单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
721	2025-05-12	Hydrogen sulfide improves depression-like behaviors in CUMS-induced mice by regulating autophagy 2025-May, Psychoneuroendocrinology IF:3.4Q2 DOI:10.1016/j.psyneuen.2025.107418 PMID:40023886	研究论文	本研究探讨了硫化氢通过调节自噬改善CUMS诱导小鼠抑郁样行为的机制	首次揭示了硫化氢通过激活PI3K/AKT/mTOR信号通路抑制自噬并改善突触可塑性损伤的抗抑郁机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类临床试验中验证	探究硫化氢的抗抑郁作用机制及其治疗潜力	慢性不可预测温和应激(CUMS)诱导的抑郁模型小鼠	神经科学	抑郁症	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 孟德尔随机化(MR)分析	动物模型	蛋白质表达数据, 行为学数据	CUMS诱导的抑郁模型小鼠
722	2025-05-12	Xin-Fu-Kang oral liquid mitigates chronic heart failure through NR4A1-Dependent regulation of endoplasmic reticulum-mitochondrial crosstalk in Cardiomyocytes 2025-May, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2025.156467 PMID:40036990	研究论文	本研究探讨了心复康口服液通过调节心肌细胞中NR4A1依赖的内质网-线粒体交互作用来缓解慢性心力衰竭的机制	揭示了心复康口服液通过NR4A1依赖的机制调节内质网-线粒体交互作用，从而改善线粒体功能和减少细胞凋亡的新药理作用	研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未进行人体临床试验	探究心复康口服液治疗慢性心力衰竭的分子机制	心肌细胞和小鼠慢性心力衰竭模型	心血管疾病研究	慢性心力衰竭	单细胞测序(scRNA-seq)、UPLC-QE MS、分子对接	小鼠横向主动脉缩窄(TAC)模型和体外苯肾上腺素诱导的心脏压力超负荷模型	基因表达数据、代谢组学数据	未明确说明具体样本数量，涉及小鼠模型和体外培养的H9C2细胞
723	2025-05-12	The Hypoxia-Associated High-Risk Cell Subpopulation Distinctly Enhances the Progression of Glioma 2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202416231 PMID:40047299	研究论文	本研究通过单细胞测序技术识别了一个与胶质瘤进展相关的独特细胞亚群，并探讨了其在胶质瘤从低级别向高级别转化中的作用	首次聚焦于低级别胶质瘤(LGG)起源的高风险细胞亚群，发现CDC20KIF20APTTG1标记的细胞亚群与胶质瘤进展密切相关	研究主要基于体外和动物实验，临床转化应用仍需进一步验证	探究胶质瘤从低级别向高级别转化的关键细胞亚群及其治疗策略	低级别胶质瘤(LGG)和胶质母细胞瘤(GBM)	肿瘤生物学	胶质瘤	单细胞RNA测序(scRNA-seq)和多重免疫荧光染色	NA	单细胞转录组数据	多个队列的低级别胶质瘤样本
724	2025-05-12	Single-cell RNA-seq reveals the immune response of Co-infection with streptococcus pneumoniae after influenza A virus by a lung-on-chip: The molecular structure and mechanism of tight junction protein ZO-1 2025-May, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.141815 PMID:40057081	研究论文	本研究利用人肺芯片模型和单细胞RNA测序技术，探讨了甲型流感病毒和肺炎链球菌共感染对肺部免疫反应的影响，重点关注紧密连接蛋白ZO-1的分子结构及作用机制	首次结合人肺芯片模型和单细胞RNA测序技术研究共感染的免疫反应，揭示了ZO-1蛋白在维持肺屏障完整性中的关键作用	研究仅使用体外模型，可能无法完全模拟体内复杂的免疫环境	探究甲型流感病毒和肺炎链球菌共感染对肺部免疫反应的影响机制	人肺芯片模型中的肺细胞和免疫细胞	数字病理学	肺炎	单细胞RNA测序、多重微球免疫分析	人肺芯片模型	基因表达数据、图像数据	未明确说明样本数量
725	2025-05-12	CO-Releasing Polyoxometalates Nanozyme with Gut Mucosal Immunity and Microbiota Homeostasis Remodeling Effects for Restoring Intestinal Barrier Integrity 2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202500116 PMID:40079617	研究论文	本研究介绍了一种释放CO的多金属氧酸盐纳米酶（PMC），用于修复炎症性肠病（IBD）中的肠道屏障完整性	PMC通过协调五羰基锰溴化物与钼基POM纳米簇合成，具有靶向积累、高效清除活性氧（ROS）和响应性CO释放的多重治疗效果	NA	开发一种多功能治疗剂，用于修复IBD中的肠道屏障完整性	炎症性肠病（IBD）患者	纳米医学	炎症性肠病	16S rRNA测序、单细胞RNA测序	NA	测序数据	NA
726	2025-05-12	CCL20/CXCL5 Drives Crosstalk Between Anaplastic Thyroid Cancer Stem Cells and Tumor-Associated Macrophages to Promote Tumor Progression 2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202405399 PMID:40091357	研究论文	探讨肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）与未分化甲状腺癌干细胞（ATCSCs）之间的相互作用及其在肿瘤进展中的作用	揭示了CCL20/CXCL5轴在TAMs与ATCSCs之间的关键作用及其通过IRAK-1/NF-κB1/2信号通路调控肿瘤干细胞特性的机制	研究主要基于体外实验和异种移植模型，临床样本验证不足	阐明TAMs与ATCSCs之间的互作机制及其对肿瘤微环境的调控作用	未分化甲状腺癌（ATC）中的肿瘤相关巨噬细胞和癌症干细胞	肿瘤生物学	甲状腺癌	单细胞RNA测序、细胞因子/趋化因子阵列、蛋白质组学、mRNA表达数据集分析	异种移植模型	基因表达数据、蛋白质数据	未明确说明具体样本数量，但使用了THP-1-M2细胞和ATCSCs
727	2025-05-12	Integrated single-cell transcriptome and comparative genome analysis reveals the origin of intermuscular bones in zebrafish 2025-May, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142397 PMID:40127795	研究论文	通过整合单细胞转录组和比较基因组分析，揭示了斑马鱼肌间骨的起源	首次结合单细胞转录组和比较基因组分析，揭示了肌间骨发育的分子调控机制和进化过程	研究仅针对斑马鱼，未在其他鱼类中进行验证	探究肌间骨的分子调控机制和进化过程	斑马鱼肌间骨	基因组学	NA	单细胞转录组测序、比较基因组分析	NA	基因组数据、转录组数据	15种鱼类（4种有肌间骨，11种无肌间骨）以及斑马鱼肌间骨组织
728	2025-05-12	Characterising Shared and Specific Cell-Cell Communication in Cardiomyopathy Subtypes From Single-Cell Transcriptomics Data 2025-May, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2 DOI:10.1111/jcmm.70554 PMID:40344498	研究论文	通过单细胞转录组数据分析心肌病亚型中细胞间通讯的共同和特异性特征	揭示了心肌病亚型中细胞间通讯的共同和特异性通路，为靶向治疗提供了新见解	研究仅基于转录组数据，未考虑蛋白质水平和功能验证	解析心肌病亚型中细胞间通讯的分子机制	心律失常性心肌病(ACM)、扩张型心肌病(DCM)、肥厚型心肌病(HCM)和缺血性心肌病(ICM)患者的单细胞转录组数据	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	单细胞转录组数据	来自ACM、DCM、HCM、ICM患者和健康供体的心室区域样本
729	2025-05-12	Single-Cell Profiling of Mononuclear Cells Identifies Transcriptomics Signatures Differentiating Prostate Cancer From Benign Prostatic Hyperplasia 2025-May, Genes, chromosomes & cancer DOI:10.1002/gcc.70051 PMID:40346907	研究论文	通过单细胞RNA测序技术分析前列腺癌和良性前列腺增生患者的单核细胞转录组特征，揭示两者在免疫微环境和转录异质性上的差异	首次使用单细胞RNA测序技术比较前列腺癌和良性前列腺增生患者的单核细胞转录组特征，并鉴定出与肿瘤进展相关的差异表达基因	样本量较小（4例前列腺癌和3例良性前列腺增生患者），可能影响结果的普遍性	探索前列腺癌和良性前列腺增生在免疫微环境和转录组水平的差异	前列腺癌和良性前列腺增生患者的单核细胞	数字病理学	前列腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA序列数据	4例前列腺癌患者和3例良性前列腺增生患者
730	2025-05-11	Identification of novel biomarkers and drug targets for frailty-related skeletal muscle aging: a multi-omics study 2025-May-09, QJM : monthly journal of the Association of Physicians DOI:10.1093/qjmed/hcaf108 PMID:40343466	研究论文	通过多组学研究识别与衰弱相关骨骼肌衰老的新型生物标志物和药物靶点	首次发现24个生物标志物基因，并构建了基于转录组特征的预测模型，揭示了内皮细胞在肌肉退化中的关键作用	研究结果需要在更大样本中进行验证，且药物靶点的临床转化效果尚不明确	识别早期检测和治疗干预衰弱相关骨骼肌衰老的生物标志物和药物靶点	人类骨骼肌衰老过程	生物信息学	老年疾病	转录组学、单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析、贝叶斯共定位分析	机器学习预测模型	转录组数据、单细胞测序数据	未明确说明样本数量
731	2025-05-11	A single cell atlas of the mouse seminal vesicle 2025-May-08, G3 (Bethesda, Md.) DOI:10.1093/g3journal/jkaf045 PMID:40036847	研究论文	本文报告了首个小鼠精囊的单细胞RNA-seq图谱，揭示了精囊分泌细胞的转录组特征及其免疫细胞群	首次构建小鼠精囊的单细胞RNA-seq图谱，明确了分泌细胞的转录组特征和免疫细胞群的组成	研究仅基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证	理解精囊这一研究较少的生殖组织的细胞组成及其功能	小鼠精囊组织	单细胞测序	NA	单细胞RNA-seq	NA	RNA-seq数据	23只不同年龄和饮食条件的小鼠
732	2025-05-11	PP1A Modulates the Efficacy of Lenvatinib Plus ICIs Therapy by Inhibiting Ferroptosis in Hepatocellular Carcinoma 2025-May-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202501730 PMID:40344394	研究论文	本文研究了PP1A在肝细胞癌中通过抑制铁死亡调节Lenvatinib联合ICIs治疗效果的机制	发现PP1A通过去磷酸化Keap1抑制铁死亡，并揭示了其在调节抗肿瘤免疫中的作用	研究主要基于体外和动物实验，临床转化效果尚需进一步验证	探索PP1A在肝细胞癌治疗抵抗中的作用机制	肝细胞癌细胞和动物模型	肿瘤生物学	肝细胞癌	转录组分析、铁死亡代谢物分析、单细胞测序	NA	分子生物学数据、测序数据	体外培养细胞和动物模型
733	2025-05-11	Mature tertiary lymphoid structures evoke intra-tumoral T and B cell responses via progenitor exhausted CD4+ T cells in head and neck cancer 2025-May-07, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-59341-w PMID:40335494	research paper	研究头颈癌中成熟三级淋巴结构（mTLS）通过祖细胞耗竭的CD4+ T细胞促进肿瘤内T和B细胞反应的机制	揭示了mTLS通过祖细胞耗竭的CD4+ T细胞激活B细胞和DC-LAMP树突状细胞，从而支持CD8+ T细胞活化的新机制	研究仅针对头颈鳞状细胞癌（HNSCC）患者，未涉及其他癌症类型	探究mTLS在肿瘤免疫中的作用机制及其对免疫检查点阻断（ICB）治疗反应的影响	头颈鳞状细胞癌（HNSCC）患者的肿瘤组织	肿瘤免疫学	头颈癌	单细胞RNA测序、抗原受体测序和空间转录组学	NA	单细胞RNA测序数据、空间转录组数据	头颈鳞状细胞癌（HNSCC）患者肿瘤组织样本（具体数量未提及）
734	2025-05-11	Spatial transcriptomics reveals tumor microenvironment heterogeneity in EBV positive diffuse large B cell lymphoma 2025-May-07, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-00410-x PMID:40335578	研究论文	通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术，研究EBV阳性弥漫大B细胞淋巴瘤的肿瘤微环境异质性及其与预后的关系	首次整合10X Visium空间转录组学和scRNA-seq技术，揭示EBV+DLBCL中PD-1/PD-L1信号通路的免疫抑制特性，并验证PD-1/PD-L1抑制剂BMS202的治疗潜力	研究样本量未明确说明，且功能验证仅限于EBV+Farage细胞系	探究EBV+DLBCL肿瘤微环境异质性及其对患者生存的影响	EBV阳性弥漫大B细胞淋巴瘤（EBV+DLBCL）	数字病理学	淋巴瘤	10X Visium空间转录组学、单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	空间转录组数据、单细胞RNA测序数据	NA
735	2025-05-11	Immunodynamic axis of fibroblast-driven neutrophil infiltration in acute pancreatitis: NF-κB-HIF-1α-CXCL1 2025-May-07, Cellular & molecular biology letters IF:9.2Q1 DOI:10.1186/s11658-025-00734-6 PMID:40335899	研究论文	本研究揭示了成纤维细胞通过NF-κB-HIF-1α-CXCL1信号轴驱动中性粒细胞浸润在急性胰腺炎中的免疫动力学机制	首次证明成纤维细胞激活是中性粒细胞浸润的免疫驱动因素之一，并阐明NF-κB-HIF-1α通路驱动的糖酵解是成纤维细胞分泌CXCL1趋化中性粒细胞的内在分子机制	研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本验证不足	阐明急性胰腺炎中成纤维细胞驱动中性粒细胞过度浸润的分子机制	C57BL/6J小鼠模型和人类胰腺星状细胞	免疫学	急性胰腺炎	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、细胞迁移实验、细胞转染、免疫荧光、流式细胞术、Western blot、RT-qPCR、共免疫沉淀(co-IP)	小鼠急性胰腺炎模型	单细胞转录组数据、蛋白质表达数据	未明确说明具体样本数量，使用C57BL/6J小鼠和人类胰腺星状细胞
736	2025-05-11	Surgery/anesthesia may cause monocytes to promote tumor development 2025-May-07, Molecular medicine (Cambridge, Mass.) DOI:10.1186/s10020-025-01213-6 PMID:40335909	研究论文	本研究利用单细胞测序技术探讨了手术/麻醉对围手术期外周血单个核细胞的影响	首次在围手术期使用单细胞测序技术深入分析手术/麻醉对免疫细胞的影响，特别是发现单核细胞可能促进肿瘤发展	样本量较小（仅4名患者），观察时间较短（仅48小时）	研究手术/麻醉对围手术期患者免疫系统的影响	接受大手术患者的围手术期外周血单个核细胞	免疫学	肿瘤	单细胞测序, RT-PCR	NA	单细胞RNA测序数据	4名手术患者
737	2025-05-11	PAQR5 drives the malignant progression and shapes the immunosuppressive microenvironment of hepatocellular carcinoma by activating the NF-κB signaling 2025-May-07, Biomarker research IF:9.5Q1 DOI:10.1186/s40364-025-00785-z PMID:40336138	研究论文	本研究揭示了PAQR5通过激活NF-κB信号通路促进肝细胞癌（HCC）恶性进展和免疫抑制微环境形成的分子机制	首次系统阐明了PAQR5在HCC中的致癌作用机制，并通过多组学分析和实验验证揭示了其通过ERK/NF-κB信号轴驱动肿瘤进展的新机制	研究主要基于细胞和动物模型，临床转化应用仍需进一步验证	阐明PAQR5在肝细胞癌进展中的作用机制及其对肿瘤免疫微环境的调控	肝细胞癌组织和细胞系	肿瘤生物学	肝细胞癌	多组学分析（包括bulk转录组、单细胞转录组和空间转录组）、体外实验和体内实验	NA	转录组数据、实验数据	未明确说明具体样本量，但涉及多个转录组队列和实验模型
738	2025-05-11	Temporal transcriptomic changes in the THY-Tau22 mouse model of tauopathy display cell type- and sex-specific differences 2025-May-07, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1 DOI:10.1186/s40478-025-02013-z PMID:40336141	研究论文	该研究通过单细胞RNA测序分析了THY-Tau22小鼠模型中不同细胞类型和性别的转录组变化，揭示了tauopathy中性别特异性和年龄依赖性的分子机制	首次在THY-Tau22小鼠模型中系统研究了性别特异性和性别二态性转录组变化，并揭示了这些变化在年龄增长过程中的演变规律	研究仅基于小鼠模型，虽然与人类AD数据进行了比较，但仍需进一步验证这些发现在人类中的适用性	理解AD相关tauopathy中性别特异性和性别二态性转录组变化的细胞类型特异性和年龄依赖性	THY-Tau22转基因小鼠和野生型小鼠的皮质组织	神经科学	阿尔茨海默病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	THY-Tau22小鼠模型	转录组数据	17月龄和7月龄的THY-Tau22和野生型小鼠皮质组织
739	2025-05-11	Key genes linking gut microbiota, immune cells, and osteoporosis: A multi-omics approach 2025-May, Microbial pathogenesis IF:3.3Q2 DOI:10.1016/j.micpath.2025.107412 PMID:39993547	研究论文	通过多组学方法探索肠道微生物群、免疫细胞与骨质疏松症之间的因果关系	整合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和生物信息学分析，揭示了肠道微生物群通过免疫细胞调节影响骨质疏松症的新机制	研究结果主要基于观察性数据，需要进一步的实验验证	探索骨质疏松症的分子机制，寻找新的治疗靶点	肠道微生物群、免疫细胞和骨质疏松症	生物信息学	骨质疏松症	孟德尔随机化(MR)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、生物信息学分析	NA	基因组数据、表达数据	UK Biobank和芬兰队列的数据
740	2025-05-11	Timestamp calibration for time-series single cell RNA-seq expression data 2025-May-01, Journal of molecular biology IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.jmb.2025.169021 PMID:40010431	research paper	本文提出了一种名为ScPace的新型时间戳校准模型，用于处理带噪声标记的时间序列单细胞RNA测序数据	ScPace模型通过引入潜在变量指示器而非概率采样来有效检测噪声样本，显著提升了时间戳自动注释的性能	当前方法倾向于选择不太关键的去噪样本进行时间戳校准，可能影响校准效果	开发一种有效的时间戳校准方法，以提高时间序列单细胞RNA测序数据分析的准确性	时间序列单细胞RNA测序数据	生物信息学	NA	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	ScPace	基因表达数据	模拟和真实时间序列单细胞RNA测序数据集