单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 867 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-07-22 |
Direct microglia replacement reveals pathologic and therapeutic contributions of brain macrophages to a monogenic neurological disease
2025-May-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.03.019
PMID:40311614
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研究论文 | 本研究通过直接替换小胶质细胞，揭示了脑巨噬细胞在单基因神经系统疾病中的病理和治疗作用 | 首次使用单细胞测序技术揭示了Krabbe病中巨噬细胞的早期干扰素反应特征，并通过直接替换小胶质细胞显著改善了疾病模型小鼠的生存率和病理特征 | 研究仅在Galc小鼠模型中进行，尚未在人类患者中验证 | 探究巨噬细胞在Krabbe病病理生理和造血干细胞移植中的作用 | Krabbe病模型小鼠和人类脑标本 | 神经科学 | Krabbe病（单基因神经系统疾病） | 单细胞测序、CNS单核细胞注射 | Galc小鼠模型 | 基因表达数据、组织病理数据 | 未明确提及具体样本数量，但包括小鼠模型和人类脑标本 |
| 62 | 2025-07-22 |
Defining pathogenic IL-17 and CSF-1 gene expression signatures in chronic graft-versus-host disease
2025-May-08, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024025337
PMID:39977705
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研究论文 | 该研究通过单细胞测序技术在小鼠模型中定义了慢性移植物抗宿主病(cGVHD)中IL-17和CSF-1的基因表达特征，并验证了这些特征在患者中的存在 | 首次在小鼠血液单核细胞中定义了非直观的IL-17和CSF-1特征，并验证了这些特征在cGVHD患者中的存在 | 仅在70%的确诊患者和50%后续发展为cGVHD的患者中检测到这些特征 | 开发用于识别cGVHD患者中可药物治疗的免疫失调的生物标志物 | 慢性移植物抗宿主病(cGVHD)患者和小鼠模型 | 生物医学研究 | 慢性移植物抗宿主病 | 单细胞测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明患者样本数量，但涉及小鼠模型和患者样本 |
| 63 | 2025-07-22 |
EnrichSci: Transcript-guided Targeted Cell Enrichment for Scalable Single-Cell RNA Sequencing
2025-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.02.651937
PMID:40654882
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研究论文 | 开发了一种名为EnrichSci的可扩展、无需微流体的平台，用于靶向细胞类型的单核转录组分析 | 结合了杂交链式反应RNA FISH与组合索引技术，实现了靶向细胞类型的单核转录组分析，并揭示了衰老相关的分子动态变化 | 目前仅在小鼠脑部的少突胶质细胞中进行了应用，尚未在其他细胞类型或组织中验证 | 解码复杂组织中多种细胞类型的动态调控景观 | 衰老小鼠脑中的少突胶质细胞亚型 | 单细胞RNA测序 | 衰老相关疾病 | 杂交链式反应RNA FISH与组合索引技术 | NA | 单核转录组数据 | 衰老小鼠脑中的少突胶质细胞 |
| 64 | 2025-07-22 |
Decoding sexual dimorphism of the sex-shared nervous system at single-neuron resolution
2025-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.27.630541
PMID:40654890
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序技术，解析了成年雄性和雌雄同体个体中共享神经系统的单神经元分辨率下的性别二态性 | 揭示了神经系统在单神经元水平上的广泛分子二态性，特别是在之前未被识别的神经元类型中，如触觉感受器，并强调了神经肽在性别特异性行为中的关键作用 | 研究主要关注转录组层面的差异，未涉及蛋白质或功能层面的验证 | 探究遗传性别如何塑造神经系统在单神经元水平上的分子结构 | 成年雄性和雌雄同体个体的共享神经系统神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成年雄性和雌雄同体个体的神经系统神经元 |
| 65 | 2025-07-22 |
scRegulate: Single-Cell Regulatory-Embedded Variational Inference of Transcription Factor Activity from Gene Expression
2025-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.17.649372
PMID:40654959
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研究论文 | 开发了一个名为scRegulate的生成深度学习框架，用于从单细胞RNA测序数据中推断转录因子活性 | 结合了基因调控网络先验知识，利用变分推断方法，能够捕捉新颖、动态和特定于上下文的调控相互作用 | 依赖于基因调控网络的先验知识，可能在某些未知调控关系的情况下表现受限 | 解决从单细胞RNA测序数据中准确推断转录因子活性的计算生物学挑战 | 转录因子活性和基因调控网络 | 计算生物学 | NA | scRNA-seq | 生成深度学习框架 | 单细胞RNA测序数据 | 多个公共实验数据集和合成数据集 |
| 66 | 2025-07-22 |
Multiomic spatial atlas shows deleted in malignant brain tumors 1 (DMBT1) glycoprotein is lost in colonic dysplasia
2025-May, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6406
PMID:40026233
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研究论文 | 该研究通过多组学空间图谱揭示了在结肠发育不良中DMBT1糖蛋白的缺失 | 揭示了DMBT1在炎症与发育不良结肠中的双相调节，并提出了细菌与结肠肿瘤发生之间的潜在机制联系 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 理解宿主-微生物在结肠肿瘤发生过程中的相互作用 | 结肠发育不良和正常结肠组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、免疫荧光图像 | 三种小鼠结肠肿瘤模型及人类腺瘤发育不良样本 |
| 67 | 2025-07-22 |
CXCL12+ fibroblastic reticular cells in lymph nodes facilitate immune tolerance by regulating T cell-mediated alloimmunity
2025-May-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI182709
PMID:40309773
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研究论文 | 本研究探讨了淋巴结中CXCL12高表达的纤维网状细胞（FRCs）在调控T细胞介导的同种免疫反应中的作用 | 首次揭示了CXCL12hi FRCs通过表达免疫调节基因促进心脏移植耐受性的具体机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类淋巴结数据验证有限 | 阐明特定FRC亚群在控制同种免疫反应中的作用机制 | 小鼠和人类淋巴结中的CXCL12hi纤维网状细胞 | 免疫学 | 器官移植排斥反应 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 心脏移植小鼠的淋巴结和人类淋巴结样本 |
| 68 | 2025-07-22 |
Single-cell transcriptomics reveals targeted modulation of inflammatory repertoire by SOCE blockers
2025-May-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.28.651042
PMID:40654653
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学揭示了SOCE阻断剂对炎症反应的靶向调控作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术研究SOCE阻断剂BTP2和CM4620对人类外周血单个核细胞的差异化影响，揭示了其对CD8效应T细胞和自然杀伤细胞的细胞毒性基因表达的抑制作用，同时保留了CD4调节性T细胞的抗炎基因表达 | 研究仅针对体外多克隆刺激的正常人类PBMCs，未涉及体内模型或疾病状态下的免疫细胞 | 探究SOCE阻断剂对不同免疫细胞类型的差异化作用机制 | 人类外周血单个核细胞(PBMCs)，包括CD8效应T细胞、自然杀伤(NK)细胞和CD4调节性T细胞 | 免疫学 | 免疫介导性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未明确说明样本数量的人类外周血单个核细胞 |
| 69 | 2025-07-21 |
Cell type-specific network analysis in Diversity Outbred mice identifies genes potentially responsible for human bone mineral density GWAS associations
2025-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.20.594981
PMID:38826475
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研究论文 | 利用单细胞转录组学数据，通过细胞类型特异性网络分析，识别与人类骨矿物质密度GWAS关联相关的潜在基因 | 结合单细胞转录组学数据与GWAS结果，识别出21个网络驱动基因，这些基因可能通过间充质细胞分化调控骨矿物质密度 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 解析骨矿物质密度GWAS关联的遗传变异，识别潜在的致病基因 | 多样性远交系小鼠的骨髓基质细胞在成骨条件下的单细胞转录组数据 | 基因组学 | 骨质疏松症 | scRNA-seq, eQTL/sQTL分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 多样性远交系小鼠的骨髓基质细胞 |
| 70 | 2025-07-21 |
Library-based single-cell analysis of CAR signaling reveals drivers of in vivo persistence
2025-May-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101260
PMID:40215972
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研究论文 | 利用单细胞测序技术研究CAR信号传导，揭示驱动体内持久性的因素 | 首次系统性地研究了不同ICD架构如何通过单细胞测序在分子水平上指导T细胞功能 | 研究发现的持久性信号特征在实体瘤中不适用 | 解码CAR信号传导的设计原则，优化下一代ICD架构的体内功能 | 工程化T细胞及其表达的嵌合抗原受体（CARs） | 单细胞分析 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 71 | 2025-07-21 |
Identification of maize genes that condition early systemic infection of sugarcane mosaic virus through single-cell transcriptomics
2025-May-12, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101297
PMID:40045576
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研究论文 | 通过单细胞转录组学技术，研究甘蔗花叶病毒（SCMV）早期系统性感染玉米时，病毒积累与细胞内基因表达变化的共变异模式 | 首次利用单细胞RNA测序技术解析SCMV早期系统性感染过程中玉米细胞的基因表达变化，并鉴定出多个潜在的抗病毒或促病毒因子 | 研究仅关注早期感染阶段（症状出现前），未涉及感染后期或不同环境条件下的宿主-病毒互作 | 揭示植物病毒早期系统性感染的分子机制及宿主基因调控网络 | 甘蔗花叶病毒（SCMV）感染的玉米叶片细胞 | 植物病理学 | 植物病毒感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | SCMV感染的玉米叶片细胞（未明确样本数量） |
| 72 | 2025-07-20 |
Decoding muscle-resident Schwann cell dynamics during neuromuscular junction remodeling
2025-May-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.06.561193
PMID:38370853
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术解析了肌肉驻留雪旺细胞在神经肌肉接头重塑中的作用 | 发现了一种新型的终末雪旺细胞亚型，其在去神经-再神经循环中起关键作用，并揭示了SPP1信号作为神经肌肉接头动态的关键调节因子 | 研究主要基于动物模型，结果向人类应用的转化需要进一步验证 | 探索肌肉驻留雪旺细胞在神经肌肉接头重塑中的贡献 | 肌肉驻留雪旺细胞和神经肌肉接头 | 生物医学研究 | 神经肌肉和神经退行性疾病 | scRNA-Seq | NA | RNA测序数据 | NA |
| 73 | 2025-07-20 |
Reactivation of CTLA4-expressing T cells accelerates resolution of lung fibrosis in a humanized mouse model
2025-May-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI181775
PMID:40100323
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和蛋白质组学技术，发现CTLA4在CD8+ T细胞中的上调与肺纤维化相关，并证明靶向CTLA4的药物ipilimumab能加速肺上皮再生和减少纤维化 | 首次发现CTLA4在CD8+ T细胞中的表达与肺纤维化区域相邻，并证明ipilimumab治疗能通过扩增Cd3e+ T细胞和减少衰老细胞积累来促进纤维化消退 | 研究仅在人类化小鼠模型中进行，尚未在人体临床试验中验证 | 探究CTLA4表达T细胞在肺纤维化消退中的作用机制 | 人类特发性肺纤维化患者样本和重复博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型 | 免疫学 | 肺纤维化 | 空间转录组学、蛋白质组学 | 人类化CTLA4敲入小鼠模型 | 转录组数据、蛋白质表达数据 | 人类特发性肺纤维化患者样本和重复博来霉素诱导的小鼠模型 |
| 74 | 2025-07-20 |
[Single-cell analysis of immune-lineage features in T-cell large granular lymphocytic leukemia]
2025-May-14, Zhonghua xue ye xue za zhi = Zhonghua xueyexue zazhi
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序技术研究T细胞大颗粒淋巴细胞白血病（T-LGLL）免疫谱系的变化及其致病机制 | 首次在单细胞水平上揭示了T-LGLL患者的免疫谱系特征，包括效应CD8+ T细胞的异常激活与扩增、Treg细胞比例减少及功能受损，以及APCs和NK细胞对T淋巴细胞的正向调控作用 | 样本量较小（5例患者和3例健康对照），且仅基于转录组数据，未进行蛋白水平验证 | 探究T-LGLL的免疫谱系变化及其致病机制 | T-LGLL患者和健康对照的外周血免疫细胞 | 单细胞转录组学 | T细胞大颗粒淋巴细胞白血病 | 单细胞转录组测序（10× Genomics） | NA | 单细胞转录组数据 | 5例T-LGLL患者（治疗前后）和3例健康对照 |
| 75 | 2025-07-20 |
POPARI: Modeling multisample variation in spatial transcriptomics
2025-May-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.08.652741
PMID:40462963
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研究论文 | 介绍了一种名为Popari的概率图模型，用于多样本空间转录组数据的因子分解，以捕捉空间组织的条件特异性变化 | Popari模型通过差异先验和空间降采样技术，实现了多分辨率层次分析，并在多样本和多分辨率空间指标上优于现有方法 | 未明确提及 | 开发一种用于多样本空间转录组数据整合和分析的方法 | 多样本空间转录组数据 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病（AD）、卵巢癌 | 空间转录组学技术（STARmap PLUS、Slide-TCR-seq、CosMx） | 概率图模型 | 空间转录组数据 | 未明确提及具体样本数量，但涉及小鼠大脑、胸腺和卵巢癌样本 |
| 76 | 2025-07-20 |
A single cell atlas of the mouse seminal vesicle
2025-May-08, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkaf045
PMID:40036847
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研究论文 | 本文报道了首个小鼠精囊的单细胞RNA-seq图谱，揭示了精囊中分泌细胞和免疫细胞的转录组特征 | 首次构建了小鼠精囊的单细胞转录组图谱，定义了负责产生精液的上皮细胞和免疫细胞群体 | 研究仅基于小鼠模型，结果向人类转化的适用性有待验证 | 理解精囊这一研究不足的生殖器官的细胞组成及其功能 | 小鼠精囊组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 23只不同年龄和饮食条件的小鼠 |
| 77 | 2025-07-20 |
Emerging Techniques in Spatial Multiomics: Fundamental Principles and Applications to Dermatology
2025-May, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.09.006
PMID:39503694
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review | 本文综述了空间多组学技术在皮肤学研究中的基本原理、优势、局限性和应用潜力 | 空间多组学技术能够同时捕获DNA、基因组可及性、组蛋白修饰和蛋白质，具有空间分辨的单细胞分辨率 | 技术尚处于早期阶段，可能存在数据解析和整合的挑战 | 探讨空间多组学技术在皮肤学研究中的应用 | 皮肤组织的分子病理学 | digital pathology | dermatology | spatial multi-omic technologies | NA | genomic, proteomic, epigenomic data | NA |
| 78 | 2025-07-19 |
Cross-expression meta-analysis of 695 brain samples reveals coordinated gene expression across spatially adjacent cells
2025-May-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.17.613579
PMID:39345494
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研究论文 | 该研究通过跨表达元分析揭示了大脑样本中相邻细胞间基因表达的协调性 | 提出跨表达概念，避免基因列表筛选或细胞类型注释，整合多个数据集构建跨表达网络 | 研究主要基于小鼠大脑数据，人类大脑的适用性有待验证 | 探究相邻细胞间基因表达的协调机制及其在组织功能中的作用 | 695个小鼠大脑样本中的基因表达数据 | 空间转录组学 | 帕金森病 | 空间转录组学技术 | NA | 基因表达数据 | 约2500万个细胞，695个样本，8种技术 |
| 79 | 2025-07-18 |
Interpretable Trajectory Inference with Single Cell Linear Adaptive Negative-binomial Expression (scLANE) Testing
2025-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.19.572477
PMID:38187622
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研究论文 | 本文提出了一种名为scLANE的可解释轨迹推断方法，用于单细胞RNA-seq数据分析 | 提出基于可解释广义线性模型的scLANE测试方法，通过经验选择的基础样条处理基因表达的非线性变化 | 未明确提及具体局限性 | 开发更可靠且可解释的单细胞轨迹差异表达分析方法 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 广义线性模型 | 基因表达数据 | 多个生物数据集（未明确样本量） |
| 80 | 2025-07-18 |
Variational inference of single cell time series
2025-May-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.29.610389
PMID:39257806
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研究论文 | 提出了一种名为SNOW的深度学习算法，用于解析单细胞时间序列数据 | SNOW算法能够将单细胞时间序列数据分解为时间依赖和时间独立的贡献，构建具有生物学意义的潜在空间，并去除批次效应 | 未提及具体的数据集规模或实验验证的局限性 | 解决单细胞RNA测序数据中基因表达受时间和细胞身份共同影响的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 深度学习算法 | 基因表达数据 | 合成和真实的scRNA-seq数据（未提及具体数量） |