单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 741 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-10-06 |
EZH2 inhibition and 5-azacytidine enhance antitumor immunity in PTEN-deficient glioblastoma by activation viral mimicry response
2025-Jun-13, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011650
PMID:40514071
|
研究论文 | 本研究揭示了PTEN缺陷胶质母细胞瘤通过抑制ERV-MAVS-IFN轴逃避免疫监视的机制，并发现EZH2抑制剂联合5-氮杂胞苷可恢复病毒模拟反应增强抗肿瘤免疫 | 首次阐明PTEN缺陷胶质母细胞瘤中ERV-MAVS-IFN通路失调导致免疫抑制的机制，并开发EZH2i联合5-AZA的协同治疗策略 | 研究主要聚焦于PTEN缺陷型胶质母细胞瘤，其他亚型的适用性需要进一步验证 | 探索PTEN缺陷胶质母细胞瘤免疫逃避机制并开发联合治疗策略 | PTEN缺陷胶质母细胞瘤模型及其肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、表观遗传学分析 | NA | 单细胞转录组数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 222 | 2025-10-06 |
A single-cell RNA-seq dataset of synovial fluid from rheumatoid arthritis treated with TNF-α/JAK inhibitor
2025-Jun-10, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-05339-4
PMID:40494845
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析类风湿关节炎患者滑膜液在TNF-α和JAK抑制剂治疗前后的细胞组成和分子变化 | 首次在滑膜液中进行配对的治疗前后单细胞分析，系统揭示TNF-α和JAK抑制剂对类风湿关节炎的单细胞水平影响 | 研究仅针对滑膜液样本，未包含滑膜组织分析 | 阐明TNF-α和JAK抑制剂在类风湿关节炎治疗中的作用机制，推动精准医疗发展 | 接受托法替尼或阿达木单抗治疗的类风湿关节炎患者的滑膜液样本 | 单细胞组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 100,387个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 223 | 2025-10-06 |
MitoTracer facilitates the identification of informative mitochondrial mutations for precise lineage reconstruction
2025-Jun, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013090
PMID:40549685
|
研究论文 | 开发了一种名为MitoTracer的开源计算算法，用于从单细胞测序数据中准确识别信息性线粒体突变并进行谱系重建 | 首次提出专门用于自动识别信息性线粒体突变的计算工具，在灵敏度和特异性方面优于现有方法 | NA | 解决基于线粒体突变的谱系追踪中信息性突变自动识别的关键挑战 | 单细胞RNA测序或单细胞ATAC测序样本中的线粒体突变 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 计算算法 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 224 | 2025-10-06 |
Multinucleated giant cells are hallmarks of ovarian aging with unique immune and degradation-associated molecular signatures
2025-Jun, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3003204
PMID:40550000
|
研究论文 | 本研究揭示了多核巨细胞在卵巢衰老过程中的特征及其独特的免疫和降解相关分子特征 | 首次通过先进成像技术和激光捕获显微切割定义了卵巢多核巨细胞的转录组特征，发现其形成复杂互连网络并随年龄增长 | 多核巨细胞体积较大限制了通过单细胞RNA测序等技术进行分离和分析 | 研究卵巢衰老过程中多核巨细胞的功能和分子特征 | 小鼠和非人灵长类动物的卵巢多核巨细胞 | 生物医学研究 | 卵巢衰老 | 先进成像技术、激光捕获显微切割、转录组分析 | NA | 图像数据、转录组数据 | 小鼠和非人灵长类动物卵巢样本 | NA | 转录组分析 | NA | NA |
| 225 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatiotemporal profile of ovulation in the mouse ovary
2025-Jun, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3003193
PMID:40554460
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术绘制了小鼠卵巢排卵过程的时空图谱 | 首次在单细胞分辨率下详细描绘排卵过程的精确时间窗口，揭示了卵巢细胞类型的时间依赖性转录状态和空间定位特征 | 研究仅限于小鼠模型，人类排卵过程可能存在差异 | 解析排卵过程的时空动态变化机制 | 小鼠卵巢组织 | 单细胞组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | 配对小鼠卵巢样本的排卵时间序列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 226 | 2025-10-06 |
A benchmarking study of copy number variation inference methods using single-cell RNA-sequencing data
2025-Jun, Precision clinical medicine
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/pcmedi/pbaf011
PMID:40584741
|
研究论文 | 本研究对五种单细胞RNA测序拷贝数变异推断方法进行了系统性基准测试 | 首次系统性地评估了五种常用scCNV推断方法在不同单细胞RNA测序平台上的性能表现 | 测试数据集规模有限，未涵盖所有可能的肿瘤类型和实验条件 | 评估单细胞RNA测序拷贝数变异推断方法的准确性和可靠性 | 人类肺腺癌细胞系和小细胞肺癌患者组织样本 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | HoneyBADGER, CopyKAT, CaSpER, inferCNV, sciCNV | 单细胞RNA测序数据 | 五个肺腺癌细胞系混合样本和一个小细胞肺癌患者组织样本 | 多种平台（具体未明确说明） | 单细胞RNA测序 | NA | 四种不同的单细胞RNA测序平台 |
| 227 | 2025-10-06 |
Differential cellular communication inference framework for large-scale single-cell RNA-sequencing data
2025-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf084
PMID:40585304
|
研究论文 | 提出一个可推广的计算框架scSeqCommDiff，用于从大规模单细胞转录组数据中推断和分析两种实验条件下的差异细胞通讯 | 开发了统计和网络计算方法，能够快速且内存高效地表征改变的细胞间通讯，并提供了用户友好的交互式分析工具CClens | 未明确说明框架在特定实验设计或数据类型的适用性限制 | 开发计算框架以支持大规模单细胞RNA测序数据中的差异细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据，包括细胞图谱和肌萎缩侧索硬化症患者与健康受试者的单核转录组数据 | 生物信息学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，单核转录组学 | 统计模型，网络分析方法 | 单细胞转录组数据 | 大规模数据集，包括细胞图谱 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 228 | 2025-10-06 |
Infiltrative classical monocyte-derived and SPP1 lipid-associated macrophages mediate inflammation and fibrosis in ANCA-associated glomerulonephritis
2025-Jun-30, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association
DOI:10.1093/ndt/gfae292
PMID:39694817
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示ANCA相关性肾小球肾炎中经典单核细胞来源巨噬细胞和SPP1脂质相关巨噬细胞介导炎症和纤维化的机制 | 首次在ANCA相关性肾小球肾炎中鉴定出四种主要巨噬细胞亚群，特别是发现经典单核细胞来源巨噬细胞和SPP1脂质相关巨噬细胞分别介导炎症和纤维化过程 | 样本量较小（仅5名活动期AGN患者），缺乏纵向随访数据 | 探究ANCA相关性肾小球肾炎中肾脏巨噬细胞的异质性及其在疾病发病机制中的作用 | ANCA相关性肾小球肾炎患者、狼疮性肾炎患者和肾切除对照者的肾脏CD45+免疫细胞 | 单细胞转录组学 | ANCA相关性肾小球肾炎 | 单细胞RNA测序, 免疫染色, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫组织化学数据, 流式细胞数据 | 25,485个新鲜获取的未冻存高质量肾脏CD45+免疫细胞，来自5名活动期AGN患者、1名狼疮性肾炎患者和1名肾切除对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 229 | 2025-10-06 |
Identification of key genes and development of an identifying machine learning model for sepsis
2025-Jun-30, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-025-02068-7
PMID:40583108
|
研究论文 | 通过整合多器官单细胞RNA测序和机器学习方法识别脓毒症关键基因并构建诊断模型 | 首次结合心脏和肺组织的单细胞RNA测序数据识别脓毒症关键基因，并采用支持向量机递归特征消除方法构建诊断模型 | 需要进一步研究验证发现结果，仅基于公共数据集分析 | 识别脓毒症关键基因并开发诊断模型 | 小鼠心脏和肺组织样本，人类基因同源物 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | SVM-RFE | 基因表达数据 | 5个GEO数据集（GSE207363, GSE207651, GSE185263, GSE69063, GSE134347） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 230 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing has revealed the palmitoylation landscape in lung adenocarcinoma and identified ABHD17C as a novel biomarker
2025-Jun-27, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.05.024
PMID:40582697
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了肺腺癌中的蛋白质棕榈酰化修饰景观，并鉴定出ABHD17C作为新型生物标志物 | 首次在单细胞水平系统描绘肺腺癌棕榈酰化修饰图谱，发现C4上皮亚型与肿瘤转移相关，鉴定ABHD17C为关键调控因子 | NA | 探索肺腺癌中蛋白质棕榈酰化修饰的异质性及其在肿瘤进展中的作用 | 肺腺癌上皮细胞 | 单细胞生物学 | 肺腺癌 | 单细胞测序，拷贝数变异分析，伪时间分析，富集分析，细胞间通讯分析 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 231 | 2025-10-06 |
Uncovering minimal pathways in melanoma initiation
2025-Jun-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60742-0
PMID:40571713
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了黑色素瘤起始的最小通路，发现仅携带Braf突变的裸鼠也能产生缓慢生长的肿瘤 | 发现仅Braf单突变即可诱导黑色素瘤形成，并鉴定出神经嵴样细胞作为恶性前体细胞 | 无法找到解释大多数肿瘤发生的从头突变或结构变异 | 探索黑色素瘤起始的最小遗传通路 | 小鼠黑色素瘤模型 | 癌症生物学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 232 | 2025-10-06 |
Distinct expression of CD56 and CD19 marks molecular and functional endotypes of tetanus- versus RBD-specific human bone marrow plasma cells
2025-Jun-24, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf059
PMID:40581803
|
研究论文 | 本研究通过分析CD56和CD19在人类骨髓浆细胞中的共表达模式，揭示了破伤风类毒素与SARS-CoV-2 RBD特异性浆细胞之间的分子和功能差异 | 首次发现CD56+CD19-骨髓浆细胞亚群在抗原特异性浆细胞中的差异分布，并揭示其与细胞组织滞留和长期存活的相关性 | 研究主要基于表型分析和已有单细胞RNA测序数据，缺乏功能性实验验证 | 探究不同抗原特异性骨髓浆细胞亚群的表型和转录特征差异 | 人类骨髓浆细胞，特别是破伤风类毒素和SARS-CoV-2 RBD特异性浆细胞 | 免疫学 | 传染病 | 多参数流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据, RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 233 | 2025-10-06 |
Direct single cell-type gene expression analysis in peripheral blood: novel ratio-based gene expression biomarkers using 2 novel monocyte reference genes (PSAP and CTSS) for detection of bacterial infection
2025-Jun-23, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaf103
PMID:40581066
|
研究论文 | 开发了一种无需细胞分选的单细胞类型基因表达分析方法DIRECT LS-TA，用于检测细菌感染 | 提出了基于比例的生物标志物方法，使用PSAP和CTSS作为新型单核细胞参考基因，可直接从外周血量化单核细胞特异性基因表达 | NA | 开发无需细胞分选的单细胞类型基因表达分析方法用于细菌感染检测 | 外周血单核细胞基因表达 | 基因表达分析 | 细菌感染 | 单细胞类型基因表达分析，比例生物标志物方法 | 数学细胞混合基因表达模型 | 基因表达数据 | 多个数据集验证 | NA | 基因表达分析 | NA | NA |
| 234 | 2025-10-06 |
Plasmablast-like lymphoma cells as a distinct subpopulation confers multidrug resistance in PCNSL
2025-Jun-21, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf154
PMID:40580931
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学等技术识别了原发性中枢神经系统淋巴瘤中的浆母细胞样淋巴瘤细胞亚群，并揭示了其在多药耐药中的关键作用 | 首次在PCNSL中识别出浆母细胞样淋巴瘤细胞这一独特亚群，并阐明其通过特定分子特征导致多药耐药的机制 | 样本量相对有限（56例患者），且为观察性研究 | 探索PCNSL的分子特征和耐药机制 | 56例新诊断的原发性中枢神经系统淋巴瘤患者 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组学，B细胞受体测序，多重免疫组织化学，离体药物反应试验 | NA | 单细胞RNA测序数据，免疫组织化学图像，药物反应数据 | 56例PCNSL患者肿瘤标本 | NA | 单细胞RNA-seq，B细胞受体测序 | NA | NA |
| 235 | 2025-10-06 |
Cambridge Neoadjuvant Cancer of the Prostate (CANCAP03): A Window Study into the Effects of Olaparib ± Degarelix in Primary Prostate Cancer
2025-Jun-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-1304
PMID:40358364
|
研究论文 | 本研究探讨奥拉帕尼联合或不联合地加瑞克在新诊断前列腺癌中的疗效及生物学机制 | 首次在无同源重组修复基因突变的前列腺癌患者中研究PARP抑制剂联合雄激素阻断的疗效机制 | 样本量有限，为单中心研究 | 研究PARP抑制剂和雄激素阻断联合治疗对原发性前列腺癌的生物学效应 | 前列腺癌患者 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA测序,单细胞RNA测序,免疫组化,基因测序 | NA | 组织样本,基因表达数据 | 未明确样本数量的前列腺癌患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 236 | 2025-10-06 |
Dissection of the immune landscape in psoriatic arthritis defines immunoproteasome up-regulation in treatment resistance
2025-06-06, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adu0284
PMID:40478933
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析银屑病关节炎患者滑膜液免疫图谱，发现免疫蛋白酶体上调与治疗耐药性相关 | 首次在银屑病关节炎耐药患者中发现免疫蛋白酶体和MHC I类基因表达上调，并通过功能实验验证其治疗潜力 | 样本量相对有限（41例PsA患者和9例OA对照），需要更大规模研究验证 | 探索银屑病关节炎治疗耐药性的免疫学机制 | 银屑病关节炎患者和骨关节炎对照患者的滑膜液免疫细胞 | 单细胞基因组学 | 银屑病关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 41例银屑病关节炎患者和9例骨关节炎对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 237 | 2025-10-06 |
Role of stem-like cells in chemotherapy resistance and relapse in pediatric T-cell acute lymphoblastic leukemia
2025-Jun-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61222-1
PMID:40579412
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究儿童T细胞急性淋巴细胞白血病中干细胞样细胞在化疗耐药和复发中的作用 | 首次在T-ALL中通过纵向单细胞研究鉴定出具有干细胞特征的耐药细胞亚群 | 样本量相对有限（13对匹配样本+5例非复发患者） | 探究T-ALL复发和化疗耐药的机制 | 儿童T细胞急性淋巴细胞白血病患者样本 | 单细胞测序分析 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18例样本（13对匹配诊断-复发样本+5例非复发诊断样本） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 238 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial analyses of the GDF family in tumors, with a focus on the prognostic and biological role of GDF15 in hepatocellular carcinoma
2025-Jun-27, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01431-9
PMID:40579699
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组分析GDF家族在肿瘤中的作用，重点关注GDF15在肝细胞癌中的预后和生物学功能 | 首次基于单细胞和空间转录组对GDF亚家族进行系统性泛癌分析，揭示了GDF15在肝细胞癌肿瘤微环境中的新作用机制 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分仅限于肝细胞癌细胞系 | 系统分析GDF亚家族在多种癌症中的表达特征及其临床意义 | 33种癌症类型，重点关注肝细胞癌 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组, 功能获得和缺失实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 细胞系实验数据 | 33种癌症类型的数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
| 239 | 2025-10-06 |
ETMR stem-like state and chemo-resistance are supported by perivascular cells at single-cell resolution
2025-Jun-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60442-9
PMID:40562749
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示胚胎性多层菊形团肿瘤的异质性及肿瘤微环境中周细胞对肿瘤干细胞状态和化疗耐药性的支持作用 | 首次在单细胞水平系统揭示ETMR肿瘤微环境中PDGFRβ周细胞通过细胞外基质相互作用支持肿瘤干细胞信号传导和化疗耐药性 | 研究主要基于模型系统，需要在更多临床样本中验证 | 探究ETMR肿瘤异质性及肿瘤微环境中的细胞通讯机制 | 人类和小鼠原代ETMR肿瘤细胞、体外培养细胞、3D前脑类器官ETMR模型 | 单细胞生物学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 空间转录组学 | 3D类器官模型 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 约250,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 240 | 2025-10-06 |
Reduction of NFX1-123 and HPV 16 E6 and E7 Decreased Telomerase and CENP-F in Cervical Cancer Cell Lines
2025-Jun-19, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17122044
PMID:40563693
|
研究论文 | 本研究通过敲除NFX1-123和HPV 16 E6/E7，探讨了它们在宫颈癌细胞系中对端粒酶和CENP-F的调控作用 | 首次在HPV相关癌症中研究NFX1-123对端粒酶活性的调控作用，并发现其与HPV 16致癌基因在调控hTERT、端粒酶和CENP-F中的共同作用 | 研究仅限于宫颈癌细胞系，需要进一步在更多细胞模型和体内实验中验证 | 研究NFX1-123在HPV相关癌症中对端粒酶活性的调控机制 | 宫颈癌细胞系（CaSki和SiHa细胞）以及TCGA数据库中的宫颈癌和HPV阳性头颈癌原发肿瘤数据 | 癌症生物学 | 宫颈癌 | 基因敲除、单细胞RNA测序、基因敲低 | NA | 单细胞RNA测序数据、基因表达数据、临床数据库数据 | 宫颈癌细胞系和TCGA数据库中的原发肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |