单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202505-202505] [清除筛选条件]
当前共找到 813 篇文献,本页显示第 81 - 100 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2025-10-06
Interpretable Machine Learning reveals the Role of PANoptosis in the Diagnosis and Subtyping of NAFLD
2025-05, Immunobiology IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过可解释机器学习揭示了PANoptosis在NAFLD诊断、分型及免疫微环境重塑中的关键作用 首次整合多组学数据和可解释机器学习方法,系统解析PANoptosis在NAFLD中的作用机制,并识别出9个枢纽基因和潜在治疗药物 NA 探究PANoptosis在非酒精性脂肪肝病诊断、分型和免疫微环境重塑中的作用 非酒精性脂肪肝病患者 机器学习 非酒精性脂肪肝病 单细胞测序,分子对接,pan-cancer分析 可解释机器学习,无监督共识聚类 基因表达数据,单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
82 2025-10-06
Prg4+ fibro-adipogenic progenitors in muscle are crucial for bone fracture repair
2025-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了肌肉中Prg4+纤维脂肪祖细胞在骨骨折修复中的关键作用 首次发现Prg4标记的FAP亚群能从肌肉迁移至骨折部位并分化为软骨细胞和骨细胞 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 探究肌肉细胞在骨骨折修复中的贡献机制 小鼠肌肉组织和骨骨折模型 细胞生物学 骨损伤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
83 2025-10-06
MACanalyzeR scRNAseq analysis tool reveals PPARγHIGH/GDF15HIGH lipid-associated macrophages facilitate thermogenic expansion in BAT
2025-May-31, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 开发用于单细胞RNA测序分析的MACanalyzeR工具,揭示PPARγHIGH/GDF15HIGH脂质相关巨噬细胞在棕色脂肪组织产热扩张中的作用 开发了专门用于单核细胞/巨噬细胞代谢谱分析的scRNAseq工具MACanalyzeR,并首次发现Pparg脂质相关巨噬细胞通过分泌GDF15调节棕色脂肪组织稳态 研究仅使用雄性小鼠模型,未涉及雌性动物或人类样本 探究巨噬细胞在棕色脂肪组织功能和代谢调节中的作用机制 肥胖雄性小鼠模型(db/db和高脂饮食喂养小鼠)的棕色脂肪组织 单细胞转录组学 肥胖代谢疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 两种肥胖小鼠模型(db/db和高脂饮食喂养小鼠) NA 单细胞RNA测序 NA NA
84 2025-10-06
Reconstructing Dynamic Gene Regulatory Networks Using f-Divergence from Time-Series scRNA-Seq Data
2025-May-30, Current issues in molecular biology IF:2.8Q3
研究论文 提出一种基于f-散度的动态基因调控网络推断方法f-DyGRN,用于从时间序列单细胞RNA测序数据重建动态基因调控网络 首次将f-散度应用于量化单细胞基因表达的时间变异,结合Granger因果关系模型和移动窗口策略捕捉动态调控变化 方法性能依赖于合适的f-散度度量选择,且仅使用THP-1细胞数据进行验证 从时间序列单细胞RNA测序数据推断动态基因调控网络 THP-1人髓系单核细胞白血病细胞的单细胞RNA测序数据 生物信息学 白血病 单细胞RNA测序 f-DyGRN(基于f-散度的动态基因调控网络模型),Granger因果关系模型 单细胞RNA测序数据,时间序列数据 模拟数据和真实THP-1细胞单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
85 2025-10-06
NPAS4 Depletion in POMC Neurons Protects From Obesity and Alters the Feeding-regulated Transcriptome in Male Mice
2025-May-19, Endocrinology IF:3.8Q2
研究论文 本研究揭示了转录因子NPAS4在POMC神经元中对摄食行为的调控作用 首次发现NPAS4在POMC神经元中被摄食刺激诱导,并证明其缺失通过改变抑制性GABA能信号传导来调控摄食行为 研究仅使用雄性小鼠,未评估性别差异;机制研究仍需进一步深入 探究NPAS4在POMC神经元中对摄食调控的作用机制 雄性小鼠的POMC神经元 神经科学 肥胖症 条件性基因敲除,单细胞RNA测序 基因敲除小鼠模型 基因表达数据,单细胞转录组数据 未明确样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
86 2025-10-06
A human and mouse subpopulation of senescent β-cells induces pathologic dysfunction through targetable paracrine signaling
2025-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过鉴定人和小鼠衰老β细胞亚群,揭示其通过可靶向的旁分泌信号诱导病理功能障碍的机制 首次在人和小鼠中鉴定出表达特定标志物的衰老β细胞亚群,并证明其分泌的SASP因子可诱导继发性衰老和β细胞功能障碍 NA 研究衰老β细胞亚群的异质性及其在糖尿病病理过程中的作用 人和小鼠的胰腺β细胞 单细胞生物学 糖尿病 单细胞RNA测序,流式细胞术,空间转录组学,空间蛋白质组学 NA 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,蛋白质组数据 高脂饮食喂养的小鼠和来自2型糖尿病供体的人类胰岛 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
87 2025-10-06
EZH2 coordinates memory B-cell programming and recall responses
2025-May-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 本研究揭示了组蛋白甲基转移酶EZH2在记忆B细胞编程和回忆应答中的关键调控作用 首次系统阐明EZH2通过表观遗传机制调控记忆B细胞分化和功能潜能的分子机制 EZH2敲除不完全,存在选择性压力维持其甲基转移酶活性,可能影响表型分析的准确性 探究表观遗传酶EZH2在记忆B细胞形成和功能调控中的作用机制 小鼠记忆B细胞 免疫学 流感感染 单细胞RNA测序 基因敲除小鼠模型 基因表达数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
88 2025-10-06
High-resolution comparative single-cell transcriptomics of doublesex-expressing neurons reveals evolutionary conservation and diversity of sexual circuits in Drosophila
2025-May-10, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过单细胞转录组学比较分析果蝇属中表达doublesex基因的神经元,揭示性行为神经回路在进化中的保守性和多样性 首次在多个果蝇物种中系统比较性决定基因表达神经元的单细胞转录组,揭示细胞类型作为独立进化单元的特性 研究主要关注doublesex表达神经元,可能未涵盖所有参与性行为的神经元类型 探究神经回路在进化过程中的细胞和分子组成变化机制 果蝇属多个物种中表达doublesex基因的神经元细胞 神经科学 NA 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序数据 四个果蝇物种的雄性个体,包括一个物种的雌性数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
89 2025-10-06
Preterm birth increases susceptibility to hyperglycemia induced glomerular alterations in male mice
2025-May-29, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究探讨早产如何增加雄性小鼠在高血糖条件下肾小球和肾小管损伤的易感性 首次揭示早产通过破坏内皮细胞-足细胞相互作用增加糖尿病肾病易感性的机制 仅使用雄性小鼠模型,未研究雌性个体的反应 确定早产对高血糖暴露后肾脏健康的影响 CD-1品系早产(19天孕龄)和足月产(20天孕龄)雄性小鼠 肾脏病理学 糖尿病肾病 单细胞RNA测序,组织学分析,分子生物学技术,成像技术 小鼠糖尿病模型 基因表达数据,组织图像,生理参数 早产和足月产雄性小鼠群体 NA 单细胞RNA测序 NA NA
90 2025-10-06
D-SPIN constructs gene regulatory network models from multiplexed scRNA-seq data revealing organizing principles of cellular perturbation response
2025-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出D-SPIN计算框架,从多重单细胞RNA测序数据构建基因调控网络模型 开发能处理数千种不同扰动条件的单细胞mRNA-seq数据的概率建模框架 NA 揭示细胞信息处理和生理控制原理 基因调控网络和细胞状态分布 计算生物学 NA 单细胞mRNA测序 概率模型 单细胞RNA测序数据 数千种不同扰动条件 NA 单细胞RNA-seq NA NA
91 2025-10-06
Quantification of single cell-type-specific alternative transcript initiation
2025-May-04, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了一种名为TSRdetector的新型生物信息学方法,用于检测不同组织、细胞类型或疾病中基因转录起始区域使用的显著变化 首个专门设计用于在单细胞类型水平分析基因转录起始区域差异使用的生物信息学工具 方法验证仅限于肾脏疾病、B细胞分化和多能性转换等特定生物学场景 探索不同组织和细胞类型中基因转录起始区域的选择性激活机制 人类肾脏细胞、小鼠B细胞、人类胚胎干细胞 生物信息学 糖尿病肾病 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 生物信息学算法 RNA测序数据 多个数据集(包括健康与糖尿病患者肾脏、小鼠B细胞分化、人类ESC多能性转换) 10x Genomics single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq 10x Chromium 10x单核RNA测序
92 2025-10-06
Integrating Single-Cell Sequencing and Transcriptome Analysis to Investigate the Role of Ferroptosis in Ischemic Stroke and the Molecular Mechanisms of Immune Checkpoints
2025-05, World neurosurgery IF:1.9Q2
研究论文 通过整合单细胞测序和转录组分析,研究铁死亡在缺血性脑卒中中的作用及免疫检查点的分子机制 首次结合单细胞转录组数据和机器学习算法识别缺血性脑卒中中铁死亡相关关键基因,并探索其与免疫细胞浸润的关联 研究基于单一数据集GSE247474,需要更多独立队列验证 识别缺血性脑卒中中铁死亡相关关键基因,探索其分子机制和早期诊断价值 星形胶质细胞和T细胞亚群 生物信息学 缺血性脑卒中 单细胞RNA-seq, 转录组分析 Lasso回归, 支持向量机 单细胞转录组数据 GSE247474数据集中的样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
93 2025-10-06
Meningeal-derived retinoic acid regulates neurogenesis via suppression of Notch and Sox2
2025-May-27, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究揭示脑膜来源的视黄酸通过抑制Notch和Sox2通路调控神经发生的新机制 首次发现脑膜来源的视黄酸通过结合Sox2ot启动子抑制Notch信号通路和Sox2表达,从而促进神经发生 研究主要基于Foxc1突变胚胎模型,机制验证仍需进一步扩展 探究脑膜来源视黄酸调控端脑神经前体细胞神经发生的分子机制 小鼠胚胎端脑神经前体细胞 发育神经生物学 神经发育障碍 空间转录组学,RARα DNA结合分析,子宫内电穿孔 Foxc1突变胚胎模型 基因表达数据,DNA结合数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
94 2025-10-06
Exploring the immune environment of glioblastoma through single-cell RNA sequencing in humanized mouse models
2025-May-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过人源化小鼠模型中的单细胞RNA测序探索胶质母细胞瘤的免疫环境 建立了利用患者来源异种移植的人源化小鼠胶质母细胞瘤模型,该模型能更好地模拟复发性胶质母细胞瘤的免疫特征 模型基于免疫缺陷小鼠,可能无法完全模拟人类完整的免疫系统功能 研究胶质母细胞瘤的肿瘤免疫微环境并评估新疗法 人源化小鼠模型中的胶质母细胞瘤患者来源异种移植 单细胞测序分析 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫组织化学 NA 单细胞RNA测序数据 两个免疫缺陷小鼠模型,使用人脐带血来源的CD34+造血干细胞祖细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
95 2025-10-06
Sex differences in adenosine deaminase activity associate with disparities in SARS-CoV-2 innate immunity
2025-May-16, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究揭示腺苷脱氨酶活性性别差异与SARS-CoV-2先天免疫差异的关联机制 首次发现女性ADA活性较低与内源性逆转录病毒-干扰素刺激基因信号增强的关联,并阐明IL-18驱动性别特异性ADA2表达的机制 样本来源和数量未明确说明,机制研究仍需进一步验证 探究抗病毒免疫性别差异的分子机制 健康人群和COVID-19患者的血液、肺组织和呼吸道细胞 免疫学 COVID-19 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
96 2025-10-06
Enhanced interpretation of immune cell phenotype and function through a rhesus macaque single-cell atlas
2025-May-14, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 本研究构建了首个以免疫为重点的猕猴单细胞多组织图谱,通过对比转录谱与免疫谱系揭示了无监督聚类在免疫细胞分析中的局限性 创建了首个猕猴免疫参考图谱,识别了具有高判别价值的基因程序,包括模拟T/NK细胞成熟的多基因特征 无监督聚类在T细胞和自然杀伤细胞分析中会导致功能不同亚群的系统性混合 提高通过单细胞图谱解读免疫细胞表型和功能的准确性 猕猴免疫细胞 单细胞基因组学 NA 单细胞RNA测序 无监督聚类分析 转录组数据 多组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
97 2025-10-06
Reparative immunological consequences of stem cell transplantation as a cellular therapy for refractory Crohn's disease
2025-May-07, Gut IF:23.0Q1
研究论文 本研究探讨自体造血干细胞移植治疗难治性克罗恩病的免疫修复机制 首次揭示干细胞移植通过影响肠道髓系细胞谱系发挥治疗作用,并发现克罗恩病患者造血干细胞功能异质性 样本量较小(n=19),为单臂II期研究 理解干细胞移植后免疫系统重建机制及其作为细胞疗法的潜在作用 难治性克罗恩病成人患者 数字病理 克罗恩病 scRNA-seq, CyTOF, 小鼠异种移植模型 NA 血液样本, 肠道组织样本 19例难治性克罗恩病患者 NA 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 NA NA
98 2025-10-06
Citrullination of NF-κB p65 by PAD2 as a Novel Therapeutic Target for Modulating Macrophage Polarization in Acute Lung Injury
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究发现了PAD2对NF-κB p65的新型瓜氨酸化修饰机制,并开发了靶向M1巨噬细胞的纳米药物治疗急性肺损伤 首次发现NF-κB p65在精氨酸171位点的PAD2介导瓜氨酸化修饰,并开发了ICAM-1抗体靶向的金纳米颗粒递送系统 研究主要聚焦于铜绿假单胞菌诱导的急性肺损伤模型,其他病因的ALI是否适用仍需验证 探索PAD2调控巨噬细胞极化的分子机制并开发急性肺损伤的新型治疗策略 巨噬细胞极化过程及铜绿假单胞菌诱导的急性肺损伤小鼠模型 分子生物学与纳米医学 急性肺损伤 单细胞RNA测序, 质谱蛋白质组学, 纳米颗粒递送系统 NA 基因表达数据, 蛋白质组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
99 2025-10-06
Histological signatures map anti-fibrotic factors in mouse and human lungs
2025-May, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究通过空间表型分析和小鼠肺纤维化模型,绘制了促纤维化和抗纤维化因子的图谱 首次将时空分辨的基质转化与多组学数据整合,识别了具有功能价值的促纤维化与抗纤维化特征 研究主要基于小鼠模型,人类数据验证仍需进一步扩展 探索肺纤维化过程中基质结构与纤维细胞亚型的功能作用 小鼠和人类肺组织,特发性肺纤维化患者样本 数字病理学 肺纤维化 单细胞测序,空间转录组学,蛋白质水平空间表型分析 NA 组织图像,单细胞测序数据,空间转录组数据 NA 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium NA
100 2025-10-06
Polyamine acetylation mediates crosstalk between cancer cells and myeloid cells to promote mesenchymal/plurimetabolic states in glioblastoma
2025-May-27, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 本研究揭示了多胺乙酰化通过调节肿瘤细胞代谢和促进与髓系细胞的代谢串扰,驱动胶质母细胞瘤间充质/多代谢状态的形成 首次发现SAT1及其产物N1-乙酰亚精胺在连接肿瘤细胞与肿瘤相关巨噬细胞/髓系细胞代谢活动中的新作用机制 SAT1对肿瘤细胞代谢的影响至少部分由N1-乙酰亚精胺介导,可能存在其他未明确的调控机制 探究多胺代谢重编程如何影响胶质母细胞瘤恶性细胞状态和肿瘤-免疫微环境串扰 人类和小鼠胶质母细胞瘤肿瘤组织及细胞系 癌症代谢研究 胶质母细胞瘤 液相色谱/串联质谱(LC-MS/MS), 单细胞RNA测序, 代谢分析 NA 代谢组数据, 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 代谢组学 NA NA
回到顶部