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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2025-04-19 |
Single-Cell Transcriptomics Revealed E-Cigarettes-Induced Vascular Remodeling by Enhancing Tcf21 Expression
2025-May, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70183
PMID:40248042
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 762 | 2025-10-07 |
Mutation S139N on Zika virus prM protein shifts immune response from Asian to contemporary strain
2025-May, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2025.02.012
PMID:39986659
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研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示寨卡病毒prM蛋白S139N突变如何改变免疫反应模式 | 首次发现S139N单点突变可使亚洲株免疫反应特征转变为当代流行株模式 | 研究仅使用1日龄小鼠模型,未在更成熟动物模型或人体中验证 | 探究寨卡病毒prM蛋白S139N突变对免疫反应的影响 | 寨卡病毒感染的小鼠脑组织免疫细胞 | 单细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1日龄小鼠感染三种寨卡病毒株 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 763 | 2025-10-07 |
CD44+ cells enhance pro-tumor stroma in the spatial landscape of colorectal cancer leading edge
2025-May, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-02968-9
PMID:40069574
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研究论文 | 本研究通过空间转录组和单细胞RNA测序揭示了结直肠癌前缘CD44+肿瘤细胞通过PTN信号重塑肿瘤微环境的机制 | 首次发现CD44+肿瘤细胞在肿瘤前缘通过PTN信号诱导CAFs表型转换,揭示了肿瘤异质性在空间结构上的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本验证相对有限 | 探索结直肠癌异质性如何影响肿瘤空间结构并促进疾病进展 | AOM/DSS诱导的结直肠癌小鼠模型和临床患者样本 | 空间转录组学 | 结直肠癌 | 空间转录组分析, 单细胞RNA测序, 伪时间轨迹分析, 细胞间通讯分析, 免疫荧光染色 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | AOM/DSS诱导的结直肠癌模型和临床样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 764 | 2025-10-07 |
Single-cell profiling reveals monocyte heterogeneity and association with liver fibrosis in patients with chronic HBV
2025-May-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000672
PMID:40227083
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示慢性乙型肝炎患者循环单核细胞的异质性及其与肝纤维化的关联 | 首次在慢性乙型肝炎患者中发现单核细胞-血小板聚集体(MPA)亚群,并揭示其通过CCL5信号通路促进肝纤维化的新机制 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现;机制研究主要基于体外实验 | 探究慢性乙型肝炎患者循环单核细胞的异质性及其在肝纤维化进展中的作用机制 | 慢性乙型肝炎伴肝纤维化患者和健康对照者的循环单核细胞 | 单细胞组学 | 慢性乙型肝炎、肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 慢性乙型肝炎患者组和健康对照组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 765 | 2025-10-07 |
Regulatory role of CD177+ neutrophils in BMP signaling pathway and its implications for inflammatory bowel disease, sepsis, and intestinal tumors
2025-May, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102336
PMID:40158420
|
研究论文 | 本研究探讨CD177+中性粒细胞在BMP信号通路中的调控作用及其对炎症性肠病、脓毒症和肠道肿瘤的影响 | 首次系统揭示CD177+中性粒细胞通过调控BMP信号通路在多种疾病中的关键作用机制 | 需要进一步的临床验证才能转化为有效治疗策略 | 探索CD177+中性粒细胞在BMP信号通路中的调控作用及其对疾病发生发展和治疗的影响 | 炎症性肠病、脓毒症、肠道肿瘤 | 生物信息学 | 炎症性肠病、脓毒症、肠道肿瘤 | 生物信息学分析、单细胞转录组测序、qRT-PCR、流式细胞术、细胞培养 | WGCNA、差异表达分析、功能富集分析 | 基因表达数据、单细胞转录组数据、实验数据 | GEO数据库中的IBD和脓毒症数据集 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 766 | 2025-10-07 |
Reevaluating the role of Pou3f1 in striatal development: Evidence from transgenic mouse models
2025-May, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 通过转基因小鼠模型重新评估Pou3f1在纹状体发育中的作用 | 通过遗传学实验证明Pou3f1缺失不影响纹状体中间棘神经元的发育,挑战了基于人类单细胞RNA测序数据的计算预测 | 不能完全排除Pou3f1在纹状体发育其他方面的潜在作用 | 研究Pou3f1转录因子在纹状体发育中的具体功能 | 转基因小鼠模型中的纹状体中间棘神经元 | 神经发育生物学 | NA | 条件性基因敲除,单细胞RNA测序数据分析 | NA | 基因表达数据,细胞计数数据 | Pou3f1条件性敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 767 | 2025-10-07 |
Understanding the cellular and molecular heterogeneity in colorectal cancer through the use of single-cell RNA sequencing
2025-May, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102374
PMID:40163910
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术解析结直肠癌的细胞和分子异质性 | 首次在结直肠癌中系统鉴定B细胞亚型并发现C3 B细胞在免疫调控中的关键作用,构建了基于C3 B细胞标志基因的生存预测模型 | 样本量相对有限,未进行多中心验证 | 解析结直肠癌的肿瘤微环境异质性 | 结直肠癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 预测模型 | 单细胞转录组数据 | 51,204个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 768 | 2025-10-07 |
TriDeNT : Triple deep network training for privileged knowledge distillation in histopathology
2025-May, Medical image analysis
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.media.2025.103479
PMID:40174325
|
研究论文 | 提出一种名为TriDeNT的新型自监督方法,用于在组织病理学中利用推理时不可用的特权数据进行知识蒸馏 | 开发了TriDeNT三重深度网络训练方法,能够利用推理时不可用的特权数据(如额外免疫组化染色和空间转录组学)来提升模型性能 | 需要配对的特权数据进行训练,这些数据可能稀缺或获取成本高昂 | 提高计算病理学模型的性能,通过利用推理时不可用的特权数据 | 组织病理学数据,包括免疫组化染色、空间转录组学和专家核注释 | 数字病理学 | NA | 深度学习,知识蒸馏 | 三重深度网络 | 图像,空间转录组数据,专家注释 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 769 | 2025-10-07 |
Glomerular mesangial cells derived complement factor H regulates complement activation, influences cell proliferation, and maintains actin cytoskeleton
2025-May-08, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114544
PMID:40157080
|
研究论文 | 本研究探讨肾小球系膜细胞来源的补体因子H在补体激活调控、细胞增殖和细胞骨架维持中的功能 | 首次发现肾小球系膜细胞来源的CFH不仅具有经典的补体调控功能,还能通过调控KLF4/p21信号通路和Cdc42表达影响细胞增殖和细胞骨架 | 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证;外源性补充CFH未能重现内源性CFH的非经典功能 | 探究肾小球系膜细胞来源的补体因子H的多重生物学功能 | 原代人肾小球系膜细胞(pHGMCs) | 细胞生物学 | IgA肾病 | 单细胞测序, 基因沉默, 基因过表达 | 细胞模型 | 基因表达数据, 蛋白沉积数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 770 | 2025-10-07 |
Pan-HDAC inhibitor LAQ824 inhibits the progression of pancreatic ductal adenocarcinoma and suppresses immune escape by promoting antigen presentation
2025-May-08, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114528
PMID:40158429
|
研究论文 | 本研究探讨了泛HDAC抑制剂LAQ824在胰腺导管腺癌中的抗肿瘤作用及其通过促进抗原呈递抑制免疫逃逸的机制 | 首次揭示LAQ824通过增强染色质可及性上调MHC-I表达,促进抗原呈递和CD8 T细胞成熟,连接表观遗传调控与免疫原性 | 仅使用小鼠皮下肿瘤模型,尚未在临床患者中验证 | 评估LAQ824对胰腺导管腺癌的治疗潜力及其调节免疫逃逸机制的作用 | 胰腺导管腺癌细胞和小鼠模型 | 癌症研究 | 胰腺癌 | 免疫组化、流式细胞术、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | C57BL/6J小鼠皮下肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 771 | 2025-10-07 |
The characterization and validation of regulated cell death-related genes in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2025-May-08, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114509
PMID:40158428
|
研究论文 | 本研究系统分析了调控性细胞死亡相关基因在慢性鼻窦炎伴鼻息肉中的特征和功能 | 首次在CRSwNP中构建了细胞死亡指数(CDI),并揭示了8种RCD亚型的特异性激活模式 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据,需要更多实验验证 | 探讨调控性细胞死亡机制在CRSwNP发病和进展中的作用 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者组织样本 | 生物信息学 | 慢性鼻窦炎 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, qRT-PCR | LASSO回归, WGCNA, GSVA | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE136825等)和临床组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 772 | 2025-10-07 |
Targeting inflammation and necroptosis in diabetic kidney disease: A novel approach via PPARα modulation
2025-May-08, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114562
PMID:40174339
|
研究论文 | 本研究通过调控PPARα探索了其在糖尿病肾病中抑制炎症和坏死性凋亡的保护机制 | 首次揭示PPARα通过抑制RIP1/RIP3/MLKL介导的坏死性凋亡和NF-κB信号通路来延缓糖尿病肾病进展 | PPARα在糖尿病肾病中的具体下游靶点和完整信号网络仍需进一步阐明 | 阐明PPARα在糖尿病肾病中的保护作用机制 | 糖尿病肾病小鼠模型和肾小管上皮细胞 | 生物医学研究 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 病毒载体转染 | 动物疾病模型 | 基因表达数据 | 糖尿病肾病小鼠模型和对照组的肾脏组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 773 | 2025-10-07 |
Leveraging machine learning for integrative analysis of T-cell receptor repertoires in colorectal cancer: Insights into MAIT cell dynamics and risk assessment
2025-May, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102358
PMID:40088748
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研究论文 | 通过机器学习整合分析结直肠癌患者T细胞受体库,揭示MAIT细胞动态与风险评估 | 发现跨不同数据集的共享TCR序列,识别MAIT细胞在转移和非转移患者中的升高现象,并验证TCR序列作为疾病结局生物标志物的潜力 | 样本量有限,单细胞数据集仅包含22例患者,且TCR序列重叠概率较低 | 研究结直肠癌中T细胞受体库的特征及其与疾病风险的关联 | 结直肠癌患者 | 机器学习 | 结直肠癌 | bulk测序, 单细胞测序 | 机器学习 | 序列数据 | 205例bulk测序患者 + 22例单细胞测序患者 | NA | 单细胞测序, bulk测序 | NA | NA |
| 774 | 2025-10-07 |
The Potential Role of C4 MYH11+ Fibroblasts and the MDK-SDC2 Ligand-Receptor Pair in Lung Adenocarcinoma: Implications for Prognosis and Therapeutic Strategies
2025-May, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102364
PMID:40121996
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肺腺癌肿瘤微环境,揭示C4 MYH11+成纤维细胞亚型和MDK-SDC2配体-受体对在肿瘤进展中的作用 | 首次发现MDK-SDC2配体-受体对作为肺腺癌进展的关键调控机制,并构建了基于基因的预后预测模型 | 样本量较小(仅9例患者),需要更大规模研究验证 | 阐明肺腺癌肿瘤微环境特征和关键生物学过程 | 肺腺癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 预后预测模型 | 单细胞转录组数据 | 9例肺腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 775 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing reveals PHLDA1-positive smooth muscle cells promote local invasion in head and neck squamous cell carcinoma
2025-May, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102301
PMID:40132389
|
研究论文 | 通过单细胞测序发现PHLDA1阳性平滑肌细胞通过THBS1促进头颈部鳞状细胞癌的局部侵袭 | 首次鉴定出PHLDA1阳性平滑肌细胞亚群在头颈部鳞癌侵袭中的关键作用,并揭示THBS1-SDC1信号轴的作用机制 | 研究主要基于公共数据库数据和体外实验,缺乏体内实验验证 | 探究肿瘤微环境中平滑肌细胞介导的细胞相互作用在头颈部鳞癌局部侵袭中的作用 | 头颈部鳞状细胞癌肿瘤微环境中的平滑肌细胞 | 单细胞测序 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞测序, 免疫荧光染色, 体外实验 | NA | 单细胞测序数据 | 来自GSE164690和GSE181919公共数据库的数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 776 | 2025-10-07 |
PIS as a regulator of cellular heterogeneity, prognostic significance, and immune landscape in thyroid cancer
2025-May, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102296
PMID:40132388
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析甲状腺癌的细胞异质性、预后标志物和免疫特征 | 首次在甲状腺癌中鉴定出RGS5+肿瘤亚群并构建预后模型,揭示了PIS评分与遗传不稳定性和免疫治疗反应的关系 | NA | 探索甲状腺癌的细胞异质性及其对预后的影响 | 甲状腺癌组织和细胞 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | 预后预测模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 777 | 2025-10-07 |
Joint analysis of single-cell RNA sequencing and bulk transcriptome reveals the heterogeneity of the urea cycle of astrocytes in glioblastoma
2025-May, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.106835
PMID:39938577
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据,揭示胶质母细胞瘤中星形胶质细胞尿素循环的异质性并建立预后模型 | 首次结合单细胞RNA测序UC评分和批量RNA测序数据构建胶质母细胞瘤预后模型,揭示星形胶质细胞亚群在尿素循环中的异质性 | 样本量较小(仅3对GB患者用于单细胞测序),需要更大规模数据验证 | 研究胶质母细胞瘤中星形胶质细胞尿素循环的异质性并建立预后预测模型 | 胶质母细胞瘤患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Cox回归模型, LASSO回归 | 基因表达数据, 临床数据, 突变数据 | 3对GB患者(单细胞测序)+ TCGA、CGGA、GEO数据库样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 778 | 2025-10-07 |
Dual and spatially resolved drought responses in the Arabidopsis leaf mesophyll revealed by single-cell transcriptomics
2025-May, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.20446
PMID:40033544
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研究论文 | 通过单细胞转录组技术揭示拟南芥叶肉细胞对轻度干旱的双重和空间分辨响应机制 | 首次在单细胞水平揭示叶肉细胞存在两种空间分离的细胞群体,分别富集不同的干旱响应基因通路 | 研究仅针对轻度干旱条件和年轻叶片,未涵盖不同干旱程度和发育阶段 | 解析植物在细胞水平对干旱胁迫的分子响应机制 | 拟南芥(Arabidopsis thaliana)叶片细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),转录抑制剂放线菌素D处理 | NA | 单细胞转录组数据 | 50,797个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 779 | 2025-10-07 |
Single-cell and spatial transcriptomics analysis reveals that Pros1+ oligodendrocytes are involved in endogenous neuroprotection after brainstem stroke
2025-May, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.106855
PMID:40090471
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学分析发现Pros1+少突胶质细胞在脑干卒中后参与内源性神经保护机制 | 首次在脑干卒中背景下鉴定出新的少突胶质细胞亚群OLG8细胞,并发现Myo1e调控其分化过程 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究脑干卒中后少突胶质细胞的神经保护机制 | 脑干卒中小鼠模型中的少突胶质细胞 | 数字病理学 | 脑干卒中 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 脑干卒中小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 780 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals AP-1 downregulation remodels bone marrow environment and contributes to osteopenia in ovariectomized mice
2025-May, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2025.03.001
PMID:40213116
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示AP-1下调通过重塑骨髓微环境导致卵巢切除小鼠骨量减少的机制 | 首次在单细胞分辨率揭示雌激素缺乏通过AP-1下调导致骨髓B细胞/中性粒细胞失衡和破骨细胞生成的新机制 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类样本验证 | 探究雌激素缺乏如何改变骨髓细胞组成和信号通路,重点关注AP-1的调控作用及其对破骨细胞生成的影响 | 假手术和卵巢切除(OVX)小鼠的骨髓细胞 | 单细胞组学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠骨髓细胞(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |