瘤微环境的单细胞分辨率综合实验方案 | 开发了结合单细胞RNA测序和免疫组织化学的综合方案，用于在单细胞水平表征颅咽管瘤亚型及其微环境 | NA | 建立分析颅咽管瘤亚型和肿瘤微环境的实验方案 | 颅咽管瘤组织样本 | 数字病理学 | 颅咽管瘤 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 314 | 2025-10-06 |
Protocol for preparing fresh frozen soybean tissues for spatial transcriptomics
2025-Jun-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103790
PMID:40272979
|
研究论文 | 本文提出了一种用于空间转录组学的新鲜冷冻大豆组织制备方案 | 针对植物组织在空间转录组学应用中的组织制备难题，首次开发了专门适用于大豆新鲜冷冻组织的标准化操作流程 | NA | 解决植物组织在空间转录组学研究中的技术障碍，建立标准化的组织制备方法 | 大豆新鲜冷冻组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 315 | 2025-10-06 |
Protocol for the imputation of stimulus-induced single-cell gene expression trajectories from time-series scRNA-seq data
2025-Jun-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103811
PMID:40343799
|
研究论文 | 提出一种从时间序列单细胞RNA测序数据中估算单细胞基因表达轨迹的计算方法 | 开发了首个能够从破坏性单细胞RNA测序数据中估算单细胞基因表达动态轨迹的计算流程 | NA | 研究细胞对刺激的异质性响应动态过程 | 癌细胞对药物的响应、免疫细胞对病原体的响应 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 降维、转移概率矩阵计算、样条插值、反卷积 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 316 | 2025-10-06 |
Protocol for isolating and characterizing human vitreous immune cell infiltrates by flow cytometry and single-cell transcriptomic studies
2025-Jun-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103830
PMID:40382772
|
方法论文 | 本文提出了一种通过流式细胞术和单细胞转录组学分离和表征人类玻璃体免疫细胞浸润的定制方案 | 开发了包含手术改良的定制方案，以最大化人类玻璃体样本中免疫细胞的产量 | NA | 建立分离和表征玻璃体免疫细胞浸润的实验方案 | 人类玻璃体免疫细胞浸润 | 单细胞分析 | 眼科疾病 | 流式细胞术, 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 317 | 2025-10-06 |
Protocol for high-quality RNA sequencing, cell surface protein analysis, and genotyping in single cells using TARGET-seq
2025-Jun-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103832
PMID:40408252
|
研究论文 | 本文介绍了一种改进的单细胞多组学技术TARGET-seq+，可同时进行RNA测序、细胞表面蛋白分析和基因分型 | 开发了TARGET-seq+技术，提高了单细胞RNA测序的灵敏度，并首次在单细胞水平整合转录组、蛋白表达和基因分型分析 | NA | 优化单细胞多组学分析技术，以更好地研究癌前和癌变组织中的体细胞突变 | 单细胞 | 单细胞测序技术 | 癌症 | RNA测序，细胞表面蛋白分析，基因分型 | NA | RNA测序数据，蛋白表达数据，基因型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，单细胞多组学 | TARGET-seq+ | TARGET-seq+单细胞多组学分析平台 |
| 318 | 2025-10-06 |
Protocol to decipher complex spatial transcriptomics data using STMiner
2025-Jun-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103838
PMID:40411788
|
方法论文 | 介绍使用STMiner工具解析复杂空间转录组数据的标准化操作流程 | 提出无需参考数据即可适用于不同分辨率和平台的通用分析协议 | NA | 解决空间转录组数据分析中的采样不均、数据稀疏和组织边界模糊等挑战 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 319 | 2025-10-06 |
Regulation of cGAS-STING pathway with inhalable nanozyme in acute lung injury
2025-Jun-20, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本研究开发了一种可吸入的纳米酶材料，通过调节cGAS-STING通路缓解急性肺损伤 | 首次发现CAL纳米片能与受损DNA结合并有效抑制cGAS-STING通路介导的炎症反应 | NA | 开发针对急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征的新型治疗方法 | 急性肺损伤和急性呼吸窘迫综合征的病理机制 | NA | 急性肺损伤 | 转录组分析，单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell sequencing | NA | NA |
| 320 | 2025-10-06 |
Integrated Multiomics Analysis and Machine Learning Approaches in Bladder Cancer: Unveiling the Impact of Immunogenic Cell Death and Its Key Gene SLC2A3 on Prognosis and Personalized Treatment Strategies
2025-Jun-17, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c01496
PMID:40547707
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析和机器学习方法，揭示了免疫原性细胞死亡在膀胱癌中的作用，并识别出关键基因SLC2A3作为预后标志和治疗靶点 | 首次构建基于免疫原性细胞死亡的风险特征，并通过101种组合机器学习算法识别出关键基因SLC2A3在癌症相关成纤维细胞中的高表达 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的回顾性数据，需要进一步实验验证 | 探索免疫原性细胞死亡在膀胱癌中的作用机制，开发预后标志物和个性化治疗策略 | 膀胱癌患者样本和正常对照样本 | 机器学习 | 膀胱癌 | 多组学分析，单细胞测序 | 组合机器学习算法，单机器学习算法 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的膀胱癌和正常样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |