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当前共找到 721 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2025-10-06 |
Integrated transcriptome analysis and combinatorial machine learning to construct a homeostatic model of acetylation for ccRCC and validate the key gene GCNT4
2025-Jun-25, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03837-4
PMID:40563096
|
研究论文 | 通过整合转录组分析和组合机器学习构建ccRCC乙酰化稳态模型并验证关键基因GCNT4 | 首次从乙酰化角度构建ccRCC稳态模型，使用10种机器学习算法的101种组合进行预后分析，发现GCNT4通过调节O-GlcNAc修饰影响乙酰化的新机制 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多独立队列验证模型的普适性 | 探索ccRCC中乙酰化的潜在生物学机制并构建预后风险模型 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者组织和肾癌细胞 | 机器学习 | 肾癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, GSEA, 细胞实验 | LASSO+RSF组合模型, 机器学习算法组合 | RNA-seq数据, 单细胞RNA测序数据, 临床信息 | 来自TCGA、ICGC和GEO数据库的ccRCC样本 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 302 | 2025-10-06 |
Ectopic expression of GDF15 in cancer-associated fibroblasts enhances melanoma immunosuppression via the GFRAL/RET cascade
2025-Jun-24, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-011036
PMID:40555562
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研究论文 | 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞通过异位表达GDF15促进黑色素瘤免疫抑制微环境形成的分子机制 | 首次发现CAFs通过GDF15/GFRAL/RET信号级联诱导巨噬细胞M2极化和肿瘤干细胞性增强 | NA | 阐明CAFs在黑色素瘤免疫微环境中的关键作用机制 | 黑色素瘤、癌症相关成纤维细胞、巨噬细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,分子动力学模拟,免疫共沉淀,染色质免疫沉淀,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据,蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 303 | 2025-10-06 |
A novel mesothelioma molecular classification based on malignant cell differentiation
2025-Jun-24, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03816-9
PMID:40555979
|
研究论文 | 基于恶性细胞分化状态开发了一种新的间皮瘤分子分型系统和预后预测模型 | 首次基于肿瘤细胞分化状态对间皮瘤进行分子分型，识别了8种恶性细胞亚型和3种临床相关亚型 | 研究基于公共数据库数据，需要更多临床样本验证 | 建立间皮瘤的分子分型系统和预后预测模型 | 间皮瘤肿瘤细胞 | 生物信息学 | 间皮瘤 | 单细胞RNA测序，多组学分析，调控网络构建 | 降维分析，聚类分析，预测模型 | 单细胞RNA测序数据 | 来自GEO数据库的间皮瘤单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 304 | 2025-10-06 |
Molecular and genetic characterization of sex-linked orange coat color in the domestic cat
2025-Jun-23, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2025.04.055
PMID:40378841
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研究论文 | 本研究揭示了家猫性连锁橙色被毛颜色的分子遗传机制 | 首次发现性连锁橙色突变由5-kb缺失引起，导致Arhgap36基因在黑色素细胞中异位表达，并证实其通过抑制PKA催化亚基影响毛色形成 | 研究主要基于胎儿猫皮肤样本，成年猫中的机制可能需要进一步验证 | 解析家猫性连锁橙色被毛颜色的遗传和分子机制 | 家猫（特别是玳瑁猫和三花猫）的毛色形成机制 | 遗传学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 胎儿猫皮肤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 305 | 2025-10-06 |
Preclinical and first-in-human of purinostat mesylate, a novel selective HDAC I/IIb inhibitor, in relapsed/refractory multiple myeloma and lymphoma
2025-Jun-23, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02285-w
PMID:40562746
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研究论文 | 评估新型选择性HDAC I/IIb抑制剂嘌呤司他甲磺酸盐在复发/难治性多发性骨髓瘤和淋巴瘤中的临床前研究及首次人体试验 | 开发了高选择性HDAC I/IIb抑制剂，相比泛HDAC抑制剂具有更优的抗肿瘤活性和独特的免疫调节机制 | 样本量较小（N=29），需要更大规模的临床试验验证疗效 | 评估嘌呤司他甲磺酸盐在血液恶性肿瘤中的安全性和有效性 | 复发/难治性多发性骨髓瘤和淋巴瘤患者 | 肿瘤学 | 多发性骨髓瘤, 淋巴瘤 | RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据, 临床数据 | 29例患者（11例MM, 18例淋巴瘤） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 306 | 2025-10-06 |
High glucose burden disrupts the glucose responsiveness of human pancreatic beta cells encapsulated in alginate fibers during Long-Term culture
2025-Jun-20, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149639
PMID:40544971
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研究论文 | 本研究通过藻酸盐封装技术长期培养人胰岛细胞，揭示了高葡萄糖负荷破坏β细胞葡萄糖响应性的分子机制 | 首次利用藻酸盐封装技术实现人胰岛细胞长期功能维持，并通过多组学分析鉴定出导致β细胞功能障碍的关键基因 | 研究仅使用两个批次的样本，样本量有限；体外培养模型可能无法完全模拟体内环境 | 探究高葡萄糖负荷下人胰腺β细胞功能障碍的分子机制 | 藻酸盐封装的人胰岛细胞 | 细胞生物学 | 糖尿病 | RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个不同批次的培养样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 307 | 2025-10-06 |
Distinct transcriptomic signatures in pulmonary tissue resident and vascular resident-like T cells in nonhuman primates
2025-Jun-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112745
PMID:40546965
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和流式细胞术研究非人灵长类动物肺组织中血管相关T细胞与间质T细胞的转录组特征差异 | 首次在非人灵长类动物中通过血管内染色技术区分肺血管相关T细胞与间质T细胞，发现血管相关T细胞是具有独特功能的'驻留样'细胞群 | 研究样本仅限于非人灵长类动物，人类中的适用性需要进一步验证 | 探索肺组织中不同空间定位T细胞的转录组特征和免疫功能 | 恒河猴肺组织中的血管相关(ivs+)和间质(ivs-)CD8 T细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,血管内染色 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 恒河猴肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 308 | 2025-10-06 |
Spatial Transcriptomics in Thyroid Cancer: Applications, Limitations, and Future Perspectives
2025-Jun-19, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14120936
PMID:40558562
|
综述 | 本文综述了空间转录组学在甲状腺癌研究中的应用、局限性与未来展望 | 系统整合了空间转录组学在解析甲状腺癌空间异质性方面的最新应用进展 | 存在分辨率低、测序深度不足、样本质量要求高和数据处理复杂等技术局限 | 探讨空间转录组学在甲状腺癌研究中的潜力与挑战 | 甲状腺癌肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 甲状腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 309 | 2025-10-06 |
Muscle Spatial Transcriptomic Reveals Heterogeneous Profiles in Juvenile Dermatomyositis and Persistence of Abnormal Signature After Remission
2025-Jun-19, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14120939
PMID:40558566
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析揭示了幼年皮肌炎患者肌肉组织的分子特征空间异质性及其在缓解期后的持续存在 | 首次在JDM肌肉中发现ANKRD1和FSLT1等新相关基因，并揭示病理特征在临床缓解后仍持续存在 | 样本量较小，仅为初步研究 | 研究幼年皮肌炎患者治疗前后肌肉分子特征的空间异质性 | 幼年皮肌炎患者肌肉活检组织 | 空间转录组学 | 幼年皮肌炎 | 空间转录组学，标准化形态计量学 | 无监督参考解卷积 | 空间转录组数据 | 4例JDM肌肉活检（来自不同患者，包含治疗前后对比） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 310 | 2025-10-06 |
A single-cell plume transcriptome atlas of the cold-seep tubeworm Paraescarpia echinospica
2025-Jun-17, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-05392-z
PMID:40527908
|
研究论文 | 本研究构建了深海管虫Paraescarpia echinospica羽状物的单细胞转录组图谱 | 首次对深海管虫羽状物进行单细胞分辨率分析，鉴定出六种细胞类型并表征免疫和转运相关基因 | NA | 解析深海管虫羽状物的细胞组成和功能特征 | Paraescarpia echinospica管虫的羽状物组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 311 | 2025-10-06 |
Patterning Defects in Mice with Defective Ventricular Wall Maturation and Cardiomyopathy
2025-Jun-12, Journal of cardiovascular development and disease
IF:2.4Q2
DOI:10.3390/jcdd12060224
PMID:40558659
|
研究论文 | 本研究通过比较小鼠和人类胎儿心室发育过程中的基因表达模式，揭示了心室壁成熟缺陷与心肌病的关系 | 首次在小鼠LVNC模型中系统分析心室区域特异性基因表达模式的变化 | 研究仅基于小鼠模型，与人类心脏发育存在物种差异 | 探究心室壁成熟过程中基因表达的空间调控机制及其在心肌病发病中的作用 | 小鼠心室发育过程及左心室非致密化心肌病模型 | 发育生物学 | 心肌病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学,原位杂交 | NA | 基因表达数据,空间表达模式 | 正常和LVNC模型小鼠心室组织 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 312 | 2025-10-06 |
NOTCH3 Drives Fatty Acid Oxidation and Ferroptosis Resistance in Aggressive Meningiomas
2025-Jun-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6779386/v1
PMID:40502769
|
研究论文 | 本研究揭示了NOTCH3通过驱动脂肪酸氧化代谢重编程赋予侵袭性脑膜瘤细胞铁死亡抵抗性的新机制 | 首次发现NOTCH3在脑膜瘤中调控脂肪酸氧化代谢并介导铁死亡抵抗，建立了NOTCH3信号与脂质代谢重编程的直接联系 | 研究主要基于细胞系模型，需要更多体内实验验证；样本量相对有限 | 探究NOTCH3在侵袭性脑膜瘤中的代谢调控机制及其对铁死亡敏感性的影响 | 人类脑膜瘤细胞系（CH157-MN）和患者来源的原代脑膜瘤细胞 | 癌症代谢研究 | 脑膜瘤 | 单细胞RNA测序, 非靶向代谢组学, 脂质组学, 批量RNA测序, 功能性代谢分析 | 细胞系模型 | 基因表达数据, 代谢物数据, 脂质数据 | 未明确具体样本数量，包括细胞系和患者来源细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 代谢组学, 脂质组学 | NA | NA |
| 313 | 2025-10-06 |
Novel mouse model reveals neurodevelopmental origin of PMM2-CDG brain pathology
2025-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.01.657261
PMID:40501776
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研究论文 | 本研究通过构建新型小鼠模型揭示了PMM2-CDG脑部病理的神经发育起源 | 开发了能够模拟患者复合杂合致病变异的条件性基因敲除小鼠模型，克服了全身敲除导致的胚胎致死问题 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证样本有限 | 探究PMM2-CDG脑部病理的发育机制和分子基础 | PMM2-CDG疾病模型小鼠和患者尸检小脑组织 | 神经科学 | 先天性糖基化障碍 | 多组学分析，包括代谢组学、糖组学、单细胞转录组学、蛋白质组学和糖蛋白组学 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 多组学数据、行为学数据、组织学数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 314 | 2025-10-06 |
Blocking ITGA5 potentiates the efficacy of anti-PD-1 therapy on glioblastoma by remodeling tumor-associated macrophages
2025-Jun, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.70016
PMID:40084746
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研究论文 | 本研究通过阻断ITGA5增强抗PD-1疗法对胶质母细胞瘤的疗效，并揭示其通过重塑肿瘤相关巨噬细胞的机制 | 发现circSDHAF2通过N-糖基化稳定ITGA5蛋白，促进间质型胶质母细胞瘤细胞形成和SPP1+髓源性巨噬细胞分化，首次阐明ITGA5阻断可增强抗PD-1疗法疗效 | 研究主要基于临床前模型，尚未在人体临床试验中验证 | 解析胶质母细胞瘤对抗PD-1疗法耐药的分子机制，开发联合治疗策略 | 胶质母细胞瘤患者组织样本、肿瘤微环境中的细胞亚群 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫共沉淀、RNA免疫沉淀、pull-down实验 | NA | 单细胞测序数据、空间转录组数据、体外和体内实验数据 | 接受抗PD-1治疗的胶质母细胞瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 315 | 2025-10-06 |
RIDDEN: Data-driven inference of receptor activity from transcriptomic data
2025-Jun, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013188
PMID:40522999
|
研究论文 | 开发了一种名为RIDDEN的计算工具，通过受体调控的基因表达谱预测受体活性 | 首个直接关注受体端活性的计算方法，使用受体调控基因表达谱而非配体-受体共表达来推断功能活性 | NA | 从转录组数据推断受体活性，促进细胞间通讯研究 | 229种不同受体的14463个扰动基因表达谱 | 生物信息学 | 癌症 | 转录组测序 | 数据驱动推断模型 | 转录组数据 | 14463个扰动基因表达谱 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 316 | 2025-10-06 |
spCLUE: a contrastive learning approach to unified spatial transcriptomics analysis across single-slice and multi-slice data
2025-Jun-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03636-0
PMID:40551235
|
研究论文 | 提出spCLUE框架，通过对比学习方法统一分析单切片和多切片空间转录组数据 | 结合多视图图网络、对比学习、注意力机制和批次提示模块，能够同时处理对齐和未对齐样本数据 | NA | 开发空间转录组数据分析工具，整合跨组织切片数据并识别一致的空间域 | 空间转录组数据中的spots（空间位点） | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | 多视图图网络, 对比学习, 注意力机制 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 317 | 2025-10-06 |
Distal electrical stimulation enhances neuromuscular reinnervation and satellite cell differentiation for functional recovery
2025-Jun-23, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04459-3
PMID:40551270
|
研究论文 | 本研究探讨远端电刺激通过促进神经肌肉接头再生和卫星细胞分化改善神经损伤后功能恢复的机制 | 首次结合单细胞RNA测序技术揭示远端电刺激对卫星细胞基因表达的调控作用，阐明其促进肌肉再生的分子机制 | 研究仅使用大鼠模型，样本量有限，电刺激参数尚未优化 | 研究远端电刺激对神经肌肉接头再生和卫星细胞活性的调控作用 | 斯普拉格-道利大鼠坐骨神经临界缺损模型 | 神经科学 | 周围神经损伤 | 单细胞RNA测序，组织学分析，生化检测，肌电图 | 动物模型 | 基因表达数据，组织图像，生理信号 | 未明确具体数量的大鼠样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 318 | 2025-10-06 |
CellMemory: hierarchical interpretation of out-of-distribution cells using bottlenecked transformer
2025-Jun-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03638-y
PMID:40551223
|
研究论文 | 本文提出了一种名为CellMemory的瓶颈Transformer模型，用于单细胞组学中分布外细胞的分层解释 | 受认知神经科学中全局工作空间理论启发，开发了具有改进泛化能力的瓶颈Transformer，无需预训练即可优于现有单细胞基础模型 | NA | 提高单细胞组学研究中分布外细胞的解释性和准确表示 | 分布外细胞、恶性细胞及其祖细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞组学、空间转录组学 | Transformer | 单细胞组学数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 319 | 2025-10-06 |
Predicting prognosis and immunotherapy response of ferroptosis-related genes in colorectal cancer
2025-Jun-23, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-02779-x
PMID:40551269
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据识别结直肠癌中铁死亡相关基因标志物，并评估其预后价值和免疫治疗反应 | 采用空间转录组、单细胞转录组和批量转录组数据整合的多组学分析方法，区别于以往研究 | NA | 识别与结直肠癌预后和免疫反应相关的铁死亡标志物 | 结直肠癌组织和铁死亡相关基因 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 空间转录组测序,单细胞转录组测序,批量转录组测序,免疫组织化学,Kaplan-Meier生存分析,ROC曲线,Lasso分析 | 预后模型 | 转录组数据,空间转录组数据,单细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 320 | 2025-10-06 |
Exploring the causal relationship between CX3CL1 and prostate cancer prognosis using Mendelian randomization
2025-Jun-22, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03001-4
PMID:40544418
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化方法探讨CX3CL1与前列腺癌预后的因果关系 | 首次使用孟德尔随机化方法验证CX3CL1与前列腺癌风险的因果关联，并结合单细胞测序分析其在肿瘤微环境中的表达特征 | 研究人群仅限于欧洲血统个体，可能限制结果在其他人群的普适性 | 探索炎症介质在前列腺癌发展和预后中的作用 | 前列腺癌患者和健康对照人群 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 全基因组关联研究(GWAS), 孟德尔随机化, 单细胞测序, 基因表达分析, 免疫细胞浸润分析 | 孟德尔随机化模型, meta分析模型 | 基因组数据, 基因表达数据, 临床预后数据 | GWAS数据涉及21,758名欧洲血统个体；前列腺癌数据集分别包含9,132例/173,493对照、7,847例/455,163对照、6,321例/354,873对照 | UK Biobank | 全基因组关联研究, 单细胞RNA测序 | NA | NA |