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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-10-06 |
Chromatin accessibility module identified by single-cell sequencing underlies the diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma
2025-Jun-27, World journal of hepatology
IF:2.5Q2
DOI:10.4254/wjh.v17.i6.107329
PMID:40606924
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研究论文 | 通过单细胞测序识别染色质可及性模块,揭示其在肝细胞癌诊断和预后中的作用机制 | 首次整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据解析HCC中多层染色质调控网络,发现DGAT1作为染色质可及性核心调控基因 | 样本来源有限,功能验证主要基于体外实验,需要更多临床样本验证 | 解析多层染色质调控如何维持致癌转录和肿瘤-基质相互作用 | 肝细胞癌样本 | 单细胞多组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 批量RNA测序 | ArchR, 共可及性网络分析 | 单细胞测序数据, 批量测序数据 | 多个队列(TCGA、肝癌研究所、GSE25907) | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 222 | 2025-10-06 |
Elevated Stanniocalcin-1 Expression in Uveal Melanoma Predicts Poor Patient Prognosis
2025-Jun-26, Cancer genomics & proteomics
IF:2.6Q3
DOI:10.21873/cgp.20526
PMID:40571316
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研究论文 | 本研究探讨了STC-1在葡萄膜黑色素瘤中的表达及其与患者预后的关系 | 首次揭示了STC-1在葡萄膜黑色素瘤中的预后价值及其在肿瘤微环境中的细胞来源 | 样本量较小(阶段IV仅4例),需要进一步实验验证机制 | 评估STC-1在葡萄膜黑色素瘤中的预后意义和生物学作用 | 葡萄膜黑色素瘤患者和肿瘤组织 | 生物信息学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 转录组分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 阶段III 36例,阶段IV 4例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 223 | 2025-10-06 |
IL-1β signaling modulates T follicular helper and regulatory cells in human lymphoid tissues
2025-Jun-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.188724
PMID:40392614
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研究论文 | 本研究揭示了IL-1β信号通过调节人类淋巴组织中滤泡辅助T细胞和滤泡调节性T细胞的平衡影响自身免疫反应 | 首次在人类淋巴组织中证实IL-1β信号通过IL-1R1/IL-1R2受体比例调控Tfh/Tfr细胞分化和功能,发现具有Treg和GC-Tfh特征的独特活化Tfr亚群 | 研究主要基于体外实验和表型分析,需要进一步体内功能验证 | 阐明IL-1β信号在人类滤泡T细胞稳态调控中的作用机制 | 人类次级淋巴器官(扁桃体、脾脏和肠系膜淋巴结)中的Tfh和Tfr细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 流式细胞术、单细胞转录组学、体外培养 | NA | 细胞表型数据、基因表达数据 | 人类淋巴组织样本和自身免疫患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 224 | 2025-10-06 |
Type 2 diabetes alters quiescent pancreatic stellate cells to tumor-prone state
2025-Jun-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.187424
PMID:40548381
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了2型糖尿病如何改变静息胰腺星状细胞的亚群分布,促进胰腺导管腺癌发展 | 首次在单细胞水平鉴定出静息胰腺星状细胞中具有肿瘤免疫和血管生成促进功能的新亚群tapPafs,并发现2型糖尿病从癌前阶段就改变了这些亚群的比例 | 研究样本量相对较小,主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究2型糖尿病对静息胰腺星状细胞亚群的影响及其在胰腺癌发生中的作用 | 小鼠胰腺星状细胞和人类2型糖尿病患者的胰腺组织 | 单细胞生物学 | 胰腺癌、2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | C57BL/6J小鼠和db/db糖尿病小鼠的胰腺星状细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 225 | 2025-10-06 |
Multi-omics Analysis Reveals Molecular Subtype of Mitochondrial Oxidative Stress and Prognostic Model Development in Sepsis
2025-Jun-20, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL38957
PMID:40613299
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研究论文 | 通过多组学分析识别脓毒症中线粒体氧化应激相关基因特征并构建预后风险模型 | 首次结合WGCNA和差异表达分析识别脓毒症中线粒体氧化应激相关基因特征,并通过单细胞RNA测序和体外实验验证RNASE2的关键作用 | 数据来源于公共数据库,样本量有限,需要进一步临床验证 | 探索脓毒症中线粒体氧化应激的分子亚型并开发预后模型 | 脓毒症患者样本和正常对照样本 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, LASSO分析, Cox回归分析, ESTIMATE, ssGSEA | 预后风险模型 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库三个数据集(GSE54514, GSE65682, GSE95233)的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 226 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis reveals abnormal angiogenesis and placentation by loss of imprinted glutaminyl-peptide cyclotransferase
2025-Jun-15, Journal of Zhejiang University. Science. B
DOI:10.1631/jzus.B2400099
PMID:40571662
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示印迹基因谷氨酰肽环转移酶缺失导致胎盘血管生成异常 | 首次发现谷氨酰肽环转移酶作为新型抗血管生成因子调控小鼠胎盘发育 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证 | 探究印迹基因在胎盘血管生成和胚胎发育中的调控机制 | 谷氨酰肽环转移酶基因敲除小鼠的胎盘和胚胎组织 | 单细胞组学 | 胎盘发育异常 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,免疫组织化学 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 32,309个细胞(来自Qpct+/-和Qpct+/+小鼠胎盘) | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | NA |
| 227 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveal differences between chorionic and basal plate cytotrophoblasts and trophoblast stem cells
2025-Jun-11, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6797967/v1
PMID:40585209
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示早期妊娠胎盘绒毛细胞滋养层细胞与滋养层干细胞之间的差异 | 首次系统比较了不同孕周、不同解剖位置(基底板和绒毛膜板)的细胞滋养层细胞,并确定了滋养层干细胞的细胞起源 | 研究样本仅来自妊娠早期胎盘,未涵盖更晚期的妊娠阶段 | 探究早期妊娠胎盘细胞滋养层细胞的转录多样性与滋养层干细胞的细胞起源 | 人类早期妊娠胎盘组织(6-14周)和滋养层干细胞系 | 单细胞生物学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞术 | 轨迹推断分析 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 早期(6-8周)和晚期(12-14周)妊娠胎盘组织,3个滋养层干细胞系,6个不同滋养层干细胞系的流式验证 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | GeoMx | 单细胞RNA测序技术 |
| 228 | 2025-10-06 |
Diversity of mast cell subpopulations in the tumor microenvironment of colorectal cancer and their prognostic implications
2025-Jun-30, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04119-8
PMID:40586903
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析结直肠癌肿瘤微环境中肥大细胞亚群的异质性及其预后意义 | 首次在结直肠癌中鉴定出三个功能各异的肥大细胞亚群,并发现它们分别具有促肿瘤和抗肿瘤的不同功能特征 | 样本量相对有限,需要更大规模的研究验证 | 探索结直肠癌肿瘤微环境中肥大细胞亚群的异质性及其与预后的关系 | 结直肠癌肿瘤微环境中的肥大细胞 | 单细胞生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,生物信息学分析 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 40例结直肠癌肿瘤样本的单细胞数据,整合HMU、GEO和TCGA队列的bulk RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 229 | 2025-10-06 |
Low-dose radiotherapy enhances the efficacy of PD-L1 blockade and induces the abscopal effect
2025-Jun-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011487
PMID:40588370
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研究论文 | 本研究证明低剂量放疗联合PD-L1阻断疗法能增强免疫检查点抑制剂在远处未照射肿瘤中的疗效并诱导远隔效应 | 首次系统比较低剂量与高剂量放疗联合PD-L1阻断的疗效,并揭示肿瘤相关巨噬细胞在远隔效应中的关键作用机制 | 研究仅使用小鼠肿瘤模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探索低剂量放疗联合PD-L1阻断疗法在癌症治疗中的协同作用机制 | 免疫健全小鼠携带的MC38和CT26 murine肿瘤模型 | 癌症免疫治疗 | 癌症 | 单细胞RNA测序,肿瘤生长监测,巨噬细胞清除实验 | 动物模型 | 基因表达数据,肿瘤生长数据 | 多个小鼠肿瘤模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 230 | 2025-10-06 |
The progress and trends of the mechanism of cardiopulmonary bypass-associated acute lung injury: A narrative review
2025-Jun-27, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000043019
PMID:40587734
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综述 | 本文综述了体外循环相关急性肺损伤机制的研究进展与趋势 | 提出未来应聚焦炎症关键靶点并探索基因编辑和单细胞测序等先进技术 | 多年未取得突破性进展,导致管理策略和临床措施停滞 | 揭示体外循环相关急性肺损伤的潜在机制并寻找有效防治策略 | 心脏直视手术患者 | 医学研究 | 心血管疾病 | 基因编辑, 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 231 | 2025-10-06 |
Transcriptional landscape of pleural mesothelioma patients in relation to NF2 gene mutational status
2025-Jun-09, Journal of the Egyptian National Cancer Institute
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s43046-025-00284-0
PMID:40484892
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研究论文 | 本研究通过分析胸膜间皮瘤患者的转录组数据,探讨NF2基因突变状态对肿瘤生物学特征和免疫微环境的影响 | 首次系统揭示NF2突变在胸膜间皮瘤中通过改变免疫细胞浸润、细胞因子信号传导和化疗敏感性影响肿瘤微环境的机制 | 样本量相对有限(82例),且为回顾性分析,需要进一步实验验证 | 阐明NF2基因突变对胸膜间皮瘤肿瘤生物学行为和治疗反应的影响 | 82例胸膜间皮瘤患者肿瘤样本 | 癌症基因组学 | 胸膜间皮瘤 | RNA测序,单细胞RNA测序,生物信息学分析 | 逻辑回归模型,差异表达分析,功能富集分析 | 转录组数据,临床数据 | 82例胸膜间皮瘤病例 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 232 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing of Rabbit Sclera at Different Developmental Stages: Unveiling Scleral Cells Atlas and the Heterogeneity of Fibroblasts
2025-Jun-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.6.83
PMID:40576432
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了兔眼巩膜发育过程的细胞图谱,揭示了成纤维细胞的异质性和细胞间通讯网络 | 首次构建兔巩膜发育的单细胞转录组图谱,发现成纤维细胞亚型异质性、ECM重塑机制和跨物种保守特征 | 仅使用新西兰兔作为研究对象,样本时间点有限 | 阐明巩膜发育过程中成纤维细胞的异质性、分化轨迹和细胞间通讯 | 新西兰兔巩膜组织 | 单细胞转录组学 | 眼部疾病 | 单细胞RNA测序 | VIA, CellChat, AUCell, CACIMAR, hdWGCNA | 单细胞转录组数据 | 胚胎期25天和出生后7天、21天、180天四个发育阶段的兔巩膜组织 | BGI | 单细胞RNA测序 | BGISEQ-2000, DNBelab C Series Kit | DNBelab C系列单细胞RNA测序建库试剂盒,BGISEQ-2000测序平台 |
| 233 | 2025-10-06 |
Elevated Fcy receptor expression augments pro-inflammatory macrophage phagocytosis in systemic sclerosis and associated rheumatic diseases
2025-Jun-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keae688
PMID:39672802
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体外实验揭示了系统性硬化症及相关风湿性疾病中巨噬细胞通过高表达Fcγ受体增强吞噬活性和促炎反应的机制 | 首次在系统性硬化症中鉴定出FCGR3Ahi皮肤巨噬细胞和FCN1hi肺巨噬细胞的促吞噬表型,并证实FcγRI和FcγRII是驱动吞噬活性和IL-6炎症的关键因素 | 研究样本来源有限,主要依赖公共数据库和体外培养模型,缺乏在体功能验证 | 探究系统性硬化症及相关风湿性疾病中巨噬细胞的促吞噬表型及其分子机制 | 健康对照和系统性硬化症、类风湿关节炎、银屑病关节炎、中轴型脊柱关节炎患者的皮肤、肺组织巨噬细胞及单核源性巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 系统性硬化症及相关风湿性疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, Western blot, RT-qPCR | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 蛋白质印迹数据, 基因表达数据 | 使用公共数据集GSE138669/GSE212109,包含健康对照和SSc患者的皮肤和肺巨噬细胞;体外培养来自多种风湿病患者CD14+单核细胞分化的巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 234 | 2025-10-06 |
Lung-resident memory CD4+ T cells are dependent on Batf3
2025-Jun-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf035
PMID:40184040
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子Batf3通过促进肺驻留记忆CD4+T细胞发育来调控过敏性气道炎症的机制 | 首次发现Batf3缺陷小鼠缺乏表达Cxcr6的肺驻留CD4+T细胞亚群,并证明该转录因子对过敏原特异性CD4+记忆T细胞在肺脏积累的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;长期哮喘模型的分子机制仍需进一步探索 | 探究肺脏驻留记忆T细胞积累的细胞和分子机制 | 小鼠肺脏CD4+驻留记忆T细胞 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Batf3缺陷小鼠和对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 235 | 2025-10-06 |
CD38 ligation in sepsis promotes nicotinamide phosphoribosyltransferase-mediated IL-6 production in kidney stromal cells
2025-Jun-30, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association
DOI:10.1093/ndt/gfae269
PMID:39568061
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研究论文 | 本研究通过单细胞和单核RNA测序技术揭示了CD38连接在脓毒症中通过NAMPT信号通路促进肾脏基质细胞产生IL-6的机制 | 首次发现CD38连接通过NAMPT信号通路诱导肾脏基质细胞产生IL-6,并证实该信号通路在小鼠和人类脓毒症中具有保守性 | 研究主要基于LPS诱导的脓毒症模型,需要在其他脓毒症模型中进一步验证 | 阐明CD38连接在脓毒症中的作用机制并寻找新的治疗靶点 | 小鼠腹膜免疫细胞、肾脏组织以及人类脓毒症组织 | 单细胞测序分析 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单核RNA测序(snRNA-seq)、组织学分析 | LPS诱导的脓毒症小鼠模型 | RNA测序数据、组织学数据 | 小鼠模型和人类脓毒症组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | NA |
| 236 | 2025-10-06 |
Molecular mechanisms of diquat-induced brain injury: Insights from network toxicology and single-cell RNA sequencing
2025-Jun-30, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118597
PMID:40592154
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研究论文 | 本研究通过整合网络毒理学、单细胞RNA测序和分子对接技术,探讨了敌草快诱导脑损伤的分子机制 | 首次结合网络毒理学、单细胞RNA测序和分子对接技术系统研究敌草快脑毒性机制,识别出五个核心靶点并验证其结合亲和力 | 研究主要基于数据库预测和计算分析,缺乏实验验证 | 阐明敌草快诱导脑损伤的分子机制 | 敌草快靶向基因和脑损伤相关基因 | 生物信息学 | 脑损伤 | 网络毒理学, 单细胞RNA测序, 分子对接 | PPI网络分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 237 | 2025-10-06 |
Targeting Annexin A2 to reactivate tumor-associated antigens presentation and relieve immune tolerance in liver cancer
2025-Jun-26, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011716
PMID:40571481
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研究论文 | 本研究通过靶向膜联蛋白A2恢复肿瘤相关抗原呈递并改善肝癌免疫耐受 | 首次揭示膜联蛋白A2通过结合HSP90调控肿瘤相关抗原呈递的分子机制,并证明其可作为癌症免疫治疗的新靶点 | 研究主要聚焦于肝癌模型,在其他癌症类型中的普适性需进一步验证 | 探索肿瘤细胞通过调控抗原呈递逃逸免疫监视的分子机制及干预策略 | 肝癌细胞、CD8+ T细胞、原发性和原位移植肝癌模型 | 癌症免疫学 | 肝癌 | CRISPR-Cas9基因敲除、单细胞测序、免疫共沉淀-液相色谱-串联质谱联用 | NA | 单细胞测序数据、质谱数据、细胞实验数据 | 多种肝癌模型(化学诱导、遗传诱导、原位移植) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 238 | 2025-10-06 |
Cell-specific nanoengineering strategy to disrupt tolerogenic signaling from myeloid-derived suppressor cells and invigorate antitumor immunity in pancreatic cancer
2025-Jun-23, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04096-y
PMID:40549154
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研究论文 | 开发了一种针对胰腺癌中PMN-MDSCs的细胞特异性纳米工程策略,通过CXCR2靶向纳米颗粒递送JAK2/STAT3抑制剂,破坏免疫抑制信号并增强抗肿瘤免疫 | 首次开发了CXCR2靶向纳米颗粒,能够特异性靶向PMN-MDSCs而不影响中性粒细胞存活,避免了传统系统性抑制导致的粒细胞缺乏症 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 克服胰腺癌中髓源性抑制细胞介导的免疫抑制,增强抗肿瘤免疫反应 | 胰腺导管腺癌(PDAC)中的多形核髓源性抑制细胞(PMN-MDSCs) | 癌症免疫治疗 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,纳米工程技术 | NA | 基因表达数据,细胞成像数据,体内治疗效果数据 | 人类和小鼠PDAC样本,治疗初治PDAC患者外周血细胞,KPC小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 239 | 2025-10-06 |
Identification of conserved and tissue-restricted transcriptional profiles for lipid associated macrophages
2025-Jun-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08387-z
PMID:40550904
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析小鼠和人类多个组织中的脂质相关巨噬细胞,定义了其保守和组织特异性的转录特征 | 首次系统性地描绘了脂质相关巨噬细胞在不同组织和炎症条件下的转录组多样性,并鉴定了跨物种保守的LAM特征基因 | 研究主要基于现有单细胞RNA测序数据集,可能受限于数据质量和样本覆盖范围 | 阐明脂质相关巨噬细胞在不同组织和炎症条件下的转录组特征及其保守性 | 小鼠和人类多个组织中的脂质相关巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 代谢相关疾病(动脉粥样硬化、肥胖、代谢功能障碍相关脂肪性肝病) | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多个组织来源的小鼠和人类单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 240 | 2025-10-06 |
Spatial and genomic profiling of residual breast cancer after neoadjuvant chemotherapy unveil divergent fates for each breast cancer subtype
2025-Jun-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102164
PMID:40482645
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研究论文 | 本研究通过单细胞空间转录组学和基因组分析,揭示了新辅助化疗后残留乳腺癌在不同亚型中的不同命运机制 | 首次结合空间转录组学和基因组分析,系统揭示了不同乳腺癌亚型在新辅助化疗后残留肿瘤的异质性机制 | 研究样本量有限,需要更大规模验证;空间分析技术分辨率可能限制细胞互作机制的深入解析 | 探索新辅助化疗后残留乳腺癌的分子机制和预后差异 | 新辅助化疗后残留的乳腺癌组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞空间转录组学,基因组分析 | NA | 空间转录组数据,基因组数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |