本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2025-10-07 |
Maternal COVID-19 infection associated with offspring neurodevelopmental disorders
2025-May, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-024-02822-z
PMID:39521839
|
研究论文 | 本研究探讨了孕期母体COVID-19感染如何通过改变免疫环境导致子代神经发育障碍风险增加 | 首次在单细胞水平揭示母体COVID-19感染通过CD4增殖T细胞影响子代神经细胞发育的机制,并建立了47个基因的风险评分模型 | 未明确说明样本量大小,机制研究仍需进一步验证 | 阐明母体COVID-19感染与子代神经发育障碍之间的因果关系和分子机制 | 孕期感染COVID-19的母体及其子代的免疫和神经细胞 | 生物医学 | 神经发育障碍 | 单细胞转录组测序, 孟德尔随机化分析, 全表型关联研究 | 风险评分模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 762 | 2025-10-07 |
A Single-Cell Atlas Revealed Altered B Cells and Neutrophils Immune Signatures and Inflammatory Responses in SFTSV Infection
2025-May, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70354
PMID:40263930
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示SFTSV感染期间B细胞和中性粒细胞的免疫特征改变及炎症反应 | 首次在单细胞水平系统描绘SFTSV感染的免疫图谱,发现B细胞和中性粒细胞是除单核细胞外的主要病毒感染靶点 | 研究样本仅来自住院患者,未包含轻症或无症状感染者 | 解析SFTSV感染的免疫发病机制和免疫学影响 | SFTSV感染患者的PBMC样本 | 单细胞生物学 | 病毒感染 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 住院SFTSV感染患者的PBMC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 763 | 2025-10-07 |
Deciphering aging-associated prognosis and heterogeneity in gastric cancer through a machine learning-driven approach
2025-May-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112316
PMID:40256325
|
研究论文 | 本研究通过机器学习方法建立衰老相关指数来分层胃癌患者并识别分子亚型 | 首次开发基于机器学习的衰老相关指数(AAI)用于胃癌预后分层,并构建了用户友好的Shiny应用 | NA | 解析胃癌中与衰老相关的预后异质性 | 胃癌患者 | 机器学习 | 胃癌 | 单细胞转录组分析,机器学习 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 764 | 2025-10-07 |
Classic Hodgkin lymphoma: Pathobiological features that impact emerging therapies
2025-May, Blood reviews
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.blre.2025.101271
PMID:39904647
|
综述 | 本文综述了经典霍奇金淋巴瘤的病理生物学特征及其对新兴疗法的影响 | 深入探讨HRS细胞的起源、表型和遗传特征,并评估包括检查点抑制剂和抗体-药物偶联物在内的新兴疗法 | 由于cHL的异质性和HRS细胞及其肿瘤微环境的复杂生物学,治疗挑战仍然存在 | 分析经典霍奇金淋巴瘤的病理生物学特征及其对治疗策略的影响 | 经典霍奇金淋巴瘤中的霍奇金 Reed-Sternberg (HRS) 细胞及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 循环肿瘤DNA分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 765 | 2025-10-07 |
scRCA: A Siamese network-based pipeline for annotating cell types using noisy single-cell RNA-seq reference data
2025-May, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110068
PMID:40158457
|
研究论文 | 开发了一种基于孪生网络的scRCA流程,用于使用有噪声的单细胞RNA-seq参考数据准确注释细胞类型 | 首次构建了能够处理参考数据中固有标注错误的计算流程,并开发了解释器评估注释可靠性 | NA | 开发高质量细胞类型注释的计算流程,解决参考数据中噪声问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | 孪生网络 | 基因表达数据 | 14个数据集和4名多发性骨髓瘤患者的独立数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 766 | 2025-10-07 |
Involvement of ryanodine receptors in the contraction of small pulmonary veins
2025-May-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00375.2024
PMID:40183687
|
研究论文 | 本研究探讨了兰尼碱受体在小肺静脉收缩中的作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序和功能性实验证明兰尼碱受体在小肺静脉收缩中的刺激依赖性作用 | 研究主要基于离体肺切片模型,可能无法完全反映体内生理环境 | 阐明兰尼碱受体在小肺静脉平滑肌细胞收缩机制中的作用 | 人和大鼠肺组织中的小肺静脉平滑肌细胞 | 分子生物学 | 肺血管疾病 | 单细胞RNA测序, 离体精准肺切片模型 | NA | 基因表达数据, 功能实验数据 | 人和大鼠肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 767 | 2025-10-07 |
Single-Cell Atlas of the Peripheral Immune Response in Patients With Chronic Hepatitis B
2025-May, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70360
PMID:40255189
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析慢性乙型肝炎患者外周血免疫细胞的组成和转录差异 | 发现新型CD14+CD163+VSIG4+ M2样巨噬细胞群体在严重CHB患者中富集,揭示了免疫耗竭和免疫逃逸机制 | 样本量相对有限,主要关注外周血免疫细胞而未深入分析肝脏局部免疫环境 | 研究慢性乙型肝炎患者的免疫反应失调机制 | 慢性乙型肝炎患者和健康供体的外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 慢性乙型肝炎患者和健康供体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 768 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing highlights the role of proinflammatory fibroblasts, vascular endothelial cells, and immune cells in the keloid immune microenvironment
2025-May, International journal of dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/ijd.17516
PMID:39450923
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示促炎性成纤维细胞、血管内皮细胞和免疫细胞在瘢痕疙瘩免疫微环境中的作用 | 首次系统阐明促炎性成纤维细胞和血管内皮细胞在瘢痕疙瘩免疫微环境中的关键作用 | 样本量较小(3例瘢痕疙瘩和2例正常皮肤),需进一步验证 | 探究瘢痕疙瘩免疫微环境中细胞的功能状态 | 瘢痕疙瘩组织和正常皮肤组织 | 单细胞测序分析 | 瘢痕疙瘩 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例瘢痕疙瘩病变组织,2例正常皮肤标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 769 | 2025-10-07 |
Heterogeneity of the tumor immune cell microenvironment revealed by single-cell sequencing in head and neck cancer
2025-May, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.104677
PMID:40023465
|
综述 | 本文综述单细胞测序技术在头颈癌肿瘤免疫微环境异质性研究中的应用与价值 | 系统阐述单细胞测序技术在解析头颈癌免疫微环境细胞异质性方面的独特优势 | NA | 探讨单细胞测序技术在头颈癌研究中的应用潜力 | 头颈癌肿瘤免疫微环境细胞 | 数字病理 | 头颈癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 770 | 2025-10-07 |
Comprehensive characterization of T cell subtypes in lung adenocarcinoma: Prognostic, predictive, and therapeutic implications
2025-May, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102332
PMID:40184717
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习算法开发了肺腺癌T细胞相关预后标志物,并验证了CPA3基因在CD4+ T细胞中的免疫功能 | 整合多种机器学习算法开发了基于T细胞特征的肺腺癌预后标志物,首次发现CPA3在CD4+ T细胞特别是Th1细胞中的表达及其促进肿瘤细胞凋亡的机制 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步临床验证;体外实验的生理相关性需要更多体内研究支持 | 开发肺腺癌预后预测模型并探索T细胞在肿瘤免疫中的作用机制 | 肺腺癌患者和CD4+ T细胞 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,机器学习算法,体外实验,分子生物学技术 | Lasso + PLSRcox,10种机器学习算法 | 基因表达数据,临床数据 | TCGA、GSE31210、GSE50081和GSE68465数据集中的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 771 | 2025-10-07 |
Senescent Syncytiotrophoblast Secretion During Early Onset Preeclampsia
2025-May, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
|
研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学分析,发现早发性子痫前期中胎盘合体滋养层细胞存在衰老相关分泌表型 | 首次在早发性子痫前期中鉴定出合体滋养层细胞的衰老相关分泌表型,并发现其分泌标志物在妊娠早期母血中已升高 | 需要进一步研究验证这些生物标志物在更大人群中的预测价值 | 识别早发性子痫前期的早期标志物和信号通路 | 人类母胎界面单位(胎儿绒毛和母体蜕膜) | 空间转录组学 | 子痫前期 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | 来自多中心队列的胎盘组织 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 772 | 2025-02-23 |
Decoding cell-cell communication using spatial transcriptomics
2025-May, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-025-00824-3
PMID:39984677
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 773 | 2025-10-07 |
Identification of the crucial roles of BAXhigh NK cells in human derived mesenchymal stem cell therapy for chronic heart failure patients
2025-May, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2025.155924
PMID:40174277
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,揭示了BAX高表达NK细胞在间充质干细胞治疗慢性心力衰竭中的关键作用机制 | 首次发现BAX高表达NK细胞在心力衰竭发病机制中的作用,并阐明间充质干细胞通过抑制BAX表达改善NK细胞功能的治疗机制 | 样本量有限,机制研究仍需进一步实验验证 | 探究间充质干细胞治疗心力衰竭的分子机制 | 慢性心力衰竭患者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 心力衰竭患者治疗前后外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 774 | 2025-10-07 |
Identification of a cancer stem cell-like subpopulation that promotes HCC metastasis
2025-May, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101302
PMID:40242316
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,鉴定并表征了肝细胞癌中促进转移的癌症干细胞样亚群 | 首次在肝细胞癌中鉴定出促进转移的癌症干细胞样亚群,并揭示其通过ICAM1信号通路诱导免疫抑制微环境的新机制 | 样本量相对有限(19例单细胞RNA测序样本和12例空间转录组样本),需要更大规模研究验证 | 探索癌症干细胞在肝细胞癌转移中的作用机制 | 肝细胞癌患者肿瘤组织中的癌症干细胞样细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 生物信息学分析, 免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 临床队列数据 | 19例肝细胞癌样本(单细胞RNA测序), 12例肝细胞癌样本(空间转录组), 9个临床队列 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 775 | 2025-04-19 |
Single-Cell Transcriptomics Revealed E-Cigarettes-Induced Vascular Remodeling by Enhancing Tcf21 Expression
2025-May, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70183
PMID:40248042
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 776 | 2025-10-07 |
Mutation S139N on Zika virus prM protein shifts immune response from Asian to contemporary strain
2025-May, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2025.02.012
PMID:39986659
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示寨卡病毒prM蛋白S139N突变如何改变免疫反应模式 | 首次发现S139N单点突变可使亚洲株免疫反应特征转变为当代流行株模式 | 研究仅使用1日龄小鼠模型,未在更成熟动物模型或人体中验证 | 探究寨卡病毒prM蛋白S139N突变对免疫反应的影响 | 寨卡病毒感染的小鼠脑组织免疫细胞 | 单细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1日龄小鼠感染三种寨卡病毒株 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 777 | 2025-10-07 |
CD44+ cells enhance pro-tumor stroma in the spatial landscape of colorectal cancer leading edge
2025-May, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-02968-9
PMID:40069574
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组和单细胞RNA测序揭示了结直肠癌前缘CD44+肿瘤细胞通过PTN信号重塑肿瘤微环境的机制 | 首次发现CD44+肿瘤细胞在肿瘤前缘通过PTN信号诱导CAFs表型转换,揭示了肿瘤异质性在空间结构上的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本验证相对有限 | 探索结直肠癌异质性如何影响肿瘤空间结构并促进疾病进展 | AOM/DSS诱导的结直肠癌小鼠模型和临床患者样本 | 空间转录组学 | 结直肠癌 | 空间转录组分析, 单细胞RNA测序, 伪时间轨迹分析, 细胞间通讯分析, 免疫荧光染色 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | AOM/DSS诱导的结直肠癌模型和临床样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 778 | 2025-10-07 |
Single-cell profiling reveals monocyte heterogeneity and association with liver fibrosis in patients with chronic HBV
2025-May-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000672
PMID:40227083
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示慢性乙型肝炎患者循环单核细胞的异质性及其与肝纤维化的关联 | 首次在慢性乙型肝炎患者中发现单核细胞-血小板聚集体(MPA)亚群,并揭示其通过CCL5信号通路促进肝纤维化的新机制 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现;机制研究主要基于体外实验 | 探究慢性乙型肝炎患者循环单核细胞的异质性及其在肝纤维化进展中的作用机制 | 慢性乙型肝炎伴肝纤维化患者和健康对照者的循环单核细胞 | 单细胞组学 | 慢性乙型肝炎、肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 慢性乙型肝炎患者组和健康对照组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 779 | 2025-10-07 |
Regulatory role of CD177+ neutrophils in BMP signaling pathway and its implications for inflammatory bowel disease, sepsis, and intestinal tumors
2025-May, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102336
PMID:40158420
|
研究论文 | 本研究探讨CD177+中性粒细胞在BMP信号通路中的调控作用及其对炎症性肠病、脓毒症和肠道肿瘤的影响 | 首次系统揭示CD177+中性粒细胞通过调控BMP信号通路在多种疾病中的关键作用机制 | 需要进一步的临床验证才能转化为有效治疗策略 | 探索CD177+中性粒细胞在BMP信号通路中的调控作用及其对疾病发生发展和治疗的影响 | 炎症性肠病、脓毒症、肠道肿瘤 | 生物信息学 | 炎症性肠病、脓毒症、肠道肿瘤 | 生物信息学分析、单细胞转录组测序、qRT-PCR、流式细胞术、细胞培养 | WGCNA、差异表达分析、功能富集分析 | 基因表达数据、单细胞转录组数据、实验数据 | GEO数据库中的IBD和脓毒症数据集 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 780 | 2025-10-07 |
Reevaluating the role of Pou3f1 in striatal development: Evidence from transgenic mouse models
2025-May, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 通过转基因小鼠模型重新评估Pou3f1在纹状体发育中的作用 | 通过遗传学实验证明Pou3f1缺失不影响纹状体中间棘神经元的发育,挑战了基于人类单细胞RNA测序数据的计算预测 | 不能完全排除Pou3f1在纹状体发育其他方面的潜在作用 | 研究Pou3f1转录因子在纹状体发育中的具体功能 | 转基因小鼠模型中的纹状体中间棘神经元 | 神经发育生物学 | NA | 条件性基因敲除,单细胞RNA测序数据分析 | NA | 基因表达数据,细胞计数数据 | Pou3f1条件性敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |