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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2025-10-07 |
Differential cellular origins of the extracellular matrix of tumor and normal tissues according to colorectal cancer subtypes
2025-May, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-02964-z
PMID:40032993
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研究论文 | 通过整合定量蛋白质组学和单细胞RNA测序数据,研究结直肠癌肿瘤微环境中细胞外基质的细胞来源异质性 | 首次系统鉴定结直肠癌中正常组织和肿瘤组织细胞外基质蛋白的差异细胞来源,并建立细胞-基质组数据库 | 样本量相对较小(21例患者),主要依赖公共数据集进行验证 | 解析结直肠癌肿瘤微环境中细胞外基质的异质性及其与临床预后的关系 | 结直肠癌患者组织样本和癌旁正常组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | TMT蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 生物信息学分析 | CMS分子分型, 单细胞水平反卷积分析 | 蛋白质组数据, RNA测序数据 | 21例结直肠癌患者的24个组织样本及癌旁正常组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 722 | 2025-10-07 |
Macrophage-mediated IL-6 signaling drives ryanodine receptor-2 calcium leak in postoperative atrial fibrillation
2025-May-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI187711
PMID:40048254
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示浸润性CCR2+巨噬细胞通过IL-6-STAT3-CaMKII信号通路驱动兰尼碱受体2钙泄漏,导致术后房颤发生 | 首次发现巨噬细胞介导的IL-6信号通过STAT3-CaMKII通路调控RyR2-S2814磷酸化,揭示术后房颤的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究术后房颤发生的细胞和分子机制 | 小鼠心房非肌细胞、人类心包液、分离的心房肌细胞 | 单细胞测序 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq、伪时间轨迹分析、共聚焦成像、条件性基因敲除 | NA | 基因表达数据、钙成像数据 | 小鼠模型和人类心脏手术患者心包液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 723 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals distinct plasma cell populations in chronic thromboembolic pulmonary hypertension
2025-May, Journal of thrombosis and haemostasis : JTH
IF:5.5Q1
DOI:10.1016/j.jtha.2025.02.010
PMID:39965671
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示慢性血栓栓塞性肺动脉高压中浆细胞的独特亚群特征 | 首次发现AHNAK和IGLC3两个新型浆细胞亚群,并揭示其分化轨迹和功能特征 | 样本量有限(5例患者和6例正常肺动脉),需要更大规模验证 | 识别CTEPH中浆细胞的表型改变和分化模式 | 慢性血栓栓塞性肺动脉高压患者的肺动脉内膜切除组织和血浆样本 | 单细胞转录组学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序,蛋白电泳 | GeneSwitches分析,轨迹分析 | 单细胞转录组数据,蛋白质数据 | 5例CTEPH患者,6例正常肺动脉,273例CTEPH患者,259例IPAH患者,251例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 724 | 2025-10-07 |
Micro-region transcriptomics profiling of cerebral organoids using a capillary-based microdissection system
2025-May-01, Analytical methods : advancing methods and applications
IF:2.7Q1
DOI:10.1039/d5ay00277j
PMID:40211824
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研究论文 | 开发了一种基于毛细管的组织微切割系统,用于脑类器官微区域的空间转录组分析 | 建立了毛细管组织微切割系统(CMS),实现了对培养脑类器官微区域的高效获取和mRNA测序 | NA | 探索脑类器官中细胞命运的空间发育轨迹 | 脑类器官中的神经祖细胞、中间祖细胞、成熟神经元和星形胶质细胞 | 空间转录组学 | NA | mRNA测序,基因本体(GO)分析,KEGG富集分析 | NA | 空间转录组数据,基因表达数据 | 第20天和第60天的脑类器官样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 毛细管组织微切割系统(CMS) | 毛细管组织微切割系统用于脑类器官微区域获取 |
| 725 | 2025-10-07 |
Restoring mitochondrial function promotes hematopoietic reconstitution from cord blood following cryopreservation-related functional decline
2025-May-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI183607
PMID:40036065
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了脐带血冷冻保存对造血干细胞功能的影响机制,并发现萝卜硫素可改善线粒体功能恢复造血重建能力 | 首次系统评估不同冷冻时长对脐带血造血干细胞功能的影响,发现线粒体功能障碍是关键机制,并验证萝卜硫素的改善作用 | 研究样本时间跨度有限,临床验证需要进一步开展 | 探究冷冻保存对脐带血造血干细胞功能的影响及其机制 | 脐带血来源的CD34+造血干细胞和祖细胞及单个核细胞 | 单细胞组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 包含新鲜和冷冻1年、5年、10年、19年的脐带血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 726 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Uncovers Molecular Features Underlying the Disrupted Neurogenesis Following Traumatic Brain Injury
2025-May, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24671
PMID:39760225
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示创伤性脑损伤后神经发生破坏的分子特征 | 首次通过大规模单细胞转录组测序识别出表达Tubb3基因的NSC-4亚群减少是神经发生破坏的关键原因,并发现转录因子Dlx2的下调及其过表达可促进神经元谱系分化 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究创伤性脑损伤后神经干细胞分化偏向的分子机制 | 小鼠脑室下区神经干细胞及其衍生细胞 | 单细胞测序 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 727 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Developmental Landscape of Wheat Roots
2025-May, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.15321
PMID:39763237
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小麦根尖细胞的转录组异质性和发育轨迹 | 首次在小麦中应用单细胞RNA测序技术解析根尖细胞类型组成和发育轨迹,并进行跨物种比较分析 | 仅分析了中国春小麦品种的根尖组织,样本来源相对有限 | 解析小麦根尖细胞类型特异的转录程序和发育机制 | 中国春小麦品种的根尖细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 中国春小麦根尖单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 728 | 2025-10-07 |
Myeloid deficiency of Z-DNA binding protein 1 restricts septic cardiomyopathy via promoting macrophage polarisation towards the M2-subtype
2025-May, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70315
PMID:40289345
|
研究论文 | 本研究揭示了ZBP1蛋白在脓毒症心肌病中的作用机制,发现巨噬细胞中STAT1-ZBP1轴促进心肌功能障碍 | 首次发现巨噬细胞中STAT1-ZBP1信号轴在脓毒症心肌病中的关键作用,并证明ZBP1缺失可促进巨噬细胞向M2亚型极化 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究ZBP1在脓毒症心肌病发生发展中的分子机制 | LPS处理的小鼠模型,重点关注心肌组织中的巨噬细胞 | 分子生物学 | 脓毒症心肌病 | 单细胞mRNA测序, 单核mRNA测序, 免疫荧光, 超声心动图 | NA | 基因表达数据, 影像数据 | LPS处理的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 729 | 2025-10-07 |
cGAS/STING signalling in macrophages aggravates obliterative bronchiolitis via an IFN-α-dependent mechanism after orthotopic tracheal transplantation in mice
2025-May, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70323
PMID:40292672
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研究论文 | 本研究通过小鼠原位气管移植模型,揭示了cGAS/STING信号通路通过IFN-α2依赖性机制加剧闭塞性细支气管炎的分子机制 | 首次证明巨噬细胞中cGAS/STING信号通路通过IFN-α2依赖性方式加重移植排斥反应,并发现STING抑制可增强CTLA4-Ig的治疗效果 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探究cGAS/STING信号通路在闭塞性细支气管炎发病机制中的具体作用 | 小鼠原位气管移植模型和巨噬细胞特异性Sting1基因敲除小鼠 | 免疫学 | 闭塞性细支气管炎 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, qRT-PCR, 流式细胞术 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 细胞表型数据, 组织病理数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 730 | 2025-10-07 |
Deciphering of intra-tumoural heterogeneity and the interplay between metastasis-associated meta-program and myofibroblasts in gastric cancer
2025-May, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70319
PMID:40292733
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学解析胃癌肿瘤内异质性,揭示转移相关元程序MP7与肌成纤维细胞的相互作用机制 | 首次在胃癌中鉴定出7个具有不同生物学意义的元程序,并阐明MP7与肌成纤维细胞通过GDF15/TGFBR2和RSPO3/EGR1通路形成相互作用环路 | NA | 解析胃癌肿瘤内异质性及肿瘤细胞与基质细胞的相互作用机制 | 胃癌组织、患者来源类器官 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 体外实验, 患者来源类器官模型 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 731 | 2025-10-07 |
Elevated KIF2C Expression Drives Osteosarcoma Progression by Modulating the Wnt/β-Catenin Signaling Pathway and Contributing to an Immunosuppressive Tumor Microenvironment
2025-May, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70915
PMID:40292920
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研究论文 | 本研究探讨KIF2C在骨肉瘤中的过表达通过调控Wnt/β-catenin信号通路和促进免疫抑制微环境驱动肿瘤进展的机制 | 首次揭示KIF2C在骨肉瘤中通过结合β-catenin调控Wnt信号通路并影响肿瘤免疫微环境的作用机制,并发现butein作为潜在抑制剂 | 未明确说明样本量大小,机制研究主要依赖体外实验和公共数据集分析 | 探究KIF2C在骨肉瘤发生发展中的作用机制及治疗靶点价值 | 骨肉瘤细胞系、公共数据库中的骨肉瘤样本数据 | 肿瘤生物学 | 骨肉瘤 | KEGG富集分析、GSVA、ssGSEA、ESTIMATE算法、单细胞测序、分子对接、分子动力学 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、体外实验数据、体内实验数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 732 | 2025-10-07 |
ScRNA-Seq reveals T cell immunity in COVID-19 patients and implications for immunotherapy
2025-May-16, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114663
PMID:40233451
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综述 | 通过单细胞RNA测序技术揭示COVID-19患者T细胞免疫特征及其对免疫治疗的启示 | 首次系统阐述scRNA-seq在解析COVID-19患者T细胞异质性和功能障碍中的应用,揭示不同临床表型患者的T细胞特征差异 | 现有靶向T细胞的治疗策略效果不一致,需联合治疗方法 | 阐明T细胞异质性对COVID-19疾病严重程度的影响机制 | COVID-19患者的常规T细胞(CD8、CD4 T细胞)和非常规T细胞(NKT、MAIT、γδT细胞) | 单细胞组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同临床表现的COVID-19患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 733 | 2025-10-07 |
Therapeutic and prognostic values of ferroptosis signature in glioblastoma
2025-May-16, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114597
PMID:40239336
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研究论文 | 探讨铁死亡特征在胶质母细胞瘤中的治疗和预后价值 | 通过单细胞RNA测序揭示胶质母细胞瘤中铁死亡的分子特征及其与肿瘤微环境的相互作用 | 铁死亡与GBM免疫景观的关系复杂,可能产生正向或负向影响 | 研究铁死亡在胶质母细胞瘤中的治疗潜力和预后价值 | 胶质母细胞瘤细胞及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 734 | 2025-10-07 |
Characterization of the Biochemical Recurrence Prediction Ability and Progression Correlation of Peroxiredoxins Family in Prostate Cancer Based on Integrating Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Cohorts
2025-May, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70855
PMID:40281661
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,探讨了过氧化物氧化还原酶家族在前列腺癌中的预后预测价值及与疾病进展的关联 | 首次系统评估PRDXs家族在前列腺癌中的临床价值,发现PRDX5与疾病进展最相关,并开发了整合PRDX5表达和临床特征的预测模型 | 研究主要基于公共数据集,部分发现需进一步实验验证 | 评估PRDXs家族在前列腺癌预后预测和治疗反应中的作用 | 前列腺癌患者样本和去势抵抗性前列腺癌细胞系 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫组织化学, 体外细胞实验 | 列线图预测模型 | 基因表达数据, 临床数据 | 2个单细胞RNA数据集和8个批量RNA数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 735 | 2025-10-07 |
Role of different Lyl1 transcripts in zebrafish primitive hematopoiesis
2025-May, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.24-288
PMID:40287790
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研究论文 | 本研究通过分析斑马鱼单细胞RNA测序数据,发现Lyl1基因存在长短两种转录本,并在原始造血过程中发挥不同调控作用 | 首次在斑马鱼和人类中发现Lyl1基因的长短转录本,并揭示它们在原始髓系造血中的不同功能 | 研究主要基于斑马鱼模型,人类中的功能验证需要进一步研究 | 探究Lyl1不同转录本在原始造血过程中的作用机制 | 斑马鱼胚胎造血细胞 | 发育生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 5'RACE, Morpholino基因敲降 | NA | 单细胞RNA测序数据, RNA测序数据 | 斑马鱼造血细胞 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 736 | 2025-10-07 |
Adaptive circuits for action and value information in rodent operant learning
2025-May, Neuroscience research
IF:2.4Q3
DOI:10.1016/j.neures.2024.09.003
PMID:39341460
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综述 | 本文综述了啮齿类动物操作性学习中的神经回路机制,重点关注多巴胺系统对行为强化的调控作用 | 整合了神经回路、突触可塑性和基因表达的多层次研究,特别强调了中脑多巴胺神经元在整合动作启动与奖赏反馈中的复杂作用 | 作为综述文章,主要基于已有研究进行总结,未提供新的实验数据 | 探讨操作性学习的神经机制 | 啮齿类动物(主要为小鼠和大鼠) | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 神经生理数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 737 | 2025-10-07 |
The Medaka approach to evolutionary social neuroscience
2025-May, Neuroscience research
IF:2.4Q3
DOI:10.1016/j.neures.2024.10.005
PMID:39481546
|
综述 | 本文综述了利用青鳉鱼类进行进化社会神经科学研究的潜力与未来方向 | 将单细胞转录组技术与'自适应回路普查'方法相结合,搭建比较生物学与神经科学方法的桥梁 | NA | 探索社会神经科学的基本原理和交配策略多样性的产生机制 | 青鳉鱼类(鳉科鱼类),特别是日本青鳉 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 738 | 2025-10-07 |
Sequencing technologies to measure translation in single cells
2025-May, Nature reviews. Molecular cell biology
DOI:10.1038/s41580-024-00822-z
PMID:39833532
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综述 | 本文讨论了用于在单细胞水平测量翻译过程的测序技术 | 聚焦单细胞分辨率下的翻译测量技术,包括核糖体分析、核糖体亲和纯化和空间翻译组方法 | NA | 研究单细胞水平上翻译过程的测量方法和技术进展 | 单细胞翻译过程 | 单细胞组学 | NA | 单细胞测序, 核糖体分析, 核糖体亲和纯化, 空间翻译组分析 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 739 | 2025-10-07 |
A practical guide for single-cell transcriptome data analysis in neuroscience
2025-May, Neuroscience research
IF:2.4Q3
DOI:10.1016/j.neures.2025.03.006
PMID:40164433
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教程 | 为神经科学领域提供单细胞转录组数据分析的实用指南 | 专注于神经科学领域的单细胞RNA测序数据分析流程,强调生物结果解释和比较分析方法 | NA | 提高神经科学中单细胞RNA测序研究的可靠性和可重复性 | 神经科学领域的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 740 | 2025-10-07 |
Metabolic alterations and immune heterogeneity in gastric cancer metastasis
2025-May-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112296
PMID:40276776
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了胃癌转移过程中的代谢重编程和免疫异质性 | 首次发现线粒体ATP合成酶亚基ATP5MC2在胃癌早期转移中的独特改变,并构建了胃癌转移的单细胞图谱 | 样本量相对有限(11个胃癌样本和8个转移灶),需要更大规模验证 | 探究胃癌转移过程中的代谢改变和免疫异质性机制 | 胃癌组织样本和转移病灶 | 单细胞测序分析 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 19个样本(11个胃癌原发灶和8个转移灶),共92,842个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |