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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 781 | 2025-10-07 |
Understanding the cellular and molecular heterogeneity in colorectal cancer through the use of single-cell RNA sequencing
2025-May, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102374
PMID:40163910
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术解析结直肠癌的细胞和分子异质性 | 首次在结直肠癌中系统鉴定B细胞亚型并发现C3 B细胞在免疫调控中的关键作用,构建了基于C3 B细胞标志基因的生存预测模型 | 样本量相对有限,未进行多中心验证 | 解析结直肠癌的肿瘤微环境异质性 | 结直肠癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 预测模型 | 单细胞转录组数据 | 51,204个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 782 | 2025-10-07 |
TriDeNT : Triple deep network training for privileged knowledge distillation in histopathology
2025-May, Medical image analysis
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.media.2025.103479
PMID:40174325
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研究论文 | 提出一种名为TriDeNT的新型自监督方法,用于在组织病理学中利用推理时不可用的特权数据进行知识蒸馏 | 开发了TriDeNT三重深度网络训练方法,能够利用推理时不可用的特权数据(如额外免疫组化染色和空间转录组学)来提升模型性能 | 需要配对的特权数据进行训练,这些数据可能稀缺或获取成本高昂 | 提高计算病理学模型的性能,通过利用推理时不可用的特权数据 | 组织病理学数据,包括免疫组化染色、空间转录组学和专家核注释 | 数字病理学 | NA | 深度学习,知识蒸馏 | 三重深度网络 | 图像,空间转录组数据,专家注释 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 783 | 2025-10-07 |
Glomerular mesangial cells derived complement factor H regulates complement activation, influences cell proliferation, and maintains actin cytoskeleton
2025-May-08, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114544
PMID:40157080
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研究论文 | 本研究探讨肾小球系膜细胞来源的补体因子H在补体激活调控、细胞增殖和细胞骨架维持中的功能 | 首次发现肾小球系膜细胞来源的CFH不仅具有经典的补体调控功能,还能通过调控KLF4/p21信号通路和Cdc42表达影响细胞增殖和细胞骨架 | 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证;外源性补充CFH未能重现内源性CFH的非经典功能 | 探究肾小球系膜细胞来源的补体因子H的多重生物学功能 | 原代人肾小球系膜细胞(pHGMCs) | 细胞生物学 | IgA肾病 | 单细胞测序, 基因沉默, 基因过表达 | 细胞模型 | 基因表达数据, 蛋白沉积数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 784 | 2025-10-07 |
Pan-HDAC inhibitor LAQ824 inhibits the progression of pancreatic ductal adenocarcinoma and suppresses immune escape by promoting antigen presentation
2025-May-08, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114528
PMID:40158429
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研究论文 | 本研究探讨了泛HDAC抑制剂LAQ824在胰腺导管腺癌中的抗肿瘤作用及其通过促进抗原呈递抑制免疫逃逸的机制 | 首次揭示LAQ824通过增强染色质可及性上调MHC-I表达,促进抗原呈递和CD8 T细胞成熟,连接表观遗传调控与免疫原性 | 仅使用小鼠皮下肿瘤模型,尚未在临床患者中验证 | 评估LAQ824对胰腺导管腺癌的治疗潜力及其调节免疫逃逸机制的作用 | 胰腺导管腺癌细胞和小鼠模型 | 癌症研究 | 胰腺癌 | 免疫组化、流式细胞术、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | C57BL/6J小鼠皮下肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 785 | 2025-10-07 |
The characterization and validation of regulated cell death-related genes in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2025-May-08, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114509
PMID:40158428
|
研究论文 | 本研究系统分析了调控性细胞死亡相关基因在慢性鼻窦炎伴鼻息肉中的特征和功能 | 首次在CRSwNP中构建了细胞死亡指数(CDI),并揭示了8种RCD亚型的特异性激活模式 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据,需要更多实验验证 | 探讨调控性细胞死亡机制在CRSwNP发病和进展中的作用 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者组织样本 | 生物信息学 | 慢性鼻窦炎 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, qRT-PCR | LASSO回归, WGCNA, GSVA | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE136825等)和临床组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 786 | 2025-10-07 |
Targeting inflammation and necroptosis in diabetic kidney disease: A novel approach via PPARα modulation
2025-May-08, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114562
PMID:40174339
|
研究论文 | 本研究通过调控PPARα探索了其在糖尿病肾病中抑制炎症和坏死性凋亡的保护机制 | 首次揭示PPARα通过抑制RIP1/RIP3/MLKL介导的坏死性凋亡和NF-κB信号通路来延缓糖尿病肾病进展 | PPARα在糖尿病肾病中的具体下游靶点和完整信号网络仍需进一步阐明 | 阐明PPARα在糖尿病肾病中的保护作用机制 | 糖尿病肾病小鼠模型和肾小管上皮细胞 | 生物医学研究 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 病毒载体转染 | 动物疾病模型 | 基因表达数据 | 糖尿病肾病小鼠模型和对照组的肾脏组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 787 | 2025-10-07 |
Leveraging machine learning for integrative analysis of T-cell receptor repertoires in colorectal cancer: Insights into MAIT cell dynamics and risk assessment
2025-May, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102358
PMID:40088748
|
研究论文 | 通过机器学习整合分析结直肠癌患者T细胞受体库,揭示MAIT细胞动态与风险评估 | 发现跨不同数据集的共享TCR序列,识别MAIT细胞在转移和非转移患者中的升高现象,并验证TCR序列作为疾病结局生物标志物的潜力 | 样本量有限,单细胞数据集仅包含22例患者,且TCR序列重叠概率较低 | 研究结直肠癌中T细胞受体库的特征及其与疾病风险的关联 | 结直肠癌患者 | 机器学习 | 结直肠癌 | bulk测序, 单细胞测序 | 机器学习 | 序列数据 | 205例bulk测序患者 + 22例单细胞测序患者 | NA | 单细胞测序, bulk测序 | NA | NA |
| 788 | 2025-10-07 |
The Potential Role of C4 MYH11+ Fibroblasts and the MDK-SDC2 Ligand-Receptor Pair in Lung Adenocarcinoma: Implications for Prognosis and Therapeutic Strategies
2025-May, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102364
PMID:40121996
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肺腺癌肿瘤微环境,揭示C4 MYH11+成纤维细胞亚型和MDK-SDC2配体-受体对在肿瘤进展中的作用 | 首次发现MDK-SDC2配体-受体对作为肺腺癌进展的关键调控机制,并构建了基于基因的预后预测模型 | 样本量较小(仅9例患者),需要更大规模研究验证 | 阐明肺腺癌肿瘤微环境特征和关键生物学过程 | 肺腺癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 预后预测模型 | 单细胞转录组数据 | 9例肺腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 789 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing reveals PHLDA1-positive smooth muscle cells promote local invasion in head and neck squamous cell carcinoma
2025-May, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102301
PMID:40132389
|
研究论文 | 通过单细胞测序发现PHLDA1阳性平滑肌细胞通过THBS1促进头颈部鳞状细胞癌的局部侵袭 | 首次鉴定出PHLDA1阳性平滑肌细胞亚群在头颈部鳞癌侵袭中的关键作用,并揭示THBS1-SDC1信号轴的作用机制 | 研究主要基于公共数据库数据和体外实验,缺乏体内实验验证 | 探究肿瘤微环境中平滑肌细胞介导的细胞相互作用在头颈部鳞癌局部侵袭中的作用 | 头颈部鳞状细胞癌肿瘤微环境中的平滑肌细胞 | 单细胞测序 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞测序, 免疫荧光染色, 体外实验 | NA | 单细胞测序数据 | 来自GSE164690和GSE181919公共数据库的数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 790 | 2025-10-07 |
PIS as a regulator of cellular heterogeneity, prognostic significance, and immune landscape in thyroid cancer
2025-May, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102296
PMID:40132388
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析甲状腺癌的细胞异质性、预后标志物和免疫特征 | 首次在甲状腺癌中鉴定出RGS5+肿瘤亚群并构建预后模型,揭示了PIS评分与遗传不稳定性和免疫治疗反应的关系 | NA | 探索甲状腺癌的细胞异质性及其对预后的影响 | 甲状腺癌组织和细胞 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | 预后预测模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 791 | 2025-10-07 |
Joint analysis of single-cell RNA sequencing and bulk transcriptome reveals the heterogeneity of the urea cycle of astrocytes in glioblastoma
2025-May, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.106835
PMID:39938577
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据,揭示胶质母细胞瘤中星形胶质细胞尿素循环的异质性并建立预后模型 | 首次结合单细胞RNA测序UC评分和批量RNA测序数据构建胶质母细胞瘤预后模型,揭示星形胶质细胞亚群在尿素循环中的异质性 | 样本量较小(仅3对GB患者用于单细胞测序),需要更大规模数据验证 | 研究胶质母细胞瘤中星形胶质细胞尿素循环的异质性并建立预后预测模型 | 胶质母细胞瘤患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Cox回归模型, LASSO回归 | 基因表达数据, 临床数据, 突变数据 | 3对GB患者(单细胞测序)+ TCGA、CGGA、GEO数据库样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 792 | 2025-10-07 |
Dual and spatially resolved drought responses in the Arabidopsis leaf mesophyll revealed by single-cell transcriptomics
2025-May, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.20446
PMID:40033544
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研究论文 | 通过单细胞转录组技术揭示拟南芥叶肉细胞对轻度干旱的双重和空间分辨响应机制 | 首次在单细胞水平揭示叶肉细胞存在两种空间分离的细胞群体,分别富集不同的干旱响应基因通路 | 研究仅针对轻度干旱条件和年轻叶片,未涵盖不同干旱程度和发育阶段 | 解析植物在细胞水平对干旱胁迫的分子响应机制 | 拟南芥(Arabidopsis thaliana)叶片细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),转录抑制剂放线菌素D处理 | NA | 单细胞转录组数据 | 50,797个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 793 | 2025-10-07 |
Single-cell and spatial transcriptomics analysis reveals that Pros1+ oligodendrocytes are involved in endogenous neuroprotection after brainstem stroke
2025-May, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.106855
PMID:40090471
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学分析发现Pros1+少突胶质细胞在脑干卒中后参与内源性神经保护机制 | 首次在脑干卒中背景下鉴定出新的少突胶质细胞亚群OLG8细胞,并发现Myo1e调控其分化过程 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究脑干卒中后少突胶质细胞的神经保护机制 | 脑干卒中小鼠模型中的少突胶质细胞 | 数字病理学 | 脑干卒中 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 脑干卒中小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 794 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals AP-1 downregulation remodels bone marrow environment and contributes to osteopenia in ovariectomized mice
2025-May, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2025.03.001
PMID:40213116
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示AP-1下调通过重塑骨髓微环境导致卵巢切除小鼠骨量减少的机制 | 首次在单细胞分辨率揭示雌激素缺乏通过AP-1下调导致骨髓B细胞/中性粒细胞失衡和破骨细胞生成的新机制 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类样本验证 | 探究雌激素缺乏如何改变骨髓细胞组成和信号通路,重点关注AP-1的调控作用及其对破骨细胞生成的影响 | 假手术和卵巢切除(OVX)小鼠的骨髓细胞 | 单细胞组学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠骨髓细胞(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 795 | 2025-10-07 |
Potential Crosstalk Between ANXA1+ Epithelial Cells and FABP4+ TAM Cells of Ferroptosis-Related Molecular Clusters Promotes an Immunosuppressive Microenvironment in Non-Small Cell Lung Cancer
2025-May, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.23899
PMID:40040274
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了铁死亡相关分子簇在非小细胞肺癌中的异质性,发现ANXA1+上皮细胞与FABP4+TAM细胞间的相互作用促进免疫抑制微环境形成 | 首次在单细胞水平系统揭示铁死亡相关分子簇在NSCLC中的异质性,发现ANXA1-FPR2/FPR1配体-受体对在免疫抑制微环境形成中的关键作用 | 样本量相对有限(18例患者),需要更大规模研究验证 | 探究铁死亡如何通过重塑肿瘤微环境影响非小细胞肺癌进展 | 非小细胞肺癌患者肿瘤组织 | 单细胞转录组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 风险评分模型 | 单细胞转录组数据 | 85,562个细胞,来自18例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 796 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomics Identifies a Prominent Role for the MIF-CD74 Axis in Myasthenia Gravis Thymus
2025-May, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000200384
PMID:40117520
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示MIF-CD74轴在重症肌无力胸腺中的关键作用 | 首次构建EOMG患者胸腺淋巴细胞的单细胞转录谱,发现B细胞通过MIF-CD74轴获得生存信号的新机制 | 样本量较小(11例患者),仅针对未接受免疫治疗的患者 | 探究早发型AChR抗体阳性重症肌无力的胸腺增生机制 | 11例未接受免疫治疗的EOMG患者的胸腺组织 | 单细胞组学 | 重症肌无力 | 单细胞RNA测序, 多重组织染色, ELISA | NA | 单细胞转录组数据, 组织图像, 蛋白浓度数据 | 11例EOMG患者胸腺样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 797 | 2025-04-10 |
FoxO1 mediates odontoblast differentiation of hDPSCs via B cell-derived ANGPTL1 in dental caries: A laboratory investigation
2025-May, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.14206
PMID:39904951
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research paper | 本研究探讨了B细胞及其分泌因子ANGPTL1在龋齿条件下促进人牙髓干细胞(hDPSCs)向成牙本质细胞分化的作用,重点关注FoxO1的激活 | 揭示了B细胞分泌的ANGPTL1通过上调FoxO1促进hDPSCs向成牙本质细胞分化的新机制 | 研究主要基于实验室数据,尚未进行临床验证 | 探索龋齿环境下牙髓修复和再生的分子机制 | 人牙髓干细胞(hDPSCs)和B细胞 | dental research | dental caries | scRNA-Seq, ELISA, 免疫荧光染色, 双荧光素酶报告基因检测, 染色质免疫沉淀 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 798 | 2025-10-07 |
Recent advances in single-cell RNA sequencing of bacteria: Techniques, challenges, and applications
2025-May, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2025.01.008
PMID:39984340
|
综述 | 本文综述了细菌单细胞RNA测序技术的最新进展、技术挑战及其在微生物学中的应用 | 系统比较了不同细菌scRNA-seq方法的优劣,并探讨了在微生物生理学、宿主-病原体相互作用等领域的潜在应用 | 细菌mRNA缺乏poly-A尾和单个细菌细胞RNA含量低等技术挑战尚未完全解决 | 总结细菌单细胞RNA测序技术的发展现状和未来方向 | 细菌单细胞转录组 | 微生物组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 板式方法、分裂-汇集条形码技术、液滴基技术 |
| 799 | 2025-10-07 |
Single‑cell RNA‑Seq reveals PBMC profile alterations in a patient following a radiation accident
2025-May, Experimental and therapeutic medicine
IF:2.4Q3
DOI:10.3892/etm.2025.12846
PMID:40165803
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示辐射事故患者外周血单核细胞谱的动态变化 | 首次在单细胞水平上系统描述辐射暴露后人类外周血免疫细胞的动态变化轨迹 | 样本量较小(仅1名患者和10名健康对照),缺乏多时间点跟踪 | 研究电离辐射对人体外周血免疫细胞的影响机制 | 辐射事故患者和健康对照者的外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 辐射损伤 | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析、基因调控网络推断 | 单细胞转录组数据 | 1名患者在辐射后第113天和631天,10名健康对照者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 800 | 2025-10-07 |
Xin-Fu-Kang oral liquid mitigates chronic heart failure through NR4A1-Dependent regulation of endoplasmic reticulum-mitochondrial crosstalk in Cardiomyocytes
2025-May, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.156467
PMID:40036990
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研究论文 | 本研究探讨了心复康口服液通过NR4A1依赖的机制调节心肌细胞内质网-线粒体相互作用缓解慢性心力衰竭的作用 | 首次揭示心复康口服液通过NR4A1调控内质网-线粒体交互作用改善慢性心力衰竭的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,需要进一步临床验证 | 阐明心复康口服液治疗慢性心力衰竭的分子机制 | 小鼠模型、大鼠血清、H9C2心肌细胞系 | 心血管疾病研究 | 慢性心力衰竭 | 单细胞RNA测序,UPLC-QE质谱分析,分子对接 | 动物疾病模型,细胞模型 | 基因表达数据,代谢组学数据,功能检测数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,质谱分析 | NA | NA |