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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 701 | 2025-10-07 |
PD-1 regulates the anti-tumor immune function of macrophages through JAK2-STAT3 signaling pathway in colorectal cancer tumor microenvironment
2025-May-02, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06469-4
PMID:40317043
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研究论文 | 本研究揭示了PD-1通过JAK2-STAT3信号通路调控结直肠癌肿瘤微环境中巨噬细胞功能的机制 | 首次发现肿瘤相关巨噬细胞表达PD-1并通过JAK2-STAT3通路调控其功能,揭示了PD-1在巨噬细胞中的新作用机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床样本验证有限 | 探究PD-1在肿瘤相关巨噬细胞中的表达和功能调控机制 | 结直肠癌肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | RNA测序,单细胞RNA测序,荧光标记小鼠模型,骨髓来源巨噬细胞培养 | 小鼠肿瘤模型 | RNA测序数据,单细胞RNA测序数据,细胞功能数据 | CT26小鼠结直肠癌细胞系,骨髓来源巨噬细胞 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 702 | 2025-10-07 |
SlideCNA: spatial copy number alteration detection from Slide-seq-like spatial transcriptomics data
2025-May-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03573-y
PMID:40317049
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研究论文 | 开发了一种从Slide-seq类空间转录组数据中检测空间拷贝数变异(CNA)的计算工具SlideCNA | 提出表达感知的空间分箱方法,在克服数据稀疏性限制的同时保持空间信号,首次从空间转录组数据中提取CNA信号 | 仅针对Slide-seq类数据进行了测试,数据稀疏性可能仍是挑战 | 利用RNA数据识别拷贝数变异,实现空间亚克隆检测 | 乳腺癌(包括转移性乳腺癌)肿瘤组织 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组测序 | 计算工具/算法 | 空间转录组数据 | 模拟数据和真实Slide-seq数据 | NA | 空间转录组学 | Slide-seq | Slide-seq类空间转录组技术 |
| 703 | 2025-10-07 |
Human skeletal development and regeneration are shaped by functional diversity of stem cells across skeletal sites
2025-May-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.02.013
PMID:40118065
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研究论文 | 通过整合人类骨骼干细胞的功能分析和单细胞RNA测序,揭示不同骨骼部位干细胞的功能多样性及其在骨骼发育和再生中的作用 | 首次系统鉴定人类骨骼干细胞的功能亚型,揭示其在不同骨骼部位的组成差异和克隆动态,并发现衰老相关的成纤维化转变机制 | 研究仅涉及十个骨骼部位,可能未完全覆盖所有骨骼区域的干细胞多样性 | 探索人类骨骼干细胞的功能多样性及其在骨骼发育、再生和疾病中的作用机制 | 人类骨骼干细胞(hSSCs)及其软骨生成、骨生成、基质和成纤维生成亚型 | 单细胞生物学 | 骨骼疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),布尔算法 | NA | 单细胞转录组数据 | 十个不同骨骼部位的人类骨骼干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 704 | 2025-10-07 |
Integrated molecular-phenotypic profiling reveals metabolic control of morphological variation in a stem-cell-based embryo model
2025-May-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.03.012
PMID:40245869
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组测序与形态学分析,揭示了代谢状态对干细胞胚胎模型表型变异的调控机制 | 首次将时间分辨单细胞RNA测序与基于成像的表型分析相结合,建立了预测表型变异的机器学习框架 | 研究仅针对模拟胚胎躯干形成的结构,未涵盖其他胚胎发育阶段 | 探究干细胞胚胎模型中表型变异的生物学根源 | 模拟胚胎躯干形成的个体结构 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 代谢测量 | 机器学习 | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 个体结构 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 705 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing combined with bulk RNA seq reveals the roles of natural killer cell in prognosis and immunotherapy of hepatocellular carcinoma
2025-May-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-99638-w
PMID:40312525
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研究论文 | 本研究结合单细胞测序和bulk RNA测序构建了基于自然杀伤细胞相关基因的肝细胞癌预后预测模型 | 首次结合单细胞测序和WGCNA分析识别NK细胞相关基因,并构建能预测肝细胞癌预后和免疫治疗反应的模型 | 未明确说明样本来源和数量,模型验证可能受限于数据集的规模和多样性 | 探究自然杀伤细胞在肝细胞癌预后和免疫治疗中的作用机制 | 肝细胞癌患者样本中的自然杀伤细胞及相关基因 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, WGCNA, 基因富集分析 | LASSO, Cox回归模型, ssGSEA | 基因表达数据, 临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 706 | 2025-10-07 |
Prognosis, immunological features and potential mechanisms of HKR1 in prostate cancer via single-cell and bulk RNA-sequencing
2025-May-01, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14230-9
PMID:40312663
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研究论文 | 通过单细胞和bulk RNA测序分析HKR1在前列腺癌中的预后价值、免疫特征及潜在机制 | 首次通过单细胞和bulk RNA测序综合分析HKR1在前列腺癌中的作用,发现两个新的lncRNA-RBP-HKR1调控轴 | 研究主要基于在线数据库分析,需要进一步实验验证 | 探索HKR1作为前列腺癌预后和免疫治疗反应的新型生物标志物 | 前列腺癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, qPCR | Cox回归分析 | RNA测序数据, 基因表达数据 | 前列腺癌细胞系和组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 707 | 2025-10-07 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq unravels the molecular feature of tumor-associated neutrophils of head and neck squamous cell carcinoma
2025-May-01, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14179-9
PMID:40312694
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,揭示了头颈鳞状细胞癌中肿瘤相关中性粒细胞的分子特征并构建了预后风险模型 | 首次在头颈鳞状细胞癌中系统鉴定肿瘤相关中性粒细胞特征基因,并开发了基于中性粒细胞的预后特征模型,发现OLR1作为新的生物标志物 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步的前瞻性临床研究验证 | 探索肿瘤相关中性粒细胞在头颈鳞状细胞癌中的临床意义和分子机制 | 头颈鳞状细胞癌患者和肿瘤相关中性粒细胞 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,CCK-8检测,Transwell实验,伤口愈合实验 | 预后风险模型 | 基因表达数据,临床数据 | TCGA和GEO数据库的头颈鳞状细胞癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 708 | 2025-10-07 |
Habitat radiomics predicts occult lymph node metastasis and uncovers immune microenvironment of head and neck cancer
2025-May-01, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06474-7
PMID:40312725
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研究论文 | 本研究开发了一种基于栖息地放射组学模型来预测头颈癌隐匿性淋巴结转移并揭示其免疫微环境特征 | 首次将栖息地放射组学概念应用于头颈癌隐匿性淋巴结转移预测,并揭示了与T细胞功能障碍相关的生物学机制 | 样本量相对有限,特别是单细胞RNA测序数据集仅包含6个样本 | 建立预测头颈鳞状细胞癌隐匿性淋巴结转移的放射组学模型 | 头颈鳞状细胞癌患者 | 计算机视觉 | 头颈癌 | 放射组学,bulk RNA测序,单细胞RNA测序 | 随机森林,逻辑回归,支持向量机 | 医学影像,基因组数据 | 训练集330例,内部测试集154例,外部测试集183例,TCGA基因组集50例,单细胞RNA测序集6例 | NA | bulk RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 709 | 2025-10-07 |
Therapy-induced senescence is a transient drug resistance mechanism in breast cancer
2025-May-01, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02310-0
PMID:40312750
|
研究论文 | 本研究揭示了治疗诱导衰老在乳腺癌中作为一种可逆的药物抵抗机制 | 首次证明治疗诱导衰老是可逆的,并作为乳腺癌细胞的普遍药物抵抗机制 | 研究主要基于细胞系和动物模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探究治疗诱导衰老在乳腺癌药物抵抗中的作用机制 | 乳腺癌细胞系和三阴性乳腺癌小鼠模型 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | RNA测序,表面蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质组数据 | 四种乳腺癌细胞系和动物模型 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 710 | 2025-10-07 |
Research on Peripheral Nerve Aging and Degeneration: Cellular Changes and Mechanism Exploration From the Perspective of Single-Cell Sequencing
2025-May, The European journal of neuroscience
DOI:10.1111/ejn.70129
PMID:40317786
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析老年大鼠背根神经节和坐骨神经,探索外周神经系统衰老和退化的细胞变化及分子机制 | 首次在单细胞水平揭示外周神经系统衰老过程中雪旺细胞的转录组特征变化,并鉴定出抗衰老蛋白PCDH9与雪旺细胞增殖分化的关联 | 研究主要基于大鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 探索外周神经系统衰老和退化的细胞学特征及分子机制 | 成年和老年大鼠的背根神经节(DRG)和坐骨神经(SN) | 单细胞测序 | 神经系统退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个年龄组的大鼠样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 711 | 2025-10-07 |
Organoid-Guided Precision Medicine: From Bench to Bedside
2025-May, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70195
PMID:40321594
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综述 | 系统阐述类器官技术从基础研究到临床应用的转化路径及其在精准医学中的多维应用 | 整合类器官构建技术、多组学分析与基因编辑工具,建立患者特异性疾病模型平台 | 存在标准化不足、血管化困难及伦理问题等挑战 | 推动类器官技术在精准医学领域的临床转化 | 多种组织来源的类器官(皮肤、肠道、肺、肿瘤等) | 生物技术 | 肿瘤疾病 | 三维培养系统、CRISPR基因编辑、多组学分析 | 类器官疾病模型 | 多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 712 | 2025-10-07 |
Systematic Ocular Phenotyping of Knockout Mouse Lines Identifies Genes Associated With Age-Related Corneal Dystrophies
2025-May-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.5.7
PMID:40323269
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研究论文 | 通过系统分析敲除小鼠品系的眼表表型,鉴定与年龄相关性角膜营养不良相关的基因 | 在国际小鼠表型联盟数据库中筛选出14个与晚发性角膜营养不良相关的基因,其中12个为角膜生物学中的新发现 | 研究基于小鼠模型,需要进一步验证这些基因在人类角膜疾病中的具体作用机制 | 鉴定与年龄相关性角膜营养不良相关的致病基因 | 8901个敲除小鼠品系的晚成年期小鼠(49周以上) | 生物信息学 | 角膜营养不良 | 生物信息学分析,单细胞转录组学,蛋白互作分析 | NA | 基因表达数据,蛋白互作数据,表型数据 | 8901个敲除小鼠品系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 713 | 2025-10-07 |
Revealing the therapeutic targets, mechanisms, and heterogeneity of Huatan Jieyu Granules for Parkinson's disease through single-cell sequencing
2025-May-15, Journal of pharmaceutical and biomedical analysis
IF:3.1Q2
DOI:10.1016/j.jpba.2025.116679
PMID:39864142
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研究论文 | 通过单细胞测序技术研究化痰解郁颗粒对帕金森病的治疗靶点、作用机制和细胞异质性 | 首次结合单细胞测序和中药研究,系统揭示化痰解郁颗粒治疗帕金森病的关键基因和细胞类型 | 研究仅使用MPTP诱导的小鼠模型,未在人类样本中验证 | 探索化痰解郁颗粒治疗帕金森病的分子机制和细胞靶点 | MPTP诱导的帕金森病小鼠模型 | 单细胞测序 | 帕金森病 | 单细胞测序,免疫荧光,行为学测试 | PPI网络拓扑分析 | 单细胞基因表达数据 | 空白组、PD模型组和药物治疗组小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 714 | 2025-10-07 |
A Bifunctional Antibody Targeting PD-1 and TGF-β Signaling Has Antitumor Activity in Combination with Radiotherapy and Attenuates Radiation-Induced Lung Injury
2025-May-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0903
PMID:39878763
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研究论文 | 研究双特异性抗体JS-201联合放疗的抗肿瘤效果及其对放射性肺损伤的保护作用 | 首次发现靶向PD-1和TGF-β信号的双功能抗体JS-201不仅能增强放疗抗肿瘤效果,还能减轻放射性肺损伤 | 临床前研究阶段,尚未进行人体临床试验 | 评估JS-201联合放疗的抗肿瘤疗效及其对放射性肺损伤的防护作用 | 肿瘤模型小鼠和放射性肺损伤模型 | 免疫治疗 | 肺癌 | 转录组测序, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 多种肿瘤模型和放射性肺损伤模型 | NA | 转录组测序, 单细胞测序 | NA | NA |
| 715 | 2025-10-07 |
Mosaic loss of Y chromosome and mortality after coronary angiography
2025-May-02, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehaf035
PMID:39935193
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研究论文 | 本研究探讨Y染色体嵌合体缺失与接受冠状动脉造影男性患者心血管死亡率之间的关联 | 首次在人类队列中证实Y染色体嵌合体缺失是心血管死亡的独立风险因素,并发现其通过RPS5基因调控心脏纤维化的机制 | 研究仅针对接受冠状动脉造影的男性患者,样本代表性有限 | 确定Y染色体嵌合体缺失与心血管死亡率之间的关联 | 1698名接受冠状动脉造影的男性患者 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,全基因组甲基化分析 | NA | 基因组数据,蛋白质表达数据,临床数据 | 1698名男性参与者 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组甲基化分析 | NA | NA |
| 716 | 2025-10-07 |
Single-Nucleus RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics for Squamous Cell Carcinoma Arising From Ovarian Mature Teratoma
2025-May, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70022
PMID:39948701
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研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学分析卵巢成熟畸胎瘤来源的鳞状细胞癌,识别新的治疗靶点 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术研究SCC-MT的分子特征,发现KLF5在癌变过程中的关键作用 | 样本量有限,需进一步研究验证KLF5相关治疗靶点的临床价值 | 探索SCC-MT的分子病理机制并寻找新的治疗靶点 | 卵巢成熟畸胎瘤来源的鳞状细胞癌临床样本及NOSCC-1细胞系 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 功能分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间基因表达数据 | 临床SCC-MT样本(具体数量未明确) | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 717 | 2025-10-07 |
Novel CHI3L1-Associated Angiogenic Phenotypes Define Glioma Microenvironments: Insights From Multi-Omics Integration
2025-May, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70028
PMID:39989140
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研究论文 | 通过多组学整合分析揭示CHI3L1相关血管表型在神经胶质瘤微环境中的作用 | 提出基于CHI3L1的新型血管表型分类系统,并构建血管相关风险评分作为预后预测工具 | 未明确说明样本量大小和研究队列的具体特征 | 探索CHI3L1信号通路在神经胶质瘤血管生成和肿瘤微环境中的作用机制 | 神经胶质瘤患者样本 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 基因组学, 转录组学, 数字病理 | 机器学习算法, 无监督共识聚类 | 转录组数据, 基因组数据, 临床数据, 病理图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 718 | 2025-10-07 |
The correlation between immune profiles and pathological changes in pulmonary tuberculosis granulomas revealed by bioinformatic analysis and experimental validation
2025-May, Tuberculosis (Edinburgh, Scotland)
DOI:10.1016/j.tube.2025.102614
PMID:39999566
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研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证揭示肺结核肉芽肿中免疫特征与病理变化的相关性 | 首次整合单细胞转录组、微环境空间特征和外周血转录组数据,结合机器学习方法系统分析肺结核肉芽肿的免疫机制 | 研究样本量有限,仅验证了6种细胞因子与肉芽肿大小的相关性 | 探究免疫系统在肺结核肉芽肿结构形成中的作用机制 | 肺结核肉芽肿组织和外周血免疫细胞 | 生物信息学 | 肺结核 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光, 流式细胞术, 机器学习 | 机器学习 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 外周血转录组数据 | 本地队列和已发表数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 流式细胞术 | NA | NA |
| 719 | 2025-10-07 |
Selective changes in vasopressin neurons and astrocytes in the suprachiasmatic nucleus of Prader-Willi syndrome subjects
2025-May, Journal of neuroendocrinology
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/jne.70015
PMID:40055943
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研究论文 | 本研究通过分析普瑞德-威利综合征患者下丘脑视交叉上核的细胞变化,发现该疾病选择性地影响加压素神经元和星形胶质细胞 | 首次揭示普瑞德-威利综合征患者视交叉上核中加压素神经元增加和星形胶质细胞减少的特定细胞类型变化 | 样本量有限,使用死后组织可能受死后变化影响 | 探究普瑞德-威利综合征患者视交叉上核细胞类型特异性变化与昼夜节律紊乱的关联 | 普瑞德-威利综合征患者和匹配对照的下丘脑视交叉上核组织 | 神经科学 | 普瑞德-威利综合征 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,组织图像数据 | 普瑞德-威利综合征患者和匹配对照的死后下丘脑组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 720 | 2025-10-07 |
Mitochondrial fatty acid oxidation regulates adult muscle stem cell function through modulating metabolic flux and protein acetylation
2025-May, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00397-1
PMID:40065099
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研究论文 | 本研究揭示了线粒体脂肪酸氧化通过调节代谢通量和蛋白质乙酰化调控成年肌肉干细胞功能的新机制 | 首次发现脂肪酸氧化通过调控乙酰辅酶A水平和选择性蛋白质乙酰化来调节卫星细胞功能 | 研究主要关注急性肌肉损伤模型,对其他生理或病理状态下卫星细胞功能的适用性有待验证 | 探究线粒体脂肪酸氧化在肌肉干细胞功能和再生中的作用机制 | 骨骼肌卫星细胞(成年肌肉干细胞) | 干细胞生物学 | 肌肉再生障碍 | 单细胞RNA测序,基因敲除,代谢分析 | NA | 基因表达数据,代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |