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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial analyses reveal the effect of VSIG4+S100A10+TAMs on the immunosuppression of glioblastoma and anti-PD-1 immunotherapy
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142415
PMID:40127797
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间分析揭示了VSIG4+S100A10+TAMs在胶质母细胞瘤免疫抑制和抗PD-1免疫治疗中的作用 | 首次发现VSIG4+S100A10+TAM是GBM不良预后的独立预后指标,并在抗PD-1免疫治疗无应答患者中显著积累 | 样本量相对有限(16例患者样本),需要更大规模研究验证 | 探索胶质母细胞瘤中肿瘤相关巨噬细胞异质性及其对免疫治疗疗效的影响 | 胶质母细胞瘤患者样本和肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞术, 多重免疫荧光, bulk RNA-seq | NA | 基因表达数据, 空间定位数据, 细胞表型数据 | 16例胶质母细胞瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 122 | 2025-10-06 |
Integrated single cell spatial multi-omics landscape of WHO grades 2-4 diffuse gliomas identifies locoregional metabolomic regulators of glioma growth
2025-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.30.651361
PMID:40654923
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞空间多组学技术,揭示了WHO 2-4级弥漫性胶质瘤的区域特异性代谢调控机制 | 首次结合空间转录组学、成像质谱流式和质谱成像技术,系统解析胶质瘤核心与边缘区域的代谢异质性 | 样本量相对有限,需要进一步验证代谢物的功能机制 | 探索弥漫性胶质瘤区域特异性代谢依赖性与肿瘤生长的关系 | WHO 2-4级弥漫性胶质瘤患者肿瘤组织(核心与边缘区域) | 数字病理学 | 脑胶质瘤 | 空间转录组学, 成像质谱流式, 质谱成像 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据 | WHO 2-4级弥漫性胶质瘤患者肿瘤样本(包含IDH突变少突胶质细胞瘤和IDH野生型星形细胞瘤) | NA | 空间转录组学, 质谱成像 | NA | NA |
| 123 | 2025-10-06 |
A computational framework for mapping isoform landscape and regulatory mechanisms from spatial transcriptomics data
2025-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.02.651907
PMID:40654841
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研究论文 | 开发了一个名为SPLISOSM的计算框架,用于从空间转录组数据中检测异构体分辨率模式 | 首次提出了能够同时考虑位点和异构体水平依赖关系的多变量测试方法,在稀疏数据上表现出稳健性能 | NA | 研究转录多样性的空间协调机制 | 小鼠大脑和人类胶质母细胞瘤 | 生物信息学 | 神经精神疾病, 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | 多变量统计模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 124 | 2025-10-06 |
CRISPRi perturbation screens and eQTLs provide complementary and distinct insights into GWAS target genes
2025-May-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.05.651929
PMID:40654604
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研究论文 | 系统比较CRISPRi扰动筛选和eQTL分析在识别GWAS靶基因方面的互补性和差异性 | 首次系统比较CRISPRi扰动筛选和eQTL分析两种方法在识别非编码变异靶基因方面的表现 | 研究主要关注血液细胞性状相关的基因组区域,可能不适用于其他组织或疾病类型 | 评估不同方法在识别非编码变异靶基因方面的效果和互补性 | 数百个与血液细胞性状相关的基因组区域 | 功能基因组学 | 血液相关疾病 | CRISPR干扰, 单细胞转录组测序, eQTL分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 数百个基因组区域 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 125 | 2025-10-06 |
Cross-species analysis of experimental PH at single cell resolution reveals prominent contributions Ednrb + EC and Dhcr24 + macrophage populations
2025-May-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.30.651587
PMID:40655025
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研究论文 | 通过跨物种单细胞分析揭示实验性肺动脉高压中新型巨噬细胞和内皮细胞亚群的作用 | 首次建立跨物种单细胞图谱,鉴定出Dhcr24高表达巨噬细胞亚群和Ednrb阳性内皮细胞亚群在肺动脉高压中的新作用 | 动物模型与人类疾病的完全对应关系仍需进一步验证 | 研究肺动脉高压动物模型与人类疾病的细胞水平关联 | 小鼠、大鼠肺动脉高压模型和人类肺动脉高压患者 | 单细胞测序分析 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多种啮齿类动物模型和人类数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 126 | 2025-10-06 |
Data standards for single-cell RNA-sequencing of paediatric cancer
2025-May, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.70033
PMID:40416408
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研究论文 | 系统评估儿科癌症单细胞RNA测序数据存储现状并提出标准化建议框架 | 首次系统分析儿科癌症scRNA-seq数据存储的不一致性问题,并提出改善数据存储实践的具体建议框架 | 仅分析已公开的scRNA-seq数据集,未涉及其他单细胞测序技术 | 改善儿科癌症单细胞RNA测序数据的存储标准和使用效率 | 公开可用的儿科癌症单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | 儿科癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 488个临床样本,超过130万个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 127 | 2025-10-06 |
Insights into human melanocyte development and characteristics through pluripotent stem cells combined with single-cell sequencing
2025-May-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112373
PMID:40641554
|
研究论文 | 通过多能干细胞结合单细胞测序技术研究人类黑色素细胞的发育过程和特征 | 首次结合人类多能干细胞和单细胞测序技术系统研究黑色素细胞发育的细胞异质性、分化轨迹和信号通路相互作用 | 研究主要基于体外诱导模型,与体内真实发育环境存在差异 | 探索人类黑色素细胞的发育机制和生物学特性 | 人类多能干细胞诱导的黑色素细胞和正常人类黑色素细胞 | 发育生物学 | 色素相关疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 128 | 2025-10-06 |
Humanized mouse model reveals T cell ANXA2 as a potential therapeutic target in ischemic stroke
2025-May-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112302
PMID:40641552
|
研究论文 | 本研究通过建立人源化小鼠脑卒中模型,鉴定出ANXA2作为T细胞亚群的生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次建立人源化T细胞缺血性脑卒中模型,发现ANXA2作为新型治疗靶点,并使用小分子抑制剂验证其神经保护作用 | 人源化小鼠模型仍与人类疾病存在差异,需要进一步临床验证 | 探索缺血性脑卒中后T细胞的分子机制并鉴定治疗靶点 | 人源化小鼠模型和人类缺血性脑组织及外周血样本 | 单细胞测序分析 | 缺血性脑卒中 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 人源化小鼠模型和人类样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 129 | 2025-10-06 |
Integrative single-cell transcriptomics of sheep ovarian development reveals dynamic transcriptional programs relevant to reproductive traits
2025-May-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112422
PMID:40641558
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组学分析绵羊卵巢发育过程,揭示与繁殖性状相关的动态转录程序 | 首次在绵羊卵巢发育关键阶段构建单细胞转录组图谱,并通过跨物种比较发现与人类生殖性状的关联 | 样本数量有限,仅涵盖四个发育阶段 | 解析绵羊卵巢发育的转录动态及其与人类生殖生物学的相关性 | 绵羊卵巢组织 | 单细胞组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 61,649个单细胞,覆盖胚胎期90天(E90)、青春期前3月(M3)、青春期后6月(M6)和成年期(Y2,Y4) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 130 | 2025-10-06 |
Single-cell RNAseq of Angiotensin II-induced abdominal aortic tissue identifies aneurysm-associated cell clusters in C57BL/6J mice
2025-05-28, Bioscience reports
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BSR20241235
PMID:40440080
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术分析血管紧张素II诱导的小鼠腹主动脉瘤组织,识别与动脉瘤相关的关键细胞群 | 首次在腹主动脉瘤中发现由内皮细胞转化的特殊细胞群(恶性ECs),并揭示Cxcl12-Cxcr4/Ackr3炎症轴在动脉瘤形成中的作用 | 研究仅使用C57BL/6J小鼠模型,样本量有限(不同年龄组样本数为21和7) | 探究腹主动脉瘤形成过程中起关键作用的特定细胞群 | C57BL/6J小鼠的腹主动脉组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 28只C57BL/6J小鼠(14周龄21只,32周龄7只) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 131 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis revealed critical causative candidates for down syndrome-related lung diseases
2025-May-30, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2025.05.009
PMID:40451386
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示唐氏综合征相关肺部疾病的关键致病候选因子 | 首次使用Dp16小鼠模型结合单细胞转录组技术系统研究21号染色体三体对肺部疾病的影响机制 | 研究主要基于小鼠模型,需要进一步在人类样本中验证 | 探索21号染色体三体导致唐氏综合征相关肺部疾病的分子机制 | Dp16小鼠模型(携带人类21号染色体同源区域片段重复) | 单细胞生物学 | 唐氏综合征相关肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | Dp16小鼠和对照小鼠的肺组织细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 132 | 2025-10-06 |
Peripheral blood cell-type and sex-specific signatures of alcohol misuse revealed by single-cell transcriptomics
2025-May-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.21.655347
PMID:40501697
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示酒精滥用在外周血细胞类型和性别特异性中的分子特征 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统分析酒精使用障碍患者外周血单核细胞的免疫细胞比例和基因表达差异,并发现性别和剂量依赖的免疫细胞功能特征 | 研究样本量有限,仅关注外周血单核细胞,未涉及其他组织或细胞类型 | 表征酒精使用障碍中的免疫失调机制 | 酒精使用障碍患者和健康对照者的外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 酒精使用障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 酒精使用障碍患者和健康对照者(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 133 | 2025-10-06 |
Targeting caseinolytic mitochondrial matrix peptidase, a novel contributor to the pathobiology of high-risk multiple myeloma
2025-May-29, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024024781
PMID:39912779
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学发现线粒体酪蛋白水解蛋白酶CLPP在多发性骨髓瘤中的过度表达及其作为治疗靶点的重要性 | 首次发现CLPP在多发性骨髓瘤进展中的关键作用,并证明其抑制剂可克服常规和新型药物耐药性 | NA | 探索多发性骨髓瘤进展的分子机制并寻找新的治疗靶点 | CD138+肿瘤性浆细胞与正常浆细胞的比较 | 单细胞转录组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 134 | 2025-10-06 |
Deconer: An Evaluation Toolkit for Reference-based Deconvolution Methods Using Gene Expression Data
2025-May-10, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf009
PMID:39963994
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研究论文 | 开发了一个用于评估基于参考的去卷积方法的综合工具包Deconer | 首次提供了针对基于参考的去卷积方法的全面评估工具包,包含多种模拟和真实基因表达数据集 | NA | 评估和比较基于参考的细胞类型去卷积方法 | 16种基于参考的去卷积方法 | 生物信息学 | NA | 基因表达数据分析 | NA | 基因表达数据,包括bulk测序数据和单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 135 | 2025-10-06 |
High-Resolution Spatial Map of the Human Facial Sebaceous Gland Reveals Marker Genes and Decodes Sebocyte Differentiation
2025-May-29, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.04.041
PMID:40449655
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研究论文 | 通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序技术,绘制了人类面部皮脂腺高分辨率空间图谱并解析了皮脂细胞分化过程 | 首次报道了人类皮脂腺的分子标记基因,识别了皮脂细胞分化的4个不同阶段及其特征基因签名 | 主要基于人类样本研究,与小鼠模型研究的可比性有限 | 深入理解人类皮脂腺的细胞和分子机制 | 人类面部皮脂腺 | 空间转录组学 | 痤疮 | Stereo-seq空间转录组学, 单细胞RNA测序, 多重误差鲁棒FISH | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 136 | 2025-10-06 |
Aboral cell types of Clytia and coral larvae have shared features and link taurine to the regulation of settlement
2025-May-16, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv1159
PMID:40378222
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研究论文 | 本研究通过比较三种刺胞动物幼虫的转录组和单细胞RNA测序数据,揭示了幼虫前端(反口端)的细胞类型特征及牛磺酸在调控幼虫附着过程中的作用 | 首次整合多种刺胞动物幼虫的单细胞RNA测序数据,发现反口端特化细胞类型中牛磺酸摄取和分解代谢基因的表达模式,并证实外源性牛磺酸抑制幼虫附着 | 研究仅涉及三种刺胞动物物种,可能无法完全代表整个刺胞动物门的多样性 | 阐明刺胞动物幼虫附着的细胞和分子调控机制 | 水母Clytia和两种珊瑚的浮浪幼虫 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,转录组数据 | 三种刺胞动物物种的浮浪幼虫 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 137 | 2025-10-06 |
Impact of mechanotransduction on gene expression changes in periodontal ligament during orthodontic tooth movement
2025-May, Journal of bone and mineral metabolism
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s00774-025-01581-3
PMID:39893595
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析正畸牙齿移动过程中牙周韧带对机械刺激的响应机制 | 首次在单细胞水平揭示Mkx转录因子在牙周韧带机械传导中的特异性表达模式和保护作用 | 研究主要基于大鼠模型,人类样本验证相对有限 | 阐明机械刺激下牙周韧带的基因表达变化和细胞群体动态 | 野生型大鼠牙周韧带细胞和人类牙周韧带细胞 | 单细胞基因组学 | 口腔正畸 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR | NA | 基因表达数据 | 大鼠PDL在0天、1周和2周时间点的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 138 | 2025-10-06 |
Safety and feasibility of 4-1BB co-stimulated CD19-specific CAR-NK cell therapy in refractory/relapsed large B cell lymphoma: a phase 1 trial
2025-May, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-025-00940-3
PMID:40251398
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研究论文 | 本研究评估了4-1BB共刺激的CD19特异性CAR-NK细胞疗法在难治/复发性大B细胞淋巴瘤患者中的安全性和可行性 | 首次使用狒狒包膜假型慢病毒载体转导脐带血来源的NK细胞生成CD19-BBz CAR-NK细胞,并进行临床阶段试验 | 样本量较小(仅8名患者),为早期阶段临床试验 | 评估CAR-NK细胞疗法在B细胞淋巴瘤患者中的安全性和治疗效果 | 难治/复发性大B细胞淋巴瘤患者 | 癌症免疫治疗 | 大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序,慢病毒转导 | 临床实验 | 临床数据,基因表达数据 | 8名患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 139 | 2025-10-06 |
Cardiac Fibroblasts regulate myocardium and coronary vasculature development via the collagen signaling pathway
2025-May-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.11.612512
PMID:39314489
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和基因标记技术揭示了心脏成纤维细胞通过胶原信号通路调控心肌和冠状血管发育的机制 | 首次系统阐明了心脏成纤维细胞在发育过程中通过胶原信号通路调控心肌细胞和血管内皮细胞发育的分子机制 | 研究主要聚焦于发育阶段,对成年心脏中成纤维细胞功能的验证相对有限 | 探究心脏成纤维细胞在心脏发育过程中对心肌和血管系统的调控作用 | 小鼠心脏成纤维细胞、心肌细胞和血管内皮细胞 | 发育生物学 | 心脏发育缺陷 | 单细胞mRNA测序(scRNA-seq), RNA染色, Pdgfra-CreER控制的DTA消融系统 | NA | 单细胞转录组数据, 组织染色图像 | 不同发育阶段的小鼠心脏组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 140 | 2025-10-06 |
Pathological α-synuclein dysregulates epitranscriptomic writer METTL3 to drive neuroinflammation in microglia
2025-May-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115618
PMID:40279247
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研究论文 | 本研究揭示了病理α-突触核蛋白通过失调m6A甲基转移酶METTL3驱动小胶质细胞神经炎症的机制 | 首次发现METTL3在α-突触核蛋白和锰诱导的神经炎症中表达上调并发挥关键调控作用 | 未明确METTL3调控神经炎症的具体下游分子机制 | 探究m6A RNA修饰在神经退行性疾病中的作用机制 | 人源小胶质细胞、星形胶质细胞、阿尔茨海默病、帕金森病和路易体痴呆患者尸检组织 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序, 亚细胞定位研究, 功能分析 | NA | RNA测序数据, 蛋白质定位数据 | 人源细胞模型和神经退行性疾病患者尸检组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |