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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2025-10-06 |
Direct single cell-type gene expression analysis in peripheral blood: novel ratio-based gene expression biomarkers using 2 novel monocyte reference genes (PSAP and CTSS) for detection of bacterial infection
2025-Jun-23, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaf103
PMID:40581066
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研究论文 | 开发了一种无需细胞分选的单细胞类型基因表达分析方法DIRECT LS-TA,用于检测细菌感染 | 提出了基于比例的生物标志物方法,使用PSAP和CTSS作为新型单核细胞参考基因,可直接从外周血量化单核细胞特异性基因表达 | NA | 开发无需细胞分选的单细胞类型基因表达分析方法用于细菌感染检测 | 外周血单核细胞基因表达 | 基因表达分析 | 细菌感染 | 单细胞类型基因表达分析,比例生物标志物方法 | 数学细胞混合基因表达模型 | 基因表达数据 | 多个数据集验证 | NA | 基因表达分析 | NA | NA |
| 242 | 2025-10-06 |
Plasmablast-like lymphoma cells as a distinct subpopulation confers multidrug resistance in PCNSL
2025-Jun-21, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf154
PMID:40580931
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学等技术识别了原发性中枢神经系统淋巴瘤中的浆母细胞样淋巴瘤细胞亚群,并揭示了其在多药耐药中的关键作用 | 首次在PCNSL中识别出浆母细胞样淋巴瘤细胞这一独特亚群,并阐明其通过特定分子特征导致多药耐药的机制 | 样本量相对有限(56例患者),且为观察性研究 | 探索PCNSL的分子特征和耐药机制 | 56例新诊断的原发性中枢神经系统淋巴瘤患者 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组学,B细胞受体测序,多重免疫组织化学,离体药物反应试验 | NA | 单细胞RNA测序数据,免疫组织化学图像,药物反应数据 | 56例PCNSL患者肿瘤标本 | NA | 单细胞RNA-seq,B细胞受体测序 | NA | NA |
| 243 | 2025-10-06 |
Cambridge Neoadjuvant Cancer of the Prostate (CANCAP03): A Window Study into the Effects of Olaparib ± Degarelix in Primary Prostate Cancer
2025-Jun-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-1304
PMID:40358364
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研究论文 | 本研究探讨奥拉帕尼联合或不联合地加瑞克在新诊断前列腺癌中的疗效及生物学机制 | 首次在无同源重组修复基因突变的前列腺癌患者中研究PARP抑制剂联合雄激素阻断的疗效机制 | 样本量有限,为单中心研究 | 研究PARP抑制剂和雄激素阻断联合治疗对原发性前列腺癌的生物学效应 | 前列腺癌患者 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA测序,单细胞RNA测序,免疫组化,基因测序 | NA | 组织样本,基因表达数据 | 未明确样本数量的前列腺癌患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 244 | 2025-10-06 |
Dissection of the immune landscape in psoriatic arthritis defines immunoproteasome up-regulation in treatment resistance
2025-06-06, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adu0284
PMID:40478933
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析银屑病关节炎患者滑膜液免疫图谱,发现免疫蛋白酶体上调与治疗耐药性相关 | 首次在银屑病关节炎耐药患者中发现免疫蛋白酶体和MHC I类基因表达上调,并通过功能实验验证其治疗潜力 | 样本量相对有限(41例PsA患者和9例OA对照),需要更大规模研究验证 | 探索银屑病关节炎治疗耐药性的免疫学机制 | 银屑病关节炎患者和骨关节炎对照患者的滑膜液免疫细胞 | 单细胞基因组学 | 银屑病关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 41例银屑病关节炎患者和9例骨关节炎对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 245 | 2025-10-06 |
Role of stem-like cells in chemotherapy resistance and relapse in pediatric T-cell acute lymphoblastic leukemia
2025-Jun-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61222-1
PMID:40579412
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究儿童T细胞急性淋巴细胞白血病中干细胞样细胞在化疗耐药和复发中的作用 | 首次在T-ALL中通过纵向单细胞研究鉴定出具有干细胞特征的耐药细胞亚群 | 样本量相对有限(13对匹配样本+5例非复发患者) | 探究T-ALL复发和化疗耐药的机制 | 儿童T细胞急性淋巴细胞白血病患者样本 | 单细胞测序分析 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18例样本(13对匹配诊断-复发样本+5例非复发诊断样本) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 246 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial analyses of the GDF family in tumors, with a focus on the prognostic and biological role of GDF15 in hepatocellular carcinoma
2025-Jun-27, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01431-9
PMID:40579699
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组分析GDF家族在肿瘤中的作用,重点关注GDF15在肝细胞癌中的预后和生物学功能 | 首次基于单细胞和空间转录组对GDF亚家族进行系统性泛癌分析,揭示了GDF15在肝细胞癌肿瘤微环境中的新作用机制 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证部分仅限于肝细胞癌细胞系 | 系统分析GDF亚家族在多种癌症中的表达特征及其临床意义 | 33种癌症类型,重点关注肝细胞癌 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组, 功能获得和缺失实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 细胞系实验数据 | 33种癌症类型的数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
| 247 | 2025-10-06 |
ETMR stem-like state and chemo-resistance are supported by perivascular cells at single-cell resolution
2025-Jun-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60442-9
PMID:40562749
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示胚胎性多层菊形团肿瘤的异质性及肿瘤微环境中周细胞对肿瘤干细胞状态和化疗耐药性的支持作用 | 首次在单细胞水平系统揭示ETMR肿瘤微环境中PDGFRβ周细胞通过细胞外基质相互作用支持肿瘤干细胞信号传导和化疗耐药性 | 研究主要基于模型系统,需要在更多临床样本中验证 | 探究ETMR肿瘤异质性及肿瘤微环境中的细胞通讯机制 | 人类和小鼠原代ETMR肿瘤细胞、体外培养细胞、3D前脑类器官ETMR模型 | 单细胞生物学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 空间转录组学 | 3D类器官模型 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 约250,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 248 | 2025-10-06 |
Reduction of NFX1-123 and HPV 16 E6 and E7 Decreased Telomerase and CENP-F in Cervical Cancer Cell Lines
2025-Jun-19, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17122044
PMID:40563693
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研究论文 | 本研究通过敲除NFX1-123和HPV 16 E6/E7,探讨了它们在宫颈癌细胞系中对端粒酶和CENP-F的调控作用 | 首次在HPV相关癌症中研究NFX1-123对端粒酶活性的调控作用,并发现其与HPV 16致癌基因在调控hTERT、端粒酶和CENP-F中的共同作用 | 研究仅限于宫颈癌细胞系,需要进一步在更多细胞模型和体内实验中验证 | 研究NFX1-123在HPV相关癌症中对端粒酶活性的调控机制 | 宫颈癌细胞系(CaSki和SiHa细胞)以及TCGA数据库中的宫颈癌和HPV阳性头颈癌原发肿瘤数据 | 癌症生物学 | 宫颈癌 | 基因敲除、单细胞RNA测序、基因敲低 | NA | 单细胞RNA测序数据、基因表达数据、临床数据库数据 | 宫颈癌细胞系和TCGA数据库中的原发肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 249 | 2025-10-06 |
Spatial Transcriptomics Reveals Regional and Temporal Dynamics of Gene Expression in the Mouse Brain Across Development and Aging
2025-Jun-18, Biology
DOI:10.3390/biology14060717
PMID:40563967
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析小鼠大脑在发育和衰老过程中的区域特异性基因表达动态 | 首次通过空间转录组学直接比较大脑发育与衰老的分子机制,建立了新颖的空间转录组参考数据集 | 研究仅针对三个特定时间点,可能无法完全捕捉连续的变化过程;研究局限于小鼠模型 | 探究大脑在发育和衰老过程中区域特异性基因表达的动态变化 | 小鼠大脑在不同发育阶段(P21、3月龄、28月龄)的基因表达 | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 三个关键时间点的小鼠大脑样本(P21、3月龄、28月龄) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 250 | 2025-10-06 |
Multi-omics analyses of the heterogenous immune microenvironment in triple-negative breast cancer implicate UQCRFS1 potentiates tumor progression
2025-Jun-16, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-025-00672-1
PMID:40524231
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研究论文 | 通过多组学分析揭示三阴性乳腺癌异质性免疫微环境,发现UQCRFS1促进肿瘤进展 | 首次通过单细胞RNA测序系统分析TNBC免疫微环境异质性,建立恶性细胞指数模型并验证UQCRFS1的促癌功能 | 样本量较小(仅9例初治TNBC患者),需更大队列验证 | 解析三阴性乳腺癌免疫微环境异质性及其与肿瘤进展的关系 | 三阴性乳腺癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组, 蛋白质组, qRT-PCR, 蛋白质印迹 | LASSO-Cox回归, CellChat算法, 伪时序分析 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 蛋白质组数据 | 9例初治三阴性乳腺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 251 | 2025-10-06 |
Next generation genetic screens in kinetoplastids
2025-Jun-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf515
PMID:40530689
|
综述 | 本文综述了动质体寄生虫中遗传筛选技术的发展与应用 | 探讨了将基于图像的筛选和单细胞测序技术与遗传筛选相结合的新方法 | NA | 系统理解基因组功能元件及其扰动对细胞功能的影响 | 动质体寄生虫的编码和非编码基因组区域 | 基因组学 | 寄生虫病 | 遗传筛选, CRISPR-Cas技术, 单细胞测序, 图像分析 | NA | 基因组数据, 图像数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 252 | 2025-10-06 |
Macrophage polarization, inflammatory monocytes, and impaired MDSCs are associated with murine and human immune aplastic anemia
2025-Jun-04, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiaf073
PMID:40411822
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型和人类样本探讨骨髓源性细胞在免疫性再生障碍性贫血发病机制中的作用 | 首次揭示CSF-1R抑制会加剧骨髓衰竭并促进M1巨噬细胞极化,同时发现JAK抑制剂可缓解疾病进程 | 研究样本量有限,人类样本仅针对严重AA患者 | 探索骨髓衰竭疾病中髓系细胞的免疫病理机制 | 小鼠骨髓衰竭模型和人类再生障碍性贫血患者样本 | 免疫学 | 再生障碍性贫血 | 流式细胞术, 细胞因子分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 细胞群体数据 | CByB6F1小鼠和严重AA患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 253 | 2025-10-06 |
Plin2 Coordinates Immune and Metabolic Reprogramming in Lacrimal Gland Aging
2025-Jun-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.6.79
PMID:40569117
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研究论文 | 本研究通过转录组分析和单细胞测序技术,揭示了Plin2在泪腺衰老过程中协调免疫和代谢重编程的核心调控作用 | 首次发现Plin2作为泪腺衰老的核心枢纽基因,完美区分年轻与衰老状态(AUC=1.00),并阐明其在免疫-代谢轴中的调控机制 | 研究仅限于C57BL/6小鼠模型,尚未在人类样本中验证;样本数量未明确说明 | 鉴定泪腺衰老的核心分子调控因子,阐明其在免疫失衡和代谢功能障碍中的作用 | 年轻和年老C57BL/6小鼠的泪腺组织 | 生物信息学 | 干眼症 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 机器学习 | LASSO回归, 支持向量机-递归特征消除 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 254 | 2025-10-06 |
Oral immunotherapy directs systemic transcriptomic changes in children with hen's egg allergy
2025-Jun-22, Asian Pacific journal of allergy and immunology
IF:2.3Q3
DOI:10.12932/AP-011124-1965
PMID:40544372
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析鸡蛋过敏儿童口服免疫治疗期间的系统性转录组变化 | 首次在鸡蛋过敏儿童中应用单细胞RNA测序技术揭示口服免疫治疗引起的系统性免疫细胞转录组变化 | 样本量较小(16名儿童),仅分析了治疗前后的两个时间点 | 研究鸡蛋过敏儿童的系统性免疫表型及口服免疫治疗期间的转录组变化 | 3-12岁被诊断为鸡蛋过敏的儿童 | 免疫学 | 食物过敏 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 16名鸡蛋过敏儿童 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 255 | 2025-10-06 |
scRepertoire 2: Enhanced and efficient toolkit for single-cell immune profiling
2025-Jun, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012760
PMID:40577285
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研究论文 | 介绍scRepertoire 2工具包,这是一个用于分析和可视化单细胞免疫受体数据的R软件包的重大更新 | 引入克隆型追踪、受体库多样性指标和新可视化模块等增强功能,性能优化使速度提升85.1%,内存使用减少91.9% | NA | 开发高效的单细胞免疫分析工具,促进健康和疾病状态下的免疫动态研究 | 单细胞适应性免疫受体序列数据和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 免疫相关疾病 | 单细胞适应性免疫受体测序(scAIRR-seq), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞免疫受体测序 | NA | NA |
| 256 | 2025-10-06 |
Regional differences in progenitor metabolism shape brain growth during development
2025-Jun-26, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.04.003
PMID:40300602
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研究论文 | 本研究通过单细胞分辨率的小鼠大脑发育图谱揭示了前脑与后脑神经发生的区域差异,并发现线粒体蛋白FAM210B通过调节代谢影响神经前体细胞增殖的机制 | 首次提供了小鼠大脑单细胞分辨率的发育时间图谱,揭示了区域特异性神经发生模式,并鉴定出线粒体蛋白FAM210B作为调节神经前体细胞代谢和增殖的关键因子 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的保守性需要进一步验证 | 探究哺乳动物大脑区域发育差异的分子机制 | 小鼠大脑发育过程中的神经前体细胞 | 发育神经生物学 | NA | 单细胞RNA测序,功能获得和功能缺失实验 | NA | 单细胞转录组数据,发育时间序列数据 | 小鼠大脑发育不同阶段的细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 257 | 2025-10-06 |
Advantages of cell proliferation and immune regulation in CD146+NESTIN+ HUMSCs: insights from single-cell RNA sequencing
2025-Jun-24, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxae063
PMID:39428975
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析不同胎龄人脐带间充质干细胞中CD146+NESTIN+亚群的增殖和免疫调节优势 | 首次在单细胞水平揭示早产HUMSCs中CD146+Nestin+亚群具有更高的增殖能力和免疫调节功能 | 样本量较小(仅3个供体),需要更大规模研究验证 | 探究不同胎龄HUMSCs的细胞异质性及其功能差异 | 人脐带间充质干细胞(HUMSCs)和骨髓间充质干细胞(BMSCs) | 单细胞组学 | 干细胞治疗 | 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析 | 单细胞转录组数据 | 3个不同胎龄HUMSCs供体(22+5周、28周、39周)和2个公共数据库BMSCs样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 258 | 2025-10-06 |
Heterologous prime-boost with an mRNA vaccine and an oncolytic virus enhances tumor regression through overcoming intratumoral immune suppression
2025-Jun-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115745
PMID:40411783
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研究论文 | 本研究开发了一种通过mRNA疫苗与溶瘤病毒异源初免-加强策略增强HPV相关肿瘤消退的方法 | 首次将mRNA疫苗与HSV-1溶瘤病毒结合使用,通过异源初免-加强策略协同激活系统性和肿瘤内免疫反应 | 研究基于小鼠同系肿瘤模型,尚未在人类临床试验中验证 | 开发克服肿瘤内免疫抑制的新型联合免疫疗法 | HPV相关癌症模型 | 免疫治疗 | HPV相关癌症 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | 小鼠同系肿瘤模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 259 | 2025-10-06 |
RORγt is crucial for gut homeostasis by regulating the expression of HB-EGF rather than IL-22 in activated ILC3s
2025-Jun-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115793
PMID:40478733
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了RORγt在活化ILC3细胞中的关键作用,特别是对HB-EGF表达的调控 | 发现RORγt缺失后ILC3细胞仍能产生足够IL-22维持肠道健康,但HB-EGF产生受损,这为理解RORγt功能提供了新视角 | 研究主要基于小鼠模型,人类ILC3细胞中RORγt功能是否相同尚需验证 | 阐明RORγt在3型先天淋巴样细胞(ILC3s)中的具体功能机制 | IL-22命运示踪小鼠模型中的ILC3细胞 | 免疫学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序,命运示踪技术 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 260 | 2025-10-06 |
Widespread and cell-type-specific transcriptomic reorganization following mild traumatic brain injury
2025-Jun-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115795
PMID:40478731
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研究论文 | 利用空间转录组学研究轻度创伤性脑损伤后全脑范围和细胞类型特异性的转录组重组 | 首次结合CHIMERA TBI模型和空间转录组学技术,系统揭示轻度脑损伤后跨脑区和细胞类型特异性的转录组变化模式 | 研究基于小鼠模型,结果向人类转化的适用性需进一步验证;仅关注亚急性期变化,缺乏长期随访数据 | 解析创伤性脑损伤的多尺度分子机制和细胞特异性反应 | 小鼠脑组织(特别是齿状回分子层星形胶质细胞和丘脑神经元) | 空间转录组学 | 创伤性脑损伤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 多只CHIMERA TBI模型小鼠 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |