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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals targeted modulation of inflammatory repertoire by SOCE blockers
2025-May-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.28.651042
PMID:40654653
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示SOCE阻断剂对免疫细胞炎症反应的靶向调控作用 | 首次在单细胞水平系统揭示SOCE阻断剂对不同免疫细胞亚群的差异化调控机制 | 研究仅使用体外刺激的正常人PBMCs,未涉及疾病模型或体内验证 | 探究SOCE阻断剂对免疫细胞功能的特异性调控机制 | 正常人外周血单个核细胞(PBMCs) | 单细胞组学 | 免疫相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 正常人PBMCs样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 多重单细胞RNA测序 |
| 122 | 2025-10-06 |
Library-based single-cell analysis of CAR signaling reveals drivers of in vivo persistence
2025-May-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101260
PMID:40215972
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析CAR信号传导,揭示了驱动体内持久性的关键因素 | 首次系统性地将多样化的CAR信号输入与转录输出进行单细胞水平映射,识别出与体内持久性相关的独特强直信号特征 | 识别出的强直信号特征在实体瘤中无效,研究结果可能不适用于所有肿瘤类型 | 解码CAR信号传导设计原则,为优化下一代细胞内信号域架构提供指导 | 工程化表达嵌合抗原受体的T细胞 | 单细胞分析 | 液体肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 123 | 2025-10-06 |
Identification of maize genes that condition early systemic infection of sugarcane mosaic virus through single-cell transcriptomics
2025-May-12, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101297
PMID:40045576
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研究论文 | 通过单细胞转录组技术研究甘蔗花叶病毒早期系统侵染玉米的基因调控机制 | 首次在单细胞分辨率下揭示甘蔗花叶病毒早期系统侵染过程中病毒积累与宿主基因表达的共变异模式 | 研究仅关注早期系统侵染阶段(症状显现前),未涉及后期感染过程 | 探究甘蔗花叶病毒早期系统侵染玉米的分子机制和宿主-病毒相互作用 | 甘蔗花叶病毒感染的玉米叶片细胞 | 植物病理学 | 病毒病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | SCMV感染的玉米叶片细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 124 | 2025-10-06 |
Reactivation of CTLA4-expressing T cells accelerates resolution of lung fibrosis in a humanized mouse model
2025-May-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI181775
PMID:40100323
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和蛋白质组学技术,揭示了CTLA4阳性T细胞在肺纤维化消退过程中的关键作用 | 首次发现CTLA4在CD8+ T细胞上的表达与纤维化区域相邻,并证明靶向CTLA4的治疗可加速肺上皮再生和纤维化消退 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用的直接转化仍需进一步验证 | 探究免疫检查点蛋白CTLA4在肺纤维化消退过程中的作用机制 | 人源化CTLA4敲入小鼠模型、人类特发性肺纤维化组织 | 空间转录组学 | 肺纤维化 | 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质组数据 | 人源化小鼠模型和人类肺纤维化组织样本 | NA | 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 125 | 2025-10-06 |
[Single-cell analysis of immune-lineage features in T-cell large granular lymphocytic leukemia]
2025-May-14, Zhonghua xue ye xue za zhi = Zhonghua xueyexue zazhi
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析T细胞大颗粒淋巴细胞白血病患者的免疫谱系特征 | 首次在单细胞水平揭示T-LGLL的免疫谱系特征,发现效应CD8+ T细胞异常扩增、Treg细胞减少及功能异常等关键免疫失衡特征 | 样本量较小(5例患者和3例健康对照),单中心研究 | 研究T细胞大颗粒淋巴细胞白血病的免疫谱系改变及其致病机制 | T-LGLL患者和健康对照者的外周血免疫细胞 | 单细胞组学 | 白血病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 5例T-LGLL患者(治疗前后配对样本)和3例健康对照 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞转录组测序技术 |
| 126 | 2025-10-06 |
POPARI: Modeling multisample variation in spatial transcriptomics
2025-May-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.08.652741
PMID:40462963
|
研究论文 | 提出Popari概率图模型用于多样本空间转录组数据的因子分解分析 | 引入差异先验正则化空间一致性和空间下采样实现多分辨率层次分析 | 未明确说明模型计算复杂度和可扩展性限制 | 开发多样本空间转录组数据整合分析方法 | 空间转录组数据集 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病, 卵巢癌 | 空间转录组学 | 概率图模型 | 空间基因表达数据 | 多个生物样本(小鼠大脑、胸腺、卵巢癌) | NA | 空间转录组学 | STARmap PLUS, Slide-TCR-seq, CosMx | NA |
| 127 | 2025-10-06 |
A single cell atlas of the mouse seminal vesicle
2025-May-08, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkaf045
PMID:40036847
|
研究论文 | 本研究构建了首个小鼠精囊的单细胞转录组图谱,揭示了该组织的细胞组成和功能特征 | 首次创建小鼠精囊的单细胞RNA-seq图谱,系统定义了该组织的细胞类型和转录组特征 | 研究仅基于小鼠模型,结果向人类推演需谨慎;样本数量相对有限 | 解析精囊组织的细胞组成和功能,理解精液形成的分子基础 | 小鼠精囊组织 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 23只不同年龄和饮食条件的小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 128 | 2025-10-06 |
Emerging Techniques in Spatial Multiomics: Fundamental Principles and Applications to Dermatology
2025-May, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.09.006
PMID:39503694
|
综述 | 本文综述了空间多组学技术的基本原理及其在皮肤病学研究中的应用前景 | 介绍了能够同时捕获DNA、基因组可及性、组蛋白修饰和蛋白质的空间多组学新技术,突破了传统空间转录组学的局限 | 作为综述文章,未涉及具体实验验证和数据分析 | 探讨空间多组学技术在皮肤病学研究中的原理、优势和局限性 | 皮肤组织的空间分子特征 | 空间生物学 | 皮肤病 | 空间多组学技术 | NA | 基因组、表观基因组、蛋白质组空间数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间多组学 | NA | NA |
| 129 | 2025-10-06 |
Molecular pathology of acute spinal cord injury in middle-aged mice
2025-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.08.652873
PMID:40463189
|
研究论文 | 本研究通过比较年轻和中年小鼠在脊髓损伤后的行为、组织病理学和转录组学变化,揭示了年龄对脊髓损伤修复机制的影响 | 首次对中年小鼠脊髓损伤病理生物学进行全面的转录组学研究,填补了该年龄段研究空白 | 研究仅关注急性期变化,未评估长期修复过程;样本量相对有限 | 探究年龄对脊髓损伤病理生物学的影响 | 年轻(2-4个月)和中年(10-12个月)小鼠 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 转录组数据,行为数据,组织病理学数据 | 年轻和中年小鼠群体 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 130 | 2025-10-06 |
Splicing regulatory dynamics for precision analysis and treatment of heterogeneous leukemias
2025-May-07, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adr1471
PMID:40333990
|
研究论文 | 开发OncoSplice计算方法分析白血病剪接调控动态并发现新的治疗靶点 | 开发无监督计算方法OncoSplice,在无剪接因子突变情况下发现新的白血病分子亚型,并验证PRMT5抑制剂对白血病剪接异常的治疗效果 | 未明确说明样本量的具体数字和研究队列的详细特征 | 研究剪接调控在白血病中的作用机制并探索治疗策略 | 成人和儿童急性髓系白血病(AML) | 生物信息学 | 白血病 | 长读长单细胞RNA测序 | 无监督计算方法 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 131 | 2025-10-06 |
Epitenon-derived cells comprise a distinct progenitor population that contributes to both fibrosis and regeneration following acute flexor tendon injury in a spatially-dependent manner
2025-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.30.526242
PMID:36778469
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研究论文 | 本研究通过遗传谱系追踪和单细胞RNA测序技术,揭示了腱外膜来源细胞在肌腱损伤后同时参与纤维化和再生过程的空间依赖性作用 | 首次明确鉴定腱外膜作为重要的祖细胞群来源,这些细胞在肌腱损伤后同时参与纤维化和再生过程,具有空间依赖性特征 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探索肌腱损伤后参与纤维化和再生过程的细胞群体及其作用机制 | 小鼠肌腱损伤模型和人类腱周瘢痕组织 | 单细胞生物学 | 肌腱损伤 | 遗传谱系追踪, 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 小鼠肌腱损伤模型和人类瘢痕组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 132 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial analyses reveal the effect of VSIG4+S100A10+TAMs on the immunosuppression of glioblastoma and anti-PD-1 immunotherapy
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142415
PMID:40127797
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间分析揭示了VSIG4+S100A10+TAMs在胶质母细胞瘤免疫抑制和抗PD-1免疫治疗中的作用 | 首次发现VSIG4+S100A10+TAM是GBM不良预后的独立预后指标,并在抗PD-1免疫治疗无应答患者中显著积累 | 样本量相对有限(16例患者样本),需要更大规模研究验证 | 探索胶质母细胞瘤中肿瘤相关巨噬细胞异质性及其对免疫治疗疗效的影响 | 胶质母细胞瘤患者样本和肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞术, 多重免疫荧光, bulk RNA-seq | NA | 基因表达数据, 空间定位数据, 细胞表型数据 | 16例胶质母细胞瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 133 | 2025-10-06 |
Integrated single cell spatial multi-omics landscape of WHO grades 2-4 diffuse gliomas identifies locoregional metabolomic regulators of glioma growth
2025-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.30.651361
PMID:40654923
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞空间多组学技术,揭示了WHO 2-4级弥漫性胶质瘤的区域特异性代谢调控机制 | 首次结合空间转录组学、成像质谱流式和质谱成像技术,系统解析胶质瘤核心与边缘区域的代谢异质性 | 样本量相对有限,需要进一步验证代谢物的功能机制 | 探索弥漫性胶质瘤区域特异性代谢依赖性与肿瘤生长的关系 | WHO 2-4级弥漫性胶质瘤患者肿瘤组织(核心与边缘区域) | 数字病理学 | 脑胶质瘤 | 空间转录组学, 成像质谱流式, 质谱成像 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据 | WHO 2-4级弥漫性胶质瘤患者肿瘤样本(包含IDH突变少突胶质细胞瘤和IDH野生型星形细胞瘤) | NA | 空间转录组学, 质谱成像 | NA | NA |
| 134 | 2025-10-06 |
CRISPRi perturbation screens and eQTLs provide complementary and distinct insights into GWAS target genes
2025-May-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.05.651929
PMID:40654604
|
研究论文 | 系统比较CRISPRi扰动筛选和eQTL分析在识别GWAS靶基因方面的互补性和差异性 | 首次系统比较CRISPRi扰动筛选和eQTL分析两种方法在识别非编码变异靶基因方面的表现 | 研究主要关注血液细胞性状相关的基因组区域,可能不适用于其他组织或疾病类型 | 评估不同方法在识别非编码变异靶基因方面的效果和互补性 | 数百个与血液细胞性状相关的基因组区域 | 功能基因组学 | 血液相关疾病 | CRISPR干扰, 单细胞转录组测序, eQTL分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 数百个基因组区域 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 135 | 2025-10-06 |
Cross-species analysis of experimental PH at single cell resolution reveals prominent contributions Ednrb + EC and Dhcr24 + macrophage populations
2025-May-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.30.651587
PMID:40655025
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研究论文 | 通过跨物种单细胞分析揭示实验性肺动脉高压中新型巨噬细胞和内皮细胞亚群的作用 | 首次建立跨物种单细胞图谱,鉴定出Dhcr24高表达巨噬细胞亚群和Ednrb阳性内皮细胞亚群在肺动脉高压中的新作用 | 动物模型与人类疾病的完全对应关系仍需进一步验证 | 研究肺动脉高压动物模型与人类疾病的细胞水平关联 | 小鼠、大鼠肺动脉高压模型和人类肺动脉高压患者 | 单细胞测序分析 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多种啮齿类动物模型和人类数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 136 | 2025-10-06 |
Data standards for single-cell RNA-sequencing of paediatric cancer
2025-May, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.70033
PMID:40416408
|
研究论文 | 系统评估儿科癌症单细胞RNA测序数据存储现状并提出标准化建议框架 | 首次系统分析儿科癌症scRNA-seq数据存储的不一致性问题,并提出改善数据存储实践的具体建议框架 | 仅分析已公开的scRNA-seq数据集,未涉及其他单细胞测序技术 | 改善儿科癌症单细胞RNA测序数据的存储标准和使用效率 | 公开可用的儿科癌症单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | 儿科癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 488个临床样本,超过130万个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 137 | 2025-10-06 |
Insights into human melanocyte development and characteristics through pluripotent stem cells combined with single-cell sequencing
2025-May-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112373
PMID:40641554
|
研究论文 | 通过多能干细胞结合单细胞测序技术研究人类黑色素细胞的发育过程和特征 | 首次结合人类多能干细胞和单细胞测序技术系统研究黑色素细胞发育的细胞异质性、分化轨迹和信号通路相互作用 | 研究主要基于体外诱导模型,与体内真实发育环境存在差异 | 探索人类黑色素细胞的发育机制和生物学特性 | 人类多能干细胞诱导的黑色素细胞和正常人类黑色素细胞 | 发育生物学 | 色素相关疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 138 | 2025-10-06 |
Humanized mouse model reveals T cell ANXA2 as a potential therapeutic target in ischemic stroke
2025-May-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112302
PMID:40641552
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研究论文 | 本研究通过建立人源化小鼠脑卒中模型,鉴定出ANXA2作为T细胞亚群的生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次建立人源化T细胞缺血性脑卒中模型,发现ANXA2作为新型治疗靶点,并使用小分子抑制剂验证其神经保护作用 | 人源化小鼠模型仍与人类疾病存在差异,需要进一步临床验证 | 探索缺血性脑卒中后T细胞的分子机制并鉴定治疗靶点 | 人源化小鼠模型和人类缺血性脑组织及外周血样本 | 单细胞测序分析 | 缺血性脑卒中 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 人源化小鼠模型和人类样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 139 | 2025-10-06 |
Integrative single-cell transcriptomics of sheep ovarian development reveals dynamic transcriptional programs relevant to reproductive traits
2025-May-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112422
PMID:40641558
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组学分析绵羊卵巢发育过程,揭示与繁殖性状相关的动态转录程序 | 首次在绵羊卵巢发育关键阶段构建单细胞转录组图谱,并通过跨物种比较发现与人类生殖性状的关联 | 样本数量有限,仅涵盖四个发育阶段 | 解析绵羊卵巢发育的转录动态及其与人类生殖生物学的相关性 | 绵羊卵巢组织 | 单细胞组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 61,649个单细胞,覆盖胚胎期90天(E90)、青春期前3月(M3)、青春期后6月(M6)和成年期(Y2,Y4) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 140 | 2025-10-06 |
Single-cell RNAseq of Angiotensin II-induced abdominal aortic tissue identifies aneurysm-associated cell clusters in C57BL/6J mice
2025-05-28, Bioscience reports
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BSR20241235
PMID:40440080
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术分析血管紧张素II诱导的小鼠腹主动脉瘤组织,识别与动脉瘤相关的关键细胞群 | 首次在腹主动脉瘤中发现由内皮细胞转化的特殊细胞群(恶性ECs),并揭示Cxcl12-Cxcr4/Ackr3炎症轴在动脉瘤形成中的作用 | 研究仅使用C57BL/6J小鼠模型,样本量有限(不同年龄组样本数为21和7) | 探究腹主动脉瘤形成过程中起关键作用的特定细胞群 | C57BL/6J小鼠的腹主动脉组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 28只C57BL/6J小鼠(14周龄21只,32周龄7只) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |