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当前共找到 727 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-28 |
Targeting the Epigenetic Regulator CBX5 Promotes Fibroblast Metabolic Reprogramming and Inhibits Lung Fibrosis
2025-Jun, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0255OC
PMID:39642371
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研究论文 | 本研究揭示了表观遗传调控因子CBX5在肺纤维化过程中通过调控成纤维细胞代谢重编程促进其持续活化的关键作用 | 首次发现CBX5作为连接表观遗传改变与成纤维细胞代谢异常的关键分子，并证明靶向CBX5可协同增强二甲双胍的抗纤维化效果 | 研究主要基于体外细胞模型和动物模型，在人体内的直接治疗效应仍需进一步验证 | 探究表观遗传调控如何影响成纤维细胞代谢重编程从而促进肺纤维化进展 | 特发性肺纤维化（IPF）患者的成纤维细胞、博来霉素诱导的肺损伤模型、IPF肺组织外植体 | 表观遗传学与代谢研究 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、bulk RNA测序、代谢评估 | NA | 基因表达数据、代谢数据、组织图像 | 未明确具体样本数量，涉及IPF患者成纤维细胞、动物模型及肺组织外植体 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-03-25 |
Unraveling the cross-talk between a highly virulent PEDV strain and the host via single-cell transcriptomic analysis
2025-06-17, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00555-25
PMID:40396761
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了一种高毒力猪流行性腹泻病毒（PEDV）毒株与宿主之间的相互作用机制 | 首次利用单细胞测序技术全面解析PEDV感染后宿主肠道细胞的组成、基因表达和细胞间通讯变化，并发现病毒可在B和T淋巴细胞中启动复制但无法产生感染性子代 | 研究仅针对一种PEDV毒株，样本量相对有限，且未深入探讨病毒在不同细胞类型中的长期感染动态 | 探究PEDV与宿主的相互作用机制，以理解病毒致病性和宿主免疫反应 | 感染PEDV的仔猪空肠细胞，包括上皮细胞、干细胞、免疫细胞等 | 数字病理学 | 猪流行性腹泻 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 19,612个空肠细胞，来自PEDV感染和对照仔猪 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-03-25 |
Primitive Hepatoblasts Driving Early Liver Development
2025-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.08.658502
PMID:40501632
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研究论文 | 本研究识别并表征了早期肝脏发育中一种先前未被认识的原始肝母细胞群，揭示了其在肝发生过程中的起源、分子特征和功能作用 | 发现并命名了源自腹侧前肠内胚层CDX2+FOXA2+祖细胞的一种新型原始肝母细胞群，揭示了其独特的分子标记和发育贡献，并阐明了WNT抑制和RA许可在此过程中的调控机制 | 原始肝母细胞在晚期胎儿和出生后发育中的贡献逐渐减少，其长期命运和功能转换的具体机制仍需进一步研究 | 探究早期肝脏发育过程中肝母细胞的异质性、起源和调控机制 | 小鼠和人类早期肝脏发育过程中的肝母细胞及前肠内胚层祖细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序、谱系追踪、表观遗传学和功能扰动研究 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-03-24 |
Rescue of naïve porcine circovirus type 3 and its pathogenesis in CD pigs
2025-06-17, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00341-25
PMID:40353661
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研究论文 | 本研究首次成功拯救了天然猪圆环病毒3型（PCV3），并利用剖腹产仔猪模型阐明了其致病机制，包括病毒复制特征、组织病理学变化及免疫抑制机制 | 首次通过透射电镜观察到PCV3病毒颗粒，并首次在剖腹产仔猪模型中系统阐明了PCV3的免疫抑制机制，特别是发现Th2细胞减少导致体液免疫受损 | 研究仅使用剖腹产仔猪模型，未在常规饲养猪只中验证；病毒分离和拯救过程依赖人工合成基因组，可能与天然病毒存在差异 | 阐明天然PCV3病毒的致病机制和免疫抑制特性 | 猪圆环病毒3型（PCV3）病毒颗粒、PK-15细胞、剖腹产仔猪（CD pigs） | NA | 猪圆环病毒感染 | 病毒拯救、免疫荧光检测、Western blotting、透射电镜、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 显微镜图像、蛋白质印迹数据、病毒滴度数据、单细胞转录组数据 | 未明确说明具体动物数量，使用剖腹产仔猪作为感染模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-03-24 |
Dissection of the global responses of mandarin fish pyloric cecum to an acute ranavirus (MRV) infection reveals the formation of serositis and then ascites
2025-06-17, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.02308-24
PMID:40366173
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了急性鳜鱼虹彩病毒感染如何靶向鳜鱼幽门盲囊的浆膜层，引发纤维性浆膜炎，并最终导致严重腹水形成的细胞和分子机制 | 首次在单细胞分辨率下解析了鳜鱼幽门盲囊对急性虹彩病毒感染的全局反应，明确了病毒驱动的浆膜炎是导致鳜鱼特有严重腹水症状的根本原因 | 研究主要关注急性感染期的反应，对慢性感染或恢复期的病理过程未作探讨，且实验模型为特定鱼类，结论的普适性有待验证 | 探究鳜鱼虹彩病毒急性感染导致严重腹水的病理机制 | 鳜鱼及其幽门盲囊组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-03-24 |
Identifying Causal Brain Structures, Genes, and Proteins for Osteoarthritis: A Large-Scale Genetic Correlation Study Based on Brain Imaging-Derived Phenotypes, Transcriptomes, and Proteomes
2025-06-10, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glaf083
PMID:40247738
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研究论文 | 本研究通过整合脑影像衍生表型、转录组和蛋白质组数据，验证了脑结构与骨关节炎风险的遗传相关性，并识别了关键的因果基因和蛋白质 | 首次大规模整合脑影像表型、脑转录组、脑蛋白质组与骨关节炎GWAS数据，系统探索脑-关节轴的遗传基础，并利用单细胞RNA-seq eQTL数据在细胞类型水平定位因果基因 | 研究主要基于欧洲人群的遗传数据，结论在其他族群中的普适性需进一步验证；脑蛋白质组样本量相对较小（152例） | 验证脑结构与骨关节炎风险的遗传相关性，识别介导该关联的因果基因和蛋白质 | 骨关节炎患者及对照人群（GWAS样本826,690人）、脑转录组（5,138例）、脑蛋白质组（152例） | 生物信息学与遗传学 | 骨关节炎 | 全基因组关联研究（GWAS）、连锁不平衡评分回归（LDSC）、孟德尔随机化（MR）、转录组范围关联研究（TWAS）、蛋白质组范围关联研究（PWAS）、单细胞RNA-seq eQTL分析 | 统计遗传学模型（LDSC、MR、TWAS、PWAS） | 遗传汇总统计数据、脑影像衍生表型数据、脑转录组数据、脑蛋白质组数据、单细胞表达数据 | GWAS：826,690人；脑转录组：5,138例；脑蛋白质组：152例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-03-24 |
Elucidating Cellular Senescence-related Genes in Benign Prostatic Hyperplasia Through Mendelian Randomization and Single-cell RNA Sequencing
2025-06-10, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glaf073
PMID:40269514
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序，识别了与良性前列腺增生（BPH）因果相关的细胞衰老相关基因，并分析了它们在多种前列腺细胞中的表达模式和调控网络 | 结合孟德尔随机化与单细胞RNA测序，首次系统性地识别了BPH中因果相关的细胞衰老基因，并揭示了跨细胞类型的一致表达模式和核心转录调控网络 | 研究主要基于欧洲人群的遗传数据（如FinnGen和UKB），可能限制了结果在其他人群中的普适性；单细胞数据样本量未明确说明，可能影响统计效力 | 识别与良性前列腺增生（BPH）因果相关的细胞衰老基因，并探究其在不同前列腺细胞中的表达和调控机制 | 良性前列腺增生（BPH）相关的细胞衰老基因及其在前列腺细胞（如成纤维细胞、巨噬细胞、T细胞、上皮细胞）中的表达 | 生物信息学 | 前列腺增生 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、共定位分析、单细胞调控网络推断与聚类 | NA | 遗传数据（eQTL）、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-03-23 |
Elucidating brain transport pathways and cell type-dependent gene silencing of a durable lipid-siRNA conjugate administered into cerebrospinal fluid
2025-Jun-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf600
PMID:40598893
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研究论文 | 本研究开发了一种脂质-siRNA偶联物（L2-siRNA），通过脑脊液注射实现全脑有效转运，并详细评估了其在小鼠和大鼠中的区域组织基因沉默效果及细胞类型特异性 | 开发了具有持久基因沉默效果的L2-siRNA偶联物，首次通过单细胞RNA测序绘制了细胞类型特异性敲低图谱，并与反义寡核苷酸进行了脑区基因沉默活性比较 | 研究主要基于动物模型（小鼠和大鼠），尚未在人体中进行验证，且长期毒性评估可能不足 | 探索脂质-siRNA偶联物通过脑脊液给药实现全脑转运和细胞类型依赖性基因沉默的机制 | 小鼠和大鼠的脑组织及脑脊液 | 神经科学 | 中枢神经系统疾病 | 单细胞RNA测序，基因沉默技术 | NA | RNA测序数据，基因表达数据 | 小鼠和大鼠模型，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-03-21 |
EVscope: A Comprehensive Bioinformatics Pipeline for Accurate and Robust Analysis of Total RNA Sequencing from Extracellular Vesicles
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.24.660984
PMID:40666973
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研究论文 | 本文介绍了一个名为EVscope的开源生物信息学流程，专门用于处理细胞外囊泡RNA测序数据，以提高RNA生物标志物和细胞间通讯研究的准确性和鲁棒性 | EVscope采用优化的全基因组期望最大化算法，通过有效利用比对分数和局部读取覆盖度，在单碱基分辨率上显著改进了多映射读取分配，特别针对片段化和低丰度的EV RNA；此外，它首次生成基于EM的BigWig文件用于下游分析，这是现有工具不具备的功能 | NA | 开发一个标准化的计算工作流程，以应对EV RNA测序中由于低丰度、片段化、组织来源广泛以及共分离材料污染带来的分析挑战 | 细胞外囊泡RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 总RNA测序 | 期望最大化算法 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2026-03-21 |
Lung endothelial cell heterogeneity in health and pulmonary vascular disease
2025-Jun-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00296.2024
PMID:39772753
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综述 | 本文探讨了肺内皮细胞在健康和肺血管疾病中的异质性，重点关注单细胞RNA测序技术带来的新见解 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了肺内皮细胞的新型亚群（如肺泡毛细血管内皮细胞和通用毛细血管内皮细胞）及其在肺动脉高压发病机制中的新通路和机制 | 作为一篇小型综述，可能未涵盖所有最新研究或技术细节，且依赖于现有文献的总结 | 综述肺内皮细胞异质性在肺血管疾病（特别是肺动脉高压）中的作用及研究进展 | 肺内皮细胞 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 11 | 2026-03-19 |
Single-cell RNA sequencing-derived signatures define response patterns to atezolizumab + bevacizumab in advanced hepatocellular carcinoma
2025-Jun, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.12.016
PMID:39709141
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了晚期肝细胞癌患者对阿特珠单抗联合贝伐珠单抗治疗的两种不同反应模式，并定义了与临床获益相关的分子亚群 | 首次通过单细胞RNA测序技术系统解析了晚期肝细胞癌对阿特珠单抗联合贝伐珠单抗治疗的分子反应机制，识别出免疫介导和血管生成相关两种不同的获益模式，并发现了与原发性耐药相关的免疫抑制性髓系细胞群和Notch通路激活 | 研究为回顾性分析，需要前瞻性研究验证；样本量相对有限；未详细探讨其他可能影响治疗反应的分子机制 | 揭示晚期肝细胞癌患者对阿特珠单抗联合贝伐珠单抗治疗产生临床获益或耐药的潜在细胞过程 | 晚期肝细胞癌患者 | 单细胞组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 422个RNA测序样本（包括317例阿特珠单抗+贝伐珠单抗治疗患者，47例阿特珠单抗单药治疗患者，58例索拉非尼治疗患者） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-03-18 |
Guanylate-Binding Proteins Promote Host Defense Against Leishmania major by Balancing iNOS/Arg-1 in Myeloid Cells
2025-Jun-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.26.661809
PMID:40631203
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研究论文 | 本文探讨了鸟苷酸结合蛋白（GBPs）在宿主防御利什曼原虫感染中的作用，特别是在调节巨噬细胞中iNOS/Arg-1平衡以控制寄生虫方面的机制 | 首次系统研究了GBPs在皮肤利什曼病中的功能，揭示了其通过平衡iNOS和Arg-1表达来调节巨噬细胞免疫反应，从而影响寄生虫控制的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类疾病情况；且GBPs的具体作用通路仍需进一步探索 | 探究GBPs在宿主防御利什曼原虫感染中的免疫调节作用 | C57Bl/6小鼠、GBPChr3敲除小鼠、骨髓来源巨噬细胞（BMDMs） | 免疫学 | 皮肤利什曼病 | RNA-Seq、单细胞RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | C57Bl/6小鼠和GBPChr3敲除小鼠模型 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-03-14 |
Sequence Diversity and Encoded Enzymatic Differences of Monocistronic L1 ORF2 mRNA Variants in the Aged Normal and Alzheimer's Disease Brain
2025-06-18, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.2298-24.2025
PMID:40368603
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研究论文 | 本研究通过功能测定、长读长测序和空间转录组学，揭示了阿尔茨海默病与正常衰老大脑中L1反转录转座子ORF2 mRNA的序列多样性及其编码的酶活性差异 | 首次在人类大脑中鉴定出超过550种编码蛋白的单顺反子ORF2 mRNA变体，其数量是参考基因组的两倍多，并证实了这些变体具有内源性反转录酶和核酸内切酶活性 | 样本量相对较小（31个大脑样本），且主要关注大脑皮层，未涵盖其他脑区 | 探究人类大脑中内源性反转录酶活性的来源、L1 mRNA的多样性及其在阿尔茨海默病与正常衰老大脑中的差异 | 31个阿尔茨海默病患者和非疾病（正常衰老）捐赠者的大脑皮层样本 | 基因组学 | 阿尔茨海默病 | 酶功能测定、靶向PacBio HiFi长读长测序、定量空间转录组学 | NA | RNA序列数据、空间转录组数据、酶活性数据 | 31个人类大脑样本（阿尔茨海默病与非疾病，包含两性） | PacBio | 长读长测序, 空间转录组学 | PacBio HiFi | 靶向PacBio HiFi长读长测序 |
| 14 | 2026-03-14 |
Multi-omic analyses of the development of obesity-related depression linked to the gut microbe Anaerotruncus colihominis and its metabolite glutamate
2025-06-15, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2025.04.010
PMID:40274437
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了肠道微生物Anaerotruncus colihominis及其代谢产物谷氨酸在肥胖相关抑郁症发展中的关键作用 | 首次将肥胖相关抑郁症与特定肠道微生物A. colihominis及其谷氨酸代谢联系起来，并通过单细胞RNA测序揭示了Efnb2-Ephb2互作在细胞通讯中的核心作用 | 研究主要基于动物模型和临床样本的相关性分析，因果关系和具体分子通路仍需进一步验证 | 探究肥胖相关抑郁症的发病机制，寻找潜在的治疗靶点 | 肥胖相关抑郁症患者、健康个体、高脂饮食小鼠、无菌小鼠 | 微生物组学 | 肥胖相关抑郁症 | 单细胞RNA测序、粪便微生物移植、多组学分析 | NA | 微生物组数据、转录组数据、代谢组数据 | 临床患者与健康个体样本、高脂饮食小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-03-13 |
[Biological characteristics of liver zonation and its role in disease and aging]
2025-Jun-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
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综述 | 本文总结了肝脏分区在维持肝功能中的重要作用及其与疾病和衰老的关系 | 利用单细胞基因组学和空间转录组学技术深化了对肝脏分区的理解 | NA | 探讨肝脏分区的生物学特性及其在疾病和衰老中的作用 | 肝脏细胞，特别是沿门静脉-中央静脉轴的肝细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞基因组学，空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 16 | 2026-03-06 |
Systematic characterization of the ovarian landscape across mouse menopause models
2025-Jun-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.658920
PMID:40661543
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研究论文 | 本研究系统比较了三种小鼠绝经模型，通过组织学、血清激素分析、单细胞转录组学和机器学习方法，揭示了卵泡丢失、内分泌紊乱和转录重塑的共性与模型特异性特征 | 首次系统比较三种小鼠绝经模型（自然衰老、化学诱导卵泡耗竭、遗传模型），并整合单细胞转录组学与机器学习进行多维度表征 | 研究局限于小鼠模型，人类绝经的分子机制可能存在物种差异 | 建立绝经研究的临床前模型选择框架，解析卵巢衰老的分子机制 | 三种小鼠绝经模型（自然衰老、VCD化学诱导、Foxl2单倍体不足遗传模型） | 计算生物学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序，机器学习 | 机器学习方法 | 转录组数据，组织图像，血清激素数据 | 多种年龄段的三种小鼠模型群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-03-06 |
Single cell RNA sequencing shows that cells expressing Sox9 postnatally populate most skeletal lineages in mouse bone
2025-Jun-03, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/jbmr/zjaf043
PMID:40143416
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和谱系追踪，揭示了小鼠骨骼中表达Sox9的祖细胞在出生后对大多数骨骼谱系的贡献 | 首次证明出生后表达Sox9的祖细胞是骨骼中多种细胞类型的共同来源，包括生长板软骨细胞、骨膜细胞和骨髓基质细胞 | 研究仅基于小鼠模型，可能不直接适用于人类骨骼发育 | 探究小鼠骨骼中成骨细胞谱系的细胞来源和发育过程 | 小鼠骨骼中的细胞类型，包括生长板软骨细胞、骨膜细胞和CXCL12丰富的网状骨髓基质细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序，谱系追踪 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-03-06 |
SMURF2 Facilitates GAP17 Isoform 1 Membrane Displacement to Promote Mutant p53-KRAS Oncogenic Synergy
2025-Jun-03, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-24-0701
PMID:39976545
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研究论文 | 本研究揭示了SMURF2通过PPLP基序与GAP17-1相互作用，使其从膜上移位，从而促进突变p53与KRAS的致癌协同作用 | 首次阐明SMURF2通过识别GAP17-1的PPLP基序导致其膜定位异常，从而维持突变KRAS的GTP结合活化状态，揭示了突变p53与KRAS协同致癌的新机制 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型，临床样本验证相对有限；GAP17-1膜移位的确切分子机制仍需进一步解析 | 探究突变p53与突变KRAS在胰腺癌中协同致癌的分子机制 | 胰腺癌细胞系、基因工程小鼠模型、临床胰腺导管腺癌样本 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、组织微阵列、基因沉默、突变分析 | 基因工程小鼠模型（iKras*; iKras*, p53*, and p48-Cre; Kras*） | 基因表达数据、组织病理数据、临床生存数据 | 多种胰腺癌细胞系、多个小鼠模型、临床前及临床样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-03-06 |
Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics reveal unique subpopulations of infiltrating macrophages and dendritic cells following AKI
2025-Jun-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00059.2025
PMID:40331777
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序、空间转录组学和CITE测序技术，揭示了急性肾损伤后肾脏浸润巨噬细胞和树突状细胞的独特亚群及其时空动态特征 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和CITE测序技术，全面解析了AKI后肾脏浸润免疫细胞的时空异质性和动态变化，并发现了KIMs可能重编程表达KRM特征基因的新现象 | 研究主要基于小鼠缺血再灌注损伤模型，人类样本的验证和临床转化仍需进一步研究 | 阐明急性肾损伤后肾脏浸润免疫细胞的异质性、时空分布特征及其功能 | 小鼠肾脏浸润巨噬细胞(KIMs)、肾脏树突状细胞(KDCs)和肾脏驻留巨噬细胞(KRMs) | 单细胞组学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, CITE测序 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 表位数据 | 未明确样本数量，基于小鼠缺血再灌注损伤模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2026-03-04 |
SpaceBF: Spatial coexpression analysis using Bayesian Fused approaches in spatial omics datasets
2025-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.29.646124
PMID:40236135
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研究论文 | 本文提出了一种名为SpaceBF的贝叶斯融合建模框架，用于在空间组学数据中分析分子间的空间共表达模式 | 开发了首个基于贝叶斯融合方法的框架，能够同时估计局部（位置特异性）和全局（组织范围）的分子共表达，相比现有主要依赖地理空间指标（如双变量莫兰指数和李氏指数）的方法具有更高的特异性和统计效力 | 未明确说明方法对计算资源的需求或可扩展性限制，也未讨论在超大规模数据集上的应用性能 | 开发稳健的统计方法来检测空间组学数据中分子对之间的空间变化共表达模式 | 空间转录组学和空间蛋白质组学数据中的分子（基因、肽段、脂质、N-聚糖）共表达关系 | 空间组学 | 癌症（多种类型） | 空间转录组学、质谱成像 | 贝叶斯融合模型 | 空间组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |