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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-10-06 |
A human and mouse subpopulation of senescent β-cells induces pathologic dysfunction through targetable paracrine signaling
2025-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.07.648438
PMID:40654723
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研究论文 | 本研究通过鉴定人和小鼠衰老β细胞亚群,揭示其通过可靶向的旁分泌信号诱导病理功能障碍的机制 | 首次在人和小鼠中鉴定出表达特定标志物的衰老β细胞亚群,并证明其分泌的SASP因子可诱导继发性衰老和β细胞功能障碍 | NA | 研究衰老β细胞亚群的异质性及其在糖尿病病理过程中的作用 | 人和小鼠的胰腺β细胞 | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,空间转录组学,空间蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,蛋白质组数据 | 高脂饮食喂养的小鼠和来自2型糖尿病供体的人类胰岛 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 102 | 2025-10-06 |
EZH2 coordinates memory B-cell programming and recall responses
2025-May-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf004
PMID:40073167
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研究论文 | 本研究揭示了组蛋白甲基转移酶EZH2在记忆B细胞编程和回忆应答中的关键调控作用 | 首次系统阐明EZH2通过表观遗传机制调控记忆B细胞分化和功能潜能的分子机制 | EZH2敲除不完全,存在选择性压力维持其甲基转移酶活性,可能影响表型分析的准确性 | 探究表观遗传酶EZH2在记忆B细胞形成和功能调控中的作用机制 | 小鼠记忆B细胞 | 免疫学 | 流感感染 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 103 | 2025-10-06 |
High-resolution comparative single-cell transcriptomics of doublesex-expressing neurons reveals evolutionary conservation and diversity of sexual circuits in Drosophila
2025-May-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.06.652433
PMID:40654601
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研究论文 | 通过单细胞转录组学比较分析果蝇属中表达doublesex基因的神经元,揭示性行为神经回路在进化中的保守性和多样性 | 首次在多个果蝇物种中系统比较性决定基因表达神经元的单细胞转录组,揭示细胞类型作为独立进化单元的特性 | 研究主要关注doublesex表达神经元,可能未涵盖所有参与性行为的神经元类型 | 探究神经回路在进化过程中的细胞和分子组成变化机制 | 果蝇属多个物种中表达doublesex基因的神经元细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 四个果蝇物种的雄性个体,包括一个物种的雌性数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 104 | 2025-10-06 |
Preterm birth increases susceptibility to hyperglycemia induced glomerular alterations in male mice
2025-May-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-00103-5
PMID:40442182
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研究论文 | 本研究探讨早产如何增加雄性小鼠在高血糖条件下肾小球和肾小管损伤的易感性 | 首次揭示早产通过破坏内皮细胞-足细胞相互作用增加糖尿病肾病易感性的机制 | 仅使用雄性小鼠模型,未研究雌性个体的反应 | 确定早产对高血糖暴露后肾脏健康的影响 | CD-1品系早产(19天孕龄)和足月产(20天孕龄)雄性小鼠 | 肾脏病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序,组织学分析,分子生物学技术,成像技术 | 小鼠糖尿病模型 | 基因表达数据,组织图像,生理参数 | 早产和足月产雄性小鼠群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 105 | 2025-10-06 |
D-SPIN constructs gene regulatory network models from multiplexed scRNA-seq data revealing organizing principles of cellular perturbation response
2025-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.19.537364
PMID:37131803
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研究论文 | 提出D-SPIN计算框架,从多重单细胞RNA测序数据构建基因调控网络模型 | 开发能处理数千种不同扰动条件的单细胞mRNA-seq数据的概率建模框架 | NA | 揭示细胞信息处理和生理控制原理 | 基因调控网络和细胞状态分布 | 计算生物学 | NA | 单细胞mRNA测序 | 概率模型 | 单细胞RNA测序数据 | 数千种不同扰动条件 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 106 | 2025-10-06 |
Quantification of single cell-type-specific alternative transcript initiation
2025-May-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.29.651292
PMID:40654755
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研究论文 | 开发了一种名为TSRdetector的新型生物信息学方法,用于检测不同组织、细胞类型或疾病中基因转录起始区域使用的显著变化 | 首个专门设计用于在单细胞类型水平分析基因转录起始区域差异使用的生物信息学工具 | 方法验证仅限于肾脏疾病、B细胞分化和多能性转换等特定生物学场景 | 探索不同组织和细胞类型中基因转录起始区域的选择性激活机制 | 人类肾脏细胞、小鼠B细胞、人类胚胎干细胞 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | 生物信息学算法 | RNA测序数据 | 多个数据集(包括健康与糖尿病患者肾脏、小鼠B细胞分化、人类ESC多能性转换) | 10x Genomics | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | 10x Chromium | 10x单核RNA测序 |
| 107 | 2025-10-06 |
Integrating Single-Cell Sequencing and Transcriptome Analysis to Investigate the Role of Ferroptosis in Ischemic Stroke and the Molecular Mechanisms of Immune Checkpoints
2025-05, World neurosurgery
IF:1.9Q2
DOI:10.1016/j.wneu.2025.123908
PMID:40118372
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研究论文 | 通过整合单细胞测序和转录组分析,研究铁死亡在缺血性脑卒中中的作用及免疫检查点的分子机制 | 首次结合单细胞转录组数据和机器学习算法识别缺血性脑卒中中铁死亡相关关键基因,并探索其与免疫细胞浸润的关联 | 研究基于单一数据集GSE247474,需要更多独立队列验证 | 识别缺血性脑卒中中铁死亡相关关键基因,探索其分子机制和早期诊断价值 | 星形胶质细胞和T细胞亚群 | 生物信息学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞RNA-seq, 转录组分析 | Lasso回归, 支持向量机 | 单细胞转录组数据 | GSE247474数据集中的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 108 | 2025-10-06 |
Meningeal-derived retinoic acid regulates neurogenesis via suppression of Notch and Sox2
2025-May-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115637
PMID:40310723
|
研究论文 | 本研究揭示脑膜来源的视黄酸通过抑制Notch和Sox2通路调控神经发生的新机制 | 首次发现脑膜来源的视黄酸通过结合Sox2ot启动子抑制Notch信号通路和Sox2表达,从而促进神经发生 | 研究主要基于Foxc1突变胚胎模型,机制验证仍需进一步扩展 | 探究脑膜来源视黄酸调控端脑神经前体细胞神经发生的分子机制 | 小鼠胚胎端脑神经前体细胞 | 发育神经生物学 | 神经发育障碍 | 空间转录组学,RARα DNA结合分析,子宫内电穿孔 | Foxc1突变胚胎模型 | 基因表达数据,DNA结合数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 109 | 2025-10-06 |
Exploring the immune environment of glioblastoma through single-cell RNA sequencing in humanized mouse models
2025-May-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.17.654526
PMID:40475625
|
研究论文 | 通过人源化小鼠模型中的单细胞RNA测序探索胶质母细胞瘤的免疫环境 | 建立了利用患者来源异种移植的人源化小鼠胶质母细胞瘤模型,该模型能更好地模拟复发性胶质母细胞瘤的免疫特征 | 模型基于免疫缺陷小鼠,可能无法完全模拟人类完整的免疫系统功能 | 研究胶质母细胞瘤的肿瘤免疫微环境并评估新疗法 | 人源化小鼠模型中的胶质母细胞瘤患者来源异种移植 | 单细胞测序分析 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 两个免疫缺陷小鼠模型,使用人脐带血来源的CD34+造血干细胞祖细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 110 | 2025-10-06 |
Sex differences in adenosine deaminase activity associate with disparities in SARS-CoV-2 innate immunity
2025-May-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112418
PMID:40343269
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研究论文 | 本研究揭示腺苷脱氨酶活性性别差异与SARS-CoV-2先天免疫差异的关联机制 | 首次发现女性ADA活性较低与内源性逆转录病毒-干扰素刺激基因信号增强的关联,并阐明IL-18驱动性别特异性ADA2表达的机制 | 样本来源和数量未明确说明,机制研究仍需进一步验证 | 探究抗病毒免疫性别差异的分子机制 | 健康人群和COVID-19患者的血液、肺组织和呼吸道细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 111 | 2025-10-06 |
Enhanced interpretation of immune cell phenotype and function through a rhesus macaque single-cell atlas
2025-May-14, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100849
PMID:40233746
|
研究论文 | 本研究构建了首个以免疫为重点的猕猴单细胞多组织图谱,通过对比转录谱与免疫谱系揭示了无监督聚类在免疫细胞分析中的局限性 | 创建了首个猕猴免疫参考图谱,识别了具有高判别价值的基因程序,包括模拟T/NK细胞成熟的多基因特征 | 无监督聚类在T细胞和自然杀伤细胞分析中会导致功能不同亚群的系统性混合 | 提高通过单细胞图谱解读免疫细胞表型和功能的准确性 | 猕猴免疫细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 转录组数据 | 多组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 112 | 2025-10-06 |
Reparative immunological consequences of stem cell transplantation as a cellular therapy for refractory Crohn's disease
2025-May-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-333558
PMID:39961646
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研究论文 | 本研究探讨自体造血干细胞移植治疗难治性克罗恩病的免疫修复机制 | 首次揭示干细胞移植通过影响肠道髓系细胞谱系发挥治疗作用,并发现克罗恩病患者造血干细胞功能异质性 | 样本量较小(n=19),为单臂II期研究 | 理解干细胞移植后免疫系统重建机制及其作为细胞疗法的潜在作用 | 难治性克罗恩病成人患者 | 数字病理 | 克罗恩病 | scRNA-seq, CyTOF, 小鼠异种移植模型 | NA | 血液样本, 肠道组织样本 | 19例难治性克罗恩病患者 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 113 | 2025-10-06 |
Citrullination of NF-κB p65 by PAD2 as a Novel Therapeutic Target for Modulating Macrophage Polarization in Acute Lung Injury
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413253
PMID:40087815
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研究论文 | 本研究发现了PAD2对NF-κB p65的新型瓜氨酸化修饰机制,并开发了靶向M1巨噬细胞的纳米药物治疗急性肺损伤 | 首次发现NF-κB p65在精氨酸171位点的PAD2介导瓜氨酸化修饰,并开发了ICAM-1抗体靶向的金纳米颗粒递送系统 | 研究主要聚焦于铜绿假单胞菌诱导的急性肺损伤模型,其他病因的ALI是否适用仍需验证 | 探索PAD2调控巨噬细胞极化的分子机制并开发急性肺损伤的新型治疗策略 | 巨噬细胞极化过程及铜绿假单胞菌诱导的急性肺损伤小鼠模型 | 分子生物学与纳米医学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序, 质谱蛋白质组学, 纳米颗粒递送系统 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 114 | 2025-10-06 |
Histological signatures map anti-fibrotic factors in mouse and human lungs
2025-May, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08727-3
PMID:40108456
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研究论文 | 本研究通过空间表型分析和小鼠肺纤维化模型,绘制了促纤维化和抗纤维化因子的图谱 | 首次将时空分辨的基质转化与多组学数据整合,识别了具有功能价值的促纤维化与抗纤维化特征 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据验证仍需进一步扩展 | 探索肺纤维化过程中基质结构与纤维细胞亚型的功能作用 | 小鼠和人类肺组织,特发性肺纤维化患者样本 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞测序,空间转录组学,蛋白质水平空间表型分析 | NA | 组织图像,单细胞测序数据,空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | NA |
| 115 | 2025-10-06 |
Spatial characterization of interface dermatitis in cutaneous lupus reveals novel chemokine ligand-receptor pairs that drive disease
2025-May-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.05.574422
PMID:38260617
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研究论文 | 本研究通过空间多组学技术揭示了皮肤红斑狼疮界面皮炎中角质细胞损伤驱动淋巴细胞募集的分子机制 | 首次系统描绘了皮肤红斑狼疮界面皮炎中角质细胞损伤到免疫细胞募集的完整信号通路,并鉴定出AIM2-Casp8-IL-18-CXCL6/CXCR1和CCL8/CCR2等新型趋化因子配体-受体对 | 样本量相对有限,研究主要聚焦于特定临床亚型 | 阐明皮肤红斑狼疮界面皮炎的免疫发病机制 | 皮肤红斑狼疮患者的水疱活检组织和穿刺活检组织 | 数字病理学 | 皮肤红斑狼疮 | 光谱流式细胞术, 96重免疫分析靶向蛋白质组学, 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 数字空间分析 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据, 流式细胞数据 | 皮肤红斑狼疮患者和健康供者的活检样本 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 靶向蛋白质组学 | 数字空间分析技术 | 96重免疫分析靶向蛋白质组学检测皮肤间质液中184种蛋白质分析物 |
| 116 | 2025-10-06 |
Avian photoreceptor homologies and the origin of double cones
2025-May-19, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2025.02.040
PMID:40250431
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究鸟类光感受器的进化关系,发现双锥细胞的两个组成部分分别起源于祖先红色和蓝色视锥细胞 | 首次系统探索鸟类光感受器与其他脊椎动物的同源关系,提出双锥细胞两个组成部分分别起源于不同祖先视锥细胞的新假说 | 研究主要基于新孵化鸡的视网膜,可能无法完全代表所有鸟类物种 | 追溯鸟类光感受器细胞类型在物种间的进化同源关系 | 鸟类(鸡)和绿安乐蜥的光感受器细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据 | 新孵化鸡的视网膜细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 117 | 2025-10-06 |
High KYNU Expression Is Associated with Poor Prognosis, KEAP1/STK11 Mutations, and Immunosuppressive Metabolism in Patient-Derived but Not Murine Lung Adenocarcinomas
2025-May-16, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17101681
PMID:40427178
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现KYNU基因在肺腺癌中的双峰表达模式与患者预后不良相关,并揭示了其在免疫抑制代谢中的作用 | 首次系统揭示KYNU在肺腺癌中的双峰表达特征及其与KEAP1/STK11共突变的关联,发现其在人类与小鼠模型中表达模式的物种特异性差异 | 人类与小鼠模型中KYNU表达模式存在显著差异,这为临床前建模带来挑战 | 发现与肺腺癌患者预后相关的双峰表达基因,揭示其潜在的致癌基因型和治疗靶点 | 肺腺癌患者样本和鼠类肺腺癌模型 | 癌症基因组学 | 肺腺癌 | 单细胞转录组学、代谢组学、批量转录组分析 | 模型聚类分析 | 基因表达数据、突变数据、代谢物数据 | 多个肺腺癌数据集(具体样本数未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 118 | 2025-10-06 |
Direct microglia replacement reveals pathologic and therapeutic contributions of brain macrophages to a monogenic neurological disease
2025-May-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.03.019
PMID:40311614
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研究论文 | 本研究通过直接替换小胶质细胞揭示了脑巨噬细胞在单基因神经疾病中的病理和治疗作用 | 首次通过直接小胶质细胞替换证明CNS限制性巨噬细胞替换可改善单基因神经退行性疾病 | 研究主要使用小鼠模型,人类临床应用仍需进一步验证 | 探究巨噬细胞在GLD疾病病理和HSCT治疗中的作用机制 | Krabbe疾病(GLD)小鼠模型和人类脑标本 | 神经科学 | 单基因神经退行性疾病 | 单细胞测序, 基因消融, 直接微胶质细胞替换 | twitcher (Galc) 小鼠模型 | 单细胞测序数据, 组织病理学数据 | 小鼠模型和人类脑标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 119 | 2025-10-06 |
Decoding sexual dimorphism of the sex-shared nervous system at single-neuron resolution
2025-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.27.630541
PMID:40654890
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析性别共享神经系统中神经元水平的分子二态性 | 首次在单神经元分辨率揭示性别共享神经系统的广泛分子二态性,发现神经肽和信号相关基因的强烈性别偏好表达 | 研究仅针对成年雄性和雌雄同体线虫,未涵盖其他发育阶段或物种 | 探究遗传性别如何在单神经元水平塑造神经系统的分子结构 | 成年雄性和雌雄同体线虫的性别共享神经元 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成年雄性和雌雄同体线虫的神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 120 | 2025-10-06 |
CXCL12+ fibroblastic reticular cells in lymph nodes facilitate immune tolerance by regulating T cell-mediated alloimmunity
2025-May-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI182709
PMID:40309773
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现淋巴结中CXCL12高表达的成纤维网状细胞通过调节T细胞介导的同种免疫反应促进移植耐受 | 首次鉴定出淋巴结中特定的CXCL12hi FRCs亚群,并证明其在调节移植免疫耐受中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需进一步深入 | 探究特定FRC亚群在控制同种免疫反应中的作用机制 | 小鼠和人类淋巴结中的成纤维网状细胞及T细胞 | 免疫学 | 移植免疫 | 单细胞RNA测序, 遗传缺失技术, 纳米递送技术 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 心脏移植小鼠的初始和引流淋巴结, 人类淋巴结样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |