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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-06 |
Cancer-associated fibroblast heterogeneity in chordoma†
2025-05, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6420
PMID:40088426
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评论 | 本文综述了脊索瘤中癌症相关成纤维细胞(CAF)异质性的最新研究进展 | 定义了脊索瘤中的炎症性CAF亚型(iCAF),该亚型与不良预后和肿瘤侵袭相关 | 区分CAF调控肿瘤表型中的相关性和因果关系仍面临重大挑战 | 研究脊索瘤中癌症相关成纤维细胞的异质性及其在肿瘤进展中的作用 | 脊索瘤肿瘤微环境中的细胞组成,特别是癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 脊索瘤 | 单细胞转录组学,空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 82 | 2025-10-06 |
Immune signatures of megakaryocytes in persistent inflammation-immunosuppression and catabolism syndrome
2025-May-30, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025087
PMID:40443348
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析持续性炎症-免疫抑制和分解代谢综合征患者中巨核细胞的免疫特征 | 首次在PICS中鉴定出五个巨核细胞亚群并揭示其通过CCL5表达和细胞间相互作用调节免疫稳态的新机制 | 样本量较小(11例患者),需要更大规模研究验证 | 探究巨核细胞在PICS中的免疫学作用和分子特征 | 巨核细胞 | 单细胞生物学 | 脓毒症相关免疫功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 11例患者(6例PICS, 5例脓毒症)和5例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 83 | 2025-10-06 |
Dissecting the immune landscape in pediatric high-grade glioma reveals cell state changes under therapeutic pressure
2025-May-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102095
PMID:40315846
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析儿童高级别胶质瘤免疫景观 | 首次全面揭示儿童高级别胶质瘤免疫微环境在治疗压力下的细胞状态变化,并与成人胶质瘤进行对比 | 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 解析儿童高级别胶质瘤免疫微环境特征及其在治疗过程中的变化 | 儿童弥漫性高级别胶质瘤和高级别室管膜瘤患者的恶性细胞、髓系细胞和T细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 84 | 2025-10-06 |
Convergent musk biosynthesis across host and microbiota in musk deer and muskrat
2025-May-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学方法揭示了麝香鹿和麝鼠在麝香生物合成中的多层次趋同进化机制 | 首次发现不同哺乳动物物种间在麝香生物合成中从分子通路到微生物群落的多层次趋同进化现象 | 研究仅聚焦于两个物种,可能无法完全代表所有麝香生产动物的多样性 | 探究哺乳动物气味腺中介导趋同麝香生产的机制基础 | 森林麝香鹿和麝鼠的麝香分泌腺体 | 多组学整合分析 | NA | 单细胞RNA测序,宏基因组学,代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据,宏基因组数据,代谢物数据 | 两个物种的麝香腺体组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,宏基因组测序 | NA | NA |
| 85 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals alterations in the ovarian immune microenvironment regulated by 17β-estradiol in neonatal mice
2025-May-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了17β-雌二醇对新生小鼠卵巢免疫微环境的调控作用 | 首次全面表征新生小鼠卵巢免疫微环境对雌激素的敏感性,发现E2治疗可诱导巨噬细胞从M1向M2表型转换 | 研究仅使用C57BL/6J品系新生小鼠,结果可能不适用于其他发育阶段或品系 | 探究雌激素在卵巢中的免疫调节功能 | 新生小鼠卵巢组织 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | C57BL/6J新生小鼠卵巢样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 86 | 2025-10-06 |
Cell type-specific network analysis in Diversity Outbred mice identifies genes potentially responsible for human bone mineral density GWAS associations
2025-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.20.594981
PMID:38826475
|
研究论文 | 本研究利用多样性远交系小鼠的单细胞转录组数据构建细胞类型特异性网络,识别与人类骨密度GWAS关联的潜在因果基因 | 首次将小鼠骨相关细胞的单细胞转录组数据与人类骨密度GWAS结合,通过细胞状态轨迹分析识别网络驱动基因 | 研究基于小鼠模型,需要进一步实验验证这些基因在人类骨质疏松中的因果作用 | 识别与人类骨密度GWAS关联的潜在因果基因并解析其在骨质疏松中的作用机制 | 多样性远交系小鼠的骨髓来源基质细胞在成骨条件下培养的细胞 | 生物信息学 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序, GWAS, eQTL/sQTL分析 | 网络分析, 轨迹推断 | 单细胞转录组数据, 基因组关联数据 | 多样性远交系小鼠骨髓基质细胞的大规模单细胞数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 87 | 2025-10-06 |
Differential memory enrichment of cytotoxic CD4 T cells in Parkinson's disease patients reactive to α-synuclein
2025-May-14, NPJ Parkinson's disease
DOI:10.1038/s41531-025-00981-6
PMID:40368950
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研究论文 | 本研究探讨帕金森病患者中对α-突触核蛋白有反应的细胞毒性CD4 T细胞的记忆富集差异 | 首次发现CELSR2在PD患者CD4效应记忆T细胞中高表达,并揭示Granulysin CD4细胞毒性T细胞在PD_R患者中减少 | 样本量有限,未涵盖所有PD患者亚型,机制研究尚不完善 | 深入理解对α-突触核蛋白有反应的帕金森病患者T细胞亚群的病理变化 | 帕金森病患者和健康对照者的外周血T细胞 | 免疫学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 帕金森病患者和健康对照者(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 88 | 2025-10-06 |
Sex-dependent effects of peptidylarginine deiminases on neutrophil function and long-term outcomes after spinal cord injury
2025-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.08.652924
PMID:40463031
|
研究论文 | 本研究探讨肽酰精氨酸脱亚氨酶对脊髓损伤后中性粒细胞功能和长期预后的性别依赖性影响 | 首次描述脊髓损伤后PAD介导的中性粒细胞功能存在性别差异,强调临床前研究需纳入两性样本的重要性 | 未观察到PAD4缺失对运动功能恢复的影响,组织保护效应存在性别差异但机制尚不明确 | 探究PADs在脊髓损伤恢复中的作用及性别差异 | 小鼠脊髓损伤模型中的中性粒细胞功能 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序,基因敲除模型,pan-PAD抑制剂处理 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,组织学数据,行为学数据 | 未明确样本数量的小鼠实验模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 89 | 2025-10-06 |
BDNF-GABA signaling in astrocytes: enhancing neural repair after SCI through MSC therapies
2025-05, Spinal cord
IF:2.1Q1
DOI:10.1038/s41393-025-01077-x
PMID:40229538
|
研究论文 | 通过生物信息学分析探索星形胶质细胞在脊髓损伤修复中的作用机制及间充质干细胞治疗的潜在价值 | 首次整合单细胞转录组、空间转录组和bulk RNA-seq数据,系统揭示BDNF调控的GABA信号通路在星形胶质细胞介导的神经修复中的关键作用 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 探索脊髓损伤后星形胶质细胞的变化及其在间充质干细胞治疗中的作用机制 | 星形胶质细胞、间充质干细胞、诱导多能干细胞 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | scRNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq, GSEA | NA | 转录组数据 | 来自GEO数据库的公共数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 90 | 2025-10-06 |
Constructing a cross-tissue human knee single-cell atlas identified osteoarthritis reduces regenerative tissue stem cells while increasing inflammatory pain macrophages
2025-May-05, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6247502/v1
PMID:40386432
|
研究论文 | 构建首个跨组织人类膝关节单细胞图谱,揭示骨关节炎减少再生性组织干细胞同时增加炎症疼痛巨噬细胞 | 首次构建包含关节软骨、半月板、滑膜和软骨下骨的膝关节骨关节炎综合单细胞图谱,发现组织间活跃通讯机制 | NA | 研究骨关节炎的跨组织分子机制和细胞组成变化 | 人类膝关节组织(关节软骨、半月板、滑膜、软骨下骨) | 单细胞组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 91 | 2025-10-06 |
miR-190 is a Key Regulator in Establishing Cell Polarity and Specification in the Drosophila Nervous System
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.28.656688
PMID:40501908
|
研究论文 | 本研究鉴定miR-190作为果蝇神经母细胞极性和分化的关键调控因子 | 首次发现miR-190通过调控Cdc42激活和Par-6定位来建立神经母细胞极性 | 研究仅限于果蝇胚胎神经母细胞,尚未在哺乳动物系统中验证 | 探究miR-190在神经母细胞不对称分裂和命运决定中的分子机制 | 果蝇胚胎神经母细胞和中枢神经系统细胞群体 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,转录组分析,qPCR | NA | RNA测序数据,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 92 | 2025-10-06 |
Comprehensive single-cell profiling of T and B cell subsets in mice reveals impacts on memory immune responses in FMDV infection
2025-05, Virology
IF:2.8Q3
DOI:10.1016/j.virol.2025.110496
PMID:40090183
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析FMDV感染对小鼠T细胞和B细胞亚群记忆免疫反应的影响 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统揭示FMDV感染对记忆免疫细胞的影响机制,并发现Fos相关基因的关键作用 | 研究工具有限,仅针对小鼠脾脏细胞进行分析 | 研究FMDV感染对记忆免疫反应的影响机制 | 小鼠脾脏中的T细胞和B细胞亚群 | 免疫学 | 口蹄疫 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠脾脏细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 93 | 2025-10-06 |
Mechanism and Efficacy of Etanercept in Treating Autoimmune-like Manifestations of Coronavirus Disease 2019 in elderly individuals
2025-05, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2025.152898
PMID:40168796
|
研究论文 | 评估依那西普治疗老年COVID-19患者自身免疫样表现的作用机制和疗效 | 首次通过单细胞测序揭示老年COVID-19患者的自身免疫样表现,并发现依那西普通过抑制PF4和TNF-α发挥治疗作用 | 基于同情使用病例的观察性分析,样本量有限(仅7名治疗患者) | 评估TNF抑制剂依那西普在老年COVID-19患者中的治疗效果 | 老年COVID-19患者(特别是有自身免疫样表现者) | 医学研究 | COVID-19 | 单细胞测序,转录组分析,分子对接 | 观察性分析 | 临床指标数据,单细胞测序数据 | 7名依那西普治疗患者+2名未感染个体,共40万个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 94 | 2025-10-06 |
Novel diagnostic biomarkers regulating macrophages autophagy in ischemic cardiomyopathy: An analysis integrating bulk RNA sequencing with single-cell RNA sequencing
2025-05, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2025.152907
PMID:40300424
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研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA测序和单细胞RNA测序分析,探索缺血性心肌病中巨噬细胞自噬相关的诊断生物标志物 | 首次整合bulk RNA测序和单细胞RNA测序技术,系统识别缺血性心肌病中巨噬细胞自噬相关的诊断生物标志物 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于大鼠模型,需要进一步临床验证 | 探索缺血性心肌病中巨噬细胞自噬相关的诊断生物标志物及其作用机制 | 缺血性心肌病患者组织样本和大鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, WGCNA分析 | PPI网络分析, WGCNA | 基因表达数据 | 使用GSE46224和GSE116250数据集,并在大鼠模型中验证 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 95 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA and TCR repertoire analysis identify markers of virus-specific T cells
2025-05, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2025.152904
PMID:40305898
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研究论文 | 通过单细胞RNA和TCR谱分析识别病毒特异性T细胞的标志物 | 发现7个上调基因可作为早期识别增殖性抗原特异性T细胞的标志物,准确率达93.52% | 样本仅来自健康供体,未在患者群体中验证 | 鉴定用于识别抗原特异性T细胞的生物标志物 | 健康供体的外周血单个核细胞和CD3/CD8 T细胞 | 单细胞分析 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序, TCR谱分析, CFSE染色 | NA | 单细胞RNA测序数据, TCR序列数据 | 健康供体外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 96 | 2025-10-06 |
Interpretable Machine Learning reveals the Role of PANoptosis in the Diagnosis and Subtyping of NAFLD
2025-05, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2025.152909
PMID:40311345
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研究论文 | 本研究通过可解释机器学习揭示了PANoptosis在NAFLD诊断、分型及免疫微环境重塑中的关键作用 | 首次整合多组学数据和可解释机器学习方法,系统解析PANoptosis在NAFLD中的作用机制,并识别出9个枢纽基因和潜在治疗药物 | NA | 探究PANoptosis在非酒精性脂肪肝病诊断、分型和免疫微环境重塑中的作用 | 非酒精性脂肪肝病患者 | 机器学习 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞测序,分子对接,pan-cancer分析 | 可解释机器学习,无监督共识聚类 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 97 | 2025-10-06 |
Prg4+ fibro-adipogenic progenitors in muscle are crucial for bone fracture repair
2025-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.14.654160
PMID:40462922
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研究论文 | 本研究揭示了肌肉中Prg4+纤维脂肪祖细胞在骨骨折修复中的关键作用 | 首次发现Prg4标记的FAP亚群能从肌肉迁移至骨折部位并分化为软骨细胞和骨细胞 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究肌肉细胞在骨骨折修复中的贡献机制 | 小鼠肌肉组织和骨骨折模型 | 细胞生物学 | 骨损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 98 | 2025-10-06 |
MACanalyzeR scRNAseq analysis tool reveals PPARγHIGH/GDF15HIGH lipid-associated macrophages facilitate thermogenic expansion in BAT
2025-May-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60295-2
PMID:40450001
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研究论文 | 开发用于单细胞RNA测序分析的MACanalyzeR工具,揭示PPARγHIGH/GDF15HIGH脂质相关巨噬细胞在棕色脂肪组织产热扩张中的作用 | 开发了专门用于单核细胞/巨噬细胞代谢谱分析的scRNAseq工具MACanalyzeR,并首次发现Pparg脂质相关巨噬细胞通过分泌GDF15调节棕色脂肪组织稳态 | 研究仅使用雄性小鼠模型,未涉及雌性动物或人类样本 | 探究巨噬细胞在棕色脂肪组织功能和代谢调节中的作用机制 | 肥胖雄性小鼠模型(db/db和高脂饮食喂养小鼠)的棕色脂肪组织 | 单细胞转录组学 | 肥胖代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 两种肥胖小鼠模型(db/db和高脂饮食喂养小鼠) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 99 | 2025-10-06 |
Reconstructing Dynamic Gene Regulatory Networks Using f-Divergence from Time-Series scRNA-Seq Data
2025-May-30, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47060408
PMID:40699807
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研究论文 | 提出一种基于f-散度的动态基因调控网络推断方法f-DyGRN,用于从时间序列单细胞RNA测序数据重建动态基因调控网络 | 首次将f-散度应用于量化单细胞基因表达的时间变异,结合Granger因果关系模型和移动窗口策略捕捉动态调控变化 | 方法性能依赖于合适的f-散度度量选择,且仅使用THP-1细胞数据进行验证 | 从时间序列单细胞RNA测序数据推断动态基因调控网络 | THP-1人髓系单核细胞白血病细胞的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | f-DyGRN(基于f-散度的动态基因调控网络模型),Granger因果关系模型 | 单细胞RNA测序数据,时间序列数据 | 模拟数据和真实THP-1细胞单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 100 | 2025-10-06 |
NPAS4 Depletion in POMC Neurons Protects From Obesity and Alters the Feeding-regulated Transcriptome in Male Mice
2025-May-19, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqaf083
PMID:40296822
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子NPAS4在POMC神经元中对摄食行为的调控作用 | 首次发现NPAS4在POMC神经元中被摄食刺激诱导,并证明其缺失通过改变抑制性GABA能信号传导来调控摄食行为 | 研究仅使用雄性小鼠,未评估性别差异;机制研究仍需进一步深入 | 探究NPAS4在POMC神经元中对摄食调控的作用机制 | 雄性小鼠的POMC神经元 | 神经科学 | 肥胖症 | 条件性基因敲除,单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |