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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic insights into endosulfan-induced liver injury: Key pathways and inflammatory responses
2025-Jun, Liver research (Beijing, China)
DOI:10.1016/j.livres.2025.05.002
PMID:40620502
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示硫丹诱导肝损伤的关键通路和炎症反应机制 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示硫丹诱导肝损伤的细胞分子机制,发现肝星状细胞与CD8+ T细胞间相互作用的关键作用 | 研究仅使用小鼠模型,未在人类样本中验证;暴露时间较短(两周) | 阐明硫丹诱导肝毒性的细胞和分子机制 | C57BL/6小鼠肝脏细胞 | 单细胞组学 | 肝损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠肝脏样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 202 | 2025-10-06 |
Inference of single cell profiles from histology stains with the Single Cell omics from Histology Analysis Framework (SCHAF)
2025-Jun-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.21.533680
PMID:36993643
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研究论文 | 开发了从H&E组织学染色图像推断单细胞转录组图谱的计算框架SCHAF | 首次利用视觉变换器和对抗深度学习从常规H&E染色图像生成空间分辨的单细胞全转录组数据 | 存在一些局限性,但未在摘要中具体说明 | 从组织学染色图像推断单细胞分子图谱 | 肺癌、转移性乳腺癌、胎盘和整只小鼠幼崽等多种组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、H&E染色 | 视觉变换器、对抗深度学习 | 图像、转录组数据 | 多种组织的匹配样本 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 203 | 2025-10-06 |
Establishing the causative link between CFAP221 variants and asthenoteratozoospermia in humans
2025-Jun, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-025-03472-y
PMID:40272718
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研究论文 | 本研究通过基因测序和功能分析确定了CFAP221基因变异与人类弱畸精子症之间的因果关系 | 首次发现CFAP221基因是男性不育的新致病基因,并揭示了其在精子鞭毛发育中的关键作用 | 研究仅基于两个中国家庭的病例,样本量较小 | 探索男性不育症中弱畸精子症的遗传病因 | 两个无血缘关系的中国不育男性家庭 | 生殖医学 | 男性不育症 | 全外显子组测序,桑格测序,扫描电镜,透射电镜,免疫荧光染色,单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | 基因组数据,图像数据,转录组数据 | 2个不育患者家庭 | NA | 单细胞RNA测序,全外显子组测序 | NA | NA |
| 204 | 2025-10-06 |
Concurrent loss of the Y chromosome in cancer and T cells impacts outcome
2025-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09071-2
PMID:40468066
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研究论文 | 通过泛癌分析揭示Y染色体丢失在癌细胞和T细胞中的共存现象及其对患者预后的影响 | 首次建立免疫细胞Y染色体丢失与恶性细胞Y染色体丢失之间的关联模型,发现上皮细胞和T细胞同时发生Y染色体丢失的患者预后最差 | 研究基于回顾性数据分析,需要进一步实验验证机制 | 探究Y染色体丢失在PBMCs、免疫细胞和癌细胞之间的关系及其临床意义 | 29种人类肿瘤类型的bulk和单细胞RNA测序数据,以及自体移植和同系小鼠模型 | 癌症基因组学 | 上皮癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 29种人类肿瘤类型 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 205 | 2025-10-06 |
The NF-κB/LY6E axis promotes oral squamous cell carcinoma stemness by responding to interaction with macrophages
2025-Jun-27, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2025.114661
PMID:40582585
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研究论文 | 本研究揭示了NF-κB/LY6E信号轴通过响应巨噬细胞与口腔鳞癌细胞的相互作用促进癌症干性的机制 | 首次发现LY6E是NF-κB驱动的增强子调控基因,并阐明巨噬细胞通过TNFα激活NF-κB/LY6E轴促进口腔鳞癌干性的新机制 | 未明确LY6E在其它类型癌症干性中的作用,且临床样本验证不足 | 探索调控口腔鳞癌干性的肿瘤-免疫细胞相互作用关键信号轴 | 口腔鳞状细胞癌细胞 | 单细胞转录组学 | 口腔鳞癌 | 单细胞RNA测序 | CytoTRACE分析 | 单细胞RNA测序数据 | GEO数据库中的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 206 | 2025-10-06 |
Early multiple sclerosis activity associated with TBX21+CD21loCXCR3+ B cell expansion resembling EBV-induced phenotypes
2025-Jun-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.188543
PMID:40359016
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析发现多发性硬化症早期活动与TBX21+CD21loCXCR3+ B细胞扩增相关,其表型类似于EB病毒诱导的B细胞 | 首次将EBV相关的非典型B细胞表型与多发性硬化症早期活动相关联,并发现这类细胞具有独特的炎症因子表达特征 | 未检测到EBV直接感染非典型B细胞,且样本量相对有限 | 探讨EBV在多发性硬化症发病机制中的作用 | 早期多发性硬化症患者的外周B细胞 | 单细胞生物学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞基因表达数据,蛋白质表达数据 | 免疫耐受网络STAyCIS试验中纵向收集的早期多发性硬化症患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 207 | 2025-10-06 |
Oncogene aberrations drive medulloblastoma progression, not initiation
2025-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08973-5
PMID:40335697
|
研究论文 | 本研究利用单细胞技术揭示了髓母细胞瘤中大规模染色体畸变是早期肿瘤起始事件,而单基因致癌事件是晚期亚克隆事件 | 首次在单细胞水平揭示髓母细胞瘤中大规模染色体畸变与单基因致癌事件在肿瘤发生发展中的时序关系 | 研究样本量有限,仅针对已知MYC、MYCN和PRDM6改变的特定亚型 | 解析髓母细胞瘤肿瘤异质性和致癌基因畸变在肿瘤进化中的作用 | 3/4组髓母细胞瘤患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学 | 群体遗传学模型 | 单细胞测序数据, 空间转录组数据 | 一组已知MYC、MYCN和PRDM6改变的3/4组髓母细胞瘤队列 | NA | 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 208 | 2025-10-06 |
Chromatin accessibility module identified by single-cell sequencing underlies the diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma
2025-Jun-27, World journal of hepatology
IF:2.5Q2
DOI:10.4254/wjh.v17.i6.107329
PMID:40606924
|
研究论文 | 通过单细胞测序识别染色质可及性模块,揭示其在肝细胞癌诊断和预后中的作用机制 | 首次整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据解析HCC中多层染色质调控网络,发现DGAT1作为染色质可及性核心调控基因 | 样本来源有限,功能验证主要基于体外实验,需要更多临床样本验证 | 解析多层染色质调控如何维持致癌转录和肿瘤-基质相互作用 | 肝细胞癌样本 | 单细胞多组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 批量RNA测序 | ArchR, 共可及性网络分析 | 单细胞测序数据, 批量测序数据 | 多个队列(TCGA、肝癌研究所、GSE25907) | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 209 | 2025-10-06 |
Elevated Stanniocalcin-1 Expression in Uveal Melanoma Predicts Poor Patient Prognosis
2025-Jun-26, Cancer genomics & proteomics
IF:2.6Q3
DOI:10.21873/cgp.20526
PMID:40571316
|
研究论文 | 本研究探讨了STC-1在葡萄膜黑色素瘤中的表达及其与患者预后的关系 | 首次揭示了STC-1在葡萄膜黑色素瘤中的预后价值及其在肿瘤微环境中的细胞来源 | 样本量较小(阶段IV仅4例),需要进一步实验验证机制 | 评估STC-1在葡萄膜黑色素瘤中的预后意义和生物学作用 | 葡萄膜黑色素瘤患者和肿瘤组织 | 生物信息学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 转录组分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 阶段III 36例,阶段IV 4例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 210 | 2025-10-06 |
IL-1β signaling modulates T follicular helper and regulatory cells in human lymphoid tissues
2025-Jun-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.188724
PMID:40392614
|
研究论文 | 本研究揭示了IL-1β信号通过调节人类淋巴组织中滤泡辅助T细胞和滤泡调节性T细胞的平衡影响自身免疫反应 | 首次在人类淋巴组织中证实IL-1β信号通过IL-1R1/IL-1R2受体比例调控Tfh/Tfr细胞分化和功能,发现具有Treg和GC-Tfh特征的独特活化Tfr亚群 | 研究主要基于体外实验和表型分析,需要进一步体内功能验证 | 阐明IL-1β信号在人类滤泡T细胞稳态调控中的作用机制 | 人类次级淋巴器官(扁桃体、脾脏和肠系膜淋巴结)中的Tfh和Tfr细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 流式细胞术、单细胞转录组学、体外培养 | NA | 细胞表型数据、基因表达数据 | 人类淋巴组织样本和自身免疫患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 211 | 2025-10-06 |
Type 2 diabetes alters quiescent pancreatic stellate cells to tumor-prone state
2025-Jun-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.187424
PMID:40548381
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了2型糖尿病如何改变静息胰腺星状细胞的亚群分布,促进胰腺导管腺癌发展 | 首次在单细胞水平鉴定出静息胰腺星状细胞中具有肿瘤免疫和血管生成促进功能的新亚群tapPafs,并发现2型糖尿病从癌前阶段就改变了这些亚群的比例 | 研究样本量相对较小,主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究2型糖尿病对静息胰腺星状细胞亚群的影响及其在胰腺癌发生中的作用 | 小鼠胰腺星状细胞和人类2型糖尿病患者的胰腺组织 | 单细胞生物学 | 胰腺癌、2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | C57BL/6J小鼠和db/db糖尿病小鼠的胰腺星状细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 212 | 2025-10-06 |
Multi-omics Analysis Reveals Molecular Subtype of Mitochondrial Oxidative Stress and Prognostic Model Development in Sepsis
2025-Jun-20, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL38957
PMID:40613299
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研究论文 | 通过多组学分析识别脓毒症中线粒体氧化应激相关基因特征并构建预后风险模型 | 首次结合WGCNA和差异表达分析识别脓毒症中线粒体氧化应激相关基因特征,并通过单细胞RNA测序和体外实验验证RNASE2的关键作用 | 数据来源于公共数据库,样本量有限,需要进一步临床验证 | 探索脓毒症中线粒体氧化应激的分子亚型并开发预后模型 | 脓毒症患者样本和正常对照样本 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, LASSO分析, Cox回归分析, ESTIMATE, ssGSEA | 预后风险模型 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库三个数据集(GSE54514, GSE65682, GSE95233)的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 213 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis reveals abnormal angiogenesis and placentation by loss of imprinted glutaminyl-peptide cyclotransferase
2025-Jun-15, Journal of Zhejiang University. Science. B
DOI:10.1631/jzus.B2400099
PMID:40571662
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示印迹基因谷氨酰肽环转移酶缺失导致胎盘血管生成异常 | 首次发现谷氨酰肽环转移酶作为新型抗血管生成因子调控小鼠胎盘发育 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证 | 探究印迹基因在胎盘血管生成和胚胎发育中的调控机制 | 谷氨酰肽环转移酶基因敲除小鼠的胎盘和胚胎组织 | 单细胞组学 | 胎盘发育异常 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,免疫组织化学 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 32,309个细胞(来自Qpct+/-和Qpct+/+小鼠胎盘) | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | NA |
| 214 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveal differences between chorionic and basal plate cytotrophoblasts and trophoblast stem cells
2025-Jun-11, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6797967/v1
PMID:40585209
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示早期妊娠胎盘绒毛细胞滋养层细胞与滋养层干细胞之间的差异 | 首次系统比较了不同孕周、不同解剖位置(基底板和绒毛膜板)的细胞滋养层细胞,并确定了滋养层干细胞的细胞起源 | 研究样本仅来自妊娠早期胎盘,未涵盖更晚期的妊娠阶段 | 探究早期妊娠胎盘细胞滋养层细胞的转录多样性与滋养层干细胞的细胞起源 | 人类早期妊娠胎盘组织(6-14周)和滋养层干细胞系 | 单细胞生物学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞术 | 轨迹推断分析 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 早期(6-8周)和晚期(12-14周)妊娠胎盘组织,3个滋养层干细胞系,6个不同滋养层干细胞系的流式验证 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | GeoMx | 单细胞RNA测序技术 |
| 215 | 2025-10-06 |
Diversity of mast cell subpopulations in the tumor microenvironment of colorectal cancer and their prognostic implications
2025-Jun-30, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04119-8
PMID:40586903
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析结直肠癌肿瘤微环境中肥大细胞亚群的异质性及其预后意义 | 首次在结直肠癌中鉴定出三个功能各异的肥大细胞亚群,并发现它们分别具有促肿瘤和抗肿瘤的不同功能特征 | 样本量相对有限,需要更大规模的研究验证 | 探索结直肠癌肿瘤微环境中肥大细胞亚群的异质性及其与预后的关系 | 结直肠癌肿瘤微环境中的肥大细胞 | 单细胞生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,生物信息学分析 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 40例结直肠癌肿瘤样本的单细胞数据,整合HMU、GEO和TCGA队列的bulk RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 216 | 2025-10-06 |
Low-dose radiotherapy enhances the efficacy of PD-L1 blockade and induces the abscopal effect
2025-Jun-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011487
PMID:40588370
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研究论文 | 本研究证明低剂量放疗联合PD-L1阻断疗法能增强免疫检查点抑制剂在远处未照射肿瘤中的疗效并诱导远隔效应 | 首次系统比较低剂量与高剂量放疗联合PD-L1阻断的疗效,并揭示肿瘤相关巨噬细胞在远隔效应中的关键作用机制 | 研究仅使用小鼠肿瘤模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探索低剂量放疗联合PD-L1阻断疗法在癌症治疗中的协同作用机制 | 免疫健全小鼠携带的MC38和CT26 murine肿瘤模型 | 癌症免疫治疗 | 癌症 | 单细胞RNA测序,肿瘤生长监测,巨噬细胞清除实验 | 动物模型 | 基因表达数据,肿瘤生长数据 | 多个小鼠肿瘤模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 217 | 2025-10-06 |
Peritoneal cavity-derived GATA6+ macrophages inhibit fibrosis through IL33 in endometrium
2025-Jun-29, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.06.088
PMID:40592367
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现腹膜腔来源的GATA6+巨噬细胞通过IL33抑制子宫内膜纤维化 | 首次鉴定子宫内膜中GATA6+巨噬细胞亚群,揭示其来源于腹膜腔大腹膜巨噬细胞并通过Lars-Fos信号轴激活IL33表达抑制纤维化 | NA | 探索子宫内膜巨噬细胞亚群的来源和功能机制 | 正常子宫内膜和宫腔粘连患者的子宫内膜组织 | 单细胞生物学 | 宫腔粘连 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 218 | 2025-10-06 |
The progress and trends of the mechanism of cardiopulmonary bypass-associated acute lung injury: A narrative review
2025-Jun-27, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000043019
PMID:40587734
|
综述 | 本文综述了体外循环相关急性肺损伤机制的研究进展与趋势 | 提出未来应聚焦炎症关键靶点并探索基因编辑和单细胞测序等先进技术 | 多年未取得突破性进展,导致管理策略和临床措施停滞 | 揭示体外循环相关急性肺损伤的潜在机制并寻找有效防治策略 | 心脏直视手术患者 | 医学研究 | 心血管疾病 | 基因编辑, 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 219 | 2025-10-06 |
Transcriptional landscape of pleural mesothelioma patients in relation to NF2 gene mutational status
2025-Jun-09, Journal of the Egyptian National Cancer Institute
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s43046-025-00284-0
PMID:40484892
|
研究论文 | 本研究通过分析胸膜间皮瘤患者的转录组数据,探讨NF2基因突变状态对肿瘤生物学特征和免疫微环境的影响 | 首次系统揭示NF2突变在胸膜间皮瘤中通过改变免疫细胞浸润、细胞因子信号传导和化疗敏感性影响肿瘤微环境的机制 | 样本量相对有限(82例),且为回顾性分析,需要进一步实验验证 | 阐明NF2基因突变对胸膜间皮瘤肿瘤生物学行为和治疗反应的影响 | 82例胸膜间皮瘤患者肿瘤样本 | 癌症基因组学 | 胸膜间皮瘤 | RNA测序,单细胞RNA测序,生物信息学分析 | 逻辑回归模型,差异表达分析,功能富集分析 | 转录组数据,临床数据 | 82例胸膜间皮瘤病例 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 220 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing of Rabbit Sclera at Different Developmental Stages: Unveiling Scleral Cells Atlas and the Heterogeneity of Fibroblasts
2025-Jun-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.6.83
PMID:40576432
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了兔眼巩膜发育过程的细胞图谱,揭示了成纤维细胞的异质性和细胞间通讯网络 | 首次构建兔巩膜发育的单细胞转录组图谱,发现成纤维细胞亚型异质性、ECM重塑机制和跨物种保守特征 | 仅使用新西兰兔作为研究对象,样本时间点有限 | 阐明巩膜发育过程中成纤维细胞的异质性、分化轨迹和细胞间通讯 | 新西兰兔巩膜组织 | 单细胞转录组学 | 眼部疾病 | 单细胞RNA测序 | VIA, CellChat, AUCell, CACIMAR, hdWGCNA | 单细胞转录组数据 | 胚胎期25天和出生后7天、21天、180天四个发育阶段的兔巩膜组织 | BGI | 单细胞RNA测序 | BGISEQ-2000, DNBelab C Series Kit | DNBelab C系列单细胞RNA测序建库试剂盒,BGISEQ-2000测序平台 |