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当前共找到 721 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Unveils Key Regulators and Signaling Pathways in Lung Adenocarcinoma Progression
2025-Jun-30, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13071606
PMID:40722679
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肺腺癌进展中的关键调控因子和信号通路 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘肺腺癌进展过程中上皮细胞特异性转录程序及肿瘤微环境内细胞间通讯的动态变化 | 研究基于多个患者队列但样本量有限，且未进行功能验证实验 | 解析肺腺癌进展过程中的细胞特异性转录调控机制和肿瘤微环境动态变化 | 肺腺癌患者肿瘤组织中的上皮细胞、免疫细胞和基质细胞 | 单细胞组学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析、谱系轨迹分析、转录调控网络重建 | 单细胞转录组数据 | 多个肺腺癌患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 182 | 2025-10-06 |
Dissecting the Cellular Heterogeneity Underlying Liver Diseases Through the Integration of GWASs and Single-Cell RNA Sequencing
2025-Jun-27, Biology
DOI:10.3390/biology14070777
PMID:40723338
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研究论文 | 通过整合GWAS和单细胞RNA测序技术解析肝脏疾病的细胞异质性 | 首次将六种肝脏疾病的GWAS数据与约16.8万个人类肝细胞的单细胞转录组数据整合，使用scDRS方法揭示疾病相关遗传信号在非实质细胞中的特异性分布 | 研究主要关注遗传风险与细胞状态的关联，未涉及功能验证实验 | 解析肝脏疾病遗传风险的细胞特异性机制 | 人类肝脏细胞 | 生物信息学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序, GWAS | scDRS | 基因组数据, 转录组数据 | 约168,000个肝细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 183 | 2025-10-06 |
Integrating Bulk RNA and Single-Cell Sequencing Data Reveals Genes Related to Energy Metabolism and Efferocytosis in Lumbar Disc Herniation
2025-Jun-24, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13071536
PMID:40722613
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研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA和单细胞测序数据，识别了与腰椎间盘突出症中能量代谢和胞葬作用相关的关键基因 | 首次将能量代谢和胞葬作用相关基因整合分析，并通过机器学习方法识别出6个关键枢纽基因 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 探索腰椎间盘突出症的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 腰椎间盘突出症患者的基因表达数据 | 生物信息学 | 腰椎间盘突出症 | RNA测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR | 机器学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 184 | 2025-10-06 |
scQTLtools: An R/Bioconductor Package for Comprehensive Identification and Visualization of Single-Cell eQTLs
2025-Jun-23, Biology
DOI:10.3390/biology14070743
PMID:40723304
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研究论文 | 开发了一个用于单细胞eQTL分析的综合R/Bioconductor软件包 | 提供端到端的单细胞eQTL分析流程，支持多种输入格式和统计模型，能够识别细胞类型特异性调控变异 | 目前仅支持顺式eQTL分析，尚未包含反式eQTL检测功能 | 开发一个功能全面、可扩展且用户友好的单细胞eQTL分析工具 | 单细胞RNA测序数据和基因型数据 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 线性回归、泊松回归、零膨胀负二项回归 | 基因表达数据、基因型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 185 | 2025-10-06 |
Pig meniscus single-cell sequencing reveals highly active red zone chondrocyte populations involved in stemness maintenance and vascularization development
2025-Jun-18, Journal of Zhejiang University. Science. B
DOI:10.1631/jzus.B2400388
PMID:40722245
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研究论文 | 通过猪半月板单细胞测序揭示了具有高度活性的红区软骨细胞亚群在干细胞特性维持和血管化发育中的作用 | 首次构建猪半月板单细胞转录组图谱，发现红区特异性软骨细胞亚群具有间充质干细胞特性和血管化诱导能力 | 研究基于猪模型，虽然与人类具有可比性但仍需进一步验证 | 探索半月板细胞组成特征及红区软骨细胞的生物学功能 | 猪半月板组织 | 单细胞组学 | 骨科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 186 | 2025-10-06 |
Spatial Proofreading Amplification of in situ Transcript and Protein Signals
2025-Jun-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.11.659176
PMID:40661487
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研究论文 | 本文提出了一种受动力学校对原理启发的无酶信号放大方法，用于增强空间转录组学中的原位转录本和蛋白质信号 | 首次将动力学校对原理应用于信号放大，通过短寡核苷酸探针在靶位点的迭代沉积和光交联形成高度稳定的DNA组装体 | NA | 开发更明亮的信号放大方法以提高空间转录组学实验的检测效率和缩短成像时间 | 原位转录本和蛋白质信号 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，信号放大技术 | NA | 图像信号 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 187 | 2025-10-06 |
Uncovering Heterogeneous Effects via Localized Feature Selection
2025-Jun-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.03.657761
PMID:40661389
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研究论文 | 提出一种利用局部化特征选择方法识别疾病相关特征的创新框架 | 开发了基于局部化检验统计量的特征选择框架，能够针对个体特征识别疾病相关特征，并利用knockoffs方法控制选择集的噪声水平 | 未明确说明方法在更大规模数据集上的可扩展性和计算效率 | 开发能够识别个体层面异质性的疾病相关特征选择方法 | 阿尔茨海默病的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 局部化特征选择框架 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 188 | 2025-10-06 |
Genetic and genomic insights into male reproductive tract development
2025-Jun, Fertility and sterility
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.fertnstert.2025.03.024
PMID:40174856
|
综述 | 通过遗传和基因组学方法探讨男性生殖道发育机制的研究综述 | 整合单细胞测序数据构建发育图谱，首次系统识别269个MRT相关基因及其在关键发育阶段的表达模式 | 人类与小鼠模型表型术语存在差异，知识体系需要进一步统一 | 解析男性生殖道发育的遗传基础及其与成年疾病的关系 | 男性生殖道发育相关基因与细胞类型 | 基因组学 | 男性生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序, 空间分子测量 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 人类表型本体35个术语对应269个基因，含小鼠对比数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 189 | 2025-10-06 |
Applications of Spatial Transcriptomics in Veterinary Medicine: A Scoping Review of Research, Diagnostics, and Treatment Strategies
2025-Jun-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26136163
PMID:40649940
|
综述 | 本文对空间转录组学在兽医医学中的应用进行了范围综述，涵盖研究、诊断和治疗策略 | 首次系统梳理空间转录组学在兽医医学中的应用现状，识别研究空白和未来方向 | 兽医医学领域的代表性有限，存在疾病、物种、器官和地理偏见 | 评估空间转录组学在人类和动物健康研究、诊断和治疗中的应用现状 | 1398项符合纳入标准的研究，涵盖人类和动物健康研究 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 1398项研究 | 10x Genomics, Nanostring | 空间转录组学 | 10x Visium, Slide-seq, GeoMx, CosMX | 10x Visium空间转录组平台，Nanostring GeoMx和CosMX平台，MERFISH技术 |
| 190 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics yield insights into the stress-immune interplay and inform disease risk
2025-Jun-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.05.658150
PMID:40661381
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学研究应激激素对免疫细胞的调控机制及其与疾病风险的关联 | 首次在单细胞分辨率下揭示生理水平应激激素诱导的细胞类型特异性转录组变化，并发现可用于区分应激相关疾病的分子特征 | 使用体外模型可能无法完全模拟体内复杂的应激环境 | 探究应激激素在单细胞水平对免疫功能的调控机制及其与疾病风险的关联 | 原代外周血单个核细胞和中性粒细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病, 精神疾病, 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两个独立人类队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 191 | 2025-10-06 |
Cell simulation as cell segmentation
2025-Jun, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02697-0
PMID:40404994
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为Proseg的概率分割方法，通过细胞模拟技术改进单细胞空间转录组数据的细胞分割精度 | 采用从头细胞模拟方法推断形态学上合理的细胞边界，在多个商业平台上表现出优越性能和计算效率 | NA | 提高单细胞空间转录组数据中细胞分割的准确性 | 肾细胞癌患者样本中的肿瘤浸润免疫细胞（中性粒细胞和T细胞） | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞空间转录组学 | 概率分割模型 | 空间转录组数据 | NA | 多个商业平台（具体未指明） | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 192 | 2025-10-06 |
CDKN1A as a potential target for Eltrombopag treatment in ITP and its regulation of the communication between macrophages and transitional B cells in ITP
2025-Jun, Annals of hematology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s00277-025-06436-5
PMID:40515824
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，发现CDKN1A是影响ITP患者对Eltrombopag治疗反应的关键基因，并揭示了其在巨噬细胞与过渡B细胞通讯中的作用 | 首次发现CDKN1A作为Eltrombopag治疗ITP的关键调控因子，揭示了巨噬细胞通过TGFβ信号通路与过渡B细胞通讯的新机制 | 研究主要基于细胞系实验和生物信息学分析，需要进一步在临床样本中验证 | 鉴定ITP患者对Eltrombopag治疗反应的新型生物标志物，研究巨噬细胞和过渡B细胞在ITP发病机制中的作用 | 免疫性血小板减少症(ITP)患者、RAW264.7巨噬细胞系 | 生物信息学 | 免疫性血小板减少症 | 单细胞RNA-seq、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、分子对接、siRNA敲低、质粒过表达 | Seurat | 基因表达数据、单细胞测序数据 | GSE112278和GSE196676数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 193 | 2025-10-06 |
Transcriptomic analysis reveals novel targets in benign schwannoma using machine learning
2025-Jun-21, Neuroscience
IF:2.9Q2
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研究论文 | 本研究通过机器学习辅助的转录组和单细胞分析识别良性神经鞘瘤的关键免疫相关生物标志物，并构建疾病评估预测模型 | 首次识别出ANGPTL1、IL17RC、LTBR、OLR1和TGFBR1五个新型免疫相关生物标志物在良性神经鞘瘤中的功能作用 | 预测模型的曲线下面积仅为0.67，模型性能有待进一步提升 | 识别良性神经鞘瘤的关键免疫相关生物标志物并构建疾病评估预测模型 | 良性神经鞘瘤患者转录组数据和NF2基因敲除小鼠模型 | 机器学习 | 神经鞘瘤 | 转录组分析,单细胞RNA测序 | LASSO,SVM,Random Forest | 转录组数据 | GSE108524数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 194 | 2025-10-06 |
Leveraging hypoxia-related genes signature for predicting the prognosis of bladder cancer
2025-Jun-30, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-2025-118
PMID:40687655
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研究论文 | 本研究开发了一种基于缺氧相关基因的膀胱癌预后风险预测模型 | 构建了包含JUN、MYC、EGFR和SLC2A1四个基因的新型预后风险模型，并首次结合单细胞测序数据分析基因在膀胱癌发育轨迹中的表达变化 | 研究样本量有限，需要更大规模的前瞻性研究验证模型的临床适用性 | 探索缺氧相关基因在膀胱癌中的功能作用并建立预后预测模型 | 膀胱癌患者 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单样本基因集富集分析(ssGSEA)、实时定量PCR(qRT-PCR)、单细胞测序 | 预后风险模型 | 基因表达数据、临床数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 195 | 2025-10-06 |
MHCIIhiLYVE1loCCR2hi Interstitial Macrophages Promote Medial Fibrosis in Pulmonary Arterioles and Contribute to Pulmonary Hypertension
2025-Jun-20, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326173
PMID:40357547
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研究论文 | 本研究揭示了MHCIIhiLYVE1loCCR2hi间质巨噬细胞通过WNT11/PCP通路促进肺动脉中膜纤维化并导致肺动脉高压的机制 | 首次鉴定出MHCIIhiLYVE1loCCR2hi间质巨噬细胞亚群在肺动脉中膜纤维化中的关键作用，并阐明其通过WNT11/平面细胞极性通路促进肺动脉平滑肌细胞向成纤维细胞样表型转化的分子机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，人类样本验证相对有限，且未涉及其他肺动脉高压亚型的验证 | 探究间质巨噬细胞浸润与肺动脉纤维化在肺动脉高压中的关联机制 | 特发性肺动脉高压患者肺组织样本、实验性肺动脉高压动物模型、间质巨噬细胞和肺动脉平滑肌细胞 | 病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序,谱系追踪,组织学分析,细胞共培养,转基因动物实验 | NA | 基因表达数据,组织图像数据,细胞表型数据 | 特发性肺动脉高压患者和实验动物肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 196 | 2025-10-06 |
Deficient FANCL Predisposes Endothelial Damage: A New Therapeutic Target for Pulmonary Hypertension
2025-Jun-06, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202408-1655OC
PMID:40479584
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研究论文 | 本研究揭示了FANCL缺陷通过导致内皮细胞DNA损伤和BMP/TGF-β信号通路失衡促进肺动脉高压(PAH)的机制 | 首次发现FANCL缺陷可自发诱发PAH，并证明靶向修复FANCL可成为PAH治疗新策略 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，临床转化需进一步验证 | 阐明FA通路、DNA损伤与PAH之间的相互作用机制 | FANCL基因敲除小鼠、PAH患者肺标本和肺动脉内皮细胞、原代培养肺微血管内皮细胞 | 分子病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序、基因敲除、腺相关病毒基因过表达、转录组分析 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 患者肺标本和内皮细胞、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 197 | 2025-10-06 |
A single-cell spatial chart of the airway wall reveals proinflammatory cellular ecosystems and their interactions in health and asthma
2025-Jun, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02161-3
PMID:40399607
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研究论文 | 本研究应用单细胞空间转录组学揭示了健康与哮喘状态下气道壁的细胞空间分布图谱，发现了促炎性细胞生态系统及其相互作用 | 首次绘制了气道壁的单细胞空间图谱，揭示了健康与哮喘中存在于特定空间微环境中的促炎性细胞生态系统及其独特机制 | NA | 揭示气道壁在健康和哮喘状态下的细胞空间组织特征及促炎性细胞生态系统的相互作用机制 | 健康与哮喘患者的气道壁组织样本 | 空间转录组学 | 哮喘 | 单细胞空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 198 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analyses reveal the mechanism of mitochondrial activity in erectile dysfunction
2025-Jun, Sexual medicine
IF:2.6Q2
DOI:10.1093/sexmed/qfaf049
PMID:40689149
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示线粒体活性在勃起功能障碍中的机制 | 首次在单细胞水平系统表征ED的细胞景观，发现成纤维细胞和内皮细胞中线粒体异质性与ED的关联 | 样本代表性有限且缺乏直接实验验证 | 研究线粒体功能对细胞异质性的影响 | 勃起功能障碍患者样本 | 单细胞组学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 64,993个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 199 | 2025-10-06 |
Iterative transcription factor screening enables rapid generation of microglia-like cells from human iPSC
2025-Jun-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59596-3
PMID:40494892
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研究论文 | 开发了一种迭代高通量单细胞转录因子筛选方法，用于快速将人类iPSC分化为小胶质细胞样细胞 | 提出迭代转录因子筛选方法，可在4天内通过六个转录因子将iPSC分化为小胶质细胞样细胞，并开发了新的计算方法构建基因调控网络 | NA | 开发高效的人类iPSC向特定细胞类型分化的方法 | 人类诱导多能干细胞(iPSC)和小胶质细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，转录因子扰动实验 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 200 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis of Host Responses in Bovine Milk Somatic Cells (bMSCs) Following HPAIV Bovine H5N1 Influenza Exposure
2025-06-03, Viruses
DOI:10.3390/v17060811
PMID:40573402
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析牛乳体细胞在H5N1禽流感病毒暴露后的宿主免疫反应 | 首次对H5N1病毒暴露的牛乳体细胞进行单细胞分析，揭示了乳腺免疫反应向2型免疫转变的动态特征 | 单细胞测序数据中未检测到病毒读数，免疫反应可能仅源于病毒成分暴露而非生产性感染 | 理解牛乳腺对H5N1病毒暴露的宿主免疫反应机制 | 体外暴露于H5N1病毒的牛乳体细胞(bMSCs) | 单细胞组学 | 禽流感 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |