单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
861	2025-04-26	Emerging clinical applications of single-cell RNA sequencing in oncology 2025-May, Nature reviews. Clinical oncology DOI:10.1038/s41571-025-01003-3 PMID:40021788	review	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在肿瘤学中的新兴临床应用	总结了scRNA-seq在癌症患者样本研究中的潜在临床相关发现，并突出了四个主要研究方向	讨论了scRNA-seq的局限性以及未来可能提升临床适用性的方法	探讨scRNA-seq在肿瘤学中的临床应用潜力	癌症患者样本	digital pathology	cancer	scRNA-seq	NA	RNA sequencing data	数百项研究中的癌症患者样本
862	2025-04-26	Chemokine (C-C Motif) Ligand 2 Expressing Adventitial Fibroblast Expansion During Loeys-Dietz Syndrome Aortic Aneurysm Formation 2025-May, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322069 PMID:40109260	research paper	该研究通过单细胞转录组学分析，探讨了Loeys-Dietz综合征（LDS）主动脉瘤形成中外膜成纤维细胞的作用及其促炎状态	揭示了LDS主动脉瘤形成中外膜成纤维细胞的促炎状态及其在巨噬细胞招募中的关键作用，与马凡综合征的机制不同	样本量较小，人类LDS手术标本仅5例，对照组仅2例	阐明LDS主动脉瘤发病机制中的细胞状态转变和转录组学变化	小鼠LDS模型（Tgfbr2G357W/+）和人类LDS手术标本的主动脉根/升主动脉	分子病理学	主动脉瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RNA原位杂交、免疫荧光、免疫组织化学	NA	转录组数据、图像数据	小鼠模型（未明确数量）和人类样本（5例LDS，2例对照），共分析超过30,000个细胞
863	2025-04-25	Deciphering the Dysregulating IGF-1-SP1-CD248 Pathway in Fibroblast Functionality during Diabetic Wound Healing 2025-May, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.jid.2024.07.035 PMID:39293711	研究论文	本研究揭示了IGF-1-SP1-CD248通路在糖尿病伤口愈合过程中对成纤维细胞功能的调控作用	首次发现IGF-1通过蛋白激酶B/mTOR信号通路和SP1转录因子调控CD248表达，并阐明TNFα在糖尿病环境中促进IGF-1抵抗的机制	研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床样本验证相对有限	探索糖尿病伤口愈合障碍的分子机制并寻找潜在治疗靶点	糖尿病伤口愈合过程中的成纤维细胞	分子生物学	糖尿病溃疡	单细胞转录组分析、免疫组化染色	NA	基因表达数据、组织样本	糖尿病患者和小鼠的皮肤伤口样本
864	2025-04-25	Profiling Long Noncoding RNA in Psoriatic Skin Using Single-Cell RNA Sequencing 2025-May, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.jid.2024.09.010 PMID:39342985	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术对银屑病患者皮肤中的长链非编码RNA（lncRNA）进行表达谱分析	首次在单细胞水平上对银屑病皮肤中的lncRNA进行系统性的表达谱分析，并鉴定了细胞类型特异性的lncRNA	样本量较小（6名患者），且仅针对银屑病皮肤进行研究	探究lncRNA在银屑病皮肤中的表达模式及其与细胞增殖/表皮分化的关系	银屑病患者的皮损和未受累皮肤组织	基因组学	银屑病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学	NA	RNA测序数据	6名银屑病患者的配对皮损和未受累皮肤样本
865	2025-04-25	Emerging Techniques in Spatial Multiomics: Fundamental Principles and Applications to Dermatology 2025-May, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.jid.2024.09.006 PMID:39503694	review	本文综述了空间多组学技术在皮肤学研究中的基本原理、优势、局限性和应用潜力	空间多组学技术能够同时捕获DNA、基因组可及性、组蛋白修饰和蛋白质，具有空间分辨的单细胞分辨率，为皮肤复杂异质性研究提供了新视角	技术尚处于早期阶段，可能存在一些未解决的技术限制和应用挑战	探讨空间多组学技术在皮肤学研究中的应用潜力	皮肤组织	分子病理学	皮肤病	空间多组学技术	NA	基因组、蛋白质组和表观基因组数据	NA
866	2025-04-25	Human Enteric Glia Diversity in Health and Disease: New Avenues for the Treatment of Hirschsprung Disease 2025-May, Gastroenterology IF:25.7Q1 DOI:10.1053/j.gastro.2024.12.011 PMID:39725172	研究论文	本研究探索了健康与疾病状态下人类肠道神经胶质细胞的多样性，并为赫希施普龙病的治疗提供了新途径	首次在儿科肠道中鉴定出两种主要的肠道神经胶质细胞类别，并揭示了它们在赫希施普龙病中的持续存在，为使用5-HT激动剂治疗提供了新靶点	研究主要基于儿科样本和斑马鱼模型，可能无法完全代表成人或其他物种的情况	探索健康与疾病状态下肠道神经胶质细胞的多样性及其在赫希施普龙病治疗中的潜在应用	儿科肠道样本和赫希施普龙病患者样本，以及野生型和ret突变斑马鱼	神经生物学	赫希施普龙病	单细胞RNA测序、荧光激活细胞分选、免疫荧光、荧光原位杂交	NA	RNA测序数据、荧光图像	儿科对照和赫希施普龙病患者的全层肠切除材料，以及野生型和ret突变斑马鱼
867	2025-04-25	Murine Aortic Valve Cell Heterogeneity at Birth 2025-May, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322280 PMID:40079140	research paper	该研究通过单细胞转录组学分析了出生后第1天小鼠主动脉瓣结构的细胞异质性	发现了一个独特的出生后第1天瓣膜内皮细胞亚群和3个未被充分认识的瓣膜间质细胞亚群	研究仅关注出生后第1天的主动脉瓣细胞异质性，未涵盖其他发育阶段	探索主动脉瓣在出生后成熟过程中建立和维持结构与功能的细胞机制	小鼠主动脉瓣细胞	单细胞转录组学	心血管疾病	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	出生后第1天小鼠主动脉瓣样本
868	2025-04-25	Glucagon-like peptide-1 receptor signaling activation in alveolar type II cells enhances lung development in neonatal rats exposed to hyperoxia 2025-May, Redox biology IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.redox.2025.103586 PMID:40080965	研究论文	本研究探讨了GLP-1R信号在肺泡II型细胞中对高氧暴露新生大鼠肺发育的促进作用及其潜在机制	首次揭示了GLP-1R信号通过调节线粒体分裂和糖代谢促进肺发育的新机制，并发现高氧通过抑制m6A甲基化影响GLP-1R激活	研究仅基于新生大鼠模型，尚未在人类样本中验证	探索GLP-1R在肺发育调控中的作用及其分子机制	新生Sprague-Dawley大鼠的肺泡II型细胞和RLE-6TN细胞	NA	支气管肺发育不良	单细胞RNA测序、Western blotting、双免疫荧光染色、Seahorse XF96代谢分析、MeRIP-qPCR	NA	基因表达数据、蛋白质表达数据、代谢数据	新生大鼠肺组织在不同时间点(3、7、10、14天)的样本
869	2025-04-25	MrgD as a Novel Modeling and Treatment Target for Pulmonary Hypertension 2025-May, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322337 PMID:40143817	研究论文	本研究探讨了MrgD在肺动脉高压（PH）中的作用及其作为治疗靶点的潜力	首次揭示了MrgD在PH中的保护作用及其通过PIM1-AKT-MAZ信号通路调控肺动脉平滑肌细胞增殖的机制	研究主要基于动物模型，人类样本验证有限	探究MrgD在肺动脉高压发病机制中的作用及其治疗潜力	肺动脉高压动物模型（Sugen5416+缺氧、野百合碱诱导）和人类肺动脉平滑肌细胞	心血管疾病研究	肺动脉高压	单细胞测序、RNA测序、分子生物学实验	基因敲除小鼠模型	基因表达数据、细胞增殖数据	多种PH动物模型及人类肺动脉平滑肌细胞
870	2025-04-25	Extracellular vesicle-packaged GBP2 from macrophages aggravates sepsis-induced acute lung injury by promoting ferroptosis in pulmonary vascular endothelial cells 2025-May, Redox biology IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.redox.2025.103614 PMID:40156957	研究论文	本研究探讨了巨噬细胞来源的细胞外囊泡（EVs）在脓毒症诱导的急性肺损伤（si-ALI）中的作用及其机制，发现GBP2通过促进肺血管内皮细胞铁死亡加剧肺损伤	首次揭示了GBP2通过OTUD5促进GPX4泛素化进而驱动内皮细胞铁死亡的机制，并筛选出具有潜在治疗作用的小分子化合物Plantainoside D	研究主要基于细胞和小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证	阐明巨噬细胞来源EVs在si-ALI中的作用机制并探索潜在治疗靶点	巨噬细胞、肺血管内皮细胞、脓毒症患者和小鼠模型	分子病理学	急性肺损伤/脓毒症	蛋白质组测序、转录组重分析、单细胞测序、RNA干扰、腺相关病毒转染、高通量筛选、分子对接、分子动力学模拟、细胞热位移分析	CLP小鼠模型、内皮特异性Gpx4敲除小鼠	蛋白质组数据、转录组数据、单细胞测序数据	脓毒症患者外周血样本、THP-1和RAW264.7细胞系、CLP小鼠模型
871	2025-04-25	Single-cell RNA sequencing reveals a reprogramming of hepatic immune cells and a protective role for B cells in MASH-driven HCC 2025-May-01, Hepatology communications IF:5.6Q1 DOI:10.1097/HC9.0000000000000668 PMID:40257356	研究论文	通过单细胞RNA测序揭示了代谢功能障碍相关脂肪性肝炎驱动的肝细胞癌中肝脏免疫细胞的重编程及B细胞的保护作用	揭示了B细胞在抗肿瘤免疫中的新作用及其通过增强T细胞反应促进抗肿瘤免疫的机制	研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证	探究代谢功能障碍相关脂肪性肝炎驱动的肝细胞癌中免疫细胞的作用及机制	小鼠模型中的肝脏免疫细胞，特别是B细胞	数字病理学	肝细胞癌	单细胞RNA测序	μMT小鼠模型	RNA测序数据	未明确提及具体样本数量，但使用了小鼠模型进行研究
872	2025-04-25	Single-Cell RNA Sequencing Reveals Molecular Signatures that Distinguish Allergic from Irritant Contact Dermatitis 2025-May, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.jid.2024.09.008 PMID:39341550	研究论文	通过单细胞RNA测序揭示区分过敏性接触性皮炎和刺激性接触性皮炎的分子特征	首次使用单细胞RNA测序技术揭示了过敏性接触性皮炎和刺激性接触性皮炎在转录组水平上的差异，并开发了一个高敏感性和特异性的诊断模型	样本量较小，且仅针对健康志愿者进行研究，未涉及不同年龄或疾病严重程度的患者	发现区分过敏性接触性皮炎和刺激性接触性皮炎的生物标志物	人类皮肤组织	生物医学	过敏性接触性皮炎和刺激性接触性皮炎	单细胞RNA测序	逻辑回归模型	转录组和蛋白质组数据	健康人类志愿者
873	2025-04-24	Exploring OLR1-mediated inflammatory mechanisms in the hematoma microenvironment of acute intracerebral hemorrhage 2025-May-07, Neuroscience IF:2.9Q2 DOI:10.1016/j.neuroscience.2025.03.035 PMID:40113072	研究论文	本研究探讨了氧化低密度脂蛋白受体1（OLR1）在急性脑出血血肿微环境中的作用及其对免疫反应和疾病进展的影响	首次全面分析了OLR1在脑出血血肿微环境中的表达及其与单核细胞和巨噬细胞活性的相关性，提出了OLR1作为生物标志物和治疗靶点的潜力	研究主要基于生物信息学分析和实验室验证，缺乏临床干预实验验证治疗效果	探索OLR1在脑出血病理机制中的作用，为开发新的治疗策略提供依据	脑出血患者的血肿微环境、外周血和脑组织样本	生物信息学	脑出血	生物信息学分析、scRNA-seq、qRT-PCR	NA	基因表达数据	来自GEO数据库的多个数据集，包括外周血、脑组织和血肿样本
874	2025-04-24	Using Single-Cell RNA sequencing with Drosophila, Zebrafish, and mouse models for studying Alzheimer's and Parkinson's disease 2025-May-07, Neuroscience IF:2.9Q2 DOI:10.1016/j.neuroscience.2025.03.042 PMID:40154937	综述	本文综述了利用果蝇、斑马鱼和小鼠模型以及单细胞RNA测序技术研究阿尔茨海默病和帕金森病的优势和局限性	重点讨论了单细胞RNA测序技术如何通过提供疾病细胞和转录组特征的新见解革新该领域	未提及具体实验数据或样本量的限制	推进阿尔茨海默病和帕金森病的研究，以加速成功治疗干预的开发	果蝇、斑马鱼和小鼠模型	数字病理学	阿尔茨海默病和帕金森病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
875	2025-04-24	Single-cell RNA sequencing and functional analysis reveal the role of altered glycosylation levels of hepatic macrophages in liver cirrhosis 2025-May, Journal of gastroenterology IF:6.9Q1 DOI:10.1007/s00535-025-02218-y PMID:39888412	research paper	该研究通过单细胞RNA测序和功能分析，揭示了肝巨噬细胞糖基化水平改变在肝硬化中的作用	首次在单细胞水平上分析了肝硬化中糖基化相关基因的变化及其功能通路富集特征，并揭示了巨噬细胞在免疫调控中的核心作用	研究样本量有限，且未进行体内功能验证实验	探究肝硬化中糖基化修饰对免疫细胞行为的影响	肝硬化患者和健康对照者的肝组织样本	digital pathology	liver cirrhosis	single-cell RNA sequencing	NA	RNA-seq data	肝硬化患者和健康对照者的肝组织样本（具体数量未提及）
876	2025-04-24	Maternal COVID-19 infection associated with offspring neurodevelopmental disorders 2025-May, Molecular psychiatry IF:9.6Q1 DOI:10.1038/s41380-024-02822-z PMID:39521839	research paper	该研究探讨了孕期母体COVID-19感染与后代神经发育障碍（NDDs）风险增加之间的关联及其潜在机制	揭示了COVID-19感染通过改变母体和胎儿免疫环境平衡，影响星形胶质细胞、内皮细胞和兴奋性神经元，从而增加后代NDDs风险的机制，并建立了基于47个独特基因的风险评分模型	潜在机制尚未完全阐明，且研究样本量未明确说明	探究孕期母体COVID-19感染与后代神经发育障碍的因果关系及分子机制	孕期感染COVID-19的母亲及其后代	医学研究	COVID-19, 神经发育障碍	单细胞转录组测序, 基于汇总数据的孟德尔随机化分析, 全表型关联研究	风险评分模型	转录组数据	NA
877	2025-04-24	A Single-Cell Atlas Revealed Altered B Cells and Neutrophils Immune Signatures and Inflammatory Responses in SFTSV Infection 2025-May, Journal of medical virology IF:6.8Q1 DOI:10.1002/jmv.70354 PMID:40263930	research paper	该研究通过单细胞转录组测序技术，揭示了SFTSV感染期间B细胞和中性粒细胞的免疫特征及炎症反应的改变	首次在单细胞水平上描绘了SFTSV感染的免疫图谱，特别关注了B细胞和中性粒细胞的免疫特征变化	研究仅基于住院患者的PBMCs样本，可能无法完全反映体内所有免疫细胞的变化	探究SFTSV感染的免疫病理机制及其对免疫细胞的影响	SFTSV感染患者的PBMCs样本	免疫学	SFTSV感染	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	住院SFTSV感染患者的PBMCs样本（具体数量未提及）
878	2025-04-23	Convergent musk biosynthesis across host and microbiota in musk deer and muskrat 2025-May-18, Zoological research IF:4.0Q1 DOI:10.24272/j.issn.2095-8137.2025.094 PMID:40259731	研究论文	本研究通过整合多组学方法，揭示了森林麝鼠和麝鼠在麝香生物合成中的多层次趋同现象	发现了环十五酮作为两种动物麝香中的共享关键代谢前体，揭示了从分子途径到微生物群落的趋同特征	未探讨其他可能参与麝香生物合成的潜在代谢途径	探究哺乳动物化学通讯中麝香生物合成的趋同机制	森林麝鼠和麝鼠的麝香分泌腺体	生物化学	NA	多组学方法、单细胞RNA测序、宏基因组分析	NA	基因组数据、转录组数据、代谢组数据	两种动物的麝香腺体组织样本
879	2025-04-23	Deciphering aging-associated prognosis and heterogeneity in gastric cancer through a machine learning-driven approach 2025-May-16, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2025.112316 PMID:40256325	research paper	该研究通过机器学习方法建立了一个与衰老相关的指数（AAI），用于分层胃癌患者，并揭示了AAI与预后、化疗和免疫治疗反应的关系	使用机器学习构建衰老相关指数（AAI）来分层胃癌患者，并识别了两种不同的分子亚型及其潜在治疗靶点	研究未涉及AAI在其他癌症类型中的适用性，且样本来源和数量未明确说明	探索衰老在胃癌预后和异质性中的作用，并开发相关预测工具	胃癌患者及其肿瘤微环境	machine learning	gastric cancer	单细胞转录组分析	机器学习模型（未具体说明）	基因表达数据	NA
880	2025-04-23	Classic Hodgkin lymphoma: Pathobiological features that impact emerging therapies 2025-May, Blood reviews IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.blre.2025.101271 PMID:39904647	综述	本文综述了经典霍奇金淋巴瘤（cHL）的病理生物学特征及其对新兴疗法的影响	探讨了HRS细胞的分子机制及其对免疫检查点抑制剂和抗体-药物偶联物等新兴疗法的影响	cHL的异质性以及HRS细胞及其周围肿瘤微环境的复杂生物学特性带来的挑战	探讨经典霍奇金淋巴瘤的病理生物学特征及其对治疗策略的影响	经典霍奇金淋巴瘤中的Hodgkin Reed-Sternberg（HRS）细胞	NA	经典霍奇金淋巴瘤	单细胞RNA测序和循环肿瘤DNA分析	NA	NA	NA