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当前共找到 736 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2025-10-06 |
scRL: Utilizing Reinforcement Learning to Evaluate Fate Decisions in Single-Cell Data
2025-Jun-11, Biology
DOI:10.3390/biology14060679
PMID:40563931
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研究论文 | 提出了一种利用强化学习评估单细胞数据中命运决策的新方法scRL | 首次将强化学习应用于单细胞数据分析，通过actor-critic框架将细胞分化重新定义为潜在流形上的顺序决策过程 | NA | 解码单细胞数据中的发育逻辑，精确定位命运决策的时间和位置 | 造血过程、小鼠内分泌发生、急性髓系白血病以及基因敲除和辐射数据集 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 强化学习, actor-critic框架, 潜在狄利克雷分配 | 单细胞转录组数据 | 数十万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 302 | 2025-10-06 |
Identifying CDCA4 as a Radiotherapy Resistance-Associated Gene in Colorectal Cancer by an Integrated Bioinformatics Analysis Approach
2025-Jun-09, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16060696
PMID:40565588
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析方法鉴定CDCA4为结直肠癌放疗耐药相关基因 | 首次通过整合胚系突变、转录组数据和免疫微环境特征的系统性分析，揭示CDCA4在结直肠癌放疗耐药中的关键作用及其与B细胞浸润的关联 | 样本量相对较小（12例LARC患者），需要在更大队列中进一步验证 | 探索结直肠癌放疗耐药的遗传和分子机制 | 局部晚期直肠癌患者肿瘤样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 全外显子组测序, 转录组分析, 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 基因组数据, 转录组数据 | 12例LARC患者肿瘤样本，整合TCGA-READ、GSE150082、GSE190826和GSE132465数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 303 | 2025-10-06 |
Chromoanagenesis in Osteosarcoma
2025-Jun-07, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15060833
PMID:40563473
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综述 | 本文综述了染色体灾难现象在骨肉瘤中的作用机制及其对肿瘤进展的影响 | 系统阐述了染色体碎裂和染色体再合成等染色体灾难机制在骨肉瘤中的发生频率（高达62%）及其驱动肿瘤异质性的作用 | 针对骨肉瘤的靶向治疗仍难以实现，需要进一步研究开发有效治疗策略 | 探讨染色体灾难现象在骨肉瘤发生发展中的作用机制及潜在治疗方向 | 骨肉瘤及其相关的染色体灾难现象 | 基因组学 | 骨肉瘤 | 下一代测序，光学基因组图谱，单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 304 | 2025-10-06 |
Uridine, a Therapeutic Nucleoside, Exacerbates Alcoholic Liver Disease via SRC Kinase Activation: A Network Toxicology and Molecular Dynamics Perspective
2025-Jun-07, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26125473
PMID:40564937
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研究论文 | 本研究通过整合网络毒理学和分子动力学方法，揭示了尿苷通过激活SRC激酶加剧酒精性肝病的新机制 | 首次发现尿苷作为潜在肝毒性物质通过SRC激酶激活加重酒精性肝病，并采用多组学整合分析阐明其分子机制 | 研究主要基于计算模拟和组学数据分析，需要进一步实验验证 | 探究酒精性肝病与血液代谢物尿苷之间的因果关系和分子机制 | 酒精性肝病患者（1416例）和对照组（217,376例）的基因组数据，以及1091种血液代谢物 | 计算生物学 | 酒精性肝病 | 孟德尔随机化分析、全基因组关联研究、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟 | NA | 基因组数据、代谢组数据、单细胞转录组数据 | 1416例酒精性肝病患者和217,376例对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 305 | 2025-10-06 |
Dynamic Transcriptomic and Cellular Remodeling Underlie Cuprizone-Induced Demyelination and Endogenous Repair in the CNS
2025-Jun-06, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox14060692
PMID:40563324
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研究论文 | 本研究通过铜宗诱导的脱髓鞘模型，揭示了中枢神经系统脱髓鞘和修复过程中的动态转录组和细胞重塑机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示胶质细胞群体的动态变化及Psap-Gpr37l1信号通路上调，并系统阐明了脱髓鞘过程中血脑屏障完整性、神经免疫激活和氧化应激的时序变化 | 研究基于动物模型，结果向人类疾病的转化需要进一步验证 | 探究中枢神经系统脱髓鞘和髓鞘再生的细胞分子机制 | 铜宗处理的小鼠模型 | 神经科学 | 脱髓鞘疾病 | 单细胞RNA测序，组织学分析，免疫荧光分析，转录组分析 | NA | 基因表达数据，组织图像数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 306 | 2025-10-06 |
Angiogenesis in Atrial Fibrillation: A Literature Review
2025-Jun-06, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13061399
PMID:40564118
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综述 | 本文综述了血管生成在心房颤动发病机制中的双重作用及治疗潜力 | 系统阐述了血管生成在房颤中的双重角色——过度血管生成促进心房重构，而代偿性血管生成具有保护作用，并提出了整合单细胞测序与心脏肿瘤学原则的跨学科策略 | 临床验证仍然有限，非选择性VEGF抑制存在心血管毒性安全问题 | 阐明血管生成在房颤发病机制中的作用并探索靶向治疗策略 | 心房颤动患者及相关病理机制 | 心血管疾病研究 | 心房颤动 | 单细胞测序 | NA | 文献资料 | 全球估计2.5-3.5%人口 | NA | NA | NA | NA |
| 307 | 2025-10-06 |
Integrated Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Novel Insights into the Role of Opioid Signaling in the Pathophysiology of Inflammatory Bowel Disease
2025-Jun-06, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13061398
PMID:40564117
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示阿片信号在炎症性肠病病理生理中的新作用机制 | 首次在单细胞水平鉴定出表达高水平阿片信号相关基因的新型单核细胞亚群（OpiHi单核细胞），并发现其在IBD组织中的富集和TNF信号主导作用 | NA | 系统研究阿片信号相关基因在炎症性肠病中的作用和潜在机制 | 炎症性肠病（包括克罗恩病和溃疡性结肠炎）患者组织样本 | 单细胞组学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, CellChat分析, 转录因子活性评估 | 预测模型 | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 308 | 2025-10-06 |
Cell-surface proteomic profiling identifies CD72 as a regulator of microglial tiling
2025-Jun-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.02.657480
PMID:40501958
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研究论文 | 通过细胞表面蛋白质组分析鉴定CD72作为调节小胶质细胞平铺现象的关键分子 | 首次采用细胞表面邻近标记技术结合质谱分析，系统研究小胶质细胞表面蛋白质组，并发现CD72在调节小胶质细胞平铺中的新功能 | 研究主要基于体外模型，需要进一步在体内验证CD72的调节机制 | 探索小胶质细胞平铺现象的分子调控机制 | 小胶质细胞 | 蛋白质组学 | 神经系统疾病 | 细胞表面邻近标记, 质谱分析, 单细胞RNA测序, 磷酸化蛋白质组学 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 质谱分析 | NA | NA |
| 309 | 2025-10-06 |
Integrative Analysis of Plasma Proteomics and Transcriptomics Reveals Potential Therapeutic Targets for Psoriasis
2025-Jun-04, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13061380
PMID:40564099
|
研究论文 | 通过整合血浆蛋白质组学和转录组学分析，揭示银屑病的潜在治疗靶点 | 首次将蛋白质组范围的孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序相结合，识别出与银屑病风险相关的13种蛋白质 | 研究主要基于欧洲人群数据，需要在其他人群中验证 | 探索银屑病的潜在治疗靶点 | 银屑病患者和健康对照 | 生物信息学 | 银屑病 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 蛋白质-蛋白质相互作用, 分子对接 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据, 基因型数据 | 发现阶段：10,312例病例和397,564例对照；蛋白质数据：54,219名UK Biobank参与者，2,923种蛋白质 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 310 | 2025-10-06 |
Synthbar: A Lightweight Tool for Adding Synthetic Barcodes to Sequencing Reads
2025-Jun-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.30.657070
PMID:40502055
|
研究论文 | 开发了一个轻量级工具Synthbar，用于向测序读段添加合成条形码 | 首个能够轻松添加合成细胞条形码的工具，填补了现有工具无法处理无细胞条形码测序数据的空白 | NA | 开发计算工具以扩展单细胞测序数据分析的兼容性 | 单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | SMART单细胞RNA测序方法 | 微孔板单细胞协议，SMART单细胞RNA测序方法家族 |
| 311 | 2025-10-06 |
NOTCH1 Mutation and Survival Analysis of Tislelizumab in Advanced or Metastatic Esophageal Squamous Cell Carcinoma: A Biomarker Analysis From the Randomized, Phase III, RATIONALE-302 Trial
2025-Jun, Journal of clinical oncology : official journal of the American Society of Clinical Oncology
IF:42.1Q1
DOI:10.1200/JCO-24-01818
PMID:40179324
|
研究论文 | 本研究通过RATIONALE-302试验分析NOTCH1突变作为替雷利珠单抗治疗晚期食管鳞状细胞癌的预测生物标志物 | 首次发现NOTCH1突变与替雷利珠单抗治疗食管鳞癌的生存获益相关，并通过单细胞测序揭示其潜在分子机制 | 研究样本来源于单一临床试验，需要进一步验证 | 探索食管鳞状细胞癌抗PD-1治疗的预测生物标志物 | 晚期或转移性食管鳞状细胞癌患者 | 肿瘤基因组学 | 食管鳞状细胞癌 | 全肿瘤基因组分析,转录组测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,转录组数据 | RATIONALE-302研究样本 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 312 | 2025-10-06 |
A Temporal Single-Cell Multi-Omics Atlas of Murine Pancreatic Islet Remodeling During Hyperglycaemia Progression
2025-Jun-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.29.656754
PMID:40568114
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学技术构建了小鼠胰腺胰岛在高血糖进展过程中的细胞重塑图谱 | 首次采用纵向单细胞多组学方法系统揭示胰岛细胞在代谢压力下的动态重塑过程，发现β细胞亚群特异性调控机制 | 研究仅限于小鼠模型，人类数据仅通过数据库比对验证 | 探究肥胖诱导的胰岛素抵抗过程中胰腺胰岛细胞重塑的分子机制 | C57BL/6小鼠胰腺胰岛细胞 | 单细胞生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 高脂饮食喂养8、16、24周的C57BL/6小鼠及年龄匹配的对照组 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 313 | 2025-10-06 |
scGANSL: Graph Attention Network with Subspace Learning for scRNA-seq Data Clustering
2025-Jun-23, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.5c00731
PMID:40468846
|
研究论文 | 提出一种名为scGANSL的新型单细胞RNA测序数据聚类方法，结合图注意力网络和子空间学习 | 首次将图注意力网络与子空间学习相结合用于scRNA-seq数据聚类，采用多视图共享图自编码器和ZINB模型，并引入局部学习和自表达策略 | 未在摘要中明确说明方法的具体局限性 | 开发更有效的单细胞RNA测序数据聚类方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图注意力网络, 自编码器, ZINB模型 | 基因表达数据 | 多个scRNA-seq数据集（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 314 | 2025-10-06 |
Breaking ground: Resolving root growth on soil at the cellular level
2025-Jun-23, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.002
PMID:40555175
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示土壤环境对水稻根系细胞形态的影响机制 | 首次在单细胞水平解析土壤压实对水稻根系细胞形态的影响，发现脱落酸信号通路介导的细胞壁修饰机制 | NA | 研究土壤环境对植物根系生长发育的影响机制 | 水稻根系细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 315 | 2025-10-06 |
CD51 Promotes Gastric Cancer Stemness via Blocking Numb-Mediated Notch1 Degradation
2025-Jun-22, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217886
PMID:40555320
|
研究论文 | 本研究揭示了CD51通过阻断Numb介导的Notch1降解促进胃癌干细胞特性的机制 | 首次发现CD51通过调控Notch1受体 trafficking 从溶酶体降解转向质膜回收的新机制来增强胃癌干细胞特性 | NA | 探索CD51在胃癌干细胞特性和恶性进展中的调控作用 | 胃癌组织和细胞 | 癌症生物学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析,功能实验 | NA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | TCGA数据库胃癌组织数据,患者来源类器官和异种移植模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 316 | 2025-10-06 |
Protocol to identify proteins as regulators of gene expression noise
2025-Jun-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103763
PMID:40220303
|
研究论文 | 介绍一种识别基因表达噪声调控蛋白的实验方案 | 开发了整合单细胞RNA测序和质谱分析的数据整合方法，用于系统识别新型噪声调控蛋白 | 方案依赖于已知的调控因子-靶点相互作用数据库，可能受限于数据库的完整性 | 建立识别基因表达噪声调控蛋白的系统方法 | 细胞系中的蛋白质调控因子 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序，液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)，翻译抑制 | NA | 单细胞RNA测序数据，质谱数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，质谱分析 | NA | NA |
| 317 | 2025-10-06 |
Protocol for characterizing craniopharyngioma subtypes and their microenvironments using single-cell RNA sequencing and immunohistochemistry
2025-Jun-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103760
PMID:40238632
|
研究论文 | 本文提供了一个分析颅咽管瘤亚型及其肿瘤微环境的单细胞分辨率综合实验方案 | 开发了结合单细胞RNA测序和免疫组织化学的综合方案，用于在单细胞水平表征颅咽管瘤亚型及其微环境 | NA | 建立分析颅咽管瘤亚型和肿瘤微环境的实验方案 | 颅咽管瘤组织样本 | 数字病理学 | 颅咽管瘤 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 318 | 2025-10-06 |
Protocol for preparing fresh frozen soybean tissues for spatial transcriptomics
2025-Jun-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103790
PMID:40272979
|
研究论文 | 本文提出了一种用于空间转录组学的新鲜冷冻大豆组织制备方案 | 针对植物组织在空间转录组学应用中的组织制备难题，首次开发了专门适用于大豆新鲜冷冻组织的标准化操作流程 | NA | 解决植物组织在空间转录组学研究中的技术障碍，建立标准化的组织制备方法 | 大豆新鲜冷冻组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 319 | 2025-10-06 |
Protocol for the imputation of stimulus-induced single-cell gene expression trajectories from time-series scRNA-seq data
2025-Jun-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103811
PMID:40343799
|
研究论文 | 提出一种从时间序列单细胞RNA测序数据中估算单细胞基因表达轨迹的计算方法 | 开发了首个能够从破坏性单细胞RNA测序数据中估算单细胞基因表达动态轨迹的计算流程 | NA | 研究细胞对刺激的异质性响应动态过程 | 癌细胞对药物的响应、免疫细胞对病原体的响应 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 降维、转移概率矩阵计算、样条插值、反卷积 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 320 | 2025-10-06 |
Protocol for isolating and characterizing human vitreous immune cell infiltrates by flow cytometry and single-cell transcriptomic studies
2025-Jun-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103830
PMID:40382772
|
方法论文 | 本文提出了一种通过流式细胞术和单细胞转录组学分离和表征人类玻璃体免疫细胞浸润的定制方案 | 开发了包含手术改良的定制方案，以最大化人类玻璃体样本中免疫细胞的产量 | NA | 建立分离和表征玻璃体免疫细胞浸润的实验方案 | 人类玻璃体免疫细胞浸润 | 单细胞分析 | 眼科疾病 | 流式细胞术, 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |