单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 926 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-06-18 |
TLR7 responses in glomerular macrophages accelerate the progression of glomerulonephritis in NZBWF1 mice
2025-05-21, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxaf005
PMID:40401698
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研究论文 | 本研究探讨了TLR7在肾小球巨噬细胞中的反应如何加速NZBWF1小鼠肾小球肾炎的进展 | 揭示了TLR7信号通过促进肾小球巨噬细胞中IL-1β的产生和狼疮相关基因的表达，加速肾小球肾炎的进展 | 研究仅限于NZBWF1小鼠模型，未在人类患者中进行验证 | 探究巨噬细胞TLR7反应在肾小球肾炎中的作用机制 | NZBWF1小鼠及其肾小球巨噬细胞 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NZBWF1小鼠及其肾小球巨噬细胞 |
| 122 | 2025-06-18 |
Single-cell transcriptome of retinal myeloid cells in response to transplantation of human neurons reveals reversibility of microglial activation
2025-May-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.16.654622
PMID:40475635
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了视网膜髓系细胞在人类神经元移植后的微胶质细胞激活可逆性 | 首次展示了视网膜髓系细胞在移植后的双向激活轨迹，揭示了微胶质细胞激活的可逆性 | 研究仅观察了移植后3天的短期反应，缺乏长期追踪数据 | 探究视网膜移植后宿主微胶质细胞/巨噬细胞的激活机制和异质性 | 人类胚胎干细胞分化的视网膜神经节细胞(RGC)和宿主视网膜髓系细胞 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNAseq)，10X Genomics Chromium平台，RNA Velocity分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 每样本多达10,000个活细胞，使用3-6月龄knock-in小鼠 |
| 123 | 2025-06-18 |
Circadian clock-gated cell renewal controls time-dependent changes in taste sensitivity
2025-May-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2421421122
PMID:40339128
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研究论文 | 研究探讨了生物钟调控细胞周期进程对小鼠舌头味觉细胞更新的影响 | 揭示了生物钟通过调控细胞周期影响味觉细胞更新的机制，并发现味觉敏感性的时间依赖性变化 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探索生物钟调控细胞周期对味觉细胞更新的影响及其生理意义 | 小鼠舌头上皮细胞和味蕾类器官 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠舌头上皮细胞和味蕾类器官 |
| 124 | 2025-06-18 |
scValue: value-based subsampling of large-scale single-cell transcriptomic data for machine and deep learning tasks
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf279
PMID:40515392
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scValue的新方法，用于大规模单细胞转录组数据的基于价值的子采样，以优化机器学习和深度学习任务的表现 | scValue通过随机森林模型的袋外估计对单个细胞进行'数据价值'排名，优先考虑高价值细胞，并更有效地保留子样本中的关键生物信号 | NA | 优化大规模单细胞RNA测序数据的子采样方法，以提高下游机器学习和深度学习任务的性能 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 随机森林 | 单细胞转录组数据 | 16个公共数据集，从数万到数百万个细胞不等 |
| 125 | 2025-06-17 |
Longitudinal single-cell analysis reveals RUNX1T1 as an early driver in treatment-induced neuroendocrine transdifferentiation
2025-May-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.14.653660
PMID:40463134
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研究论文 | 通过纵向单细胞分析揭示了RUNX1T1作为治疗诱导神经内分泌转分化的早期驱动因素 | 首次在患者来源的异种移植模型中识别出一个新的早期中间过渡细胞状态，并发现RUNX1T1作为神经内分泌转分化的关键转录调节因子 | 研究仅基于单一患者来源的异种移植模型，可能限制了结果的普适性 | 探索治疗诱导神经内分泌前列腺癌(t-NEPC)发展过程中的时间动态和分子驱动因素 | 前列腺腺癌向神经内分泌癌转分化过程 | 癌症生物学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | 患者来源的异种移植模型(PDX) | 单细胞转录组数据 | 7个时间点的样本(从去势前到复发NEPC) |
| 126 | 2025-06-17 |
Spatial transcriptomics highlights B cells as key contributors to a complete and durable response to chemo-immunotherapy in a patient with resectable NSCLC
2025-May-11, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011563
PMID:40350207
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research paper | 该研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示B细胞在可切除非小细胞肺癌患者对化疗免疫疗法产生完全和持久反应中的关键作用 | 利用空间转录组学结合单细胞RNA测序和血清蛋白质组分析，首次揭示了B细胞在不同成熟状态下的关键作用，并观察到治疗后原发肿瘤中三级淋巴结构的形成 | 研究仅基于一个病例，样本量有限，需要更大规模的研究验证结果 | 探索可切除非小细胞肺癌患者对化疗免疫疗法产生完全和持久反应的分子机制 | 一名可切除非小细胞肺癌伴同步脑转移的患者 | digital pathology | lung cancer | spatial transcriptomics, single-cell RNA-sequencing, serum proteomic profiling | NA | transcriptomic data, proteomic data | 1名患者（包括治疗前脑转移灶和治疗后原发肺肿瘤组织） |
| 127 | 2025-06-17 |
Hepatic stellate cell heterogeneity: Functional aspects and therapeutic implications
2025-May-08, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001386
PMID:40338161
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综述 | 本文综述了肝星状细胞（HSCs）在健康和疾病肝脏中的异质性及其功能 | 整合了单细胞测序、空间转录组学及临床前和临床数据，提供了对HSC异质性的最新理解 | NA | 探讨HSC异质性在肝脏稳态和疾病中的作用及其治疗潜力 | 肝星状细胞（HSCs）及其与肝细胞、内皮细胞、巨噬细胞/单核细胞、T细胞和肿瘤细胞的相互作用 | NA | 肝病 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 128 | 2025-06-17 |
Revolutionizing cancer treatment: Navigating the intricate landscape of cellular signaling networks
2025-May, Advances in clinical and experimental medicine : official organ Wroclaw Medical University
IF:2.1Q3
DOI:10.17219/acem/205024
PMID:40418208
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研究论文 | 探讨癌症治疗中细胞信号网络的动态重连及其对治疗抵抗的影响 | 利用单细胞多组学、空间转录组学和AI驱动的网络建模等创新技术解析癌症的适应性机制 | 未提及具体研究样本大小或数据类型的限制 | 通过整合系统生物学与计算和实验方法，设计能够克服癌症进化适应性的适应性疗法 | 肿瘤细胞、非编码基因组和微环境之间的动态交互 | 系统生物学 | 癌症 | 单细胞多组学、空间转录组学、AI驱动的网络建模 | AI-powered network modeling | 多组学数据 | NA |
| 129 | 2025-06-16 |
siHIF-1α-loaded micellar nanoparticles inhibit M1 macrophage activation to ameliorate chronic rhinosinusitis
2025-May-31, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 研究通过负载siHIF-1α的胶束纳米颗粒调节巨噬细胞极化和铁死亡，以改善慢性鼻窦炎(CRS)的慢性炎症和免疫失调 | 首次利用MNP_siHIF-1α纳米颗粒靶向抑制HIF-1α/TFRC-ROS轴，从而调控巨噬细胞极化和铁死亡，为CRS提供了一种新型精准治疗方法 | 需要进一步验证长期安全性和临床转化潜力 | 探究MNP_siHIF-1α调控巨噬细胞极化和铁死亡的分子机制，开发CRS新型疗法 | 慢性鼻窦炎(CRS)小鼠模型和Raw264.7巨噬细胞系 | 纳米医学 | 慢性鼻窦炎 | scRNA-seq, ChIP, 双荧光素酶报告基因检测, 流式细胞术, DLS, 凝胶阻滞实验 | CRS小鼠模型 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | CRS小鼠模型（具体数量未明确说明）和Raw264.7细胞系 |
| 130 | 2025-06-16 |
scDown: A Pipeline for Single-Cell RNA-Seq Downstream Analysis
2025-May-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26115297
PMID:40508102
|
research paper | 介绍了一个名为scDown的单细胞RNA测序下游分析流程，用于自动化细胞分化和通讯分析 | 开发了一个集成多种分析工具（如细胞比例差异分析、细胞间通讯分析、伪时间分析和RNA速度分析）的R包，支持Seurat和Scanpy注释的数据，并在一个罕见遗传性神经发育障碍数据集中发现了新的神经元炎症信号特征 | 未明确说明流程的计算效率或在大规模数据集上的适用性 | 开发一个自动化单细胞RNA测序下游分析流程，以促进细胞分化和通讯研究 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 一个已发表的数据集（具体样本量未说明） |
| 131 | 2025-06-16 |
Modeling the Transitional Phase of Epithelial Cells Reveals Prognostic and Therapeutic Targets in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2025-May-29, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17111813
PMID:40507294
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了胰腺导管腺癌（PDAC）进展过程中上皮细胞过渡阶段的特征，并构建了一个基于基因的风险评分模型 | 识别了PDAC进展中高度增殖的上皮细胞过渡亚群，构建了基因风险评分模型，并揭示了肿瘤微环境中特定成纤维细胞亚群与过渡上皮细胞间的相互作用 | 研究样本量未明确说明，且模型验证仅限于qPCR，缺乏更广泛的临床验证 | 寻找PDAC从早期阶段向侵袭性阶段转变的生物标志物，以改善临床管理 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者的上皮细胞和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），qPCR | Lasso Cox回归模型 | 基因表达数据 | NA |
| 132 | 2025-06-16 |
Single-Cell Sequencing: An Emerging Tool for Biomarker Development in Nuclear Emergencies and Radiation Oncology
2025-May-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17111801
PMID:40507282
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综述 | 本文探讨了单细胞测序技术在核紧急情况和放射肿瘤学中作为生物标志物开发新兴工具的应用 | 强调了单细胞测序技术在提供高分辨率细胞多样性和异质性视图方面的创新性，特别是在识别辐射暴露相关生物标志物方面的潜力 | 单细胞RNA测序技术在辐射研究领域仍处于新兴阶段 | 探讨辐射剂量测定的当前方法及与辐射暴露相关的生物标志物，并关注NGS技术在放射治疗和紧急事件中的发展 | 辐射暴露后的细胞和生物标志物 | 生物信息学 | 放射肿瘤学 | NGS, 单细胞测序, scRNA-seq | NA | 基因序列数据 | NA |
| 133 | 2025-06-16 |
Potential Role of SESN3 in Linking Heart Failure with Preserved Ejection Fraction and Chronic Obstructive Pulmonary Disease via Autophagy Dysregulation
2025-May-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26115174
PMID:40507985
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研究论文 | 本研究探讨了SESN3通过自噬失调在心力衰竭伴保留射血分数（HFpEF）和慢性阻塞性肺疾病（COPD）之间的潜在联系 | 首次提出SESN3介导的自噬可能是HFpEF和COPD的共同机制，并验证了其在心脏和肺组织中的系统性作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证不足 | 识别HFpEF和COPD的共同致病机制并验证其系统性作用 | HFpEF心脏组织和COPD肺组织 | 分子病理学 | 心血管疾病 | 转录组分析、WGCNA、LASSO回归、scRNA-seq、qPCR、Western blotting | HFpEF小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量 |
| 134 | 2025-06-16 |
Molecular Characterization of Atypical Fibroxanthoma and Pleomorphic Dermal Sarcoma
2025-May-27, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17111785
PMID:40507266
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综述 | 本文综述了非典型纤维黄色瘤（AFX）和多形性真皮肉瘤（PDS）的分子特征，包括它们的分子组成、基因表达和预后生物标志物 | 首次整合了包括单细胞RNA测序在内的多种分子数据集，讨论了这些肿瘤的分子驱动因素和预后生物标志物 | 由于这些肿瘤的罕见性，相关研究较少，分子特征的全面理解仍有待深入 | 探讨AFX和PDS的分子特征及其预后生物标志物 | 非典型纤维黄色瘤（AFX）和多形性真皮肉瘤（PDS） | 分子病理学 | 皮肤肉瘤 | 外显子测序、批量RNA测序、靶向DNA测序、DNA甲基化分析、拷贝数分析、scRNA-seq | NA | 分子数据 | NA |
| 135 | 2025-06-16 |
PRRX1 is a key regulator in the phenotypic transition between human normal dermal and keloid fibroblasts
2025-May-16, Journal of dermatological science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jdermsci.2025.05.002
PMID:40517126
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research paper | 该研究探讨了人类胎儿皮肤、产后皮肤和瘢痕疙瘩组织之间的差异，以找出影响伤口愈合结果的关键因素 | 发现了PRRX1在调节正常和瘢痕疙瘩成纤维细胞表型转变中的关键作用，并利用三维人类瘢痕疙瘩模型在组织水平上进一步验证了这一作用 | 研究主要聚焦于PRRX1的作用，可能忽略了其他潜在的关键因素 | 理解人类胎儿皮肤、产后皮肤和瘢痕疙瘩组织之间的差异，以促进无疤痕伤口愈合的临床治疗 | 人类胎儿皮肤、产后皮肤和瘢痕疙瘩组织 | digital pathology | scarring | spatial transcriptomics (ST), histological imaging | three-dimensional human keloid model | transcriptomics data, histological images | 人类胎儿皮肤、产后皮肤和瘢痕疙瘩组织样本 |
| 136 | 2025-06-16 |
Clinical efficacy and chemoresistance analysis of precision neoadjuvant chemotherapy for borderline resectable pancreatic cancer: a prospective, single-arm pilot study
2025-May-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002342
PMID:40146255
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研究论文 | 本研究评估了基于患者来源类器官（PDOs）的新辅助化疗（NAC）在临界可切除胰腺癌（BRPC）中的临床疗效和安全性 | 利用PDOs进行药物敏感性测试，调整NAC方案，并探索了吉西他滨耐药的潜在机制 | 单臂试点研究，样本量较小（19例患者） | 评估PDOs指导的NAC在BRPC中的临床疗效和安全性，并探索吉西他滨耐药的分子机制 | 临界可切除胰腺癌（BRPC）患者 | 数字病理学 | 胰腺癌 | scRNA-seq分析 | NA | 临床数据和单细胞转录组数据 | 19例BRPC患者 |
| 137 | 2025-06-15 |
Novel PAP-targeted CAR-T therapy enhances antitumor efficacy through CoupledCAR approach
2025-May-31, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-011238
PMID:40449956
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research paper | 该研究提出了一种新型的PAP靶向CAR-T疗法，通过CoupledCAR方法增强抗肿瘤效果 | 首次证明PAP是前列腺癌CAR-T疗法的特异性靶点，并开发了CoupledCAR平台技术，无需肿瘤抗原即可扩增肿瘤靶向CAR-T细胞 | 研究主要基于体外和体内实验，尚未进行临床试验验证 | 开发针对前列腺癌的新型CAR-T疗法，解决现有疗法靶点缺乏和CAR-T细胞扩增受限的问题 | 前列腺癌细胞和CAR-T细胞 | 肿瘤免疫治疗 | 前列腺癌 | scRNA-Seq, 免疫组化染色 | CAR-T | 基因表达数据, 免疫组化数据 | NA |
| 138 | 2025-06-15 |
Essential role of CD56dimNKG2C+ NK cells trained by SARS-CoV-2 vaccines in protecting against COVID-19
2025-May-30, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.05.031
PMID:40450518
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research paper | 该研究探讨了SARS-CoV-2疫苗通过训练特定NK细胞亚群在预防COVID-19中的关键作用 | 揭示了灭活COVID-19疫苗通过训练CD56dimNKG2C+ NK细胞和M2样巨噬细胞在先天免疫保护中的新机制 | 研究发现老年参与者在加强接种后这些适应性细胞存在缺陷，可能导致保护不足 | 评估疫苗在先天免疫层面的保护效果 | NK细胞、巨噬细胞和T细胞在SARS-CoV-2感染中的保护作用 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序、飞行时间质谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据 | 使用恒河猴模型和人类参与者进行研究 |
| 139 | 2025-06-15 |
Chaperonin containing TCP1 subunit 5 as a novel pan-cancer prognostic biomarker for tumor stemness and immunotherapy response: insights from multi-omics data, integrated machine learning, and experimental validation
2025-May-27, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04071-7
PMID:40423850
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研究论文 | 本研究通过多组学数据和机器学习方法，揭示了CCT5在泛癌中的预后价值和免疫治疗响应预测作用 | 首次全面评估CCT5在33种癌症类型中的表达模式，并开发了基于CCT5的免疫治疗响应预测模型CCT5.Sig | 研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证 | 探究CCT5在泛癌进展中的作用及其作为免疫治疗响应预测标志物的潜力 | 33种癌症类型的肿瘤组织 | 生物信息学 | 泛癌 | 多组学分析（包括bulk RNA-seq、scRNA-seq和空间转录组学） | 机器学习模型 | 多组学数据 | 23个免疫检查点阻断队列（n=1394），涵盖8种癌症类型 |
| 140 | 2025-06-15 |
Analyses of single-cell RNA sequencing uncover the role of intratumoral Helicobacter pylori in shaping tumor progression and immunity in gastric cancer
2025-May-24, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04048-6
PMID:40411560
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示了肿瘤内幽门螺杆菌在胃癌中塑造肿瘤进展和免疫的作用 | 使用SAHMI流程系统地恢复和去噪人类临床组织中的微生物信号，并在单细胞转录组水平上检查肿瘤-微生物相互作用 | 研究仅针对胃癌，未涉及其他类型的肿瘤 | 探究肿瘤内微生物群与胃癌发生和发展的关系 | 胃癌组织中的幽门螺杆菌及其与宿主细胞的相互作用 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、荧光原位杂交、免疫组织化学 | NA | RNA测序数据、图像数据 | 大型胃癌队列 |