单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
181	2025-07-04	Spatial Transcriptome Analysis of B7-H4 in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma: A Novel Therapeutic Target for Anti-Immune Checkpoint Inhibitors 2025-Jun-30, Head and neck pathology DOI:10.1007/s12105-025-01815-w PMID:40586978	研究论文	本研究通过免疫组化和空间转录组学分析，探讨了B7-H4在头颈部鳞状细胞癌中的治疗潜力	发现B7-H4与PD-L1在肿瘤细胞中呈现互斥表达模式，并证实B7-H4与低CD8+ T细胞浸润显著相关	样本量较小（空间转录组学仅分析6例HNSCC），且未进行功能验证实验	探索头颈部鳞状细胞癌中B7-H4作为免疫检查点抑制剂耐药治疗靶点的潜力	头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）组织样本	数字病理学	头颈部鳞状细胞癌	免疫组化（IHC）、空间转录组学（ST）	NA	组织微阵列图像、空间转录组数据	94例HNSCC、94例相邻鳞状上皮内瘤变、69例正常口腔黏膜（IHC）；6例HNSCC及其配对的瘤变和正常组织（ST）
182	2025-07-04	Low-dose radiotherapy enhances the efficacy of PD-L1 blockade and induces the abscopal effect 2025-Jun-30, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2025-011487 PMID:40588370	research paper	该研究探讨了低剂量放疗（RT）如何增强PD-L1阻断的疗效并诱导远隔效应	研究发现低剂量RT与抗PD-L1联合治疗在远隔未照射肿瘤中产生与高剂量RT相当的远隔效应，并揭示了肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）在此过程中的关键作用	研究仅在免疫健全小鼠模型中进行，尚未在人类临床试验中验证	探索低剂量RT与免疫检查点抑制剂联合治疗在癌症治疗中的优化策略	携带MC38或CT26小鼠肿瘤模型的免疫健全小鼠	癌症治疗	癌症	单细胞RNA测序	小鼠肿瘤模型	RNA测序数据	使用不同剂量RT处理的小鼠肿瘤模型
183	2025-07-04	Peritoneal cavity-derived GATA6+ macrophages inhibit fibrosis through IL33 in endometrium 2025-Jun-29, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2025.06.088 PMID:40592367	研究论文	本研究通过单细胞测序技术，识别并验证了GATA6+巨噬细胞在子宫内膜损伤修复和抑制纤维化中的关键作用	首次发现腹膜腔来源的GATA6+巨噬细胞通过IL33抑制子宫内膜纤维化的机制	研究样本可能仅限于特定类型的子宫内膜损伤患者，未涉及其他病因的子宫内膜疾病	探究子宫内膜损伤后修复过程中巨噬细胞的来源及其功能机制	正常子宫内膜和宫腔粘连(IUA)患者的子宫内膜组织	生殖医学	宫腔粘连	单细胞测序	NA	单细胞RNA测序数据	未明确提及具体样本数量，但包括正常子宫内膜和IUA患者的样本
184	2025-07-04	The progress and trends of the mechanism of cardiopulmonary bypass-associated acute lung injury: A narrative review 2025-Jun-27, Medicine IF:1.3Q2 DOI:10.1097/MD.0000000000043019 PMID:40587734	综述	本文回顾了心肺转流相关急性肺损伤机制的研究进展与趋势	强调未来研究应聚焦于炎症关键靶点（如中性粒细胞、巨噬细胞和糖萼细胞外衣）以及基因编辑和单细胞测序等先进技术	多年来该领域未取得突破性进展，导致管理策略和临床医学措施停滞不前	揭示心肺转流相关急性肺损伤的潜在机制并寻找有效的预防和治疗策略	心肺转流相关急性肺损伤的机制	临床医学	心血管疾病	基因编辑、单细胞测序	NA	NA	NA
185	2025-07-04	Sp140L functions as a herpesvirus restriction factor suppressing viral transcription and activating interferon-stimulated genes 2025-Jun-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2426339122 PMID:40526717	研究论文	该研究揭示了Sp140L作为一种疱疹病毒限制因子，通过抑制病毒转录和激活干扰素刺激基因来发挥作用	首次发现Sp140L作为疱疹病毒的限制因子，并揭示了其在干扰素非依赖性先天免疫反应中的作用	研究主要基于EBV病毒模型，对其他疱疹病毒的普适性需要进一步验证	探究疱疹病毒如何逃避宿主防御机制以及宿主限制因子的作用	EB病毒（EBV）及其与宿主B细胞的相互作用	病毒学	多发性硬化症	单细胞RNA测序	EBNA-LP敲除（LPKO）模型	RNA-seq数据	未明确说明样本数量，使用EBNA-LP敲除感染的B细胞
186	2025-07-04	Transcriptional landscape of pleural mesothelioma patients in relation to NF2 gene mutational status 2025-Jun-09, Journal of the Egyptian National Cancer Institute IF:2.1Q3 DOI:10.1186/s43046-025-00284-0 PMID:40484892	研究论文	本研究探讨了NF2基因突变状态对胸膜间皮瘤患者转录景观的影响	揭示了NF2突变如何影响肿瘤微环境、免疫浸润、细胞因子信号传导及化疗敏感性	样本量相对较小（82例），且缺乏实验验证	阐明NF2基因突变在胸膜间皮瘤生物学行为和治疗反应中的作用	82例胸膜间皮瘤患者	肿瘤基因组学	胸膜间皮瘤	RNA测序、单细胞RNA测序、生物信息学分析（xCell, Cytosig, pRRophetic）	逻辑回归模型	转录组数据	82例胸膜间皮瘤患者（来自TCGA数据库）
187	2025-07-04	Single-Cell RNA Sequencing of Rabbit Sclera at Different Developmental Stages: Unveiling Scleral Cells Atlas and the Heterogeneity of Fibroblasts 2025-Jun-02, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1 DOI:10.1167/iovs.66.6.83 PMID:40576432	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术构建了兔巩膜发育的单细胞转录组图谱，揭示了成纤维细胞的异质性、分化轨迹、基质组表达模式及细胞间通讯	首次构建兔巩膜发育的单细胞图谱，揭示了成纤维细胞的异质性及跨物种保守特征	研究仅针对新西兰兔，未涉及其他物种或人类样本的直接验证	阐明巩膜成纤维细胞的异质性及发育过程中的分子特征	新西兰兔巩膜组织（胚胎25天及出生后7天、21天、180天）	单细胞转录组学	近视	scRNA-seq	NA	单细胞转录组数据	新西兰兔巩膜组织（E25、P7、P21、P180四个发育阶段）
188	2025-07-04	Elevated Fcy receptor expression augments pro-inflammatory macrophage phagocytosis in systemic sclerosis and associated rheumatic diseases 2025-Jun-01, Rheumatology (Oxford, England) DOI:10.1093/rheumatology/keae688 PMID:39672802	research paper	本研究通过分析系统性硬化症（SSc）和其他风湿性疾病的巨噬细胞激活、信号通路及治疗反应，揭示了增强吞噬作用的机制	发现SSc患者巨噬细胞中FCGR基因表达升高及FcγR介导的吞噬途径富集，并指出FcγRI和FcγRII水平升高是增强吞噬活性和IL-6驱动炎症的关键因素	研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序数据，可能无法完全反映体内复杂的免疫环境	探究SSc及其他风湿性疾病中巨噬细胞的促吞噬表型及其机制	健康对照者及SSc、RA、PsA和axSpA患者的皮肤和肺巨噬细胞	免疫学	系统性硬化症及相关风湿性疾病	scRNA-seq, 流式细胞术, Western blot, RT-qPCR	NA	基因表达数据, 蛋白质数据	来自健康对照者及SSc、RA、PsA和axSpA患者的CD14+单核细胞衍生的巨噬细胞
189	2025-07-04	Lung-resident memory CD4+ T cells are dependent on Batf3 2025-Jun-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950) DOI:10.1093/jimmun/vkaf035 PMID:40184040	研究论文	本文研究了Batf3转录因子在肺组织中CD4+记忆T细胞积累中的作用及其对过敏反应的影响	揭示了Batf3通过促进特定CD4+记忆T细胞亚群的发育来调控过敏性反应的分子机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证	探究肺组织中记忆T细胞积累的细胞和分子机制	小鼠肺组织中的CD4+记忆T细胞	免疫学	哮喘	单细胞RNA测序	小鼠哮喘模型	基因表达数据	Batf3缺陷小鼠和对照小鼠
190	2025-07-03	CD38 ligation in sepsis promotes nicotinamide phosphoribosyltransferase-mediated IL-6 production in kidney stromal cells 2025-Jun-30, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association DOI:10.1093/ndt/gfae269 PMID:39568061	研究论文	本研究通过单细胞和单核RNA测序技术，探讨了CD38连接在脓毒症中对肾脏基质细胞产生IL-6的影响，并提出了NAMPT信号作为治疗靶点的新发现	揭示了CD38连接通过NAMPT信号促进肾脏基质细胞产生IL-6的新机制，并验证了其在人和小鼠脓毒症模型中的一致性	研究主要基于LPS诱导的脓毒症模型，可能无法完全反映其他类型脓毒症的病理过程	阐明CD38连接在脓毒症中的作用机制并寻找新的治疗靶点	小鼠腹膜免疫细胞、LPS诱导的脓毒症模型、人类脓毒症组织	免疫学	脓毒症	scRNA-seq, snRNA-seq	LPS诱导的脓毒症小鼠模型	RNA测序数据、组织学数据	小鼠模型和人类脓毒症组织样本（具体数量未明确说明）
191	2025-07-03	Molecular mechanisms of diquat-induced brain injury: Insights from network toxicology and single-cell RNA sequencing 2025-Jun-30, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118597 PMID:40592154	研究论文	本研究通过整合网络毒理学、单细胞RNA测序和分子对接技术，探讨了敌草快(DQ)诱导脑损伤的分子机制	结合网络毒理学、单细胞RNA测序和分子对接技术，首次系统性地揭示了DQ诱导脑损伤的分子机制	研究主要基于生物信息学分析和体外实验验证，缺乏体内实验数据支持	探究敌草快(DQ)诱导脑损伤的分子机制	敌草快(DQ)及其诱导的脑损伤相关分子靶点	分子毒理学	脑损伤	单细胞RNA测序、分子对接、网络毒理学	NA	基因表达数据	NA
192	2025-07-03	CCR1hi/CCL5hi macrophage-mediated CCL5hi T cell chemotaxis in salivary gland aggravates Sjögren's syndrome 2025-Jun-27, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2025.06.076 PMID:40582566	research paper	该研究揭示了CCR1hi/CCL5hi巨噬细胞通过CCL5介导的T细胞趋化作用在唾液腺中加剧干燥综合征(SS)的发病机制	首次揭示了CCR1hi/CCL5hi巨噬细胞通过CCL5介导的T/B细胞顺序浸润在SS发病中的关键作用，并提出了CCR1/CCL5作为潜在治疗靶点	研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本验证仍需扩大样本量	探究CCR1/CCL5在唾液腺淋巴细胞浸润和SS进展中的作用	干燥综合征患者和NOD小鼠的唾液腺组织	免疫学	干燥综合征	scRNA-seq, bulk RNA-seq, mIF	NOD小鼠模型	RNA测序数据, 免疫荧光图像	SS患者和NOD小鼠的唾液腺组织样本
193	2025-07-03	Targeting Annexin A2 to reactivate tumor-associated antigens presentation and relieve immune tolerance in liver cancer 2025-Jun-26, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2025-011716 PMID:40571481	研究论文	本研究探讨了靶向Annexin A2在肝癌中重新激活肿瘤相关抗原呈递和缓解免疫耐受的作用	揭示了Annexin A2在肿瘤相关抗原呈递和免疫逃逸中的新机制，并验证了其作为癌症免疫治疗靶点的可行性	研究主要基于体外和动物模型，临床转化效果需进一步验证	探索肝癌免疫逃逸的分子机制并寻找干预措施	肝癌细胞和CD8+ T细胞	癌症免疫治疗	肝癌	CRISPR-Cas9基因敲除、单细胞测序、免疫共沉淀结合液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)	化学和基因诱导的原发性肝癌模型、原位植入肝肿瘤模型	测序数据、质谱数据、细胞实验数据	未明确说明具体样本数量，使用了多种肝癌模型和体外实验
194	2025-07-03	Cell-specific nanoengineering strategy to disrupt tolerogenic signaling from myeloid-derived suppressor cells and invigorate antitumor immunity in pancreatic cancer 2025-Jun-23, Cancer immunology, immunotherapy : CII DOI:10.1007/s00262-025-04096-y PMID:40549154	research paper	开发了一种纳米工程策略，特异性靶向PMN-MDSCs，以破坏其免疫抑制信号并增强胰腺癌的抗肿瘤免疫	利用CXCR2作为PMN-MDSC特异性靶点，设计了CXCR2-NP纳米颗粒，实现了对PMN-MDSCs的特异性药物递送，避免了系统性抑制的副作用	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证其安全性和有效性	开发一种特异性靶向PMN-MDSCs的纳米工程策略，以克服系统性抑制的局限性并增强抗肿瘤免疫	胰腺导管腺癌（PDAC）中的PMN-MDSCs	纳米医学	胰腺癌	单细胞RNA测序，流式细胞术，纳米颗粒工程	KPC小鼠模型	RNA测序数据，流式细胞数据，体内外实验数据	人类和小鼠PDAC样本，治疗初治PDAC患者的外周血细胞
195	2025-07-03	Identification of conserved and tissue-restricted transcriptional profiles for lipid associated macrophages 2025-Jun-23, Communications biology IF:5.2Q1 DOI:10.1038/s42003-025-08387-z PMID:40550904	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，在小鼠和人类多个组织及炎症条件下，分析了脂质相关巨噬细胞（LAMs）的多样性，定义了共享的LAM转录特征及组织特异性基因程序	首次在多组织和炎症条件下系统分析LAMs的转录特征，发现其标记基因在人类炎症中高度保守，为LAMs在疾病中的治疗干预提供了分子靶点	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需进一步扩展	揭示脂质相关巨噬细胞在不同组织和炎症条件下的转录特征，为相关疾病治疗提供靶点	小鼠和人类多个组织中的脂质相关巨噬细胞（LAMs）	免疫学	动脉粥样硬化, 肥胖症, 代谢功能障碍相关脂肪性肝病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	多组织来源的小鼠和人类样本（具体数量未明确说明）
196	2025-07-03	Spatial and genomic profiling of residual breast cancer after neoadjuvant chemotherapy unveil divergent fates for each breast cancer subtype 2025-Jun-17, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102164 PMID:40482645	研究论文	通过单细胞空间转录组学和基因组分析，研究乳腺癌新辅助化疗后残留癌症的基因组和微环境特征	揭示了不同乳腺癌亚型在新辅助化疗后残留癌症的基因组和微环境特征，以及这些特征如何影响预后	研究仅针对乳腺癌，未涉及其他癌症类型	探索乳腺癌新辅助化疗后残留癌症的基因组和微环境特征及其对预后的影响	乳腺癌患者	数字病理学	乳腺癌	单细胞空间转录组学、基因组分析	NA	基因组数据、转录组数据	NA
197	2025-07-03	Cell states and neighborhoods in distinct clinical stages of primary and metastatic esophageal adenocarcinoma 2025-Jun-17, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102188 PMID:40499545	研究论文	通过多组学分析揭示食管腺癌的肿瘤微环境特征、恶性细胞程序及其与临床结果的关系	识别了五种恶性细胞程序，并揭示了它们与表观遗传可塑性和临床结果的关联，同时预测了这些细胞与微环境细胞类型的显著相互作用	研究结果需要在更大规模的队列中进行验证	理解食管腺癌的异质性、疾病进展和治疗反应	原发性和转移性食管腺癌肿瘤	数字病理学	食管腺癌	单核转录组测序、染色质可及性测序、空间分析	NA	转录组数据、染色质可及性数据、空间数据	一组原发性和转移性食管腺癌肿瘤样本
198	2025-07-03	Positionally distinct interferon-stimulated dermal immune-acting fibroblasts promote neutrophil recruitment in Sweet syndrome 2025-Jun-16, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jaci.2025.05.029 PMID:40516577	研究论文	该研究通过单细胞和批量转录组学分析，揭示了Sweet综合征皮肤中的干扰素特征及其在成纤维细胞中的表达，阐明了该疾病中中性粒细胞浸润的分子机制	首次在Sweet综合征皮肤中鉴定出显著的干扰素特征，并发现位置不同的干扰素激活成纤维细胞亚群在疾病发病机制中的作用	研究样本来自存档的临床皮肤样本，可能影响细胞活性分析；样本量未明确说明	明确Sweet综合征患者皮肤的细胞和分子特征	Sweet综合征患者、坏疽性脓皮症患者和健康对照者的皮肤样本	皮肤病理学	Sweet综合征	单细胞转录组学、批量转录组学、空间转录组学	NA	转录组数据	未明确说明样本数量
199	2025-07-03	EZH2 inhibition and 5-azacytidine enhance antitumor immunity in PTEN-deficient glioblastoma by activation viral mimicry response 2025-Jun-13, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2025-011650 PMID:40514071	研究论文	本研究探讨了PTEN缺陷型胶质母细胞瘤(GBM)中EZH2抑制和5-氮杂胞苷通过激活病毒模拟反应增强抗肿瘤免疫的机制	首次揭示了PTEN缺陷通过ERV-MAVS-IFN通路失调抑制I型干扰素反应的机制，并开发了EZH2i联合5-AZA的新型联合疗法	研究主要基于体外和动物模型，尚未进行临床试验验证	探索PTEN缺陷型GBM免疫逃逸机制并开发新型免疫治疗策略	PTEN缺陷型胶质母细胞瘤及其肿瘤微环境	肿瘤免疫治疗	胶质母细胞瘤	流式细胞术、单细胞RNA测序、表观遗传调控分析	NA	基因表达数据、表观遗传数据	未明确说明具体样本数量
200	2025-07-03	A single-cell RNA-seq dataset of synovial fluid from rheumatoid arthritis treated with TNF-α/JAK inhibitor 2025-Jun-10, Scientific data IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41597-025-05339-4 PMID:40494845	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术分析了类风湿关节炎患者在接受TNF-α/JAK抑制剂治疗前后的滑液样本	首次对TNF-α和JAK抑制剂在类风湿关节炎治疗中的单细胞水平影响进行了全面分析，并提供了治疗前后的配对比较数据	研究仅关注滑液样本，未涉及滑膜组织等其他可能相关的组织类型	探索TNF-α和JAK抑制剂对类风湿关节炎的治疗机制，并寻找新的治疗靶点	类风湿关节炎患者的滑液样本	数字病理学	类风湿关节炎	scRNA-seq	NA	RNA测序数据	100,387个高质量细胞