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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2025-10-07 |
The correlation between immune profiles and pathological changes in pulmonary tuberculosis granulomas revealed by bioinformatic analysis and experimental validation
2025-May, Tuberculosis (Edinburgh, Scotland)
DOI:10.1016/j.tube.2025.102614
PMID:39999566
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研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证揭示肺结核肉芽肿中免疫特征与病理变化的相关性 | 首次整合单细胞转录组、微环境空间特征和外周血转录组数据,结合机器学习方法系统分析肺结核肉芽肿的免疫机制 | 研究样本量有限,仅验证了6种细胞因子与肉芽肿大小的相关性 | 探究免疫系统在肺结核肉芽肿结构形成中的作用机制 | 肺结核肉芽肿组织和外周血免疫细胞 | 生物信息学 | 肺结核 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光, 流式细胞术, 机器学习 | 机器学习 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 外周血转录组数据 | 本地队列和已发表数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 流式细胞术 | NA | NA |
| 722 | 2025-10-07 |
Selective changes in vasopressin neurons and astrocytes in the suprachiasmatic nucleus of Prader-Willi syndrome subjects
2025-May, Journal of neuroendocrinology
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/jne.70015
PMID:40055943
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研究论文 | 本研究通过分析普瑞德-威利综合征患者下丘脑视交叉上核的细胞变化,发现该疾病选择性地影响加压素神经元和星形胶质细胞 | 首次揭示普瑞德-威利综合征患者视交叉上核中加压素神经元增加和星形胶质细胞减少的特定细胞类型变化 | 样本量有限,使用死后组织可能受死后变化影响 | 探究普瑞德-威利综合征患者视交叉上核细胞类型特异性变化与昼夜节律紊乱的关联 | 普瑞德-威利综合征患者和匹配对照的下丘脑视交叉上核组织 | 神经科学 | 普瑞德-威利综合征 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,组织图像数据 | 普瑞德-威利综合征患者和匹配对照的死后下丘脑组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 723 | 2025-10-07 |
Systemic inflammation impairs myelopoiesis and interferon type I responses in humans
2025-May, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02136-4
PMID:40251340
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研究论文 | 本研究通过LPS诱导的系统性炎症模型揭示了炎症早期出现的炎性单核细胞亚群和晚期免疫抑制阶段的髓系生成受损及I型干扰素反应减弱机制 | 首次在人体内系统性炎症模型中同时研究急性和晚期免疫阶段,发现infMono单核细胞亚群并证实IFNβ治疗可恢复免疫反应 | 研究样本量有限,主要基于LPS诱导模型,临床验证需要更大规模研究 | 阐明系统性炎症过程中免疫反应动态变化的分子机制 | 人类系统性炎症模型和患者队列(细菌性脓毒症和冠状病毒疾病) | 免疫学 | 系统性炎症疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类LPS诱导炎症模型和患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 724 | 2025-10-07 |
Unveiling the immune microenvironment of complex tissues and tumors in transcriptomics through a deconvolution approach
2025-May-01, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14089-w
PMID:40307726
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研究论文 | 开发了一个用于从转录组数据解析免疫微环境的两步工作流程和网络应用工具 | 整合了hisat2-stringtie流程与反卷积算法,提供比现有方法更准确的免疫细胞组成分析 | 仅使用合成伪批量数据进行了验证,缺乏真实临床样本的广泛验证 | 开发解析肿瘤浸润白细胞组成的生物信息学工具 | 黑色素瘤和头颈癌患者的转录组数据 | 生物信息学 | 癌症 | RNA测序,单细胞RNA测序 | 反卷积算法 | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | Galaxy/Docker环境 |
| 725 | 2025-10-07 |
Molecular landscape of atherosclerotic plaque progression: insights from proteomics, single-cell transcriptomics and genomics
2025-May-01, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-04058-2
PMID:40307879
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研究论文 | 本研究通过整合蛋白质组学、单细胞转录组学和基因组学方法,深入分析了颈动脉粥样硬化斑块的分子特征 | 首次采用数据非依赖采集蛋白质组学与单细胞RNA测序相结合的方法,系统描绘了不同阶段动脉粥样硬化斑块的分子图谱,并通过孟德尔随机化验证了关键蛋白与缺血性中风的因果关系 | 样本量相对有限(87例颈动脉斑块),且仅针对特定类型的斑块(AHA IV-VI型)进行分析 | 揭示动脉粥样硬化斑块进展的分子机制,识别潜在的生物标志物和治疗靶点 | 人类颈动脉粥样硬化斑块 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 数据非依赖采集蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化 | NA | 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据, 基因组数据 | 87例人类颈动脉斑块 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 726 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing reveals a regulatory role of WT1 in mast cell proliferation in endometrial polyps
2025-May-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500116R
PMID:40304994
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研究论文 | 通过单细胞测序技术研究子宫内膜息肉中肥大细胞的调控机制 | 首次在单细胞分辨率下揭示WT1转录因子调控子宫内膜息肉中肥大细胞增殖的新机制 | 样本量有限,需要进一步验证WT1调控机制的功能性实验 | 探索子宫内膜息肉的细胞异质性和分子机制 | 子宫内膜息肉组织和邻近正常子宫内膜组织 | 单细胞生物学 | 子宫内膜息肉 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | 转录调控网络分析 | 基因表达数据 | 子宫内膜息肉和邻近正常子宫内膜组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 727 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics in a child with coenzyme Q10 nephropathy: potential of single-cell RNA sequencing in pediatric kidney disease
2025-May, Pediatric nephrology (Berlin, Germany)
DOI:10.1007/s00467-024-06611-2
PMID:39805995
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了一名辅酶Q10肾病患儿的肾脏活检样本,揭示了该疾病中细胞类型比例和基因表达的变化 | 首次在辅酶Q10肾病中应用单细胞RNA测序技术,揭示了跨细胞类型的线粒体基因表达普遍下调 | 仅基于单个病例的研究,样本量有限 | 阐明辅酶Q10肾病在单细胞水平的基因表达变化 | 5岁辅酶Q10肾病患儿的肾脏活检组织 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患儿肾脏活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 728 | 2025-10-07 |
T-type calcium channels regulate medulloblastoma and can be targeted for therapy
2025-May, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-025-04967-5
PMID:39961940
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研究论文 | 本研究探讨T型钙通道在髓母细胞瘤中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次对髓母细胞瘤中T型钙通道进行全面的多组学表征,为米贝地尔药物重新用于治疗提供临床前数据 | 研究主要基于临床前模型,需要进一步临床试验验证 | 研究T型钙通道在髓母细胞瘤中的作用机制及治疗靶向性 | 髓母细胞瘤肿瘤细胞和异种移植模型 | 癌症研究 | 髓母细胞瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 反向蛋白质阵列(RPPA), 高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA) | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 超过30%的髓母细胞瘤肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 729 | 2025-10-07 |
Differential cellular origins of the extracellular matrix of tumor and normal tissues according to colorectal cancer subtypes
2025-May, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-02964-z
PMID:40032993
|
研究论文 | 通过整合定量蛋白质组学和单细胞RNA测序数据,研究结直肠癌肿瘤微环境中细胞外基质的细胞来源异质性 | 首次系统鉴定结直肠癌中正常组织和肿瘤组织细胞外基质蛋白的差异细胞来源,并建立细胞-基质组数据库 | 样本量相对较小(21例患者),主要依赖公共数据集进行验证 | 解析结直肠癌肿瘤微环境中细胞外基质的异质性及其与临床预后的关系 | 结直肠癌患者组织样本和癌旁正常组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | TMT蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 生物信息学分析 | CMS分子分型, 单细胞水平反卷积分析 | 蛋白质组数据, RNA测序数据 | 21例结直肠癌患者的24个组织样本及癌旁正常组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 730 | 2025-10-07 |
Macrophage-mediated IL-6 signaling drives ryanodine receptor-2 calcium leak in postoperative atrial fibrillation
2025-May-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI187711
PMID:40048254
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示浸润性CCR2+巨噬细胞通过IL-6-STAT3-CaMKII信号通路驱动兰尼碱受体2钙泄漏,导致术后房颤发生 | 首次发现巨噬细胞介导的IL-6信号通过STAT3-CaMKII通路调控RyR2-S2814磷酸化,揭示术后房颤的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究术后房颤发生的细胞和分子机制 | 小鼠心房非肌细胞、人类心包液、分离的心房肌细胞 | 单细胞测序 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq、伪时间轨迹分析、共聚焦成像、条件性基因敲除 | NA | 基因表达数据、钙成像数据 | 小鼠模型和人类心脏手术患者心包液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 731 | 2025-10-07 |
Micro-region transcriptomics profiling of cerebral organoids using a capillary-based microdissection system
2025-May-01, Analytical methods : advancing methods and applications
IF:2.7Q1
DOI:10.1039/d5ay00277j
PMID:40211824
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研究论文 | 开发了一种基于毛细管的组织微切割系统,用于脑类器官微区域的空间转录组分析 | 建立了毛细管组织微切割系统(CMS),实现了对培养脑类器官微区域的高效获取和mRNA测序 | NA | 探索脑类器官中细胞命运的空间发育轨迹 | 脑类器官中的神经祖细胞、中间祖细胞、成熟神经元和星形胶质细胞 | 空间转录组学 | NA | mRNA测序,基因本体(GO)分析,KEGG富集分析 | NA | 空间转录组数据,基因表达数据 | 第20天和第60天的脑类器官样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 毛细管组织微切割系统(CMS) | 毛细管组织微切割系统用于脑类器官微区域获取 |
| 732 | 2025-10-07 |
Restoring mitochondrial function promotes hematopoietic reconstitution from cord blood following cryopreservation-related functional decline
2025-May-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI183607
PMID:40036065
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了脐带血冷冻保存对造血干细胞功能的影响机制,并发现萝卜硫素可改善线粒体功能恢复造血重建能力 | 首次系统评估不同冷冻时长对脐带血造血干细胞功能的影响,发现线粒体功能障碍是关键机制,并验证萝卜硫素的改善作用 | 研究样本时间跨度有限,临床验证需要进一步开展 | 探究冷冻保存对脐带血造血干细胞功能的影响及其机制 | 脐带血来源的CD34+造血干细胞和祖细胞及单个核细胞 | 单细胞组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 包含新鲜和冷冻1年、5年、10年、19年的脐带血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 733 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Uncovers Molecular Features Underlying the Disrupted Neurogenesis Following Traumatic Brain Injury
2025-May, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24671
PMID:39760225
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示创伤性脑损伤后神经发生破坏的分子特征 | 首次通过大规模单细胞转录组测序识别出表达Tubb3基因的NSC-4亚群减少是神经发生破坏的关键原因,并发现转录因子Dlx2的下调及其过表达可促进神经元谱系分化 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究创伤性脑损伤后神经干细胞分化偏向的分子机制 | 小鼠脑室下区神经干细胞及其衍生细胞 | 单细胞测序 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 734 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Developmental Landscape of Wheat Roots
2025-May, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.15321
PMID:39763237
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小麦根尖细胞的转录组异质性和发育轨迹 | 首次在小麦中应用单细胞RNA测序技术解析根尖细胞类型组成和发育轨迹,并进行跨物种比较分析 | 仅分析了中国春小麦品种的根尖组织,样本来源相对有限 | 解析小麦根尖细胞类型特异的转录程序和发育机制 | 中国春小麦品种的根尖细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 中国春小麦根尖单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 735 | 2025-10-07 |
Elevated KIF2C Expression Drives Osteosarcoma Progression by Modulating the Wnt/β-Catenin Signaling Pathway and Contributing to an Immunosuppressive Tumor Microenvironment
2025-May, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70915
PMID:40292920
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研究论文 | 本研究探讨KIF2C在骨肉瘤中的过表达通过调控Wnt/β-catenin信号通路和促进免疫抑制微环境驱动肿瘤进展的机制 | 首次揭示KIF2C在骨肉瘤中通过结合β-catenin调控Wnt信号通路并影响肿瘤免疫微环境的作用机制,并发现butein作为潜在抑制剂 | 未明确说明样本量大小,机制研究主要依赖体外实验和公共数据集分析 | 探究KIF2C在骨肉瘤发生发展中的作用机制及治疗靶点价值 | 骨肉瘤细胞系、公共数据库中的骨肉瘤样本数据 | 肿瘤生物学 | 骨肉瘤 | KEGG富集分析、GSVA、ssGSEA、ESTIMATE算法、单细胞测序、分子对接、分子动力学 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、体外实验数据、体内实验数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 736 | 2025-10-07 |
ScRNA-Seq reveals T cell immunity in COVID-19 patients and implications for immunotherapy
2025-May-16, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114663
PMID:40233451
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综述 | 通过单细胞RNA测序技术揭示COVID-19患者T细胞免疫特征及其对免疫治疗的启示 | 首次系统阐述scRNA-seq在解析COVID-19患者T细胞异质性和功能障碍中的应用,揭示不同临床表型患者的T细胞特征差异 | 现有靶向T细胞的治疗策略效果不一致,需联合治疗方法 | 阐明T细胞异质性对COVID-19疾病严重程度的影响机制 | COVID-19患者的常规T细胞(CD8、CD4 T细胞)和非常规T细胞(NKT、MAIT、γδT细胞) | 单细胞组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同临床表现的COVID-19患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 737 | 2025-10-07 |
Therapeutic and prognostic values of ferroptosis signature in glioblastoma
2025-May-16, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114597
PMID:40239336
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研究论文 | 探讨铁死亡特征在胶质母细胞瘤中的治疗和预后价值 | 通过单细胞RNA测序揭示胶质母细胞瘤中铁死亡的分子特征及其与肿瘤微环境的相互作用 | 铁死亡与GBM免疫景观的关系复杂,可能产生正向或负向影响 | 研究铁死亡在胶质母细胞瘤中的治疗潜力和预后价值 | 胶质母细胞瘤细胞及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 738 | 2025-10-07 |
Characterization of the Biochemical Recurrence Prediction Ability and Progression Correlation of Peroxiredoxins Family in Prostate Cancer Based on Integrating Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Cohorts
2025-May, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70855
PMID:40281661
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,探讨了过氧化物氧化还原酶家族在前列腺癌中的预后预测价值及与疾病进展的关联 | 首次系统评估PRDXs家族在前列腺癌中的临床价值,发现PRDX5与疾病进展最相关,并开发了整合PRDX5表达和临床特征的预测模型 | 研究主要基于公共数据集,部分发现需进一步实验验证 | 评估PRDXs家族在前列腺癌预后预测和治疗反应中的作用 | 前列腺癌患者样本和去势抵抗性前列腺癌细胞系 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫组织化学, 体外细胞实验 | 列线图预测模型 | 基因表达数据, 临床数据 | 2个单细胞RNA数据集和8个批量RNA数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 739 | 2025-10-07 |
Role of different Lyl1 transcripts in zebrafish primitive hematopoiesis
2025-May, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.24-288
PMID:40287790
|
研究论文 | 本研究通过分析斑马鱼单细胞RNA测序数据,发现Lyl1基因存在长短两种转录本,并在原始造血过程中发挥不同调控作用 | 首次在斑马鱼和人类中发现Lyl1基因的长短转录本,并揭示它们在原始髓系造血中的不同功能 | 研究主要基于斑马鱼模型,人类中的功能验证需要进一步研究 | 探究Lyl1不同转录本在原始造血过程中的作用机制 | 斑马鱼胚胎造血细胞 | 发育生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 5'RACE, Morpholino基因敲降 | NA | 单细胞RNA测序数据, RNA测序数据 | 斑马鱼造血细胞 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 740 | 2025-10-07 |
Adaptive circuits for action and value information in rodent operant learning
2025-May, Neuroscience research
IF:2.4Q3
DOI:10.1016/j.neures.2024.09.003
PMID:39341460
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综述 | 本文综述了啮齿类动物操作性学习中的神经回路机制,重点关注多巴胺系统对行为强化的调控作用 | 整合了神经回路、突触可塑性和基因表达的多层次研究,特别强调了中脑多巴胺神经元在整合动作启动与奖赏反馈中的复杂作用 | 作为综述文章,主要基于已有研究进行总结,未提供新的实验数据 | 探讨操作性学习的神经机制 | 啮齿类动物(主要为小鼠和大鼠) | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 神经生理数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |