单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 721 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-10-06 |
scRNA-seq reveals transcriptional plasticity of var gene expression in Plasmodium falciparum for host immune avoidance
2025-Jun, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-025-02008-5
PMID:40379932
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示恶性疟原虫var基因表达的可塑性及其在宿主免疫逃避中的作用 | 首次在单细胞水平证明恶性疟原虫除了单等位基因var基因表达外，还能同时表达多个var基因或进入低/无表达状态 | 研究仅使用了3D7和IT4两个克隆寄生虫系，可能需要更多寄生虫株验证 | 探究恶性疟原虫var基因表达机制及其在免疫逃避中的作用 | 恶性疟原虫克隆株3D7和IT4 | 单细胞生物学 | 疟疾 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 两个克隆寄生虫系(3D7和IT4) | NA | 单细胞RNA-seq | 便携式微孔系统 | 使用富集探针和便携式微孔系统的单细胞转录组学技术 |
| 202 | 2025-10-06 |
A spatial transcriptomic atlas of the host response to oropharyngeal candidiasis
2025-Jun-30, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00849-25
PMID:40586608
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研究论文 | 利用空间转录组学技术构建宿主对口腔念珠菌病免疫反应的细胞图谱 | 首次通过空间转录组学揭示口腔念珠菌感染微环境中2型免疫反应和M2巨噬细胞的平衡作用，发现新型富含脯氨酸抗菌蛋白家族 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探索口腔念珠菌病感染环境中免疫平衡机制 | 小鼠口腔念珠菌感染模型中的舌组织 | 空间转录组学 | 口腔念珠菌病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组技术 |
| 203 | 2025-10-06 |
Protocol for deep-learning-driven cell type label transfer in single-cell RNA sequencing data
2025-Jun-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103768
PMID:40232935
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研究论文 | 介绍使用SIMS工具进行单细胞RNA测序数据中细胞类型标签转移的详细操作流程 | 提出了一个基于深度学习的标准化协议，用于单细胞RNA测序数据中的细胞类型标签转移，支持多种使用方式 | NA | 开发单细胞RNA测序数据中细胞类型标签转移的标准化操作流程 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 204 | 2025-10-06 |
Identifying condition-related cell-cell communication events using supervised tensor analysis
2025-Jun-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.15.571918
PMID:38168391
|
研究论文 | 开发了一种名为STACCato的监督张量分析工具，用于识别与生物条件相关的细胞间通讯事件 | 首次将监督张量分析方法应用于细胞间通讯研究，能够同时调整混杂因素和考虑CCC事件间的依赖关系 | 方法主要基于scRNA-seq数据，可能不适用于其他类型的数据 | 开发统计方法来识别与生物条件相关的细胞间通讯事件 | 细胞间通讯事件 | 生物信息学 | 狼疮,自闭症 | 单细胞RNA测序 | 张量回归模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 205 | 2025-10-06 |
Habitual Exercise Modulates Neuroimmune Interaction to Mitigate Aortic Stiffness
2025-Jun-06, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325656
PMID:40304034
|
研究论文 | 本研究探讨了习惯性运动通过调节神经免疫相互作用缓解血管紧张素II诱导的主动脉硬化的机制 | 首次揭示了运动通过β2-肾上腺素能受体调节巨噬细胞与交感神经的相互作用，进而抑制成纤维细胞活化和细胞外基质沉积的新机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体验证；神经免疫相互作用的详细分子通路仍需进一步阐明 | 探究运动如何调节交感神经与免疫细胞的相互作用以缓解主动脉硬化 | C57BL/6小鼠模型，包括野生型、Ccr2敲除小鼠和Col1a1-tdT报告基因小鼠 | 心血管生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色，神经化学去神经术，细胞通讯分析 | 动物模型 | 基因表达数据，蛋白质表达数据，生理测量数据 | 未明确样本数量的小鼠实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 206 | 2025-10-06 |
Mesenchymal stem/stromal cell therapy improves immune recovery in a feline model of severe coronavirus infection
2025-Jun-25, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szaf025
PMID:40659357
|
研究论文 | 评估同种异体间充质干细胞联合抗病毒治疗在猫传染性腹膜炎中的安全性和有效性 | 首次在自然发生的猫冠状病毒感染模型中证明MSC疗法能促进免疫恢复，揭示PDGF-bb在淋巴细胞恢复中的潜在作用 | 研究结束时仍存在残余细胞因子升高，样本量未明确说明 | 评估MSC疗法改善严重冠状病毒感染免疫恢复的效果 | 患有渗出性猫传染性腹膜炎的猫 | 免疫学 | 冠状病毒感染 | 单细胞RNA测序，血清细胞因子分析，主成分分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，血液学数据，细胞因子数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 207 | 2025-10-06 |
Regulatory network analysis of Dclk1 gene expression reveals a tuft cell-ILC2 axis that inhibits pancreatic tumor progression
2025-Jun-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115734
PMID:40408246
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示Dclk1基因在胰腺肿瘤中的双相调控机制及保护性簇细胞-ILC2轴 | 首次明确Dclk1+细胞在胰腺肿瘤中的异质性，发现ADM样细胞与簇样细胞的相反作用，并揭示SPIB转录因子和ILC2-CAF旁分泌环路的关键调控机制 | 研究基于小鼠模型，人类胰腺肿瘤中的适用性需进一步验证 | 解析Dclk1基因在胰腺肿瘤进展中的调控网络与细胞功能 | Dclk1报告基因小鼠模型中的胰腺细胞群体 | 单细胞生物学 | 胰腺肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 208 | 2025-10-06 |
Tumor suppressors in Sox2-mediated lung cancers promote distinct cell-intrinsic and immunologic remodeling
2025-Jun-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.171364
PMID:40327401
|
研究论文 | 本研究探讨了Trp53和Pten肿瘤抑制因子在Sox2介导的非小细胞肺癌中的协同作用机制 | 首次在Sox2高表达背景下揭示Trp53和Pten缺失对肺癌亚型分化、粘蛋白组成和免疫微环境重塑的协同调控作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床样本验证有限 | 阐明肿瘤抑制因子在Sox2介导的肺癌进展中的分子机制 | 非小细胞肺癌小鼠模型和细胞系 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，组织学分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，组织学图像 | 多种基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 209 | 2025-10-06 |
Spatial Multiomics Toward Understanding Neurological Systems
2025-Jun, Journal of mass spectrometry : JMS
IF:1.9Q2
DOI:10.1002/jms.5143
PMID:40360168
|
综述 | 本文探讨空间多组学技术在理解神经系统复杂相互作用中的应用与前景 | 提出整合代谢组学、转录组学和蛋白质组学的空间多组学方法，突破传统单组学研究的局限 | 样本制备优化、分子完整性维持和多组学数据整合仍存在挑战 | 通过空间多组学技术增强对神经系统细胞相互作用的理解 | 大脑中的动态生物过程和细胞间相互作用 | 空间多组学 | 阿尔茨海默病,自闭症谱系障碍 | 质谱成像,空间转录组学,空间蛋白质组学,多模态成像 | NA | 空间分子数据,成像数据 | NA | NA | 空间代谢组学,空间转录组学,空间蛋白质组学,多组学整合 | NA | NA |
| 210 | 2025-10-06 |
The CXCL16/CXCR6 axis is linked to immune effector cell-associated neurotoxicity in chimeric antigen receptor (CAR) T cell therapy
2025-Jun-30, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01498-6
PMID:40588764
|
研究论文 | 本研究探讨CXCL16/CXCR6轴在CAR-T细胞疗法相关神经毒性中的作用机制 | 首次发现CXCR6+细胞毒性T细胞在ICANS脑脊液中富集，并揭示CXCL16/CXCR6轴与神经毒性严重程度的相关性 | 样本量较小（n=11），且严重病例数量有限 | 阐明CAR-T细胞疗法中免疫效应细胞相关神经毒性综合征的发病机制 | 接受CAR-T细胞治疗并发生ICANS的患者外周血和脑脊液样本，以及尸检脉络丛和脑组织 | 单细胞生物学 | 神经毒性综合征 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 多模态空间转录组学, 免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像 | 11例ICANS患者（分级：1级3例，2级4例，3级1例，4级3例） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 211 | 2025-10-06 |
Identification of Prognostic Biomarkers in Gene Expression Profile of Neuroblastoma Via Machine Learning
2025-Jun, Pediatric discovery
DOI:10.1002/pdi3.70009
PMID:40666234
|
研究论文 | 通过机器学习方法识别神经母细胞瘤基因表达谱中的预后生物标志物 | 提出了一种基于网络的整合机器学习方法，结合bulk和单细胞RNA测序数据发现神经母细胞瘤预后相关生物标志物 | NA | 识别神经母细胞瘤的预后生物标志物和治疗靶点 | 神经母细胞瘤基因表达数据 | 机器学习 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | 支持向量机 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 212 | 2025-10-06 |
GPX1 and RCN1 as New Endoplasmic Reticulum Stress-Related Biomarkers in Multiple Sclerosis Brain Tissue and Their Involvement in the APP-CD74 Pathway: An Integrated Study Combining Machine Learning and Multi-Omics
2025-Jun-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26136286
PMID:40650067
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析和单细胞测序技术，鉴定出13个与多发性硬化相关的内质网应激生物标志物，并揭示了它们在APP-CD74通路中的作用机制 | 首次结合机器学习算法和多组学方法系统鉴定多发性硬化中内质网应激相关生物标志物，并发现GPX1和RCN1的诊断价值 | 研究结果仍需在更大规模的人群中验证，动物模型与人类疾病的差异可能影响结果的普适性 | 探索内质网应激相关生物标志物在多发性硬化发病机制中的作用 | 多发性硬化患者脑组织和实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠模型 | 机器学习 | 多发性硬化 | 单细胞测序,加权基因共表达网络分析,机器学习算法,孟德尔随机化分析 | 机器学习算法 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 213 | 2025-10-06 |
Identification of Potential Therapeutic Targets for Coronary Atherosclerosis from an Inflammatory Perspective Through Integrated Proteomics and Single-Cell Omics
2025-Jun-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26136201
PMID:40649979
|
研究论文 | 通过整合蛋白质组学和单细胞组学方法，从炎症角度识别冠状动脉粥样硬化的潜在治疗靶点 | 首次将蛋白质组范围的孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序相结合，从炎症角度系统识别冠状动脉粥样硬化的治疗靶点 | 研究主要基于欧洲人群数据，需要在其他人群中验证 | 识别冠状动脉粥样硬化的炎症相关蛋白治疗靶点 | 冠状动脉粥样硬化患者及相关蛋白质靶点 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | 孟德尔随机化模型 | 蛋白质组数据, 基因组数据, 单细胞转录组数据 | UK-PPP队列54,219名参与者(2,923种蛋白质), 冰岛队列35,559名参与者(4,907种蛋白质) | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 214 | 2025-10-06 |
Personalized Gut-Liver Microphysiological System Maps Donor-Specific Tissue-Resident Immunity and Reveals a Conserved Metabolic Crosstalk
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.05.652244
PMID:40667172
|
研究论文 | 构建个性化肠道-肝脏微生理系统以重现组织驻留免疫特征并揭示保守的代谢互作 | 首次建立包含自体免疫细胞的个性化多器官微生理系统，揭示代谢对话与个体免疫特征的共存关系 | 仅使用两名供者的样本，样本规模有限 | 探索组织驻留免疫的个体差异及其与代谢互作的关系 | 原代结肠上皮细胞、肝细胞和自体CD45⁺组织驻留免疫细胞 | 生物医学工程 | 免疫代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | 微生理系统 | 单细胞转录组数据 | 2名供者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 215 | 2025-10-06 |
Stiffness sensing fuels matrix-driven metabolic reboot for kidney repair and regeneration
2025-Jun-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.22.660927
PMID:40667238
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研究论文 | 本研究揭示了Mfap2通过调控细胞外基质硬度和机械信号传导，促进肾脏修复所需的代谢重编程机制 | 首次发现Mfap2作为核心基质蛋白通过Esr2-Lats1轴连接组织硬度感知与代谢重编程，为肾脏修复提供新机制 | 研究主要基于基因工程和药理学模型，临床转化潜力需进一步验证 | 探索细胞外基质驱动的肾脏修复机制 | 急性肾损伤后的肾脏修复过程 | 组织工程与再生医学 | 急性肾损伤 | 组织工程、多组学分析、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、空间转录组学 | 基因敲除模型、药理学模型 | 蛋白质组数据、转录组数据、空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学,蛋白质组学 | NA | NA |
| 216 | 2025-10-06 |
Tumor Cells Enriched for Interferon and Inflammatory Programs Pre-Exist in High Grade Serous Ovarian Cancer and are Proportionately Significantly Increased Post Chemotherapy
2025-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.24.661404
PMID:40667229
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析化疗前后高级别浆液性卵巢癌肿瘤细胞的转录组变化 | 发现化疗后显著富集表达干扰素和炎症基因特征的肿瘤细胞群，并揭示LINE1去抑制与先天免疫激活的关联 | 样本量相对较小（7对匹配肿瘤），需要更大队列验证 | 定义可逆耐药细胞的脆弱性并探索化疗对肿瘤微环境的影响 | 高级别浆液性卵巢癌患者化疗前后的肿瘤样本 | 单细胞基因组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序，多重免疫荧光成像 | NA | 单细胞转录组数据，影像数据 | 7对匹配的化疗前后肿瘤样本，>130个初治肿瘤的跨队列分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 217 | 2025-10-06 |
A spatial atlas of chemoradiation therapy in pancreatic cancer identifies cellular and microenvironmental determinants of persister populations
2025-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.20.660757
PMID:40667350
|
研究论文 | 本研究构建了胰腺癌放化疗的空间图谱，揭示了耐受性细胞群体的细胞和微环境决定因素 | 开发了新型统计方法SpaCCI解析空间细胞互作，首次发现CXCL12/TGFβ驱动的耐受细胞生态位及其对铁死亡和铜死亡途径的抵抗机制 | 样本量相对有限（50例患者样本），空间转录组数据存在细胞类型混合的技术局限 | 阐明胰腺导管腺癌对放疗的适应性机制和细胞间相互作用 | 胰腺导管腺癌患者样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | SpaCCI统计模型 | 转录组数据, 空间数据 | 50例患者样本（16例纵向匹配单细胞RNA测序，34例空间转录组样本） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 218 | 2025-10-06 |
The transcriptome of playfulness is sex biased in the juvenile rat medial amygdala: A role for inhibitory neurons
2025-Jun-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115782
PMID:40478737
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索了幼年大鼠内侧杏仁核中游戏行为的性别差异转录组特征 | 首次揭示了游戏行为相关转录组在内侧杏仁核中的性别特异性表达模式，并确定抑制性神经元是驱动这种性别差异的关键细胞类型 | 研究仅针对大鼠模型，结果在其他物种中的普适性需要进一步验证 | 探索游戏行为在内侧杏仁核中的分子机制和性别差异基础 | 幼年大鼠的内侧杏仁核组织 | 神经科学, 转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 整合生物信息学分析 | NA | 转录组数据 | 新生和幼年大鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 219 | 2025-10-06 |
Immunosuppressive Tumor Microenvironment of Osteosarcoma
2025-Jun-24, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17132117
PMID:40647416
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析骨肉瘤的免疫微环境特征 | 首次在骨肉瘤中系统鉴定免疫抑制细胞群体并揭示MDSCs通过NF-κB通路促进免疫抑制微环境的机制 | 样本量较小（12个单细胞RNA测序样本），需要更大队列验证 | 解析骨肉瘤免疫微环境的组成和功能 | 骨肉瘤肿瘤活检样本 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 细胞-细胞通讯模型 | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | 12个骨肉瘤活检样本（6个新测序+6个已发表） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 220 | 2025-10-06 |
Developmental Plasticity and Stromal Co-option Shape a Pituitary Neuroendocrine Tumor Transcriptional Continuum
2025-Jun-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.18.659743
PMID:40666832
|
研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学解析垂体神经内分泌肿瘤的发育可塑性和微环境相互作用 | 发现垂体神经内分泌肿瘤存在跨越亚型的转录连续谱，挑战传统离散分类；揭示肿瘤细胞共用了正常成体神经内分泌细胞的细胞通讯网络 | 样本来源仅限于人类正常垂体和垂体神经内分泌肿瘤，未涉及其他物种或更广泛的肿瘤类型 | 解析垂体神经内分泌肿瘤的细胞起源、分子异质性和微环境相互作用 | 人类正常垂体和垂体神经内分泌肿瘤组织 | 数字病理学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 419,874个细胞 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |