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当前共找到 802 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-01-21 |
Altered Hepatic Metabolism in Down Syndrome
2025-May-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.27.656393
PMID:40502193
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了唐氏综合征患者中肝脏代谢的改变，特别是胆汁酸水平升高和肝功能异常蛋白标志物 | 首次在唐氏综合征中系统报道了广泛的代谢变化，并利用小鼠模型和单细胞转录组学验证了胆汁酸代谢紊乱与肝脏病理的关联 | 研究样本量相对有限，且主要基于血浆分析，未深入探讨其他组织或长期临床影响 | 探究唐氏综合征中肝脏代谢的改变及其潜在机制 | 唐氏综合征患者和小鼠模型 | 代谢组学 | 唐氏综合征 | 多组学分析、bulk RNA-seq、单细胞转录组学 | Dp16小鼠模型 | 血浆、RNA序列数据 | 超过400人 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 122 | 2026-01-21 |
Interpretable Trajectory Inference with Single Cell Linear Adaptive Negative-binomial Expression (scLANE) Testing
2025-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.19.572477
PMID:38187622
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研究论文 | 本文提出了一种名为scLANE的可解释轨迹推断方法，用于单细胞RNA-seq数据中的基因表达动态分析 | scLANE测试基于可解释的广义线性模型，通过经验选择的基样条处理非线性，并扩展至估计方程和混合模型，以支持复杂实验设计下的可靠轨迹测试 | NA | 开发一种可解释的轨迹推断方法，以识别与生物轨迹进展显著相关的基因表达变化 | 单细胞RNA-seq数据中的基因表达动态 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | 广义线性模型（GLM）、基样条、估计方程、混合模型 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 123 | 2026-01-14 |
Evaluating the practical aspects and performance of commercial single-cell RNA sequencing technologies
2025-May-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.19.654974
PMID:40475448
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研究论文 | 本文通过标准化PBMCs样本，全面比较了多种商业单细胞RNA测序技术的性能，包括细胞回收率、测序效率、灵敏度、细胞注释和差异基因表达等指标 | 首次对七种全转录组mRNA测序试剂盒和两种包含TCR分析的试剂盒进行标准化比较，强调实验约束对细胞亚型分辨能力的影响 | 研究仅使用PBMCs样本，可能无法完全代表其他组织或细胞类型的性能差异 | 评估商业单细胞RNA测序技术的实际应用性能和选择标准 | 来自不同供者的标准化外周血单个核细胞（PBMCs） | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多个供者的PBMCs样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 124 | 2026-01-14 |
DRUG AND SINGLE-CELL GENE EXPRESSION INTEGRATION IDENTIFIES SENSITIVE AND RESISTANT GLIOBLASTOMA CELL POPULATIONS
2025-May-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.15.654044
PMID:40462892
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研究论文 | 本研究开发了一个名为ISOSCELES的新框架，通过整合单细胞基因表达数据和药物反应签名，量化胶质母细胞瘤细胞对药物的敏感性和耐药性景观 | ISOSCELES框架首次整合单细胞RNA测序数据和L1000表达签名，以预测不同细胞状态对药物的差异反应，并识别出OLIG2抑制剂与Depatux-M的新型组合疗法 | 研究未明确说明样本量大小或验证实验的详细范围，可能限制结果的普适性 | 开发一个预测胶质母细胞瘤不同细胞状态对药物敏感性和耐药性的平台，以促进治疗开发 | 新诊断和复发性胶质母细胞瘤肿瘤的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | ISOSCELES框架 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 125 | 2026-01-14 |
A computational framework for mapping isoform landscape and regulatory mechanisms from spatial transcriptomics data
2025-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.02.651907
PMID:40654841
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研究论文 | 本文介绍了一个名为SPLISOSM的计算框架，用于从空间转录组学数据中检测异构体分辨率的模式 | SPLISOSM利用多元测试来考虑位点和异构体水平的依赖性，在稀疏数据上表现出稳健且理论依据充分的性能 | NA | 研究转录多样性（包括剪接和替代3'端使用）的空间协调机制 | 小鼠大脑和人类胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | 神经精神疾病，胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | 多元统计模型 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 126 | 2026-01-11 |
Overexpression of Meis factors in late-stage retinal progenitors yields complex effects on temporal patterning and neurogenesis
2025-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.01.651492
PMID:40654906
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研究论文 | 本研究通过在小鼠晚期视网膜祖细胞中过表达Meis1和Meis2转录因子，探究其对细胞时间身份和神经发生的影响 | 首次在晚期视网膜祖细胞中系统研究Meis1和Meis2过表达对时间模式调控和神经发生能力的影响，揭示了二者在晚期发育阶段具有非重叠的调控功能 | 过表达Meis因子未能完全重编程晚期祖细胞的时间身份，且研究仅在小鼠模型中进行，未涉及人类细胞或体内长期功能验证 | 探究转录因子Meis1和Meis2在晚期视网膜祖细胞中对时间身份决定和神经发生的调控作用 | 出生后小鼠的视网膜祖细胞 | 发育生物学 | NA | 电穿孔转染、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，使用小鼠视网膜祖细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 127 | 2026-01-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals distinct senotypes and a quiescence-senescence continuum at the transcriptome level following chemotherapy
2025-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.13.653730
PMID:40463227
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研究论文 | 本研究结合延时成像与单细胞RNA测序，揭示了化疗后细胞在转录组水平上存在不同的衰老类型以及静息-衰老连续体 | 首次通过单细胞RNA测序结合延时成像，将异质性细胞周期表型与转录组景观联系起来，并识别出多种衰老类型及两种不同的细胞周期阻滞途径 | 研究仅使用依托泊苷处理，未涵盖其他化疗药物；样本来源和数量未明确说明 | 区分化疗后细胞的静息与衰老状态，并探究其转录组特征 | 化疗处理后的细胞 | 单细胞组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序，延时成像 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 128 | 2026-01-09 |
ABCC3 Is a Differential Marker of CYP11B2-Negative Zona Glomerulosa Cells in Human Adrenal Cortex
2025-May-07, Endocrine pathology
IF:11.3Q1
DOI:10.1007/s12022-025-09862-3
PMID:40332623
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研究论文 | 本研究揭示了ABCC3作为人类肾上腺皮质中CYP11B2阴性球状带细胞的新型标志物，可用于区分正常肾上腺分区与醛固酮增多症相关的病变 | 首次发现ABCC3与醛固酮合酶CYP11B2在肾上腺球状带细胞中呈反向表达模式，并证明ABCC3可作为特异性区分CYP11B2阴性球状带细胞的标志物 | 研究主要基于组织样本和体外细胞实验，尚未在更大规模的临床队列中验证ABCC3标志物的诊断效能 | 探究ABCC3在人类肾上腺皮质中的表达模式及其在原发性醛固酮增多症中的病理学意义 | 人类肾上腺皮质组织、醛固酮生成腺瘤、皮质醇生成腺瘤、无功能腺瘤、醛固酮生成微结节及培养的人肾上腺皮质细胞 | 病理学 | 原发性醛固酮增多症 | 空间转录组学、免疫荧光共定位、细胞培养、基因表达分析 | NA | 组织样本、细胞样本、基因表达数据 | 多种肾上腺腺瘤样本及相邻肾上腺皮质组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 129 | 2026-01-08 |
Time-Varying Gene Regulatory Networks Inference Using KL Divergence from Single Cell Data
2025-May, Proceedings of the ... International Conference on Bioinformatics and Biomedical Technology
DOI:10.1109/icbbt65815.2025.11276344
PMID:41488127
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研究论文 | 本文提出了一种基于KL散度的新框架，用于从时间序列单细胞RNA测序数据中推断时变基因调控网络 | 整合KL散度的时间变异测量、自回归模型和正则化方法，以应对高维、稀疏和时序异质性的挑战 | NA | 从时间序列单细胞RNA测序数据中准确重建动态基因调控网络 | 10基因合成数据集和THP-1单核细胞分化数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自回归模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 130 | 2026-01-06 |
Mapping satellite glial cell heterogeneity reveals distinct spatial organization and signifies functional diversity in the dorsal root ganglion
2025-May-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.19.654813
PMID:40475507
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研究论文 | 本研究首次全面表征了小鼠背根神经节中卫星胶质细胞的异质性，并通过整合单细胞RNA测序与免疫组化等技术，识别、验证并空间定位了四个不同的SGC亚群 | 首次在小鼠背根神经节中对卫星胶质细胞异质性进行综合表征，识别并空间定位了四个功能不同的SGC亚群，并在人类DRG中发现了内外双层SGC结构 | NA | 探究背根神经节中卫星胶质细胞的异质性、空间分布及其潜在功能意义 | 小鼠和人类背根神经节中的卫星胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 免疫组化, 原位杂交, 先进成像技术 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 131 | 2026-01-06 |
High-Sensitivity PD-L1 Staining Using Clone 73-10 Antibody and Spatial Transcriptomics for Precise Expression Analysis in Non-Tumorous, Intraepithelial Neoplasia, and Squamous Cell Carcinoma of Head and Neck
2025-May-20, Head and neck pathology
DOI:10.1007/s12105-025-01798-8
PMID:40392349
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研究论文 | 本研究利用高灵敏度克隆73-10抗体和空间转录组学技术，评估头颈部鳞状细胞癌中PD-L1的表达，旨在扩大免疫检查点抑制剂治疗的适用患者范围 | 首次结合高灵敏度克隆73-10抗体和空间转录组学分析，系统评估PD-L1在头颈部鳞状细胞癌、上皮内瘤变及正常组织中的表达，并揭示其与免疫微环境及预后的关联 | 样本量相对有限（94例临床样本，其中6例进行空间转录组学分析），且为单中心研究，可能影响结果的普遍性 | 评估PD-L1在头颈部鳞状细胞癌中的表达，探索其作为免疫治疗生物标志物的潜力，以优化患者筛选策略 | 头颈部鳞状细胞癌患者组织样本，包括癌组织、配对的上皮内瘤变及正常口腔黏膜 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 免疫组织化学染色，空间转录组学 | NA | 组织图像，转录组数据 | 94例头颈部鳞状细胞癌临床样本，包括配对的鳞状上皮内瘤变和正常口腔黏膜样本，其中6例进行了空间转录组学分析 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 132 | 2026-01-02 |
Resident CD24 +LCN2 + LPCs aggravate fibrosis and inflammatory progression via the recruitment of TPPP3 +COL10A1 + macrophages in NASH
2025-May-16, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025081
PMID:40380802
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研究论文 | 本研究揭示了在非酒精性脂肪性肝炎（NASH）中，驻留的CD24+LCN2+肝脏祖细胞（LPCs）通过招募TPPP3+COL10A1+巨噬细胞亚型，加剧纤维化和炎症进展 | 首次在人类NASH中鉴定出驻留的CD24+LCN2+ LPCs，并阐明其通过促进促炎性巨噬细胞亚型（MP-2，标记为COL10A1和TPPP3）的激活来驱动纤维化的分子机制 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和计算分析，虽然在小鼠模型和人类样本中进行了验证，但具体的功能机制和靶向干预策略仍需进一步实验验证 | 探究人类NASH中肝脏祖细胞（LPCs）的分子表型及其调控机制，特别是在纤维化和炎症进展中的作用 | 人类NASH患者的肝脏样本、NASH小鼠模型（CDAHFD和HFD）以及相关的RNA测序数据集 | 单细胞组学 | 非酒精性脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RNA测序、细胞通讯分析（CellChat和NicheNet） | NA | 单细胞RNA测序数据、RNA测序数据 | 临床NASH样本、NASH小鼠模型及人类NASH肝脏样本（具体数量未在摘要中明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 133 | 2025-12-24 |
EnrichSci: Transcript-guided Targeted Cell Enrichment for Scalable Single-Cell RNA Sequencing
2025-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.02.651937
PMID:40654882
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研究论文 | 本研究开发了一种名为EnrichSci的可扩展单细胞RNA测序平台，用于靶向富集和解析复杂组织中稀有细胞类型的转录组动态 | 结合杂交链式反应RNA FISH与组合索引技术，实现了无需微流控的靶向细胞富集，并首次在单细胞水平揭示了衰老过程中少突胶质细胞亚型的转录后调控特征 | 研究目前仅在小鼠脑衰老模型中验证，尚未在人类样本或其他疾病模型中广泛应用 | 开发可扩展的靶向单细胞转录组测序技术，以解析复杂组织中稀有细胞类型的分子动态 | 衰老小鼠脑组织中的少突胶质细胞及其亚型 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序，杂交链式反应RNA FISH，组合索引 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | EnrichSci | 结合杂交链式反应RNA FISH与组合索引的微流控-free单核转录组测序平台 |
| 134 | 2025-12-20 |
Resolving Leukemia Heterogeneity and Lineage Aberrations with HematoMap
2025-05-30, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf005
PMID:39945785
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据构建了正常造血过程的综合参考层次结构，并开发了HematoMap工具，用于解析白血病异质性和谱系异常 | 开发了基于余弦距离算法的似然评分系统，能够将白血病细胞精确映射到正常造血层次结构，并创建了用户友好的R包HematoMap用于可视化分析 | 研究主要基于25名健康供体的数据构建参考层次，样本量相对有限，且主要针对AML和BCP-ALL两种白血病类型 | 解析白血病异质性，将白血病细胞精确映射到正常造血层次结构，以理解疾病起源和发展机制 | 急性髓系白血病（AML）和B细胞前体急性淋巴细胞白血病（BCP-ALL）患者的白血病细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | LASSO（最小绝对收缩和选择算子）评分模型 | 单细胞RNA测序数据，批量RNA测序数据 | 25名健康供体的超过100,000个骨髓单个核细胞，以及AML和BCP-ALL患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 135 | 2025-12-19 |
Temporal transcriptomic changes in the THY-Tau22 mouse model of tauopathy display cell type- and sex-specific differences
2025-05-07, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02013-z
PMID:40336141
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了THY-Tau22小鼠模型中tau蛋白病的性别和年龄依赖性转录组变化 | 首次在THY-Tau22小鼠模型中系统揭示了tau蛋白病相关的性别特异性转录组变化及其年龄依赖性演化 | 研究仅基于小鼠模型，人类数据的验证有限，且样本年龄点较少 | 探究阿尔茨海默病相关tau蛋白病中性别特异性和性别二态性转录组变化的细胞类型特异性及年龄依赖性 | THY-Tau22转基因小鼠和野生型小鼠的皮质组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 17月龄和7月龄的THY-Tau22及野生型小鼠皮质组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 136 | 2025-12-17 |
EryDB: A Transcriptomic Profile Database for Erythropoiesis and Erythroid-related Diseases
2025-05-30, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae029
PMID:39436241
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研究论文 | 本文介绍了EryDB，一个专为红细胞生成和红细胞相关疾病设计的开放获取转录组数据库，整合了多种物种和疾病的数据 | EryDB是首个全面整合红细胞生成和红细胞相关疾病转录组数据的数据库，支持单细胞和批量RNA测序数据的计算分析 | 数据库目前仅包含三个物种的数据，可能未覆盖所有相关疾病或组织类型 | 构建一个综合数据库以促进红细胞生成和红细胞相关疾病的基因表达数据挖掘和大规模研究 | 红细胞生成过程、红细胞相关疾病以及来自人类、小鼠和斑马鱼的转录组数据 | 生物信息学 | 红细胞相关疾病 | RNA测序（包括单细胞和批量RNA测序） | NA | 转录组数据 | 3803个样本和1,187,119个单细胞，来自107项公共研究 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 137 | 2025-12-17 |
CIEC: Cross-tissue Immune Cell Type Enrichment and Expression Map Visualization for Cancer
2025-05-10, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae067
PMID:39363510
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研究论文 | 本文介绍了一个名为CIEC的基于网络的应用程序，用于跨组织免疫细胞类型或状态的富集分析和可视化，以探索癌症患者的免疫细胞特征 | 首次开发了一个集成数据库和富集分析的网络应用程序，用于估计跨组织免疫细胞类型或状态，并提供了多组织免疫细胞特征的全面分析界面 | 样本量相对有限（323名患者），且仅覆盖了特定癌症类型和组织的480个样本，可能无法代表所有癌症或免疫细胞状态 | 通过整合单细胞转录组测序数据，构建跨组织免疫细胞类型/状态图谱，以深入理解肿瘤免疫系统并指导癌症免疫生物标志物开发和免疫治疗策略 | 癌症患者的免疫细胞，包括来自原发性肿瘤、邻近正常组织、淋巴结、转移组织和外周血的样本 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞转录组测序 | KOBAS算法 | 单细胞RNA-seq数据 | 323名癌症患者的480个样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 138 | 2025-12-16 |
Brain tumors induce immunoregulatory dendritic cells in draining lymph nodes that can be targeted by OX40 agonist treatment
2025-May-19, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011548
PMID:40389372
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研究论文 | 本研究探讨了脑肿瘤如何诱导引流淋巴结中的免疫调节性树突状细胞，并发现OX40激动剂治疗可靶向这些细胞 | 揭示了脑肿瘤引流淋巴结中树突状细胞的独特免疫调节功能，并首次将OX40信号通路与CCR7+OX40+树突状细胞的直接作用及对T细胞的间接影响联系起来 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；未详细探讨其他免疫细胞或信号通路在脑肿瘤免疫微环境中的潜在作用 | 研究脑肿瘤免疫微环境中树突状细胞的免疫调节功能及其对治疗反应的影响 | 小鼠胶质瘤和淋巴瘤模型中的树突状细胞及T细胞 | 免疫学 | 脑肿瘤 | 高分辨率流式细胞术、单细胞RNA测序、体外和体内功能表征 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据 | 小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 139 | 2025-12-15 |
O-GlcNAcylation stabilized WTAP promotes GBM malignant progression in an N6-methyladenosine-dependent manner
2025-May-15, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae268
PMID:39671515
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研究论文 | 本文探讨了O-GlcNAcylation稳定的WTAP通过N6-甲基腺苷依赖方式促进胶质母细胞瘤恶性进展的机制 | 揭示了WTAP通过O-GlcNAcylation和去泛素化增强稳定性，调控LOXL2的m6A修饰，进而影响胶质母细胞瘤干细胞间充质转化和免疫微环境形成的新机制 | NA | 研究m6A在胶质母细胞瘤免疫抑制微环境形成中的作用机制 | 间充质胶质母细胞瘤干细胞和髓源性巨噬细胞 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq、质谱分析、RNA免疫沉淀、共免疫沉淀 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 140 | 2025-12-15 |
scRegulate: Single-Cell Regulatory-Embedded Variational Inference of Transcription Factor Activity from Gene Expression
2025-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.17.649372
PMID:40654959
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scRegulate的生成式深度学习框架，用于从单细胞RNA测序数据中推断转录因子活性 | scRegulate通过变分推理整合基因调控网络先验知识，提供了一种可扩展且生物学可解释的解决方案，能够捕获新颖、动态和上下文特定的调控相互作用 | NA | 开发一种从单细胞RNA测序数据中准确推断转录因子活性的计算方法 | 转录因子活性和基因调控网络 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 生成式深度学习框架，变分推理 | 单细胞RNA测序数据 | 多个公共实验和合成数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |