单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
901	2025-04-14	The characterization and validation of regulated cell death-related genes in chronic rhinosinusitis with nasal polyps 2025-May-08, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114509 PMID:40158428	研究论文	本研究系统调查了调控性细胞死亡（RCD）机制在慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）发病和进展中的作用	首次在CRSwNP中描绘了8种RCD亚型的激活特征，并构建了具有诊断潜力的细胞死亡指数（CDI）	研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证	探究RCD机制在CRSwNP发病和进展中的作用	慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者	生物信息学	慢性鼻窦炎	转录组分析、WGCNA、LASSO回归、scRNA-seq、qRT-PCR	NA	基因表达数据	多个GEO数据集（GSE136825等）及临床组织样本
902	2025-04-14	Targeting inflammation and necroptosis in diabetic kidney disease: A novel approach via PPARα modulation 2025-May-08, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114562 PMID:40174339	研究论文	本研究探讨了PPARα在糖尿病肾病(DKD)中通过调节炎症和坏死性凋亡的作用机制	首次揭示了PPARα通过抑制RIP1/RIP3/MLKL介导的坏死性凋亡来延缓DKD进展的分子机制	研究主要基于小鼠模型，人类临床应用的转化效果尚需进一步验证	阐明PPARα在DKD中的保护作用机制并探索其治疗潜力	糖尿病肾病小鼠模型和肾小管上皮细胞	分子病理学	糖尿病肾病	单细胞RNA测序、AAV9病毒载体转染	DKD小鼠模型	RNA测序数据	未明确说明样本数量
903	2025-04-14	Multiomic spatial atlas shows deleted in malignant brain tumors 1 (DMBT1) glycoprotein is lost in colonic dysplasia 2025-May, The Journal of pathology IF:5.6Q1 DOI:10.1002/path.6406 PMID:40026233	研究论文	该研究通过多组学空间图谱揭示了在结肠发育不良中DMBT1糖蛋白的缺失	结合单细胞RNA测序、空间转录组学和免疫荧光技术，揭示了DMBT1在炎症与发育不良结肠中的双向调控	研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，可能不完全反映人类结肠癌的全部复杂性	理解结肠肿瘤发生过程中宿主与微生物的相互作用	结肠发育不良和正常结肠组织	数字病理学	结肠癌	scRNA-seq, 空间转录组学, 免疫荧光	NA	RNA-seq数据, 空间转录组数据, 图像数据	小鼠模型和人类腺瘤发育不良样本
904	2025-04-14	Cancer-associated fibroblast heterogeneity in chordoma† 2025-May, The Journal of pathology IF:5.6Q1 DOI:10.1002/path.6420 PMID:40088426	评论	本文讨论了脊索瘤中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的异质性及其在肿瘤进展中的作用	定义了脊索瘤中的炎症性CAF亚型（iCAF），并探讨其与不良预后和肿瘤侵袭的关联	在CAFs调控肿瘤表型中区分相关性和因果关系仍是一个重大挑战	研究脊索瘤中CAFs的异质性及其在肿瘤生态系统中的作用	脊索瘤中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）	数字病理学	脊索瘤	单细胞转录组学和空间转录组学	NA	转录组数据	NA
905	2025-04-14	Leveraging machine learning for integrative analysis of T-cell receptor repertoires in colorectal cancer: Insights into MAIT cell dynamics and risk assessment 2025-May, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102358 PMID:40088748	research paper	该研究通过分析结直肠癌患者的T细胞受体（TCR）库，探讨了MAIT细胞动态与风险评估的关系	发现了在转移性和非转移性患者中MAIT细胞的升高存在，并识别出9对相同的TCR alpha和TCR beta对，这些序列在单细胞和批量数据中均有出现	TCR库存在显著变异性且序列重叠可能性低，样本量相对有限	增强对结直肠癌中TCR库的理解，探索TCR序列作为疾病结果生物标志物的潜力	结直肠癌患者的T细胞受体（TCR）库	machine learning	colorectal cancer	bulk sequencing, single-cell sequencing	NA	sequencing data	205名患者（批量测序数据集）和22名患者（两个单细胞测序数据集）
906	2025-04-14	The Potential Role of C4 MYH11+ Fibroblasts and the MDK-SDC2 Ligand-Receptor Pair in Lung Adenocarcinoma: Implications for Prognosis and Therapeutic Strategies 2025-May, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102364 PMID:40121996	research paper	该研究利用单细胞RNA测序技术分析了九名肺腺癌患者的转录组数据，揭示了肿瘤微环境中的关键细胞亚群和基因表达模式，并提出了MDK-SDC2配体-受体对在肿瘤进展中的作用	研究发现了C4 MYH11+成纤维细胞亚型在肿瘤进展中的作用，并首次提出MDK-SDC2配体-受体对作为肿瘤细胞侵袭、增殖和迁移的关键调节因子	研究样本量较小（仅九名患者），可能限制了结果的普遍性	阐明肺腺癌的肿瘤微环境和关键生物学过程，为预后和治疗策略提供新见解	肺腺癌患者的肿瘤微环境	digital pathology	lung cancer	scRNA-seq	gene-based prognostic model	RNA-seq data	九名肺腺癌患者
907	2025-04-14	Single-cell sequencing reveals PHLDA1-positive smooth muscle cells promote local invasion in head and neck squamous cell carcinoma 2025-May, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102301 PMID:40132389	研究论文	本研究通过单细胞测序技术揭示了PHLDA1阳性平滑肌细胞在头颈部鳞状细胞癌局部侵袭中的关键作用	首次发现PHLDA1阳性平滑肌细胞通过THBS1促进头颈部鳞状细胞癌的侵袭	研究主要基于公共数据库和体外实验，缺乏体内实验验证	探究平滑肌细胞介导的细胞互作在头颈部鳞状细胞癌局部侵袭中的作用	头颈部鳞状细胞癌中的平滑肌细胞	肿瘤微环境	头颈部鳞状细胞癌	单细胞测序、免疫荧光染色、体外实验	NA	单细胞测序数据	来自公共数据库GSE164690和GSE181919的数据
908	2025-04-14	PIS as a regulator of cellular heterogeneity, prognostic significance, and immune landscape in thyroid cancer 2025-May, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102296 PMID:40132388	研究论文	该研究通过单细胞RNA测序技术探索甲状腺癌的细胞组成和基因表达模式，并建立了一个基于特定肿瘤亚群的预后模型	发现了甲状腺癌中不同的肿瘤亚群及其与免疫逃逸特性的关联，提出了基于RGS5+肿瘤亚群的预后模型，并揭示了PIS与遗传不稳定性和免疫治疗反应的关系	研究未提及样本量大小，可能影响结果的普适性	探索甲状腺癌的肿瘤异质性及其对临床预后的影响	甲状腺癌(THCA)的肿瘤细胞和免疫细胞	数字病理学	甲状腺癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	预后模型	基因表达数据	NA
909	2025-04-13	Joint analysis of single-cell RNA sequencing and bulk transcriptome reveals the heterogeneity of the urea cycle of astrocytes in glioblastoma 2025-May, Neurobiology of disease IF:5.1Q1 DOI:10.1016/j.nbd.2025.106835 PMID:39938577	研究论文	通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据，揭示了胶质母细胞瘤中星形胶质细胞尿素循环的异质性，并建立了一个预后模型	首次整合单细胞RNA测序和批量转录组数据，揭示了胶质母细胞瘤中星形胶质细胞尿素循环的异质性，并建立了一个新的预后模型	样本量较小（3对胶质母细胞瘤患者），且仅基于RNA测序数据	研究胶质母细胞瘤中星形胶质细胞尿素循环的异质性并建立预后模型	胶质母细胞瘤患者和星形胶质细胞	数字病理学	胶质母细胞瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序（bulk RNA-seq）	Cox回归模型、LASSO分析	RNA测序数据、临床数据	3对胶质母细胞瘤患者的scRNA-seq数据，TCGA、CGGA和GEO数据库中的批量RNA-seq数据
910	2025-04-13	Dual and spatially resolved drought responses in the Arabidopsis leaf mesophyll revealed by single-cell transcriptomics 2025-May, The New phytologist DOI:10.1111/nph.20446 PMID:40033544	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了拟南芥叶片中叶肉细胞对轻度干旱的双重和空间分辨的响应机制	首次在单细胞水平上揭示了叶肉细胞对轻度干旱的双重响应机制，并提供了一个经过验证的单细胞图谱资源	研究仅针对拟南芥的幼叶，结果可能不适用于其他植物或不同发育阶段的叶片	理解植物在细胞水平上对干旱的响应机制，为工程化提高作物的抗旱性提供基础	拟南芥（Arabidopsis thaliana）的幼叶	植物生物学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	50,797个高质量细胞
911	2025-04-13	Single-cell and spatial transcriptomics analysis reveals that Pros1+ oligodendrocytes are involved in endogenous neuroprotection after brainstem stroke 2025-May, Neurobiology of disease IF:5.1Q1 DOI:10.1016/j.nbd.2025.106855 PMID:40090471	research paper	该研究通过单细胞和空间转录组学分析，揭示了Pros1+少突胶质细胞在脑干卒中后内源性神经保护中的作用	发现了一个新的细胞亚群OLG8细胞，并揭示了Myo1e在促进OLG8细胞分化和减轻缺血性损伤中的作用	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证	探究少突胶质细胞在脑干卒中后神经保护中的机制	小鼠脑干卒中模型中的少突胶质细胞	digital pathology	cardiovascular disease	single-cell RNA sequencing, spatial transcriptomic sequencing	mouse model	RNA-seq	NA
912	2025-04-13	Single-cell transcriptomic analysis reveals AP-1 downregulation remodels bone marrow environment and contributes to osteopenia in ovariectomized mice 2025-May, Journal of orthopaedic translation IF:5.9Q1 DOI:10.1016/j.jot.2025.03.001 PMID:40213116	研究论文	通过单细胞转录组分析揭示AP-1下调重塑骨髓环境并导致卵巢切除小鼠骨质疏松	揭示了AP-1下调通过破坏骨髓稳态导致骨质疏松的新机制，并提出了针对B细胞增殖的IL-7阻断治疗策略	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体验证	探究雌激素缺乏如何改变骨髓细胞组成和信号通路，特别是AP-1的调控作用及其对破骨细胞生成的影响	卵巢切除小鼠的骨髓细胞	单细胞转录组学	骨质疏松	scRNA-seq	小鼠模型	单细胞RNA测序数据	假手术和卵巢切除小鼠的骨髓细胞
913	2025-04-12	Potential Crosstalk Between ANXA1+ Epithelial Cells and FABP4+ TAM Cells of Ferroptosis-Related Molecular Clusters Promotes an Immunosuppressive Microenvironment in Non-Small Cell Lung Cancer 2025-May, Molecular carcinogenesis IF:3.0Q2 DOI:10.1002/mc.23899 PMID:40040274	研究论文	本研究探讨了铁死亡相关分子簇在非小细胞肺癌（NSCLC）肿瘤微环境（TME）中的作用及其对免疫抑制微环境的影响	首次揭示了ANXA1+上皮细胞和FABP4+ TAM细胞亚群通过铁死亡相关分子簇促进NSCLC免疫抑制微环境的机制，并建立了基于这些分子簇的新型预后标志物和治疗靶点	研究样本量相对较小（n=18），且需要进一步实验验证ANXA1和FABP4作为生物标志物的临床适用性	探究铁死亡如何通过重塑肿瘤微环境影响非小细胞肺癌的进展	非小细胞肺癌肿瘤微环境中的细胞亚群	肿瘤生物学	非小细胞肺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	风险评分模型	单细胞转录组数据	85,562个细胞（来自18个样本）
914	2025-04-12	Interleukin-11 expressed in the polyp-enriched fibroblast subset is a potential therapeutic target in Peutz-Jeghers syndrome 2025-May, The Journal of pathology IF:5.6Q1 DOI:10.1002/path.6408 PMID:40070038	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，识别了Peutz-Jeghers综合征（PJS）息肉中富集的成纤维细胞亚群，并发现白细胞介素-11（IL-11）是其关键调控因子及潜在治疗靶点	首次鉴定出PJS息肉中富集的成纤维细胞亚群（pCTF），并揭示IL-11在成纤维细胞重编程中的核心作用，提出IL-11中和抗体作为新型治疗策略	研究主要基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证	探究PJS息肉形成的细胞机制并寻找治疗靶点	Peutz-Jeghers综合征（PJS）患者和小鼠模型的胃肠道息肉	数字病理学	胃肠道息肉病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	Foxl1-Cre介导的Stk11条件性敲除小鼠模型	单细胞转录组数据	PJS小鼠模型息肉及患者息肉样本（具体数量未明确说明）
915	2025-04-10	FoxO1 mediates odontoblast differentiation of hDPSCs via B cell-derived ANGPTL1 in dental caries: A laboratory investigation 2025-May, International endodontic journal IF:5.4Q1 DOI:10.1111/iej.14206 PMID:39904951	research paper	本研究探讨了B细胞及其分泌因子ANGPTL1在龋齿条件下促进人牙髓干细胞(hDPSCs)向成牙本质细胞分化的作用，重点关注FoxO1的激活	揭示了B细胞分泌的ANGPTL1通过上调FoxO1促进hDPSCs向成牙本质细胞分化的新机制	研究主要基于实验室数据，尚未进行临床验证	探索龋齿环境下牙髓修复和再生的分子机制	人牙髓干细胞(hDPSCs)和B细胞	dental research	dental caries	scRNA-Seq, ELISA, 免疫荧光染色, 双荧光素酶报告基因检测, 染色质免疫沉淀	NA	基因表达数据, 蛋白质表达数据	NA
916	2025-04-03	Single‑cell RNA‑Seq reveals PBMC profile alterations in a patient following a radiation accident 2025-May, Experimental and therapeutic medicine IF:2.4Q3 DOI:10.3892/etm.2025.12846 PMID:40165803	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了一名辐射事故患者外周血单核细胞的动态变化	首次应用单细胞RNA测序技术分析辐射暴露后PBMCs的动态变化，揭示了细胞比例变化和信号通路失调	样本量较小，仅包含一名辐射患者和10名健康对照	探究辐射暴露对人体血液免疫反应的影响	辐射事故患者和健康对照者的外周血单核细胞(PBMCs)	生物医学	辐射损伤	单细胞RNA测序(scRNA-Seq)	NA	RNA测序数据	1名辐射患者(两个时间点)和10名健康对照者，共计24,440个细胞
917	2025-03-19	Insight into perfluorooctanoic acid-induced impairment of mouse embryo implantation via single-cell RNA-seq 2025-May-05, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1 DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137375 PMID:39892134	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了全氟辛酸（PFOA）对小鼠胚胎植入的影响及其机制	首次利用单细胞RNA测序技术揭示了PFOA通过干扰ANGPTL信号通路影响子宫内膜上皮细胞功能和发育的具体机制	研究仅限于小鼠模型，未涉及人类样本	探讨PFOA对子宫内膜接受性和胚胎植入的影响及其分子机制	小鼠子宫内膜	生殖医学	不孕症	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	NA
918	2025-03-19	SPP1 + macrophages in colorectal cancer: Markers of malignancy and promising therapeutic targets 2025-May, Genes & diseases IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.gendis.2024.101340 PMID:40092488	研究论文	本研究通过整合单细胞和空间转录组学以及批量测序技术，探讨了SPP1+巨噬细胞在结直肠癌（CRC）肿瘤微环境中的角色和机制	揭示了SPP1+巨噬细胞在CRC中的显著升高及其作为恶性肿瘤标志物的潜力，提出了这些巨噬细胞作为治疗靶点的可能性	研究中未明确提及样本量，且对于SPP1+巨噬细胞的具体作用机制仍需进一步探索	探讨SPP1+巨噬细胞在结直肠癌中的作用及其作为治疗靶点的潜力	结直肠癌（CRC）肿瘤微环境中的SPP1+巨噬细胞	数字病理学	结直肠癌	单细胞转录组学, 空间转录组学, 批量测序	NA	转录组数据	NA
919	2025-03-19	Comprehensive analysis of immune subtype characterization on identification of potential cells and drugs to predict response to immune checkpoint inhibitors for hepatocellular carcinoma 2025-May, Genes & diseases IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.gendis.2024.101471 PMID:40092490	研究论文	本文通过免疫亚型分类，研究了肝细胞癌（HCC）患者对免疫检查点抑制剂（ICIs）反应的预测，并探讨了细胞异质性和候选药物的作用	本研究首次整合了细胞异质性和免疫表型分析，以预测HCC患者对ICIs的反应，并识别了与ICI反应相关的关键细胞和候选药物	研究样本量有限，且未进行大规模临床试验验证	预测肝细胞癌患者对免疫检查点抑制剂的反应，并探索相关细胞和药物	肝细胞癌（HCC）患者	数字病理学	肝癌	单细胞测序技术	NA	基因表达数据	151个免疫相关基因集
920	2025-03-19	The scRNA-sequencing landscape of pancreatic ductal adenocarcinoma revealed distinct cell populations associated with tumor initiation and progression 2025-May, Genes & diseases IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.gendis.2024.101323 PMID:40092486	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术揭示了胰腺导管腺癌（PDAC）中与肿瘤起始和进展相关的不同细胞群体	首次在PDAC患者中通过单细胞RNA测序技术识别了与肿瘤起始和淋巴结转移相关的关键细胞群体和基因	样本量较小，仅包括8名PDAC患者，且未涉及其他类型的胰腺癌	探索胰腺导管腺癌（PDAC）的转录组景观，以理解其发展机制并寻找新的治疗策略	8名不同淋巴结转移状态的PDAC患者	数字病理学	胰腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	8名PDAC患者